Abstract

Ιστορικό

επιδιόρθωση του DNA γονίδιο ακτίνων Χ επισκευή cross ομάδα συμπληρώνοντας 1 (ΧΚΧΧ1) διαδραματίζει σημαντικό ρόλο στη διατήρηση της γονιδιωματικής ακεραιότητας και την προστασία των κυττάρων από βλάβη του DNA. διαφοροποίηση αλληλουχίας σε γονίδιο ΧΚΧΧ1 μπορεί να μεταβάλει καρκίνο κεφαλής και τραχήλου ευαισθησίας (ΕΘΕΓ). Ωστόσο, αυτά τα αποτελέσματα είναι αμφίβολα. Για να προκύψει μια πιο ακριβή εκτίμηση της σχέσης μεταξύ ΧΚΧΧ1 πολυμορφισμού και του κινδύνου ΕΘΕΓ, αναλάβαμε μια μετα-ανάλυση που περιλαμβάνει 16.344 άτομα.

Μέθοδοι

Μια αναζήτηση της βιβλιογραφίας από PubMed, Embase, Web της Επιστήμης και Υποδομών China National Γνώση διεξήχθη για να προσδιορίσει τις μελέτες με βάση τα προκαθορισμένα κριτήρια ένταξης. Η αναλογία πιθανοτήτων (OR), με διάστημα εμπιστοσύνης 95% (CI) συνδυάστηκε χρησιμοποιώντας ένα μοντέλο τυχαίων δράσεων ή ορισμένου επιπτώσεις μοντέλο.

Αποτελέσματα

Είκοσι-εννέα μελέτες που αποτελείται από 6.719 περιπτώσεις και 9.627 ελέγχους εντοπίστηκαν και αναλύθηκαν. Συνολικά, δεν παρατηρήθηκε καμία ένδειξη σημαντική συσχέτιση μεταξύ ΧΚΧΧ1 Arg194Trp, ΧΚΧΧ1 Arg280His, γονότυπους ΧΚΧΧ1 Arg399Gln και τον κίνδυνο της ΕΘΕΓ σε οποιαδήποτε γενετική μοντέλα. Οι αναλύσεις υποομάδων σύμφωνα με την εθνικότητα, τη θέση του όγκου, το έτος δημοσίευσης, η μέθοδος του γονότυπου ανιχνεύεται επίσης καμία σημαντική συσχέτιση σε κάθε υποομάδα, εκτός από το ότι τον καρκίνο του στόματος συνδέθηκε με την παραλλαγή Arg194Trp στο υπολειπόμενο μοντέλο. Επιπλέον, καμία σημαντική επίδραση αυτών των πολυμορφισμών αλληλεπιδράσει με το κάπνισμα στην ΕΘΕΓ κινδύνου εντοπίστηκε αλλά Arg194Trp ομόζυγη παραλλαγή.

Συμπέρασμα

Εν κατακλείδι, αυτή η μετα-ανάλυση δείχνει ότι η ΧΚΧΧ1 Arg194Trp, Arg280His και Arg399Gln πολυμορφισμός δεν μπορεί να αφορά στην ευαισθησία ΕΘΕΓ. Οι περαιτέρω μελέτες σχετικά με τις αλληλεπιδράσεις γονιδίων-γονιδίων και γονιδίων-περιβάλλοντος σε διαφορετικούς πληθυσμούς απαιτείται

Παράθεση:. Lou Υ, Peng Wj, Cao Ds, Xie J, Li Hh, Jiang ΖΧ (2013) Επισκευή DNA Γονιδιακή ΧΚΧΧ1 πολυμορφισμοί και καρκίνου κεφαλής και τραχήλου κινδύνων: Ενημέρωση μετα-ανάλυση που πραγματοποιήθηκε συμπεριλαμβάνοντας 16344 Θέματα. PLoS ONE 8 (9): e74059. doi: 10.1371 /journal.pone.0074059

Επιμέλεια: Peiwen Φέι, Πανεπιστήμιο της Χαβάης Cancer Center, Ηνωμένες Πολιτείες της Αμερικής

Ελήφθη: 13η Απριλίου 2013? Αποδεκτές: 29 του Ιούλη, 2013? Δημοσιεύθηκε: 23 Σεπτέμβρη 2013

Copyright: © 2013 Lou et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Οι συγγραφείς δεν έχουν καμία υποστήριξη ή χρηματοδότηση για να αναφέρετε

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

Καρκίνος κεφαλής και τραχήλου (ΕΘΕΓ) είναι πλέον η πέμπτη πιο κοινή μορφή καρκίνου στον κόσμο [1], με περίπου 434.000 νέους ασθενείς διαγιγνώσκονται κάθε χρόνο σε όλο τον κόσμο [2]. Οι περισσότερες από τις υποθέσεις που αφορούν τους νέους ασθενείς να συμβεί σε οικονομικά αναπτυσσόμενες χώρες, όπως η Ινδία, η Βραζιλία και την Ταϊλάνδη [3,4]. ΕΘΕΓ είναι γενικά χωρίζονται σε τρεις ομάδες: στοματικής κοιλότητας, του φάρυγγα και του λάρυγγα. Εξέλιξη του ΕΘΕΓ είναι μια πολυπαραγοντική διαδικασία που σχετίζεται με διάφορους παράγοντες κινδύνου. Σωρευτικά στοιχεία δείχνουν ότι το κάπνισμα, η κατανάλωση αλκοόλ, και το μάσημα betel λίρες είναι τρεις σημαντικοί παράγοντες κινδύνου για ΕΘΕΓ [5,6]. Αυτές οι καρκινογόνες ουσίες στο περιβάλλον μπορεί να προκαλέσει μια ελαττωματική ανταπόκριση βλάβη του DNA, το οποίο μπορεί να οδηγήσει σε απόπτωση ή μπορεί να οδηγήσει σε γενετική αστάθεια και un-ρυθμίζεται (πολλαπλασιαστική) κυτταρική ανάπτυξη [7-9].

Το σύστημα επιδιόρθωσης του DNA έχει ως στόχο να διατηρήσει γονιδιωματική ακεραιότητα, και συνεχώς αμφισβητούν τις περιβαλλοντικές προσβολές και τα σφάλματα αντιγραφής. Ως εκ τούτου, η τροποποίηση των γονιδίων επιδιόρθωσης του DNA θα μπορούσε να αυξήσει τον κίνδυνο καρκινώματος στην κεφαλή και τον αυχένα [10]. Τα τρία σημαντικότερα μονοπάτια επιδιόρθωσης του DNA, συμπεριλαμβανομένης της επισκευής νουκλεοτιδίων εκτομή (NER), βάση επισκευή εκτομής (ΚΑΚ), και το διπλό σπάσιμο σκέλος (ΟΕΔ), που εμπλέκονται σε αυτή τη διαδικασία. Η ομάδα X-ray επισκευή εγκάρσια συμπληρώνοντας 1 (ΧΚΧΧ1) που συμμετέχουν στην οδό BER θεωρείται ότι παίζει καθοριστικό ρόλο στην προστασία του γονιδιώματος από μια ποικιλία παραγόντων κινδύνου. Τρία κοινά πολυμορφισμών μονού νουκλεοτιδίου στο γονίδιο ΧΚΧΧ1, συμπεριλαμβανομένων Arg194Trp (C για υποκατάσταση Τ στο εξόνιο 6 με αποτέλεσμα μια αλλαγή αμινοξέος Arg σε Trp), Arg280His (G σε Α υποκατάσταση στο εξόνιο 9 με αποτέλεσμα την Arg στην αλλαγή του αμινοξέος His) και Arg399Gln (G σε Α υποκατάσταση στο εξόνιο 10 με αποτέλεσμα μια αλλαγή αμινοξέος Arg σε Gln) ελέγχονται πιο συχνά σε πολλές μελέτες που έχουν εξετάσει διαφορετικούς πληθυσμούς.

Πολλαπλές μελέτες έχουν εκτιμήσει τη σχέση του ΕΘΕΓ κινδύνου πολυμορφισμός στα γονίδια επιδιόρθωσης του DNA ΧΚΧΧ1 Arg194Trp, ΧΚΧΧ1 Arg280His και ΧΚΧΧ1 Arg399Gln. Ωστόσο, αυτά τα αποτελέσματα είναι ασυνεπής. Ενώ δεν υπάρχει συσχέτιση μεταξύ πολυμορφισμών ΧΚΧΧ1 και τον κίνδυνο ΕΘΕΓ καταδείχθηκε σε μερικές μελέτες [11,12], αλλά Ramachandran et al. [13] και Olshan et al. [14] βρήκε μια σχέση μεταξύ ΧΚΧΧ1 Arg194Trp και πολυμορφισμούς Arg399Gln και τον κίνδυνο της ΕΘΕΓ. Olshan et al. [14] πραγματοποιείται μια στρωματοποιημένη ανάλυση για να εκτιμηθεί η αλληλεπίδραση μεταξύ πολυμορφισμών ΧΚΧΧ1 και το κάπνισμα, γεγονός που υποδηλώνει ότι οι παραλλαγές Arg194Trp και Arg399Gln του ΧΚΧΧ1 συσχετίστηκαν με τον κίνδυνο της HNC σε αυτές τις περιπτώσεις, αλλά δεν διαπιστώθηκε καμία συσχέτιση σε έρευνα Kumar [15]. Παρά το γεγονός ότι Flores-Obando et al. [16] πραγματοποιείται μια μετα-ανάλυση για το 2010 σχετικά με τη σχέση μεταξύ των πολυμορφισμών ΧΚΧΧ1 και τον κίνδυνο της ΕΘΕΓ, αναλύσεις υποομάδων του καπνίσματος και της μεθόδου του γονότυπου δεν πραγματοποιήθηκαν. Λαμβάνοντας υπόψη αυτά τα αντικρουόμενα αποτελέσματα, πραγματοποιήσαμε μια ενημερωμένη μετα-ανάλυση για να συμπεράνουμε ένα λογικό συμπέρασμα για τη σχέση μεταξύ πολυμορφισμών ΧΚΧΧ1 και τον κίνδυνο ΕΘΕΓ. Οι αναλύσεις υποομάδων σχετικά με την εθνικότητα, το κάπνισμα, το site του ΕΘΕΓ, το έτος δημοσίευσης, και η μέθοδος του γονότυπου πραγματοποιήθηκαν. Ως εκ τούτου, η σημερινή μετα-ανάλυση έχει μεγαλύτερη δύναμη την ικανότητα να αντλούν μια πιο ακριβή συμπεράσματα από τις προηγούμενες μετα-αναλύσεις.

Υλικά και Μέθοδοι

στρατηγική αναζήτησης

Μια συστηματική και ηλεκτρονική αναζήτηση του PubMed, EMBASE, Web of Science, και Υποδομών China National Γνώσης (CNKI) βάσεις δεδομένων διεξήχθη για να προσδιορίσει μελέτες που χρησιμοποιούν συνδυασμούς των ακόλουθων όρων αναζήτησης: «το κεφάλι και το λαιμό», «το στόμα», «φάρυγγα», «λάρυγγα »,« ρινοφάρυγγα «,» καρκίνος «,» όγκος «,» καρκίνωμα «,» x-ray επισκευή cross ομάδα 1 συμπληρώνει «,» ΧΚΧΧ1 «,» Arg194Trp «,» Arg280His «,» Arg399Gln »,« πολυμορφισμός », και «παραλλαγή». Όλες οι μελέτες δημοσιεύθηκαν από τα πρώτα σημεία εισόδου τους μέχρι τον Μάρτιο του 2013.

Επιλογή

Όλες οι μελέτες πληρούσαν τα ακόλουθα κριτήρια ένταξης: (1) δημοσιεύεται στα αγγλικά? (2) εξέτασε μελέτες ασθενών-μαρτύρων εκτίμηση της σχέσης μεταξύ ΧΚΧΧ1 πολυμορφισμού και του κινδύνου ΕΘΕΓ? (3) που περιγράφεται συχνότητες γονοτύπου? (4) τη διανομή γονότυπο σε ελέγχους πρέπει να είναι σε ισορροπία Hardy-Weinberg ισορροπία (HWE)? και (5) όταν αναπαράγεται μελέτες δημοσιεύθηκαν από τον ίδιο συγγραφέα που λαμβάνεται από το ίδιο δείγμα ασθενούς, μόνο η πιο ολοκληρωμένη μελέτη δημοσίευση αυτή περιλαμβάνονται σε αυτό το μετα-ανάλυση. δεν θεωρήθηκαν αδημοσίευτες εκθέσεις και περιλήψεις.

Δεδομένα εξόρυξη

Τα στοιχεία που συλλέχθηκαν σύμφωνα με ένα πρότυπο πρωτόκολλο. Οι ακόλουθες πληροφορίες προέρχονται από κάθε μελέτης: το όνομα του πρώτου συγγραφέα, το έτος δημοσίευσης, τη χώρα, οι μέθοδοι προσδιορισμού του γονότυπου, την εθνότητα και την πηγή των περιπτώσεων και των ελέγχων, τα χαρακτηριστικά του πληθυσμού του δείγματος, και οι αριθμοί γονότυπο από τις περιπτώσεις και τους ελέγχους.

η στατιστική ανάλυση

Εμείς δοκιμάστηκε για πρώτη φορά για αποκλίσεις από την ισορροπία Hardy-Weinberg (HWE) στις ομάδες ελέγχου χρησιμοποιώντας το τεστ καλοσύνη-of-fit (Chi-square test ή την ακριβή δοκιμασία Fisher) . Η αναλογία πιθανοτήτων (OR) με ένα αντίστοιχο 95% διάστημα εμπιστοσύνης (CI) χρησιμοποιήθηκε για να εξετάσει τη σχέση μεταξύ ΧΚΧΧ1 πολυμορφισμού και τον κίνδυνο ΕΘΕΓ. Η τρέχουσα μετα-ανάλυση χρησιμοποιούνται τα ακόλουθα στατιστικά μοντέλα, η αλληλόμορφη γενετικό μοντέλο, το συνεπικρατούν γενετικό μοντέλο (σύγκριση ομοζυγώτη), και το υπολειπόμενο γενετικό μοντέλο. Ετερογένεια μεταξύ των μελετών αξιολογήθηκε με τη χρήση του chi-square-based στατιστική Q (P & lt? 0.1 για τη δοκιμή Q υποδηλώνει σημαντική ετερογένεια) [17]. Εμείς ποσοτικά επίσης την επίδραση της ετερογένειας χρησιμοποιώντας το I

2 Στατιστική [18]. Είτε το μοντέλο τυχαίων δράσεων (μέθοδος Dersimonian-Laird [19]) ή το μοντέλο σταθερών επιδράσεων (μέθοδος Mantel-Haenszel [20]) χρησιμοποιήθηκε για τον υπολογισμό εκτιμήσεων συγκεντρωτικά επίδραση στην παρουσία ή απουσία της ετερογένειας, αντίστοιχα. Τέλος, η πιθανή προκατάληψη δημοσίευση αξιολογήθηκε μέσω της δοκιμής Begg και δοκιμή Egger κατά την οπτική ανάλυση του οικοπέδου χοάνη [21,22]. P & lt? 0,05 θεωρήθηκε στατιστικά σημαντική προκατάληψη δημοσίευση. συχνότητες γονότυπο στους πληθυσμούς ελέγχου ανάλογα με τη φυλή υπολογίστηκαν και οι δοκιμές για την ισότητα των αναλογιών έγινε για τις ασιατικές και του Καυκάσου πληθυσμούς τους ελέγχου προκειμένου να συγκρίνει τις διαφορές στις συχνότητες γονοτύπου μεταξύ των δύο ομάδων. Όλες οι στατιστικές αναλύσεις πραγματοποιήθηκαν με τη STATA έκδοση 10.0 του λογισμικού (Stata Corporation, College Station, TX).

Αποτελέσματα

Μελέτες χαρακτηριστικά

Όπως φαίνεται στο Σχήμα 1, η μηχανογραφημένη αναζήτηση χρησιμοποιώντας τη στρατηγική έρευνας που αναφέρονται παραπάνω παραδοθεί 38 δημοσιεύσεις. Από αυτά, δύο έγγραφα εξαιρέθηκαν, λόγω του γεγονότος ότι δεν αξιολογούν τη συσχέτιση μεταξύ του κινδύνου και HNC πολυμορφισμών ΧΚΧΧ1 [23,24]. Στη συνέχεια, πέντε μελέτες αποκλείστηκαν λόγω της έλλειψης των χρήσιμων δεδομένων γονότυπο [25-29]. Στις υπόλοιπες 31 μελέτες, δύο έγγραφα αποκλείστηκαν λόγω των δεδομένων επικάλυψη [30,31]. Τελικά, 29 μελέτες θεωρήθηκαν ως επιλέξιμες και αναλύθηκαν [11-15,32-55].

Η

Συνολικά, 29 εκθέσεις, που αποτελείται από 6.719 περιπτώσεις και 9.627 ελέγχους, που ταιριάζουν με τα κριτήρια ένταξης ήταν περιλαμβάνονται στην παρούσα μετα-ανάλυση. Τα χαρακτηριστικά συνοψίζονται στον Πίνακα 1. Από αυτά τα 29 εκθέσεις, 15 διενεργήθηκαν μελέτες για Καυκάσιους, 10 διενεργήθηκαν μελέτες για Ασιάτες, και τέσσερις μελέτες πραγματοποιήθηκαν σε ένα μικτό πληθυσμό. Στις 29 μελέτες, 23 εστίασε στη σχέση μεταξύ ΧΚΧΧ1 Arg194Trp πολυμορφισμού και τον κίνδυνο ΕΘΕΓ, 11 επικεντρώθηκε στην Arg280His πολυμορφισμό, και 28 διερευνήθηκε η σχέση μεταξύ Arg399Gln πολυμορφισμού και τον κίνδυνο ΕΘΕΓ. Σε 19 μελέτες, οι έλεγχοι ήταν από έναν υγιή πληθυσμό όσο και σε οκτώ μελέτες οι έλεγχοι ήταν από έναν πληθυσμό νοσοκομείο.

Πρώτο συγγραφέα (έτος)

Χώρα

Εθνότητα

πηγή Ελέγχου

τοποθεσίες όγκου

Γονοτυπικές Μέθοδοι

μέγεθος δείγματος (υπόθεση /έλεγχος)

Έρευνα των περιβαλλοντικών παραγόντων

Sturgis et al. (1999) USACaucasianHospitalOral κοιλότητας, του λάρυγγα, oro /υπο-pharynxPCR-RFLP203 /424NROlshan et al. (2002 ) USACaucasianHospitalOral κοιλότητας, του λάρυγγα, pharynxPCR-RFLP98 /161SmokingVarzim et al. (2003) PortugalCaucasianHealthyLarynxPCR-RFLP88 /178NRCho et al. (2003) TaiwanAsianHealthyNasopharynxPCR-RFLP334 /282NRTae et al. (2004) KoreaAsianHospitalOral κοιλότητας, του λάρυγγα, oro /υπο-pharynxSequence129 /157NRDemokan et al. (2005) TurkeyOtherHealthyNRPCR-RFLP95 /98Smoking, alcoholMatullo et al. (2005) EuropeCaucasianHealthyOral κοιλότητα, του λάρυγγα, pharynxTaqman82 /1094SmokingRydzanicz et al. (2005) PolandCaucasianHealthyOral κοιλότητα, γλώσσα, λάρυγγα και pharynxPCR-RFLP182 /143SmokingGajecka et al. ( 2005) PolandCaucasianHealthyLarynxPCR-RFLP293 /319NRKietthubthew et al. (2006) ThailandAsianHealthyOral cavityPCR-RFLP106 /164SmokingRamachandran et al. (2006) IndiaAsianHospitalOral cavityPCR-RFLP110 /110Smoking, το αλκοόλ, ινδοκάρυδο quid chewingCao et al. (2006) ChinaAsianHealthyNasopharynxPCR-RFLP425 /501SmokingLi et al. (2007) USACaucasianHealthyOral κοιλότητας, του λάρυγγα, pharynxPCR-RFLP830 /854Smoking, alcoholMajumder et al. (2007) IndiaAsianHospitalOral cavityPCR-RFLP309 /385NRYang et al. (2007) ChinaAsianHealthyNasopharynxPCR-RFLP153 /168NRHo et al. (2007) USACaucasianHospitalOral cavityPCR-RFLP138 /503NRHarth et al. (2008) GermanyCaucasianHospitalOral κοιλότητας, του λάρυγγα, pharynxPCR-RFLP310 /300SmokingYen et al. (2008 ) TaiwanAsianHospitalOral cavityPCR-RFLP103 /98NRCsejtei et al. (2009) HungaryCaucasianHealthyOral κοιλότητας, του λάρυγγα, pharynxPCR-RFLP108 /102SmokingKowalski et al. (2009) PolandCaucasianHealthyOral κοιλότητας, του λάρυγγα, pharynxPCR-RFLP92 /124SmokingApplebaum et al. (2009) USACaucasianHealthyOral κοιλότητας, του λάρυγγα, oro /υπο-pharynxPCR-RFLP483 /547SmokingJelonek et al. (2010) PolandCaucasianHealthyNRPCR-RFLP104 /252NRGugatschka et al. (2011) AustriaCaucasianHealthyNRTaqman168 /463NRLaantri et al. (2011) MoroccoAfricanNRNasopharynxTaqman512 /477NRKumar et al. ( 2012) IndiaAsianHealthyOral κοιλότητας, της γλώσσας, του λάρυγγα και pharynxPCR-RFLP278 /278Smoking, το αλκοόλ, τον καπνό chewingYuan et al. (2012) ChinaAsianHealthyOral κοιλότητας, του λάρυγγα, oropharynxTaqman390 /886NRAl-Hadyan et al. (2012) Σαουδική ArabiaOtherHealthyNasopharynxSequence156 /251NRDos Reis et al. (2012) BrazilOtherHealthyOral cavityPCR-RFLP150 /150NRKostrzewska-Poczekaj et al. (2012) PolandCaucasianNROral κοιλότητα, larynxPCR-RFLP290 /158NRTable 1. Κύρια χαρακτηριστικά των μελετών που περιλαμβάνονται στο μετα-ανάλυση.

Συντομογραφίες: ΔΕ = δεν αναφέρονται? PCR-RFLP = PCR-based μήκους θραυσμάτων εκ περιορισμού πολυμορφισμού CSV Λήψη CSV

Η κατανομή των ΧΚΧΧ1 Arg194Trp, ΧΚΧΧ1 Arg280His και ΧΚΧΧ1 Arg399Gln συχνότητες πολυμορφισμός γονότυπο μεταξύ των περιπτώσεων ΕΘΕΓ και τους ελέγχους στα 29 μελέτες παρουσιάζονται στον Πίνακα 2. Αισθητά , κατανομή γονότυπων στους ελέγχους του Arg194Trp πολυμορφισμού στη μελέτη των Demokan et al. [36] και Arg399Gln πολυμορφισμού στη μελέτη των Dos Reis et al. [46] αποκλίνουν από HWE, οι οποίες εξαιρούνται στην υποομάδα αναλύσεις.

Πολυμορφισμό του γονιδίου

Πρώτο συγγραφέα (έτος)

Περιπτώσεις (n)

Έλεγχοι (n)

P-τιμή του HWE σε ελέγχους

ΧΚΧΧ1-Arg194TrpArg /ArgArg /TrpTrp /TrpArg /ArgArg /TrpTrp /TrpSturgis et al. (1999) 1802213636100.279Olshan et al. (2002) 821601352600.537Varzim et al. (2003) 80801601800.777Tae et al. (2004) 595291013950.879Matullo et al. (2005) 784095114120.391Rydzanicz et al. (2005) 1651611291400.827Gajecka et al. (2005) 2622712913310.998Kietthubthew et al. (2006) 4050167767200.664Ramachandran et al. (2006) 66377901910.999Cao et al. (2006) 23216619235217430.776Majumder et al. (2007) 2485833176280.074Yang et al. (2007) 627912996540.204Ho et al. (2007) 1082904336910.592Harth et al. (2008) 2174012593920.924Yen et al. (2008) 484015543590.643Csejtei et al. (2009) 96111851520.425Kowalski et al. (2009) 712101022200.556Applebaum et al. (2009) 4275524856130.776Gugatschka et al. (2011) 1482003976330.959Laantri et al. (2011) 4925544704110.994Kumar et al. (2012) 14411123121131260.535Dos Reis et al. (2012) 1272301232430.396XRCC1-Arg280HisArg /ArgArg /HisHis /HisArg /ArgArg /HisHis /HisCho et al. (2003) 2755522156620.442Tae et al. (2004) 1132111392900.473Ramachandran et al. (2006) 77312832610.798Majumder et al. (2007) 2257932978730.461Yang et al. (2007) 1252711313520.981Ho et al. (2007) 1251304535000.503Harth et al. (2008) 2832812703000.660Applebaum et al. (2009) 4374614925240.150Gugatschka et al. (2011) 159904303210.885Laantri et al. (2011) 431114104059290.382Kumar et al. (2012) 12912326142116200.855XRCC1- Arg399GlnArg /ArgArg /GlnGln /GlnArg /ArgArg /GlnGln /GlnSturgis et al. (1999) 947732181197460.782Olshan et al. (2002) 455036282170.412Varzim et al. (2003) 3740118080180.954Cho et al. (2003) 17412832152109210.972Tae et al. (2004) 69519866470.517Demokan et al. (2005) 4241123946130.995Matullo et al. (2005) 3438104844821280.892Rydzanicz et al. (2005) 6398215963210.825Gajecka et al. (2005) 10615334124145500.783Kietthubthew et al. (2006) 554566774230.940Ramachandran et al. (2006) 464816733340.996Cao et al. (2006) 24115232270201300.651Li et al. (2007) 3353741213603851090.929Majumder et al. (2007) 13414332170179360.523Yang et al. (2007) 93546956760.370Ho et al. (2007) 616215220216670.486Harth et al. (2008) 11416630143121360.423Csejtei et al. (2009) 504711534180.999Kowalski et al. (2009) 3744114953220.521Applebaum et al. (2009) 19222962232246690.956Jelonek et al. (2010) 47507103124250.374Gugatschka et al. (2011) 707424204198610.503Laantri et al. (2011) 27419345279163350.268Kumar et al. (2012) 1281242698144360.323Yuan et al. (2012) 22114623481339660.842Al-Hadyan et al. (2012) 96501013599170.980Kostrzewska-Poczekaj et al. (2012) 110154265081270.837Arg194Trp επηρεάζεται από smokingArg /ArgArg /TrpTrp /TrpArg /ArgArg /TrpTrp /TrpOlshan et al. (2002) 74160811600.675Rydzanicz et al. (2005) 1651611291400.827Cao et al. (2006) 15410897862140.947Csejtei et al. (2009) 96111851520.425Kowalski et al. (2009) 4917044800.835Arg399Gln επηρεάζεται από smokingArg /ArgArg /GlnGln /GlnArg /ArgArg /GlnGln /GlnRydzanicz et al. (2005) 6398215963210.825Cao et al. (2006) 156102218560120.953Csejtei et al. (2009) 504711534180.999Kowalski et al. (2009) 193611361600.423Table 2. Κατανομή των γονότυπων ΧΚΧΧ1 μεταξύ της κεφαλής και του τραχήλου περιπτώσεις και τους ελέγχους που περιλαμβάνονται στη μετα-ανάλυση

Συντομογραφίες:. HWE = Hardy-Weinberg ισορροπία. CSV Λήψη CSV

Αποτελέσματα μετα-ανάλυση

Τα συνολικά αποτελέσματα της μετα-ανάλυσης για ΧΚΧΧ1 πολυμορφισμού και του κινδύνου ΕΘΕΓ παρουσιάζονται στον Πίνακα 3.

Σύγκριση

Αριθμός μελετών

μέγεθος δείγματος (υπόθεση /έλεγχος)

Δοκιμή σύνδεσης

Δοκιμή ετερογένεια

προκατάληψη Δημοσίευση

Η

Η Ή

95% CI

P αξίας

Μοντέλο

Q

τιμή P

I

2

P αξίας

P αξίας (Begg του) (Egger του)

Arg194Trp

Arg194 αλληλόμορφο εναντίον Trp194 allele

Total224,478/6,8730.910.77-1.080.279R66.780.00068.6%0.3670.449Caucasian122,190/4,3661.040.89-1.210.652F12.280.30410.4%0.0860.108Asian81,596/1,8450.760.55-1.050.095R50.480.00086.1%0.0190.001OC6915/1,4120.740.55-1.010.054R13.990.01664.3%0.4520.573Smoking5717/5481.190.94-1.520.155F4.830.30517.2%0.2210.219Publication year41147/14031.110.93-1.340.251F5.950.11449.6%1.0000.890PCR-RFLP183566/46590.920.77-1.090.332R49.240.00065.5%0.8200.176Taqman3801/20691.210.63-2.350.768R7.650.02273.9%0.2960.221

Arg/Arg έναντι Trp/Trp

Total224,478/6,8730.800.50-1.280.349R33.770.01346.7%0.9440.245Caucasian122,190/4,3661.040.45-2.400.920F2.950.9370.0%0.1180.125Asian81,596/1,8450.700.37-1.350.294R27.710.00074.7%0.0350.046OC6915/1,4120.710.44-1.130.145F8.400.13640.4%1.0000.715Smoking5717/5482.531.16-5.530.020F1.380.5020.0%0.2960.346Publication year41147/14031.330.77-2.280.308F3.550.31415.5%0.3080.908PCR-RFLP183566/46590.900.54-1.500.684R27.700.01649.5%0.6210.334Taqman3801/20690.590.16-2.220.439F1.550.4610.0%1.0000.525

Arg/Arg vs.Arg /Trp + Trp/Trp

Total224,478/6,8730.900.75-1.080.225R61.790.00066.0%0.6930.450Caucasian122,190/4,3661.030.88-1.210.711F13.220.27916.8%0.0860.112Asian81,596/1,8450.720.50-1.060.094R45.550.00084.6%0.0190.003OC6915/1,4120.700.52-0.950.022R10.660.05953.1%1.0000.483Smoking6842/7051.570.68-3.640.289R44.810.00088.8%0.4520.948Publication year41147/14031.130.91-1.400.283F5.530.13745.7%0.7340.852PCR-RFLP183566/46590.900.75-1.100.305R44.930.00062.2%0.9400.156Taqman3801/20691.220.63-2.330.704R6.880.03270.9%0.2960.169Arg280His

Arg280 αλληλόμορφο εναντίον His280 allele

Total112,972/3,7140.980.87-1.100.757F9.870.4520.0%0.2760.153Caucasian41,102/1,8041.120.86-1.450.411F0.420.9370.0%0.7340.508Asian61,315/1,3940.970.83-1.130.696F8.000.15637.5%0.4520.550OC3555/1,0000.860.67-1.100.241F0.590.7460.0%1.0000.749Publication year31001/12470.890.75-1.070.220F1.480.4770.0%0.2960.097PCR-RFLP82114/25770.990.87-1.140.922F8.480.29217.4%0.7110.413Taqman2723/9690.940.73-1.200.617F1.210.27217.2%1.000

Arg/Arg vs.His/His

Total112,972/3,7140.840.55-1.290.427F3.730.9280.0%0.7210.638Caucasian41,102/1,8041.560.38-6.410.536F1.420.4920.0%1.0000.276Asian61,315/1,3940.740.44-1.240.250F1.440.9200.0%0.7070.826OC3555/1,0000.650.17-2.440.521F0.110.7410.0%1.000Publication year31001/12470.780.47-1.300.342F0.360.8360.0%1.0000.559PCR-RFLP82114/25770.830.50-1.370.463F3.130.7920.0%1.0000.404Taqman2723/9690.970.40-2.320.943F0.010.9300.0%1.000

Arg/Arg έναντι Arg /His + His/His

Total112,972/3,7140.990.87-1.130.872F9.950.4450.0%0.2760.205Caucasian41,102/1,8041.100.84-1.440.483F0.340.9520.0%0.3080.258Asian61,315/1,3940.990.83-1.180.913F8.260.14239.5%0.4520.680OC3555/1,0000.850.65-1.120.247F0.610.7360.0%1.0000.746Publication year31001/12470.880.72-1.090.252F1.380.5020.0%1.0000.200PCR-RFLP82114/25771.010.86-1.170.938F8.410.29816.8%0.5360.596Taqman2723/9690.920.70-1.210.565F1.160.28213.7%1.000Arg399Gln

Arg399 αλληλόμορφο εναντίον Gln399 allele

Total276,466/9,3791.010.94-1.090.850R50.970.00249.0%0.5320.529Caucasian142,639/4,7681.000.93-1.080.965F14.090.3687.7%0.5110.324Asian92,234/2,9311.010.84-1.210.931R30.420.00073.7%0.4660.425OC4663/1,1620.910.59-1.400.674R22.410.00086.6%1.0000.685Smoking4635/4540.700.43-1.150.158R18.190.00083.5%0.0890.042Publication year71898/27651.120.96-1.290.149R14.080.02957.4%0.7640.276PCR-RFLP215029/60511.020.93-1.110.737R44.770.00155.3%0.5660.558Taqman41152/29200.960.85-1.080.478F3.730.29219.6%1.0000.762Sequence2285/4081.080.85-1.390.519F1.560.21235.8%1.000

Arg/Arg vs.Gln/Gln

Total276,466/9,3791.030.88-1.200.714R43.000.01939.5%0.2600.330Caucasian142,639/4,7681.080.92-1.280.348F16.570.21921.6%0.3240.157Asian92,234/2,9310.970.65-1.440.874R22.860.00465.0%0.4660.478OC4663/1,1620.910.38-2.200.838R15.870.00181.1%0.8060.692Smoking4635/4540.730.33-1.630.445R7.490.05860.0%0.0890.002Publication year71898/27651.280.93-1.750.129R11.320.07947.0%0.2300.314PCR-RFLP215029/60511.060.87-1.300.534R39.180.00649.0%0.1560.290Taqman41152/29200.950.73-1.240.709F2.580.4600.0%0.7340.974Sequence2285/4080.940.50-1.770.843F0.960.3280.0%1.000

Arg/Arg εναντίον Arg /Gln +Gln/Gln

Total276,466/9,3790.990.90-1.090.869R46.670.00844.3%0.6770.721Caucasian142,639/4,7680.940.85-1.040.233F14.540.33710.6%0.3810.380Asian92,234/2,9311.040.85-1.280.687R23.770.00366.3%0.9170.472OC4663/1,1620.880.55-1.420.612R15.800.00181.0%1.0000.657Smoking71,039/7460.730.45-1.190.206R35.560.00083.1%0.2300.038Publication year71898/27651.130.94-1.360.199R12.650.04952.6%0.7640.225PCR-RFLP215029/60510.990.89-1.120.928R40.730.00450.9%0.8330.795Taqman41152/29200.940.81-1.090.412F2.950.4000.0%0.7340.734Sequence2285/4081.170.86-1.590.308F1.370.24227.1%1.000Table 3. Τα αποτελέσματα της μετα-ανάλυσης για ΧΚΧΧ1 πολυμορφισμού και του κινδύνου ΕΘΕΓ

Συντομογραφίες:. CI, διάστημα εμπιστοσύνης? Ή, λόγος πιθανοτήτων? OC, καρκίνο του στόματος? R: τυχαίων δράσεων μοντέλο? F: σταθερών επιδράσεων μοντέλο. CSV Λήψη CSV

ΧΚΧΧ1 Arg194Trp πολυμορφισμού σε ΕΘΕΓ κινδύνου στο σύνολο του πληθυσμού.

Ένα σύνολο των 22 μελετών, συμπεριλαμβανομένων 4.487 περιπτώσεις και 6.873 ελέγχους, εξετάζοντας τη σχέση μεταξύ ΧΚΧΧ1 Arg194Trp πολυμορφισμού και τον κίνδυνο ΕΘΕΓ εξετάστηκαν. Υπήρξε σημαντική διαφορά στην συχνότητα του πολυμορφισμού ΧΚΧΧ1 Arg194Trp μεταξύ τους Καυκάσιους και Ασιάτες (34,42% έναντι 12,27%, Ρ & lt? 0.001). Τα συγκεντρωτικά ΕΑΠ για το σύνολο του πληθυσμού δεν έδειξε καμία ένδειξη μιας σημαντικής σύνδεσης μεταξύ των παραλλαγή γονότυπους των ΧΚΧΧ1 Arg194Trp και τον κίνδυνο της ΕΘΕΓ σε κάθε γενετικό μοντέλο. Σημαντική ετερογένεια βρέθηκε σε όλα τα γενετικά μοντέλα. Το οικόπεδο δάσος φαίνεται στο Σχήμα 2.

Η

ΧΚΧΧ1 Arg194Trp πολυμορφισμού σε ΕΘΕΓ κινδύνου σε ένα συγκεκριμένο πληθυσμό.

Η ανάλυση ανά εθνικότητα πραγματοποιήθηκε, προκειμένου να προσδιοριστεί η πηγή της ετερογένειας μεταξύ των οι μελέτες. Καμία σημαντική συσχέτιση της ΕΘΕΓ κινδύνου με ΧΚΧΧ1 Arg194Trp πολυμορφισμός εντοπίστηκε σε Ασιατών και Καυκάσιων κάτω από οποιοδήποτε γενετικό μοντέλο (Σχήματα S1-S2). Σημαντικές διαφορές μεταξύ μελετών ετερογενειών βρέθηκαν στα Ασιάτες, αλλά δεν βρέθηκαν στους Καυκάσιους.

καρκίνο του στόματος (OC) είναι η πιο κοινή μορφή της ΕΘΕΓ και είναι υπεύθυνη για πάνω από το 90% του κεφαλιού και καρκίνοι του αυχένα [56]. Συνεπώς, πραγματοποιήσαμε μια στρωματοποιημένη ανάλυση για τη διερεύνηση της σχέσης μεταξύ ΧΚΧΧ1 Arg194Trp πολυμορφισμό και την ευαισθησία του οργανωμένου εγκλήματος. Έξι μελέτες, συμπεριλαμβανομένων 915 περιπτώσεις και 1412 ελέγχους, την αξιολόγηση της συσχέτιση μεταξύ του κινδύνου του οργανωμένου εγκλήματος και ΧΚΧΧ1 παραλλαγή γονότυπους περιελήφθησαν (Πίνακας 1). Δεν παρατηρήθηκε σημαντική συσχέτιση μεταξύ του πολυμορφισμού ΧΚΧΧ1 Arg194Trp και τον κίνδυνο της OC βρέθηκε στο γενετικό μοντέλο αλληλομόρφων και τη σύγκριση ομοζυγώτες, αλλά μια σημαντική συσχέτιση βρέθηκε για το υπολειπόμενο μοντέλο (Σχήμα S3). Μεταξύ μελετών ετερογένειες ανιχνεύθηκαν στο γενετικό μοντέλο αλληλικές και το υπολειπόμενο μοντέλο, αλλά δεν βρέθηκε να είναι σημαντική για τη σύγκριση ομοζυγώτη.

Πολλές μελέτες έχουν αποδείξει ότι η αλληλεπίδραση μεταξύ ΧΚΧΧ1 πολυμορφισμό και περιβαλλοντικές τοξίνες θα μπορούσαν να επηρεάσουν ο κίνδυνος του ΕΘΕΓ. Λαμβάνοντας υπόψη ότι το κάπνισμα είναι μια σημαντική πτυχή των περιβαλλοντικών τοξινών, πραγματοποιήσαμε μια ανάλυση υποομάδων των έξι μελέτες για τη διερεύνηση της επίδρασης που η αλληλεπίδραση του καπνού με ΧΚΧΧ1 πολυμορφισμός έχει στην ΕΘΕΓ κίνδυνο. Υπήρξε μια σημαντική συσχέτιση μεταξύ της κοινής επίδραση του καπνίσματος με ΧΚΧΧ1 Arg194Trp πολυμορφισμό και τον κίνδυνο της ΕΘΕΓ υπό σύγκριση ομοζυγώτες (Σχήμα 3). Καμία σημαντική συσχέτιση παρατηρήθηκε στην αλληλόμορφη γενετικό μοντέλο και το υπολειπόμενο μοντέλο (Σχήμα 3). Ετερογένεια μεταξύ των μελετών δεν ήταν αξιοσημείωτο σε οποιαδήποτε γενετικό μοντέλο, εκτός από το υπολειπόμενο πρότυπο.

Η

Flores-Obando et al. πραγματοποίησε μια παρόμοια μετα-ανάλυση που περιελάμβανε μελέτες που δημοσιεύθηκαν πριν από το 2010. Λαμβάνοντας υπόψη τα αντιφατικά αποτελέσματα μεταξύ των δύο μελετών, αποφασίσαμε να εκτελέσει μια στρωματοποιημένη ανάλυση, συμπεριλαμβάνοντας μελέτες που δημοσιεύθηκαν μετά το 2010. Το αποτέλεσμα δεν έδειξε σημαντική συσχέτιση διαπιστώθηκε μεταξύ Arg194Trp πολυμορφισμού και του κινδύνου ΕΘΕΓ σε οποιοδήποτε γενετικό μοντέλο (Σχήμα S4). Μεταξύ μελέτη ετερογένεια δεν ήταν αξιοσημείωτο σε αυτή την στρωματοποιημένη ανάλυση.

Οι διάφορες μέθοδοι προσδιορισμού του γονότυπου που χρησιμοποιούνται στη βιβλιογραφία θα μπορούσε να προκαλέσει τα διαφορετικά αποτελέσματα του γονότυπου. Ως εκ τούτου, πραγματοποιήσαμε μια ανάλυση υποομάδων ανά τον προσδιορισμό του γονότυπου μεθόδους για να διερευνήσουν τη σχέση μεταξύ Arg194Trp και την ευαισθησία του ΕΘΕΓ. Ούτε η υποομάδα PCR-RFLP, ούτε η υποομάδα TaqMan ανιχνευθεί καμία σημαντική συσχέτιση με τις αναλύσεις για όλες τις γενετικές μοντέλα (Σχήματα S5-S6). Επιπλέον, παρατηρήθηκε ετερογένεια μεταξύ των μελετών στις δύο στρωματοποιημένη αναλύσεις κάτω από όλες τις γενετικές μοντέλα, εκτός από τη σύγκριση ομοζυγώτες στην υποομάδα TaqMan.

ΧΚΧΧ1 Arg280His πολυμορφισμού σε ΕΘΕΓ κινδύνου στο σύνολο του πληθυσμού.

έντεκα μελέτες, συμπεριλαμβανομένων 2.972 περιπτώσεις και 3.714 ελέγχους, εξετάζοντας τη σχέση μεταξύ ΧΚΧΧ1 Arg280His πολυμορφισμού και τον κίνδυνο ΕΘΕΓ εξετάστηκαν. Υπήρξε σημαντική διαφορά στην συχνότητα του πολυμορφισμού ΧΚΧΧ1 Arg280His μεταξύ τους Καυκάσιους και Ασιάτες (25,75% έναντι 9,04%, Ρ & lt? 0.001). Δεν υπήρχε σημαντική συσχέτιση της HNC κινδύνου με την παραλλαγή γονότυπους του ΧΚΧΧ1 Arg280His σε οποιοδήποτε γενετικό μοντέλο. Σημαντικές μεταξύ μελετών ετερογένεια ήταν η απουσία σε όλα τα γενετικά μοντέλα. Το οικόπεδο δάσος φαίνεται στο Σχήμα 4.

Η

ΧΚΧΧ1 Arg280His πολυμορφισμού σε ΕΘΕΓ κινδύνου σε συγκεκριμένες πληθυσμό.

Πραγματοποιήσαμε αναλύσεις υποομάδων από την εθνικότητα, τη θέση του όγκου, το έτος δημοσίευσης, και του γονότυπου μέθοδος για να εκτιμηθεί η σχέση μεταξύ ΧΚΧΧ1 Arg280His παραλλαγής γονότυπους και του κινδύνου NHC. Ωστόσο, καμία σημαντική συσχέτιση παρατηρήθηκε σε οποιαδήποτε υπο-ομάδα στο πλαίσιο διαφορετικών γενετικά μοντέλα, και δεν υπήρχε σημαντική ετερογένεια μεταξύ των μελετών σε οποιαδήποτε στρωματοποιημένη ανάλυση (Σχήματα S7-S12). Μόνο μία μελέτη αξιολόγησε την επίδραση της αλληλεπίδρασης μεταξύ του καπνίσματος και Arg280His πολυμορφισμού επί HNC κινδύνου? Ωστόσο, δεν είμαστε σε θέση να προβεί σε περαιτέρω στρωματοποιημένη ανάλυση της εν λόγω μελέτης.

ΧΚΧΧ1 Arg399Gln πολυμορφισμού σε ΕΘΕΓ κινδύνου στο σύνολο του πληθυσμού.

Υπήρχαν 27 μελέτες, μεταξύ των οποίων 6.466 περιπτώσεις και 9.379 ελέγχους, ότι εξέτασε τη σχέση μεταξύ του ΕΘΕΓ ευαισθησία και ΧΚΧΧ1 Arg399Gln πολυμορφισμό. Υπήρξε σημαντική διαφορά στην συχνότητα του πολυμορφισμού ΧΚΧΧ1 Arg399Gln μεταξύ τους Καυκάσιους και Ασιάτες (41,28% έναντι 44,65%, Ρ = 0,004). Συνολικά, η συσχέτιση μεταξύ παραλλαγή γονότυπων της ΧΚΧΧ1 Arg399Gln πολυμορφισμό και την ευαισθησία του ΕΘΕΓ δεν ήταν σημαντική στο πλαίσιο της αλληλομόρφων γενετικό μοντέλο, σύγκριση ομοζυγώτη, και το υπολειπόμενο πρότυπο. Μεταξύ-μελέτη ετερογένεια ανιχνεύθηκε σε όλα τα γενετικά μοντέλα. Το οικόπεδο δάσος φαίνεται στο Σχήμα 5.

Η

ΧΚΧΧ1 Arg399Gln πολυμορφισμού σε ΕΘΕΓ κινδύνου σε ένα συγκεκριμένο πληθυσμό.

Κατά την ανάλυση μίας υποομάδας με βάση την εθνικότητα, δεν υπάρχει σημαντική συσχέτιση μεταξύ ΧΚΧΧ1 Arg399Gln πολυμορφισμό και ΕΘΕΓ κίνδυνο βρέθηκε σε Ασιάτες (Σχήμα S13) και Καυκάσιους (Σχήμα S14). Ετερογένεια μεταξύ των μελετών δεν ήταν αξιοσημείωτη σε Καυκάσιους? Ωστόσο, σημαντική ετερογένεια ανιχνεύθηκε σε Ασιάτες κάτω από όλες τις γενετικές μοντέλα.

Τέσσερις μελέτες, συμπεριλαμβανομένων 663 περιπτώσεις και 1.162 έλεγχοι, πραγματοποιήθηκαν σε πληθυσμό OC, και δεν υπήρχε σημαντική συσχέτιση μεταξύ ΧΚΧΧ1 Arg399Gln πολυμορφισμό και την ευαισθησία ΕΘΕΓ (Σχήμα S15). Μεταξύ μελέτη ετερογένεια βρέθηκε σε όλες τις γενετικές μοντέλα.

Στο στρωματοποιημένη ανάλυση από το κάπνισμα στο αλληλομόρφων γενετικό μοντέλο και ομοζυγώτες σύγκρισης, τέσσερις μελέτες συμπεριλήφθηκαν και καμία σημαντική συσχέτιση βρέθηκε (Σχήμα S16). Επτά μελέτες συνενώθηκαν στο υπολειπόμενο μοντέλο. Ωστόσο, δεν καταφέραμε να αντλήσει μια σημαντική συσχέτιση μεταξύ του ΕΘΕΓ κινδύνου και Arg399Gln γονότυπο (Σχήμα S16). Ετερογένεια μεταξύ των μελετών, παρατηρήθηκε σε όλες τις γενετικές μοντέλα.

Σε στρωματοποιημένη ανάλυση ανά έτος δημοσίευση της λογοτεχνίας δημοσιεύθηκαν από το 2010-2012, σημαντική ετερογένεια ανιχνεύθηκε σε όλα τα γενετικά μοντέλα. Επιπλέον, βρήκαμε καμία συσχέτιση μεταξύ Arg399Gln και τον κίνδυνο ΕΘΕΓ κάτω από οποιοδήποτε γενετικό μοντέλο (Σχήμα S17).

Στην ανάλυση υποομάδων της μεθόδου προσδιορισμού του γονότυπου, PCR-RFLP, TaqMan και ανάλυση της αλληλουχίας χρησιμοποιήθηκαν στη βιβλιογραφία για προσδιορισμό του γονότυπου των ΧΚΧΧ1 Arg399Gln πολυμορφισμό. Τα αποτελέσματα δεν έδειξαν σημαντική συσχέτιση μεταξύ Arg399Gln και τον κίνδυνο ΕΘΕΓ σε κάθε στρωματοποιημένη ανάλυση κάτω από διαφορετικές γενετικές μοντέλα (Σχήματα S18-S20).

προκατάληψη Δημοσίευση

Τόσο η δοκιμασία Begg και δοκιμή Egger για διεξήχθησαν για την αξιολόγηση η προκατάληψη δημοσίευση της λογοτεχνίας. Οπτική ανάλυση των οικοπέδων χοάνη δεν παρουσίασε καμία ένδειξη προφανής ασυμμετρία για κάθε γενετικό μοντέλο στο σύνολο των μετα-αναλύσεις των ΧΚΧΧ1 Arg194Trp, Arg280His και Arg399Gln (Εικόνες 6-8). Ωστόσο, προφανείς ενδείξεις για μεροληψία δημοσίευσης αποκαλύφθηκε στην ασιατική ομάδα ΧΚΧΧ1 Arg194Trp κάτω από όλες τις γενετικές μοντέλα. Σε ΧΚΧΧ1 Arg399Gln κάπνισμα στρωματοποιημένη ανάλυση, η πιθανή προκατάληψη δημοσίευση δεν αποκαλύφθηκε στη δοκιμασία Begg είναι κάτω από οποιαδήποτε γενετικό μοντέλο, αλλά παρουσιάστηκε στην δοκιμασία του Egger του. Ούτε δοκιμή του Begg ούτε δοκιμή του Egger ανίχνευσε κανένα προφανή απόδειξη της μεροληψίας δημοσίευση και σε άλλες στρωματοποιημένη αναλύσεις για όλες τις γενετικές μοντέλα (Πίνακας 3).

Η

Η

Συζήτηση

μηχανισμοί επιδιόρθωσης DNA διαδραματίζουν έναν κρίσιμο ρόλο στην προστασία των κυττάρων από βλάβες στο DNA και στην διατήρηση της ακεραιότητας γονιδιωματικού. Η πρωτεΐνη που κωδικοποιείται από το γονίδιο ΧΚΧΧ1 είναι μια πρωτεΐνη σκαλωσιά που συνδυάζεται με την DNA λιγάση Ι, DNA λιγάση III, κινάση πολυνουκλεοτιδίου (ΡΝΚ), β DNA πολυμεράση, και πολυ πολυμεράση, τα οποία είναι μέρη του συστήματος επιδιόρθωσης DNA. Η αλληλεπίδραση των ΧΚΧΧ1 με την DNA λιγάση III μπορεί να αυξήσει τον ενδοκυτταρικής σταθερότητας της λιγάσης. Οι κοινές επιπτώσεις της ΧΚΧΧ1 και ΡΝΚ τονώσει τις δραστηριότητες 5′-κινάσης και 3′-φωσφατάση. Όλες αυτές οι συνθήκες προάγουν την επιδιόρθωση του DNA. Ως εκ τούτου, παραλλαγή αλληλουχίας στο γονίδιο ΧΚΧΧ1 προτείνεται να θωρακίζουν καρκίνου. Οι πιο κοινές γονότυποι παραλλαγή ΧΚΧΧ1, συμπεριλαμβανομένης της Arg194Trp, Arg399Gln, και τα γονίδια Arg280His, περιγράφονται και μια σειρά από μελέτες έχουν διερευνήσει την γενετική επίδραση του ΧΚΧΧ1 Arg194Trp, Arg280His, και πολυμορφισμούς Arg399Gln επί HNC ευαισθησία με αντιφατικά αποτελέσματα. Αυτή η ποικιλομορφία παρακινεί την τρέχουσα ενημερωμένη μετα-ανάλυση που μπορεί να μας βοηθήσει να εξερευνήσουν μια πιο ισχυρή εκτίμηση της επίδρασης της ΧΚΧΧ1 πολυμορφισμού σχετικά με τον κίνδυνο της ΕΘΕΓ. Στην παρούσα μετα-ανάλυση 6.719 περιπτώσεις και 9.627 μάρτυρες, ανιχνεύθηκε καμία ένδειξη μιας σημαντική συσχέτιση μεταξύ του ΕΘΕΓ ευαισθησίας και κάθε είδους παραλλαγή ΧΚΧΧ1 γονότυπο.

Μια προηγούμενη μετα-ανάλυση, που πραγματοποιήθηκε το 2010 από Flores- Obando et al., αξιολόγησε τη σχέση μεταξύ πολυμορφισμών ΧΚΧΧ1 και τον κίνδυνο της ΕΘΕΓ με βάση 15 εκδόσεις, συμπεριλαμβανομένων 2.330 περιπτώσεις και 3.834 έλεγχοι για Arg194Trp, τέσσερις εκδόσεις, συμπεριλαμβανομένων 879 περιπτώσεις και 926 έλεγχοι για Arg280His, και 15 μελέτες στις οποίες συμμετείχαν 3.582 περιπτώσεις και 5.347 ελέγχους για Arg399Gln πολυμορφισμό. Έχουμε ενημερωθεί αυτό το μετα-ανάλυση με την προσθήκη των μεγεθών του δείγματος. Ένα σύνολο των 22 μελετών, συμπεριλαμβανομένων 4.487 περιπτώσεις και 6.873 ελέγχους, αξιολόγησε τη συσχέτιση μεταξύ του γονιδίου ΧΚΧΧ1 Arg194Trp και τον κίνδυνο ΕΘΕΓ? 11 μελέτες, συμπεριλαμβανομένων 2.972 περιπτώσεις και 3.714 ελέγχους, αξιολόγησε τη σχέση μεταξύ Arg280His και τον κίνδυνο ΕΘΕΓ? και 27 μελετών, συμπεριλαμβανομένων 6.466 περιπτώσεις και 9.379 ελέγχους, αξιολόγησε τη σχέση μεταξύ Arg399Gln πολυμορφισμού και τον κίνδυνο ΕΘΕΓ. Υπάρχουν ορισμένες διαφορές μεταξύ της Flores-Obando et al. μετα-ανάλυση και η δική μας. Μια οριακή συσχέτιση μεταξύ ΧΚΧΧ1 Arg399Gln πολυμορφισμού και τον κίνδυνο ΕΘΕΓ εντοπίστηκε κάτω από το υπολειπόμενο γενετικό μοντέλο για Καυκάσιους στη μετα-ανάλυση που διενεργήθηκε από Flores-Obando et al., Αλλά δεν βρέθηκε στη δική μας. Αυτά τα ποικίλα αποτελέσματα μπορεί, εν γένει, να οφείλεται στις διαφορές των μελετών που περιλαμβάνονται στο μετα-ανάλυση. Ρινοφαρυγγικού καρκινώματος (NPC) είναι ένας τύπος ΕΘΕΓ, η οποία έχει μια εντυπωσιακή γεωγραφική και εθνική κατανομή, με ιδιαίτερα υψηλά ποσοστά παρατηρούνται μεταξύ των Ασιατών. Η βιβλιογραφία σχετικά με NPC δεν περιελήφθη στο Flores-Obando et al. σπουδάσουν, αλλά συμπεριλήφθηκε στο δικό μας. Στην προαναφερόμενη στρωματοποιημένη αποτέλεσμα της ανάλυσης, επτά άρθρα μοιράστηκαν το Flores-Obando et al. μελέτη και η μελέτη μας, και η μελέτη μας περιελάμβανε επιπλέον επτά άρθρα, συμπεριλαμβανομένης πρόσφατα δημοσιευμένη βιβλιογραφία και NPC λογοτεχνία. Τα αποτελέσματα αυτών των μελετών επτά αντιπροσωπεύουν 54,94% κατά βάρος (Σχήμα 9), το οποίο προκάλεσε τη διαφορά μεταξύ αυτών των δύο μετα-αναλύσεις. Κατά την εκτίμηση της επίδρασης της ΧΚΧΧ1 Arg194Trp παραλλαγή γονότυπους για ΕΘΕΓ ευαισθησία, την μετα- ή διεξάγεται από Flores-Obando et al. βρέθηκε σημαντική συσχέτιση μεταξύ της παραλλαγής Arg194Trp και τον κίνδυνο ΕΘΕΓ για σύγκριση ομοζυγώτες στο συνολικό πληθυσμό και στην ασιατική ομάδα, η οποία δεν ανιχνεύθηκε σε μας μετα-ανάλυση. Παρομοίως, στη μελέτη μας, ένα επιπλέον εννέα μελέτες και τέσσερις μελέτες, που αποτελείται από πρόσφατα δημοσιευμένες έρευνες και μελέτες NPC, περιλαμβάνονται στη συνολική πληθυσμιακή ομάδα και την ασιατική ομάδα, αντίστοιχα. Τα αποτελέσματα αυτών των πρόσθετων μελετών αντιπροσωπεύουν 53,46% και 53,79% κατά βάρος (Σχήματα 10-11), αντίστοιχα. Στους ελέγχους σε μια μελέτη που διεξήχθη από Demokan et al, διανομή γονότυπο σε Arg194Trp παρέκκλινε από HWE, ο οποίος αποκλείστηκε στην ανάλυσή μας Arg194Trp πολυμορφισμού.? Ωστόσο, συμπεριλήφθηκε στο Flores-Obando et al. άρθρο. Επιπλέον, τόσο η μελέτη μας και ο Flores-Obando et al. μελέτη περιελάμβανε δύο μελέτες από Majumder et al. πιο πρόσφατη δημοσίευση Majumder et al. συμπεριλαμβανόταν στη μελέτη μας, αλλά η έρευνα που δημοσιεύθηκε το 2005 Majumder et al. συμπεριλαμβανόταν στο Flores-Obando et al. μετα-ανάλυση. Οι παράγοντες αυτοί οδηγούν σε διαφορετικό συμπέρασμα. Πολλές άλλες σχέσεις δεν περιγράφονται στην Flores-Obando et al. άρθρο. Επιπλέον, θα πραγματοποιηθεί αναλύει ορισμένες ανεξάρτητες και πρωτότυπο υποομάδα. Η ανάλυση των υποομάδων του καπνίσματος δεν έγινε στη μελέτη του Φλόρες-Obando, αλλά δεν συμπεριλήφθηκε σε αυτή την μετα-ανάλυση. Πραγματοποιήσαμε επίσης στρωματοποιημένη αναλύσεις προσδιορισμού του γονοτύπου μεθόδους και έτος δημοσίευσης, και όλα τα αποτελέσματα έδειξαν καμία συσχέτιση μεταξύ ΧΚΧΧ1 πολυμορφισμό και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου. Ως εκ τούτου, μας μετα-ανάλυση έχει ισχυρότερη απόδειξη για την αποσαφήνιση των ενώσεων.

Η

Η

Η σχέση μεταξύ του ΕΘΕΓ ευαισθησία και παραλλαγή γονότυπους των ΧΚΧΧ1 ενδέχεται να επηρεαστούν από τις περιοχές του όγκου. Κατά συνέπεια, πραγματοποιήσαμε επίσης στρωματοποιημένη ανάλυση στην ομάδα του καρκίνου του στόματος.

PRISMA Λίστα ελέγχου.