You must be logged into post a comment.
Αφηρημένο
Σκοπός
Αυτή η μελέτη είχε ως στόχο να προσδιορίσει το πρότυπο έκφρασης του αγγειακού ενδοθηλιακού αυξητικού παράγοντα (VEGF) σε μη-μικροκυτταρικό καρκίνο του πνεύμονα (NSCLC) και να διερευνήσει τις δυνατότητες συσχέτισης της με την εξέλιξη του NSCLC.
Μέθοδοι
η γονιδιακή έκφραση προφίλ GSE39345 είχε κατεβάσει από το γονιδιακής έκφρασης βάση δεδομένων Omnibus. Είκοσι υγιείς μάρτυρες και 32 δείγματα NSCLC πριν από τη χημειοθεραπεία αναλύθηκαν για τον προσδιορισμό των διαφορικά εκφραζόμενων γονιδίων (βαθμούς με). Στη συνέχεια, ανάλυση εμπλουτισμός μονοπάτι των βαθμούς με διεξήχθη και κατασκευάστηκαν δίκτυα αλληλεπίδρασης πρωτεΐνης-πρωτεΐνης. Ιδιαίτερα, τα γονίδια VEGF και ο VEGF μονοπάτι σηματοδότησης αναλύθηκαν. Η υπο-δίκτυο κατασκευάστηκε ακολουθείται από ανάλυση λειτουργικών εμπλουτισμού.
Αποτελέσματα
Σύνολο 1666 μέχρι ρυθμιζόμενα και ταυτοποιήθηκαν 1542 κάτω-ρυθμίζονται βαθμούς με. Οι βαθμούς με ρυθμισμένα προς τα κάτω εμπλουτίστηκαν κυρίως στις οδούς που σχετίζονται με τον καρκίνο.
VEGFA
και
VEGFB
βρέθηκαν να είναι η έναρξη παράγοντα VEGF μονοπατιού σηματοδότησης. Επιπλέον, στον υποδοχέα του επιδερμικού αυξητικού παράγοντα (
EGFR
),
VEGFA
και
VEGFB
συνδέονται υπο-δίκτυο, υποδοχέα ένθετο πεδίο κινάσης (
ΚΟΚ
), φιμπρονεκτίνη 1 (
FN1
), αυξητικός παράγοντας μετασχηματισμού βήτα που προκαλείται (
TGFBI
) και του πυρηνικού αντιγόνου πολλαπλασιαζόμενων κυττάρων (
PCNA
) βρέθηκαν να αλληλεπιδρούν με τουλάχιστον δύο από τα τρία γονίδια πλήμνης. Οι βαθμούς με σε αυτό το υπο-δίκτυο εμπλουτίστηκαν κυρίως όσον αφορά Γονιδιακή Οντολογία που σχετίζονται με τον κυτταρικό πολλαπλασιασμό.
Συμπέρασμα
EGFR
,
ΚΟΚ
,
FN1
,
TGFBI
και
PCNA
μπορεί να αλληλεπιδρά με το
VEGFA
να παίξει σημαντικό ρόλο στον NSCLC ογκογένεση. Αυτά τα γονίδια και τις αντίστοιχες πρωτεΐνες μπορεί να έχουν την δυνατότητα να χρησιμοποιηθούν ως στόχοι για είτε διάγνωση ή θεραπεία των ασθενών με NSCLC
Παράθεση:. Wang Υ, Huang L, Wu S, Jia Υ, Yang Υ, Luo L , et al. Αναλύσεις (2015) Βιοπληροφορικής του ρόλος του αγγειακού ενδοθηλιακού αυξητικού παράγοντα σε ασθενείς με μη-μικροκυτταρικό καρκίνο του πνεύμονα. PLoS ONE 10 (9): e0139285. doi: 10.1371 /journal.pone.0139285
Επιμέλεια: Selvakumar Subbian, Δημόσιας Υγείας Ερευνητικό Ινστιτούτο RBHS, Ηνωμένες Πολιτείες
You must be logged into post a comment.