PLoS One: Επίδραση του πολυμορφισμού ενός νουκλεοτιδίου Rs189037 σε ΑΤΜ Gene για κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα στην κινεζική: A case-control Study


Αφηρημένο

Ιστορικό

Οι συσσωρευμένες αποδείξεις έδειξε ότι αταξία-τηλαγγειεκτασία μεταλλαγμένο (ATM) πολυμορφισμοί του γονιδίου συνδέονται στενά με τον καρκίνο του πνεύμονα. Έχουμε ως στόχο να διερευνήσει την προγνωστική αξία της rs189037 (G & gt? Α)., Ένα από τα ATM πολυμορφισμών μοναδικού νουκλεοτιδίου (SNPs), και τον εντοπισμό είτε πρόκειται για το κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα στην κινεζική Han άνθρωποι

Μέθοδοι

σε αυτή τη μελέτη συμφωνημένα-μαρτύρων νοσοκομείο με βάση, έχουν 852 ασθενείς με καρκίνο του πνεύμονα και 852 υγιείς μάρτυρες έχουν τεθεί σε σχέση με την ανάλυση της συσχέτισης μεταξύ rs189037 και του κινδύνου καρκίνου του πνεύμονα στην κινεζική. Οι πολυμορφισμοί ενός νουκλεοτιδίου προσδιορίστηκαν με TaqMan πραγματικού χρόνου PCR και χρησιμοποιήσαμε το λογισμικό SPSS για την εκτέλεση των στατιστικών αναλύσεων.

Αποτελέσματα

Τα άτομα που φέρουν την παραλλαγή AA γονότυπος rs189037 είχαν υψηλότερο κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα (προσαρμοσμένο Ή: 1,56) από εκείνες που μεταφέρουν GG γονότυπο. Μετά την ανάλυση δεδομένων αντίστοιχα από διαφορετικές ομάδες διαιρείται με φύλα και την κατάσταση καπνίσματος, παρατηρήσαμε ότι η επίδραση κίνδυνος ΑΑ γονότυπο στο καρκίνο του πνεύμονα ήταν σημαντική στα θηλυκά, μη καπνιστές και θηλυκά μη καπνιστές, καθώς και η επίδραση κίνδυνος GA γονότυπου σε άνδρες καπνιστές. Σε σύγκριση με τους μη καπνιστές που μεταφέρουν GG γονότυπο, οι καπνιστές που φέρουν τουλάχιστον ένα αλληλόμορφο Α είχαν μεγαλύτερο κίνδυνο να αναπτύξουν καρκίνο του πνεύμονα σε σχέση με αυτούς με GG γονότυπο (προσαρμογή OR: 3,52 έναντι προσαρμογή OR: 2,53).

Συμπεράσματα

Αυτή η μελέτη προτείνει ότι rs189037 (G & gt? Α) πολυμορφισμός σχετίζεται με τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα σε πληθυσμό Κινέζοι Χαν. AA γονότυπος και το Α αλληλόμορφο μπορεί να αποβεί επικίνδυνη σήματα καρκίνο του πνεύμονα στην κινεζική και να συμβάλει στην διάγνωσης και θεραπείας αξίας

Παράθεση:. Liu J, Wang Χ, Υ Ρεν, Λι Χ, Zhang X, Zhou Β (2014) επίδραση του πολυμορφισμού ενός νουκλεοτιδίου Rs189037 σε ΑΤΜ Gene για κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα στην κινεζική: Μια μελέτη ασθενών-μαρτύρων. PLoS ONE 9 (12): e115845. doi: 10.1371 /journal.pone.0115845

Επιμέλεια: Ramon Andrade de Mello, Πανεπιστήμιο του Algarve, Πορτογαλία

Ελήφθη: 7 Αυγ 2014? Αποδεκτές: 29 Νοεμβρίου, 2014? Δημοσιεύθηκε: 26 Δεκ 2014

Copyright: © 2014 Liu et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Δεδομένα Διαθεσιμότητα:. Η συγγραφείς επιβεβαιώνουν ότι όλα τα δεδομένα που διέπουν τα ευρήματα είναι πλήρως διαθέσιμα χωρίς περιορισμούς. Όλα τα σχετικά δεδομένα είναι εντός του Υποστηρίζοντας αρχεία πληροφοριών του χαρτιού και

Χρηματοδότηση:. Η μελέτη αυτή χρηματοδοτήθηκε από την επιχορήγηση όχι. 81272293 από το Εθνικό Ίδρυμα Φυσικών Επιστημών της Κίνας? BZ λάβει τη χρηματοδότηση. Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

καρκίνος του πνεύμονα είναι μία από τις πιο θανατηφόρες κακοήθειες και παραμένει μια κύρια αιτία θανάτου από καρκίνο σχετίζονται σε πολλές χώρες. Παρά το γεγονός ότι το κάπνισμα θεωρείται ότι είναι μια κοινή αιτία του καρκίνου του πνεύμονα, παγκόσμια στατιστικά στοιχεία καρκίνο δηλώνουν ότι το 25% όλων των περιπτώσεων καρκίνου του πνεύμονα στον κόσμο δεν οφείλονται στο κάπνισμα, συμπεριλαμβανομένων 15% των ανδρών καρκίνων του πνεύμονα και καρκίνους 53% των γυναικών του πνεύμονα [1] , γεγονός που υποδηλώνει ότι υπάρχουν μεμονωμένες παραλλαγές για καρκινογόνες ουσίες καρκίνο του πνεύμονα. Για τους Κινέζους, η επίπτωση των πνευμόνων αυξάνεται καρκίνου κατά 1,63% ανά έτος, 1,30% για τους άνδρες και 2,34% για τις γυναίκες [2]. Λαμβάνοντας υπόψη ένα μεγάλο ποσοστό των γυναικών είναι ακόμα μη καπνιστές, πολλοί ερευνητές θεωρούν το περιβάλλον και ο τρόπος ζωής είναι οι προδιάθεση αιτίες στις γυναίκες [3] – [5]. Ωστόσο, μόνο ένα μέρος των ατόμων που εκτίθενται σε καρκινογόνο ανέπτυξε καρκίνο του πνεύμονα, το οποίο σημαίνει ότι μπορεί να υπάρχουν γενετικοί παράγοντες που οδηγούν σε υψηλότερη ευαισθησία σε καρκίνους. μελέτες συσχέτισης γονιδιώματος-ευρεία (GWAS) υποδηλώνουν ότι οι πολυμορφισμοί ενός νουκλεοτιδίου (SNPs) σε διάφορα γονίδια που βρίσκονται σε διάφορα χρωμοσώματα που σχετίζονται με τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα [6] – [9].

αταξία-τηλαγγειεκτασία μεταλλαγμένα (ΑΤΜ) πρωτεΐνη είναι μια 370 kDa κινάση σερίνης /θρεονίνης [10], αλλά έχουν μόνο πολλούς τομείς έχουν σαφώς ανιχνευθεί. ATM γενικά πιστεύεται ότι παραμένουν σταθερές με τα κύτταρα για να κρατήσει ιδιοσυστατικά εκφράζουν, προτείνεται να εμπλέκεται στην απόκριση σε καταστροφή του DNA (DDR) μονοπάτι το οποίο ενεργοποιείται από εκτεταμένες βλάβες του DNA [11]. ATM ενεργεί ως επιστάτης της γονιδιωματικής υγείας έτσι ώστε να μπορεί να ενεργοποιηθεί από γονιδιωματική προσβολές [12]. Ως βασικό μέρος σε απάντηση βλάβη του DNA, ΑΤΜ εμπλέκεται στην επιδιόρθωση του DNA, των κυττάρων σύλληψη, αναδιαμόρφωσης χρωματίνης και την κυτταρική απόπτωση [13]. Επιπλέον, παίζει ρόλο στην οξειδωτικό στρες και του κυτταρικού μεταβολισμού. Ως εκ τούτου, ATM μοιάζει με ένα χειριστή της κυτταρικής τύχης μέσω των μεγάλων υποστρώματα του. Η ανάλυση σύνδεσης ανιχνεύει ότι το γονίδιο ΑΤΜ που βρίσκεται στο χρωμόσωμα 11q22-23 μεταγραφών mRNA με μια αλληλουχία κωδικοποίησης του 9168 bp [14], και είναι υπεύθυνος για την αταξία τελαγγειεκτασία, ένα αυτοσωματικό υπολειπόμενο διαταραχή κληρονομικότητα. Επιδημιολογικές μελέτες έχουν δείξει ότι οι πολυμορφισμοί του γονιδίου ΑΤΜ που σχετίζονται με τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου, συμπεριλαμβανομένου του καρκίνου του πνεύμονα, ο καρκίνος του μαστού, γλοίωμα και παγκρεατικό καρκίνο [15].

Πολλές επιδημιολογικές στατιστικές έρευνες έχουν καταρτίσει μια ευρύτερη εικόνα για να παράγει μια σχέση μεταξύ ataxia- μετάλλαξη telangiectasia και η συχνότητα εμφάνισης των διαφόρων καρκίνο [14], [16]. Εκτίθενται σε ϋΝΑ βλαπτικούς παράγοντες, μια σειρά κυτταρικών αποκρίσεων και τις οδούς επιδιόρθωσης σε φυσιολογικά κύτταρα θα ενεργοποιείται, αλλά η ικανότητα αποκατάστασης των ζημιών του DNA σε κύτταρα ATM-ανεπάρκειας θα μειώνεται. Όπως αρκετές προηγούμενες μελέτες υποστηρίζουν σημαντικά τη σχέση μεταξύ ATM μονοπάτι σήματος και την ευαισθησία του καρκίνου του πνεύμονα, κάναμε μια περαιτέρω έρευνα επικεντρώνεται σε γονίδιο ΑΤΜ πολυμορφισμός και η σύνδεσή της με τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα. Ερευνήσαμε την κατανομή των γονότυπων rs189037 στις περιπτώσεις και ομάδες ελέγχου για να επιβεβαιωθεί κατά πόσο αυτό συμβάλλει στον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα σε πληθυσμό Κινέζοι Χαν.

Υλικά και Μέθοδοι

Τα άτομα της μελέτης

Η το όνομά της επιτροπής δεοντολογίας είναι η Κίνα Ιατρικού Πανεπιστημίου επιτροπής δεοντολογίας και πήραμε την έγκριση ηθικής. Έχουμε ανεβάσει μια επίσημη γραπτή παραίτηση από την έγκριση ηθικής στο σύστημά σας. Όλες οι συμμετοχές που παρέχονται σε γραπτή μορφή συναίνεσης, καθώς και τα μέλη των οικογενειών τους, υπέγραψαν επίσης το έντυπο συγκατάθεσης. Επιτροπή Δεοντολογίας εγκεκριμένη διαδικασία συγκατάθεσή μας.

Σε αυτή τη μελέτη ασθενών-μαρτύρων νοσοκομείο με βάση, θα προσληφθούν 852 ασθενείς με καρκίνο του πνεύμονα με ιστολογικά επιβεβαιωμένη διάγνωση. Οι ασθενείς θα πρέπει να πληρούν τα ακόλουθα κριτήρια:

1. Όλες οι περιπτώσεις θα πρέπει να πληρούν τα διαγνωστικά κριτήρια του καρκίνου του πνεύμονα που ανακοίνωσε η Παγκόσμια Οργάνωση Υγείας (W.H.O) το 2004

2. Θα πρέπει να είναι πρωτοπαθή καρκίνο του πνεύμονα

3. Δεν έχουν χρησιμοποιηθεί σε χημειοθεραπεία ή ακτινοθεραπεία

Κατά την ίδια περίοδο, 852 υγιείς μάρτυρες, χωρίς αποδεικτικά στοιχεία των πνευμόνων ή άλλων καρκίνων ήταν τυχαία προσληφθεί από ένα ιατρικό κέντρο εξέτασης στο ίδιο νοσοκομείο. Οι συμμετέχοντες ήταν άσχετες εθνοτικών Κινέζων Χαν και υπέγραψε ενημερωμένη συγκατάθεση. Πρόσωπο με πρόσωπο συνεντεύξεις των ασθενών και υγιών ατόμων ελέγχου που διεξήχθη από δύο εκπαιδευμένους ερευνητές, συλλέγονται πληροφορίες συμπεριλαμβανομένων των δημογραφικών δεδομένων (όνομα, φύλο, ηλικία, κλπ) και το κάπνισμα. Όλες οι πληροφορίες εισήχθη από την Epi-info λογισμικού μετά από επανειλημμένες έλεγχο και αυστηρή κωδικοποίηση.

Γονοτυπικές

Το DNA που εξάγεται από 1 ml δείγματα ολικού αίματος χρησιμοποιώντας τυποποιημένες μεθόδους φαινόλης-χλωροφορμίου. Η γονοτύπηση πραγματοποιήθηκε σε ένα Applied Biosystems 7500 FAST PCR Πραγματικού χρόνου System (Foster City, CA, USA) χρησιμοποιώντας μια δοκιμασία προσδιορισμού του γονότυπου TaqMan SNP (Affymetrix Inc., Cleveland, Ohio, USA). Κάθε αντίδραση (10 μλ) περιείχαν 5 μΐ TaqMan Γονοτυποποίηση κύριου μείγματος, εκκινητές και ανιχνευτές 0.5 μΙ (Applied Biosystems), 2,5 μΙ νερό και 2 μΐ DNA (15-25 ng /μl). Θερμικές συνθήκες ποδηλασίας ήταν 95 όρους ποδηλασία δ Biosystems), 2,5 n ένα Applied Biosystems 7500 FASmin. Αντίγραφα 10% των δειγμάτων επανελέγχονται για σκοπούς ελέγχου ποιότητας. Για την επιβεβαίωση των αποτελεσμάτων του γονότυπου και να αξιολογήσει την επαναληψιμότητα, το 10% διπλές δείγματα αλληλουχία τυχαία, και τα αποτελέσματα ήταν 100% συγκλίνουσες.

Η στατιστική ανάλυση

Το τεστ chi-τετράγωνο χρησιμοποιήθηκε για να εξετάσει τις διαφορές μεταξύ ασθενών και μαρτύρων. Η ισορροπία Hardy-Weinberg ελέγχθηκε χρησιμοποιώντας ένα τεστ chi-τετράγωνο Pearson. Η αναλογία πιθανοτήτων (OR) και το διάστημα εμπιστοσύνης 95% της (95% CI) ελήφθησαν από λογιστικής μεθοδολογίας παλινδρόμηση για τον προσδιορισμό συσχετίσεις μεταξύ του πολυμορφισμού rs189037, και η συχνότητα εμφάνισης του καρκίνου του πνεύμονα στην κινεζική. Όλες οι αναλύσεις πραγματοποιήθηκαν με τη χρήση SPSS 13.0 (SPSS, Inc. Chicago, IL, USA), και P & lt? 0,05 θεωρήθηκε στατιστικά σημαντική

Αυτή η μελέτη περιελάμβανε

Αποτελέσματα

852 πνεύμονα. περιπτώσεις καρκίνου και 852 έλεγχοι, οι οποίοι ήταν όλοι οι εθνοτικές Κινέζων Χαν.

S1 πίνακα παρουσιάζεται η κατανομή γονότυπο rs189037 ATM SNP και τις ενώσεις του με τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα σε αυτόν τον πληθυσμό Κινέζοι Χαν. Στο σύνολο του πληθυσμού, rs189037 βρέθηκε να σχετίζεται σημαντικά με τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα. Οι συχνότητες του GG, GA και ΑΑ γονότυπους των rs189037 ήταν 25,5, 53,1, 23,5% στις περιπτώσεις και 31,0, 50,9, 18,1% σε ελέγχους, αντίστοιχα. Ρύθμιση παράξενο αναλογίες για την ηλικία, το φύλο και τον παράγοντα του καπνίσματος, ένα σημαντικά αυξημένο κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα παρατηρήθηκε μεταξύ των συμμετεχόντων με ομόζυγο γονότυπο παραλλαγή (AA) (προσαρμογή OR: 1,56, 95% CI: 01.18 – 02.08), σε σύγκριση με την ομόζυγη άγρια τύπου (GG). Επιπλέον, παρόμοια σημαντική συσχέτιση παρατηρήθηκε στο γυναικείο πληθυσμό, σε σχέση με αυτές τις γυναίκες που μεταφέρουν GG γονότυπο, προσαρμογή OR (95% CI) των θηλυκών με ΑΑ γονότυπο ήταν 1,75 (1,14 – 2,68), πράγμα που σημαίνει rs189037 ΑΑ γονότυπο μπορεί να είναι ένας παράγοντας κινδύνου των κινεζικών γυναικείο καρκίνο του πνεύμονα, ενώ καμία τέτοια επίδραση υπήρχε μεταξύ των ανδρών (P & gt? 0,05).

Εμείς αντίστοιχα μελέτησε συσχετισμούς μεταξύ rs189037 ΑΤΜ και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου του πνεύμονα σε μη καπνιστές και οι καπνιστές. Του πληθυσμού του καπνίσματος (S2 Πίνακας), GG, GA και ΑΑ γονότυπους των rs189037 ήταν 25,2%, 52,2%, 22,6% στις περιπτώσεις και 31,9%, 47,3%, 20,9% σε ελέγχους. Βρήκαμε ότι οι άνδρες καπνιστές που μεταφέρουν rs189037 γονότυπο GA έδειξε αυξημένο κίνδυνο σε σύγκριση με τους άνδρες καπνιστές που μεταφέρουν ομόζυγο άγριου τύπου (GG) (προσαρμογή OR: 1,63, 95% CI: 1,04 – 2,55), αλλά δεν υπάρχουν σημαντικές ενώσεις θα μπορούσε να βρεθεί στη συνολική καπνιστές ή θηλυκό καπνιστές (Ρ & gt? 0,05). Σε μη-καπνιστές πληθυσμού (S3 Πίνακας), διανομή γονότυπο της rs189037 GG, GA, τύπου ΑΑ ήταν 25,9%, 49,6%, 24,5% στις περιπτώσεις και 30,6%, 52,7%, 16,8% σε ελέγχους. Αφού ανέλυσε τα δεδομένα σε μη-καπνιστές, βρήκαμε οι φορείς του γονότυπου rs189037 AA έδειξε αυξημένο κίνδυνο για καρκίνο του πνεύμονα σε σύγκριση με ομόζυγο άγριου τύπου (GG) σε μη-καπνιστές (Adjusted OR: 1,73, 95% CI: 1,18 – 2,52) . Ξεχωριστές αναλύσεις έδειξαν ότι η επίδραση του κινδύνου καρκίνου του πνεύμονα με γονότυπο ΑΑ ήταν σημαντική σε γυναίκες μη καπνίστριες (Adjusted OR: 1,86, 95% CI: 01.08 – 03.21)., Αλλά δεν έχει νόημα σε άνδρες μη καπνιστές

όπως φαίνεται στον πίνακα S4, θεωρήσαμε ότι οι μη καπνιστές που φέρουν άγριου τύπου GG γονότυπο του rs189037 ως σημείο αναφοράς, και βρήκαμε το αν οι καπνιστές φέρουν ένα αλληλόμορφο ή όχι, όλοι είχαν αυξημένο κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα. Τι είναι περισσότερο, οι καπνιστές που φέρουν τουλάχιστον ένα αλληλόμορφο Α είχε 1,39 φορές αυξημένο κίνδυνο ανάπτυξης καρκίνου του πνεύμονα σε σχέση με τους καπνιστές που φέρουν γονότυπο GG (προσαρμογή OR: 3,52 έναντι προσαρμογή OR: 2,53).

Συζήτηση

δεν υπάρχουν μόνο μια μεγάλη πολλοί, αλλά και τα διάφορα είδη των αιτιολογιών του καρκίνου του πνεύμονα, όμως δεν είναι όλα είναι σαφή τώρα. Για τους Κινέζους, η συχνότητα εμφάνισης του καρκίνου του πνεύμονα αυξάνεται ετησίως. Κάναμε αυτή τη μελέτη ασθενών-μαρτύρων να ανακαλύπτω τη σχέση μεταξύ ATM πολυμορφισμού ενός νουκλεοτιδίου (SNP) rs189037 και καρκίνο του πνεύμονα κινδύνου σε ένα κινεζικό πληθυσμό, ο οποίος υποστήριξε ότι γενετικός παράγοντας έπαιξε σημαντικό ρόλο στην ατομική ευαισθησία του καρκίνου του πνεύμονα.

στην παρούσα μελέτη, επιλέξαμε και γονότυπου rs189037 στην περιοχή του υποκινητή του γονιδίου ΑΤΜ που βρίσκεται στο 11q22-23, υπάρχει μια στατιστικά σημαντική συσχέτιση μεταξύ rs189037 και τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα σε αυτόν τον πληθυσμό Κινέζοι Χαν. Ο σύλλογος είναι συνεπής με μια ανάλυση βάσει διαδρομής, το 2012, Dong J et al. εξετάστηκαν 218 SNPs σε γονίδια επιδιόρθωσης του DNA 50 στα 568 επιβιώσεις καρκίνο του πνεύμονα και βρήκαν 6 SNPs που σχετίζονται με την πρόγνωση του καρκίνου του πνεύμονα, συμπεριλαμβανομένων rs189037 ATM, MRE11A rs11020802, rs1799793 ERCC2, rs140693 MBD4, rs25487 ΧΚΧΧ1 και PMS1 rs5742933 [8]. Σε σύγκριση με τον ομόζυγο άγριου τύπου (GG) στον κινεζικό λαό μας, παρατηρήσαμε συμμετέχοντες με την ομόζυγη παραλλαγή γονότυπο (ΑΑ) της ATM SNP rs189037 συνέβαλαν στην αύξηση του κινδύνου καρκίνου του πνεύμονα (προσαρμογή OR: 1,56, 95% CI: 01.18 – 02.08). Αρκετές προηγούμενες μελέτες έδειξαν ότι τα άτομα που μεταφέρουν ΑΑ γονότυπο του rs189037 είχαν υψηλότερα κίνδυνο καρκίνου του μαστού [17] και τον καρκίνο του στόματος [18], που πρότεινε ότι παραλλαγή ΑΑ γονότυπος μπορεί να είναι ένα επικίνδυνο μήνυμα των αναπτυσσόμενων malignances, και Χυ L et al. επεσήμανε ότι τα άγρια ​​γονότυπο GG της rs189037 ήταν μια προστατευτική επίδραση έναντι διαφοροποιημένο καρκίνωμα του θυρεοειδούς (DTC) [19]. Υποθέσαμε ότι GG γονότυπος μπορεί επίσης να είναι προστατευτική γονίδιο έναντι του καρκίνου του πνεύμονα. Εκτός από κακοήθη όγκο, ΑΑ γονότυπος του rs189037 έχει επίσης αρνητικές συνέπειες σε άλλες ασθένειες, για παράδειγμα, Xiong Η et al. ανέφεραν ότι τύπου ΑΑ θα μπορούσε να προβλέψει σοβαρή πνευμονίτιδας από ακτινοβολία σε ασθενείς με μη-μικροκυτταρικό καρκίνο του πνεύμονα μετά την οριστική θεραπεία ακτινοβολίας [20]. Η μελέτη των Li et al. έδειξαν ότι και οι δύο του ΑΑ γονότυπο και Α αλληλόμορφο συσχετίστηκαν με αυξημένο κίνδυνο ιδιοπαθούς nonobstructive αζωοσπερμία (ΙΝΟΑ) [21]. Ωστόσο, υπάρχουν αρκετές μελέτες που ανταγωνίζονται με την έρευνα μας. Στην πρώτη έρευνα για τη σχέση μεταξύ rs189037 και του καρκίνου του πνεύμονα, Kim et al. κάλεσε 616 ασθενείς με καρκίνο του πνεύμονα στην κορεατική πληθυσμού και αξιολογούνται διάφορες γονότυπους ΑΤΜ ξεχωριστά, αλλά καμία σημαντική συσχέτιση βρέθηκε μεταξύ αυτού του κινδύνου πολυμορφισμό και καρκίνο του πνεύμονα (Ρ & gt? 0.05) [22]. Το 2010, Lo et al. γονότυπος 9 SNPs σε 730 ασθενείς με καρκίνο του πνεύμονα και 730 υγιείς μάρτυρες στην Ταϊβάν, αλλά δεν κατάφερε να βρει τη σχέση μεταξύ rs189037 και τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα μεταξύ όλων των συμμετοχών (P & gt? 0.05) [23]. Το 2013, Hsia et al. διερευνηθεί 358 ασθενείς με καρκίνο του πνεύμονα και 716 έλεγχοι στην Ταϊβάν, ούτε βρήκαν τη συσχέτιση. Βρήκαν καμία διαφορά γονότυπο συχνότητα μεταξύ των περιπτώσεων και ελέγχων καρκίνου του πνεύμονα στους καπνιστές (Ρ & gt? 0.05) [24]. Αυτά τα αντικρουόμενα αποτελέσματα μπορεί να οφείλονται σε πολλούς λόγους. Πρώτον, για τα διάφορα ερευνητικά πληθυσμού από διαφορετικές περιοχές, τα διάφορα είδη των περιβαλλόντων και του τρόπου ζωής θα επηρεάσει την ευαισθησία του καρκίνου του πνεύμονα. Δεύτερον, το κάπνισμα μπορεί να διαμορφώνει τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου του πνεύμονα και είναι ένας παράγοντας σύγχυσης στο σύλλογο. Στην κορυφή αυτής, οι περισσότεροι από έρευνες περιορίζονταν από το μικρό μέγεθος του πληθυσμού. Όταν η προσοχή του κοινού έχει συνταχθεί σε παράγοντες κινδύνου, συμπεριλαμβανομένης της έκθεσης του καπνίσματος, εσωτερικό περιβάλλον και τον τρόπο ζωής στην κινεζική θηλυκά [5], [25], θα πρέπει επίσης να δώσει μεγαλύτερη προσοχή στην ατομική γενετικός παράγοντας. Στη μελέτη μας, σημαντική συσχέτιση μεταξύ rs189037 ΑΑ γονότυπο και τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα παρατηρήθηκε στα κινέζικα γυναίκες (προσαρμογή OR: 1,75, 95% CI: 1,14 – 2,68), αλλά όχι στην κινεζική αρσενικά. Αυτό έδειξε ότι η ΑΑ γονότυπος μπορεί να είναι ένα επικίνδυνο σήμα της κινεζικής των γυναικών με καρκίνο του πνεύμονα.

Λαμβάνοντας υπόψη την κατάσταση καπνίσματος, μελετήσαμε rs189037 σε μη καπνιστές και οι καπνιστές, αντίστοιχα. Είναι ενδιαφέρον, θα είναι σύμφωνα με Lo et al. σχετικά με τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα σε μη καπνιστές [23], οι μεταφορείς ΑΑ γονότυπο έδειξε αυξημένο κίνδυνο σε σύγκριση με τα άγριου τύπου γονότυπο GG σε μη-καπνιστές (Adjusted OR: 1,73, 95% CI: 1,18 – 2,52). Σε περαιτέρω ξεχωριστές αναλύσεις, βρήκαμε ότι οι κινεζικές γυναίκες μη καπνίστριες που μεταφέρουν ΑΑ γονότυπο είχαν περισσότερες πιθανότητες να αναπτύξουν καρκίνο του πνεύμονα σε σχέση με άλλες που μεταφέρουν GG γονότυπο, η οποία είναι συνεπής με την πρόσφατα δημοσιευμένη αποτέλεσμα μιας άλλης ομάδας στο εργαστήριο μας, ο γονότυπος rs189037 σε 487 πνεύμονα ασθενείς με καρκίνο και 516 υγιείς ελέγχους. Η μελέτη τους πρότεινε ότι AA γονότυπος μπορεί να είναι ένας παράγοντας κινδύνου αδενοκαρκινώματος του πνεύμονα στην κινεζική γυναικεία μη καπνιστές χωρίς μαγείρεμα έκθεση αναθυμιάσεων λαδιού (προσαρμογή OR: 1,89, 95% CI: 1,03 – 3,49, P = 0,040) [26]. Υπήρξε μια αξιοσημείωτη φαινόμενο στη μελέτη μας βρήκαμε καμία σημαντική συσχέτιση μεταξύ rs89037 και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου των πνευμόνων στους άνδρες (P & gt? 0.05), αλλά άνδρες καπνιστές που μεταφέρουν GA γονότυπο είχαν αυξημένη συχνότητα εμφάνισης του καρκίνου του πνεύμονα (προσαρμογή OR: 1,63, 95% CI: 1,04 έως 2,55). Παρατηρήσαμε αυξημένο κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα στις γυναίκες που φέρουν γονότυπο rs189037 ΑΑ (προσαρμογή OR: 1,75, 95% CI: 1,14 – 2,68), αλλά θηλυκό καπνιστές με παραλλαγή γονότυπο δεν συσχετίστηκαν με τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα (Ρ & gt? 0,05). Είναι γενικά αποδεκτό ότι το κάπνισμα επηρεάζει σε μεγάλο βαθμό τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα. Ανεξάρτητα από rs189037 γονότυπους, ο κίνδυνος καρκίνου του πνεύμονα στους καπνιστές αυξήθηκε (τύπου GG Adjusted OR: 2,53, GA + τύπου AA Adjusted OR: 3,52). Πνεύμονα αποτέλεσμα τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου του Α αλληλόμορφου προστίθεται στο αποτέλεσμα, έτσι ώστε οι καπνιστές που φέρουν τουλάχιστον ένα αλληλόμορφο είχαν 1,39 φορές σε αυξημένο κίνδυνο ανάπτυξης καρκίνου του πνεύμονα σε σχέση με GG φέρει. Ο καπνός του τσιγάρου είναι ένα σύνθετο μείγμα που περιέχει πολλές μεταλλαξιογόνες και καρκινογόνες ουσίες. SNPs διαφόρων γονιδίων μπορεί να συμμετέχει σε επηρεάζουν μηχανισμούς ανταμοιβής ντοπαμίνης λόγω νικοτίνη, τον μεταβολισμό και την αποτοξίνωση καρκινογόνο [27]. Στο μοριακό επίπεδο, και οι δύο πολυμορφισμοί γονιδίων και καρκινογόνες ουσίες θα μπορούσαν να μεταβάλουν ατομική ικανότητα επιδιόρθωσης του DNA, τον έλεγχο του κυτταρικού κύκλου και άλλων κυτταρικών αποκρίσεων.

Rs189037 είναι ένα μοναδικού νουκλεοτιδίου πολυμορφισμός (SNP) που βρίσκεται στην περιοχή του υποκινητή (μη-κωδικοποίησης περιοχή) του γονιδίου ΑΤΜ. Rs189037 πολυμορφισμός δεν μπορεί να επηρεάσει άμεσα αμινοξέα κωδικοποίησης οξέος της πρωτεΐνης ΑΤΜ. Έτσι είναι δυνατό να συμμετάσχουν σε μάτισμα, παρέμβαση, τροποποίηση, διαδικασία προσδιορισμού αλλάζοντας σταθερότητα του RNA και στη συνέχεια επηρεάζει το επίπεδο έκφρασης της πρωτεΐνης ATM [17]. Για να καταλάβω πώς αυτός ο πολυμορφισμός ρυθμίζει την έκφραση ATM mRNA, Tie Chen et al. αναλύθηκαν οι αλληλουχίες γύρω από τις rs189037 SNP και απέδειξαν ότι AP-2α συνδέεται με τη θέση SNP να καταστέλλει μεταγραφή ATM [28], σύμφωνα με την ανάλυση βιοπληροφορικής Leask et al. το 1991 [29]. Μέχρι σήμερα, η πρωτεϊνική κινάση ΑΤΜ έχει ευθέως θεωρηθεί ένας αισθητήρας της βλάβης του DNA και ένα από θεραπευτικών στόχων για καρκίνο του [30]. Συσσωρευμένες αποδείξεις απέδειξε ότι ΑΤΜ πρωτεΐνη ενεργοποιείται αμέσως σε απόκριση σε διπλή διάσπαση της έλικας του DNA (DSB), που προκαλούνται είτε από γενετικά προγραμματισμένο ή την εμφάνιση των επιλεγμένων εξωγενών παραγόντων [31], [32]. Με σκοπό την ταχεία και ακριβή αίσθηση και την αποκατάσταση των ζημιών στην κυτταρική βλάβη, το σήμα που παράγεται να προσλάβει κινάση ΑΤΜ σε χώρους DSB και να προκαλέσει τη φωσφορυλίωση των πολλαπλών υποστρωμάτων ATM [32]. Τα κύτταρα έχουν σχηματίσει πολύπλοκα μοριακά δίκτυα για να αισθανθούν ϋδΒδ και να συντονίσουν την επισκευή τους. Τα άτομα που έχουν ελλείψεις στις ικανότητες παραπάνω μπορεί να οδηγήσει στο θάνατο των κυττάρων, σωματικές μεταλλάξεις, και καρκινογόνες ουσίες [31]. ΑΤΜ προωθεί τον ανασυνδυασμό των ενδιαμέσων DSB και αποτρέπει σπασμένα άκρα DNA από μετάλλαξη του χρωμοσώματος [33]. μετάλλαξη ATM οδηγεί στο καρκίνο προδιαθέσεως γενετική διαταραχή αταξία-τηλαγγειεκτασία (Α-Τ) που ανήκει στην γενωμική αστάθεια σύνδρομα [34]. Συσσωρευμένες αποδείξεις έχουν δείξει ότι πολυμορφισμοί του γονιδίου ΑΤΜ έχουν στενή σχέση με τον καρκίνο του πνεύμονα [35] – [37]. Εκτός αυτού, πιθανώς λειτουργική πολυμορφισμοί στο γονίδιο ΑΤΜ μπορούν να χρησιμεύσουν ως πιθανοί βιοδείκτη πρόβλεψη για τον καρκίνο [8], παρατηρήσαμε τη συσχέτιση μεταξύ rs189037 πολυμορφισμού στη γονιδιακή ATM και καρκίνου του πνεύμονα σε έναν πληθυσμό κινεζική Han, το οποίο παρέχει αποδείξεις για rs189037 να είναι μια πρόβλεψη βιοδείκτης της καρκίνος του πνεύμονα. Κατά συνέπεια, με βάση τα δεδομένα από διαφορετικά είδη SNPs, βιοαισθητήρες θα μπορούσε να σχεδιαστεί [38] για την προστασία φυσιολογικό ιστό από κυτταροτοξικές επιδράσεις σε θεραπεία, αυξάνοντας θεραπευτικό αποτέλεσμα των φαρμάκων γονιδιοτοξικότητα ή άλλες θεραπείες.

Συμπεράσματα

Εν κατακλείδι, η έρευνά μας έδειξε ότι η ATM rs189037 μοναδικού νουκλεοτιδίου πολυμορφισμός σχετίζεται με τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα σε πληθυσμό Κινέζοι Χαν. ΑΑ γονότυπος και το Α αλληλόμορφο μπορεί να αυξήσει την ευαισθησία του καρκίνου του πνεύμονα. Η μελέτη μας παρέχονται ισχυρές ενδείξεις για την περαιτέρω έρευνα του μεγάλου πληθυσμού σε διαφορετικές φυλές. Επιπλέον, η συμβολή των μεταλλάξεων του γονιδίου ΑΤΜ στην ευαισθησία του καρκίνου θεωρείται ένα φωτεινό λαμπτήρα της επιδημιολογίας του καρκίνου.

Υποστήριξη Πληροφορίες

Πίνακα S1. κατανομή

γονότυπου των rs189037 ΑΤΜ και τις ενώσεις του με τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου του πνεύμονα

doi:. 10.1371 /journal.pone.0115845.s001

(DOCX)

S2 πίνακα.

Rs189037 διανομή γονότυπου και του κινδύνου καρκίνου του πνεύμονα στους καπνιστές

doi:. 10.1371 /journal.pone.0115845.s002

(DOCX)

S3 πίνακα.

Rs189037 διανομή γονότυπου και του κινδύνου καρκίνου του πνεύμονα σε μη καπνιστές

doi:. 10.1371 /journal.pone.0115845.s003

(DOCX)

S4 πίνακα. κατανομή

γονότυπου των rs189037 και το κάπνισμα και τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα

doi:. 10.1371 /journal.pone.0115845.s004

(DOCX)

S1 δεδομένων.

αρχικά δεδομένα των αποτελεσμάτων του γονότυπου

doi:. 10.1371 /journal.pone.0115845.s005

(XLS)

You must be logged into post a comment.