Αφηρημένο

Ιστορικό

Πολυάριθμες μελέτες έχουν διερευνήσει συνδέσμου

OGG1

Ser326Cys πολυμορφισμού με την ευαισθησία του καρκίνου του πνεύμονα? Ωστόσο, τα ευρήματα είναι ασυνεπής. Ως εκ τούτου, πραγματοποιήσαμε μια μετα-ανάλυση βασίζεται σε 27 δημοσιεύσεις περιλαμβάνουν 9663 περιπτώσεις και 11348 ελέγχους για να αξιολογήσει πλήρως τις εν λόγω ενώσεις.

Μέθοδοι

Ψάξαμε δημοσιεύσεις από MEDLINE και EMBASE που ήταν την αξιολόγηση των συσχετίσεων μεταξύ

OGG1

Ser326Cys πολυμορφισμό και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου του πνεύμονα. Υπολογίσαμε συγκεντρώνονται αναλογία πιθανοτήτων (OR) και το 95% διάστημα εμπιστοσύνης (CI) χρησιμοποιώντας είτε σταθερού επιδράσεις ή τυχαίων δράσεων μοντέλο. Χρησιμοποιήσαμε τα στοιχεία έκφρασης mRNA γονότυπο βάση από HapMap για SNP rs1052133 στην κανονική κυτταρικές σειρές μεταξύ 270 ασθενών με τέσσερις διαφορετικές εθνότητες.

Αποτελέσματα

Τα αποτελέσματα έδειξαν ότι τα άτομα που φέρουν το γονότυπο Cys /Cys δεν το έκανε έχουν αυξήσει σημαντικά τον κίνδυνο για καρκίνο του πνεύμονα (OR = 1.15, 95% CI = 0,98 – 1,36), σε σύγκριση με τον γονότυπο Ser /Ser? Ομοίως, δεν υπάρχει σημαντική συσχέτιση βρέθηκε στην υπολειπόμενη, κυρίαρχη ή ετερόζυγο συν-κυρίαρχο μοντέλο (Ser /Cys εναντίον Cys /Cys). Ωστόσο, σημαντικά αυξημένο κίνδυνο βρέθηκαν σε σχετικά μεγάλο μέγεθος του δείγματος (Ser /Ser εναντίον Cys /Cys: OR = 1,29, 95% CI = 1,13 – 1,48, και υποτελούς μοντέλο: OR = 1,19, 95% CI = 1,07 – 1,32) . Όσον αφορά ιστολογικών τύπων, βρήκαμε το Cys /Cys σχετίστηκε με τον κίνδυνο αδενοκαρκινώματος (Ser /Ser εναντίον Cys /Cys: OR = 1,32, 95% CI = 1,12 – 1,56? Ser /Cys εναντίον Cys /Cys: OR = 1,19 , 95% CI = 1,04 – 1,37, και υποτελούς μοντέλο OR = 1,23, 95% CI = 1.08-1.40). Δεν παρατηρήθηκε σημαντική διαφορά του

OGG1

έκφραση του mRNA βρέθηκε μεταξύ των γονότυπων μεταξύ των διαφόρων εθνοτήτων.

Συμπεράσματα

Παρά ορισμένους περιορισμούς, αυτή η μετα-ανάλυση ιδρύθηκε στερεά στατιστικά στοιχεία για μια συσχέτιση μεταξύ της . η

OGG1

Cys /Cys γονότυπου και του κινδύνου καρκίνου του πνεύμονα, ιδίως για τις μελέτες με μεγάλο μέγεθος του δείγματος και το αδενοκαρκίνωμα, αλλά αυτή τη συσχέτιση εντάλματα επιπλέον επικύρωση σε μεγαλύτερες και καλά σχεδιασμένες μελέτες

Παράθεση: Duan WX , Hua RX, Yi W, Shen LJ, Jin ZX, Zhao YH, et al. (2012) Ο Σύνδεσμος μεταξύ

OGG1

Ser326Cys Πολυμορφισμός και τον Καρκίνο του Πνεύμονα Ευαισθησία: Μια μετα-ανάλυση 27 μελετών. PLoS ONE 7 (4): e35970. doi: 10.1371 /journal.pone.0035970

Επιμέλεια: Javier Σ Castresana, Πανεπιστήμιο της Ναβάρα, Ισπανία

Ελήφθη: 17 Ιανουαρίου του 2012? Αποδεκτές: 24 Μάρ του 2012? Δημοσιεύθηκε: 23, Απριλίου 2012

Copyright: © 2012 Duan et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Αυτή η έρευνα υποστηρίχθηκε από επιχορηγήσεις από το Εθνικό Ίδρυμα Φυσικών Επιστημών της Κίνας (αρ. 81102687, NO. 81070198). Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

Ο καρκίνος έχει αναγνωριστεί ως η κύρια αιτία θανάτου στις οικονομικά ανεπτυγμένες χώρες και η δεύτερη κύρια αιτία θανάτου στις αναπτυσσόμενες χώρες. Έχει υπολογιστεί ότι περίπου 12,7 εκατομμύρια περιπτώσεις καρκίνου και 7,6 εκατομμύρια θάνατοι από καρκίνο έχουν συμβεί το 2008. Ο καρκίνος του πνεύμονα είναι η πιο συχνά διαγιγνώσκεται τύπο του καρκίνου, καθώς και η κύρια αιτία θανάτου από καρκίνο στους άνδρες το 2008. Σε παγκόσμιο επίπεδο, οι λογαριασμοί του καρκίνου του πνεύμονα για το 13% (1,6 εκατομμύρια ευρώ) του συνόλου των περιπτώσεων και το 18% (1,4 εκατομμύρια) από τους θανάτους [1]. Το κάπνισμα είναι ο γνωστός παράγοντας κινδύνου για καρκίνο του πνεύμονα, το οποίο αντιπροσωπεύει το 80% της παγκόσμιας επιβάρυνσης του καρκίνου του πνεύμονα στους άνδρες και το 50% τουλάχιστον του βάρους στις γυναίκες [2]. Ο καπνός του τσιγάρου περιέχει πολλαπλά καρκινογόνα που είναι γνωστό ότι προκαλεί χημική μετατροπή του γενωμικού DNA [3] και περαιτέρω να οδηγήσει σε γενετικές μεταλλάξεις [4].

γονιδίων επιδιόρθωσης του DNA διαδραματίζουν έναν κρίσιμο ρόλο στη διατήρηση της σταθερότητας και ακεραιότητας του γενωμικού DNA. Στους ανθρώπους, οι περισσότεροι από 130 γονίδια που εμπλέκονται στις πέντε κύριες οδούς επιδιόρθωσης του DNA, ένας από τους οποίους είναι επισκευή βάση εκτομή (BER) οδού [5]. Οι επισκευές BER μονοπάτι βλάβες που περιλαμβάνουν τροποποιήσεις των βάσεων του DNA, συμπεριλαμβανομένων των βλαβών που δημιουργούνται από αντιδραστικά είδη οξυγόνου. Η ιδιαιτερότητα της ΚΑΚ υποστηρίζεται από γλυκοζυλασών DNA, οι οποίες έχουν ακριβή ειδικότητες υποστρώματος. Σε κύτταρα θηλαστικών υπάρχουν τέσσερα μεγάλα γλυκοσυλάσες DNA συμπεριλαμβανομένων οξογονανίνη DNA γλυκοσυλάση (OGG1), η οποία αναγνωρίζει κυρίως 8-oxodG αλλά δραστηριοποιείται και σε άλλες οξειδωμένα πουρίνες [6].

Το DNA γλυκοσυλάση 8-οξογονανίνη (

OGG1

) γονίδιο, που βρίσκεται στο χρωμόσωμα 3p26.2, κωδικοποιεί το ένζυμο που είναι υπεύθυνο για την εκτομή του 8-οξογουανίνη, ένα μεταλλαξιογόνο παραπροϊόν βάση η οποία εμφανίζεται ως αποτέλεσμα της έκθεσης σε αντιδραστικά είδη οξυγόνου. Είναι καταλύει τη διάσπαση του δεσμού γλυκοζιλικών μεταξύ της τροποποιημένης βάσης και το τμήμα σακχάρου, αφήνοντας μια αβασική απουρινική /απυριμιδινική θέση στο DNA? η προκύπτουσα θέση στη συνέχεια τέμνεται, ακολουθούμενη από την ολοκλήρωση της επισκευής με τις διαδοχικές ενέργειες ενός φωσφοδιεστεράσης, πολυμεράση DNA και λιγάση DNA [7], [8]. Η

OGG1

είναι ιδιαίτερα πολυμορφικό, και μια σειρά από ενιαίο νουκλεοτιδικών πολυμορφισμών (SNPs) έχουν ταυτοποιηθεί [9] – [12], με τουλάχιστον 231 αναφερθεί SNPs στην περιοχή του γονιδίου (http: //www. ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP). Ωστόσο, λίγοι μόνο από αυτούς δήλωσαν SNPs είναι δυνητικά λειτουργικά και έχουν μελετηθεί για τις ενώσεις τους με την ευαισθησία του καρκίνου. Για

OGG1

, υπάρχουν είκοσι πέντε SNPs που αλλάζουν φέρεται αμινοξέων της πρωτεΐνης, αλλά μόνο Ser326Cys (rs1052133) ήταν ερευνηθεί εκτενώς για τη σχέση της με τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου, ιδίως για τον καρκίνο του πνεύμονα. Επειδή τα αποτελέσματα από αυτές τις μελέτες ήταν ασυνεπής [9], [13] – [25], πραγματοποιήσαμε μια μετα-ανάλυση των δημοσιευμένων εκθέσεων για την αξιολόγηση περαιτέρω τη σύνδεση των

OGG1

Ser326Cys SNPs με τον κίνδυνο του πνεύμονα . ο καρκίνος

Υλικά και Μέθοδοι

Αναγνώριση και την επιλεξιμότητα των σχετικών μελετών

οι μελέτες που περιλαμβάνονται σε αυτό το μετα-ανάλυσης ήταν να πληρούν τα ακόλουθα κριτήρια: (α) την αξιολόγηση της συσχέτισης μεταξύ

OGG1

Ser326Cys και τον κίνδυνο του καρκίνου, (β) χρησιμοποιώντας ένα σχέδιο-μαρτύρων, (γ) παρέχει επαρκείς πληροφορίες για την εκτίμηση αναλογίες πιθανοτήτων (OR) και τα διαστήματα εμπιστοσύνης 95% τους (ΠΙ).

Ψάξαμε την ηλεκτρονική MEDLINE λογοτεχνία και βάσεις δεδομένων EMBASE για όλα τα σχετικά άρθρα που χρησιμοποιούν τους όρους αναζήτησης: «

OGG1

,

HMMH

,

MUTM

,

OGH1

ή

hOGG1

«,» παραλλαγή ή παραλλαγή ή πολυμορφισμός »και« ο καρκίνος του πνεύμονα »(τελευταία αναζήτηση ενημερώθηκε στις 30 Νοεμβρίου, 2011). Όλες οι επιλέξιμες μελέτες ανακτήθηκαν και βιβλιογραφίες τους ήταν το χέρι ελέγχονται για άλλες σχετικές δημοσιεύσεις. άρθρα ανασκόπησης και βιβλιογραφίες άλλων συναφών μελετών που εντοπίστηκαν στο χέρι έψαξε καθώς και να ψάξετε για πρόσθετες επιλέξιμες μελέτες. συμπεριλήφθηκαν μόνο δημοσιευμένες μελέτες με άρθρα πλήρους κειμένου στα αγγλικά. Εάν περισσότερα από ένα άρθρο δημοσιεύτηκε χρησιμοποιώντας το ίδιο πληθυσμό ασθενών, μόνο η τελευταία ή η μεγαλύτερη μελέτη θα μπορούσε να χρησιμοποιηθεί σε αυτή την μετα-ανάλυση. Δύο συγγραφείς (Wei-Xun Duan και Rui-Xi Hua) ανεξάρτητα αξιολόγησε τα άρθρα για τη συμμόρφωση με τα κριτήρια ένταξης, καθώς και κάθε διαφωνία επιλύθηκε από συζητήσεις μέχρι επετεύχθη συναίνεση. Επιπλέον, έρευνες αναχώρηση από Hardy-Weinberg ισορροπία (HWE) αποκλείστηκε από την τελική ανάλυση

Δεδομένα εξόρυξη

Οι παρακάτω πληροφορίες συλλέχθηκαν από κάθε μελέτη:. Επώνυμο συγγραφέα, έτος δημοσίευσης , την εθνικότητα του πληθυσμού της μελέτης, οι τύποι καρκίνου, ιστολογικών τύπων, πηγή που χρησιμοποιείται για τους ελέγχους, ο συνολικός αριθμός των υποθέσεων και των ελέγχων, των μεθόδων γονότυπο και τους αριθμούς των υποθέσεων και των ελέγχων με τους γονότυπους Ser /Ser, Ser /Cys και Cys /Cys για

OGG1

. Για εκείνες τις μελέτες που περιλαμβάνονται θέματα των διαφόρων εθνοτικών ομάδων, δεδομένων γονότυπους εξήχθησαν ξεχωριστά για κάθε μία από τις εθνοτικές ομάδες, κατηγοριοποιούνται ως Καυκάσιους, Ασιάτες, Αφρικανοί ή Mixed που περιείχαν περισσότερες από μία εθνική ομάδα.

γονότυπου και της γονιδιακής έκφρασης συσχέτιση ανάλυση

Τα στοιχεία για

OGG1

Ser326Cys (rs1052133C app = snpexp) [26]. Τα δεδομένα του γονότυπου για

OGG1

προήλθαν από το HapMap φάση απελευθέρωσης ΙΙ σύνολο 23 στοιχεία που αποτελείται από 3.960.000 SNP γονοτύπων από 270 άτομα από τέσσερις πληθυσμούς (CEU: 90 Γιούτα κάτοικοι με καταγωγή από τη βόρεια και δυτική Ευρώπη? CHB: 45 άσχετα Κινέζων Χαν στο Πεκίνο? JPT: 45 άσχετες Ιάπωνες στο Τόκιο? YRI: 90 Γιορούμπα σε Ibadan, Νιγηρία) [27]. Τα δεδομένα έκφρασης μεταγράφου (mRNA) ανιχνεύθηκαν χρησιμοποιώντας συστοιχίες έκφρασης γονιδιώματος σε επίπεδο (47294 μεταγραφές) από EBV μετασχηματισμένες λεμφοβλαστοειδείς κυτταρικές σειρές από τα ίδια 270 άτομα [28].

Στατιστικές μέθοδοι

η δύναμη της σύνδεσης μεταξύ των

OGG1

Ser326Cys και τον καρκίνο του πνεύμονα κίνδυνος εκτιμήθηκε υπολογίζοντας ΕΑΠ με ​​τα αντίστοιχα 95% ΠΙ. Για

OGG1

Ser326Cys, τα συγκεντρωμένα ΕΑΠ πραγματοποιήθηκαν επίσης για το συμπλήρωμα (Ser /Ser εναντίον Cys /Cys και Ser /Cys εναντίον Cys /Cys), υπολειπόμενο μοντέλο (Ser /Ser + Ser /Cys εναντίον Cys /Cys), και κυρίαρχο μοντέλο (Ser /Ser εναντίον Ser /Cys + Cys /Cys). Η υπόθεση της ομοιογένειας επαληθεύτηκε από Chi τετράγωνο που βασίζεται Q-test. Εάν οι μελέτες βρέθηκαν να είναι ομοιογενές (με

P

& gt? 0,10 για τη δοκιμή Q), η συγκεντρωτική Ή εκτίμηση όλων των μελετών που θα υπολογίζεται από το μοντέλο σταθερών επιδράσεων (η μέθοδος Mantel-Haenszel) [ ,,,0],29]. Εάν δεν μπορεί να θεωρηθεί ομοιογένεια, ένα μοντέλο τυχαίων δράσεων (η μέθοδος Dersimonian και Laird) θα χρησιμοποιηθεί [30]. αναλύσεις υποομάδων έγιναν από τον τύπο του καρκίνου, την εθνικότητα, το σχεδιασμό της μελέτης και το μέγεθος του δείγματος. Για να επαληθεύσετε την πιθανή προκατάληψη δημοσίευση, ένα τυπικό σφάλμα του log (OR) για κάθε μελέτη συναρτήσει του log (ή). οικόπεδο χοάνη ασυμμετρία εκτιμήθηκε με δοκιμασία γραμμικής παλινδρόμησης Egger του [31]. Για να εκτιμηθεί η επίδραση των μεμονωμένων μελετών στο συνολικό κίνδυνο του καρκίνου, αναλύσεις ευαισθησίας πραγματοποιήθηκαν αποκλείοντας κάθε μελέτη ξεχωριστά και εκ νέου υπολογισμό των ΕΑΠ και τα 95% ΠΙ. Τα επίπεδα έκφρασης του mRNA μεταξύ των δύο στρωμάτων αξιολογήθηκαν χρησιμοποιώντας δοκιμασία t του Student. Οι τάσεις επίπεδο έκφρασης μεταγραφής από γονότυπους αξιολογήθηκαν με τη χρήση Γενικής γραμμικό μοντέλο. Αυτή η μετα-ανάλυση πραγματοποιήθηκε χρησιμοποιώντας την έκδοση STATA λογισμικού 11.0 (Stata Corporation, College Station, TX) και του λογισμικού SAS (έκδοση 9.1? SAS Institute, Cary, NC). Όλες οι

P

τιμές ήταν δύο όψεων, και

P

& lt? 0,05 θεωρήθηκε στατιστικά σημαντική

Αποτελέσματα

χαρακτηριστικά Μελέτη

.

Όπως φαίνεται στο Σχήμα 1, συνολικά 76 που δημοσιεύθηκε αρχεία ανακτήθηκαν, εκ των οποίων 45 είχαν εξαιρεθεί από το αφηρημένο βρέθηκε να είναι άσχετη, και ένα χαρτί αποκλείεται, δεδομένου ότι δημοσιεύθηκε στην κορεατική [32]. Συνολικά 30 μελέτες ελέγχου πληρούσαν τα κριτήρια ένταξης [9], [13] – [25], [33] και συμπεριλήφθηκαν στη μετα-ανάλυση (Πίνακας 1). Η μελέτη από Bonner et al. [33] αποκλείστηκε, σε τελική ανάλυση, επειδή χρησιμοποιούνται τα ίδια δείγματα ως προηγούμενο άρθρο [34]. Η κατανομή των γονότυπων για το

OGG1

πολυμορφισμού στους ελέγχους όλων των μελετών ήταν σύμφωνο με αυτό που αναμένεται από το HWE, εκτός από τρεις μελέτες [23], [35], [36]. Chang et al. [19] αξιολογεί τις διαφορές στη γενετική συνεισφορά στον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα σε Latinos και αφρικανικός-αμερικανικό εθνοτικών ομάδων, έτσι ώστε αυτή η μελέτη χωρίστηκε σε δύο. Συνολικά, 27 μελέτες με 9663 περιπτώσεις και 11348 ελέγχων ερευνά το

OGG1

Ser326Cys SNP συμπεριλήφθηκαν σε αυτή την μετα-ανάλυση. Η μελέτη των Klinchid et al. [20] συμπεριλήφθηκε στον υπολογισμό της κυρίαρχης μοντέλου, επειδή η κατανομή γονότυπων δεν παρουσιάστηκε σε επαρκείς λεπτομέρειες. Από τις 27 μελέτες, το μέγεθος των δειγμάτων ήταν από 45 μέχρι 2155, στην οποία οκτώ μελέτες επικεντρώθηκαν σε μη μικροκυτταρικό καρκίνο του πνεύμονα (NSCLC) και δεκαεννέα στις μικτές καρκίνων του πνεύμονα. Υπήρχαν έντεκα μελέτες σχετικά με Καυκάσιους, δώδεκα μελέτες για Ασιάτες, δύο μελέτες για τους Αφρικανούς και δύο στις μικτές εθνικότητας. Σχεδόν σε όλες τις περιπτώσεις ήταν ιστολογικά επιβεβαιωμένη. Έλεγχοι συμφωνημένα κυρίως για το φύλο και την ηλικία. Από όλες τις μελέτες, δώδεκα ήταν βασισμένη στον πληθυσμό, δεκαπέντε ήταν το νοσοκομείο με βάση το? τρεις μελέτες με το μέγεθος του δείγματος είναι μικρότερη από 100, δεκαεννέα μελέτες με το μέγεθος του δείγματος μεταξύ 100 έως 500, και πέντε μελέτες με το μέγεθος του δείγματος πάνω από 500. Για διαθέσιμο ιστολογικών τύπων, έξι μελέτες με μικροκυτταρικό καρκίνο του πνεύμονα (SCLC), επτά με καρκίνωμα των πλακωδών κυττάρων (SCC), δέκα με αδενοκαρκίνωμα (ADC), ένα με μεγάλο καρκίνωμα (LCC), έξι με NSCLC λεπτομέρειες έτσι ιστολογικό τύπο δεν είναι διαθέσιμη, και δώδεκα με καρκίνο του πνεύμονα, αλλά τα στοιχεία δεν είναι διαθέσιμα τα οποία θεωρήθηκαν ως αναμειγνύονται.

αποτελέσματα μετα-ανάλυση

Τα συνολικά αποτελέσματα έδειξαν δεν υπήρχε σημαντική συσχέτιση μεταξύ

OGG1

Ser326Cys και τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα (Ser /Ser εναντίον Cys /Cys: OR = 1.15, 95% CI = 0,98 – 1,36? Ser /Cys εναντίον Cys /Cys: OR = 1,09, 95% CI = 0.95-1.25), υπολειπόμενο (OR = 1,11, 95% CI = 0,97 – 1,28) ή κυρίαρχη μοντέλο (OR = 1.09, 95% CI = 0,98 – 1,21) (Πίνακας 2). Στην ανάλυση υποομάδας με το μέγεθος του δείγματος, μια στατιστικά σημαντική συσχέτιση βρέθηκε για μελέτες με μεγάλο μέγεθος του δείγματος (Ser /Ser εναντίον Cys /Cys: OR = 1,29, 95% CI = 1,13 – 1,48? Ser /Ser + Ser /Cys vs . Cys /Cys: OR = 1,19, 95% CI = 1,07 – 1,32), και ένα σχετικά μικρό μέγεθος του δείγματος (& lt? 100) για κυρίαρχο μοντέλο (OR = 1,79, 95% CI = 1,08 – 2,98), η οποία μόλις συμπεριλαμβάνονται τρεις μελέτες . Περαιτέρω διαστρωμάτωση με βάση τον τύπο του καρκίνου, την εθνότητα, και η πηγή των ελέγχων όλων δεν έδωσαν στατιστικά σημαντικές εκτιμήσεις. Στην ιστολογική ανάλυση τύπου υποομάδα με περισσότερες λεπτομέρειες, το

OGG1

Ser326Cys αλληλόμορφο συσχετίστηκε σημαντικά με τον κίνδυνο του ADC (Ser /Ser εναντίον Cys /Cys: OR = 1,32, 95% CI = 1,12 – 1,56? Ser /Cys εναντίον Cys /Cys: OR = 1,19, 95% CI = 1,04 – 1,37) και υπολειπόμενη μοντέλο (OR = 1,23, 95% CI = 1.08-1.40), αλλά όχι με καρκίνους του SCC, SCLC και LCC (Πίνακας 3, Σχήμα 2).

Για κάθε μελέτη, οι εκτιμήσεις της OR και 95% CI της απεικονίζονται με ένα κουτί και μια οριζόντια γραμμή. ⋄, συγκεντρώθηκαν ΕΑΠ και του 95% ΠΙ.

Η

Η

Η έκφραση του mRNA από γονότυπους

Το επίπεδο έκφρασης του mRNA της

OGG1

από το γονότυπους των τεσσάρων εθνοτήτων παρουσιάζεται στον πίνακα 4. Εμείς δεν βρήκε καμία διαφορά έκφραση του mRNA μεταξύ διαφορετικών γονότυπων μεταξύ των τεσσάρων διαφορετικών εθνοτήτων. Έτσι, το επίπεδο έκφρασης του mRNA ήταν λίγο υψηλότερη αν δεν υπάρχει σημαντική διαφορά για rs1052133G παραλλαγή αλληλόμορφο βρέθηκε σε ασιατικούς πληθυσμούς. Δεν τάση των επιπέδων έκφρασης μεταγραφής από γονότυπους βρέθηκε για

OGG1

.

Η

προκατάληψη Δημοσίευση

Όχι μεροληψία δημοσίευσης ανιχνεύθηκε για

OGG1

Ser326Cys (δοκιμή του Egger, το Ser /Ser εναντίον Cys /Cys:

P

= 0,944, Ser /Cys εναντίον Cys /Cys:

P

= 0.987, υπολειπόμενο μοντέλο:

P

= 0,892, κυρίαρχο μοντέλο:.

P

= 0,217)

Συζήτηση

είναι γνωστό ότι η ευαισθησία του κάθε ατόμου στον καρκίνο ποικίλλει, ακόμη και μετά την έκθεση στον ίδιο περιβάλλο. Ως εκ τούτου, έχει προταθεί ότι η γενετική παραλλαγή, όπως SNPs γονιδίων εμπλέκεται σε καρκινογένεση. Πραγματοποιήσαμε μια μετα-ανάλυση των δημοσιευμένων μελετών για την αξιολόγηση της σύνδεσης μεταξύ της

OGG1

Ser326Cys πολυμορφισμό και τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα, επειδή δεν υπάρχει τέτοια up-to-ημερομηνία μετα-ανάλυση συμπεριλαμβανομένων των ιστολογικών τύπων έχει δημοσιευθεί μέχρι σήμερα. Εμείς δεν βρήκε στατιστικά στοιχεία μιας συνολικής επίδρασης του πολυμορφισμού Ser326Cys στον κίνδυνο για καρκίνο του πνεύμονα είτε υποτελούς ή δεσπόζουσα μοντέλα αποτέλεσμα. Σε σύγκριση με το γονότυπο Ser /Ser, η παραλλαγή Cys /Cys γονότυπος δεν συσχετίστηκε σημαντικά με συνολικό κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα σε όλα τα άτομα από 27 επιλέξιμες μελέτες που περιλαμβάνονται στην ανάλυση. Σε μια προηγούμενη μετα-ανάλυση 17 μελετών αποτελείται από 6375 περιπτώσεις και 6406 ελέγχους, σημαντικά αυξημένο κίνδυνο βρέθηκαν μεταξύ των ασιατικών θεμάτων σε ένα κυρίαρχο μοντέλο, και τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα σχετίζεται με το

OGG1

Cys /Cys γονότυπο ήταν σημαντικά αυξήθηκαν σε πληθυσμιακές μελέτες [9]. Ωστόσο, αυτά δεν βρέθηκαν σε δική μας, μπορεί να αποδοθεί σε ένα μεγαλύτερο μέγεθος δείγματος

Προηγούμενες μελέτες έδειξαν ότι η γενετική παραλλαγή στο

OGG1

επηρεάζει την ευαισθησία του καρκίνου.? η συχνότητα του

OGG1

326Cys αλληλόμορφο βρέθηκε να είναι σημαντικά μεγαλύτερη σε ασθενείς σε σύγκριση με τους ελέγχους [22], [24], [25], [37], [38]? Ωστόσο, η συσχέτιση αυτή δεν είχε αναπαραχθεί από άλλες μελέτες [9], [13] – [17]. Συνολικά, δεν διαπιστώθηκε ότι τα άτομα που φέρουν το γονότυπο Cys /Cys είχαν σημαντικά αυξημένο κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα σε σύγκριση με το γονότυπο Ser /Ser, καμία σημαντική συσχέτιση με τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα βρέθηκε το κυρίαρχο μοντέλο, υπολειπόμενο μοντέλο και ετερόζυγα συν-κυρίαρχο μοντέλο (Ser /Cys εναντίον Cys /Cys). Ωστόσο, σημαντικά αυξημένο κίνδυνο βρέθηκαν σε σχετικά μεγάλο μέγεθος του δείγματος, και αυτό μας άφησε να εννοηθεί ότι στις μελλοντικές μελέτες, μόνο οι μελέτες με μεγάλο μέγεθος του δείγματος θα είναι αξιόπιστη. Στην ανάλυση ιστολογικό τύπο υποομάδας, η

OGG1

Ser326Cys αλληλόμορφο συσχετίστηκε σημαντικά με τον κίνδυνο της ADC, αλλά όχι με καρκίνους του SCC, SCLC και LCC. Αυτά μπορεί να αποδοθεί στην ιδιαιτερότητα του όγκου.

Mambo et al. [39] ανέλυσε την έκφραση του

hOGG1

mRNA σε 18 καρκίνου του πνεύμονα και τρία φυσιολογικές κυτταρικές σειρές και βρέθηκε

hOGG1

ήταν πάνω εκφράζεται σε περισσότερες κυτταρικές σειρές, 2/18 (11,1%) έδειξε μια χαμηλότερες

hOGG1

mRNA και την έκφραση της πρωτεΐνης (περίπου 80% μείωση) σε σχέση με την κανονική κυτταρικές σειρές, υποδεικνύοντας 8-υδροξυγουανίνης ελαττώματα επισκευή σε ορισμένους καρκίνους του πνεύμονα. Όταν συνέκριναν τα επίπεδα έκφρασης του mRNA της

OGG1

Ser326Cys από τους γονότυπους των τεσσάρων διαφορετικών εθνοτήτων, καμία διαφορά ή τάση βρέθηκε. Ο καρκίνος του πνεύμονα είναι γνωστό ότι είναι μια πολύπλοκη και πολυπαραγοντική νόσος, το γονίδιο-γονιδίων και γονιδίων-περιβάλλοντος αλληλεπιδράσεις τόσο συμβάλει σημαντικά στην εμφάνιση της νόσου αυτής, μια ενιαία παραλλαγή νουκλεοτιδίων μπορεί να είναι ανεπαρκής για να αλλάξει το

OGG1

έκφραση του mRNA ιδιαίτερα αυτές τις περιοχές κωδικοποίησης που απλά οδηγούν σε αμινοξέα αλλοίωση οξύ.

Αν και συμπεριλάβαμε τα πιο πρόσφατα στοιχεία, υπάρχουν αρκετοί περιορισμοί σε αυτή την μετα-ανάλυση πρέπει επίσης να λαμβάνονται υπόψη. Πρώτον, η έλλειψη των αρχικών δεδομένων του καρκίνου του πνεύμονα ιστολογικών τύπων περιορίζεται περαιτέρω αξιολόγηση μας ιστολογικών τύπων και γονότυπους αλληλεπιδράσεις. Δεύτερον, η έλλειψη του αρχικού δεδομένων περιορίζεται περαιτέρω αξιολόγησή μας πιθανές αλληλεπιδράσεις γονιδίων-γονιδίων και γονιδίων-περιβάλλοντος. Τρίτον, η έλλειψη πληροφοριών σχετικά με την κατάσταση της νόσου, γονότυπους και καλά τεκμηριωμένες κάπνισμα μπορεί επίσης να επηρεάσει τα αποτελέσματα. Τέταρτον, οι περισσότερες από τις μελέτες, εκτός από πέντε [17], [21], [22], [40], [41] είχε ένα σχετικά μικρό μέγεθος του δείγματος (& lt? 500 περιπτώσεις και ελέγχους). Τέλος, οι μελέτες που συμπεριλήφθηκαν στην ανάλυση έχουν χρησιμοποιηθεί περισσότερο από δέκα διαφορετικές μεθόδους καθορισμού γονοτύπου που είχαν διάφορα θέματα ποιοτικού ελέγχου.

Εν κατακλείδι, αυτή η μετα-ανάλυση διαπιστώθηκε ότι το

OGG1

326Cys /Cys γονότυπο δεν συσχετίστηκε με σημαντικά αυξημένο κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα. Ωστόσο, δεδομένης της σχετικά περιορισμένη καρκίνο του πνεύμονα ιστολογικών τύπων και μέγεθος δείγματος, Cys /Cys σχετίστηκε με τον κίνδυνο αδενοκαρκινώματος. Ωστόσο, απαιτούνται περαιτέρω μελέτες δικαιολογείται να επικυρώσει τη συσχέτιση μεταξύ του

OGG1

Ser326Cys πολυμορφισμό και καρκίνο του πνεύμονα κινδύνου με μεγαλύτερο μέγεθος δείγματος και πιο λεπτομερείς ιστολογικών τύπων.