PLoS One: Επικράτηση της Παθολογικής βλαστικές μεταλλάξεις του hMLH1 και hMSH2 Γονίδια σε παχέος Cancer


Αφηρημένο

Η επικράτηση των παθολογικών μεταλλάξεων βλαστικής σειράς σε καρκίνο του παχέος εντέρου έχει μελετηθεί ευρέως, όπως μεταλλάξεις βλαστική στα γονίδια επιδιόρθωσης του DNA

hMLH1

και

hMSH2

προσδίδουν υψηλό κίνδυνο καρκίνου του παχέος εντέρου. Ωστόσο, επειδή το μέγεθος του δείγματος και ο πληθυσμός των προηγούμενων μελετών είναι πολύ διαφορετικό από το άλλο, τα συμπεράσματα παραμένουν αμφιλεγόμενα. Στο έγγραφο αυτό, εφαρμόστηκαν βάσεις δεδομένων, όπως η PubMed για να αναζητήσετε σχετικές εργασίες. Τα δεδομένα που εισήχθησαν στην Περιεκτική Μετα-Ανάλυση V2, το οποίο χρησιμοποιήθηκε για την εκτίμηση της σταθμισμένης επικράτηση του

hMLH1

και

hMSH2

παθολογικές μεταλλάξεις και να συγκρίνουν τις διαφορές του επιπολασμού μεταξύ διαφορετικών οικογενειακές ιστορίες, εθνοτήτων και σχετικών παραγόντων. Η μελέτη αυτή που συλλέγονται και χρησιμοποιούνται τα δεδομένα από 102 έγγραφα. Στο Άμστερνταμ-κριτήρια θετική ομάδα, η επικράτηση των παθολογικών μεταλλάξεων βλαστικής σειράς του

hMLH1

και

hMSH2

γονίδια ήταν 28,55% (95% CI 26.04% -31.19%) και 19,41% (95 % CI 15,88% -23,51%), αντίστοιχα, και η επικράτηση των μεταλλάξεων βλαστικής σειράς στο

hMLH1

/

hMSH2

ήταν 15.44% /10.02%, 20.43% /13.26% και 15.43% /11.70 % σε χώρες της Ασίας, της Αμερικής πολυεθνικό και ευρωπαϊκό /Αυστραλίας πληθυσμών, αντίστοιχα. μεταλλάξεις υποκατάστασης αντιπροσώπευαν το μεγαλύτερο ποσοστό των μεταλλάξεων βλαστικής σειράς (

hMLH1

: 52.34%,

hMSH

2: 43,25%). Ο συνολικός επιπολασμός των μεταλλάξεων του

hMLH1

και

hMSH2

στο Άμστερνταμ-κριτήρια θετική, Άμστερνταμ-κριτήρια αρνητικά και σποραδικές του παχέος εντέρου ήταν γύρω στο 45%, 25% και 15%, αντίστοιχα, και εκεί δεν υπήρξαν εμφανείς διαφορές στον επιπολασμό της βλαστικής σειράς μεταλλάξεων μεταξύ των διαφορετικών εθνοτήτων

Παράθεση:. Li D, Χου F, Wang F, Cui Β, Dong Χ, Zhang W, et al. (2013) Ο επιπολασμός της Παθολογικής βλαστικές μεταλλάξεις του

hMLH1

και

hMSH2

Τα γονίδια για τον καρκίνο του παχέος εντέρου. PLoS ONE 8 (3): e51240. doi: 10.1371 /journal.pone.0051240

Συντάκτης: Amanda Ewart Toland, Πολιτειακό Πανεπιστήμιο του Οχάιο Medical Center, Ηνωμένες Πολιτείες της Αμερικής

Ελήφθη: 27 Ιουνίου 2011? Αποδεκτές: 5, Νοέμβρη του 2012? Δημοσιεύθηκε: 19 Μάρτη 2013

Copyright: © 2013 Li et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Αυτό το έργο υποστηρίχθηκε από επιχορηγήσεις από το Εθνικό Ίδρυμα Φυσικών Επιστημών της Κίνας (αριθμός Grant 30.671.801), το Ίδρυμα Harbin για το επιστρεφόμενο Scholars (αριθμός Grant 2005AFLXJ017), και το Γραφείο Υγείας της επαρχίας Heilongjiang (αριθμός Grant 2005-103). Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

Καρκίνος του παχέος εντέρου (CRC) είναι ένα σημαντικό παγκόσμιο πρόβλημα δημόσιας υγείας [1], και είναι η δεύτερη κύρια αιτία θανάτου από καρκίνο στις αναπτυγμένες χώρες. Στις αναπτυσσόμενες χώρες, CRC αντιπροσωπεύει την έκτη ή έβδομη κύρια αιτία θανάτου από καρκίνο [2].

Εκτιμάται ότι κληρονομικό μη-πολυποειδούς ορθοκολικού καρκίνου (HNPCC) αντιπροσωπεύει κάπου μεταξύ λιγότερο από 1% έως 13% [3] [4], του παχέος εντέρου, το οποίο η πιο κοινή κληρονομούμενη σύνδρομο CRC κάνουν [5], [6]. HNPCC χαρακτηρίζεται από αυτοσωμική επικρατής κληρονομικότητα της πρώιμης έναρξης ορθοκολικό καρκίνο, η οποία συνδέεται με επιπλέον κολονική κακοήθειες, όπως ενδομητρίου, ουρολογικές και του άνω γαστρεντερικού καρκίνους [7]. Δεν υπάρχει χαρακτηριστικό φαινότυπο που σχετίζονται με HNPCC, και η διάγνωση της εξαρτάται από την αναγνώριση ενός ισχυρό οικογενειακό ιστορικό ενδεικτικό της δεσπόζουσας κληρονομιά [8].

HNPCC, επίσης γνωστή ως σύνδρομο Lynch (LS), προκαλείται από μια μετάλλαξη βλαστικής σειράς στην επισκευή αναντιστοιχία DNA (MMR) γονιδίων [9], [10]. Ένα κανονικό λειτουργικό σύστημα MMR μπορεί να αναγνωρίσει και να διορθώσει τις αναντιστοιχίες ζευγών βάσεων και μικρών νουκλεοτιδίων (1-4 ζεύγη βάσεων) μεταλλάξεις εισαγωγής /διαγραφής, η οποία είναι απαραίτητη για τη διατήρηση της γονιδιωματικής σταθερότητας [11].

Υπάρχουν τουλάχιστον πέντε βλαστική μεταλλάξεις στα γονίδια επιδιόρθωσης του DNA που μπορεί να προκαλέσει το σύνδρομο Lynch, συμπεριλαμβανομένων των

hMLH1

,

hMSH2

,

hMSH6

,

hPMS1

και

hPMS2

[12] – [17]. Μεταλλάξεις στο

hMLH1

και

hMSH2

αντιπροσωπεύουν την πλειοψηφία των περίπτωση του συνδρόμου Lynch [18].

Το

hMSH2

γονίδιο, το οποίο είναι ένα συστατικό της οδού DNA επιδιόρθωσης αταίριαστων βάσεων, ήταν ο πρώτος γονίδιο που ταυτοποιείται ότι σχετίζεται με HNPCC. Χρησιμεύει ως «προσκοπικό» που αναγνωρίζει και συνδέεται άμεσα με την αλληλουχία DNA αταίριαστων [19], [20] και μπορούν να σχηματίσουν ένα ετεροδιμερές με

hMSH6

όταν μία μόνο αναντιστοιχία ζεύγους βάσεων έχει αναγνωριστεί ή με

hMSH3

αν υπάρχουν δυο να οκτώ εισαγωγές ή απαλοιφές νουκλεοτιδίου [11].

Ο

hMLH1

πρωτεΐνη γονιδιακό προϊόν είναι επίσης ένα συστατικό του μονοπατιού επιδιόρθωσης αταίριαστων βάσεων του DNA, η οποία έχει αποδειχθεί για να σχηματίσουν ένα ετεροδιμερές με το

hMLH3

,

hPMS2

και

hPMS1

γονίδια. Ωστόσο, αυτή η πρωτεΐνη έχει άγνωστη ενζυματική δράση και πιθανόν δρα σαν ένα «μοριακό προξενητής» που προσλαμβάνει άλλες πρωτεΐνες επιδιόρθωσης DNA στο σύμπλοκο επιδιόρθωσης αταίριαστων βάσεων [21].

Από την

hMLH1

και

hMSH2

γονίδια βρέθηκαν σε ανθρώπους, ο επιπολασμός της βλαστικής σειράς μεταλλάξεων έχει μελετηθεί ευρέως όχι μόνο στην περίπτωση του καρκίνου του παχέος εντέρου με μια υποβλητική οικογενειακό ιστορικό, αλλά και σε σποραδικά καρκίνο του παχέος εντέρου. Ωστόσο, τα αποτελέσματα των μελετών αυτών είναι ασυνεπής, επειδή τα μεγέθη των δειγμάτων ήταν μικρό, και τα εθνικό υπόβαθρο μεταβάλλονταν [22] – [24]. Ως εκ τούτου, μια συστηματική ανασκόπηση και μετα-ανάλυση είναι απαραίτητη για να προβεί σε συστάσεις για γενετικές εξετάσεις με βάση το οικογενειακό ιστορικό και τη βάση για την πρόληψη, την έγκαιρη διάγνωση και θεραπεία του καρκίνου του παχέος εντέρου.

Μέθοδοι

1 . κριτήρια στρατηγική αναζήτησης και επιλογής

Βάσεις δεδομένων, συμπεριλαμβανομένων των PubMed, Embase και Cochrane Library, εφαρμόστηκαν για να αναζητήσετε σχετικές εργασίες που δημοσιεύθηκαν από Ιανουάριος 1993-Μάρτιος 2011 με τις ακόλουθες λέξεις-κλειδιά:

hMLH1

,

hMSH2

, μετάλλαξη, κληρονομικό μη-πολυποειδούς ορθοκολικό καρκίνο, καρκίνο του παχέος εντέρου ή /και καρκίνωμα, όγκο ή νεόπλασμα. Επιλέξει χαρτιά περιορίζονταν σε αυτές που δημοσιεύθηκαν στα αγγλικά και πληρούν τα ακόλουθα κριτήρια επιλογής: 1) χαρτί αξιολόγηση μόνο ένα συγκεκριμένο τύπο μετάλλαξης ή αποκλείστηκαν μόνο συγκεκριμένες περιοχές των γονιδίων? 2) οι μεταλλάξεις έπρεπε να είναι βλαστική μεταλλάξεις με παθολογικά χαρακτηριστικά, αλλά όχι σωματικά, εξαιρέθηκαν μελέτες που αποκάλυψαν σωματικές αλλοίωση της παρουσίας MMR γονίδια? 3) εκθέσεις περίπτωση αποκλείστηκαν? 4) επαναλαμβανόμενες εκθέσεις ενωμένη χρησιμοποιώντας την τελευταία ή την μεγαλύτερη έκδοση? 5) έρευνα για τον πολυμορφισμό αποκλείστηκε? 6) ασθενείς με σύνδρομο Lynch με γνωστές μεταλλάξεις γονιδίων MMR αποκλείστηκαν? 7) ο ασθενής ανίχνευση περιορίστηκε σε μια διάγνωση του καρκίνου του παχέος εντέρου και όχι άλλα που σχετίζονται με τον καρκίνο σύνδρομο Lynch, όπως ο καρκίνος του ενδομητρίου. Η συγκεκριμένη διαδικασία της επιλογής μελέτη έχει δείξει στο σχήμα S4 στην υποστήριξη των πληροφοριών.

2. Ταξινόμηση των οικογενειακό ιστορικό και η εθνικότητα

Έχουμε κατηγοριοποιούνται ασθενείς με ορθοκολικό καρκίνο που πληρούσαν τα αυστηρά κριτήρια του Άμστερνταμ (Ι ή ΙΙ) [25], όπως το Άμστερνταμ-κριτήρια θετική ομάδα (AC +). Ασθενείς χωρίς οικογενειακό ιστορικό καρκίνου, ανεξάρτητα από την ηλικία έναρξης, ταξινομήθηκαν στην σποραδική ομάδα καρκίνου. Άλλοι που είχαν οικογενειακό ιστορικό, αλλά δεν είναι απολύτως σύμφωνα με τα κριτήρια του Άμστερνταμ ορίστηκαν ως το Άμστερνταμ-κριτήρια αρνητική ομάδα (AC-). Επιπλέον, έχουμε το όνομά τους ασθενείς με διφορούμενη οικογενειακό ιστορικό ή εκείνους που δεν έχουν αρκετές πληροφορίες για να καταταγούν εκ νέου και πάλι, όπως το οικογενειακό ιστορικό δεν είναι σαφές ομάδα.

Επειδή οι πληροφορίες σχετικά με την εθνικότητα των ασθενών δεν ήταν καλά -defined, έπρεπε να καθορίσει την εθνικότητα βασίζεται σε ηπείρους, συμπεριλαμβανομένης της Ασίας, της Αμερικής πολυεθνική, Ευρωπαϊκό /Αυστραλίας ή μικτών εθνικοτήτων (μερικές μελέτες δεν προσφέρουν αυτό το είδος των δεδομένων ή τα δεδομένα που περιλαμβάνονται αμερικανικές, ευρωπαϊκές και Αυστραλίας).

3. κατάσταση MSI και την κατηγορία

Εάν περισσότερο από το 30% των συνήθως χρησιμοποιούνται δείκτες μικροδορυφορικού δείχνουν αστάθεια, ο όγκος θα πρέπει να θεωρείται MSI-υψηλής. MSI-σταθερό (MSS) ορίζεται ως απουσία δείκτες παρέχουν ενδείξεις αστάθειας [26], [27]. Σε αντίθετη περίπτωση, ο όγκος ορίζεται ως MSI-χαμηλό. Για τους ασθενείς χωρίς πληροφορίες σχετικά με την κατάσταση μικροδορυφόρων, που τα έχει χαρακτηρίσει MSI-που δεν προσδιορίζονται. Επιπλέον ορίζουμε μελέτες που συνδυάζεται MSI-υψηλής και MSI-χαμηλή όγκους, όπως MSI.

4. Προσδιορισμός της παθογένειας

Έχουμε καθορίσει την παθογένεια των μεταλλάξεων κυρίως με τρεις μεθόδους σε συνδυασμό. Πρώτον, αναβάλλεται για τις ερμηνείες των αρχικών εγγράφων και του παθογόνου ορισμός περιλαμβάνει: μετάλλαξη μετατόπισης πλαισίου που θα προβλέπεται να οδηγήσει σε μια κολοβωμένη πρωτεΐνη? μεταλλάξεις ανοησίες? νοηματικές μεταλλάξεις εξακριβωθεί με μια λειτουργική δοκιμασία? μεγάλων γονιδιωματικών εξαλείψεις που αφαιρείται τουλάχιστον ένα εξόνιο? ή επανάληψη των εξόνιο, με διαχωρισμό της αλλοίωσης με καρκίνο στο συγγενικό κύκλο [28]. Δεύτερον, χρησιμοποιήσαμε την αναλυτική PolyPhen πρόγραμμα για να προβλέψει αυτή τη μετάλλαξη να είναι παθογόνα [29], Αν PolyPhen βαθμολογίας & gt? 2.0 τότε η αλλαγή αυτή αναμένεται να επηρεάσει τη λειτουργία της πρωτεΐνης. Τελευταία, ελέγξαμε δύο ιστοσελίδες, συμπεριλαμβανομένων «Διεθνής Εταιρεία για Γαστρεντερικές Κληρονομική Όγκοι Incorporated (Insight) (www.insight-group.org/mutations/)» και «MMR Gene Αταξινόμητα Παραλλαγές Database (www.mmruv.info)» να καθορίσουν την περαιτέρω παθογένειας . Για να εφαρμόσετε λειτουργικές δοκιμασίες θα είναι πιο ακριβή και αντικειμενική κατά τη δοκιμή παραλλαγές εσφαλμένου νοήματος για την παθογένεια. Αλλά πολλά άρθρα δεν μπορούσε να κάνει αυτό οφείλεται σε διάφορους περιορισμούς? Ορισμένες μελέτες διακρίνονται μεταξύ παθολογικές αλλαγές με πολυμορφισμό ή προσδιορίζεται παθογένεια όταν οι ίδιες παραλλαγές ιδρυτικό στον πληθυσμό ελέγχου. Στη βάση δεδομένων Insight », ανέφερε παθογένεια» της κατηγοριοποιήθηκε ως αναφέρθηκε παθογόνων ή πιθανώς παθογόνων και «κατέληξε παθογένεια» ήταν άγνωστη. Εμείς τότε θεωρείται ως αναφερόμενη παθογένεια, σύμφωνα με τα αποτελέσματα αυτά. Σε μας μετα-ανάλυση, που κατηγοριοποιούνται εκείνες που αναφέρθηκαν παθογόνων μεταλλάξεων ή πιθανώς παθογόνων συνάντηση ο ορισμός ως παθογόνων μεταλλάξεων.

5. Εξαγωγή δεδομένων

Δύο ερευνητές (Dandan Li και Fulan Hu) ανεξάρτητα εξαγόμενα δεδομένα και να ελέγχονται όλες οι διαφορές στις μεταβλητές έως ότου επετεύχθη συμφωνία σε όλα τα θέματα. Πληροφορίες όπως η πρώτη συγγραφέας, που δημοσιεύθηκε χρόνια, την ήπειρο, τη χώρα, το οικογενειακό ιστορικό, θέσεις μετάλλαξης, είδη μετάλλαξη, και φαινότυπο MSI και μεθόδους ανίχνευσης συλλέχθηκε από κάθε άρθρο.

6. Η στατιστική ανάλυση

Τα δεδομένα εισήχθησαν στην Περιεκτική Μετα-Ανάλυση V2, η οποία υπολογίζεται ο σταθμισμένος επιπολασμό και σε σύγκριση με τη διαφορά της επικράτησης μεταξύ των σχετικών παραγόντων. Εφαρμόστηκε Ένα σημαντικό επίπεδο α 0.05. Για πολλαπλές δοκιμές, ένα επίπεδο α 0,05 ρυθμίστηκε σε α διαιρείται με τον αριθμό των πολλαπλών δοκιμών. Ετερογένεια μεταξύ των μελετών αξιολογήθηκε με μετα-παλινδρόμησης και I

2 στατιστικών στοιχείων. I

2 στατιστικά στοιχεία που περιλαμβάνονται 25, 50 και 75 που αντιστοιχούν σε χαμηλής, μέσης και υψηλής ετερογένειας, αντίστοιχα [30]. Αν

2 ≤50 σε συνδυασμό με τα χαρακτηριστικά των δεδομένων [31], χρησιμοποιήθηκε το μοντέλο σταθερών επιδράσεων. Διαφορετικά, εγκρίθηκαν τυχαία εφέ μοντέλα. Η προκατάληψη δημοσίευση εκτιμήθηκε οπτικά χρησιμοποιώντας ένα οικόπεδο χωνί. Η μέθοδος rank συσχέτιση προτείνεται από Begg [32] και την προσέγγιση γραμμικής παλινδρόμησης προτείνει Egger et al. [33], [34] χρησιμοποιήθηκαν για να αναλύσει ποσοτικά την πιθανή προκατάληψη δημοσίευση.

Αποτελέσματα

Μετά το φιλτράρισμα για δυνητικά σχετική παραπομπή, υπήρχαν 796 περιλήψεις ανακτηθεί. Στη συνέχεια, εξαιρούνται εκείνες τις μελέτες που δεν είχαν σαφή δεδομένα ανίχνευση γονιδιακής μετάλλαξης. Τέλος, συνολικά 279 άρθρα για

hMLH1

και

hMSH2

βλαστική μεταλλάξεις σε καρκίνο του παχέος εντέρου αναζητήθηκαν σε ηλεκτρονική βάση δεδομένων. Ωστόσο, υπήρχαν μόνο 102 έγγραφα που περιλαμβάνονται σε αυτή τη μελέτη [6], [8], [24], [26], [35] – [132] με βάση τα κριτήρια επιλογής. Μια σαφής οικογενειακό ιστορικό δόθηκαν σε 82 από αυτά τα έγγραφα. Η ανιχνεύεται πληθυσμού προήλθε από Ασίας, της Αμερικής, της Ευρωπαϊκής /Αυστραλίας και της μικτής εθνικής πληθυσμούς σε 22, 11, 63 και 6 χαρτιά, αντίστοιχα. Τα βασικά χαρακτηριστικά του περιλαμβάνονται άρθρα που παρουσιάζονται στον Πίνακα S1 στην υποστήριξη των πληροφοριών.

1. Ο επιπολασμός της βλαστικής σειράς παθολογικών μεταλλάξεων σε διαφορετικές οικογενειακές ιστορίες

Συνολικά, 861 του 7057 και 698 του 7096 παχέος περιπτώσεων καρκίνου που αναφέρθηκαν είχαν

hMLH1

και

hMSH2

μεταλλάξεις γονιδίων, αντίστοιχα . Επιπροσθέτως, 1526 του 6965 περιπτώσεις είχε μια μετάλλαξη σε ένα γονίδιο ή την άλλη όταν υποβλήθηκαν σε διαλογή δύο γονίδια

Η υψηλότερη επικράτηση των παθολογικών μεταλλάξεων βλαστικής σειράς σημειώθηκε στην ομάδα + AC και ήταν 28,55% (95% CI 26.04%. – 31.19%) και 19,41% (95% CI 15,88% -23,51%) στις

hMLH1

και

hMSH2

γονίδια (

P

= 0.00 & lt? 0.05), αντίστοιχα . Η επικράτηση της ομάδας AC- ήταν 16,70% (95% CI 14,53% -19,13%) και 11,30% (95% CI 9,49% -13,42%) (

P

= 0.00 & lt? 0.05), αντίστοιχα. Στην σποραδικές ομάδα του καρκίνου, η συχνότητα των μεταλλάξεων ήταν 8,72% (95% CI 6,12% -12,29%) και 7,28% (95% CI 5,12% -10,26%) (

P

= 0,47 & gt? 0,05) (Τραπέζι 1). Υψηλή ετερογένεια μεταξύ των περιελάμβανε όλες τις μελέτες παρατηρήθηκε σε δύο

hMLH1

2 = 80,10%) και

hMSH2

2 = 79.98%) σε όλες του παχέος εντέρου . Ωστόσο, η ετερογένεια ήταν σε ένα αποδεκτό επίπεδο για τα δύο γονίδια στις τρεις υποομάδες με σαφείς οικογενειακό ιστορικό (Πίνακας 1).

Η

Ο συνολικός επιπολασμός των παθολογικών μεταλλάξεων των δύο γονιδίων »σε χαρτιά που ανιχνεύονται και τα δύο αυτά ήταν 44.70% (95% CI 39.13% -50,40%), 24,65% (95% CI 20.37% -29,50%), 11,56% (95% CI 7,11% -18,23%) και 17,02% (95% CI 11,24% – 24,93%) στις AC +, AC-, σποραδικό καρκίνο και το οικογενειακό ιστορικό δεν είναι σαφές ομάδες, αντίστοιχα (

P

= 0.00 & lt?. 0,05) (Πίνακας 2)

Η

2. Η επικράτηση των παθολογικών μεταλλάξεων βλαστικής σειράς σε διαφορετικές εθνότητες

Στο

hMLH1

γονίδιο, η επικράτηση των παθολογικών μεταλλάξεων βλαστικής σειράς στο AC + ομάδας κυμάνθηκε από 25,64% σε 32,94% στις τέσσερις εθνότητες αξιολογήθηκαν (

P

= 0,48 & gt? 0,05). Στην AC- ομάδα, κυμαίνονταν από 14,88% έως 17,35% (

P

= 0,99 & gt? 0,05), και κυμαίνονταν από 3,21% έως 16,71% (

P

= 0,13 & gt? 0,05) στην ομάδα σποραδικές καρκίνου (Πίνακας 1).

στο

hMSH2

γονίδιο, ο επιπολασμός μετάλλαξη κυμάνθηκε από 17,56% έως 33,78% στην AC + ομάδα, από 10,33% έως 20,60% στην ομάδα της AC- και από 3,64% έως 21,90% στο σποραδικό καρκίνο ομάδα (AC +:

P

= 0.00 & lt? 0,05? AC-:

P

= 0,91 & gt? 0,05? σποραδικές :

P

= 0.00 & lt? 0,05) στις τέσσερις εθνότητες αξιολογούνται. Στο AC + και σποραδικές ομάδα του καρκίνου, διαφορές παρατηρήθηκαν στην ομάδα μικτών εθνικοτήτων σε σύγκριση με το ευρωπαϊκό /αυστραλιανή ομάδα (

P

= 0.000 & lt? 0.007) και στην ομάδα της Ασίας σε σύγκριση με την μικτή ομάδα εθνοτήτων (

P

= 0.000 & lt?. 0.007), αντίστοιχα (Πίνακας 1)

Αναφέρεται στα άρθρα που είχαν τόσο γονίδιο που εντοπίστηκαν, στην AC + ομίλου, το συνολικό επιπολασμό μετάλλαξη του

hMLH1

και

hMSH2

για Ασίας, της Αμερικής πολυεθνική, Ευρωπαϊκή /Αυστραλίας και μικτών εθνικοτήτων ήταν 38.01%, 54.02%, 42.59% και 66.09%, αντίστοιχα (Πίνακας 2). Στην AC- ομάδα, η επικράτηση ήταν περίπου 25% (

P

= 0,83 & gt? 0,05). Σε σποραδικές περιπτώσεις, υπήρχε ένα ευρύ φάσμα και διαφορά στην επικράτηση (από 5,31% έως 37,63%,

P

= 0,00 & lt? 0,05) (Πίνακας 2). Υπήρχαν προφανείς διαφορές μεταξύ αυτών των εθνοτήτων στην AC + και σποραδικές ομάδες του καρκίνου (όλοι είχαν

P

= 0.000 & lt? 0.007). Περαιτέρω ανάλυση έδειξε ότι οι διαφορές παρατηρήθηκαν στις ασιατικές σύγκριση με μικτών εθνικοτήτων και ευρωπαϊκή /Αυστραλίας έναντι μικτών εθνικοτήτων. Δεν παρατηρήθηκαν διαφορές μεταξύ των τριών σαφές εθνοτήτων.

3. Η κατανομή μετάλλαξη σε διαφορετικά εξώνια

Όλα τα εξώνια σε αυτά τα δύο γονίδια έδειξαν μεταλλάξεις. Η υψηλότερη μετάλλαξη επικράτηση του 3,62% βρέθηκε στο εξόνιο 16 του

hMLH1

γονίδιο, με 2,19 μεταλλάξεις /100 bp, η οποία, παραδόξως, αντιπροσώπευαν το 16,36% του συνόλου των μεταλλάξεων. Εκτός από το εξώνιο 16, ο επιπολασμός της μετάλλαξης ήταν υψηλότερη στο εξόνιο 2, το εξόνιο 6, το εξόνιο 8, το εξόνιο 12, το εξόνιο 13 και εξόνιο 19. Μεταλλάξεις σε αυτά τα επτά εξόνια (συμπεριλαμβανομένων exon16) αντιπροσώπευαν 55,45% του συνόλου των μεταλλάξεων. Στο

hMSH2

γονίδιο, ο επιπολασμός μετάλλαξη και πυκνότητες σε διαφορετικά εξώνια ήταν γενικά χαμηλότερες από εκείνες του

hMLH1

γονίδιο. Η υψηλότερη επικράτηση της μετάλλαξης ήταν 2,62% στο εξόνιο 7. Εκείνοι στο εξόνιο 3, το εξόνιο 5, εξόνιο 11 και εξόνιο 12 ήταν επίσης υψηλότερες από ό, τι σε άλλα εξώνια. Το σύνολο των μεταλλάξεων σε αυτά τα πέντε εξόνια αντιπροσώπευαν 53,39% του συνόλου των μεταλλάξεων (πίνακας 3).

Η

4. Οι τύποι μετάλλαξη

Όπως φαίνεται στον Πίνακα 4, υπήρχαν τρεις βασικοί τύποι των μεταλλάξεων του γονιδίου, συμπεριλαμβανομένων των αντικαταστάσεων (με συμπερίληψη της μετάβασης και της μεταστροφής), διαγραφές ή προσθήκες και μεγάλα γονιδιωματικής αναδιατάξεις. Υποκατάσταση αντιπροσώπευαν το 60,97% και το 53,77% του συνόλου των τριών σημειακών μεταλλάξεων στο

hMLH1

και

hMSH2

γονίδιο, αντίστοιχα. Η επόμενη υψηλότερη ήταν η διαγραφή, η οποία αντιπροσώπευε το 24,15% και το 36,98% του συνόλου, αντίστοιχα.

Η

5. κατάσταση MSI και την επικράτηση των μεταλλάξεων βλαστικής σειράς

MSI-υψηλή φαινότυπο, ο επιπολασμός μετάλλαξη στο

hMLH1

γονιδίου ήταν 29,84% (95% CI 22,43% -38,48%), 22,03% (95 % CI 13,66% -33,53%) και 18,34% (95% CI 9,39% -32,72%) σε AC +, AC- και τον καρκίνο σποραδικές, αντίστοιχα. Η επόμενη υψηλότερη επικράτηση μετάλλαξη ήταν στα MSI-χαμηλά και MSS ομάδες. Δεν υπήρχαν στατιστικά σημαντικές διαφορές μεταξύ των διαφόρων οικογενειακές ιστορίες σε όλες αυτές τις τρεις κατηγορίες φαινότυπο MSI (

P

ήταν 0,25, 0,41 και 0,93, αντίστοιχα).

Η επικράτηση μετάλλαξη στο

hMSH2

γονιδίου ήταν επίσης η υψηλότερη στην AC + (26.81% 95% CI 19,02% -36,35%), ακολουθούμενη από AC- (24,84%, 95% CI 16,14% -36,21%) και σποραδικό καρκίνο (7,46%, 95% CI 2,64% -19,34%) με MSI-υψηλή φαινότυπο, με οριακή στατιστικές διαφορές (

P

= 0,04 & lt? 0,05). Θήκες με MSS εκδηλώθηκε το χαμηλότερο επιπολασμό των μεταλλάξεων στην διαφορετική ομάδα οικογενειακό ιστορικό (

P

= 0,48 & gt? 0,05). Η επικράτηση στην MSI-χαμηλή ήταν μέτρια (

P

= 0,98 & gt? 0,05). (Πίνακας 5)

Η

Στα άρθρα που ανιχνεύονται και τα δύο γονίδια, ο επιπολασμός της μετάλλαξης ήταν η υψηλότερη σε AC + (53.41%, 95% CI 38.02% -68,17%), ακολουθούμενη από AC- (38.80%, 95% CI 27,87% -50,98%) και σποραδικό καρκίνο (22,54%, 95% CI 12,55% -37,11%) με MSI-υψηλής φαινότυπο (

P

= 0,02 & lt? 0,05). Αυτά ακολουθήθηκαν από τις περιπτώσεις με MSI-χαμηλά και MSS στην διαφορετική ομάδα οικογενειακό ιστορικό (

P

& gt? 0,05).

6. Επικράτηση των μεταλλάξεων βλαστικής σειράς σε διαφορετικό θέμα επιλέξτε τη ρύθμιση

Υπήρχαν 28 με βάση τον πληθυσμό άρθρα σειρές και 29 είδη της σειράς κλινική που βασίζεται αξιολογήθηκαν σε αυτή τη μελέτη. Στο

hMLH1

γονίδιο, ο επιπολασμός μετάλλαξη ήταν 12.49 (95% CI 8,65 – 17,71) στην ομάδα πληθυσμού που βασίζεται και 17.39 (95% CI 13,62 – 21,93) στην ομάδα κλινική που βασίζεται (

P

= 0,13). Στο

hMSH2

γονίδιο, ο επιπολασμός μετάλλαξη ήταν 10,50% (95% CI 6,94% -15,59%) και 12.03% (95% CI 8,47% -16,80%), αντίστοιχα (

P

= 0,62) (Πίνακας S5 σε πληροφορίες υποστήριξης). Να εξετάσει περαιτέρω τη διαφορά σε κάθε ομάδα οικογενειακό ιστορικό, δεν υπήρχαν σημαντικές στατιστικές σε οποιαδήποτε ομάδα.

7. Επικράτηση του

hMLH1

και

hMSH2

γονίδιο περιοχή ιντρονίου βλαστική μετάλλαξη

Τα αποτελέσματα μας διαπίστωσε ότι η υψηλότερη συχνότητα ιντρονική μετάλλαξη στην ομάδα AC + ήταν 8,49% (95% CI 6,43% -11,13%) και 5,42% (95% CI 3,82% -7,64%) στο

hMLH1

και

hMSH2

γονίδια, αντίστοιχα. Η επικράτηση της ομάδας AC- ήταν 4,15% (95% CI 2,75% -6,23%) και 4,01% (95% CI 2,57% -6,21%), αντίστοιχα. Στον καρκίνο σποραδικές, ο επιπολασμός των μεταλλάξεων ήταν 5,81% (95% CI 3,04% -10,84%) και 5,51% (95% CI 2,76% -10,68%), αντίστοιχα (Πίνακας S6 στην υποστήριξη των πληροφοριών). Και δεν υπήρχαν διαφορές μεταξύ των διαφορετικών εθνοτήτων είτε γονίδιο (

hMLH1

:

P

= 0,78 σε AC +,

P

= 0,12 σε AC-,

P

= 0,38 σε καρκίνο σποραδικές?

hMSH2

:

P

= 0,44 σε AC +,

P

= 0,41 σε AC-,

P

= 0,58 στον καρκίνο σποραδικές) (Πίνακας S6 σε πληροφορίες υποστήριξης).

8. προκατάληψη δημοσίευση

Χωνί οικόπεδα του επιπολασμού της παθολογικής μετάλλαξης σε αυτά τα δύο γονίδια τόσο γενικά όσο και με διαφορετικές οικογενειακές ιστορίες έδειξε κάποια έκταση της ασυμμετρίας, με μικρές μελέτες σχετικά με την αριστερή πλευρά του οικοπέδου (Σχήμα S1, S2 και S3 σε πληροφορίες υποστήριξης). Τα αναλυτικά αποτελέσματα της παλινδρόμησης Egger, μια συσχέτιση Begg και ανάλυση «Περικοπή και Fill» για διάφορες οικογενειακές ιστορίες με αυτά τα δύο γονίδια, τόσο χωριστά όσο και από κοινού, παρουσιάζονται στον Πίνακα 6.

Η

Συζήτηση

με βάση μια συστηματική ανασκόπηση και μετα-ανάλυση, βρήκαμε ότι ο συνολικός επιπολασμός μετάλλαξη του

hMLH1

και

hMSH2

σε ασθενείς που έχουν και τα δύο γονίδια που προβλήθηκε ήταν 44.70%, 24.65% και 11,56% στο AC +, AC- και σποραδικές ομάδες του καρκίνου, αντίστοιχα. Ωστόσο, οι αναφερόμενες μεταλλάξεις σε αυτά τα δύο γονίδια ήταν πολύ διαφορετικά σε σύνδρομο Lynch [6], [48], [59]. Ένας λόγος για τη διαφορά ήταν ότι περιορίσαμε την περιοχή μετάλλαξης σε εξώνια και τον τύπο μετάλλαξης στην παθογένεια, η οποία μας επέτρεψε να παρέχει πιο σταθερά αποτελέσματα επικράτηση μετάλλαξη εκτελώντας μια συστηματική ανασκόπηση και μετα-ανάλυση.

Παρά το γεγονός ότι τα έγγραφα σχετικά με μεταλλάξεις σε διαφορετικές εθνότητες έχουν δημοσιευθεί, υπάρχουν αναφορές έχουν περιγράψει ρητώς οποιεσδήποτε διαφορές μεταξύ τους. Η ανάλυσή μας διαπίστωσε ότι δεν υπήρχε σημαντική στατιστική διαφορά μεταξύ αυτών των τεσσάρων εθνικοτήτων με διαφορετικές οικογενειακές ιστορίες σε όλη δύο γονίδια, είτε χωριστά είτε από κοινού.

Αν και βάσης δεδομένων Insight έχουν συλλέξει πληροφορίες σχετικά με τις νέες μεταλλάξεις σε διαφορετικά εξώνια, μερικά έγγραφα ή ιστοσελίδες παρέχονται πληροφορίες σχετικά με το εξόνιο ειδικά επικράτηση και λεπτομερής τύπους μετάλλαξης. Τα αποτελέσματά μας έδειξαν ότι μια αξιοσημείωτη υψηλό επιπολασμό της μετάλλαξης συνέβη στο εξώνιο 16. Ήταν, επίσης, να σημειωθεί ότι οι μεταλλάξεις στο εξόνιο 16 και εξόνιο 2 συγκεντρώθηκαν κυρίως σε c.1852_1854delAAG και c.199G & gt? Α, η οποία αντιπροσώπευε το 37,78% και το 29,03% των μεταλλάξεων, αντίστοιχα (τα δεδομένα δεν παρουσιάζονται). Στις

hMSH2

, η υψηλότερη επικράτηση μετάλλαξη βρέθηκε στο εξόνιο 7. Τα συνολικά μεταλλάξεις στο εξόνιο 3, το εξόνιο 5, εξόνιο 7, το εξόνιο 11 και εξόνιο 12 ανήλθε σε 53,39% του συνόλου (Πίνακας 3). Ως εκ τούτου, κατά την εκτέλεση

hMLH1

και

hMSH2

δοκιμές γονιδιακής μετάλλαξης, θα ήταν σημαντικό να εστιάσουμε την προσοχή σε αυτά τα εξώνια και κοινά σημεία μετάλλαξης τους.

Σε Wei W. et al. [133], τρεις μεταλλάξεις (εξόνιο 8 c.649C

& gt?

Τ, εξόνιο 14 c.1625A

& gt?

Τ και το εξόνιο 15 c.1721T

& gt?

Γ) στο

hMLH1

και τέσσερις μεταλλάξεις (εξόνιο 1 c.23C

& gt?

Τ και c.187dupG, εξόνιο 3 c.505A

& gt?

G και το εξόνιο 7 c.1168C

& gt?

Τ) στο

hMSH

2 είχε πολύ υψηλότερο επιπολασμό στους ασιατικούς πληθυσμούς σε σχέση με τους ευρωπαϊκούς πληθυσμούς. Επιπλέον, τρεις μεταλλάξεις (εξόνιο 13 c.1453G

& gt?

C, εξόνιο 16 c.1742C

& gt?

Τ και c.1758dupC) στο

hMLH1

και δύο ( εξόνιο 7 c.1255C

& gt?

Α και το εξόνιο 12 c.1886A

& gt?

G) στο

hMSH2

βρέθηκαν μόνο στο ασιατικό πληθυσμό της, πράγμα που σημαίνει ότι συγκεκριμένες μεταλλάξεις σε αυτόν τον πληθυσμό θα πρέπει να επισημανθεί, όταν ο έλεγχος για μεταλλάξεις σε αυτά τα δύο γονίδια.

τα αποτελέσματα μας έδειξαν ότι ο κύριος τύπος μετάλλαξης και των δύο γονιδίων ήταν υποκατάστασης και διαγραφής. Η υποκατάσταση ενός νουκλεοτιδίου θα μπορούσε να οδηγήσει σε παρανοηματική, ανοησίες και σιωπηλές μεταλλάξεις, ενώ η διαγραφή και παρεμβολή συνήθως οδηγούν σε μετατόπιση πλαισίου. Δεν υπήρχαν διαφορές στον τύπο μετάλλαξης από την εθνότητα στην

hMSH2

(διαγραφή

P

= 0,18 & gt? 0,05? εισαγωγής

P

= 0,11 & gt? 0,05? υποκατάστασης

P

= 0,85 & gt? 0.05), αλλά υπήρχαν στο

hMLH1

γονίδιο. Για την εισαγωγή, διαφορές υπήρχαν μεταξύ της Ασίας και της Ευρωπαϊκής /Αυστραλίας πληθυσμών τους (

P

= 0.00 & lt? 0,05). μεταλλάξεις εισαγωγής αντιπροσώπευε μεγαλύτερο ποσοστό στις ασιατικές πληθυσμού της από ό, τι στην Ευρωπαϊκή /Αυστραλίας πληθυσμού (Πίνακας 4 και Πίνακας S4 στην υποστήριξη των πληροφοριών).

Αυτά τα αποτελέσματα έδειξαν ότι όχι μόνο σημειακές μεταλλάξεις εμφανίστηκαν συχνά σε καρκίνο του παχέος εντέρου, αλλά και μεγάλων γονιδιωματικών αναδιατάξεις ήταν παρόντες σε κάποιο βαθμό. Αρχικά, οι μέθοδοι ανίχνευσης για μεγάλων γονιδιωματικών αναδιατάξεων ήταν κυρίως ανάλυση Southern [115] και η ανάλυση μετατροπή [18]. Πρόσφατα, περισσότερο ευαίσθητη ανάλυση MLPA διεξήχθη για ασθενείς οι οποίοι δεν είχαν μεταλλάξεις σημείου για τον προσδιορισμό της εμφάνισης μεγάλων γονιδιωματικών διαγραφών αυτών των δύο γονιδίων [134]. Σε 102 μελέτες μας, υπήρχαν μόνο πέντε χαρτιά χρησιμοποιώντας MLPA χωριστά ή σε συνδυασμό με άλλες μεθόδους, που αντιπροσωπεύει 4,90% του συνόλου των μελετών. Η επικράτηση των μεγάλων γονιδιωματικής αναδιατάξεων στο

hMLH1

και

hMSH2

ήταν 6,76% (95% CI 3,11% -14,05%) και 13,56 (95% CI 11,19% -16,32%) (Τα δεδομένα δεν φαίνεται), αντίστοιχα, οι οποίες ήταν υψηλότερες από τα αποτελέσματα στον πίνακα 4, όπου δεν διευκρινίζεται τα θέματα και μεθόδους ανίχνευσης. Ως εκ τούτου, ο επιπολασμός μετάλλαξη στο μέλλον αποτελέσματα αναμένεται να είναι υψηλότερη με τη χρήση πιο ευαίσθητες μεθόδους για τον εντοπισμό μεγάλων γονιδιωματικών διαγραφών.

Μελέτες έχουν δείξει ότι οι περιπτώσεις με αρνητικές αστάθεια μικροδορυφόρου μπορεί επίσης να φέρει βλαστικής σειράς μεταλλάξεων. Ο επιπολασμός μετάλλαξη είναι ευρέως κυμάνθηκε σε διάφορες καταστάσεις MSI και με διαφορετικές οικογενειακό ιστορικό [70]. Ο επιπολασμός της μετάλλαξης ήταν 53,41% στους ασθενείς AC + ‘με όγκους που εμφανίζουν MSI-υψηλής φαινότυπο, που πρότεινε ότι η προβλεπόμενη τιμή του MSI-υψηλό για μεταλλάξεις σε αυτά τα δύο γονίδια ήταν 53,41% στην ομάδα AC +. Το επόμενο υψηλότερο ήταν 38,80% στην ομάδα AC- και στη συνέχεια 22,54% στην σποραδική ομάδα. Αν πήραμε MSI ως μία ομάδα (σε συνδυασμό MSI-υψηλή, MSI-χαμηλή και MSI (δεν μπορεί να εντοπίσει MSI-υψηλή ή MSI-χαμηλή)), η αντίστοιχη προβλεπόμενη τιμή ήταν 57,12% (95% CI 50.43% -63.55%) στην ομάδα AC + (Πίνακας 5).

Αρκετές τεχνικές για την ανίχνευση μεταλλάξεων που χρησιμοποιούνται συνήθως, συμπεριλαμβανομένων ανοσοϊστοχημεία ακολουθούμενη από DNA-αλληλουχίας, μονόκλωνης χωροδιατάξεως πολυμορφισμού που ακολουθείται από DNA-αλληλούχιση, ανάλυση ετεροδιπόλου που ακολουθείται από DNA-αλληλουχίας, μετουσίωσης βαθμιδωτή ηλεκτροφόρηση πηκτής ακολουθούμενη από το DNA-αλληλουχίας, μετουσίωσης υγρή χρωματογραφία υψηλής απόδοσης που ακολουθείται από DNA-αλληλουχίας, και την άμεση DNA-αλληλούχιση. Ανάλυση της επίδρασης των διαφορετικών μεθόδων ανίχνευσης για τον επιπολασμό έχουν διαπιστώσει ότι, σε γενικές γραμμές, δεν υπήρχε σημαντική διαφορά στην επικράτηση ανιχνεύεται από τις τέσσερις μεθόδους AC + (

P

= 0,60 & gt? 0,05) και Ac- (

P

= 0,30 & gt? 0,05) ομάδα. Στην σποραδικές ομάδα, υπήρχαν πολύ λίγες μελέτες για την ανάλυση (Πίνακας S2 στην υποστήριξη των πληροφοριών).

Μια διάκριση ανάμεσα σε μια σειρά βασισμένη στον πληθυσμό και κλινική που βασίζεται έγινε, γι ‘αυτό ήταν ένα δυνητικά σημαντικό προκατάληψη των ανάλυση. Ωστόσο, παρατηρήθηκε ότι δεν υπήρχαν σημαντικές διαφορές στην επικράτηση μετάλλαξη μεταξύ των ομάδων που βασίζονται σε κλινική και με βάση τον πληθυσμό είτε σε γονίδιο. Κατά την εξέταση των επιπτώσεων της οικογενειακής ιστορίας, το συμπέρασμα δεν αλλάζει (Πίνακας S5 στην υποστήριξη των πληροφοριών).

Υπήρξε υψηλότερη ετερογένεια στη συνολική επικράτηση. αποτελέσματα μετα-παλινδρόμησης έδειξε ότι το 22,34% αυτής της ετερογένειας εξηγήθηκε από διαφορετικές οικογενειακές ιστορίες (

P

= 0.00) (Πίνακας S3 σε πληροφορίες υποστήριξης). Η ανάλυση των υποομάδων έδειξε ότι η ετερογένεια ήταν σε μέτρια ή χαμηλά επίπεδα για διαφορετικές οικογενειακές ιστορίες σε σχέση με την επικράτηση σε αυτές τις δύο γονίδια. Εκτός από το οικογενειακό ιστορικό, παράγοντες όπως τα χρόνια από τη δημοσίευση, διαφορετικές εθνότητες και μεθόδους ανίχνευσης Αναλύθηκαν επίσης, και κανένα από αυτά δεν έδειξε καμία στατιστικά σημαντική επίδραση στην ετερογένεια (Πίνακας S3 στην υποστήριξη των πληροφοριών).

Από οικόπεδα χωνί (Εικόνα S2 και S3 σε πληροφορίες υποστήριξης), παρατηρήσαμε ότι τα στοιχεία από τη μετα-ανάλυση για την επικράτηση μετάλλαξη με διαφορετικές οικογενειακές ιστορίες από τα δύο γονίδια ήταν όλα λοξή προς τα αριστερά. Περαιτέρω ανάλυση ποσότητα από Egger παλινδρόμησης και μέθοδοι συσχέτισης Begg σχετικά με την έκταση της ασυμμετρίας διαπίστωσε ότι η αριστερή πλευρά ασυμμετρία ήταν στατιστικά σημαντική σε ορισμένες περιπτώσεις (Πίνακας 6). Αυτό έδειξε ότι ένας αυξημένος αριθμός δημοσιεύσεων και αποδεκτές μικρά μεγέθη μελέτη δεν είχε καμία επίδραση στα θετικά αποτελέσματα. Αυτό μόνο φαίνεται ότι περισσότερες μελέτες με μικρά μεγέθη δειγμάτων και μειωμένη ικανότητα ανίχνευσης διεξήχθησαν και δημοσιεύονται. Ωστόσο, μπορούμε ακόμα να χρησιμοποιήσετε το «Περικοπή και Fill» για να ρυθμίσετε την αξία των αρχικών δεδομένων [135]. Παρατηρήσαμε ότι η αναπροσαρμοσμένη αξία αυξήθηκε από 28,55% σε 33,94% το

hMLH1

γονίδιο και από 19,41% σε 23,00% το

hMSH2

γονίδιο στο AC + ομάδα (Πίνακας 6).

Εκτός από τις μεταλλάξεις στα εξώνια, μερικά από τα πιο κοινά παθογόνα παραλλαγές είναι ιντρονικές. Έτσι, ψάξαμε συστηματικά έγγραφα σχετικά με τις ενώσεις μεταξύ παρεμβαλλόμενη αλληλουχία ή περιοχή ιντρονίου μεταλλάξεις και το σύνδρομο Lynch, και αναλύσαμε επίσης τη διαφορά της επικράτησης μεταξύ των σχετικών παραγόντων, όπως το οικογενειακό ιστορικό και εθνότητες (Πίνακας S6 στην υποστήριξη των πληροφοριών). Όταν υπολογίζονται τα δύο γονίδια σε συνδυασμό, η εσονικές συχνότητα μετάλλαξης ήταν 12,30% (95% CI 9,80% -15,33%) στο AC + ομάδα και 5,90% (95% CI 4,08% -8,47%) στην ομάδα της AC-. Επιπλέον, βρήκαμε ότι τα πιο κοινά παθογόνα επιβλαβή παραλλαγές στο σύνδρομο Lynch ήταν

hMSH2

Intron5 c.942 + 3Α & gt? T, και

hMLH1

Intron9 c.790 + 1G & gt? Α, με μεταλλάξεων συνέπεια της διαγραφής του exon5 στο

hMSH2

και διαγραφή exon9-10 στο

hMLH1

.

η ανάλυση ευαισθησίας έδειξε ότι τα αποτελέσματα της μελέτης μας ήταν αξιόπιστο και σταθερό. Ωστόσο, αυτή η μετα-ανάλυση εξακολουθεί να έχει κάποιους περιορισμούς, όπως οι πληροφορίες οικογενειακό ιστορικό των ασθενών δεν είναι να εξηγούνται σαφώς και μελέτες που παρέχουν επαρκείς πληροφορίες εθνότητα έχει να κατατάσσονται χονδρικά. Στην σποραδικά ορθοκολικά ομάδα του καρκίνου, ο πληθυσμός ανίχνευση συνήθως φιλτράρεται με MSI φαινότυπο ή εμφάνιση ηλικία [64], [129]. Επιπλέον, ανεπαρκείς μελέτες για σποραδικές colorecal καρκίνο και πληροφορίες σχετικά με το φύλο πρέπει να αναλυθούν περαιτέρω. Επιπλέον, με σκοπό τον έλεγχο των προτύπων ποιότητας και ενιαία για τα άρθρα, η γραπτή γλώσσα περιορίζεται στα αγγλικά, το οποίο μπορεί να έχει επηρεάσει τον αριθμό των περιλαμβάνονται μελέτες.

Όχι μόνο

hMLH1

και

hMSH2

γονίδιο, που εξακολουθεί να ανησυχεί για την επικράτηση αυτών των μεταλλάξεων των άλλων MMR γονίδια, ιδίως

hMSH6

ή

hPMS2

. Το 2009, μια συστηματική ανασκόπηση διεξήχθη και μια μετα-ανάλυση για να προσδιοριστεί η συχνότητα

hMSH6

μετάλλαξη στο παχέος εντέρου και του ενδομητρίου από την ακαδημαϊκή ομάδα μας [136].

You must be logged into post a comment.