PLoS One: NOD2 πολυμορφισμών που σχετίζονται με τον κίνδυνο καρκίνου: Μια μετα-ανάλυση


Αφηρημένο

Ιστορικό

Οι αναδυόμενες αποδεικτικά στοιχεία δείχνουν ότι η κοινή πολυμορφισμοί του

NOD2

μπορεί να επηρεάσει την ατομική ευαισθησία στον καρκίνο. Ωστόσο, τα αποτελέσματα από τις δημοσιευμένες μελέτες ήταν ασαφή. Ο στόχος αυτής της μετα-ανάλυσης ήταν να διευκρινίσει εάν

NOD2

πολυμορφισμοί που σχετίζονται με τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου.

Μέθοδοι

Μια συστηματική βιβλιογραφική έρευνα πραγματοποιήθηκε με τη χρήση ηλεκτρονικών βάσεων δεδομένων, συμπεριλαμβανομένων PubMed και Web of Science. ΕΑΠ και το 95% CI τους χρησιμοποιήθηκαν για την αξιολόγηση του βαθμού συσχέτισης μεταξύ των

NOD2

πολυμορφισμών των γονιδίων και των κινδύνων του καρκίνου.

Αποτελέσματα

Τριάντα μελέτες ασθενών-μαρτύρων συμπεριλήφθηκαν σε αυτό μετα-ανάλυση. Η συγκεντρωτική ανάλυση έδειξε ότι

NOD2

rs2066842 C /T πολυμορφισμός δεν συσχετίστηκε σημαντικά με τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου? για

NOD2

rs2066844 C /Τ πολυμορφισμού, (ΤΤ + CT) γονότυπος σχετίζεται με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου σε σύγκριση με γονότυπο άγριου τύπου CC (OR = 1,32, 95% CI = 1,01 – 1,72, P = 0,041) ? για

NOD2

rs2066845 C /G πολυμορφισμό, τα άτομα με γονότυπο (CG CC +) ήταν σημαντικά σχετίζεται με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου σε σύγκριση με GG γονότυπο (OR = 1,32, 95% CI = 1,01 – 1,72, P = 0,040) ? για

NOD2

rs2066847 (3020insC) πολυμορφισμός, φορείς (ΜΣΠΑ /ΜΣΠΝ + INSC /-) γονότυπου ήταν σημαντικά σχετίζεται με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου σε σύγκριση με – /- φορείς (OR = 1,23, 95% CI = 1.10- 1,38, P & lt? 0.001). Στην ανάλυση υποομάδας του τύπου καρκίνου, (INSC /ΜΣΠΝ + INSC /-) γονότυπου ήταν σημαντικά σχετίζεται με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου του παχέος εντέρου, του καρκίνου του στομάχου και του λέμφωμα MALT, ο καρκίνος του μαστού, ο καρκίνος του πνεύμονα, ο καρκίνος του λάρυγγα αλλά όχι με τον καρκίνο του ουρογεννητικού, του καρκίνου του παγκρέατος , μελάνωμα ή μη-Hodgkin λέμφωμα.

Συμπέρασμα

NOD2

rs2066844 C /T, rs2066845 C /G και rs2066847 (3020insC) πολυμορφισμοί μπορεί να σχετίζεται με αυξημένο κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου . Καμία σημαντική συσχέτιση παρατηρήθηκε μεταξύ

NOD2

rs2066842 C /Τ πολυμορφισμού και του καρκίνου του κινδύνου. Περαιτέρω μεγάλης κλίμακας και καλά σχεδιασμένες μελέτες χρειάζονται ακόμη να επιβεβαιωθούν τα αποτελέσματα της μας μετα-ανάλυση

Παράθεση:. Liu J, Εκείνος C, Xu Q, Xing C, Yuan Υ (2014)

NOD2

πολυμορφισμών που σχετίζονται με τον κίνδυνο καρκίνου: Μια μετα-ανάλυση. PLoS ONE 9 (2): e89340. doi: 10.1371 /journal.pone.0089340

Συντάκτης: William B. Coleman, του Πανεπιστημίου της Βόρειας Καρολίνας Σχολή Ιατρικής, Ηνωμένες Πολιτείες της Αμερικής

Ελήφθη: 1 του Νοεμβρίου 2013? Αποδεκτές: 20 Ιανουαρίου, 2014? Δημοσιεύθηκε: 20 Φεβρουαρίου 2014

Copyright: © 2014 Liu et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Αυτή η μελέτη υποστηρίζεται από επιχορηγήσεις από το Εθνικό Πρόγραμμα βασικής Έρευνας της Κίνας (973 Πρόγραμμα Ref No.2010CB529304), τις επιχορηγήσεις του Προγράμματος Επιστήμης και Τεχνολογίας της επαρχίας Liaoning (Ref No.2011225002) και τις επιδοτήσεις του Προγράμματος Επιστήμης και Τεχνολογίας της επαρχίας Liaoning ( Ref No.2012225016). Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

Ο καρκίνος είναι ένα μείζον πρόβλημα υγείας στα περισσότερα μέρη του κόσμου. Περίπου 12,7 εκατομμύρια κρούσματα καρκίνου και 7,6 εκατομμύρια θάνατοι από καρκίνο εκτιμάται ότι συμβαίνουν κάθε χρόνο σε όλο τον κόσμο [1]. Η πρόληψη και η θεραπεία για καρκίνους που προκαλούνται αύξηση των χρηματοοικονομικών επιβαρύνσεων σε όλο τον κόσμο [2]. Ως πολύπλοκη ασθένεια, καρκίνος επηρεάζεται έντονα από περιβαλλοντικούς και γενετικούς παράγοντες, εκ των οποίων πολυμορφισμό του γονιδίου είναι μια κρίσιμη αιτία για τη διαφορά των επιμέρους γενετική ευαισθησία σε καρκίνο του [3]. Προσδιορισμός των βασικών πολυμορφισμών του γονιδίου που σχετίζεται με τον κίνδυνο καρκίνου του είναι απαραίτητη για την πρόβλεψη ατόμου σε κίνδυνο.

Ο τομέας ολιγομερισμού νουκλεοτίδιο δέσμευσης που περιείχε 2 (

NOD2

) γονίδιο, επίσης γνωστή ως

CARD15

, χαρτογραφείται στο χρωμόσωμα 16q21. NOD2 είναι μέλος της εξελικτικά συντηρημένη Nod-σαν υποδοχείς (ΕΜΑΜ) οικογένεια που μοιράζονται μια τριμερή δομή του C-τερματικού τομέα αισθητήρα (πλούσιες σε λευκίνη επαναλήψεις, LRRs), ένα κεντρικό νουκλεοτίδιο-πεδίο σύνδεσης ολιγομερισμού (NOD) και ένα Ν- τερματικό περιοχή τελεστή (CARD) [4]. NOD2 συμμετέχει σε αισθητήρες του τοιχώματος μικροβιακού κυττάρου και έχει αναφερθεί ότι ρυθμίζουν την απόπτωση και χρόνιες φλεγμονώδεις καταστάσεις [5]. Οι πιο συχνά μελετηθεί πολυμορφισμών περιλαμβάνονται τρεις μεταλλάξεις απουσίας (rs2066842 C /T, rs2066844 C /T, rs2066845 C /G) και μια μετάλλαξη μετατόπισης πλαισίου (rs2066847 ΜΣΠΑ). Αυτές οι τέσσερις πολυμορφισμοί βρίσκονται σε περιοχές κωδικοποίησης και μπορεί να επηρεάσει την έκφραση και τη λειτουργία του NOD2 μεταβάλλοντας αμινοξέων. Πρόσφατα, αυξάνοντας μελέτες διερευνήθηκαν οι σχέσεις μεταξύ των τεσσάρων αυτών πολυμορφισμών και τον κίνδυνο της νόσου.

Οι πολυμορφισμοί rs2066842, rs2066844, rs2066845 και rs2066847 αρχικά βρέθηκε να σχετίζεται με αυξημένο κίνδυνο της νόσου του Crohn (CD) το 2001 σε 2003 [ ,,,0],6]. Στη συνέχεια, η σχέση μεταξύ αυτών των πολυμορφισμών και η ελκώδης κολίτιδα (UC) κίνδυνος αποκαλύφθηκε [7]. Το 2004, Kurzawski et al. πρώτη συνδέονται

NOD2

πολυμορφισμού με τον κίνδυνο καρκίνου του παχέος εντέρου [8]. Μετά από αυτό, η αύξηση μελέτες επικεντρώθηκαν, για τη σύνδεση μεταξύ

NOD2

πολυμορφισμούς και τους κινδύνους των διαφόρων μορφών καρκίνου, συμπεριλαμβανομένων του καρκίνου του στομάχου, του παχέος εντέρου, καρκίνο του ενδομητρίου, τον καρκίνο του μαστού, τον καρκίνο των ωοθηκών, καρκίνο του λάρυγγα και ούτω καθεξής. Ωστόσο, τα αποτελέσματα από τις μεμονωμένες μελέτες ήταν ασυνεπής.

Μέχρι στιγμής, δεν υπάρχει μια ολοκληρωμένη μετα-ανάλυση έχει διερευνηθεί το συνολικό κίνδυνο καρκίνου σε σχέση με το

NOD2

πολυμορφισμών, εκτός από μια μετα-ανάλυση μόνο σχετικά με τον καρκίνο του παχέος το 2010. για να διερευνήσουν κατά πόσον

NOD2

πολυμορφισμοί που σχετίζονται με τους κινδύνους της συνολικής καρκίνου και των ειδικών υποτύπων καρκίνου, πραγματοποιήσαμε μια μετα-ανάλυση για τη σύνδεση μεταξύ των τεσσάρων πιο συχνά μελετηθεί

NOD2

πολυμορφισμών (rs2066842 C /T, rs2066844 C /T, rs2066845 C /G και rs2066847 INSC) και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου στην παρούσα μελέτη.

Υλικά και Μέθοδοι

Αναγνώριση και την επιλεξιμότητα των σχετικών μελετών

Φιλολογιών των ηλεκτρονικών βάσεων δεδομένων, συμπεριλαμβανομένων PubMed και Web of Science συστηματικά αναζήτηση χρησιμοποιώντας τους όρους αναζήτησης των «

NOD2 /CARD15

«, «πολυμορφισμός /μετάλλαξης /παραλλαγή» και «καρκίνος /κακοήθεια /νεόπλασμα «. Παραπομπές που αναφέρονται σε κάθε εντοπίστηκαν λογοτεχνίες περαιτέρω αναζήτηση με το χέρι για να βρείτε πιθανές διαθέσιμες μελέτες. Ήρθαμε σε επαφή με τον συγγραφέα για συγκεκριμένες πρώτες δεδομένων αν τα δεδομένα που παρουσιάζονται στο άρθρο δεν ήταν επαρκή. Όταν η επικάλυψη δεδομένων υπάρχει, επιλέχθηκε μόνο η πιο πρόσφατη μελέτη με το μεγαλύτερο δείγμα για αυτό το μετα-ανάλυση. Η τελευταία ημερομηνία αναζήτησης ήταν η 1η Ιουλίου 2013.

ένταξης και αποκλεισμού Κριτήρια

Οι μελέτες που περιλαμβάνονται στην παρούσα μετα-ανάλυση πρέπει να πληρούν τα κριτήρια ένταξης ως εξής: μελέτες παρατήρησης σχετικά με τη σύνδεση μεταξύ του

NOD2

πολυμορφισμούς του γονιδίου (rs2066842 C /T, rs2066844 C /T, rs2066845 C /G και rs2066847 INSC) και του καρκίνου κινδύνους? μελέτες που δημοσιεύθηκαν στα αγγλικά? μελέτες με επαρκή πρωτογενή δεδομένα για την εκτίμηση των λόγων πιθανοτήτων (OR) και το διάστημα εμπιστοσύνης 95% τους (CI)? η ομάδα ελέγχου των μελετών πρέπει να είναι σύμφωνα με το Hardy Weinberg ισορροπία (HWE). Οι κύριοι λόγοι για αποκλεισμό ήταν αξιολογήσεις ή μετα-ανάλυση? πειράματα σε ζώα? δεν έχουν σχέση με συγκεκριμένες πολυμορφισμούς? διπλές εκδόσεις? Δεν ανεπεξέργαστα δεδομένα μετά από επικοινωνία με τον συγγραφέα? μελέτες όχι στα αγγλικά.

Data Extraction

Δύο συγγραφείς (Jingwei Liu και Caiyun He) εξάγονται τα δεδομένα από τις μελέτες που περιλαμβάνονται ανεξάρτητα. Οι ακόλουθες πληροφορίες προέρχονται από κάθε μελέτη: πρώτος συγγραφέας, έτος δημοσίευσης, την εθνικότητα του πληθυσμού, ο αριθμός των περιπτώσεων και ελέγχων, των μεθόδων ανίχνευσης των

NOD2

πολυμορφισμό και η πηγή της ομάδας ελέγχου. Οι συγκρούσεις υποχώρησαν μετά τη συζήτηση και συναίνεση επιτεύχθηκε τελικά για όλα τα εξαγόμενα δεδομένα

Στατιστική Ανάλυση

Η στατιστική ανάλυση έγινε με το λογισμικό Stata (έκδοση 11.0?. StataCorp, College Station, TX ). ΕΑΠ και το 95% CI τους χρησιμοποιήθηκαν για την αξιολόγηση του βαθμού συσχέτισης μεταξύ των

NOD2

πολυμορφισμών των γονιδίων και των κινδύνων του καρκίνου. Ρ τιμή & lt? 0,05 θεωρήθηκε ως στατιστικά σημαντική. Ετερογένεια μετρήθηκε με τη χρήση Q στατιστική (P & lt? 0.10 δείχνει σημαντική ετερογένεια μεταξύ των μελετών) και Ι-τετράγωνο (Ι

2) αξίας [9]. Ένα σταθερό ενέργειες μοντέλο χρησιμοποιώντας τη μέθοδο Mantel-Haenszel [10] έγινε για τον υπολογισμό των συγκεντρωμένων ΕΑΠ όταν ετερογένεια μεταξύ των μελετών δεν ήταν σημαντική. Διαφορετικά, εφαρμόστηκε ένα μοντέλο τυχαίων δράσεων χρήση Dersimonian και η μέθοδος Laird [11]. ανάλυση ευαισθησίας πραγματοποιήθηκε για να εξερευνήσετε ετερογένεια όταν αναφέρθηκε σημαντική ετερογένεια. αναλύσεις υποομάδων έγιναν για να διερευνήσει τις επιπτώσεις του τύπου του καρκίνου και την πηγή των ελέγχων. Επιπλέον, η προκατάληψη δημοσίευση αξιολογήθηκαν ποιοτικά εκτελώντας οικόπεδα χοάνη και αξιολογούνται ποσοτικά με δοκιμασία Begg [12] και τη δοκιμή Egger [13], αντίστοιχα. P τιμή & lt? 0,05 για Begg και δοκιμές Egger υποδεικνύει σημαντική προκατάληψη δημοσίευση

Αποτελέσματα

Χαρακτηριστικά του Συμπεριλαμβάνεται Σπουδών

Αυτή η μετα-ανάλυση οργανώθηκε σύμφωνα με την ανακοίνωση PRISMA (. Λίστα ελέγχου S1). Απόλυτα 93 λογοτεχνίες ήταν αταξινόμητους μέσω ηλεκτρονικών βάσεων δεδομένων μετά την απομάκρυνση εις διπλούν. Μετά την εξέταση τους τίτλους και περιλήψεις των πιθανών διαθέσιμων άρθρα, 57 βιβλία αποκλείστηκαν, κυρίως επειδή δεν έχει σημασία, in vitro ή ζώων πειράματα, σχόλια ή μετα-ανάλυσης. Οι άφησε 36 άρθρα πλήρους κειμένου αξιολογήθηκε περαιτέρω επιλεξιμότητας. Τέλος, 30 άρθρα πλήρους κειμένου με την επιλεξιμότητα συμπεριλήφθηκαν σε αυτή την μετα-ανάλυση [8], [14] – [42]. Το διάγραμμα ροής της επιλογής του άρθρου παρουσιάστηκε στο σχήμα S1.

Τα κύρια χαρακτηριστικά των μελετών που περιλαμβάνονται σε αυτό το μετα-ανάλυση συνοψίζονται στον Πίνακα 1. Όλες οι περιλαμβάνονται μελέτες περίπτωση-ελέγχου που έχουν σχεδιαστεί δημοσιεύεται στα αγγλικά. Οι πληθυσμοί των μελετών ήταν όλα Καυκάσιους. Τέσσερις μελέτες που αποτελείται από 368 περιπτώσεις και 567 έλεγχοι διερευνήθηκε η συσχέτιση της

NOD2

rs2066842 C /T (P268S) πολυμορφισμός και τον κίνδυνο καρκίνου? 16 μελέτες στις οποίες συμμετείχαν 4.507 περιπτώσεις και 4780 ελέγχους μελέτησαν τη σύνδεση της

NOD2

rs2066844 C /T (R702W) πολυμορφισμού και του καρκίνου του κινδύνου? 14 άρθρα συμπεριλαμβανομένων των 4185 περιπτώσεις και 4474 ελέγχους διερευνήθηκε η συσχέτιση της

NOD2

rs2066845 C /G (G908R) πολυμορφισμού και του καρκίνου του κινδύνου? για

NOD2

πολυμορφισμού rs2066847 /rs5743293 (3020insC), συμπεριλήφθηκαν 25 μελέτες που αποτελείται από 23.167 περιπτώσεις και 28.601 ελέγχους. Οι τύποι των καρκίνων που μελετήθηκαν σε σχέση με

NOD2

πολυμορφισμοί συμπεριλαμβάνονται γαστρικό καρκίνο και λέμφωμα MALT, ορθοκολικό καρκίνο (CRC), μελάνωμα, καρκίνο του ενδομητρίου, τον καρκίνο του παγκρέατος, καρκίνο του μαστού, μη-Hodgkin λέμφωμα, καρκίνο του λάρυγγα, λεμφοκυτταρική λευχαιμία και καρκίνου των ωοθηκών. Τα δεδομένα που αφορούν διαφορετικούς καρκίνους αντιμετωπίστηκαν ως ξεχωριστές μελέτες στην ανάλυση υποομάδας.

Η

Σύλλογοι

NOD2

πολυμορφισμοί με Καρκίνο Κίνδυνοι

Για

NOD2

rs2066842 C /T (P268S) πολυμορφισμός, φορείς του ΤΤ ή CT γονότυπο δεν συσχετίστηκαν σημαντικά με τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου σε σύγκριση με το αγρίου τύπου CC γονότυπο (ΤΤ έναντι CC: OR = 2.48, 95% CI = 0,85 – 7,25, P = 0,097 ? CT εναντίον CC: OR = 1,32, 95% CI = 0,54 – 3,25, P = 0,543, Πίνακας 2). Παρομοίως, καμία σημαντική σχέση βρέθηκε σε υπολειπόμενο μοντέλο επίδραση του (ΤΤ + CT) γονότυπο σύγκριση με CC γονότυπο (OR = 1.74, 95% CI = 0,80 – 3,77, Ρ = 0.163, Εικόνα 1) ή σε ανάλυση αλληλόμορφο Τ αλληλίου σύγκρισης με αλληλόμορφο C (OR = 1.54, 95% CI = 0,74 – 3,21, Ρ = 0,247) (Πίνακας 2). Τα αποτελέσματα από την ανάλυση υποομάδας

NOD2

rs2066842 πολυμορφισμός παρουσιάστηκαν στον Πίνακα S1.

Η

Για

NOD2

rs2066844 C /T (R702W) πολυμορφισμός, άτομα με ΤΤ ή CT γονότυπο σχετίζονταν με αυξημένο κίνδυνο για καρκίνο σε σχέση με τους μεταφορείς CC, αντίστοιχα (ΤΤ έναντι CC: OR = 3.77, 95% CI = 1,30 – 10,93, P = 0,015? CT εναντίον CC: OR = 1,34, 95% CI = 1,01 – 1,76, P = 0,040, Πίνακας 2). (ΤΤ + CT) γονότυπο συσχετίστηκε με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου σε σύγκριση με γονότυπο άγριου τύπου CC (OR = 1.32, 95% CI = 1,01 – 1,72, Ρ = 0,041, Σχήμα 2). Στην ανάλυση υποομάδας τύπου καρκίνου, (ΤΤ + CT) γονότυπος σχετίζεται με σημαντικά αυξημένο κίνδυνο CRC (OR = 1,26, 95% CI = 1,03 – 1,53, P = 0,027), αλλά καμία σημαντική συσχέτιση παρατηρήθηκε για γαστρικών όγκων (Πίνακας S2). Επιπλέον, Τ αλληλόμορφο

NOD2

rs2066844 C /T πολυμορφισμού συσχετίστηκε με σημαντικά αυξημένο κίνδυνο καρκίνου σε σύγκριση με το αλληλόμορφο C (Πίνακας 2).

Η

Για

NOD2

rs2066845 C /G (G908R) πολυμορφισμός, CG μεταφορείς γονότυπο παρατηρήθηκαν να σχετίζονται σημαντικά με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου σε σύγκριση με φορείς GG (OR = 1.39, 95% CI = 1,03 – 1,87, Ρ = 0,030, Πίνακας 2). Τα άτομα με γονότυπο (CG CC +) ήταν σημαντικά σχετίζεται με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου στη συνολική ανάλυση (OR = 1.32, 95% CI = 1,01 – 1,72, Ρ = 0,040, Εικόνα 3) και στο γαστρικό υποομάδα όγκου (OR = 2.70, 95% CI = 1,39 – 5,25, P = 0,003, Πίνακας S3), αλλά καμία σημαντική συσχέτιση παρατηρήθηκε στο CRC υποομάδα. Επιπλέον, C αλληλόμορφο συσχετίστηκε με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου σε σύγκριση με το G αλληλόμορφο

Η

Για

NOD2

rs2066847 /rs5743293 (3020insC) πολυμορφισμός, φορείς της ΜΣΠΝ /ΜΣΠΝ ή INSC /-. Γονότυπο συσχετίστηκαν με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου σε σύγκριση με το αγρίου τύπου – /- φορείς, αντίστοιχα (INSC /INSC έναντι – /-: OR = 3,42, 95% CI = 1,59 – 7,40, P = 0,002? INSC /- έναντι – /-: OR = 1.35, 95% CI = 1,06 – 1,72, P = 0,016). Τα άτομα με (INSC /ΜΣΠΝ + INSC /-) γονότυπου ήταν σημαντικά σχετίζεται με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου σε σύγκριση με – /- φορείς (OR = 1,23, 95% CI = 1,10-1,38, P & lt? 0.001, Εικόνα 4). Στην ανάλυση υποομάδας του τύπου καρκίνου, (INSC /ΜΣΠΝ + INSC /-) γονότυπου ήταν σημαντικά σχετίζεται με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου του παχέος εντέρου, του καρκίνου του στομάχου και του λέμφωμα MALT, ο καρκίνος του μαστού, ο καρκίνος του πνεύμονα, ο καρκίνος του λάρυγγα αλλά όχι με τον καρκίνο του ουρογεννητικού, του καρκίνου του παγκρέατος , μελάνωμα ή μη Hodgkin λέμφωμα (Πίνακας S4). Στην ανάλυση υποομάδων της πηγής ελέγχου, (INSC /ΜΣΠΝ + INSC /-) γονότυπου συσχετίστηκε με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου σε νοσοκομείο με βάση υποομάδα (OR = 1,25, 95% CI = 1,12-1,40, P & lt? 0.001), αλλά χωρίς σημαντική συσχέτιση παρατηρήθηκε στον πληθυσμό με βάση το υποομάδα (Πίνακας S4).

η

η ετερογένεια Test, Ανάλυση ευαισθησίας, και Δημοσίευση Bias

για τους περισσότερους συγκρίσεις για το

NOD2

γονίδιο rs2066844 C /T, rs2066845 C /G και rs2066847 πολυμορφισμούς ΜΣΠΝ, δεν παρατηρήθηκε εμφανής ετερογένεια (Ι

2 & lt? 50%). Ο αποκλεισμός κάθε μεμονωμένη μελέτη δεν μεταβλήθηκε σημαντικά το συνολικό αποτέλεσμα, γεγονός που υποδηλώνει ότι τα αποτελέσματα της μετα-ανάλυσης ήταν ισχυρή. Ωστόσο, στις περισσότερες από τις συγκρίσεις rs2066842 C /T πολυμορφισμού, σημαντική ετερογένεια παρατηρήθηκε, η οποία δεν μπορεί να εξηγηθεί πλήρως από το σχεδιασμό μελέτη ή ανάλυση υποομάδας. Η ετερογένεια μπορεί να προκύψουν από τον περιορισμένο αριθμό των μελετών που περιλαμβάνονται. Εκτός αυτού, μετα-παλινδρόμησης δεν έγινε για να εξερευνήσετε την πηγή της ετερογένειας, λόγω του περιορισμένου αριθμού μελέτη.

δοκιμή του Begg και δοκιμή Egger του έγιναν για να αξιολογηθεί ποσοτικά η μεροληψία δημοσίευση των μελετών. Τα αναλυτικά αποτελέσματα για τη δοκιμή προκατάληψη δημοσίευση συνοψίζονται στον Πίνακα 3. Καμία σημαντική προκατάληψη δημοσίευση παρατηρήθηκε σε αυτό το μετα-ανάλυση, εκτός από δύο συγκρίσεις στο

NOD2

rs2066847 πολυμορφισμό ΜΣΠΝ. Επιπλέον, οικόπεδα χοάνη που ποιοτικά αξιολόγησε την προκατάληψη δημοσίευση της σύνδεσης μεταξύ

NOD2

rs2066847 πολυμορφισμού και του καρκίνου του κινδύνου ΜΣΠΝ παρουσιάστηκε στο σχήμα S2.

Η

Συζήτηση

Αποτελέσματα από προηγούμενες μεμονωμένες μελέτες που διερευνούν τις συσχετίσεις μεταξύ

NOD2

πολυμορφισμών και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου ήταν ασαφή. Για τις γνώσεις μας, αυτή ήταν η πρώτη ολοκληρωμένη μετα-ανάλυση σχετικά με την επίδραση του

NOD2

rs2066842 C /T, rs2066844 C /T, rs2066845 C /G και rs2066847 ΜΣΠΝ πολυμορφισμούς σχετικά με τους κινδύνους της συνολικής καρκίνου και των ειδικών υποτύπων καρκίνου . Με την ανάλυση των δεδομένων που προέρχονται από 30 δημοσιεύσεις πλήρους κειμένου, που αποκάλυψε ότι

NOD2

rs2066844 C /T, rs2066845 C /G και rs2066847 (3020insC) πολυμορφισμοί μπορεί να σχετίζεται με αυξημένο κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου, ιδίως για τον καρκίνο του γαστρεντερικού, αλλά δεν σημαντική συσχέτιση παρατηρήθηκε μεταξύ

NOD2

rs2066842 C /Τ πολυμορφισμού και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου.

NOD2

γονίδιο αποτελείται από 12 εξώνια και κωδικοποιεί μια πρωτεΐνη που αποτελείται από 1040 αμινοξέα. NOD2 αναγνωρίζεται μικροβιακά παθογόνα που βρίσκονται στο κυτταρόπλασμα μέσω την ειδική ανίχνευση των διατηρημένων μουραμυλο διπεπτίδια και επάγεται πυρηνικού παράγοντα κάπα Β (ΝΡ-κΒ) ενεργοποίηση μέσω της οδού RIP2 /ΙΚΚ [43]. Η οδός ΝΡ-κΒ δρα για να ενισχύσει την έκφραση των προφλεγμονωδών μορίων, τονώνοντας έτσι τόσο προσαρμοστικές και έμφυτη ανοσοαποκρίσεων. Επιπλέον, NOD2 είχε εμπλακεί σε προγραμματισμένο κυτταρικό θάνατο και ήταν γνωστό ότι είναι βασικό ρυθμιστή των χρόνιων φλεγμονωδών καταστάσεων [44]. Πρόσφατες προσοχή έχει δοθεί στο ρόλο του

NOD2

πολυμορφισμών στην καρκινογένεση. Εκ των οποίων, τέσσερις πολυμορφισμοί (rs2066842 C /T, rs2066844 C /T, rs2066845 C /G και rs2066847 ΜΣΠΑ) είχαν μεγάλο ενδιαφέρον. Ωστόσο, τα αποτελέσματα των επιμέρους μελετών ήρθε με ασυνεπής συμπεράσματα.

Σε αυτό το μετα-ανάλυση,

NOD2

rs2066842 πολυμορφισμός δεν παρατηρήθηκε να σχετίζεται με τον κίνδυνο καρκίνου σε όλες τις συγκρίσεις. Μόνο τέσσερις μελέτες αναλύθηκαν στις συγκεντρωτικές εκτιμήσεις και προφανή ετερογένειες εντοπίστηκαν τα οποία δεν θα μπορούσε να εξηγηθεί από την ανάλυση υποομάδας ή να επιλυθούν με μετα-παλινδρόμησης. Ως εκ τούτου, περαιτέρω μελέτες μεγάλης κλίμακας που απαιτούνται για την επικύρωση των αποτελεσμάτων. Όσον αφορά την

NOD2

rs2066844, rs2066845 και rs2066847 πολυμορφισμούς, τα μοντέλα κυρίαρχη επίδραση των τριών πολυμορφισμών όλα υποδεικνύεται σημαντικά αυξημένο κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου (OR για rs2066844 = 1,32? Ή για rs2066845 = 1,32? Ή για rs2066847 = 1,23) (Πίνακας 2). Η ανάλυση αλληλόμορφο βρέθηκε με συνέπεια αυξημένο κίνδυνο καρκίνου (OR για rs2066844 = 1,43? Ή για rs2066845 = 1,40? Ή για rs2066847 = 1,40) (Πίνακας 2)

Διαφορετικές καρκίνο έχει διακριτούς μηχανισμούς της έναρξης και εξέλιξης, σε. που πολυμορφισμών των βασικών γονίδια παίζουν έναν κρίσιμο ρόλο. Η παρούσα μετα-ανάλυση κατέρρευσε ότι

NOD2

πολυμορφισμοί παρατηρήθηκαν διαφορετικές συσχετίσεις με καρκίνο σε διάφορες υποομάδες του καρκίνου. Η (ΤΤ + CT) γονότυπο του rs2066844 ανατίθενται αυξημένο κίνδυνο για CRC, αλλά όχι καρκίνο του στομάχου και MALT λέμφωμα? άτομα με (CC + CG) γονότυπο του rs2066845 συσχετίστηκε με αυξημένο κίνδυνο γαστρικού καρκίνου και MALT λέμφωμα όχι CRC? (INSC /ΜΣΠΝ + INSC /-) γονότυπου φορείς rs2066847 συσχετίστηκαν με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου του παχέος εντέρου, του καρκίνου του στομάχου και του λέμφωμα MALT, ο καρκίνος του μαστού, ο καρκίνος του πνεύμονα, ο καρκίνος του λάρυγγα αλλά όχι με ουρογεννητικό καρκίνο, παγκρεατικό καρκίνο, μελάνωμα ή μη Hodgkin λέμφωμα. Εκτός αυτού, η πηγή των ελέγχων που θα επηρεάσει τις ενώσεις των πολυμορφισμών με τους κινδύνους του καρκίνου. Στην παρούσα μελέτη, (INSC /ΜΣΠΝ + INSC /-) φορείς του γονότυπου του rs2066847 συσχετίστηκε με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου σε υποομάδα των νοσοκομειακών βάση αλλά όχι σε πληθυσμό. Τα προαναφερθέντα αποτελέσματα της ανάλυσης υποομάδας αποκάλυψε υποκείμενες πληροφορίες και άξιζε μελλοντικές ανησυχίες.

Η φλεγμονή μπορεί να οδηγήσει σε καρκινογένεση διεγείροντας συνεχή πολλαπλασιασμό των κυττάρων, προκαλώντας βλάβη στο DNA, και προκαλώντας την αγγειογένεση [45]. Μεταλλάξεις του

NOD2

γονίδιο έχουν συνδεθεί με έναν αριθμό χρόνιων φλεγμονωδών νόσων περιλαμβανομένης της νόσου του Crohn, ατοπική δερματίτιδα και ούτω καθεξής [46]. Όπως NOD2 εμπλέκεται σε μικροβιακή αναγνώριση και φλεγμονώδεις αντιδράσεις, η ένωση του

NOD2

πολυμορφισμών με τον κίνδυνο καρκίνου ενδέχεται να οφείλεται στο μεταβολή της ικανότητας του να επάγει ανοσοαπόκριση σε βακτήρια που κατά συνέπεια έχει ως αποτέλεσμα την ανάπτυξη επίμονης βακτηριακής λοίμωξης ή ενισχυμένη παραγωγή προφλεγμονωδών μεσολαβητών. Οι τρεις πολυμορφισμοί (rs2066844, rs2066845 και rs2066847) τα οποία παρατηρήθηκαν να σχετίζονται με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου σε αυτό το μετα-ανάλυση ήταν όλοι εντοπισμένοι στην πλούσια σε λευκίνη περιοχή (LRR) του NOD2 πρωτεΐνης. Οι υποκαταστάσεις αμινοξέων που προκαλούνται από αυτούς τους πολυμορφισμούς θα μεταβάλει την λειτουργία της πρωτεΐνης ή μάτισμα, επηρεάζοντας έτσι το ρόλο του NOD2 στη ρύθμιση της απόπτωσης και της χρόνιας φλεγμονής και τελικά οδηγούν σε καρκίνο. Όσο για λειτουργικές μελέτες, παραλλαγή 3020insC, οδηγώντας σε μια υποκατάσταση στη 10η LRR ακολουθείται από ένα πρόωρο κωδικόνιο τερματισμού, έχει αποδειχθεί ότι είναι λιγότερο δραστικό στην απόκριση σε βακτηριακών λιποπολυσακχαριτών, που θα μπορούσαν να παράγουν αυξημένη φλεγμονώδη απόκριση [47]. Τα ποντίκια με ανεπάρκεια σε NOD1, NOD2, ή RIPK2 παρουσίασαν αυξημένη ευαισθησία σε βακτήρια, η οποία προκύπτει από μια μειωμένη ικανότητα να προσλαμβάνουν ουδετερόφιλα και λιγότερο παραγωγής προφλεγμονωδών και αντιμικροβιακή μόρια [17], [48]. Παρά το γεγονός ότι οι προαναφερθείσες μελέτες θα μπορούσαν, τουλάχιστον εν μέρει, να εξηγήσει την παρατηρούμενη σχέση του

NOD2

πολυμορφισμών με τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου, μελλοντικές έρευνες σχετικά με το ειδικό μηχανισμό του

NOD2

πολυμορφισμών στην καρκινογένεση εξακολουθούν να απαιτούνται .

Αρκετές οι περιορισμοί θα πρέπει να αναγνωριστεί σε αυτό το μετα-ανάλυση κατά την ερμηνεία των αποτελεσμάτων. Πρώτον, το μέγεθος του δείγματος δεν ήταν αρκετά μεγάλο για τη συγκεντρωτική ανάλυση των

NOD2

rs2066842 C /Τ πολυμορφισμού και κάποιες αναλύσεις υποομάδων για

NOD2

rs2066844 C /T, rs2066845 C /G και rs2066847 ΜΣΠΝ πολυμορφισμούς. Δεύτερον, όλες οι μελέτες που περιλαμβάνονται στο σημερινό μετα-ανάλυση δημοσιεύθηκε στην αγγλική γλώσσα, ως εκ τούτου, μεροληψία δημοσίευση θα μπορούσε να υπάρξει αν η στατιστική δοκιμή δεν το δείχνουν. Τρίτον, οι εθνότητες όλων των διαθέσιμων μελετών ήταν Καυκάσιοι πληθυσμών, η οποία περιορίζεται αναπόφευκτα τη δυνατότητα γενίκευσης των συμπέρασμά μας σε άλλους πληθυσμούς. Τέταρτον, προφανές ετερογενειών παρατηρήθηκαν σε μερικές συγκρίσεις, η οποία θα περιόριζε την ακρίβεια ορισμένων ενώσεων. Τέλος, όπως και άλλα σημαντικά στοιχεία του περιβάλλοντος παράγοντες, όπως το κάπνισμα ή το αλκοόλ δεν ήταν διαθέσιμα για μεμονωμένες μελέτες, δεν θα μπορούσαμε να ληφθούν αποτελέσματα με προσαρμογές από άλλους συν-μεταβλητές.

Συμπέρασμα

Για να συναφθεί , αυτή η μετα-ανάλυση έδειξε ότι

rs2066844 NOD2

rs2066847 (3020insC) πολυμορφισμοί C /T, rs2066845 C /G και μπορεί να σχετίζεται με αυξημένο κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου, ιδίως για τον καρκίνο του γαστρεντερικού. Καμία σημαντική συσχέτιση παρατηρήθηκε μεταξύ

NOD2

rs2066842 C /Τ πολυμορφισμού και του καρκίνου του κινδύνου. Περαιτέρω μεγάλης κλίμακας και καλά σχεδιασμένες μελέτες που αφορούν διαφορετικές εθνικότητες χρειάζονται ακόμη να επιβεβαιωθούν τα αποτελέσματα της μας μετα-ανάλυση.

Υποστήριξη Πληροφορίες

Εικόνα S1. .

Το διάγραμμα ροής της λογοτεχνίας ένταξης και αποκλεισμού

doi: 10.1371 /journal.pone.0089340.s001

(ΔΕΘ)

Εικόνα S2.

Χωνί οικόπεδο για μελέτες συσχέτισης NOD2 rs2066847 πολυμορφισμό και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου ((+ /+ και +/-) έναντι – /-)

doi:. 10.1371 /journal.pone.0089340.s002

(ΔΕΘ)

πίνακα S1. .

Ανάλυση υποομάδων της σύνδεσης μεταξύ

NOD2

rs2066842 πολυμορφισμού και του καρκίνου του κινδύνου

doi: 10.1371 /journal.pone.0089340.s003

(DOC)

Πίνακας S2. .

Ανάλυση υποομάδων της σύνδεσης μεταξύ

NOD2

rs2066844 πολυμορφισμού και του καρκίνου του κινδύνου

doi: 10.1371 /journal.pone.0089340.s004

(DOC)

Πίνακα S3. .

Ανάλυση υποομάδων της σύνδεσης μεταξύ

NOD2

rs2066845 πολυμορφισμού και του καρκίνου του κινδύνου

doi: 10.1371 /journal.pone.0089340.s005

(DOC)

Πίνακας S4. .

Ανάλυση υποομάδων της σύνδεσης μεταξύ

NOD2

rs2066847 πολυμορφισμού και του καρκίνου του κινδύνου

doi: 10.1371 /journal.pone.0089340.s006

(DOC)

Λίστα ελέγχου S1.

PRISMA λίστα ελέγχου

doi:. 10.1371 /journal.pone.0089340.s007

(DOC)

You must be logged into post a comment.