Αφηρημένο

Ο ρυθμιστής της σηματοδότησης G-πρωτεϊνών (RGS) οδός παίζει ένα σημαντικό ρόλο στη μεταγωγή, κυτταρική δραστηριότητα, και καρκινογένεση σηματοδότησης. Υποθέσαμε ότι γενετικές παραλλαγές σε οικογένεια γονιδίων RGS μπορεί να σχετίζεται με την απόκριση του προχωρημένου σταδίου μη μικροκυτταρικό καρκίνο του πνεύμονα (NSCLC), οι ασθενείς στη χημειοθεραπεία ή χημειοραδιοθεραπεία. Έχουμε επιλέξει 95 tagging πολυμορφισμούς μονών νουκλεοτιδίων (SNPs) σε 17 RGS γονίδια και τα γονότυπος σε 598 ασθενείς με μη μικροκυτταρικό καρκίνο πνεύμονα προχωρημένου σταδίου. Δεκατρείς SNPs ήταν σημαντικά σχετίζεται με τη συνολική επιβίωση. Μεταξύ αυτών, rs2749786 του

RGS12

ήταν πιο σημαντική. Στρωματοποιημένη ανάλυση από χημειοθεραπεία ή chemoradiation αναγνωρίζεται περαιτέρω SNPs που σχετίζονται με τη συνολική επιβίωση σε υποομάδες. Rs2816312 του

RGS1

και rs6689169 του

RGS7

ήταν πιο σημαντική στην ομάδα της χημειοθεραπείας και της ομάδας χημειοραδιοθεραπεία, αντίστοιχα. Μια σημαντική σωρευτική επίδραση παρατηρήθηκε όταν συνδυάζονται αυτά τα SNPs. Οι αναλύσεις επιβίωσης δέντρο εντοπίζονται πιθανές αλληλεπιδράσεις μεταξύ rs944343, rs2816312 και rs1122794 στο επηρεάζουν το χρόνο επιβίωσης σε ασθενείς που έλαβαν θεραπεία με χημειοθεραπεία, ενώ ο γονότυπος του rs6429264 επηρεάζονται επιβίωσης σε ασθενείς chemoradiation-θεραπεία. Για τις γνώσεις μας, αυτή είναι η πρώτη μελέτη για να αποκαλύψει τη σημασία της οικογένειας γονιδίων RGS στην επιβίωση των ασθενών με NSCLC προχωρημένου σταδίου

Παράθεση:. Dai J, Gu J, Lu C, Lin J, Stewart D, Chang D, et al. (2011) Γενετικές Μεταβολές στην Ρυθμιστική Αρχή της G-πρωτεΐνης σηματοδότησης Γονίδια συνδέονται με την επιβίωση στο τελευταίο στάδιο μη-μικροκυτταρικό καρκίνο του πνεύμονα. PLoS ONE 6 (6): e21120. doi: 10.1371 /journal.pone.0021120

Επιμέλεια: Λιν Ζανγκ, University of Pennsylvania, Ηνωμένες Πολιτείες της Αμερικής

Ελήφθη: 4 Μάη, 2011? Αποδεκτές: 19η Μάη 2011? Δημοσιεύθηκε: 17, Ιουνίου, 2011

Copyright: © 2011 Dai et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Αυτό το έργο υποστηρίχθηκε από τα Εθνικά Ινστιτούτα Υγείας χορηγεί R01 CA111646, Ρ50 CA070907, και R01 CA055769. Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου. Καμία πρόσθετη εξωτερική χρηματοδότηση ελήφθη για τη μελέτη αυτή

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

Μη μικροκυτταρικός καρκίνος του πνεύμονα (NSCLC ) είναι η κύρια αιτία θνησιμότητας από καρκίνο σε όλο τον κόσμο [1]. Πάνω από το 45% των ασθενών με NSCLC παρόν με ανεγχείρητο τελικού σταδίου (στάδιο ΙΙΙΑ /Β ή σταδίου IV) της νόσου στις Ηνωμένες Πολιτείες [2]. Μια συνδυασμένη θεραπεία τροπικότητα είναι το τρέχον πρότυπο της περίθαλψης για τους ασθενείς με ΜΜΚΠ σταδίου ΙΙΙ με την καλή κατάσταση απόδοσης (βαθμολογία επιδόσεις 0 ή 1). Πολυάριθμες κλινικές μελέτες έχουν δείξει ότι η ταυτόχρονη chemoradiation προσφέρει ένα σημαντικό πλεονέκτημα επιβίωσης σε διαδοχικά chemoradiation [3]. Παρά το γεγονός ότι η ταυτόχρονη χημειοραδιοθεραπεία βελτιώνει σημαντικά την επιβίωση των ασθενών με τοπικά προχωρημένη νόσο, η πλειοψηφία των ασθενών πεθαίνουν μέσα σε 5 χρόνια, λόγω της τοποπεριοχική ή μακρινό εξέλιξη της νόσου [4]. Οι ασθενείς σταδίου IV προσφέρονται συνήθως παρηγορητική χημειοθεραπεία και υποστηρικτικής φροντίδας [5]. Υπάρχει μια μεγάλη μεταβλητότητα στην ανταπόκριση των ασθενών σε chemoradiation και κλινικοπαθολογοανατομικές μεταβλητές μόνο δεν παρέχουν ικανοποιητική καθοδήγηση για την απόφαση της θεραπευτικής στρατηγικής. Η εφαρμογή της φαρμακογονιδιωματικής μπορεί να βελτιώσει την πρόβλεψη της ανταπόκρισης και να βοηθήσει τους κλινικούς ιατρούς καθορίσει θεραπείες για τον καρκίνο των επιμέρους NSCLC ασθενή, σύμφωνα με το μοναδικό γενετικό υπόβαθρο του. Ως εκ τούτου, σε αυτή τη μελέτη, με στόχο να προσδιοριστούν οι γενετικοί παράγοντες πρόβλεψης για την κλινική έκβαση των ασθενών προχωρημένο στάδιο NSCLC.

πρωτεΐνες G (γουανίνη νουκλεοτίδιο-δεσμευτικές πρωτεΐνες) είναι σημαντικά μόρια μεταγωγής κυτταρικού σήματος που εκφράζονται σε όλα τα ανθρώπινα κύτταρα [ ,,,0],6], [7]. Ενεργοποιούνται από την G πρωτεΐνη υποδοχείς (GPCRs) και ως εκ τούτου μπορούν να μετάγουν εξωκυτταρικά σήματα μέσα στο εσωτερικό ενός κυττάρου [8]. GPCRs είναι μια οικογένεια υποδοχέων τομέα επτά-διαμεμβράνης. Όταν GPCRs πολεμούν ένα σήμα στο εσωτερικό του κυττάρου, η εξωκυτταρική περιοχή του GPCR συνδέεται πρώτα με τα μόρια του σήματος, και στη συνέχεια, η ενδοκυτταρική περιοχή του GPCR ενεργοποιεί μια ετεροτριμερών G-πρωτεΐνη. Οι ετεροτριμερείς πρωτεΐνη λειτουργεί G ως «μοριακό διακόπτες» και μπορεί να ενεργοποιήσει έναν καταρράκτη σηματοδότησης παραγόντων και την ενεργοποίηση προς τα κάτω στόχος [7]. Αυτό συζευγμένου με πρωτεΐνη βιολογική διεργασία απαιτεί λεπτούς χειρισμούς μέσα από βοηθητικά μόρια όπως το ρυθμιστή της G-πρωτεΐνης σηματοδότησης (RGS) [9]. RGS πρωτεΐνες είναι μια μεγάλη οικογένεια άνω των 30 ενδοκυτταρικών πρωτεϊνών [10], η οποία μπορεί να ρυθμίζουν αρνητικά GPCRs μονοπατιών σηματοδότησης [11], [12]. RGS είναι πολυ-λειτουργικό, μονοπάτια ΟΤΡάσης-επιτάχυνση πρωτεΐνες που προάγουν GTP υδρόλυση από το άλφα υπομονάδα του ετεροτριμερή πρωτεϊνών G, αδρανοποιώντας έτσι την πρωτεΐνη G και ταχέως σβήσιμο GPCR σηματοδότηση [11]. Όλες οι πρωτεΐνες RGS περιέχουν έναν τομέα RGS (που αναφέρεται επίσης ως «RGS-box»), η οποία είναι απαραίτητη για τις δραστηριότητές τους [13], και αυτά τα RGS domains διαμεσολαβούν για την αλληλεπίδραση με άλλες πρωτεΐνες σηματοδότησης, επιτρέποντας RGS πρωτεΐνες για να χρησιμεύσει ως ικριώματα σηματοδότηση [8 ]. Οι Δυσλειτουργίες πρωτεϊνών RGS έχει αναφερθεί ότι σχετίζεται με την παθογένεση πολλών κοινών ανθρώπινων ασθενειών και της τοξικομανίας [14], [15], [16], [17]. Πολλαπλές RGS πρωτεΐνες βρέθηκαν εκφράζεται διαφορικά σε ποικιλία στερεών και αιματολογικές κακοήθειες [18], [19], [20], [21], [22], [23], [24], [25], [26] , [27], [28], [29], [30], [31], [32], [33], [34], [35], [36].

Το μόνο νουκλεοτίδιο οι πολυμορφισμοί (SNPs) του RGS έχουν συσχετιστεί με αρκετές ανθρώπινες ασθένειες, γεγονός που υποδηλώνει ότι η γενετική παραλλαγή στην οδό RGS μπορεί να παίζει ένα σημαντικό ρόλο στην παθογένεση αυτών των ασθενειών »[37], [38]. Πρόσφατα, RGS SNPs έχουν επίσης αναφερθεί να παίζουν σημαντικό ρόλο στον καρκίνο του πνεύμονα. Για παράδειγμα, SNPs στο

RGS17

στο χρωμόσωμα 6q23-25 ​​συσχετίστηκε με οικογενή επιδεκτικότητα καρκίνου του πνεύμονα [39]. SNPs σε

RGS2

και

RGS6

μπορεί να ρυθμίζει τους κινδύνους της ουροδόχου κύστης και καρκίνους του πνεύμονα [37], [40]. Είτε γενετικές παραλλαγές στην οδό RGS θα μπορούσε να επηρεάσει τα κλινικά αποτελέσματα σε ασθενείς με ΜΜΚΠ παραμένει άγνωστη. Σε αυτή τη μελέτη, ελέγξαμε την υπόθεση ότι οι γενετικές παραλλαγές των RGS που σχετίζονται με την επιβίωση των ασθενών με NSCLC τελικού σταδίου που υποβάλλονται σε χημειοθεραπεία ή chemoradiation.

Αποτελέσματα

Εμείς περιλαμβάνονται 598 ασθενείς με NSCLC σε αυτή τη μελέτη , με μέση ηλικία 59,7 ετών (Πίνακας 1). Από τους 598 ασθενείς, οι 456 ήταν νεκροί και 142 ήταν ζωντανός. Εμείς δεν βρήκε καμία σημαντική διαφορά ως προς την ηλικία (

P

= 0.884), την εθνότητα (

P

= 0,937), το κάπνισμα (

P

= 0,860) και πακέτα-έτη του καπνίσματος (

P

= 0,926) μεταξύ των δύο ομάδων ασθενών (Πίνακας 1). Ωστόσο, παρατηρήσαμε μια σημαντική διαφορά στην κατάσταση της θνησιμότητας κατά φύλο (

P

= 0,002), κλινικό στάδιο (

P

= 0.004), και κατάσταση απόδοσης (

P

= 0,002) (Πίνακας 1).

η

Σύλλογοι μεταξύ SNPs και η συνολική επιβίωση στα τέλη του σταδίου ασθενείς με NSCLC

Ένα σύνολο των 13 SNPs σε 6 γονίδια που σχετίζονταν σημαντικά με τον κίνδυνο θανάτου στο

P

& lt? 0,05 (Πίνακας 2). Μεταξύ αυτών, οι παραλλαγή αλληλόμορφα τέσσερα SNPs, rs7549021 και rs1056515 του

RGS5

, rs944343 του

RGS3

, και rs2749786 του

RGS12

, συσχετίστηκαν με μειωμένο κίνδυνο θανάτου , με προσαρμοσμένο ώρας 0.42 (95% CI, 0,22 – 0,83), 0,72 (95% CI, 0,54 – 0,97), 0,80 (95% CI, 0,67 – 0,95), και 0,58 (95% CI, 0,40 – 0,85), αντίστοιχα. Άλλες SNPs που ανατίθενται αυξημένο κίνδυνο θανάτου. Όλα τα SNPs στο

RGS1

γονιδίου ήταν σε ανισορροπία σύνδεσης (με r

2 & gt? 0,8). Με παρόμοιο ώρες σε ένα κυρίαρχο μοντέλο

Η

Η ανάλυση bootstrap εκ νέου δειγματοληψία ήταν Στη συνέχεια έγιναν για 13 SNPs σε εσωτερικώς επικύρωση των αποτελεσμάτων. Βρήκαμε ότι μόνο 5 SNPs, rs944343 (

RGS3

), rs6678136 (

RGS4

), rs7549021 (

RGS5

), rs3820487 (

RGS5

) και rs2749786 (

RGS12

), είχε εκκίνησης

P

τιμές & lt? 0,05 τουλάχιστον 70 φορές από 100 φορές (Πίνακας 2). Η άλλη SNPs είχαν εκκίνησης

P

τιμές & lt? 0,05 λιγότερο από 50 φορές, υποδεικνύοντας ότι οι SNPs ήταν πιθανόν ψευδώς θετικά αποτελέσματα

Σύλλογοι μεταξύ SNPs και τον κίνδυνο θανάτου στρωματοποιημένη με επεξεργασία

Στην συνέχεια εκτελείται ένα στρωματοποιημένο ανάλυση με τρόπο θεραπείας, χημειοθεραπείας ή chemoradiation (πίνακες 3 και 4). Εννέα SNPs συνδέθηκαν με τη συνολική επιβίωση σε ασθενείς που έλαβαν μόνο χημειοθεραπεία, 5 εκ των οποίων είχαν εκκίνησης

P

τιμές & lt? 0,05 τουλάχιστον 70 φορές από 100 φορές (Πίνακας 3). Μεταξύ αυτών των πέντε SNPs, τρεις (rs2816312 [

RGS1

], rs10218752 [

RGS5

], και rs1122794 [

RGS11

]) έχουν συσχετιστεί με αυξημένο κίνδυνο θανάτου, με HRs 1,80 (95% CI, 1,32 – 2,45), 1,76 (95% CI, 1,06 – 2,90), και 1,37 (95% CI, 1,07 – 1,77), αντίστοιχα. Από την άλλη πλευρά, rs944343 (

RGS3

) και rs1051013 (

RGS3

) συσχετίστηκαν με μειωμένο κίνδυνο θανάτου, στο HRS 0,73 (95% CI, 0,57 έως 0,94) και 0,77 (95% CI, 0,60 – 0,98), αντίστοιχα. Σε Kaplan-Meier αναλύσεις, τέσσερις από τις πέντε σημαντικών SNPs (rs2816312 [

RGS1

], rs944343 [

RGS3

], rs1051013 [

RGS3

], και rs1122794 [

RGS11

]) ήταν σημαντικά σχετίζεται με αλλαγμένη διάμεσος χρόνος επιβίωσης (MST) (log-rank

P

αξία & lt?. 0,05) (Πίνακας 3)

Η

Υπήρχαν οκτώ SNPs σημαντικά που συνδέονται με την κατάσταση επιβίωσης σε ασθενείς που έλαβαν chemoradiation, πέντε από τα οποία είχαν εκκίνησης

P

τιμές & lt? 0.05 περισσότερες από 70 φορές από 100 φορές (Πίνακας 4). Μεταξύ αυτών των πέντε SNPs, τρεις (rs2344673 [

RGS5

], rs12127281 [

RGS5

], και rs6429264 [

RGS7

]) έχουν συσχετιστεί με αυξημένο κίνδυνο θανάτου, με HRs 1,86 (95% CI, 1,00 – 3,47), 1,83 (95% CI, 01.09 – 03.10), και 1,89 (95% CI, 1,06 – 3,38), αντίστοιχα? ενώ rs12757054 (

RGS7

) και rs6689169 (

RGS7

) συσχετίστηκαν με μειωμένο κίνδυνο θανάτου, με ωρών από 0,48 (95% CI, 0,26 έως 0,86) και 0,47 (95% CI , 0,27 να 0,80), αντίστοιχα. Δύο από αυτά τα 5 SNPs στο

RGS7

(rs6429264 και rs6689169) σχετίστηκαν με τροποποιηθεί MST για τους ασθενείς με NSCLC (log-rank

P

= 0,0055 και 0,0441, αντίστοιχα) (Πίνακας 4).

αθροιστική επίδραση των δυσμενών γονότυπους στην επιβίωση

αξιολογηθεί περαιτέρω τις σωρευτικές επιπτώσεις των δυσμενών γονότυπους είτε σε ομάδες θεραπείας με τη χρήση του SNPs με εκκίνησης

P

τιμές & lt? 0,05 σε τουλάχιστον 70 φορές από 100 φορές σε κάθε ομάδα (Πίνακας 5). Υπήρχαν σημαντικές επιδράσεις γονίδιο δόσης σε ασθενείς που λαμβάνουν και τις δύο θεραπείες (Πίνακας 5). Σε εκείνους τους ασθενείς που λαμβάνουν χημειοθεραπεία μόνο και τη λήψη της ομάδας αναφοράς χαμηλού κινδύνου ως σημείο αναφοράς (0 δυσμενείς γονότυπους), το μέσο κινδύνου (1 ή 2 δυσμενείς γονότυπους) και οι ομάδες υψηλού κινδύνου (3 ή 4 δυσμενείς γονότυποι) είχαν 1,69 φορές (95% CI, 1,19 – 2,41?

P

= 0,004) και 2,52 φορές (95% CI, 1,71 – 3,71?

P

& lt? 0.001) αυξημένο κίνδυνο θανάτου, αντίστοιχα (

P

για τάση & lt? 0.001). Το MST για το μέσο κινδύνου και οι ομάδες υψηλού κινδύνου ήταν 11,22 μήνες και 8,19 μήνες, αντίστοιχα, σε σύγκριση με 18,22 μήνες για την ομάδα αναφοράς χαμηλού κινδύνου (log-rank

P

αξία & lt? 0,0001). Παρόμοιες τάσεις δόσης-απόκρισης παρατηρήθηκαν μεταξύ των ασθενών που έλαβαν chemoradiation (Πίνακας 5 και Σχήμα 1).

Στερεά γραμμή αντιπροσωπεύει ομάδα χαμηλού κινδύνου, που μεταφέρουν 0 δυσμενείς γονότυπους στη χημειοθεραπεία (Α) και 0-1 δυσμενείς γονότυπους στην χημειοραδιοθεραπεία (ΣΙ). Διακεκομμένη γραμμή παριστάνει την ομάδα μέσου κινδύνου, που μεταφέρουν 1-2 δυσμενείς γονότυπους στη χημειοθεραπεία (Α) και 2-3 δυσμενείς γονότυπους στην χημειοακτινοθεραπεία (Β). Διακεκομμένη γραμμή αντιπροσωπεύει ομάδα υψηλού κινδύνου, που μεταφέρουν 3-4 δυσμενείς γονότυπους στη χημειοθεραπεία (Α) και 4-5 δυσμενείς γονότυπους στην χημειοακτινοθεραπεία (Β). Ν: αριθμός των νεκρών /Alive. MST:. Διάμεσος χρόνος επιβίωσης

Η

Ανώτατη τάξης των αλληλεπιδράσεων γονιδίων-γονίδιο

Τα αποτελέσματα της ανάλυσης του προγράμματος STREE για την αλληλεπίδραση των 10 εκκίνησης-επικυρωμένη σημαντική SNPs (η SNPs που είχε bootstrap τιμές Ρ & lt? 0.05 τουλάχιστον 70% του χρόνου στους πίνακες 3 και 4) σε στρωματοποιημένη ανάλυση παρουσιάστηκαν σε ανάλυση δέντρο Σχήμα 2. επιβίωση οδήγησε σε τέσσερα τερματικών κόμβων στην ομάδα χημειοθεραπεία και δύο τερματικούς κόμβους της ομάδας chemoradiation ( Σχήμα 2Α). Στην ομάδα χημειοθεραπεία, η αρχική διάσπαση ήταν rs944343 (

RGS3

), και μετέπειτα διασπάσεις ήταν rs2816312 (

RGS1

) και rs1122794 (

RGS11

). Διαφορετικούς κόμβους είχε διαφορετικά ποσοστά της εκδήλωσης θανάτου. Για την εκτίμηση του κινδύνου που συνδέεται με καθέναν από τους τερματικούς κόμβους, τον κόμβο 1 στον κλάδο χημειοθεραπεία λήφθηκε ως ομάδα αναφοράς, που αποτελείται από άτομα με ετερόζυγο και τα ομόζυγα παραλλαγή γονότυπους των rs944343 (

RGS3

) και την ομόζυγη άγριου τύπου γονότυπο του rs1122794 (

RGS11

). Σε σύγκριση με την ομάδα αναφοράς, οι ασθενείς στις τερματικές κόμβους στην ομάδα χημειοθεραπεία είχε HRs κυμαίνονται από 1,49 να 2,92. Οι ασθενείς σε κόμβο 1 είχε τη μεγαλύτερη MST του 13,58 μήνες. Το υψηλότερο σε κίνδυνο ομάδας (κόμβος 3), η οποία αποτελούνταν από ασθενείς που φέρουν το ομόζυγο άγριου τύπου γονότυπο του rs944343 (

RGS3

) και την παραλλαγή που περιέχουν γονότυπους του rs2816312 (

RGS1

) , είχαν HR 2,92 (95% CI, 1,92 έως 4,44). Οι MSTS έδειξαν να είναι σημαντικά διαφορετική σε ανάλυση Kaplan-Meier επιβίωσης (log-rank

P

αξία & lt? 0.0001) (Σχήμα 2Β και Πίνακας 6). Στην ομάδα chemoradiation, υπήρχε μόνο ένα επιπλέον διάσπαση. Σε σύγκριση με τους ασθενείς με ομόζυγο άγριου τύπου γονότυπο του rs6429264 (

RGS7

) (κόμβος 5), ο οποίος είχε ένα MST των 19,28 μήνες, οι ασθενείς που φέρουν την παραλλαγή που περιέχουν γονότυπους του rs6429264 (

RGS7

) παρουσίασαν ένα 1,89 φορές αυξημένο κίνδυνο θανάτου (95% CI, 1,06 – 3,38), με MST των 12,37 μήνες (Εικόνα 2C και Πίνακας 6)

(α) αναλύσεις επιβίωσης δέντρο.? 0: ομόζυγο άγριου τύπου γονότυπο? 1: ετερόζυγο γονότυπο? 2: ομόζυγο παραλλαγή γονότυπο. (Β) και (Γ) αντιπροσωπεύουν τις καμπύλες επιβίωσης της ομάδας κινδύνου στην ομάδα χημειοθεραπεία και ομάδα χημειοραδιοθεραπεία? Ν: αριθμός των νεκρών /Alive. MST:. Διάμεσος χρόνος επιβίωσης

Η

Συζήτηση

Σε αυτή τη μελέτη, διαπιστώσαμε ότι οι γενετικές παραλλαγές στα γονίδια RGS συνδέθηκαν με τη συνολική επιβίωση σε ασθενείς με ΜΜΚΠ προχωρημένου σταδίου. Τα ευρήματά μας ενίσχυσε επίσης τη σημασία της αξιολόγησης των σωρευτικών και την αλληλεπίδραση αποτελέσματα των γενετικών παραλλαγών κατά την πρόβλεψη κλινική έκβαση των ασθενών με NSCLC.

NSCLC οι ασθενείς συνήθως αντιμετωπίζονται με χημειοθεραπεία με βάση την πλατίνα, συχνά σε συνδυασμό με ακτινοθεραπεία. Η χημειοθεραπεία με βάση την πλατίνα μπορεί να σχετίζεται με αρκετές κυτταρικές οδούς, όπως η βλάβη του DNA /επισκευής, έλεγχο του κυτταρικού κύκλου, και τις οδούς απόπτωσης [41]. Ωστόσο, δεν έχει υπάρξει καμία μελέτη αναφέρει ότι RGS εμπλέκεται στις οδούς που σχετίζονται με χημειοθεραπεία με βάση την πλατίνα.

κύτταρα NSCLC μπορεί να εισβάλει γειτονικούς ιστούς και μεταστάσεις σε μη γειτονικά όργανα και ιστούς, διεργασίες που μπορεί να αποδοθεί σε μεταβολή της κυτταρικής σηματοδότησης μονοπάτια [42], [43]. Ογκογόνο μετασχηματισμό είναι συχνά το άμεσο αποτέλεσμα των μεταλλάξεων των μορίων σηματοδότησης, οι οποίες συνιστούν αυτές τις οδούς. Σε αυτή τη μελέτη, 5 SNPs συνδέθηκαν με το συνολικό κίνδυνο θανάτου με εκκίνησης

P

τιμές & lt? 0,05, τουλάχιστον 90 φορές από 100 φορές. Τρία από αυτά τα 5 SNPs, rs6678136 (

RGS4

), rs3820487 (

RGS5

) και rs2749786 (

RGS12

) παρέχει σημαντικά διαφορετική MST στην καμπύλη Kaplan-Meier (Πίνακας 4 ). Προηγούμενες μελέτες ανέφεραν ότι

RGS4

γονιδιακής έκφρασης συνδέθηκαν με εισβολή αρκετών καρκίνο [36], [44]. Επιπλέον, RGS4 πρωτεΐνη δρα ως αναστολέας των επιθηλιακών και ενδοθηλιακών κυττάρων tubulogenesis ρυθμίζοντας ενεργοποιείται από μιτογόνο κινασών πρωτεΐνης και των αγγειακών σηματοδότηση ενδοθηλιακού αυξητικού παράγοντα, αναστέλλοντας έτσι τον πολλαπλασιασμό των κυττάρων, μετανάστευση και εισβολή [45]. Xiao

et a.l

ανέφερε ότι πολλαπλές SNPs σε συνδυασμό με

RGS5

μπορεί να αναθέσει κίνδυνο για υπέρταση στην κινεζική πληθυσμού [46].

RGS5

αναφέρθηκε για να είναι ένα βασικό ρυθμιστή της ωρίμανσης περικύτταρο όγκου και διαδραματίζουν καίριο ρόλο στην νεοαγγείωση όγκου [9].

RGS5

knockout ποντίκια έδειξαν μεγαλύτερο φορτίο όγκου και νωρίτερα θανάτου που μπορεί να προκληθεί από την ωρίμανση περικύτταρο και αγγειακή εξομάλυνση [33]. RGS5 έχει επίσης αναγνωριστεί ως ένα μεγάλο βαθμό εκφράζονται αντιγόνο όγκου σε πολλούς τύπους καρκίνου [47]. RGS12 είναι μια μεγάλη πρωτεΐνη RGS με πολλαπλές λειτουργικές περιοχές όπως ΡΟΖ, ΡΤΒ (δέσμευση φωσφο-τυροσίνη) και Rap περιοχές δέσμευσης [48]. περιοχή PDZ της RGS12 αλληλεπιδρά με ένα GPCR, CXCR2, και κατά συνέπεια, συμβάλλει στη δράση GAP της RGS12 σε CXCR2 μεσολάβηση σήματα G-πρωτεΐνη [49]. Ως εκ τούτου, είναι βιολογικά εύλογο ότι RGS4, RGS5, και RGS12 σχετίζονται με την επιβίωση καρκίνου του πνεύμονα. Οι λειτουργίες των σημαντικών SNPs σε αυτά τα γονίδια δεν είναι σαφείς, δεδομένου ότι είναι πιο πιθανό tagging SNPs. Οι μελλοντικές μελέτες για να βρείτε τις αιτιώδεις SNPs.

Σε στρωματοποιημένη αναλύσεις, 5 SNPs στην ομάδα χημειοθεραπεία και ένα άλλο 5 στην ομάδα chemoradiation συσχετίστηκαν με τον κίνδυνο του θανάτου με εκκίνησης

P

τιμές & lt? 0,05 τουλάχιστον 70 φορές από 100 φορές. Οι γονότυποι των τεσσάρων SNP: rs2816312 (

RGS1

), rs944343 (

RGS3

), rs1051013 (

RGS3

), και rs1122794 (

RGS11

) βρέθηκαν να σχετίζονται σημαντικά με MST στην ομάδα χημειοθεραπεία. Η πιο σημαντική ήταν rs944343 (Log-rank

P

= 0,0009), το οποίο ήταν ένα SNP ετικετών που βρίσκεται στο 3 ‘πλευρική περιοχή του

RGS3

. Αυξημένη έκφραση RGS3 έχει χρησιμοποιηθεί ως διαγνωστικός δείκτης για το σάρκωμα μαλακών ιστών και συνδέθηκε με την αντίσταση στη χημειοθεραπεία στον καρκίνο του μαστού [50], [51]. Επιπλέον, RGS3 έχει αναφερθεί ότι διαμορφώνουν την κινητικότητα κυττάρων γλοιώματος [36]. Τα άλλα γονίδια του ξενιστή SNPs στην ομάδα χημειοθεραπεία,

RGS1

, και

RGS11

, έχουν επίσης συσχετιστεί με την αιτιολογία και την πρόγνωση του καρκίνου. Rangel

et al

. ανέφεραν ότι RGS1 μπορεί να είναι ένα προγνωστικό δείκτη σε εξέλιξη μελανώματος και η έκφρασή της σχετίζεται με την επιβίωση των ασθενών με μελάνωμα [20]. Martinez-Cardus,

et al

. ανέφεραν ότι η έκφραση RGS11 συσχετίστηκε σημαντικά με την αντίσταση στη θεραπεία με πλατίνα σε καρκίνο του παχέος εντέρου [52]. Αυτές οι μελέτες υποστηρίζουν το ρόλο του RGS1, RGS3, και RGS11 στην πρόγνωση του καρκίνου του πνεύμονα. Υπήρχαν μόνο δύο SNPs σε chemoradiation ομάδα, rs6429264 και rs6689169, σχετίζεται σημαντικά με το MST (log-rank

P

= 0,0055 και 0,0441, αντίστοιχα). δύο εκ των οποίων οι ετικέτες SNP και βρίσκεται στο

RGS7

. Αρκετές μελέτες απέδειξαν ότι η παράγοντα νέκρωσης όγκων-α, μια σημαντική κυτοκίνη φλεγμονή που παίζει σημαντικό ρόλο σε πολλούς ανθρώπινους καρκίνους, μπορεί γρήγορα να ενεργοποιήσει το επίπεδο έκφρασης της RGS7 [53], [54]. Οι μηχανισμοί με τους οποίους αυτές οι γονότυπους καθορίζουν φαινοτύπους τους και να επηρεάσουν την έκβαση του NSCLC δεν είναι σαφείς. Περαιτέρω μελέτες δικαιολογείται να εντοπίσει τις παραλλαγές συνάφεια και τις βιολογικές τους μηχανισμούς που διέπουν παρατηρείται ενώσεις μας.

Παρατηρήσαμε επίσης οι σωρευτικές επιπτώσεις των RGS SNPs για την επιβίωση των ασθενών με NSCLC προχωρημένου σταδίου. Επιπλέον, χρησιμοποιήσαμε την ανάλυση δέντρο επιβίωσης για τον εντοπισμό αλληλεπιδράσεων μεταξύ αυτών των SNPs. Αυτές οι αλληλεπιδράσεις γονιδίων-γονιδίου οδήγησε σε τέσσερις τερματικούς κόμβους με διαφορετικούς κινδύνους θανάτου στην χημειοθεραπεία μόνο ομάδα και δύο τερματικούς κόμβους με διαφορετικούς κινδύνους θανάτου η ομάδα chemoradiation. Η ανάλυση δέντρο σωρευτικές επιπτώσεις ανάλυση και η επιβίωση μπορεί να μας επιτρέψει να εντοπίσει πιο ισχυρό προγνωστικό ή προγνωστική δείκτες και τις υπογραφές που βασίζονται στο συνδυασμό γενετικών παραλλαγών του κάθε ασθενούς. Θα πρέπει να σημειωθεί ότι αυτοί οι τύποι των αναλύσεων ήταν διερευνητική, και τα αποτελέσματα θα πρέπει να επικυρωθούν σε ανεξάρτητες μελέτες.

Υπάρχουν μερικές δυνάμεις για τη μελέτη μας. Κατ ‘αρχάς, η σημερινή οδός προσέγγιση μας είναι μια λογική επέκταση της προσέγγισης γονιδίου υποψήφιο και αποφεύγει την απαίτηση του πολύ μεγαλύτερου μεγέθους του δείγματος από τη μελέτη σύνδεσης του γονιδιώματος-ευρεία. Δεύτερον, έχουμε συγκεντρώσει μια σχετική μεγάλο μέρος του πληθυσμού των ασθενών με NSCLC από το ίδιο ίδρυμα. Οι ενιαίες τυποποιημένες διαδικασίες λειτουργίας για τον εντοπισμό του καρκίνου, παθολογικές στάσης, ακόμη και αποφασιστικότητα στρατηγική για τη θεραπεία του καρκίνου έκανε πορίσματά μας πιο ολοκληρωμένη και ισχύει για μελλοντικές κλινικές μελέτες. Τρίτον, έχουμε εκτελούνται εσωτερικές στατιστική επικύρωση από ένα bootstrap διαδικασία αναδειγματοληψία στην ελαχιστοποίηση των λανθασμένων ανακαλύψεις. Τέταρτον, έχουμε πραγματοποιήσει διερευνητική ανάλυση της αλληλεπίδρασης γονιδίων-γονίδιο να καθιερώσει ένα νέο συνδυασμό SNPs να προβλέψει την έκβαση των ασθενών με NSCLC για τη θεραπεία τους, η οποία θα μπορούσε να βοηθήσει τους κλινικούς ιατρούς για τον προσδιορισμό της βέλτιστης εξατομικευμένης θεραπείας και την ποιότητα της φροντίδας για την επιβίωση.

για το καλύτερο της γνώσης μας, αυτή είναι η πρώτη μελέτη που διερεύνησε τη συσχέτιση των γενετικών παραλλαγών στην οικογένειά RGS με την επιβίωση για NSCLC. αποτελέσματα μας δίνουν όχι μόνο την ανάλυση SNP-based, αλλά και μια πιο ολοκληρωμένη πορεία προσέγγισης στην πρόβλεψη κλινική έκβαση για ασθενείς με NSCLC που υποβλήθηκαν σε χημειοθεραπεία ή chemoradiation. Μελλοντικές ανεξάρτητη επικύρωση σε μεγαλύτερο πληθυσμό και λεπτομερείς λειτουργικές δοκιμασίες είναι απαραίτητες πριν από τα ευρήματα αυτά μπορεί να μεταφραστεί στις κλινικές.

Μέθοδοι

Δήλωση Ηθικής

Όλοι οι ασθενείς που υπέγραψε γραπτή συγκατάθεση και η μελέτη αυτή έχει ελεγχθεί και εγκριθεί από το Διοικητικό συμβούλιο Institutional Review (IRB) του MD Anderson.

πληθυσμού μελέτη και συλλογή επιδημιολογικών και κλινικών δεδομένων

Ένα σύνολο 598 ασθενών με τελικού σταδίου NSCLC, συμπεριλαμβανομένων των σταδίων IIIA, IIIB (Dry), ΙΙΙΒ (Wet), και IV, προσλαμβάνονται μεταξύ του 1995 και του 2007 από μια επιδημιολογική μελέτη για τον καρκίνο του πνεύμονα που διεξήχθη στο Πανεπιστήμιο του Τέξας MD Anderson Κέντρο καρκίνου. Κανένας από αυτούς δεν είχαν λάβει προηγούμενη θεραπεία με χειρουργική επέμβαση χημειοθεραπεία ή /και ακτινοθεραπεία πριν από την εγγραφή στη μελέτη. Όλοι οι συμμετέχοντες είχαν συμπληρώσει ένα ερωτηματολόγιο παράγοντα κινδύνου που συνέλεξε στοιχεία για τα δημογραφικά χαρακτηριστικά, το ιστορικό της χρήσης του καπνού, επαγγελματική και περιβαλλοντική έκθεση, πριν από το ιατρικό ιστορικό, καθώς και κάθε ιστορικό καρκίνου σε συγγενείς πρώτου βαθμού, και επίσης είχε δωρίσει ένα δείγμα 40 ml αίματος για του γονότυπου. Εξάγαμε τις κλινικές πληροφορίες από τα ιατρικά αρχεία των ασθενών του συνοδές παθολογικές καταστάσεις τους, το μέγεθος του όγκου, το κλινικό στάδιο, παθολογική στάδιο, ιστολογικό τύπο, το βαθμό του όγκου, το είδος της θεραπείας, η επανεμφάνιση του όγκου, την επιβίωση και την εξέλιξη του όγκου για όλες τις αναλύσεις. Ο μέσος χρόνος παρακολούθησης ήταν 11,8 μήνες.

επιλογή SNP και του γονότυπου

Μια πλήρης πίνακας των γονιδίων που σχετίζονται με τον καρκίνο, συμπεριλαμβανομένων της οικογένειας γονιδίων RGS εντοπίστηκε και κατατάσσονται σε κάθε συγκεκριμένη οδό, σύμφωνα με μείζονα τους αναφερθεί λειτουργίες. Στη λίστα γονίδιο, δεκαεπτά γονίδια στην οικογένεια RGS (

RGS 1-5

,

7-14

,

16

,

18

,

20

, και

22

) επιλέχθηκαν για αυτόν τον πίνακα. Η λεπτομερής διαδικασία για την κατάρτιση του πίνακα των γονιδίων και των SNPs έχουν αναφερθεί στο παρελθόν [55]. Γενωμικό DNA εκχυλίστηκε από τα λεμφοκύτταρα περιφερικού αίματος των δειγμάτων αίματος των ασθενών, καθώς και όλες οι εργασίες προσδιορισμού γονοτύπου διεξήχθησαν σύμφωνα με το πρότυπο πρωτόκολλο που παρέχεται από Illumina Inc. τότε τα αποτελέσματα του προσδιορισμού του γονότυπου παρήχθησαν αυτόματα από το λογισμικό του BeadStudio Illumina του. Τέλος, επιλέχθηκαν 95 SNPs στην οδό RGS και με επιτυχία ο γονότυπος σε αυτούς τους ασθενείς, όπως φαίνεται στον Πίνακα S1 στη συμπληρωματική πληροφορία.

Η στατιστική ανάλυση

STATA στατιστικού λογισμικού (StataCorp LP, College Station , TX) έκδοση 10.2 χρησιμοποιήθηκε για την ανάλυση των λόγων κινδύνου (HR),

P

τιμές, μέσος χρόνος επιβίωσης (MST),

αξίες P

για δοκιμασία log-rank και Kaplan-Meier εκτίμηση επιβίωσης. χ

2 τεστ (για τις κατηγορικές μεταβλητές) και Φοιτητών

t-test

(για τις συνεχείς μεταβλητές) χρησιμοποιήθηκαν για την αξιολόγηση των διαφορών στις μεταβλητές μεταξύ των νεκρών και των ζωντανών τους ασθενείς. Για κάθε SNP, ο κίνδυνος θανάτου ως αναλογία κινδύνου (HR) και το 95% διάστημα εμπιστοσύνης (CI) εκτιμήθηκαν με το μοντέλο παλινδρόμησης αναλογικού κινδύνου του Cox. Επιπλέον, πολυπαραγοντική προσαρμογή χρησιμοποιήθηκε για τον έλεγχο για πιθανούς συγχυτικούς παράγοντες (ηλικία, φύλο, εθνικότητα, το κάπνισμα και τα πακέτα-έτη, την κατάσταση απόδοσης, κλινικό στάδιο, και θεραπεία). Για κάθε SNP, η γενετική κατανομή αξιολογήθηκαν από τρεις γενετικά μοντέλα (κυρίαρχη, υπολειπόμενο, και πρόσθετα), και το μοντέλο με το μικρότερο

P

αξία επιλέχθηκε ως μοντέλο καλύτερη εφαρμοστό [56]. Για την επικύρωση των αποτελεσμάτων, χρησιμοποιήθηκε η μέθοδος bootstap αναδειγματοληψία. Για κάθε bootstrap δείγμα προέρχεται από το αρχικό σύνολο δεδομένων, 100 δείγματα bootstrap παρήχθησαν. Έχουμε λάβει το

P

τιμή για κάθε SNP μεταξύ των κυρίαρχων, υπολειπόμενο, και πρόσθετο μοντέλα. Οι σωρευτικές επιπτώσεις των διαφορετικών γονότυπων ήταν υπολογίζονται αθροίζοντας τα επιμέρους αποτελέσματα των σημαντικών SNPs, δηλαδή, SNPs που έδειξε σημαντική συσχέτιση στο single-SNP ανάλυση και είχε επίσης μια εκκίνησης

P

αξία & lt? 0,05, τουλάχιστον 70 φορές. Χρησιμοποιήσαμε Cox μοντέλο παλινδρόμησης αναλογικών κινδύνων για την εκτίμηση των ωρών και 95% ΠΙ. Η μέθοδος Kaplan-Meier και τη δοκιμασία log-rank χρησιμοποιήθηκαν για την εκτίμηση των επιπτώσεών τους στη διάρκεια επιβίωσης για αυτά τα SNPs. Τέλος, το πρόγραμμα STREE (https://masal.med.yale.edu/stree/) χρησιμοποιήθηκε για να εκτελέσει την ανάλυση δέντρο επιβίωσης για τις αλληλεπιδράσεις γονιδίου-γονιδίου υψηλότερης τάξης του SNPs. Για τις αναλύσεις αυτές, θα περιλαμβάνονται μόνο SNPs που είχε επικυρωθεί εσωτερικά από bootstrapping. Ένα δύο όψεων

P

& lt? 0,05 θεωρήθηκε στατιστικά σημαντική

Υποστήριξη Πληροφορίες

Πίνακα S1..

ΣΔ στην οδό RGS.

doi: 10.1371 /journal.pone.0021120.s001

(DOC)