Αφηρημένο

Ιστορικό

Η Ξηροδερμία Pigmento αθροίσματος γονίδιο ομάδας D (

XPD

) διαδραματίζει καίριο ρόλο στην επιδιόρθωση νουκλεοτιδίων εκτομή. πολυμορφισμών απλού νουκλεοτιδίου (SNP) που βρίσκεται στην λειτουργική περιοχή της μπορεί να μεταβάλει το φαινότυπο ικανότητα επιδιόρθωσης του DNA και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου. Πολλές μελέτες έχουν δείξει ότι

XPD

πολυμορφισμοί είναι σημαντικά σχετίζονται με το πεπτικό κίνδυνο καρκίνων του συστήματος, αλλά τα αποτελέσματα είναι ασυνεπής. Πραγματοποιήσαμε μια περιεκτική μετα-ανάλυση για να εκτιμηθεί η σχέση μεταξύ

XPD

Lys751Gln πολυμορφισμό και καρκίνους του πεπτικού σωλήνα κίνδυνο. Το πεπτικό σωλήνα καρκίνοι που η μελέτη μας αναφέρεται, περιλαμβάνει τον καρκίνο του στόματος, καρκίνο του οισοφάγου, καρκίνο του στομάχου και του παχέος εντέρου.

Μέθοδοι

Ψάξαμε PubMed και Embase έως 31ης Δεκεμβρίου 2012 για τον εντοπισμό επιλέξιμων σπουδές. Συνολικά 37 μελέτες ασθενών-μαρτύρων, συμπεριλαμβανομένων 9027 περιπτώσεις και 16.072 έλεγχοι που εμπλέκονται σε αυτό το μετα-ανάλυση. Οι στατιστικές αναλύσεις πραγματοποιήθηκαν με το λογισμικό Stata (έκδοση 11.0, USA). αναλογίες πιθανοτήτων (OR) με 95% διαστήματα εμπιστοσύνης (ΠΙ) χρησιμοποιήθηκαν για την αξιολόγηση της αντοχής του συλλόγου.

Αποτελέσματα

Τα αποτελέσματα έδειξαν ότι το

XPD

Lys751Gln πολυμορφισμού ήταν σχετίζεται με τον αυξημένο κίνδυνο καρκίνου του πεπτικού σωλήνα (σύγκριση ομοζυγώτες (GlnGln

vs

LysLys):. OR = 1.12, 95% CI = 01.01 έως 01.24,

P

= 0,029,

P

ετερογένεια = 0,133). Εμείς δεν βρήκε στατιστικά στοιχεία για μια σημαντικά αυξημένη καρκίνων του πεπτικού σωλήνα του κινδύνου στις άλλες γενετικές μοντέλα. Στην ανάλυση υποομάδας, βρήκαμε επίσης η σύγκριση ομοζυγώτες αυξηθεί η ευπάθεια των ασιατικών πληθυσμών (OR = 1,28, 95% CI = 1,01 – 1,63,

P

= 0,045,

P

ετερογένεια = 0,287). Ανά τύπο του καρκίνου και την πηγή του ελέγχου, κανένας σημαντικά αυξημένο κίνδυνο καρκίνου βρέθηκε σε αυτές τις υποομάδες. Επιπλέον, οι εκτιμήσεις κινδύνου από το νοσοκομείο με βάση μελέτες και του οισοφάγου μελέτες ήταν ετερογενείς.

Συμπεράσματα

μετα-ανάλυσή μας προτείνει ότι η

XPD

751Gln /Gln γονότυπο ήταν χαμηλής διεισδύσει παράγοντας κινδύνου για την ανάπτυξη καρκίνων του πεπτικού συστήματος, ιδιαίτερα σε πληθυσμούς ασιατικής καταγωγής

Παράθεση:. Du Η, Guo Ν, Shi Β, Zhang Q, Chen Ζ, Lu K, et al. (2014) Η επίδραση του

XPD

πολυμορφισμοί για το πεπτικό σύστημα Φυλλαδική Καρκίνοι Κινδύνων: Μια μετα-ανάλυση. PLoS ONE 9 (5): e96301. doi: 10.1371 /journal.pone.0096301

Συντάκτης: Robert W. Sobol, Πανεπιστήμιο του Pittsburgh, Ηνωμένες Πολιτείες της Αμερικής

Ελήφθη: 14, Νοέμβρη του 2013? Αποδεκτές: 6 του Απρίλη του 2014? Δημοσιεύθηκε: δεύτερης Μαΐου 2014

Copyright: © 2014 Du et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Αυτή η μελέτη υποστηρίχθηκε εν μέρει από το Ίδρυμα Μεταδιδακτορικός Επιστημών της επαρχίας Jiangsu (528), το έργο καθοδήγηση Υπουργείο Υγείας της επαρχίας Jiangsu (Z201201), το Πρόγραμμα για την Ανάπτυξη Καινοτόμων ερευνητικής ομάδας στην Πρώτη Ενταγμένο Νοσοκομείο NJMU και το έργο που χρηματοδοτήθηκε από την Προτεραιότητα Ακαδημαϊκό πρόγραμμα Ανάπτυξης της Jiangsu Ιδρυμάτων Ανώτατης Εκπαίδευσης (JX10231801), στην επαρχία Jiangsu Κλινική προγράμματα επιστήμης και τεχνολογίας (Clinical Research Center, BL2012008) και η Σύνοδος Κορυφής των έξι κορυφαία ταλέντα πρόγραμμα της επαρχίας Jiangsu (2013-WSN-034). Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

Πεπτικό καρκίνους οδού, ειδικά του στομάχου, του οισοφάγου και του παχέος εντέρου, είναι ένα σημαντικό παγκόσμιο πρόβλημα υγείας. Globocan δεδομένα το 2008 έδειξε [1], ότι η τυποποιημένη συχνότητα εμφάνισης καρκίνου του παχέος εντέρου, του καρκίνου του στομάχου και του καρκίνου του οισοφάγου βρίσκονταν στην 4η, 6η και 9η σε όλους τους όγκους, αντίστοιχα. Το τυποποιημένο ποσοστό θνησιμότητας του καρκίνου του στομάχου, που έρχεται μετά τον καρκίνο του πνεύμονα και ο καρκίνος του μαστού, ανάλογα την τρίτη θέση. Επιπλέον, καρκίνο του παχέος εντέρου και του καρκίνου του οισοφάγου κατατάσσεται επίσης πρώτη δεκάδα στην κατάταξη της θνησιμότητας του καρκίνου. Η συχνότητα εμφάνισης των διαφόρων καρκίνου ποικίλλει σε μεγάλο βαθμό μεταξύ των διαφόρων φυλετικών και εθνοτικών ομάδων που μπορεί εν μέρει να αποδοθεί στον τρόπο ζωής και το γενετικό υπόβαθρο [2]. Η έκθεση σε περιβαλλοντικά καρκινογόνα μπορούν να προκαλέσουν διάφορους τύπους βλάβης του DNA η οποία στη συνέχεια οδηγούν σε καρκινογένεση διαφορετικών ιστών, αν αφεθεί επιδιορθώθηκε [3].

μηχανισμούς επιδιόρθωσης του DNA, όπως η επισκευή νουκλεοτιδίων εκτομή (NER), βάση εκτομή επισκευή μονοπάτι (ΚΑΚ) και διπλό σκέλος οδός διάλειμμα, είναι απαραίτητη για τη διατήρηση της ακεραιότητας του γονιδιώματος και την πρόληψη της καρκινογένεσης. NER, το πιο ευέλικτο, καλά μελετηθεί μηχανισμός επιδιόρθωσης του DNA σε ανθρώπους, είναι κυρίως υπεύθυνη για την επισκευή ογκώδη βλάβης του DNA, όπως ενώσεις προσθήκης DNA που προκαλείται από την υπεριώδη ακτινοβολία, μεταλλαξιογόνες χημικές ουσίες, ή χημειοθεραπευτικά φάρμακα [4]. Το κύριο συστατικό του NER, ομάδα Pigmentosum ξηροδερμίας D (

XPD

ή

ERCC2

), χαρτογραφήθηκε σε χρωμόσωμα 19q13.3, εκτείνεται σε πάνω από 20 kb, περιέχει 23exons και κωδικοποιεί την πρωτεΐνη 761 αμινοξέων . Έχει δύο λειτουργίες: νουκλεοτίδιο επιδιόρθωση εκτομής και βασική μεταγραφή ως μέρος του συμπλόκου παράγοντα μεταγραφής (TFIIH) [5]. Μεταλλάξεις σε διαφορετικές τοποθεσίες στο

XPD

γονίδιο μπορεί να προκαλέσει την επισκευή και ελαττώματα της μεταγραφής, και αλλαγμένη ικανότητα επιδιόρθωσης του DNA μπορεί να καταστήσει έναν υψηλότερο κίνδυνο ανάπτυξης διαφόρων τύπων καρκίνου [5] – [11]. Αρκετοί πολυμορφισμοί του

XPD

εντοπίστηκαν, όπως Asp312Asn, Lys751Gln, Arg194Trp και Arg399Gln. Η πολυμορφικών θέσεων XPD που έχει ιδιαίτερο ενδιαφέρον σε μελέτες μοριακής επιδημιολογίας είναι ο πολυμορφισμός Lys751Gln (rs13181) στο εξόνιο 23 [12]. Η λυσίνη τη μετάβαση γλουταμίνη στη θέση 751 στο εξόνιο 23 μπορεί να επηρεάσει διαφορετικές αλληλεπιδράσεις πρωτεϊνών, μειώνει τη δραστηριότητα των συγκροτημάτων ΤΡΙΙΒ, και να τροποποιήσει τη γενετική προδιάθεση στον καρκίνο [13].

Η γενετική παραλλαγή στο

XPD

Lys751Gln αποδείχθηκε ότι σχετίζεται με ορισμένες μορφές καρκίνου κινδύνων σε διάφορες μετα-ανάλυση, όπως καρκίνο του οισοφάγου, γαστρικό καρκίνο, καρκίνο του παχέος εντέρου, ο καρκίνος του μαστού, ο καρκίνος του προστάτη, ο καρκίνος του πνεύμονα και καρκίνου της ουροδόχου κύστης [14] – [23]. Ωστόσο, λόγω του ανεπαρκούς αριθμού των δημοσιεύσεων, που δεν υπολογίζουν συγκεντρωτικά αναλογίες πιθανοτήτων (OR) των καρκίνων του πεπτικού συστήματος συνολικά. Λαμβάνοντας υπόψη το εκτεταμένο ρόλο του

XPD

σε καρκίνους του πεπτικού συστήματος, πραγματοποιήσαμε μια μετα-ανάλυση όλων των 37 επιλέξιμες μελέτες ασθενών-μαρτύρων: τον καρκίνο του στόματος, καρκίνο του οισοφάγου, γαστρικός καρκίνος http: //www.sciencedirect. com /επιστήμη /άρθρο /ΑΕΑ /S0188440911000853 – bib10and καρκίνο του παχέος εντέρου, για να αποκομίσουν μια ακριβέστερη συσχέτιση των

XPD

Lys751Gln πολυμορφισμό και διαφορετικούς τύπους πεπτικού κίνδυνο καρκίνων του σωλήνα

Υλικά και Μέθοδοι

Αναγνώριση των επιλέξιμων μελετών

χρησιμοποιώντας PubMed, εντοπίσαμε όλες τις δημοσιευμένες μελέτες ασθενών-μαρτύρων, που διερεύνησε τη σχέση μεταξύ του

XPD

Lys751Gln πολυμορφισμού και των καρκίνων του πεπτικού συστήματος κινδύνου με τη χρήση ενός σκευάσματος ερώτημα ανάκτηση «(

XPD

ή ERCC2) πολυμορφισμών και (ορθοκολικό καρκίνο ή καρκίνο του στομάχου ή του καρκίνου του οισοφάγου ή του καρκίνου του στόματος)». Το πεπτικό σωλήνα καρκίνων σε αυτό το άρθρο αναφέρεται σε καρκίνο του στόματος, οισοφαγικό καρκίνο, γαστρικό καρκίνο και ορθοκολικό καρκίνο. Ψάξαμε επίσης αναφορές σε δημοσιευμένα άρθρα και σχόλια για το θέμα αυτό στο PubMed. Επιλέξιμες μελέτες έπρεπε να πληρούν τα ακόλουθα κριτήρια: (α) μόνο σχέδια περίπτωση-ελέγχου θεωρήθηκαν, (β) Η μελέτη διερεύνησε τη συσχέτιση μεταξύ των διαφόρων τύπων των καρκίνων του πεπτικού συστήματος και

XPD

Lys751Gln πολυμορφισμό. Σημαντικές κριτήρια αποκλεισμού ήταν (α) κανένα πληθυσμό ελέγχου, (β) δεν είναι διαθέσιμη συχνότητα του γονότυπου. διανομής (γ) γονοτυπική των ελέγχων δεν ήταν σε συμφωνία με Hardy-Weinberg ισορροπία (HWE). των προηγούμενων εκδόσεων, επιλέχθηκε (δ) Διττός η μεγαλύτερη ή πιο πρόσφατη έκδοση.

Εξόρυξη Δεδομένων

Πληροφορίες εκχυλίζεται προσεκτικά από όλες τις επιλέξιμες δημοσιεύσεις ανεξάρτητα από δύο συγγραφείς, σύμφωνα με τα κριτήρια ένταξης που περιλαμβάνονται πάνω από. Αν τα δύο κομμάτια του δακτυλογραφημένες δεδομένα ήταν διαφορετικά, το ένα τρίτο ερευνητής θα κληθεί να ελέγξετε και να βεβαιωθείτε ότι όλα τα δεδομένα είχαν δίκιο. Οι ακόλουθες πληροφορίες προέρχονται από κάθε μελέτη:. Πρώτου συγγραφέα, το έτος δημοσίευσης, τη χώρα του πληθυσμού της μελέτης, την εθνικότητα, την πηγή των ελέγχων, ο αριθμός των περιπτώσεων και ελέγχων με διαφορετικούς γονότυπους και HWE (Πίνακας 1)

Η

Στατιστική Ανάλυση

Είμαστε αξιολόγησε την αποχώρηση από την ισορροπία Hardy-Weinberg για την ομάδα ελέγχου σε κάθε μελέτη χρησιμοποιώντας την καλοσύνη-of-fit χ

2test με 1 βαθμό Pearson της ελευθερίας. Ετερογένεια μεταξύ των μελετών ελέγχθηκε από το μοντέλο τυχαίων δράσεων (η μέθοδος Der Simonian και Laird) εάν υπήρξε σημαντική ετερογένεια [24]. Ένα

P

αξία περισσότερο από το ονομαστικό επίπεδο του 0,05 για τη στατιστική Q έδειξε έλλειψη ετερογένεια μεταξύ των μελετών, επιτρέποντας τη χρήση του σταθερού μοντέλου -effects (η μέθοδος Mantel-Haenszel) [25]. Εάν

P

τιμή μικρότερη από 0,05 θεωρήθηκε ως έχουσα ετερογένεια, τα αποτελέσματα δεν μπορούν να συγκεντρωθούν και να συζητηθούν. Οι κίνδυνοι ΕΑΠ των καρκίνων του πεπτικού σωλήνα που συνδέεται με το

XPD

Lys751Gln πολυμορφισμός εκτιμήθηκαν για κάθε μελέτη. Τα συγκεντρωτικά ΕΑΠ αξιολογήθηκαν σε συν-κυρίαρχο μοντέλο (Lys /Gln

vs

.Lys /Lys, Gln /Gln

vs

. Lys /Lys), κυρίαρχο μοντέλο (Gln /Gln + Lys /Gln

vs

. Lys /Lys), υπολειπόμενο μοντέλο (Gln /Gln

vs

. Lys /Gln + Lys /Lys), αντίστοιχα. αναλύσεις υποομάδων έγιναν από τύπους καρκίνου, την εθνότητα και την πηγή των ελέγχων. Η προκατάληψη δημοσίευση διαγνώστηκε από το οικόπεδο χοάνη, στην οποία το τυπικό σφάλμα του log (OR) της κάθε μελέτης συναρτήσει του log (ή). οικόπεδο χοάνη ασυμμετρία αξιολογήθηκε με γραμμική δοκιμή παλινδρόμησης Egger του. Η σημασία της τομής προσδιορίσθηκε από τη δοκιμασία t προτείνεται από Egger (

P

& lt? 0,05 θεωρήθηκε αντιπροσωπευτικό των στατιστικά σημαντική προκατάληψη δημοσίευση) [26]. Όλες οι στατιστικές δοκιμασίες διεξήχθησαν με STATA version11.0 (Stata Corporation, College Station, TX, USA).

Αποτελέσματα

Μελέτη χαρακτηριστικό

Ένα σύνολο 107 πιθανών σχετικών μελέτες ανακτήθηκαν μέσω PubMed (Σχήμα 1). Μετά από προσεκτική επανεξέταση, 40 επιλέξιμες μελέτες ασθενών-μαρτύρων (3 μελέτες δεν συνάδει με HWE επίσης φαίνεται) για τη σχέση μεταξύ

XPD

Lys715Gln πολυμορφισμό και το πεπτικό τους καρκίνους του κινδύνου ενεπλάκησαν σε αυτή την μετα-ανάλυση, συμπεριλαμβανομένων των 4 καρκίνο του στόματος μελέτες [62] – [65], 13 οισοφάγου μελέτες του καρκίνου [27] – [39], 12 γαστρικό καρκίνο μελέτες [36], [40] – [50] και 11 παχέος μελέτες του καρκίνου [51] – [61]. Όπως φαίνεται στον Πίνακα 1, 17 μελέτες διεξήχθησαν σε Ασιάτες, 20 μελέτες σε Ευρωπαίους. Επιπλέον, υπήρχαν 18 νοσοκομείο με βάση μελέτες, 19 πληθυσμού με βάση μελέτες. Ποικίλες μέθοδοι προσδιορισμού του γονότυπου χρησιμοποιήθηκαν, συμπεριλαμβανομένης της PCR-RFLP, PCR-SSCP, Taqman, Real-time PCR και SEB PCR. Όλες οι μελέτες έδειξαν ότι η γονοτυπική κατανομή των ελέγχων ήταν σύμφωνα με HWE.

Η

Η μετα-ανάλυση

Πίνακας 2 παραθέτει τα κύρια αποτελέσματα της μετα-ανάλυσης για

XPD

Lys751Gln: έχει το γονότυπο Gln /Gln είναι ένας παράγοντας κινδύνου για καρκίνους του πεπτικού συστήματος: GlnGln

vs

. LysLys: OR = 1.12, 95% CI = 01.01-01.24,

P

= 0,029,

P

ετερογένεια = 0,133.

I

2 = 20,9% (Σχήμα 2). Δεν βρήκαμε καμία σημαντική συσχέτιση μεταξύ των άλλων γενετικών μοντέλων και των καρκίνων του πεπτικού συστήματος. Τα αποτελέσματα της στρωματοποιημένη ανάλυση ανά τύπο καρκίνου, πηγή των ελέγχων και την εθνικότητα ήταν φαίνονται στον πίνακα 2. Η Gln /Gln έναντι Lys /Lys γονότυπο είχαν αυξημένο κίνδυνο σε ασιατικό πληθυσμό (OR = 1,28, 95% CI = 1,01 – 1,63,

P

= 0,045,

P

ετερογένεια = 0,287,

I

2 = 14,2%? Σχήμα 3). Υψηλή ετερογένεια βρέθηκε σε καρκίνο του οισοφάγου και μελέτες νοσοκομείο με βάση, έτσι ώστε τα αποτελέσματα δεν μπορούν να συγκεντρωθούν. Επιπλέον, τα αποτελέσματα δεν δείχνουν καμία συσχέτιση μεταξύ

XPD

Lys751Gln πολυμορφισμό και το πεπτικό καρκίνους ευαισθησία για όλες τις γενετικές μοντέλα στην Ευρωπαϊκή άτομα ή σε μελέτες βασισμένες στον πληθυσμό συνολικά.

σύγκριση ομοζυγώτες.

Ένα σταθερό ενέργειες μοντέλο χρησιμοποιήθηκε. Οι πλατείες και οι οριζόντιες γραμμές αντιστοιχούν στη μελέτη ειδικών OR και 95% CI. Η περιοχή των πλατειών αντανακλά το βάρος (αντίστροφο της διακύμανσης). Το διαμάντι εκπροσωπεί την περίληψη ή και 95% CI.

Η

Ανάλυση ευαισθησίας

Κατά την ανάλυση ευαισθησίας, όταν κάθε συγκεκριμένη μελέτη είχαν αφαιρεθεί μετα-αναλύσεις διεξήχθησαν κατ ‘επανάληψη. Τα αντίστοιχα συγκεντρωτικά ΕΑΠ δεν ήταν ποιοτικά μεταβληθεί με ή χωρίς αυτή τη μελέτη. Όπως φαίνεται στο Σχήμα 4, η πιο συνδιαμόρφωση μία μελέτη για τη συνολική ομαδοποιημένη ή εκτιμήσεις φάνηκε να είναι το ένα που διεξήχθη από Mariana κ.ά., η οποία είχε ένα σχετικά μεγάλο μέγεθος του δείγματος. Ωστόσο, μετά την αφαίρεση της μελέτης, το αποτέλεσμα της μετα-ανάλυσης δεν έχει επηρεαστεί σημαντικά: Gln /Gln έναντι Lys /Lys: OR = 1.17, 95% CI: 1,05-1,30, που δείχνει μεγάλη σταθερότητα των αποτελεσμάτων μας.

τα αποτελέσματα υπολογίζονται με την παράλειψη κάθε μελέτη (αριστερή στήλη) με τη σειρά. Μπαρ, 95% CI.

Η

Η ετερογένεια ανάλυση

Υπήρχε μέτρια ετερογένεια μεταξύ των μελετών σε GlnGln + GlnLys

vs

.LysLys συγκρίσεις και Gln /Gln

vs

. Lys /Lys συγκρίσεις, αλλά όχι στα άλλα γενετικά μοντέλα. Ερευνήσαμε την πηγή της ετερογένειας για κυρίαρχο μοντέλο με τον τύπο του καρκίνου, την εθνικότητα, την πηγή του ελέγχου, και διαπίστωσε ότι ο καρκίνος του οισοφάγου και μελέτες του νοσοκομείου με βάση συνέβαλε στη σημαντική ετερογένεια (πίνακας 3). Ένας λόγος μπορεί να είναι ότι οι μελέτες του νοσοκομείου με βάση σχετικά μικρά δείγματα και ήταν πιο επιρρεπείς σε τυχαίο σφάλμα και ψευδώς θετικά ή αρνητικά αποτελέσματα. Επιπλέον, είναι πολύ πιθανό ότι η ετερογένεια στην οισοφάγου μελέτες και μελέτες του νοσοκομείου με βάση σχετίζονται δεδομένου ότι οι μελέτες του νοσοκομείου με βάση κυριαρχούν μεταξύ των οισοφάγου μελέτες.

Η

Δημοσίευση Bias

Begg του βαθμού συσχέτισης μέθοδος και μέθοδος σταθμισμένης παλινδρόμησης Egger που χρησιμοποιήθηκαν για την αξιολόγηση προκατάληψη δημοσίευση. Δεν υπήρξε καμία ένδειξη για μεροληψία δημοσίευσης στο

XPD

Lys751Gln (δοκιμασία Begg του

P

= 0,284, δοκιμή Egger του

P

= 0,324, t = 1.00, 95% CI = 0,41 -1.21). Σας παρουσιάζουμε οικόπεδο χοάνη για την ΕΑΠ της Gln /Gln έναντι Lys /Lys (Σχήμα 5).

Κάθε σημείο αντιπροσωπεύει μια ξεχωριστή μελέτη για την υποδεικνυόμενη ένωση.

Η

Συζήτηση

XPD διαδραματίζει κρίσιμο ρόλο στην NER, η οποία είναι σημαντική για την κατάργηση ορισμένων διασταυρούμενων δεσμών του DNA, την υπεριώδη (UV) photo-βλάβες, και ογκώδη χημικές ενώσεις προσθήκης. Η

XPD

πρωτεΐνη διαθέτει δύο μονά-κλώνου DNA-εξαρτώμενη ase ΑΤΡ και 5′-3 δραστηριότητες ελικάση DNA », η οποία είναι απαραίτητη για την NER μονοπάτι και μεταγραφή [66]. Η γενετική ποικιλομορφία στο

XPD

μπορεί να συμβάλει στη μειωμένη ικανότητα επιδιόρθωσης του DNA και αυξημένο κίνδυνο καρκίνου. Η Lys σε Gln αλλαγή στη θέση 751 του

XPD

ως αποτέλεσμα την πλήρη αλλαγές σχετικά με τη διαμόρφωση φορτίο του αμινοξέος, το οποίο επηρεάζει τις αλληλεπιδράσεις του

XPD

πρωτεΐνες και ενεργοποιητή ελικάση του [67]. Μέχρι σήμερα, ένας αριθμός επιδημιολογικών μελετών έχουν διεξαχθεί για την αξιολόγηση του ρόλου της Lys751Gln πολυμορφισμού σε διάφορους κινδύνους καρκίνου, αλλά τα αποτελέσματα παραμένουν αμφιλεγόμενα. Σε ό, τι γνωρίζουμε, αρκετές προηγούμενες μετα-αναλύσεις για

XPD

Lys751Gln πολυμορφισμό και καρκίνων του κινδύνου έχουν διεξαχθεί, όπως γαστρικό καρκίνο, ορθοκολικό καρκίνο, καρκίνο του οισοφάγου, καρκίνο του μαστού και καρκίνο της ουροδόχου κύστης [14] – [23 ]. Αλλά μέχρι σήμερα, δεν υπάρχει μετα-ανάλυση για τη σύνδεση μεταξύ του πεπτικού σωλήνα καρκίνων του κινδύνου και

XPD

Lys751Gln πολυμορφισμό. Προκειμένου να αντλούν μια ακριβέστερη εκτίμηση της σχέσης, που πραγματοποιείται αυτή την μετα-ανάλυση 37 μελετών, συμπεριλαμβανομένων και 9027 περιπτώσεις και 16.072 ελέγχους.

Μέσα από την ανάλυση των γονοτύπων από τις 37 επιλέξιμες μελέτες, βρήκαμε τον γονότυπο Gln /Gln φέρει μπορεί να είναι σε πιθανό κίνδυνο για καρκίνους του πεπτικού συστήματος. Η Lys σε Gln παραλλαγή θέση 751 του

XPD

οδήγησε σε πλήρη αλλαγές σχετικά με την ηλεκτρονική διάταξη του αμινοξέος, το οποίο επηρέασε τις αλληλεπιδράσεις του

XPD

πρωτεΐνες και ενεργοποιητή ελικάση του [68]. καρκίνους του πεπτικού συστήματος αποτελούν μια ομοιογενή ομάδα κακοηθειών με κάποιους τρόπους. Διαφορετικές πρωτογενείς θέσεις των καρκίνων του πεπτικού σωλήνα έχουν κάποια κοινόχρηστα παράγοντες κινδύνου. Για παράδειγμα, εκτός από το κάπνισμα και η κατανάλωση αλκοόλ, η κατανάλωση τραχύ, πικάντικο, ζεστό και μη εύπεπτα τρόφιμα είναι πιθανό να βλάψει τον ιστό του πεπτικού σωλήνα. Επιπλέον,

H.pylori

λοίμωξη είναι μια σημαντική αιτία του καρκίνου του στομάχου, ενώ τα νιτρώδη που προέρχεται από το κόκκινο κρέας και τα επεξεργασμένα κρέατα αποτελεί βασικό παράγοντα κινδύνου για τον καρκίνο του οισοφάγου και του παχέος εντέρου. Τέτοιοι παράγοντες κινδύνου και την ειδικότητα του ιστού τους, εγείρουν την πιθανότητα ότι το

XPD

πολυμορφισμός μπορεί να σχετίζεται με καρκίνους του πεπτικού συστήματος κίνδυνο. Η λειτουργική

XPD

Lys751Gln πολυμορφισμού με αποτέλεσμα την μειωμένη δραστηριότητα του

XPD

πρωτεΐνη μπορεί να αυξήσει τον κίνδυνο καρκίνου του πεπτικού σωλήνα στη βάση του ιστού ζημίας.

Σε στρωματοποιημένη ανάλυση ανά τύπο καρκίνου , βρήκαμε ότι όλα τα γενετικά μοντέλα δεν φάνηκε να έχει επίδραση σχετικά με τους κινδύνους του οισοφάγου, του στομάχου, του παχέος εντέρου και του στόματος μορφών καρκίνου. Αυτό ήταν διαφορετική από Ling Yuan και μελέτες Wu ΧΒ του [69], [70]. Ωστόσο Bo Chen et al. [71] Διαπιστώσαμε ότι Gln /Gln φορείς γονότυπο μπορεί να έχουν αυξημένο κίνδυνο γαστρικού καρκίνου στον πληθυσμό -θετικό Helico-Bacter πυλωρού (H.pylori), αλλά όχι στην -αρνητική πληθυσμό Helico-Bacter πυλωρού (H. pylori). Μια πιθανή εξήγηση είναι ότι η διαμόρφωση του πεπτικού κινδύνου καρκίνων σωλήνα μπορεί να εξαρτώνται όχι μόνο από ένα μόνο γονίδιο /πολυμορφισμού ενός νουκλεοτιδίου, αλλά επίσης επί ενός κοινού επίδραση των πολλαπλών πολυμορφισμών εντός διαφορετικά γονίδια ή οδούς, ή στη στενή αλληλεπίδραση μεταξύ πολυμορφισμών και περιβαλλοντικό παράγοντα. Το άλλο είναι ότι Helicobacter pylori λοίμωξη είναι μία από τις σαφείς αιτιολογίες του γαστρικού καρκίνου και ίσως υπάρχει κάποια σχέση μεταξύ των Helicobacter pylori και πολυμορφικό τόπους. Στην υποομάδα της εθνικότητας, βρήκαμε σημαντική συσχέτιση μεταξύ

XPD

Gln /Gln πολυμορφισμό και αυξημένο κίνδυνο καρκίνων του πεπτικού σωλήνα σε Ασιάτες, αλλά όχι σε ευρωπαϊκό. Πιστεύουμε ότι οι εθνοτικές διαφορές και ποικίλο ζωντανό περιβάλλον μπορεί να εξηγήσει εν μέρει το φαινόμενο. Επιπλέον, πιστεύαμε διαφορές στη διατροφή, όπως είναι η δομή των τροφίμων και τον τρόπο μαγειρέματος, ήταν η κύρια αιτία αυτού του αποτελέσματος. Επιπλέον, ήταν επίσης πιθανό ότι οι παρατηρούμενες εθνοτικές διαφορές μπορεί να οφείλονται στην τύχη, διότι μελέτες με μικρό μέγεθος του δείγματος ενδέχεται να έχουν ανεπαρκή στατιστική ισχύ για να ανιχνεύσει μια μικρή επίδραση ή μπορεί να έχουν δημιουργήσει μια εκτίμηση κυμάνθηκε κίνδυνο [72].

Εν ολίγοις, αυτή η μετα-ανάλυση έδειξε ότι

XPD

Lys751Gln πολυμορφισμό, τα άτομα που φέρουν την παραλλαγή ομοζυγώτες Gln /Gln μπορεί να αυξήσει την ευαισθησία των καρκίνων του πεπτικού συστήματος. Και, σημαντικές συσχετίσεις διαπιστώθηκαν μεταξύ του πληθυσμού Ασιάτες. Θα πρέπει να σημειωθεί ρητά: πρώτον, το αποτελεσματικό μέγεθος δείγματος είναι πολύ μικρότερο για τη Gln /Gln έναντι Lys /Lys αναλύσεων από τα άλλα γενετικά μοντέλα και, συνεπώς, είναι πιο επιρρεπείς σε τυχαίο σφάλμα και ψευδώς θετικά αποτελέσματα? Δεύτερον, τα αποτελέσματα για GlnGln εναντίον GlyLys + LysLys, ενώ δεν είναι στατιστικά σημαντική (OR 1,09, 95% CI = 0,99 – 1,20,

P

= 0,072,

P

ετερογένεια = 0,385), να ενισχύσει το συμπέρασμά μας για το οποίο γενετικό μοντέλο είναι η πλέον κατάλληλη. Μεγάλης κλίμακας μελέτες συσχετισμού βάσει πληθυσμού ασθενών-μαρτύρων και εγγύηση για την επικύρωση του κινδύνου που περιέχονται στο σημερινό μετα-ανάλυση και διερεύνηση των πιθανών αλληλεπιδράσεων γονιδίων-γονιδίων και γονιδίων-περιβάλλοντος στο πεπτικό κίνδυνο καρκίνων του σωλήνα.

Υποστήριξη πληροφορίες

Λίστα ελέγχου S1.

doi: 10.1371 /journal.pone.0096301.s001

(DOC)