PLoS One: Έλλειψη Συλλόγου miR-146a rs2910164 Πολυμορφισμός με γαστρεντερικού Καρκίνοι: Στοιχεία από 10206 Subjects


Αφηρημένο

Ιστορικό

Πρόσφατες μελέτες σχετικά με τη σύνδεση μεταξύ του miR-146a rs2910164 πολυμορφισμό και τον κίνδυνο του γαστρεντερικού (GI) καρκίνων έδειξαν αμφίβολα αποτελέσματα. Κατά συνέπεια, πραγματοποιήσαμε μια περιεκτική βιβλιογραφική έρευνα και μια μετα-ανάλυση για να διευκρινίσει τη σχέση

Μεθοδολογία /Κύρια Ευρήματα

Τα στοιχεία συλλέχθηκαν από τις ακόλουθες ηλεκτρονικές βάσεις δεδομένων:. Pubmed, Excerpta Medica Database (Embase ), και την κινεζική Βιοϊατρικής Λογοτεχνία Database (ΜΟΕ), με την τελευταία έκθεση μέχρι 24 Φεβρουαρίου 2012. Η αναλογία πιθανοτήτων (OR) και το διάστημα εμπιστοσύνης 95% της (95% CI) χρησιμοποιήθηκαν για την αξιολόγηση της αντοχής του συνεταιρίζεσθαι. Τελικά, συνολικά 12 μελέτες (4.817 περιπτώσεις και 5.389 έλεγχοι) βρέθηκαν να είναι επιλέξιμες για μετα-ανάλυση. Έχουμε συνόψισε τα στοιχεία σχετικά με τη σύνδεση μεταξύ του miR-146a rs2910164 πολυμορφισμό και τον κίνδυνο καρκίνου GI στο συνολικό πληθυσμό, και εκτελούνται αναλύσεις υποομάδων από την εθνικότητα, τύπους καρκίνου, και την ποιότητα των σπουδών. Στη συνολική ανάλυση, δεν υπήρχε καμία απόδειξη συσχέτισης miR-146a rs2910164 πολυμορφισμό και τον κίνδυνο του καρκίνου GI (G έναντι Γ: OR = 1.07, 95% CI 0,98-1,16,

P

= 0,14? GG + GC έναντι CC: OR = 1.14, 95% CI 1,00 έως 1,31,

P

= 0,05? GG έναντι GC + CC: OR = 1.06, 95% CI 0,91 έως 1,23,

P

= 0,47? GG έναντι CC: OR = 1.17, 95% CI 0,95 έως 1,44,

P

= 0,13? GC έναντι CC: OR = 1.14, 95% CI 1,00 έως 1,31,

P

= 0.05). Παρόμοια αποτελέσματα βρέθηκαν σε αναλύσεις των υποομάδων ανά εθνικότητα, τύπους καρκίνου, και την ποιότητα των σπουδών.

Συμπεράσματα /Σημασία

Αυτή η μετα-ανάλυση δείχνει ότι το miR-146a rs2910164 πολυμορφισμός δεν σχετίζεται με ΓΕ καρκίνους ευαισθησία. Πιο καλά σχεδιασμένες μελέτες που βασίζονται σε μεγαλύτερα μεγέθη δειγμάτων και ασθενείς με καρκίνο του ομογενή χρειάζονται

Παράθεση:. Wang F, G Sun, Ζου Υ, Fan L, Τραγούδι Β (2012) Έλλειψη Συλλόγου rs2910164 miR-146a πολυμορφισμό με γαστρεντερικού καρκίνοι: Στοιχεία από 10206 Θέματα. PLoS ONE 7 (6): e39623. doi: 10.1371 /journal.pone.0039623

Επιμέλεια: David L. Boone, University of Chicago, Ηνωμένες Πολιτείες της Αμερικής

Ελήφθη: 19 Μαρτίου 2012? Αποδεκτές: 23η Μαΐου του 2012? Δημοσιεύθηκε: 27 του Ιούν 2012

Copyright: © 2012 Wang et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Αυτό το έργο υποστηρίχθηκε από επιχορηγήσεις από το Εθνικό Ίδρυμα Φυσικών Επιστημών της Κίνας. Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

τα microRNAs (miRNAs) είναι μικρά, μη-κωδικοποίησης, ενδογενή RNA που αντιπροσωπεύουν ένα σημαντικό μηχανισμό μετα μεταγραφικής γονιδιακής ρύθμισης [1]. Έχει αποδειχθεί ότι miRNAs έχουν μια κρίσιμη λειτουργία στο να επηρεάζουν τις διαδικασίες τόσο ποικίλες όσο κυτταρική διαφοροποίηση, τον πολλαπλασιασμό, το μεταβολισμό, την απόπτωση, και ογκογένεση [2]. Αρκετές αναλύσεις έκφραση miRNA σε ανθρώπινα επιθηλιακά κακοήθειες έχουν δείξει ότι η διακριτή όγκου ειδικών υπογραφές miRNA μπορεί να διακρίνει διαφορετικούς τύπους καρκίνου και ταξινομούν υπο-τύπους τους [3]. Μερικά από τα βασικά απορρύθμισης του miRNAs έχουν τη δυνητική αξία να είναι μοριακών βιολογικών δεικτών, η οποία μπορεί να βελτιώσει τη διάγνωση, την πρόγνωση και την παρακολούθηση της ανταπόκρισης στη θεραπεία για καρκίνους του ανθρώπου [4] – [6]. Ορισμένες miRNAs μπορεί να λειτουργούν ως ογκογονίδια ή καταστολείς όγκων [7] – [8].

Οι πρωτογενείς μεταγραφές miRNA διασπάται με ριβονουκλεάση (RNase) III Drosha στον πυρήνα του κυττάρου σε 70-νουκλεοτιδίου προς πρόδρομο 80 νουκλεοτιδίων miRNA ( προ-miRNA) φουρκέτες και μεταφέρονται στο κυτταρόπλασμα. Στη συνέχεια, οι προ-miRNAs επεξεργασία από RNase III Dicer σε miRNA: miRNA δίπολα. Ένα σκέλος αυτών των διπόλων είναι γενικά υποβαθμίζεται, ενώ το άλλο χρησιμοποιείται ως ώριμο miRNA. Ώριμη miRNAs μπορούν αναγνωρίζουν και δεσμεύονται στην 3′-αμετάφραστη περιοχή (UTR) των mRNA στόχου και να παρεμβαίνει με τη μετάφρασή τους [9]. Υποτέθηκε ότι πολυμορφισμοί ενός νουκλεοτιδίου (SNPs) εντός της αλληλουχίας miRNA ή στόχο miRNA θα μπορούσε είτε να αποδυναμώσει ή να ενισχύσει τη σύνδεση μεταξύ miRNA και στόχου [10].

Στο ανθρώπινο γονιδίωμα, miR-146a βρίσκεται στο χρωμόσωμα 5q33. Πολλές πρόσφατες μελέτες έχουν δείξει ότι η έκφραση miR-146a είναι απορυθμισμένη σε πολλούς στερεούς όγκους [11] – [14]. Κατέστη προφανές ότι miR-146a μπορεί να δρα ως καταστολέας όγκου. Μέχρι στιγμής, ο πιθανός μηχανισμός μέσω του οποίου ένας προς τα κάτω ρύθμιση miR-146a μπορεί να συμβάλει στην ανάπτυξη των όγκων παραμένει ασαφής. Ωστόσο, φαίνεται σχετίζεται με την ικανότητα αυτού του miRNA να στοχεύσει ορισμένα mRNAs [15]. A G & gt? Πολυμορφισμού C έχει εντοπιστεί στο γονίδιο miR-146a, και ο αριθμός αναφοράς της παρούσας SNP στη βάση δεδομένων του Εθνικού Κέντρου για πληροφορίες Βιοτεχνολογίας (NCBI) είναι rs2910164 [16] πολυμορφισμός .Αυτό υπάρχει στην αντίθετη στέλεχος περιοχής να η ακολουθία ώριμη miR-146a, η οποία οδηγεί σε μια αλλαγή από G: U ζευγάρι στο C: U αναντιστοιχία στη δομή στελέχους των πρόδρομων miR-146a [16] .A πρόσφατη μελέτη παρείχε ενδείξεις ότι η ύπαρξη μιας κοινής πολυμορφισμού G /C εντός της ακολουθίας προ-miR-146a μειωμένη παραγωγή miR-146a [17]. Αυτό μπορεί να οδηγήσει σε μειωμένη προς τα κάτω ρύθμιση των αντίστοιχων γονιδίων στόχων. Αρκετές μελέτες έχουν αναφέρει ότι αυτός ο πολυμορφισμός μπορεί να συμβάλει στην ογκογένεση πολλών μορφών καρκίνου, ειδικά εκείνα που ανήκουν στην γαστρεντερική (GI) οδού, όπως γαστρικό καρκίνο και ηπατοκυτταρικό καρκίνωμα [18] – [19].

Οι καρκίνοι GI μοιράζονται μια σειρά από χαρακτηριστικά που υποδηλώνουν κοινή αιτιολογικός οδούς ή μηχανισμούς. Έτσι, ο προσδιορισμός των πιθανών παραγόντων κινδύνου και καρκινογόνο μηχανισμών είναι απαραίτητη για την πρόληψη αυτών των καρκίνων. Συσσωρευμένα στοιχεία που αποκάλυψε το σημαντικό ρόλο της φλεγμονώδους δικτύου για την προώθηση του καρκίνου του γαστρεντερικού ανάπτυξης [20]. Η τακτική χρήση του μη-στεροειδή αντι-φλεγμονώδη φάρμακα (NSAIDs) μπορεί να μειώσει το ποσοστό θνησιμότητας από καρκίνους στον γαστρεντερικό σωλήνα [21]. Οι περιβαλλοντικές, διατροφικές και ενδογενείς παράγοντες κινδύνου πιστεύεται ότι ασκούν σημαντικές επιδράσεις στην ατομική προδιάθεση [10]. Από το 2008 έως το 2012, οι ερευνητές έχουν διαδοχικά αναφερθεί συσχετίσεις μεταξύ miR-146a rs2910164 πολυμορφισμό και τον κίνδυνο καρκίνου GI, αλλά με μικτά ή ακόμα και αλληλοσυγκρουόμενα αποτελέσματα [22] – [33]. Ως εκ τούτου, έχουμε ως στόχο να διεξάγει μια μετα-ανάλυση για να ρίξει περισσότερο φως στο ρόλο του miR-146a rs2910164 πολυμορφισμός στην ευαισθησία σε καρκίνους GI.

Υλικά και Μέθοδοι

Αναγνώριση Επιλέξιμες Μελέτες

Πραγματοποιήσαμε μια συστηματική αναζήτηση χρησιμοποιώντας Pubmed, Excerpta Medica Database (Embase) και την κινεζική Βιοϊατρικής Λογοτεχνία Database (CBM) με την τελευταία έρευνα ενημερώθηκε στις 24 Φεβρουαρίου, χρησιμοποιήθηκαν το 2012. Οι ακόλουθοι όροι αναζήτησης: «microRNA Ή mir Ή miRNA »,« καρκίνος ή καρκίνωμα ή αδενοκαρκίνωμα Ή νεοπλάσματος ή όγκου ή όγκων «,» γονίδιο ή πολυμορφισμός Ή αλληλόμορφο ή τροποποίηση «και» 146a OR rs2910164 «. Ψάχνοντας έγινε χωρίς περιορισμό στην γλώσσα ή δημοσίευση χρόνια. Αξιολογήσαμε όλες τις σχετικές δημοσιεύσεις για να ανακτήσετε το πιο επιλέξιμες λογοτεχνία. λίστες αναφοράς τους αναζητήθηκαν με το χέρι για να εντοπίσει πρόσθετες επιλέξιμες μελέτες

ένταξης και αποκλεισμού Κριτήρια

Τα ακόλουθα κριτήρια ένταξης χρησιμοποιήθηκαν για την επιλογή βιβλιογραφίας για περαιτέρω μετα-ανάλυση:. (1) αξιολόγηση των ΜΙΚ 146α rs2910164 πολυμορφισμός και GI καρκίνων? (2) ανεξάρτητες μελέτες ασθενών-μαρτύρων για τον άνθρωπο? (3) περιγράφει χρήσιμες συχνότητες γονοτύπου? (4) μόνο περιλήφθηκαν χειρόγραφα πλήρους κειμένου. Τα κριτήρια αποκλεισμού περιλάμβαναν: (1) η επανάληψη των προηγούμενων εκδόσεων? (2) αφηρημένα, σχόλια, κριτική και συντακτική? (3) που βασίζονται στην οικογένεια μελέτες γενεαλογία με αρκετές επηρεάζονται περιπτώσεις ανά οικογένεια. Όταν μια μελέτη που ανέφερε τα αποτελέσματα σε διαφορετικές εθνότητες, τους αντιμετωπίζονται ως ξεχωριστές μελέτες. Όταν υπήρχαν πολλαπλές δημοσιεύσεις από τον ίδιο πληθυσμό, συμπεριλήφθηκε μόνο η μεγαλύτερη μελέτη.

Data Extraction

Δύο ερευνητές εξάγεται ανεξάρτητα τα στοιχεία σύμφωνα με τα κριτήρια ένταξης που αναφέρονται παραπάνω. Αποκλίσεις αυτές εκδικάζονται από το ένα τρίτο ερευνητή μέχρι να επιτευχθεί συναίνεση για κάθε αντικείμενο. Οι ακόλουθες πληροφορίες προέρχονται από κάθε επιλέξιμη μελέτη χρησιμοποιώντας ένα τυποποιημένο πρωτόκολλο συλλογής δεδομένων (η λίστα ελέγχου PRISMA, Πίνακας S1): το όνομα του πρώτου συγγραφέα, έτος έκδοσης, πηγή της δημοσίευσης, την εθνικότητα, τύπους καρκίνου, τον ορισμό και τους αριθμούς των υποθέσεων και των ελέγχων, και αλληλόμορφο καθώς και τις συχνότητες γονοτύπου για τις περιπτώσεις και τους ελέγχους. Εάν τα δεδομένα συχνότητας αρχικό γονότυπο ήταν διαθέσιμο σε σχετικά άρθρα, μια αίτηση για πρόσθετα στοιχεία στάλθηκε στον αντίστοιχο συγγραφέα.

Βαθμολογία ποιότητας Αξιολόγησης

Η ποιότητα των μελετών ανεξάρτητα αξιολογείται από δύο ερευνητές σύμφωνα σε ένα σύνολο προκαθορισμένων κριτηρίων που εκχυλίζεται και να τροποποιηθούν από τις προηγούμενες μελέτες [34] – [35] (Πίνακας 1). Αυτά τα αποτελέσματα βασίστηκαν σε παραδοσιακές επιδημιολογικές εκτιμήσεις, καθώς και θέματα γενετικής του καρκίνου. Οποιαδήποτε διαφωνία επιλύθηκε από συζήτηση μεταξύ των δύο ερευνητές. Οι βαθμοί κυμαίνονται από το χαμηλότερο μηδέν έως τις υψηλότερες 18. Τα άρθρα σκοράροντας & lt?. 12 είχαν ταξινομηθεί ως «χαμηλής ποιότητας», και αυτά ≥12 ως «υψηλής ποιότητας»

Η

Μέθοδοι μετα-ανάλυση

Χρησιμοποιήσαμε τη λίστα ελέγχου PRISMA ως πρωτόκολλο της μετα-ανάλυσης και ακολούθησε την κατευθυντήρια γραμμή (Πίνακας S1) [36]. Εμείς αξιολογούνται πρώτα Hardy-Weinberg ισορροπίας για κάθε μελέτη χρησιμοποιώντας Chi-square test στις ομάδες ελέγχου. Η αναλογία πιθανοτήτων (OR) και το διάστημα εμπιστοσύνης 95% της (95% CI) χρησιμοποιήθηκαν για την εκτίμηση της αντοχής της σύνδεσης μεταξύ των miR-146a rs2910164 πολυμορφισμό και τον κίνδυνο καρκίνου GI βασίζεται σε συχνότητες γονοτύπου στις περιπτώσεις και τους ελέγχους. Τα συγκεντρωτικά ΕΑΠ πραγματοποιήθηκαν για σύγκριση αλληλομόρφων (G έναντι C), κυρίαρχο μοντέλο (ΦΕΚ + GC έναντι CC), υπολειπόμενο μοντέλο (ΦΕΚ έναντι GC + CC), η σύγκριση ομοζυγώτες (ΦΕΚ έναντι CC) και σύγκριση ετεροζυγώτες (GC έναντι CC), αντίστοιχα. Η σημασία του ομαδοποιημένου Ή καθορίστηκε από το

Z

-τεστ. Στρωματοποιημένη αναλύσεις διεξήχθησαν από την εθνικότητα, τύπους καρκίνου και την ποιότητα των σπουδών. Μια Chi-square test με βάση Q-στατιστική διεξήχθη για να εκτιμηθεί η μεταξύ μελετών ετερογένεια [37]. Εάν η ετερογένεια δεν ήταν σημαντική, το μοντέλο σταθερό αποτέλεσμα (χρησιμοποιώντας τη μέθοδο Mantel-Haenszel) χρησιμοποιήθηκε για να εκτιμηθεί η περίληψη ή και 95% CI? Αλλιώς, το μοντέλο τυχαία επίδραση (χρησιμοποιώντας τη μέθοδο Dersimonian και Laird) χρησιμοποιήθηκε [38] – [39]. Μετρήσαμε επίσης την επίδραση της ετερογένειας από άλλο μέτρο,

2

= 100% × (Q-DF) /Q [40].

Αξιολόγηση των Δημοσίευση Bias

πιθανή προκατάληψη δημοσίευση εκτιμήθηκε με τη χρήση της δοκιμής γραμμικής παλινδρόμησης Egger του (

P

& lt? 0,05 θεωρήθηκε σημαντική) με οπτική επιθεώρηση του οικοπέδου χοάνη [41]. Οι αναλύσεις πραγματοποιήθηκαν με τη χρήση του Διαχειριστή κριτική λογισμικού 4.2 (Cochrane Collaboration, https://www.cc-ims.net/RevMan/relnotes.htm/) και Stata έκδοση 10 (StataCorp LP, College Station, Texas, USA). Τα συγκεντρωτικά ΕΑΠ έγιναν για αλληλομόρφων σύγκρισης, κυρίαρχο μοντέλο, υπολειπόμενο μοντέλο, σύγκριση ομοζυγώτες και σύγκριση ετερόζυγο, αντίστοιχα. Έτσι, η μέθοδος Bonferroni χρησιμοποιήθηκε για να ρυθμίσετε το επίπεδο άλφα σημασία για τη διόρθωση για το πρόβλημα των πολλαπλών συγκρίσεων. Συγκεκριμένα, το σύνηθες επίπεδο σημαντικότητας (α = 0,05) διαιρέθηκε με 5 στον λογαριασμό για πέντε συγκρίσεις. Έτσι, ένα

P

τιμή μικρότερη από 0,01 θεωρήθηκε στατιστικά σημαντική στη μελέτη, και όλα τα

P

τιμές ήταν δύο όψεων.

Αποτελέσματα

χαρακτηριστικά Επιλέξιμων Σπουδών (Πίνακας 2)

Βασικά χαρακτηριστικά του περιλαμβάνονται δημοσιεύσεις ερευνά τη σύνδεση του miR-146a rs2910164 πολυμορφισμού με καρκίνους GI παρουσιάζονται στον πίνακα 2. Υπήρχαν 308 άρθρα που σχετίζονται με τις λέξεις αναζήτησης (Pubmed: 98? Embase: 199? CBM: 11). Το διάγραμμα ροής στο σχήμα 1 συνοψίζει αυτήν την διαδικασία ανασκόπηση της βιβλιογραφίας. Στην παρούσα μελέτη, συνολικά 12 επιλέξιμες μελέτες (4.817 περιπτώσεις και 5.389 έλεγχοι) πληρούσαν τα κριτήρια ένταξης [22] – [33].

Η

Μεταξύ των 12 εκδόσεων, πέντε μελέτες επικεντρώθηκαν σχετικά με τον καρκίνο του ήπατος [22], [24] – [26], [32], τρεις μελέτες για καρκίνο του στομάχου [27], [28], [30], δύο μελέτες για τον καρκίνο του οισοφάγου [29], [33], ένα μελέτη για καρκίνο του παχέος εντέρου [23], καθώς και μια μελέτη για τον καρκίνο της χοληδόχου κύστης [31], αντίστοιχα. Από όλες τις μελέτες, δέκα μελέτες διεξήχθησαν σε ασιατικές πληθυσμούς [22] – [24], [26] – [32], και δύο σε Καυκάσιους πληθυσμούς [25], [33]. Τα αποτελέσματα δοκιμής ισορροπία Hardy-Weinberg για την κατανομή του γονότυπου σε πληθυσμό ελέγχου φαίνονται στον Πίνακα 2. Οι κατανομές συχνότητας γονότυπου των ελέγχων σε 10 από 12 μελέτες ήταν σε συμφωνία με HWE. Εμείς δεν θα μπορούσε να εκτελέσει τη δοκιμή ισορροπία Hardy-Weinberg για μια μελέτη, επειδή μόνο τα δεδομένα της συχνότητας αλληλόμορφου ήταν διαθέσιμο [33]. Έτσι, για την αξιολόγηση της ποιότητας, η μελέτη αυτή θεωρήθηκε ως Hardy-Weinberg ανισορροπία. βαθμολογίες ποιότητας για τις μεμονωμένες μελέτες κυμαίνονταν 9-17, με το 83% (10 από 12) από τις μελέτες που έχουν ταξινομηθεί ως υψηλής ποιότητας (≥12).

Σύνδεσης μεταξύ miR-146a rs2910164 Πολυμορφισμός και GI Καρκίνοι

Η σύνοψη της μετα-ανάλυση για το miR-196a2 rs11614913 πολυμορφισμό και GI καρκίνων παρουσιάζεται στον πίνακα 3. Αναλύσαμε πρώτα τη σύνδεση στο συνολικό πληθυσμό. Στη συνέχεια, προκειμένου να επιτευχθεί το ακριβές αποτέλεσμα της σχέσης μεταξύ miR-146a rs2910164 πολυμορφισμό και GI ευαισθησία καρκίνους, πραγματοποιήθηκαν στρωματοποιημένη αναλύσεις από την εθνικότητα, τύπους καρκίνου και την ποιότητα των σπουδών. Όταν το Q-test της ετερογένειας δεν ήταν σημαντική, πραγματοποιήσαμε αναλύσεις χρησιμοποιώντας τα μοντέλα σταθερό αποτέλεσμα. Τα μοντέλα τυχαία επίδραση διεξήχθησαν όταν ανιχνεύεται σημαντική μεταξύ μελετών ετερογένεια.

Η

Σε γενικές γραμμές, όταν όλοι οι τύποι καρκίνων GI θεωρήθηκαν από κοινού στη μετα-ανάλυση, δεν υπήρχε καμία απόδειξη συσχέτισης μεταξύ ΜΙΚ 146α rs2910164 πολυμορφισμό και ο κίνδυνος καρκίνου GI σε κάθε γενετικό μοντέλο (G έναντι Γ: OR = 1.07, 95% CI 0,98-1,16,

P

= 0,14? GG + GC έναντι CC: OR = 1.14, 95 % CI 1,00 έως 1,31,

P

= 0,05? GG έναντι GC + CC: OR = 1.06, 95% CI 0,91 έως 1,23,

P

= 0,47? GG έναντι CC: OR = 1,17 , 95% CI 0,95 έως 1,44,

P

= 0,13? GC έναντι CC:. OR = 1.14, 95% CI 1,00 έως 1,31,

P

= 0,05)

Στη συνέχεια, πραγματοποιήσαμε αναλύσεις υποομάδων σύμφωνα με την εθνικότητα των μελετών. Σε Ασιάτες, δεν υπάρχει σημαντική συσχέτιση μεταξύ miR-146a rs2910164 πολυμορφισμό και τον κίνδυνο καρκίνου GI βρέθηκε για όλους γενετικό μοντέλο (G έναντι Γ: OR = 1,09, 95% CI 0,99 έως 1,19,

P

= 0,09? GG + GC έναντι CC: OR = 1.15, 95% CI 0,99 έως 1,32,

P

= 0,06? GG έναντι GC + CC: OR = 1.08, 95% CI 0,91 έως 1,27,

P

= 0,37? GG έναντι CC: OR = 1.18, 95% CI 0,95 έως 1,47,

P

= 0,14? GC έναντι CC: OR = 1.14, 95% CI 0,99 έως 1,31,

P

= 0.07). Σε Καυκάσιους, δεν υπήρχε καμία απόδειξη της σύνδεσης μεταξύ των παραλλαγή γονότυπους του miR-146a rs2910164 πολυμορφισμό και τον κίνδυνο καρκίνου GI κατά τη σύγκριση αλληλομόρφων (G έναντι Γ: OR = 0,94, 95% CI 0,77 έως 1,14,

P

= 0.51).

Επίσης, διερευνήθηκε η επίδραση του rs2910164 πολυμορφισμού miR-146a σχετικά με την ευαισθησία σε υποτύπους των καρκίνων του γαστρεντερικού. Καμία ένδειξη σύνδεσης παρατηρήθηκε σε οποιοδήποτε γενετικό μοντέλο μεταξύ miR-146a rs2910164 πολυμορφισμό και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου του ήπατος (G έναντι Γ: OR = 1.07, 95% CI 0,98 έως 1,18,

P

= 0,13? GG + GC έναντι CC: OR = 1,11, 95% CI 0,96 έως 1,27,

P

= 0,15? GG έναντι GC + CC: OR = 1.08, 95% CI 0,92 έως 1,27,

P

= 0,34 ? GG έναντι CC: OR = 1.18, 95% CI 0,97 έως 1,43,

P

= 0,10? GC έναντι CC: OR = 1,09, 95% CI 0,94 έως 1,26,

P

= 0,27 ), γαστρικό καρκίνο (G έναντι Γ: OR = 1.05, 95% CI 0,89 έως 1,24,

P

= 0,54? GG + GC έναντι CC: OR = 1.15, 95% CI 0,88 έως 1,51,

P

= 0,31? GG έναντι GC + CC: OR = 0,93, 95% CI 0,77 έως 1,13,

P

= 0,48? GG έναντι CC: OR = 1,04, 95% CI 0,74 έως 1,47,

P

= 0,81? GC έναντι CC: OR = 1.20, 95% CI 0,88 έως 1,64,

P

= 0,26) και καρκίνο του οισοφάγου (G έναντι Γ: OR = 1.15, 95% CI 0,80 -1.66,

P

= 0,46).

Θα πραγματοποιηθεί, επίσης, ανάλυση υποομάδας σύμφωνα με την ποιότητα των σπουδών. Στην υποομάδα των μελετών υψηλής ποιότητας, δεν υπάρχει σημαντική συσχέτιση μεταξύ miR-146a rs2910164 πολυμορφισμό και τον κίνδυνο καρκίνου του γαστρεντερικού παρατηρήθηκε (G έναντι Γ: OR = 1.07, 95% CI 0,97 έως 1,18,

P

= 0,19? GG + GC έναντι CC: OR = 1.14, 95% CI 0,96 έως 1,35,

P

= 0,13? GG έναντι GC + CC: OR = 1,09, 95% CI 0,94 έως 1,27,

P

= 0,25? GG έναντι CC: OR = 1.22, 95% CI 0,97 έως 1,53,

P

= 0,09? GC έναντι CC: OR = 1.12, 95% CI 0,95 έως 1,31,

P

= 0.18). Στην υποομάδα των μελετών χαμηλής ποιότητας, υπήρχε επίσης καμία απόδειξη συσχέτισης miR-146a rs2910164 πολυμορφισμό και τον κίνδυνο καρκίνου GI σε κάθε γενετικό μοντέλο (G έναντι Γ: OR = 1,02, 95% CI 0,88 έως 1,19,

P

= 0,79? GG + GC έναντι CC: OR = 1.16, 95% CI 0,94 έως 1,44,

P

= 0,61? GG έναντι GC + CC: OR = 0,94, 95% CI 0,50 – 1,76 ,

P

= 0,85? GG έναντι CC: OR = 0.91, 95% CI 0,67 έως 1,23,

P

= 0,54? GC έναντι CC: OR = 1,29, 95% CI 1,02 – 1,61 ,

P

= 0,03).

Αξιολόγηση των Δημοσίευση Bias (Πίνακας 4)

Τα αποτελέσματα της γραμμικής παλινδρόμησης δοκιμής Egger του φαίνονται στον πίνακα 4. το σχήμα της χοάνης οικόπεδα δεν αποκάλυψε καμία ένδειξη προφανής ασυμμετρία για όλες τις γενετικές μοντέλα στη συνολική μετα-ανάλυση. δοκιμή Egger χρησιμοποιήθηκε για να παρέχει στατιστικά στοιχεία του οικοπέδου χοάνη συμμετρίας. Το σημείο τομής

μια

παρέχει ένα μέτρο της ασυμμετρίας, και το μεγαλύτερο απόκλισή του από το μηδέν η πιο έντονη η ασυμμετρία. Τα αποτελέσματα ακόμα δεν παρουσιάζει κανένα προφανή απόδειξη της μεροληψίας δημοσίευσης για οποιοδήποτε από τα γενετικά μοντέλα. δοκιμή Egger ανίχνευσε μόνο ενδείξεις μεροληψίας δημοσίευση στην ανάλυση των υποομάδων του καρκίνου του στομάχου για την αντίθεση αλληλομόρφων (P = 0,004). Ωστόσο, τεστ Egger δεν εφαρμόστηκε σε κάποιες συγκρίσεις λόγω του μικρού αριθμού των μελετών.

Η

Συζήτηση

Στην παρούσα μετα-ανάλυση με 4.817 περιπτώσεις και 5.389 μάρτυρες, δεν υπήρχε ενδείξεις συσχέτισης μεταξύ miR-146a rs2910164 πολυμορφισμό και τον κίνδυνο καρκίνου GI. Παρόμοια αποτελέσματα βρέθηκαν σε αναλύσεις των υποομάδων ανά εθνικότητα, τύπους καρκίνου, και την ποιότητα των σπουδών. Η παρούσα μελέτη είναι η μεγαλύτερη μετα-ανάλυση της σχέσης μεταξύ του miR-146a rs2910164 πολυμορφισμό και τον κίνδυνο καρκίνου του γαστρεντερικού.

Το 2011, αρκετές μετα-αναλύσεις διεξήχθησαν για να διερευνηθεί η σχέση μεταξύ miR-146a rs2910164 πολυμορφισμός και το συνολικό κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου. Xu et al. [42] και Qiu et al. [43] και διαπίστωσε ότι το miR-146a rs2910164 πολυμορφισμός δεν συσχετίστηκε με το συνολικό κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου. Σε μια άλλη μετα-ανάλυση, η συνολική αύξηση του κινδύνου καρκίνου βρέθηκε μόνο στο κυρίαρχο μοντέλο (

P

= 0,02) [44]. Παρ ‘όλα αυτά, οι συγγραφείς δεν ρυθμίσετε το επίπεδο σημαντικότητας α. Αν διορθώθηκαν πολλαπλές συγκρίσεις, θα μπορούσε να ληφθεί ένα αρνητικό αποτέλεσμα. Σε συνεπής με τις εκθέσεις αυτές, δεν βρήκαμε καμία συσχέτιση μεταξύ miR-146a rs2910164 πολυμορφισμό και τον κίνδυνο καρκίνου GI σε συνολική ανάλυση. Όταν στρωματοποίηση από τύπους καρκίνου, Xu et al. [42] διαπίστωσαν ότι το αλληλόμορφο C του miR-146a rs2910164 πολυμορφισμός μπορεί να σχετίζεται με την προστασία από τον καρκίνο του πεπτικού συστήματος στην ανάλυση υποομάδας. Όμως, η ανάλυση υποομάδας περιελάμβανε μόνο τρεις μελέτες [29], [31], [32]. Σε αντίθεση με το αποτέλεσμα, μας μετα-ανάλυση που παρέχει πιο επαρκείς αποδείξεις ότι το miR-146a rs2910164 δεν ήταν ένα λειτουργικό πολυμορφισμού σε καρκίνους GI ευαισθησίας βασίζεται σε μεγαλύτερα μεγέθη δειγμάτων και αυξημένη στατιστική ισχύ. Ομοίως, στην ανάλυση υποομάδας, δείξαμε συνέπεια καμία σχέση μεταξύ αυτού του SNP και καρκίνους GI.

Η τρέχουσα μετα-ανάλυση είναι βασισμένη σε μια ενιαία στρατηγική πολυμορφισμός να διερευνήσει τη σχέση μεταξύ πολυμορφισμό του γονιδίου miR-146a και καρκίνους GI. Duan και οι συνεργάτες του εντόπισαν 323 SNPs σε 227 ανθρώπινα γνωστό miRNAs [45]. Αν και μια ενιαία SNP έχει περιορισμένη επίδραση στον κίνδυνο καρκίνου του γαστρεντερικού, αλληλεπιδράσεις πολλαπλών SNPs σε γονίδια miRNA που σχετίζονται μπορεί να αυξήσει την επίδραση. Ανάπτυξη καρκίνων του γαστρεντερικού είναι μια διαδικασία πολλαπλών σταδίων, και μια ενιαία πολυμορφισμός μπορεί να έχει περιορισμένο αντίκτυπο στην καρκίνους GI ευαισθησία [10]. Τα πιο ολοκληρωμένη απλότυπος που βασίζονται ή πολλαπλών πολυμορφισμών που βασίζονται σε στρατηγικές και όχι μια ενιαία στρατηγική πολυμορφισμός που βασίζεται σε εγγύηση, η οποία μπορεί να παρέχει πιο ακριβείς πληροφορίες σχετικά με τη γενετική συμβολή των πολυμορφισμό του γονιδίου miR-146a σε καρκίνους GI αιτιολογία. Εκτός από την γενετική προδιάθεση, η έκθεση στο περιβάλλον, όπως το κάπνισμα, η κατανάλωση αλκοόλ, και η διατροφή, είναι επίσης πιστεύεται ότι παίζουν κρίσιμο ρόλο στην αιτιολογία των καρκίνων GI [46]. Αλληλεπιδράσεων γονιδίων-περιβάλλοντος πρέπει να εξετάζεται σε περαιτέρω μελέτες, εάν είναι διαθέσιμα ατομικά στοιχεία της περιβαλλοντικής έκθεσης.

Υπάρχουν

Ορισμένες πιθανούς περιορισμούς σε μας μετα-ανάλυση. Πρώτον, οι έλεγχοι για μία μελέτη που περιλαμβάνονται στην παρούσα μετα-ανάλυση δεν ήταν σε ισορροπία Hardy-Weinberg. Σε κάποιο βαθμό, τα αποτελέσματα των μελετών γενετικής συσχέτισης μπορεί να παραμορφωθεί. Δεύτερον, η προκατάληψη δημοσίευση ανιχνεύθηκε στην ανάλυση των υποομάδων του καρκίνου του στομάχου για την αντίθεση αλληλομόρφων. Αυτό μπορεί επίσης να στρεβλώσουν την μετα-ανάλυση. Τρίτον, όπως με τις περισσότερες μετα-αναλύσεις, τα αποτελέσματα πρέπει να ερμηνεύονται με προσοχή λόγω των προφανών μεταξύ μελετών ετερογένεια σε ορισμένες συγκρίσεις. Τέταρτον, αν ήταν διαθέσιμα ατομικά στοιχεία, θα μπορούσαμε να εκτελέσει μια ακριβέστερη ανάλυση με εκτίμηση προσαρμογής. Τέλος, καρκίνο του παχέος εντέρου είναι η συχνότερη μορφή καρκίνου του πεπτικού σωλήνα. Στερούνται επαρκή επιλέξιμα μελέτες για καρκίνο του παχέος εντέρου περιορίζεται περαιτέρω στρωματοποιημένη αναλύσεις μας.

Εν κατακλείδι, τα αποτελέσματα από την μετα-ανάλυση των δημοσιευμένων στοιχείων δείχνουν ότι το miR-146a rs2910164 πολυμορφισμός δεν σχετίζεται με καρκίνους GI ευαισθησία. Είναι αναγκαίο να διεξαχθούν περισσότερες καλά σχεδιασμένες μελέτες που βασίζονται σε μεγαλύτερα μεγέθη δειγμάτων και ασθενείς με καρκίνο ομοιογενές.

Υποστήριξη Πληροφορίες

Πίνακα S1.

Κατάλογος ελέγχου των στοιχείων που θα περιλαμβάνονται σε αυτό το μετα-ανάλυση.

doi:. 10.1371 /journal.pone.0039623.s001

(DOC)

Ευχαριστίες

Ευχαριστούμε όλους τους ανθρώπους που δίνουν τη βοήθεια για τη μελέτη αυτή

You must be logged into post a comment.