Αφηρημένο

Η γενετική προδιάθεση που ελέγχεται από την ευαισθησία ποσοτικά χαρακτηριστικό loci (QTLs) συμβάλλει σε ένα μεγάλο ποσοστό των κοινών καρκίνων. Μελέτες γενετικής ευαισθησίας του καρκίνου, ωστόσο, δεν αντιμετωπίσει συστηματικά τη σχέση μεταξύ ευαισθησίας σε καρκίνους σε διαφορετικά όργανα. Παρουσιάζουμε πέντε σύνολα δεδομένων σχετικά με τους γενετικούς αρχιτεκτονική του παχέος εντέρου και του καρκίνου του πνεύμονα επιδεκτικότητα σε ποντικούς, ανθρώπους και αρουραίους. Μπορούν συλλογικά δείχνουν ότι η πλειοψηφία των γονιδίων για παχέος εντέρου και του καρκίνου του πνεύμονα επιδεκτικότητα συνδέονται κατά ζεύγη και είναι πιθανόν ταυτόσημους ή συναφείς. Τέσσερις CCS /DEM ανασυνδυασμένου συγγενή στελέχη, το καθένα διαφορετικό από το στέλεχος BALB /CHEA από ένα διαφορετικό μικρό τυχαίο υποσύνολο ± 12,5% των γονιδίων που λαμβάνονται από το στέλεχος STS /Α, παρουσιάζουν ενδεικτικά είτε ακραία ευαισθησία ή ακραία αντίσταση και για τα δύο του παχέος εντέρου και του πνεύμονα όγκους, η οποία είναι απίθανο αν οι δύο όγκοι ελέγχονται από ανεξάρτητους γονίδια ευαισθησίας. Πράγματι, η ευπάθεια στον καρκίνο του πνεύμονα (

Sluc

) τόπους που διέπουν την ακραία ευαισθησία ή αντίσταση αυτών των CCS /Dem στελέχη, χαρτογραφήθηκαν σε 226 (× CCS-19 CCS-10) F2 ποντίκια, συν-εντοπίζονται με ευαισθησία σε καρκίνο του παχέος εντέρου (

Scc

) τόπους. Ανάλυση των πρόσθετων

Sluc

τόποι που χαρτογραφήθηκαν στο OCB /DEM στελέχη και

Scc

τόπους στην CCS /DEM στελέχη, αντίστοιχα, δείχνει εκτεταμένη ζεύγη συν-εντοπισμός τους (P = 0.0036) . Τέλος, η πλειοψηφία των δημοσιευμένων γονιδίων ανθρώπου και αρουραίου ευαισθησίας στον καρκίνο του παχέος εντέρου χάρτη για χρωμοσωμικές περιοχές ομόλογες με το ποντίκι

Sluc

τόπους. 12/12 ποντίκι

Scc

τόπους, 9/11 του ανθρώπου και των 5/7 τόπους ευαισθησίας στον καρκίνο του παχέος εντέρου αρουραίου είναι κοντά σε μια

Sluc

τόπου ή ομόλογο ιστοσελίδα της, σχηματίζοντας 21 συστάδες των πνευμόνων και του παχέος εντέρου γονίδια ευαισθησίας στον καρκίνο από ένα, δύο ή τρία είδη. Τα στοιχεία μας δείχνουν ότι QTLs ευαισθησία του καρκίνου μπορεί να έχει πολύ ευρύτερη βιολογικές επιδράσεις από ό, τι προς το παρόν να εκτιμηθεί. Καταδεικνύει, επίσης, τη δύναμη της γενετικής του ποντικιού για να προβλέψει τα γονίδια της ανθρώπινης ευαισθησίας. Σύγκριση των μοριακών μηχανισμών των γονιδίων ευαισθησίας που είναι όργανο ειδικά και εκείνων με εφέ trans-όργανο μπορεί να προσφέρει μια νέα διάσταση στην κατανόηση της ατομικής ευαισθησίας του καρκίνου

Παράθεση:. Quan L, Stassen APM, Ruivenkamp CAL, van Wezel Τ , Fijneman RJA, Hutson A, et al. (2011) Τα περισσότερα πνεύμονα και του παχέος εντέρου Ευαισθησία γονίδια είναι Ζεύγη Συνδέεται σε ποντίκια, τους ανθρώπους και αρουραίους. PLoS ONE 6 (2): e14727. doi: 10.1371 /journal.pone.0014727

Επιμέλεια: Joaquín Dopazo, Centro de Investigación Πρίνσιπε Felipe, Ισπανία

Ελήφθη: 19 Μαρ, 2010? Αποδεκτές: 31 Ιαν 2011? Δημοσιεύθηκε: 24 Φεβρουαρίου 2011

Copyright: © 2011 Quan et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Το έργο έχει χρηματοδοτηθεί από τα Εθνικά Ινστιτούτα Υγείας, Εθνικό Ινστιτούτο Καρκίνου χορηγήσει R01CA116158b, Ralph C. Wilson πρεσβύτερος και νεώτερος Ιατρικό Ίδρυμα, και μια θεσμική επιχορήγηση από το Roswell Park Cancer Institute για την Πέτρου Demant. Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

Ο καρκίνος είναι μία από τις κύριες αιτίες νοσηρότητας και θνησιμότητας παγκοσμίως. Μεμονωμένα κίνδυνο καρκίνου σποραδική σε πληθυσμούς ποικίλλει σημαντικά και ελέγχεται από πολλά γονίδια χαμηλή ευαισθησία διεισδυτικότητα [1]. Γονιδίωμα-ευρύ σύνδεσης (GWA) μελέτες έχουν αποκαλύψει κοινές παραλλαγές που σχετίζονται με τον κίνδυνο καρκίνου του παχέος εντέρου [2] – [10], του πνεύμονα [11] – [16], του μαστού [17] – [23] και του προστάτη [24] – [30], αλλά αυτές οι παραλλαγές εξηγούν μόνο ένα κλάσμα του κινδύνου του πληθυσμού [31] και η εξειδίκευση οργάνου τους είναι άγνωστη. Πνεύμονα και ο καρκίνος του παχέος εντέρου είναι η πρώτη και η δεύτερη κύρια αιτία θανάτου από καρκίνο στις Ηνωμένες Πολιτείες, που αντιπροσωπεύουν το 28% και 9% των θανάτων από καρκίνο, αντίστοιχα [32]. Εδώ αναφέρουμε συστηματικές δοκιμές που περιλαμβάνουν τρία είδη που αποκαλύπτουν γενετική σύνδεση και την πιθανή ταυτότητα των περισσότερων γονιδίων ευαισθησίας για τους δύο καρκίνους.

Αναλύσαμε του παχέος εντέρου και του καρκίνου του πνεύμονα γονιδίων ευαισθησίας του ποντικιού χρησιμοποιώντας ανασυνδυασμένη συγγενή (RC) στελέχη, τα οποία αυξάνουν το ισχύς της χαρτογράφησης, μειώνοντας γενετική ετερογένεια [33]. Τα στελέχη RC παρήχθησαν από δύο επόμενες γενιές αναδιασταύρωσης ενός «δότη» γονικού στελέχους σε ένα «φόντο» γονικό στέλεχος, που ακολουθείται από είκοσι γενεές του αδελφού-αδελφής ζευγάρωμα από τυχαία επιλεγμένα ζεύγη αναπαραγωγής των ποντικών. Αυτό δημιούργησε ένα σύνολο περίπου 20 ομόζυγη στελέχη RC. Κάθε στέλεχος RC φέρει ένα διαφορετικό, τυχαίο σύνολο 12,5% των «χορηγών» γονίδια του στελέχους και το 87,5% των «φόντο» τα γονίδια του στελέχους (Σχήμα 1) [33], [34]. Με τον τρόπο αυτό, ο αριθμός διαχωρισμού των γονιδίων των ποσοτικών χαρακτήρων (QTLs) σε διασταυρώσεις μεταξύ ενός στελέχους RC και στέλεχος φόντο του μειώνεται σημαντικά και η εξουσία για τον εντοπισμό τους αυξάνεται [34]. RC στελέχη βελτιώσει επίσης την χαρτογράφηση ΟΤΙ εντοπίζοντας την αντιστοιχισμένη τόπους σε σχετικά σύντομο δότη περιοχές στέλεχος προερχόμενο από το οποίο μπορεί να οριοθετηθεί με ακρίβεια. Προηγουμένως, έχουμε χαρτογραφηθεί 15

Η ευαισθησία στον καρκίνο του παχέος εντέρου

(

Scc

) τόπους που χρησιμοποιούν CCS /DEM (CCS) στελέχη RC, που προέρχεται από το «φόντο» στέλεχος BALB /CHEA (BALB /c, ανθεκτική) και «δότης» στέλεχος STS /Α (STS, ευαίσθητα) [35] – [39]. Ανεξάρτητα, θα χαρτογραφηθεί 30

Ευαισθησία για τον καρκίνο του πνεύμονα

(

Sluc

) τόπους που χρησιμοποιούν τα στελέχη OCB /DEM (OCB) RC, που προέρχεται από το «φόντο» στέλεχος Ο20 /Α (Ο20, ευαίσθητα ) και «δότης» στέλεχος B10.O20 /DEM (B10.O20, ανθεκτικό) [40] – [42].

Οι κυριότερες περιοχές δότη-στέλεχος των στελεχών CCS RC που χρησιμοποιήθηκαν για τη χαρτογράφηση του παχέος εντέρου ή οι πνεύμονες των γονιδίων ευαισθησίας του όγκου εμφανίζονται με βάση την πραγματική γονότυπους.

η

Εάν ένα σημαντικό ποσοστό των γονιδίων ευαισθησίας του καρκίνου για τα δύο όργανα είναι πανομοιότυπα ή γενετικά σχετίζονται με, ένας σημαντικός αριθμός των άνω και κάτω τελεία και την ευαισθησία του καρκίνου του πνεύμονα τόπους θα συνεργαστούν -localize στις ίδιες χρωμοσωμικές περιοχές. Πράγματι, η ανάλυση αυτών των τόπων υποδηλώνει έντονα ότι τα περισσότερα γονίδια προδιάθεσης για πνεύμονα και του παχέος εντέρου δεν είναι γενετικά ανεξάρτητη, αλλά είναι κατά ζεύγη συνδέονται μεταξύ τους. Επιπλέον, αυτή η συν-εντοπισμό παρατηρείται επίσης μεταξύ του καρκίνου του πνεύμονα ποντικού loci ευαισθησία και καρκίνο του παχέος εντέρου επιδεκτικότητα loci σε ανθρώπινο και αρουραίου. Δείχνουμε πέντε ανεξάρτητα σύνολα δεδομένων, συμπεριλαμβανομένων μεταξύ των ειδών ομολογίες, οι οποίες δείχνουν συλλογικά έντονα ότι τα περισσότερα γονίδια προδιάθεσης για πνεύμονα και του παχέος εντέρου δεν είναι γενετικά ανεξάρτητη όπως έχει πίστευαν, αλλά συνδέονται κατά ζεύγη και πιθανώς σχετίζονται λειτουργικά ή ταυτόσημες.

Υλικά και Μέθοδοι

Ηθική Δήλωση

Όλα τα πειράματα σε ζώα εγκρίθηκαν από την επιτροπή IACUC στο Roswell Park Cancer Institute (αριθμός άδειας IACUC M905).

Ποντίκια

τα ποντίκια διατηρήθηκαν σε αεριζόμενα κορυφή φίλτρο κλουβιά κάτω από ένα αυστηρό φως-σκοτάδι αγωγή και έλαβαν οξινισμένο πόσιμο νερό και ένα πρότυπο εργαστήριο διατροφή (LM-485, Harlan Teklad, ΗΠΑ)

κατά βούληση

. RC στελέχη είναι αμιγείς και μορφή σετ των περίπου 20 στελέχη που προέρχονται από τα ίδια γονικά στελέχη. Κάθε OCB ανασυνδυασμένου συγγενή (RC) στέλεχος έχει το 87,5% του γονιδιώματος από το στέλεχος Ο20 – το «φόντο» το στέλεχος που είναι σχετικά ευαίσθητο και 12,5% από το στέλεχος B10.O20 – το «δότη» στέλεχος που είναι σχετικά ανθεκτικό σε όγκους του πνεύμονα . Κάθε CCS ανασυνδυασμένου συγγενή (RC) στέλεχος έχει το 87,5% του γονιδιώματος από το στέλεχος BALB /c – το «φόντο» το στέλεχος που είναι σχετικά ανθεκτικό και 12,5% από το στέλεχος STS – το «δότη» στέλεχος που είναι σχετικά ευαίσθητα σε όγκους παχέος εντέρου (Σχήμα 1) [33], [34].

επαγωγή όγκων του πνεύμονα και την ανάλυση στην παρούσα μελέτη

επαγωγή όγκων του πνεύμονα σε ποντίκια έχει περιγραφεί στο παρελθόν [40]. Εν συντομία, την ημέρα 17 της κύησης, οι έγκυες (CCS-10 × CCS-19) θηλυκά F1 δόθηκε η (ίρ) ένεση 30 mg /kg σωματικού βάρους του καρκινογόνου Ν-αιθυλ-Ν-νιτροζουρία (ENU) ενδοπεριτοναϊκή διαλύεται σε φωσφορικό ρυθμιστικό κιτρικού οξέος (ρΗ 5.8) [40]. Οι απόγονοι του καρκινογόνος-ένεση θηλυκά F1 ήταν έτσι εκτίθενται σε ENU πλακούντα. Αυτό απόγονοι υποβλήθηκαν σε ευθανασία σε ηλικία 16 εβδομάδων και ολόκληρο πνεύμονές τους αφαιρέθηκαν, σταθεροποιήθηκαν σε 10% ουδέτερη ρυθμισμένη φορμαλίνη και εμπεδώθηκαν σε histowax. Για τις δοκιμές της ευαισθησίας των πνευμόνων του όγκου των στελεχών CCS, εμείς που προκαλείται από όγκους του πνεύμονα στην CCS-19, CCS-11, CCS-10 και CCS-20 ποντίκια. Μπορούμε επίσης προκάλεσε όγκους του πνεύμονα σε σταυρούς της CCS-19, CCS-11, CCS-10 ή CCS-20 θηλυκά ποντίκια με (BALB /c × FVB) F

1 αρσενικά ποντίκια (λόγω του μικρού αριθμού των διαθέσιμων ποντικών CCS ). Για τις δοκιμές σύνδεσης, οι όγκοι του πνεύμονα προκλήθηκαν σε 226 F2 διασταυρώνονται ποντίκια που κατασκευάστηκαν μεταξύ CCS-10 και CCS-19 ποντίκια.

Τα ενσωματωμένα πνεύμονες κόπηκαν ημι-σειριακά (5-μm τμήματα σε 100 μm διαστήματα). Στις περισσότερες περιπτώσεις, λάβαμε 30 έως 35 τομές ανά πνεύμονα. Όλες οι τομές χρωματίστηκαν με αιματοξυλίνη-ηωσίνη και εξετάστηκαν μικροσκοπικά σε 50Χ και 400Χ μεγεθύνσεις. Για να γίνει διάκριση κατηγορηματικά μεμονωμένων όγκων, έχουν χρησιμοποιηθεί θέση ενός όγκου στο λοβό του πνεύμονα σε διαδοχικές τομές, το σχήμα και το μέγεθός του, θέσεως σχέση με τους βρόγχους και τα αιμοφόρα αγγεία, και τα χαρακτηριστικά των καρκινικών κυττάρων. Οι όγκοι που αναλύθηκαν στην παρούσα μελέτη αντιπροσωπεύουν ένα συνεχές ιστολογική φάσμα από εντελώς καλοήθη αδενώματα (μειοψηφία) σε αδενοκαρκινώματα του διαφορετικού βαθμού προόδου, η οποία χαρακτηρίζεται από την έκταση της αποδιοργάνωσης της αρχικής αρχιτεκτονικής του οργάνου, μεγάλες διαφορές στη μορφολογία των κυττάρων, προφέρεται πυρηνική πλειομορφία, ενδο- πυρηνική κυτταροπλασματικά έγκλειστα, εκτεταμένες περιοχές στρώματος και αγγειακή προσλήψεων. Όταν αφέθηκε να αναπτυχθεί για ένα μεγαλύτερο χρονικό διάστημα από ό, τι στην παρούσα μελέτη, οι περισσότεροι από τους όγκους σχηματίζουν προηγμένες καρκινώματα με εισβολή γειτονικών κυψελίδων, και τη διείσδυση σε βρόγχους και τα αιμοφόρα αγγεία (αδημοσίευτα observatins). Αριθμός των όγκων, το μέγεθος του όγκου και το φορτίο του όγκου βαθμολογήθηκαν όπως περιγράφηκε προηγουμένως [40]. Εν συντομία, το μέγεθος του όγκου εκφράστηκε ως το άθροισμα όλων των μετρούμενων επιφανειών (που υπολογίζεται χρησιμοποιώντας ένα φράγμα στην οφθαλμική) στις semiserial τμήματα όπου ο όγκος ήταν παρόν, και αντιστοιχούσε σε όγκο του όγκου. Όγκοι που δεν υπερβαίνει τη διάμετρο των 300 μm σε οποιοδήποτε από τα τμήματα δεν συμπεριλήφθηκαν στα δεδομένα. φορτίο του όγκου υπολογίστηκε ως το άθροισμα των μεγεθών (όγκοι) όλων των όγκων σε έναν ποντικό και αντιστοιχούσε στο συνολικό φορτίο του όγκου του ποντικού.

γονοτυπικός

Περισσότερο από το 90% της γενετικού υλικού από το «δότη» στελέχους σε ένα στέλεχος RC συγκεντρώνεται σε 9 έως 13 διακριτές όμορες χρωμοσωμικές περιοχές με ενδιάμεσο μήκος (5-25 cm), οι οποίες συνήθως βρίσκονται σε 7 έως 11 διαφορετικά χρωμοσώματα [34]. Έχουμε προσδιορίσει τις θέσεις και το μήκος της πλειοψηφίας των χορηγών-στέλεχος που προέρχεται χρωμοσωμικές περιοχές στην CCS και στελέχη OCB RC με 855 και 716 δείκτες μικροδορυφόρων σε ολόκληρο το γονιδίωμα, αντίστοιχα. Με βάση αυτές τις πληροφορίες, οι δότη στέλεχος που προέρχεται από τις περιοχές διαχωρισμού σε 226 (CCS-10 × CcS19) F2 ποντίκια ήταν PCR-γονότυπος [40], χρησιμοποιώντας 23 δείκτες μικροδορυφορικού: D1Mit291, D1Mit155, D2Mit99, D2Mit156, D2Nds3, D4Mit53, D4Mit15, D5Mit68 , D6Mit177, D7Mit105, D8Mit17, D8Mit36, D9Mit254, D10Mit28, D10Mit2, D11Mit316, D14Mit11, D15Mit16, D17Mit72, D17Mit123, D18Mit17, D18Mit124, D19Mit6 (https://informatics.jax.org). Κάθε γνωστό διαχωρισμό χρωμοσωμική περιοχή αντιπροσωπεύεται από τουλάχιστον έναν δείκτη. Περισσότεροι δείκτες έχουν δοκιμαστεί στις πλέον χρωμοσωμικές δότη περιοχές και η μέγιστη απόσταση μεταξύ των δύο δεικτών ήταν λιγότερο από 10 cm.

Η στατιστική ανάλυση

α. Σύνδεση και την κατεύθυνση των αλληλομόρφων αποτελέσματα σε (CCS-10xCcS-19) F

2 ποντίκια.

Το σύνολο δεδομένων του πειράματος αυτού υποβλήθηκε στην PLoS One ιστοσελίδα ως συμπληρωματικό υλικό (Σύνολο δεδομένων S1). Οι χρωμοσωμικές περιοχές που επηρεάζουν το φορτίο του όγκου, το μέγεθος και τον αριθμό προσδιορίστηκαν με ανάλυση διακύμανσης (ANOVA) με τη χρήση μεμονωμένων μικροδορυφορικών δεικτών που περιλαμβάνονται στο «γονοτυπική» παραπάνω. Τα αποτελέσματα του κάθε δείκτη, το φύλο και την αλληλεπίδραση μεταξύ των ζευγών (δείκτης σήμανσης και δείκτη φύλου) στις αντίστοιχες φαινοτύπους ελέγχθηκαν από το GLM PROC (γενικά γραμμικά μοντέλα) διαδικασία του στατιστικού πακέτου SAS 9.1 για Windows (SAS Institute, Inc. , Cary, NC). Μια διαδικασία προς τα πίσω-αποβολή ακολουθήθηκε για τον αποκλεισμό στατιστικά μη σημαντικές επιπτώσεις (

P

& gt? 0,05). Οι Ρ-τιμές των σημαντικών επιπτώσεων στη συνέχεια διορθώθηκαν για πολλαπλές δοκιμές χρησιμοποιώντας τη μέθοδο των Lander και Kruglyak [43] για να κατασκευάσουν το τελικό μοντέλο. Όλες οι στατιστικές δοκιμασίες ήταν δύο όψεων. Χρησιμοποιώντας τουλάχιστον πλατεία (LS) σημαίνει κάθε γονότυπο από την ANOVA προσδιορίσαμε τον αριθμό των κύριων επιδράσεων και αλληλεπιδράσεων, όπου CCS-19-σαν γονότυπων συνδέθηκαν με ευαισθησία ή αντίσταση σε σύγκριση με CCS-10 γονότυπο (διαφορές & gt? 30%) .

b. Αξιολόγηση του προτύπου ευαισθησίας του όγκου των στελεχών RC.

Οι αριθμοί του παχέος εντέρου όγκου και τα φορτία των όγκων του πνεύμονα ή οι αριθμοί συγκρίθηκαν μεταξύ των RC στελέχη CCS-10, -11, -19, -20 και οι Wilcoxon (rank ποσά) τεστ δύο δειγμάτων με τη χρήση της διαδικασίας PROC NPAR1WAY του στατιστικού πακέτου SAS 9.1 για Windows (SAS Institute, Inc., Cary, NC).

c. Ανάλυση προηγουμένως δημοσιευθεί Sluc και η SCC τόπους.

Χρησιμοποιήσαμε τα δημοσιευμένα δεδομένα χαρτογράφησης για το

Scc

ή

Sluc

τόπους χωρίς προ-επιλογή. Έχουμε εντοπίσει τα επικαλυπτόμενα STS και B10.O20 δότη στέλεχος προερχόμενο από χρωμοσωμικές περιοχές, και προσδιορίζεται το ποιες από τις 14

Scc

(

SCC1

και

Scc10

εξετάζονται εδώ μια ενιαία θέση επειδή είναι λιγότερο από 1 cm μεταξύ τους) και 30

Sluc

τόπους χάρτη σε τέτοια επικάλυψη STS-B10.O20 δότη στέλεχος προερχόμενο από χρωμοσωμικές περιοχές. Χρησιμοποιήσαμε την κατανομή Poisson με μέση τιμή παραμέτρου (MSCC και mSluc), το οποίο είναι ίσο με το συνολικό αριθμό των διαπιστωμένων loci κάθε τύπου διαιρούμενο με το μέγεθος του συνολικού μήκους του γονιδιώματος δοκιμάστηκαν για αυτόν τον τύπο. Η πιθανότητα να παρατηρήσει τουλάχιστον ένα τόπο ενός συγκεκριμένου τύπου k σε μία περιοχή μεγέθους s ισούται με 1-exp (ΜΚ * s). Οι πιθανότητες που τόσο

Scc

και

Sluc

, κανένα από αυτά, ή μόνο ένα

Scc

ή

Sluc

τόπου είναι παρόντα είναι {1- exp (-mScc * s)} * {(1-exp (-mSluc * s)}, exp (-mScc * s) * exp (-mSluc * s), {1-exp (-mScc * s)} * exp (-mSluc * s), και exp (-mScc * s) * {1-exp (-mSluc * s)}, αντίστοιχα, υποθέτοντας ότι το loci των δύο τύπων διανέμονται ανεξάρτητα πάνω από το γονιδίωμα. Αυτές οι τιμές στη συνέχεια συγκρίνονται με τα πραγματικά δεδομένα από την chi-square.

δ. Συν-εντοπισμός των γονιδίων ευαισθησίας του όγκου ανθρώπινου παχέος εντέρου και του πνεύμονα ποντικού.

Χρησιμοποιήσαμε δημοσιευμένες πληροφορίες σχετικά με τα ανθρώπινα καρκίνο του παχέος εντέρου τόπους ευαισθησία ανιχνεύεται στο γονιδίωμά ευρύ ή σύνδεσης μελέτες. ορθόλογες περιοχών αυτών των τόπων στον ποντικό συγκρίθηκαν με γνωστές

Sluc

και

Scc

loci. Εμείς αξιολογήθηκαν από την διωνυμική δοκιμή διανομή δυνατότητα της παρατηρούμενης αριθμού ανθρώπινων καρκίνου του παχέος εντέρου τόπους ευαισθησίας, των οποίων ορθόλογες περιοχές ήταν πολυμορφικοί στα δοκιμάστηκαν ποντίκια, μέσα σε ένα μέσο όρο 3.3cm του που δημοσιεύθηκε

Sluc

τόπους.

Αποτελέσματα

Συσχετίζεται ευαισθησία σε παχέος εντέρου και του πνεύμονα όγκους στην CCS RC στελέχη

στο πρώτο βήμα, έχουμε επιλέξει δύο στελέχη RC ιδιαίτερα ευαίσθητοι και δύο RC στελέχη που είναι πιο ανθεκτικά σε όγκους του παχέος εντέρου και ελέγχθηκαν την ευαισθησία τους στους όγκους των πνευμόνων. Τα RC στελέχη CCS-19 και CCS-11 είναι ιδιαίτερα ευαίσθητα και CCS-10 και CCS-20 είναι πολύ ανθεκτικό σε όγκους του παχέος εντέρου (p & lt? 0,0001, Σχήμα 2Β άνω) [35], [37] που προκαλείται από επαναλαμβανόμενες ενέσεις των καρκινογόνων ουσιών 1 , 2-διμεθυλο-υδραζίνη (ΩΜΗ) ή αζοξυμεθάνιο (ΑΟΜ). Εμείς που προκαλείται από όγκους του πνεύμονα στην CCS-19 και CCS-20 ή CCS-11 και CCS-10 σε δύο ανεξάρτητα πειράματα. Παρατηρήσαμε ότι, σύμφωνη με την ευαισθησία του όγκου του παχέος εντέρου ή της αντίστασης, CCS-19 είναι ιδιαίτερα ευαίσθητα στην ENU που προκαλείται από όγκους του πνεύμονα σε σύγκριση με CCS-20 (p & lt? 0,0001, Wilcoxon τεστ), και CCS-11 είναι ιδιαίτερα ευαίσθητα στην ENU που προκαλείται όγκων του πνεύμονα σε σύγκριση με CCS-10 (p = 0,0012, Wilcoxon τεστ) (Σχήμα 2Β κάτω). Η ακραία ευαισθησία ή αντίσταση σε όγκους του πνεύμονα παρατηρήθηκε στα στελέχη CCS, σύμφωνη με την ευαισθησία του όγκου του παχέος εντέρου, έχει υποστηριχθεί από τα αποτελέσματα από διασταυρώσεις της CCS-19, CCS-11, CCS-10 και CCS-20 με (BALB /c × FVB ) F

1 ποντίκια (δοκιμάζονται λόγω του μικρού αριθμού των διαθέσιμων ποντίκια CCS) (Σχήμα S1, Πίνακας S1). Ποντίκια αυτών των σταυρών μεταφέρουν σε κάθε θέση ένα αλληλόμορφο του σχετικού στέλεχος RC και έδειξε παρόμοιο πρότυπο ευαισθησία στα ομόζυγα ποντίκια CCS. Αυτά τα δεδομένα υποδεικνύουν ότι τα μικρά υποσύνολα του 12,5% STS γονίδια που λαμβάνονται από αυτά τα στελέχη RC περιέχουν είτε κυρίως ευαίσθητα (CCS-11, CCS-19), ή κατά κύριο λόγο ανθεκτικά (CCS-10, CCS-20) αλληλόμορφα στο πιο παχύ έντερο (

Scc

) και ο καρκίνος του πνεύμονα (

Sluc

) γονίδια, γεγονός που υποδηλώνει ζεύγη σύνδεση ή την ταυτότητά τους (Εικόνα 2Α άνω). Διαφορετικά, αυτά τα στελέχη RC θα είναι εξαιρετικά ευπαθή ή εξαιρετικά ανθεκτικό σε έναν τύπο όγκου, αλλά δεν είναι πιθανό να την άλλη (Σχήμα 2Α κατώτερο).

A. Αναμένεται ευαισθησία σε παχέος εντέρου και του πνεύμονα όγκους κάτω από διαφορετικές υποθέσεις. Σύμφωνων ευαισθησία ή αντίσταση σε κόλον και πνεύμονα όγκους αναμένεται όταν η πλειοψηφία των γονιδίων ευαισθησίας των δύο καρκίνων συνδέονται στενά ή ταυτόσημες (άνω πάνελ)? αλλά όχι όταν τα γονίδια ευαισθησίας των δύο καρκίνων είναι ανεξάρτητο από το άλλο (κάτω πίνακας). B. Παρατηρήθηκε ευαισθησία σε παχέος εντέρου και του πνεύμονα όγκους στα CCS RC στελέχη με ακραίες φαινότυπο ευαισθησίας. Κάθε κουκίδα αντιπροσωπεύει ένα ποντίκι. Μέσος αριθμός των όγκων από κάθε στέλεχος υποδεικνύεται. Άνω του πίνακα: οι αριθμοί των όγκων του παχέος εντέρου για τις τεχνολογίες CCS-19, CCS-11, CCS-10 και CCS-20 ποντίκια. αριθμός Colon όγκος είναι ευθέως ανάλογη προς το φορτίο όγκου κόλου, δεδομένου ότι σε μεγέθη όγκων πειράματα παχέος εντέρου μας δεν διέφεραν σημαντικά μεταξύ των CCS στελεχών [35]. Κάτω πίνακας: φορτία όγκου πνεύμονα για τις τεχνολογίες CCS-19, CCS-11, CCS-10 και CCS-20 ποντίκια. Η ίδια ακραία ευαισθησία ή αντίσταση σε όγκους του πνεύμονα παρατηρήθηκε εδώ έχει επίσης παρατηρηθεί σε υβριδικά ποντίκια μεταξύ CCS και (BALB /c χ FVB) F1 ποντικοί (Σχήμα S1, Πίνακας S1).

Η

SCC-Sluc σύνδεση στο (CCS-10 × CcS19) υβρίδια F2

για να διευκρινιστεί η σύμφωνη ακραία ευαισθησία της CCS-19 και την αντίσταση της CCS-10 ποντίκια στα δύο του παχέος εντέρου και του πνεύμονα όγκους, θα χαρτογραφηθεί

Sluc

τόποι στην ENU επεξεργασμένο διασταυρώνονται (CCS-10 × CCS-19) F

2 ποντίκια. Συγκρίναμε τις θέσεις αυτών των

Sluc

τόπους με τις θέσεις του

Scc

τόπους ανιχνευθεί προηγουμένως στα στελέχη CCS.

Χαρτογράφηση Sluc τόπους.

Διαπιστώσαμε 1191 όγκων του πνεύμονα σε 226 (CCS-10 × CCS-19) F

2 ποντίκια. Τα 21 STS προερχόμενο περιοχές διαχωρισμού κατά την εγκάρσια (περίπου 23,5% του γονιδιώματος) προσδιορίσθηκαν στα στελέχη CCS χρησιμοποιώντας 855 μικροδορυφορικών δεικτών (τα δεδομένα δεν φαίνονται) και σαρώθηκαν σε υβρίδια F2 με 23 δείκτες μικροδορυφόρων σε απόσταση κατά μέσο όρο 10 εκατοστά μεταξύ τους. δεδομένα χαρτογράφησης όλων των σημαντικών δεσμών είναι στο Σχήμα 3, συμπεριλαμβανομένων τιμές ρ διορθώθηκαν για γονιδιώματος σε επίπεδο δοκιμών [43] και ελαχίστου τετραγώνου μέσα φαινοτύπων ευαισθησίας του κάθε τόπου. Διαπιστώσαμε 15

Sluc

τόπους που επηρεάζουν όγκου μέγεθος, το φορτίο και τον αριθμό (Σχήμα 3Α & amp? Β, Πίνακας S2). Οκτώ από αυτούς τους τόπους είχε επιμέρους αποτελέσματα (Σχήμα 3Α) και επτά τόποι ανιχνεύθηκαν μόνο σε αλληλεπιδράσεις μεταξύ τόπο. Βρήκαμε 17 ζεύγη ενδο-locus αλληλεπιδράσεις (Σχήμα 3Β), στην οποία η επίδραση του ενός

Sluc

locus εξαρτάται από το γονότυπο ενός δεύτερου αλληλεπιδρώντας

Sluc

τόπο [40], [ ,,,0],42]. Πέντε από αυτά τα 15

Sluc

τόποι είναι καινούργιες θέσεις:

Sluc31

–

Sluc35,

συνδέονται με D2Mit99, D17Mit72, D5Mit68, D15Mit16 και D19Mit6, αντίστοιχα (Σχήμα 3Α & amp? Β , Πίνακας S2). Το άλλο 10

Sluc

τόποι είναι πολύ κοντά (0-1,5 cm, πέντε θέσεις) ή σχετικά κοντά (6-12 cm, πέντε θέσεις) για τις θέσεις του στο παρελθόν δημοσιευθεί

Sluc

ή

Pas

τόπους (Πίνακας S2), έτσι θα μπορούσαμε να αποκλείσουμε ότι είναι διπλές ανιχνεύσεις και όχι μυθιστόρημα τόπους και δεν τους αποδίδεται μυθιστόρημα χαρακτήρων.

Οκτώ κύριες επιπτώσεις (Α) και 17 αλληλεπιδράσεις (Β) ανιχνεύθηκαν. Οι δείκτες μικροδορυφορικού με σύνδεση παρατίθενται κάτω από κάθε τόπο. Μαρκαδόροι σε ροζ χρώμα αντιπροσωπεύουν δότη χρωμοσωμική περιοχή από CCS-10 και των δεικτών στο πράσινο αντιπροσωπεύουν περιοχές δότη από CCS-19. Τα δεδομένα παρουσιάζονται ως επί τοις εκατό αποκλίσεις από το μέσο φορτίο όγκου, τον αριθμό και το μέγεθος για κάθε γονότυπο ή γονοτυπικής συνδυασμός (για αλληλεπιδράσεις) του αντίστοιχου loci σε γυναίκες, άνδρες ή δύο φύλα (όλες), αντίστοιχα, ρυθμίζεται για τις υπόλοιπες δείκτες σε το μοντέλο (ελαχίστων τετραγώνων δηλαδή από την έξοδο ANOVA). Τα μέσα (± SEM) του αριθμού των όγκων σε ολόκληρη την εγκάρσια είναι: θηλυκά, 4,78 (± 0,37)? αρσενικά, 4,18 (± 0,29)? Όλοι οι ποντικοί, 4,48 (± 0,24). Τα μέσα (± SEM) του μεγέθους του όγκου ανά ποντικό (mm

3) είναι: θηλυκά, 2,05 (± 0,25)? αρσενικά, 2,26 (± 0,28)? όλοι οι ποντικοί 2.15 (± 0.19). Τα μέσα (± SEM) του φορτίου όγκου ανά ποντικό (mm

3) είναι: θηλυκά, 10.57 (± 1.60)? άνδρες, 10.04 (± 1.30)? Όλα τα ποντίκια, 10.30 (± 1.03). † Loci Α και Β είναι αλληλεπιδρούν? s /s, ομόζυγο STS? γ /γ ομόζυγο BALB /c? s /c ετερόζυγο? Οι C. Παραδείγματα δείξει ότι οι STS αλληλόμορφα του

Sluc

τόποι είναι ευαίσθητα όταν κληρονόμησε από την CCS-19 γονική ποντίκια (

Sluc5

) και ανθεκτικά, όταν κληρονομούνται από τους CCS -10 γονική ποντίκια (

Pas9

). D. Παράδειγμα δεικνύεται ότι σε αλληλεπιδράσεις, οι γονοτυπικές συνδυασμούς που είναι παρόμοια με το CCS-19 γονικό ποντίκια (CCS-19-σαν) είναι ευαίσθητα σε σύγκριση με τα γονοτυπικά συνδυασμούς που είναι παρόμοια με το CCS-10 γονικό ποντικούς (CCS-10 -αρέσει). Στο παράδειγμα, μία από τις αλληλεπιδρώντων τόπων

Pas9

κληρονομείται από CCS-10 και η άλλη θέση

Sluc4

κληρονομείται από CCS-19.

Η

Εφέ των αλληλόμορφα αυτών των τόπων υποστηρίζουν την υπόθεση ότι αυτά είναι υπεύθυνα για την υψηλή ευαισθησία και αντοχή, αντίστοιχα, της CCS-19 και CCS-10, γιατί με ελάχιστες εξαιρέσεις το αλληλόμορφο που λαμβάνεται από CCS-19 προσδίδει μεγαλύτερη ευαισθησία από ότι από το CcS- 10 (Σχήμα 3C). Ομοίως, ο συνδυασμός των αλληλομόρφων στην αλληλεπίδραση ζεύγη

Sluc

τόποι που είναι παρούσα στο CCS-19 είναι πιο ευαίσθητα από εκείνη που υπάρχει στο CCS-10 (Σχήμα 3D).

SCC-Sluc συνεργασία -localization.

Συγκρίναμε την τοποθεσία χάρτη του 15

Sluc

τόπους ανιχνεύθηκε στα (CCS-10 × CCS-19) F

2 υβρίδια με την τοποθεσία του

Scc

τόπους ανιχνευθεί προηγουμένως σε σταυρούς της CCS στελέχη -3, -5, -11, -19, με BALB /c (Πίνακας S3) [36], [38], [39]. Επτά από τα 15

Sluc

τόπους, που συνδέονται με D1Mit291, D2Mit99, D8Mit17, D10Mit28, D11Mit316, D17Mit72 και D18Mit17, χαρτογραφούνται σε περιοχές που είχαν προηγουμένως ελεγχθεί για την ευαισθησία του καρκίνου του παχέος εντέρου. Χωρίς εξαίρεση, όλοι συν-εντοπίζεται με

Scc

τόπους και σχηματίζεται συνδέονται ζεύγη

SCC3

/

Sluc5

,

SCC1

/

Sluc31 , Scc8

/

Sluc20

,

Scc14

/

Sluc29

,

Scc15

/

Sluc4, SCC4

/

Sluc32

και

Scc5

/

Sluc14

(Σχήμα 4, Πίνακας S2). Πέντε από αυτά τα

Sluc

τόποι χαρτογραφήθηκαν λιγότερο από 1 εκατοστό από την αντιστοιχισμένη

Scc

τόπο? ένας τόπος 2 cm και ένα 5 cm. Η άλλη οκτώ πρόσφατα ανιχνεύθηκε

Οι Sluc

τόπους που βρίσκονται σε περιοχές που δεν έχει ακόμη δοκιμαστεί για την ευαισθησία των όγκων του παχέος εντέρου σε στελέχη RC και θα μπορούσε να αντιστοιχίσετε με το παρόν άγνωστο

Scc

τόπους. Αυτά τα στοιχεία δείχνουν ότι το

Scc

και

Sluc

τόπους διέπουν τη σύμφωνη ακραία ευαισθησία ή αντίσταση στην παχέος εντέρου και του πνεύμονα όγκους και είναι κατά ζεύγη συγκεντρωμένα.

Οι επτά

Sluc

loci στις χρωμοσωμικές περιοχές που έχουν δοκιμαστεί για επιδεκτικότητα καρκίνου του παχέος εντέρου προηγουμένως δείχνονται. Όλα τα επτά

Sluc

συν-εντοπισμό τόπους με

Scc

τόπους. Οι δείκτες με σύνδεση επισημαίνεται με πορτοκαλί χρώμα και το αντίστοιχο

Sluc

τόπους παρατίθενται. Πρόσθετες δείκτες που εξετάστηκαν στις ίδιες χρωμοσωμικές περιοχές δότη που δεν δείχνουν σύνδεση μπορεί να βοηθήσει στον περιορισμό των υποψήφιων περιοχών και εμφανίζονται σε γκρι χρώμα. Προηγουμένως ανιχνεύεται

Οι Scc

τόπους επισημαίνονται με μπλε χρώμα. Λεπτομερείς πληροφορίες για κάθε τόπο είναι εισηγμένη στο Suppl. Πίνακας 2 και Συμπλ. Πίνακας 3.

Η

SCC-Sluc σύνδεση σε ανεξάρτητα στελέχη

Πραγματοποιήσαμε μια ανάλυση του χάρτη τοποθεσίες

Scc

τόπους και

Sluc

τόποι ότι είχαν προηγουμένως χαρτογραφηθεί σε δύο τελείως ανεξάρτητα έργα που χρησιμοποιούν σταυρούς των τεσσάρων CCS στελεχών στο χάρτη

Scc

γονίδια [36], [38], [39] και πέντε στελέχη OCB στο χάρτη

Sluc

γονίδια [40] – [42], αντίστοιχα (Πίνακας S3). Τα στέλεχος δότης χρωμοσωμικές περιοχές των στελεχών CCS δοκιμάστηκαν για ευαισθησία όγκου κόλου που αποτελείται μαζί περίπου το 40-50% του γονιδιώματος, το οποίο είναι παρόμοιο με το συνολικό ποσοστό του γονιδιώματος των στελεχών OCB δοκιμάστηκαν για ευαισθησία όγκου πνεύμονα. Οι περιφέρειες «επικάλυψη» προβλήθηκε τόσο των πνευμόνων και του όγκου του παχέος εντέρου ευπάθεια μπορεί να χρησιμοποιηθεί για να αξιολογηθεί η πιθανή συν-εντοπισμός του

Scc

και

Sluc

γονίδια, ενώ οι περιφέρειες «μη επικάλυψη» ήταν μελετήθηκε μόνο για ένα τύπο όγκου και ως εκ τούτου δεν είναι κατατοπιστική (Σχήμα 5Α). Εντοπίσαμε 23 «επικάλυψη» χρωμοσωμικές περιοχές με συνολικό μήκος 430 cm ( «επικάλυψη» στον Πίνακα 1), που περιέχει 9

Scc

τόπους και 14

Sluc

τόπους (Πίνακας 1). Βρήκαμε ότι οι «συμφωνούν» επικάλυψη «περιοχές» που περιέχει είτε τόσο

Scc

και

Sluc

τόπου (n = 9) ή κανένας από αυτούς (n = 11) ξεπερνούν κατά πολύ το » ασύμφωνα «επικάλυψη» των περιφερειών »που περιέχουν είτε μόνο ένα

Scc

(n = 0) ή μόνο ένα

Sluc

τόπου (n = 3) (Πίνακας 1). Αυτά παρατηρούνται συχνότητες είναι σημαντικά διαφορετικές από τις αναμενόμενες συχνότητες υποθέτοντας ανεξάρτητη διανομή

Scc

–

Sluc

τόπους, όπως υπολογίζεται από την κατανομή Poisson με βάση το μήκος των περιοχών επικάλυψης (P = 0.0036, τροποποιημένο 2 χ 2 test-Υλικά και Μέθοδοι). Αυτά τα δεδομένα υποδεικνύουν ότι η γενετική σχετικότητα μεταξύ ενός μεγάλου αριθμού παχέος εντέρου και την επιδεκτικότητα καρκίνου του πνεύμονα γονίδια που παρατηρήσαμε στα στελέχη CCS RC είναι πιθανό κοινό σε άλλα στελέχη ποντικών, όπως καλά. Στην πραγματικότητα, η τιμή p 0,0036 πιθανό υποεκτιμά την πραγματική σημασία του συν-εντοπισμού, επειδή στις εννέα περιοχές επικάλυψης που περιέχουν τόσο ένα

Scc

τόπου και

Sluc

τόπου, οι αποστάσεις μεταξύ των οι δείκτες για αυτούς τους τόπους είναι περίπου 75% μικρότερο από το μήκος των περιοχών επικάλυψης (που προέρχεται από τον πίνακα 1, Σχήμα 5Β).

η

A. Σχηματική αναπαράσταση των επικαλυπτόμενων χρωμοσωμικών δότη περιοχές μεταξύ των CCS και στελέχη OCB RC (περιφέρειες ελέγχονται και για τα δύο του παχέος εντέρου και του καρκίνου του πνεύμονα loci ευαισθησία). Τέτοιες περιοχές είναι κατατοπιστική και εμείς τους που χρησιμοποιούνται για να ελεγχθεί εάν

Sluc

και

Scc

τόποι είναι πιο συχνά βρίσκονται μαζί στην ίδια χρωμοσωμική δότη περιοχή. Μέρος ενός χρωμοσώματος εμφανίζεται ως παράδειγμα. B. Η συχνή συν-εντοπισμό των

Sluc

και

Scc

τόπους που προσδιορίζονται ανεξάρτητα σε OCB και CCS RC στελέχη, αντίστοιχα (βλέπε επίσης Πίνακα 1 για λεπτομερείς θέσεις). * Θέσεις Χάρτης αυτά

Sluc

τόποι είναι ελαφρώς διαφορετική από τις θέσεις του ίδιου τόπων που φαίνεται στο Σχήμα 4, εφόσον έχουν αντιστοιχιστεί σε διαφορετικά στελέχη RC χρησιμοποιώντας διαφορετικούς δείκτες μικροδορυφόρων.

Η

Αρκετά εργαστήρια διεξάγεται παραγωγικά αναζητήσεων για κόλον [44] – [46] και του πνεύμονα [47] – [52] γονίδια ευαισθησίας στον καρκίνο. Ωστόσο, δεν θα μπορούσαμε να περιλαμβάνουν αυτές που δημοσιεύθηκαν τόπους ευαισθησίας του καρκίνου στο παρόν αναλύει γιατί οι υποψήφιες περιοχές περισσότεροι από αυτούς δεν μπορούν να οριστούν επακριβώς οι περιοχές δότη-στέλεχος σε στελέχη RC, έτσι ώστε η έκταση των επικαλύψεων τους, δεν μπορούν να αξιολογηθούν στατιστικά. Επίσης, η ανίχνευση του συν-εντοπισμό εξαρτάται από την ισχύ της δοκιμής χαρτογράφηση, η οποία είναι λιγότερο σε ολόκληρο σταυρούς γονιδίωμα σε σχέση με το RC διασχίζει [34]. Παρ ‘όλα αυτά, αυτά τα δεδομένα έδειξαν ότι η θέση ευαισθησίας του καρκίνου του παχέος εντέρου

Ccs1

ανιχνεύθηκε σε ICR × C57BL /6 αναδιασταύρωσης [44], χαρτογραφεί μόνο 1cm από τον τόπο καρκίνο του πνεύμονα αντίσταση

Μέρος 3

ανιχνεύθηκαν σε SMXA × Μια επαναδιασταυρώσεις [50] στο χρωμόσωμα ποντικού 12.

Ποντίκια Sluc loci συν-εντοπίζονται με ορθόλογα ποντικού του ανθρώπου και αρουραίου κόλον loci ευαισθησίας στον καρκίνο

συν-εντοπισμό του παχέος εντέρου και την επιδεκτικότητα καρκίνου του πνεύμονα σε γονίδια ποντίκι υποδηλώνει ότι πολλοί από αυτούς μπορεί να σχετίζονται ή ταυτόσημα. Ως εκ τούτου, διερευνώνται πιθανές ομοιότητες αυτού του ευρήματος στους ανθρώπους και αρουραίους (Σχήμα 6Α).

Α. Σχηματική αναπαράσταση του τμήματος του γονιδιώματος που χρησιμοποιούνται για την συν-εντοπισμό αναλύσεις. Η

Sluc

loci που αναλύθηκαν εδώ περιλαμβάνονται επίσης 2

Sluc

τόπους που προσδιορίζονται στο (CcS10 XCcS19) ποντίκια F2 και 1

CCS

τόπο [44] και 1

Par

τόπος [50] προσδιορίζονται από άλλη ομάδα. Β Διαειδική συσχέτιση μεταξύ του παχέος εντέρου και του καρκίνου του πνεύμονα ευαισθησία τόπους. Αυτό το σχήμα συνοψίζει όλες τις 21 ομάδες των τόπων του παχέος εντέρου και του καρκίνου του πνεύμονα ευαισθησία χαρτογραφηθεί σε στελέχη RC ποντίκι (πορτοκαλί για πνεύμονα, μπλε για παχέος εντέρου), του ανθρώπου του παχέος εντέρου (πράσινο) και του παχέος εντέρου αρουραίου (μοβ). Οι συστάδες στις οποίες οι τόποι του πνεύμονα και του παχέος εντέρου χαρτογραφηθεί μέσα σε 2,5 εκατοστά από την άλλη τονίζεται σε πλατείες. Οι περισσότεροι του παχέος εντέρου και του καρκίνου του πνεύμονα επιδεκτικότητα loci συν-Localize, με την εξαίρεση της ανθρώπινης 15q13 και 20p12.3 (κόλον), και αρουραίου

rCcr6

και

rCcr8

(κόλον). Ορθόλογες περιοχές του ανθρώπινου 18q21, 11q23 (παχέος εντέρου) και 5p15, 6p21 και 15q25 (πνεύμονα), και αρουραίος

rCcr1

,

rCcr4

και

rCcr9

(παχέος εντέρου) δεν είναι ενημερωτικό δεδομένου ότι δεν ελέγχθηκαν για πνεύμονα ή του κόλου επιδεκτικότητα σε στελέχη RC ποντικού. †

Pas1c

έχει επίσης ανιχνευθεί σε μας (CCS-10 × CCS-19) F2 σταυρό στο D6Mit177. Ανθρώπινο παχύ έντερο τόπο καρκίνο 3q21-q24 έχει αντιστοιχιστεί σε μια περιοχή 18MB και ορθόλογες σε δύο χρωμοσωμικές ποντίκι περιοχές: Chr.6 (

Pas1c

) και Chr.9 (

Sluc11

), αντίστοιχα. †† Δύο ανθρώπινου παχέος εντέρου ευαισθησία του καρκίνου τόπους συν-εντοπίζεται με ένα

Sluc

τόπο.

Η

Ανθρώπινο παχύ έντερο ευαισθησία του καρκίνου τόπους.

Γονιδίωμα-ευρύ μελέτες σύνδεσης και σύνδεσης σε ανθρώπους ανιχνεύεται loci 13 ευαισθησία για καρκίνο του παχέος εντέρου και τέσσερα για τον καρκίνο του πνεύμονα [2] – [10]. Τα ορθόλογα περιοχές 11 από τα 13 ανθρώπινων τόπων επιδεκτικότητα καρκίνου του παχέος εντέρου είναι πολυμορφικές στους OCB ή CCS στελέχη τα οποία δοκιμάστηκαν για ευαισθησία όγκου πνεύμονα. Παραδόξως, εννέα από αυτές τις 11 περιοχές που βρίσκονται κοντά σε ήδη εντοπιστεί

Sluc

τόπους (Εικόνα 6Β). Έξι είναι πολύ κοντά (0-2,5 cm): 8q24 /

Sluc25

, 9q22.2-31.2 /

Sluc23

, 10p14 /

Sluc16

, 3q21-24 /

Pas1c

-D6mit177 (ή

Sluc11

), 14q22.2 /

Sluc13

και 6q23-25 ​​(τόσο του παχέος εντέρου και του πνεύμονα) /

Scc14 /Sluc29

[2], [3], [5], [6], [8], [10], [11], [39], [42], [51]? Τρεις είναι σχετικά κοντά (5-7cM): 8q23.3 /

Sluc25

, 16q22.1 /

Sluc9

και 19q13.1 /

Sluc30

[8], [ ,,,0],10], [42]. Όχι

Sluc

θέση εντοπίστηκε κοντά ορθόλογα του 15q13 ή 20p12.3 [7], [8]. Το γεγονός ότι εννέα από τα 11 ανθρώπινου κόλον loci ευαισθησίας στον καρκίνο, του οποίου ορθόλογα έχουν δοκιμαστεί σε RC στελέχη ποντικού, χάρτης κατά μέσο όρο σε 3,3 cm από ένα

Sluc

τόπο, υποδηλώνει ότι ο καρκίνος του πνεύμονα και του παχέος εντέρου ευαισθησίας στον καρκίνο οι τόποι είναι επίσης σημαντικά συγκεντρωμένα στον άνθρωπο (

P

= 0,0015, διωνυμική δοκιμή διανομής).