PLoS One: κανένας συσχετισμός μεταξύ Timp2 -418 G & gt? C Πολυμορφισμός και αυξημένο κίνδυνο καρκίνου: Στοιχεία από μια μετα-ανάλυση


Αφηρημένο

Σκοπός

αναστολέας ιστού της μεταλλοπρωτεϊνάσης (Timp2) εμπλέκεται στη ρύθμιση των μεταλλοπρωτεϊνασών μήτρας 2 (ΜΜΡ2) και φαίνεται να εμπλέξει στην ανάπτυξη και εξέλιξη του καρκίνου. Τα αποτελέσματα από τις δημοσιευμένες μελέτες με βάση τη σχέση μεταξύ Timp2 -418 G & gt? C πολυμορφισμού και του κινδύνου καρκίνου είναι ασυνεπής. Σε αυτή την μετα-ανάλυση, έχουμε ως στόχο να αξιολογήσει την πιθανή συσχέτιση μεταξύ Timp2 -418 G & gt?. C πολυμορφισμού και του καρκίνου του κινδύνου

Μεθοδολογία

Ψάξαμε PubMed (Medline) και βάσεις δεδομένων web EMBASE για την κάλυψη όλες οι μελέτες που βασίζονται σε σχέση Timp2 -418 G & gt? C πολυμορφισμός και τον κίνδυνο του καρκίνου του μέχρι τον Οκτώβριο του 2013. Η μετα-ανάλυση έγινε για επιλεγμένες μελέτες ασθενών-μαρτύρων και συγκέντρωσε αναλογίες πιθανοτήτων (OR) και 95% διαστήματα εμπιστοσύνης (95% ΠΙ) υπολογίστηκαν για όλες τις γενετικές μοντέλα.

Αποτελέσματα

Ένα σύνολο των 2225 περιπτώσεων καρκίνου και 2532 μάρτυρες συμπεριλήφθηκαν από δέκα επιλέξιμες μελέτες ασθενών-μαρτύρων. Τα αποτελέσματα από τη συνολική συγκεντρωτική ανάλυση έδειξε καμία απόδειξη των σημαντικών κινδύνων μεταξύ Timp2 -418 G & gt? C πολυμορφισμός και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου σε οποιοδήποτε των γενετικών μοντέλων, όπως, αλληλόμορφο (C εναντίον G: OR = 1.293, 95% CI = 0,882 – 1,894 , p = 0,188), ομόζυγο (CC εναντίον GG: OR = 0.940, 95% CI = 0,434 – 2,039, p = 0,876), ετερόζυγη (GC εναντίον GG: OR = 1.397, 95% CI = 0,888 – 2,198, p = 0,148), κυρίαρχη (CC + GC εναντίον GG: OR = 1.387, 95% CI = 0,880 – 2,187, p = 0,159) και υπολειπόμενη (CC έναντι GG + GC: OR = 0.901, 95% CI = 0,442 – 1,838 , p = 0,774) μοντέλα. Δεν υπάρχουν ενδείξεις για μεροληψία δημοσίευσης εντοπίστηκε κατά τη διάρκεια της ανάλυσης

Συμπεράσματα

Η παρούσα μετα-ανάλυση δείχνει ότι η Timp2 -418 G & gt?. C πολυμορφισμός δεν μπορούν να συμμετέχουν σε προδιαθεσικός παράγοντας κινδύνου για καρκίνο στο συνολικού πληθυσμού. Ωστόσο, οι μελλοντικές μεγαλύτερες μελέτες με την ομάδα του πληθυσμού που απαιτούνται για να αναλύσει την πιθανή συσχέτιση

Παράθεση:. Mandal RK, Akhter Ν, Haque S, το Panda AK, Mittal RD, Alqumber ΜΑΑ (2014) καμία συσχέτιση μεταξύ Timp2 – 418 G & gt? C Πολυμορφισμός και αυξημένο κίνδυνο καρκίνου: Στοιχεία από μια μετα-ανάλυση. PLoS ONE 9 (8): e88184. doi: 10.1371 /journal.pone.0088184

Επιμέλεια: Shama Ahmad, University of Colorado, Denver, Ηνωμένες Πολιτείες της Αμερικής

Ελήφθη: 4 Δεκέμβρη του 2013? Αποδεκτές: 30 Ιουν 2014? Δημοσιεύθηκε: 19, Αύγ του 2014

Copyright: © 2014 Mandal et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Οι συγγραφείς δεν έχουν καμία υποστήριξη ή χρηματοδότηση για να αναφέρετε

Αντικρουόμενα συμφέροντα:. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

Ο καρκίνος είναι μια πολυπαραγοντική νόσος που προκύπτει από πολύπλοκες αλληλεπιδράσεις. μεταξύ των διαφόρων γενετικών και περιβαλλοντικών παραγόντων [1], παραμένει ένα σημαντικό παγκόσμιο πρόβλημα υγείας και να οδηγήσει σε αυξημένη νοσηρότητα και θνησιμότητα παγκοσμίως [2]. Η ακριβής αιτιολογία αυτής της θανάσιμης ασθένειας είναι επίσης ασαφής. Η πιο κοινή μορφή της γενετικής παραλλαγής, δηλαδή, πολυμορφισμοί ενός νουκλεοτιδίου (SNPs) είναι γνωστό ότι συμβάλλει μεμονωμένα επιδεκτικότητα σε καρκίνο μέσω της αλληλεπίδρασης με τους περιβαλλοντικούς παράγοντες [3]. Ως εκ τούτου, αναμένεται ότι η ταυτοποίηση των γενετικών παραγόντων υποδοχής για επιδεκτικότητα σε καρκίνο θα βοηθούσε σημαντικά την παγκόσμια έλεγχο και θεραπευτικές στρατηγικές της παρούσας θανατηφόρου ασθένειας.

αναστολέας ιστού μεταλλοπρωτεϊνάσης μήτρας (Timp2, που βρίσκεται στο 17q25) είναι ένα εκκριτική πρωτεΐνη, η οποία αναστέλλει την πρωτεολυτική δράση της μεταλλοπρωτεϊνάσης μήτρας 2 (ΜΜΡ2), ένα μέλος της οικογένειας πρωτεάσης κυρίως εμπλέκεται στην αποικοδόμηση της εξωκυττάριας ουσίας (ECM) [4]. Επιπλέον, Timp2 ρυθμίζει επίσης την ανάπτυξη των κυττάρων και την απόπτωση [5]. Η ισορροπία μεταξύ Timp2 και ΜΜΡ2 διαδραματίζει σημαντικό ρόλο στη διατήρηση της ακεραιότητας των υγιών ιστών. Η αλληλουχία παραλλαγές μέσα στα γονίδια Timp2 διαταράξει προφανώς αυτήν την ισορροπία και είναι φαινομενικά συνδέονται με την ευαισθησία για την ανάπτυξη της ανάπτυξης και εξέλιξης του όγκου. Χαμηλά και υψηλές ποσότητες έκφρασης Timp2 έχουν βρεθεί να συνδέονται με διάφορα είδη και τη μετάσταση του καρκίνου και σε πολλές περιπτώσεις έχει αποδειχθεί ότι συνδέεται με κακή πρόγνωση των ασθενών [6] – [8]. Μια ενιαία νουκλεοτίδιο G & gt? C (rs8179090) πολυμορφισμός έχει εντοπιστεί στη θέση -418 στην περιοχή προαγωγέα του γονιδίου Timp2 [9] και είναι δεδομένο ότι αυτή η παραλλαγή μπορεί να επηρεάσει την έκφραση γονιδίων, ίσως επηρεάζουν την πρόσδεση του μεταγραφικού παράγοντα Sp1 στην μια συναινετική αλληλουχία στην περιοχή του υποκινητή του γονιδίου Timp2 [10].

Λαμβάνοντας υπόψη τον ζωτικό ρόλο των Timp2 στην καρκινογένεση, αρκετές μελέτες ασθενών-μαρτύρων μοριακής επιδημιολογίας έχουν διεξαχθεί για να διερευνηθεί η πιθανή συσχέτιση μεταξύ του Timp2 -418 G & gt? C πολυμορφισμός και καρκίνος επιδεκτικότητα σε διάφορες νεοπλάσματος σε διαφορετικούς πληθυσμούς [11] – [20]. Αν και, τα ευρήματα ήταν ασυνεπής και αντιφατική. Ασυνέπεια στα αποτελέσματα των μελετών αυτών θα μπορούσε ενδεχομένως να αποδοθεί στην εθνικότητα του πληθυσμού ή του δείγματος μέγεθος από μεμονωμένες μελέτες που έχουν χαμηλή ισχύ για να αξιολογήσει το συνολικό αποτέλεσμα. Έτσι, είναι απαραίτητο να ποσοτικοποιηθεί και συνοψίζουν τα αποτελέσματα από όλες τις επιλέξιμες μελέτες με αυστηρές μεθόδους. Στην παρούσα μελέτη, εκτελέσαμε την μετα-ανάλυση για να αξιολογηθεί η συνολική σύνδεση των -418 G & gt? C πολυμορφισμός του κινδύνου /αντίσταση στην ανάπτυξη του καρκίνου. Μια μετα-ανάλυση είναι ένα ισχυρό εργαλείο για να αντλήσει ακριβή συμπέρασμα από συγκεντρωτικά δεδομένα και ως επί το πλείστον χρησιμοποιείται για τη διερεύνηση των παραγόντων κινδύνου που σχετίζονται με γενετικές ασθένειες. Απασχολεί ποσοτική μέθοδο για να συνδυάσει τα στοιχεία από μεμονωμένες μελέτες όπου οι επιμέρους μεγέθη των δειγμάτων είναι μικρά και έχουν χαμηλή στατιστική ισχύ [21], [22].

Υλικά και Μέθοδοι

Αναγνώριση και την επιλεξιμότητα των σχετικών μελέτες

Αυτή η μετα-ανάλυση οργανώθηκε και αναφέρθηκαν σύμφωνα με τα στοιχεία που Προτεινόμενα Πληροφόρησης για συστηματικές ανασκοπήσεις και μετα-αναλύσεις (PRISMA) δήλωση (Checklist S1). Ψάξαμε ηλεκτρονική βιβλιογραφική έρευνα από το PubMed (Medline) και βάσεις δεδομένων web EMBASE με το συνδυασμό των εξής λέξεις κλειδιά: «Timp2, αναστολέας ιστών μεταλλοπρωτεϊνάσης 2 γονιδίου (πολυμορφισμός ή μετάλλαξη ή παραλλαγή) και την ευαισθησία του καρκίνου ή κινδύνου (τελευταία ενημέρωση τον Οκτώβριο του 2013). Η έρευνα επικεντρώθηκε σε μελέτες που είχαν διεξαχθεί σε ανθρώπινα υποκείμενα. Όλα ανακτηθεί άρθρα αξιολογήθηκαν από την ανάγνωση τους τίτλους και περιλήψεις, και όλοι οι δημοσιευμένες μελέτες που ταιριάζουν με την παραπάνω δήλωσε επιλέξιμες κριτήρια που περιλαμβάνονται σε αυτό το μετα-ανάλυση. Κάναμε επίσης χειροκίνητη αναζήτηση της λίστας αναφοράς από τα ανακτημένα αντικείμενα για άλλα επιλέξιμα ερευνητικά άρθρα

Τα κριτήρια ένταξης και αποκλεισμού

Τα άρθρα που περιλαμβάνονται στην παρούσα μετα-ανάλυση έπρεπε να πληρούν όλα τα ακόλουθα κριτήρια.: α) πρέπει να αξιολογηθεί η συσχέτιση μεταξύ Timp2 (-418 G & gt? C) πολυμορφισμός και τον κίνδυνο του καρκίνου, β) χρησιμοποιείται ένα σχέδιο μελέτης ασθενών-μαρτύρων και διεξήχθησαν στον άνθρωπο, γ) που δημοσιεύθηκε στην αγγλική γλώσσα, δ) να διαθέτουν γονότυπο συχνότητα σε περιπτώσεις και τους ελέγχους. κριτήρια ένταξης για τις περιπτώσεις και τους ελέγχους ήταν, περιπτώσεις α) του καρκίνου θα πρέπει να επιβεβαιωθεί ιστολογικά ή παθολογικά, β) οι έλεγχοι πρέπει να είναι υγιές και απαλλαγμένο από κάθε είδους κακοήθειας, γ) και τα δύο, οι έλεγχοι και οι υποθέσεις θα πρέπει να έχουν παρόμοια εθνικότητα. Επιπλέον, όταν ο ίδιος πληθυσμός ασθενών εμφανίστηκε σε περισσότερες από μία δημοσίευση, τότε μόνο η πιο πρόσφατη ή πλήρη μελέτη περιλήφθηκε σε αυτό το μετα-ανάλυση. Οι κύριοι λόγοι για τον αποκλεισμό της μελέτης ήταν, επικάλυψη των δεδομένων, την περίπτωση μόνο μελέτες, άρθρα ανασκόπησης, και οι συχνότητες γονοτύπου ή τους αριθμούς των ατόμων που δεν έχουν αναφερθεί. Η υποστήριξη των πληροφοριών που σχετίζονται με τη διαδικασία επιλογής (που δείχνει την ένταξη και κριτήρια αποκλεισμού) των μελετών έχει προσαρτηθεί ως σχήμα S1 (PRISMA 2009 Flow Diagram).

Εξαγωγή δεδομένων και αξιολόγηση της ποιότητας

Για κάθε ανακτηθεί δημοσίευση, η αξιολόγηση μεθοδολογική ποιότητα και την εξόρυξη δεδομένων ήταν ανεξάρτητα αντλείται εις διπλούν από δύο ανεξάρτητους ερευνητές χρησιμοποιώντας ένα πρότυπο πρωτόκολλο. Η μορφή συλλογής δεδομένων χρησιμοποιήθηκε για να εξασφαλιστεί η ακρίβεια των δεδομένων που συλλέγονται από αυστηρά την έγκριση των κριτηρίων ένταξης, όπως αναφέρεται ανωτέρω. Τα κύρια χαρακτηριστικά που αντλείται από τα ανακτηθεί μελέτες περιλαμβάνεται το όνομα του πρώτου συγγραφέα, έτος έκδοσης της έρευνας, τη χώρα προέλευσης, τον αριθμό των περιπτώσεων και των ελέγχων, το είδος του καρκίνου, οι συχνότητες γονοτύπου για τις περιπτώσεις και τους ελέγχους και την πηγή του γονότυπου. Περιπτώσεις που σχετίζονται με τη σύγκρουση ή διαφωνία σε οποιοδήποτε στοιχείο των δεδομένων από τα συλλεχθέντα μελέτες διεξήχθη εκτενής συζήτηση με τους ερευνητές για να επιτευχθεί μια τελική συναίνεση.

Η στατιστική ανάλυση

Για να αξιολογηθεί η ισχύς της σύνδεσης μεταξύ Timp2 -418 G & gt? C πολυμορφισμός και τον κίνδυνο του καρκίνου, συγκεντρώνονται ΕΑΠ και των αντίστοιχων επιπέδου 95% υπολογίστηκαν [23]. παραδοχή ετερογένεια μεταξύ των μελετών σε όλη την επιλέξιμη σύγκριση έγινε με την Q-chi-square test με βάση [24]. Η ετερογένεια θεωρήθηκε σημαντική σε ρ-τιμή & lt? 0,05 για να αποφευχθεί υποτίμηση της παρουσίας της ετερογένειας. Ένα μοντέλο σταθερής επίδραση (αν ρ-τιμή & gt? 0,05) [25] ή ένα μοντέλο τυχαία επίδραση (αν p-value & lt? 0,05) [26] χρησιμοποιήθηκε για τη συγκέντρωση των αποτελεσμάτων. Επίσης, έχω

2 στατιστικές χρησιμοποιήθηκε για να ελέγξετε αποτελεσματικά την ετερογένεια [27]. Hardy-Weinberg ισορροπία (HWE) στους ελέγχους μετρήθηκε μέσω τεστ chi-square. οικόπεδο Χωνί ασυμμετρία μετρήθηκε με γραμμική παλινδρόμηση δοκιμή Egger, η οποία είναι ένας τύπος γραμμική προσέγγιση παλινδρόμησης για την εκτίμηση της ασυμμετρίας πλοκή χοάνης το φυσικό λογάριθμο κλίμακα του OR. Η σημασία της τομής προσδιορίστηκε με την t-test (ρ-τιμή & lt? 0,05 θεωρήθηκε ως αναπαράσταση στατιστικά σημαντική προκατάληψη δημοσίευση) [28]. Για να επιλέξετε το καταλληλότερο πρόγραμμα για να εκτελέσετε το τρέχον μετα-ανάλυση, ένα online σύγκριση των προγραμμάτων λογισμικού «μετα-ανάλυση» διεξήχθη χρησιμοποιώντας (Uniform Resource Locator url) στην αντιμετώπιση https://www.meta-analysis.com/σελίδες /comparisons.html. Η έκδοση 2 του προγράμματος λογισμικού Ολοκληρωμένη μετα-ανάλυση (CMA) από Biostat Inc., NJ, USA χρησιμοποιήθηκε για την εκτέλεση όλων των στατιστικών αναλύσεων που εμπλέκονται στην παρούσα μετα-ανάλυση. Όλες οι p-τιμές ήταν δύο όψεων και στατιστική επίπεδο σημαντικότητας θεωρήθηκε ως p-τιμή μικρότερη από 0.05 για αυτό το μετα-ανάλυση.

Αποτελέσματα

αναζήτηση Λογοτεχνία και μετα-ανάλυση δεδομένων

Σύμφωνα με τα κριτήρια ένταξης και αποκλεισμού, συνολικά δέκα ερευνητικά άρθρα τελικά περιλαμβάνονται σε αυτό το μετα-ανάλυση μέσω της αναζήτησης λογοτεχνίας από το PubMed (Medline) και βάσεις δεδομένων web EMBASE. Αποκλείσαμε ένα άρθρο κατά τη διάρκεια της διαδικασίας επιλογής μελέτη μας, η οποία δημοσιεύθηκε στην κινεζική γλώσσα [29]. Όλα ανακτηθεί άρθρα εξετάστηκαν προσεκτικά από την ανάγνωση τους τίτλους και περιλήψεις και τα πλήρη κείμενα των εν δυνάμει σχετικών ερευνητικών άρθρων εξετάστηκαν περαιτέρω για την καταλληλότητά τους για αυτό το μετα-ανάλυση (Σχήμα S1: PRISMA 2009 Flow Diagram). Μελέτες είτε δείχνοντας Timp2 πολυμορφισμός να προβλέψει την επιβίωση σε ασθενείς με καρκίνο ή θεωρώντας παραλλαγές Timp2 ως ένα δείκτες για την ανταπόκριση στη θεραπεία αποκλείστηκαν αμέσως από αυτό το μετα-ανάλυση. Παρομοίως, μελέτες που διερευνούν τα επίπεδα Timp2 mRNA ή έκφραση πρωτεΐνης ή σχετικά άρθρα ανασκόπησης αποκλείσθηκαν επίσης από αυτή τη μελέτη. Συμπεριλάβαμε μόνο περίπτωση ελέγχου ή σχέδιο ομαδικής μελέτες που έχουν συχνότητα των τριών γονότυπο. Εκτός από την αναζήτηση της βάσης δεδομένων, οι διατίθεται στα ανακτηθούν άρθρα αναφορές έγιναν επίσης αξιολογούνται για άλλα πιθανά είδη (Πίνακας 1). Οι κατανομές των γονοτύπων και τη συχνότητα έλασσον αλληλόμορφο (MAF) στους μάρτυρες και περιπτώσεις έχουν δοθεί στον Πίνακα 2.

Η

προκατάληψη Δημοσίευση

οικόπεδο χοάνη Begg και δοκιμή Egger είχαν πραγματοποιηθεί έξω για να επανεξετάσει την προκατάληψη δημοσίευση μεταξύ των επιλεγμένων εκδόσεων για τη μετα-ανάλυση. Η εμφάνιση του σχήματος των οικοπέδων χοάνης Begg ήταν έμοιαζε συμμετρική σε όλες τις γενετικά μοντέλα αυτής της μελέτης (σχήμα S2). δοκιμή του Egger του έγινε να αρκεί η στατιστικά στοιχεία του οικοπέδου χοάνη. Η δοκιμή αυτή αξιολογεί την προκατάληψη, χρησιμοποιώντας την ακρίβεια να προβλέψει το τυποποιημένο αποτέλεσμα. δοκιμή του Egger δεν ανίχνευσε προκατάληψη δημοσίευση, αλλά με 10 μελέτες, υπάρχει μικρή πιθανότητα ότι θα μπορούσε, και ως εκ τούτου μια μη-σημαντική δοκιμασία δεν σημαίνει ότι δεν υπήρχε μεροληψία δημοσίευσης (Πίνακας 3).

Η

Αξιολόγηση της ετερογένειας

για να ελέγξετε την ετερογένεια μεταξύ των επιλεγμένων εκδόσεων, Q-test και I

2 στατιστικά στοιχεία που χρησιμοποιούνται. Ετερογένεια παρατηρήθηκε σε όλες τις γενετικές μοντέλα, δηλαδή, αλληλόμορφο (C έναντι G), ομόζυγο (CC εναντίον GG), ετερόζυγη (GC εναντίον GG), κυρίαρχη (CC + GC εναντίον GG) και υπολειπόμενη (CC vs. GG + GC). Έτσι, τυχαίων επιδράσεων μοντέλο εφαρμόστηκε για τη σύνθεση των δεδομένων για αυτήν την ανάλυση (Πίνακας 3)

Σύλλογος Timp2 -418 G & gt?. C πολυμορφισμός και η συνολική επιδεκτικότητα καρκίνου σε όλα ο πληθυσμός

ομαδοποιήθηκαν τα δεδομένα από όλες τις δέκα μελέτες μαζί και απέδωσε σε 2225 περιπτώσεις καρκίνου και 2532 άτομα ελέγχου, για την αξιολόγηση της συνολικής σύνδεσης μεταξύ Timp2 -418 G & gt? C πολυμορφισμός και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου. Το συγκεντρωμένο Ή από το συνολικό μελέτες έδειξαν καμία σημαντική αυξημένη ή μειωμένη κινδύνου μεταξύ -418 G & gt? C πολυμορφισμός και επιδεκτικότητα καρκίνου σε αλληλόμορφη (Γ εναντίον G: OR = 1.293, 95% CI = 0,882 να 1,894, p = 0,188), ομόζυγο ( CC εναντίον GG: OR = 0.940, 95% CI = 0,434 – 2,039, p = 0,876), ετερόζυγη (GC εναντίον GG: OR = 1.397, 95% CI = 0,888 – 2,198, p = 0,148), κυρίαρχη (CC + GC εναντίον GG: OR = 1.387, 95% CI = 0,880 – 2,187, p = 0,159) και υπολειπόμενη (CC έναντι GG + GC: OR = 0.901, 95% CI = 0,442 – 1,838, p = 0,774) μοντέλα σύγκρισης ( Σχήμα 1 και 2)

Σημείωση:. Οι πλατείες και οι οριζόντιες γραμμές αντιστοιχούν στη μελέτη ειδικών OR και 95% CI

η

Σημείωση:. Οι πλατείες και οριζόντιες γραμμές αντιστοιχούν στις μελετήσει ειδικά OR και 95% CI.

η

ανάλυση ευαισθησίας

για να αξιολογηθεί η αξιοπιστία των αποτελεσμάτων μετα-ανάλυσή μας, πραγματοποιήσαμε ανάλυση ευαισθησίας για να καθορίσει αν πληρούνται τα κριτήρια ένταξης των Αυτή η μετα-ανάλυση επηρέασαν τα αποτελέσματα ή όχι [30]. Διαδοχικά, ενιαία μελέτη διαγράφεται κάθε φορά ώστε να αντικατοπτρίζει την επιρροή των ατομικών δεδομένων. Το αποτέλεσμα της ανάλυσης ευαισθησίας έδειξε ότι συγκεντρωτικές ΕΑΠ πριν και μετά τον αποκλεισμό της μελέτης ήταν γενικά παρόμοια σε όλες τις πέντε γενετικές μοντέλα (Εικόνα S3). Ως εκ τούτου, τα αποτελέσματα της μετα-ανάλυσης ήταν σχετικά σταθερές και αξιόπιστες.

Συζήτηση

Η επεξεργασία και η αξιολόγηση του κινδύνου και εξέλιξη του καρκίνου εξακολουθεί να αποτελεί σοβαρό πρόβλημα, δεδομένου ότι επαναλαμβάνεται παρά την απομάκρυνσή του μέσω χειρουργική επέμβαση, χημειοθεραπεία και δεν μειώνεται συχνότητα εμφάνισης καρκίνου. Έχει ήδη αποδειχθεί ότι οι γενετικοί παράγοντες παίζουν σημαντικό ρόλο στην αιτιολογία του καρκίνου και αρκετών χαμηλή διεισδυτικότητα γονίδια εμπλέκονται στην εξέλιξη του καρκίνου. Ως εκ τούτου, γενετικός δείκτης εκτίμησης του κινδύνου με βάση μπορεί να προσφέρει κάποιο όφελος για την καλύτερη πρόληψη του κινδύνου του καρκίνου και την έγκαιρη διάγνωση της νόσου. Timp2 παρεμποδίζει την ανάπτυξη των ενδοθηλιακών κυττάρων που επάγεται από βασικό αυξητικό παράγοντα ινοβλαστών, καταστέλλοντας έτσι την αγγειογένεση και τη ρύθμιση της απόπτωσης, δείχνει αρνητικό ρόλο στον καρκίνο [31], [32]. Timp2 κατέχει ένα πολύπλοκο ρόλο στον καρκίνο μέσω της ικανότητάς της να ρυθμίζει δραστικότητα ΜΜΡ και να αναστέλλουν ειδικά ΜΜΡ2. Η αγγειογένεση είναι σημαντική στην καρκινογένεση και προαγγειογόνος παράγοντες διαδραματίζουν βασικό ρόλο στην αγγειογένεση [33]. Λαμβάνοντας υπόψη τον σημαντικό ρόλο των Timp2 στην αύξηση του όγκου, αγγειογένεση, την εισβολή και τη μετάσταση, είναι λογικό να υποθέσουμε ότι υποδοχής γονιδιωματικής πολυμορφισμός του Timp2 μπορεί να επηρεάσουν την εμφάνιση όγκων. Τα τελευταία χρόνια, έχουν γενετικές παραλλαγές του γονιδίου Timp2 και το ρόλο της στην αιτιολογία των διαφόρων τύπων καρκίνου έχουν μελετηθεί διεξοδικά, αλλά τα αποτελέσματα είναι ασαφή και αντιφατικό. Όπως είναι γνωστό ότι, μεμονωμένες μελέτες με μικρό μέγεθος δείγματος μπορεί να μην έχει επαρκή στατιστική ισχύ για την ανίχνευση ενός μικρού παράγοντα κινδύνου. Προκειμένου να αποκομίσουν πιο ακριβή αποτελέσματα, πραγματοποιήσαμε το σημερινό μετα-ανάλυση για να εκτιμηθεί κατά πόσον υπάρχει σύνδεση μεταξύ του γονιδίου Timp2 πολυμορφισμό και τον κίνδυνο ανάπτυξης καρκίνου. Έχει διαπιστωθεί ότι η συγκεντρωτική ΕΑΠ που παράγεται από το μεγάλο μέγεθος του δείγματος και του πληθυσμού μπορεί να αυξήσει τη στατιστική ισχύ των αποτελεσμάτων και συνδυάζοντας στοιχεία από διάφορες μελέτες έχει το πλεονέκτημα των μειωμένων τυχαία σφάλματα [34].

Σύμφωνα με όσα μας γνώση, αυτή είναι η πρώτη μελέτη μετα-ανάλυση διερευνά τη σχέση μεταξύ Timp2 -418 G & gt? C πολυμορφισμό του γονιδίου και συνολικό κίνδυνο καρκίνου. Οι ενώσεις για την αντίθεση αλληλόμορφο, κυρίαρχα και υπολειπόμενο μοντέλο εξετάστηκαν στην μετα-ανάλυση. Τα αποτελέσματα έδειξαν ότι -418 G & gt? C πολυμορφισμός δεν συνδέονται σημαντικά με την ευαισθησία του καρκίνου σε σύγκριση με GG γονότυπο στη συνολική πληθυσμούς. Μία από τις πιθανές εξηγήσεις είναι ότι η γονιδιακή Timp2 έχει πολλές άλλες SNPs και κάθε πολυμορφισμού σε κίνδυνο του καρκίνου μπορεί να οφείλεται σε διαταραχή ισορροπίας σύνδεσης (LD). Είναι καλά τεκμηριωμένο ότι οι πολλαπλές SNPs ίσως δρα ανεξάρτητα, συλλογικά ή αλληλεπιδρούν μεταξύ τους για να επηρεάσει την εμφάνιση του καρκίνου. Ως εκ τούτου, είναι πιθανό ότι οι πολλαπλές αλληλόμορφα ή γονίδια συνεισφέρουν την ευαισθησία σε κίνδυνο καρκίνου και Timp2 -418 G & gt? C αναλύθηκαν παραλλαγή δεν επηρεάζουν μεμονωμένα. Παρ ‘όλα αυτά, γενετικά πολύπλοκες ασθένειες διαφέρουν από τις απλές Μέντελ ασθένειες και αιτιολογία του καρκίνου είναι πολυγονιδιακή, μια ενιαία γενετική παραλλαγή είναι συνήθως ανεπαρκής για να προβλέψει τον κίνδυνο αυτής της θανάσιμης ασθένειας που έχει ένα σύνθετο φαινότυπο της νόσου.

Η ετερογένεια είναι ένα κρίσιμο ζήτημα, ενώ ερμηνεία των αποτελεσμάτων της κάθε μελέτης μετα-ανάλυση. Παρά το γεγονός ότι, η ετερογένεια μπορεί να ελαχιστοποιηθεί με την εκτέλεση τυχαίων δράσεων μοντέλο [35]. Στην παρούσα μελέτη ανιχνεύσαμε ετερογένεια μεταξύ μελέτης. Υπάρχουν διάφοροι παράγοντες που συμβάλλουν σε τέτοια ετερογένεια, για παράδειγμα, τα γενετικά υπόβαθρα για τις περιπτώσεις και τους ελέγχους, κλινική χαρακτηριστικό των διαφορετικών όγκων, διαφορετικά διανομή γονότυπος Timp2 σε διαφορετικές εθνοτικές ομάδες και δείχνουν ότι είναι σχεδόν /πάντα με την επιφύλαξη της φυσικής επιλογής [36 ]. Σε μερικές από τις επιλεγμένες μελέτες, οι έλεγχοι δεν ήταν ομοιόμορφα ορίζεται και ορισμένες μελέτες περιελάμβαναν ασθενή με καλοήθη ασθένεια η οποία μπορεί να συνεισφέρει στη γονιδιακή μετάλλαξη Timp2 και ανάπτυξη διαφόρων καρκίνων.

Παρά τα σημαντικά ευρήματα από την τρέχουσα ανάλυση μας, έχουμε ακόμη να αναγνωρίσουμε μερικούς από τους περιορισμούς της παρούσας ανάλυσης. Κατ ‘αρχάς, θα περιλαμβάνονται μόνο οι μελέτες που δημοσιεύθηκε στην αγγλική γλώσσα, που αντλείται και καταχωρίζονται από τις επιλεγμένες ηλεκτρονικές βάσεις δεδομένων συμπεριλήφθηκαν για την ανάλυση δεδομένων? είναι πιθανό ότι κάποια σχετική άρθρα που δημοσιεύονται σε άλλες γλώσσες ή /και αναπροσαρμόζονται σε κάποιες άλλες ηλεκτρονικές βάσεις δεδομένων μπορεί να έχουν χαθεί. Δεύτερον, το αποτέλεσμα αυτής της μετα-ανάλυση βασίστηκε σε αδιόρθωτη ΕΑΠ, διότι δεν είναι όλα επιλεγμένα επιλέξιμες μελέτες δήλωσε προσαρμοσμένη ΕΑΠ. Τρίτον, ο ρόλος των αλληλεπιδράσεων γονιδίων-περιβάλλοντος και η ανάλυση υποομάδας δεν θεωρήθηκαν σε αυτή τη μελέτη, λόγω των περιορισμένων εκδόσεων και ανεπαρκή στοιχεία. Παρά το γεγονός αυτό, οι τρέχουσες μετα-ανάλυση μας έχει κάποιο πλεονέκτημα. Πρώτον, δεν υπήρχαν σαφείς ενδείξεις για μεροληψία δημοσίευσης μέσω ποιοτικών οικόπεδο χοάνη και ποσοτική Egger γραμμική παλινδρόμηση, η οποία ανέφερε ότι τα αποτελέσματά μας είναι στατιστικά ισχυρή. Δεύτερον, χρησιμοποιήσαμε σαφή κριτήρια για την ένταξη της μελέτης και εκτελούνται αυστηρά εξόρυξη δεδομένων και η ανάλυση να γίνει ικανοποιητική και αξιόπιστα συμπεράσματα.

Συμπέρασμα

Εν κατακλείδι, μια μετα-ανάλυση είναι ένα εξαιρετικά πολύτιμο και ισχυρό προσέγγιση της ανάλυσης δεδομένων που πισίνες τόσο στατιστικά σημαντικές και μη σημαντικές στοιχεία από μεμονωμένες μελέτες και δημιουργεί ένα ακριβές και απόλυτο συμπέρασμα. Η παρούσα μετα-ανάλυση αξιολόγησε τη σχέση της Timp2 -418 G & gt? C πολυμορφισμού με τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου και πρότεινε ότι η Timp2 -418 G & gt? C πολυμορφισμός δεν συνέβαλε αυξημένο ή μειωμένο κίνδυνο καρκίνου. Περαιτέρω καλά σχεδιασμένες μελέτες μεγάλης κλίμακας με την εξέταση των αλληλεπιδράσεων γονιδίων-γονιδίων και γονιδίων-περιβάλλοντος θα πρέπει να ενθαρρύνονται να ερευνήσει την πιθανή συσχέτιση. Εδώ, αναλύσαμε μόνο το -418 G & gt? Παραλλαγή C για τον κίνδυνο του καρκίνου, χωρίς να εξετάσει την αλληλεπίδραση μεταξύ πολλών άλλων SNPs. Στο μέλλον, θα διερευνήσει περαιτέρω τις άλλες σχετικές αλληλεπιδράσεις για να διευκολύνει την ανακάλυψη της παθογένειας του καρκίνου.

Υποστήριξη Πληροφορίες

Εικόνα S1.

(PRISMA 2009 Flow Diagram):. διάγραμμα ροής εμφανίζοντας τον εντοπισμό και την επιλογή των μελετών για την παρούσα μετα-ανάλυση

doi: 10.1371 /journal.pone.0088184.s001

(ΔΕΘ)

Εικόνα S2.

Χωνί οικόπεδα των δοκιμών του Egger να εντοπίζει προκατάληψη δημοσίευση σε πέντε διαφορετικά γενετικά μοντέλα. Κάθε σημείο αντιπροσωπεύει μια ξεχωριστή μελέτη. Η Ή χαράχθηκε σε λογαριθμική κλίμακα κατά της ακρίβειας της κάθε μελέτης

doi:. 10.1371 /journal.pone.0088184.s002

(ΔΕΘ)

Εικόνα S3.

Ανάλυση ευαισθησίας των Timp2 -418 G & gt? C πολυμορφισμός

doi:. 10.1371 /journal.pone.0088184.s003

(ΔΕΘ)

Λίστα ελέγχου S1.

(PRISMA Checklist 2009)

doi:. 10.1371 /journal.pone.0088184.s004

(DOC)

Ευχαριστίες

Συγγραφείς ειλικρινά αναγνωρίζουν το σχετικό πρόγραμμα λογισμικού υπηρεσία υποστήριξη για τη στατιστική ανάλυση που παρέχεται από το Ινστιτούτο Επιστημών ζωής (Bhubaneswar, Ινδία) και το Πανεπιστήμιο Albaha (Albaha, Σαουδική Αραβία).

You must be logged into post a comment.