PLoS One: MNS16A διαδοχικές επαναλήψεις μικροδορυφόρων της ανθρώπινης τελομεράσης Gene και τον κίνδυνο καρκίνου: Μια μετα-Analysis


Αφηρημένο

Ιστορικό

Οι ερευνητές έχουν προσκομίσει αποδεικτικά στοιχεία ότι η δυσλειτουργία των τελομερών να διαδραματίσει σημαντικό ρόλο στην ανάπτυξη καρκίνου . MNS16A είναι ένα πολυμορφικό δίδυμες επαναλήψεις μινιδορυφορικών ανθρώπινης τελομεράσης (hTERT) γονίδιο που επηρεάζει δραστικότητα προωθητή των hTERT και έτσι εμπλέκει να σχετίζονται με κίνδυνο πολλών κακοηθειών. Ωστόσο, τα αποτελέσματα σχετικά με τη σύνδεση μεταξύ MNS16A και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου παραμένουν αμφιλεγόμενα. Ως εκ τούτου, διεξάγει μια μετα-ανάλυση για να αποκομίσουν μια πιο ακριβή εκτίμηση της σύνδεσης μεταξύ MNS16A και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου.

Μέθοδοι

Μια συστηματική βιβλιογραφική έρευνα διεξήχθη από την αναζήτηση PubMed, ISI Web of Knowledge, Ανθρωπίνων γονιδίωμα και Επιδημιολογίας Δίκτυο Navigator και το Google Scholar ψηφιακής βάσης δεδομένων για τις δημοσιεύσεις για τις ενώσεις μεταξύ MNS16A και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου. Παραλλαγές με στατιστικά σημαντικές συσχετίσεις με μετα-ανάλυση αξιολογήθηκαν με βάση κριτήρια της Βενετίας.

Αποτελέσματα

άρθρα

10 case-control εγγραφή 6101 περιπτώσεις και 10521 μάρτυρες τέθηκαν σε μας μετα-ανάλυση. Οι σχέσεις ήταν ισχυρές επιδημιολογικές αξιοπιστία στην εγκεφαλική πληθυσμού καρκίνο και τον καρκίνο του μαστού (

P

για ετερογένεια & gt? 0,1). Η αθροιστική ανάλυση σε χρονολογική σειρά πρότεινε μια σαφής τάση προς μια σημαντική συσχέτιση με επιπλέον δείγματα της μελέτης.

Συμπεράσματα

Τα αποτελέσματα παρείχε μια πιο ακριβή απεικόνιση του ρόλου των MNS16A στην εγκεφαλική καρκίνο και τον καρκίνο του μαστού ευαισθησία. Πρόσθετες μεγαλύτερες μελέτες δικαιολογείται να επικυρώσει τα ευρήματά μας

Παράθεση:. Xia Χ, Rui R, Quan S, Zhong R, Ζου L, Lou J, et al. (2013) MNS16A διαδοχικές επαναλήψεις μικροδορυφόρων της ανθρώπινης τελομεράσης Gene και τον κίνδυνο καρκίνου: Μια μετα-ανάλυση. PLoS ONE 8 (8): e73367. doi: 10.1371 /journal.pone.0073367

Επιμέλεια: Balraj Mittal, Sanjay Gandhi Ιατρικό Ινστιτούτο, Ινδία

Ελήφθη: 29 Νοεμβρίου, 2012? Αποδεκτές: 23, Ιουλίου 2013? Δημοσιεύθηκε: 22 Αυγούστου 2013

Copyright: © 2013 Xia et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Οι συγγραφείς δεν έχουν καμία υποστήριξη ή χρηματοδότηση για να αναφέρετε

Αντικρουόμενα συμφέροντα:. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

Τα τελομερή (ένα διακριτικό δομή του DNA-πρωτεΐνης στο. απομακρυσμένο άκρο ευκαρυωτικών χρωμοσωμάτων) είναι ζωτικής σημασίας για γονιδιωματική σταθερότητα [1] – [5]. Σωματικά κύτταρα έχουν μια προοδευτική βράχυνση των τελομερών μετά από κάθε κυτταρική διαίρεση, ωστόσο, τα τελομερή φτάσουν ένα κρίσιμο μικρό μήκος και να χάσουν τη λειτουργία ανώτατο όριο κατά το στάδιο γήρανση σε αθάνατα καρκινικά κύτταρα. τότε Uncapped χρωμοσωμική άκρα θα προκαλέσει βλάβη του DNA που μοιάζει αποκρίσεις [6], [7]. Οι εκφράσεις του τελομεράσης μπορεί να αποτρέψει την απώλεια των τελομερών [8] – [10]. Ανθρώπινα τελομεράσης ανάστροφης μεταγραφάσης (hTERT) ως το βασικό συστατικό του τελομεράσης, εκφράζεται έντονα σε όλα ουσιαστικά τα αθάνατα κύτταρα όγκου, αλλά περιορίζεται σε φυσιολογικούς ιστούς, οδηγώντας τους ερευνητές να λαμβάνετε υπόψη hTERT ως κρίσιμο ρόλο με επιδεκτικότητα καρκίνου του [11] – [13] . MNS16A, μια πολυμορφική διαδοχικές επαναλήψεις μινιδορυφορικών σε κατάντη του γονιδίου hTERT, έχει πρώτα αναφερθεί ότι επηρεάζουν προαγωγό δραστικότητα σε κυτταρικές σειρές καρκίνου του πνεύμονα [14]. Οι παραλλαγές που περιέχουν μικρή διαδοχικές επαναλήψεις (S αλλήλιο) έχουν ισχυρότερη δραστικότητα υποκινητή από μακρές επαναλήψεις (L αλληλόμορφο), υποδεικνύοντας τον αριθμό των διαδοχικές επαναλήψεις που σχετίζονται με τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου του πνεύμονα. Στη συνέχεια, αρκετές κακοήθειες όπως εγκεφαλική [15], [16], του πνεύμονα [17], [18], του μαστού [19], [20], του παχέος εντέρου [21], ρινοφαρυγγικού [22], του καρκίνου του προστάτη [23] και ένα μετα-ανάλυση [24] είχε διερευνήσει MNS16A στην αιτιολογία του καρκίνου, αλλά με αντιφατικά αποτελέσματα. Λαμβάνοντας υπόψη το σημαντικό ρόλο της MNS16A στη δράση του υποκινητή του γονιδίου hTERT, εμείς, ως εκ τούτου διεξάγει μια μετα-ανάλυση σχετικά με τις επιλέξιμες άρθρα για την εκτίμηση σύνδεση των MNS16A με τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου.

Υλικά και Μέθοδοι

στρατηγική αναζήτησης, κριτήρια επιλεξιμότητας και

εξόρυξη δεδομένων

Όλα μεθοδολογία βασίστηκε στις κατευθυντήριες γραμμές που προτείνει το Δίκτυο Ανθρώπινου Γονιδιώματος Επιδημιολογία (HuGENet) [25] και τα στοιχεία Προτεινόμενα Πληροφόρησης για συστηματικές ανασκοπήσεις και μετα-αναλύσεις (PRISMA) [26] για τη συστηματική ανασκόπηση των μελετών γενετικής σύνδεσης. Μια συστηματική ανασκόπηση των αρχικών εκδόσεων αναλύοντας τη σχέση μεταξύ MNS16A και τον κίνδυνο καρκίνου του έγινε από την αναζήτηση PUBMED, ISI Web of Knowledge και της βάσης δεδομένων του Google Scholar και να πριν από το Φεβρουάριο του 2013, χωρίς περιορισμό γλώσσας. Η στρατηγική των λέξεων-κλειδιών ήταν: ( «Νεοπλάσματα» [Mesh] Ή «Καρκίνωμα» [Mesh]) ΚΑΙ ( «Η τελομεράση» [Mesh] Ή hTERT) ΚΑΙ MNS16A. Επιπλέον, θα προβληθεί το Ανθρώπινο Γονιδίωμα και Επιδημιολογίας Δίκτυο Navigator, καθώς και τις αναφορές τους καταλόγους των βασικών μελετών και σχόλια για πρόσθετες εκδόσεις [27]. Στη συνέχεια πραγματοποιήθηκαν τα ακόλουθα κριτήρια για την επιλογή της βιβλιογραφίας: (α) την αρχική σχετικών άρθρων περίπτωση ελέγχου συμπεριλήφθηκαν σε αυτό το χαρτί? (Β) τα άρθρα που ασχολούνται με την σχέση μεταξύ MNS16A και καρκίνων στον άνθρωπο ήταν διαθέσιμα? (Γ) τα άρθρα που παρέχουν επαρκή στοιχεία για τον υπολογισμό ΕΑΠ και 95% διαστήματα εμπιστοσύνης (ΠΙ) θεωρήθηκαν επιλέξιμες. Πληροφορίες εκχυλίζεται ανεξάρτητα από δύο ερευνητές (Rui και Ζου) για να διασφαλιστεί η ομοιογένεια της συλλογής δεδομένων και να αποκλείσει επίδραση υποκειμενικότητα στη συλλογή δεδομένων και την είσοδο. Τα ακόλουθα στοιχεία θα πρέπει να σημειωθεί: όνομα πρώτου συγγραφέα, η οποία δημοσιεύθηκε το χρόνο, τον τόπο όπου πραγματοποιήθηκε η μελέτη, την εθνικότητα, την περίοδο των σπουδών, η μέση ηλικία της υπόθεσης και του ελέγχου, ο πληθυσμός πηγή, το είδος του καρκίνου, το μέγεθος του δείγματος, μετράει παραλλαγή και στις δύο περιπτώσεις και τους ελέγχους. Για τις μελέτες που διερευνούν περισσότερους από έναν τύπο καρκίνου, τα δεδομένα εξάγονται ξεχωριστά ως ανεξάρτητη μελέτη [15], [16].

Η στατιστική ανάλυση

Μετα-ανάλυση.

Για στατιστική ανάλυση, τον αριθμό των διαδοχικές επαναλήψεις ταξινομήθηκε ως είτε μικρή (S) ή μακρά (L) αλληλόμορφα (LS σύστημα κατάταξης): αλληλόμορφα S, 213bp, 240bp, 243bp, 271bp, 272bp, 274bp? αλληλόμορφα L, 299bp, 302bp, 331bp, 333bp, 364bp, που εφαρμόζεται συχνά στη βιβλιογραφία. Με βάση την ταξινόμηση, MNS16A γονότυποι είχαν ανατεθεί σε SS, LS ή ομάδες γονότυπο LL. ΕΑΠ και το 95% ΚΠ υπολογίστηκαν εκ νέου και αξιολογήθηκε σε μοντέλα γονίδιο που βασίζονται σε συγκρίσεις μήκος MNS16A (S αλληλόμορφο έναντι αλληλόμορφο L): ένα συν κυρίαρχη γενετικό μοντέλο (SS έναντι LL? LS έναντι LL), ένα κυρίαρχο γενετικό μοντέλο (SS + LS έναντι LL ) και ένα υπολειπόμενο μοντέλο (SS έναντι LS + LL). Να διερευνήσει σε βάθος διαφορετικά μήκη MNS16A στην ομάδα αλληλόμορφο S, εμείς χαρακτήρισε το αλληλόμορφο 271bp, 272bp και 274bp ως μέση αλληλόμορφα (Μ αλληλόμορφο) και 213bp, 240bp και 243bp αλληλόμορφα ακόμα ως αλληλόμορφα S (LMS σύστημα ταξινόμησης) που περιγράφεται από τον Jin et al [18].

αναλύσεων ευαισθησίας και μεταξύ μελετών ετερογένεια.

μεταξύ μελέτη ετερογένεια εκτιμήθηκε από το

χ2-

βάση Cochran του

Q

στατιστικό αποτέλεσμα της δοκιμής και

2

μετρικό [28]. Ετερογένεια θεωρήθηκε σημαντική σε

P

& lt? 0,1 για το

Q

στατιστική (για να εκτιμήσει κατά πόσον παρατηρείται απόκλιση υπερβαίνει αναμένεται διακύμανσης). Και για το

2

μετρικό (

2

= 100% × (

Q

df

) /

Q

), χρησιμοποιήθηκαν τα ακόλουθα σημεία αποκοπής:

2

= 0-25%, δεν ετερογένεια?

2

= 25-50%, μέτρια ετερογένεια?

2

= 50-75%, μεγάλη ετερογένεια?

2

= 75-100%, ακραία ετερογένεια. Η σημασία των συνδυασμένων ΕΑΠ προσδιορίστηκε χρησιμοποιώντας το

Z

δοκιμή (

P

& lt? 0,05 θεωρήθηκε στατιστικά σημαντική). Το μοντέλο τυχαία επίδραση Dersimonian και Laird [29] χρησιμοποιήθηκε για τον υπολογισμό συγκεντρωτικά ΕΑΠ και 95% πιστωτικών ιδρυμάτων σύμφωνα με την ετερογένεια τους, διαφορετικά, εφαρμόστηκε ένα σταθερό μοντέλο επιπτώσεις (η μέθοδος Mantel-Haenszel). Στρωματοποιημένη ανάλυση πραγματοποιήθηκε για δύο ομάδων εθνότητα, προκειμένου να διερευνηθεί η υπόθεση των γενετικών μηχανισμών εθνικότητας ειδικά στην ανάπτυξη του MNS16A. Περίληψη ΕΑΠ και 95% CI υπολογίστηκαν επίσης μετά από στρωματοποίηση για τον τύπο του καρκίνου. Επιπλέον, η ανάλυση ευαισθησίας διεξήχθη διαδοχικά με την παράλειψη κάθε άρθρο από την μετα-ανάλυση με τη σειρά του για να προσδιοριστεί η επίδραση της κάθε μελέτης σχετικά με την συνολική εκτίμηση [30]. Αθροιστική μετα-ανάλυση έγινε με μια συλλογή όλων των επιλέξιμων μελέτες για τον καρκίνο εντός των ετών δημοσίευση. Τέλος, η προκατάληψη δημοσίευση αξιολογήθηκε με δοκιμή Begg και δοκιμή Egger για να ανιχνεύσουν την μικρή επίδραση μελέτη [31]. Όλες οι στατιστικές αναλύσεις πραγματοποιήθηκαν με το λογισμικό STATA (έκδοση 10.1), και ένα 2-sided

P

τιμή μικρότερη από 0,05 θεωρήθηκε σημαντική, εκτός από

Q

δοκιμή για ετερογένεια, για τις οποίες εφαρμόστηκε λιγότερο από 0,1 επίπεδο στατιστικής σημαντικότητας.

η εκτίμηση της αξιοπιστίας των στατιστικά σημαντικές συσχετίσεις.

Κάθε παραλλαγή με στατιστικά σημαντικές συσχετίσεις με μετα-ανάλυση αξιολογήθηκαν βάσει του Ανθρώπινου Γονιδιώματος Επιδημιολογία δίκτυο κριτήρια της Βενετίας. Αξιοπιστία ορίστηκε ως «ισχυρή», «μέτρια» ή «αδύναμος» με βάση τους βαθμούς Α, Β ή C σε τρεις κατηγορίες: 1) το ποσό των αποδείξεων? 2) την αντιγραφή? και 3) την προστασία από προκαταλήψεις. Ποσό των αποδείξεων εκτιμήθηκε με βάση το μέγεθος του αλληλόμορφου δοκιμής μεταξύ των περιπτώσεων και ελέγχων σε μετα-ανάλυση (n

ανήλικος): Βαθμός Α, Β, C απαιτεί n

ανήλικος & gt? 1000, 100 ≤ n

ανήλικος ≤ 1000, n

ανήλικος & lt? 100. Αντιγραφής βαθμολογήθηκε από τη στατιστική ετερογένεια: βαθμίδων Α, Β, και Γ είχαν ανατεθεί για

2

λιγότερο από 25%, 25-50%, και περισσότερο από το 50%, αντίστοιχα. Αξιολόγηση της προστασίας από προκαταλήψεις βαθμολογήθηκε με βαθμό Α, αν δεν υπήρχε παρατηρήσιμη προκατάληψη, Β βαθμού, αν προκατάληψη θα μπορούσαν να είναι παρόντες, ή βαθμό C αν προκατάληψη ήταν απόδειξη (η παρουσία της μια σύνοψη ΕΑΠ λιγότερο από 1,15 ή απώλεια της στατιστικής σημαντικότητας αφού εκτός από το αρχική μελέτη) [32].

Αποτελέσματα

Θέματα χαρακτηριστικά

Μετά την ολοκληρωμένη αναζήτηση των 71 άρθρων, εντοπίσαμε 10 σχετικές δημοσιεύσεις, συμπεριλαμβανομένων 6101 περιπτώσεις και 10521 μάρτυρες από 13 μελέτες για να αξιολογηθεί η συσχέτιση μεταξύ MNS16A και του κινδύνου καρκίνου (Σχήμα 1): 2 μελέτες επικεντρώθηκαν σε γλοιοβλάστωμα [15], [16], 2 μελέτες επικεντρώθηκαν στην γλοιώματος [15], [16], 3 μελέτες επικεντρώθηκαν σε μη μικροκυτταρικό καρκίνο του πνεύμονα [ ,,,0],14], [17], [18], 2 μελέτες επικεντρώθηκαν στον καρκίνο του μαστού [19], [20] και το καθένα ήταν ένα για μηνιγγίωμα [15], ορθοκολικό καρκίνωμα [21], το ρινοφαρυγγικό καρκίνωμα [22] και του καρκίνου του προστάτη [23 ] (Τραπέζι 1). Όλες οι μελέτες ήταν μελέτες ασθενών-μαρτύρων, των οποίων η πιο συχνά διερευνηθεί ήταν καρκίνο του εγκεφάλου (6451 άτομα? 38,81%). Μεταξύ αυτών, 9 μελέτες διεξήχθησαν σε Καυκάσιους (10400 θέματα? 62,57%) και 4 στους Ασιάτες (6222 άτομα? 37.43%).

Η

Τα αποτελέσματα της μετα-ανάλυσης

Όπως φαίνεται στον πίνακα 2, όλες οι μελέτες ομαδοποιήθηκαν σε μια μετα-ανάλυση, και η αυξημένη συσχέτιση μεταξύ MNS16A και τον κίνδυνο του καρκίνου αποτελέσματα για όλες τις γονοτυπικής μοντέλα. αναλύσεις τυχαίας επίδρασης μοντέλο συγκέντρωσης απέδωσε συνολικά ΕΑΠ 1,15 (95% CI = 01.03 έως 01.28?

P

για ετερογένεια = 0,102,

2

= 35,0%) για το LS γονότυπο έναντι LL γονότυπο, και 1,17 (95% CI = 01.05 – 01.31?

P

για ετερογένεια = 0.064,

2

= 40,5%) για το κυρίαρχο μοντέλο. Σε σταθερή επιπτώσεις μοντέλο, συνολικά ΕΑΠ ήταν 1,32 (95% CI = 1,14 – 1,53?

P

για ετερογένεια = 0,337,

2

= 10,8%) για το SS γονότυπο έναντι LL γονότυπο, και 1,23 (95% CI = 1,07 – 1,41?

P

για ετερογένεια = 0.307,

2

= 13,7%) για το υπολειπόμενο μοντέλο

στη συνέχεια θα κατηγοριοποιούνται τα δεδομένα στην κατάταξη LMS περιγράφεται από τον Jin et al. να διερευνήσει σε βάθος την επίδραση της MNS16A S αλληλόμορφο (η σύντομη αλληλόμορφο) και Μ αλληλόμορφο (το μεσαίο αλληλόμορφο) με τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου. Όπως φαίνεται στον Πίνακα 2, 8 μελέτες κατατάχθηκαν κατά την διάρκεια σύστημα ταξινόμησης LMS. Όλα τα γενετικά μοντέλα αποκάλυψε ότι S αλληλόμορφο παρουσίασε έναν μεγάλο κίνδυνο καρκίνου από το Μ αλληλόμορφο και 95% ΚΠ ήταν σε κοντινή απόσταση στατιστικά σημαντική.

Στρωματοποιημένη ανάλυση

Στρωματοποιημένη ανάλυση πραγματοποιήθηκε για δύο ομάδων εθνότητα, προκειμένου να διερευνήσει η υπόθεση της Ασίας και του Καυκάσου γενετικούς μηχανισμούς για την ανάπτυξη της MNS16A. (Πίνακας 3). Καμία ένδειξη ετερογένειας αποκαλύφθηκε σε Καυκάσιο πληθυσμό (

P

για ετερογένεια & gt? 0.1), και όλες τις γενετικές μοντέλα που παρουσιάζονται σημαντικά αυξημένο κίνδυνο καρκίνου, με την ΕΑΠ 1,16 (95% CI = 01.05 – 01.28), 1.33 (95% CI = 1,15 – 1,54), 1,19 (95% CI = 01.09 – 01.31), και 1,23 (95% CI = 1,07 – 1,42) για LS έναντι LL γονότυπο, SS έναντι LL γονότυπο, κυρίαρχο μοντέλο, και υπολειπόμενο μοντέλο, αντίστοιχα. Ωστόσο, όλες οι γενετικές μοντέλα που παρουσιάζονται στατιστικές διαφορές του κινδύνου εμφάνισης καρκίνου μεταξύ των ασιατικών πληθυσμών (Σχήμα 2).

Η

Στη συνέχεια, εκτιμήσαμε την πηγή της ετερογένειας με βάση τον τύπο του καρκίνου (Πίνακας 3). Βάσει των πέντε εγκεφαλικής μελέτες για τον καρκίνο, δεν υπήρχε ετερογένεια για όλα τα γενετικά μοντέλα

για ετερογένεια & gt? 0,1). Ασθενείς με MNS16A-S αλλήλιο είχε μια σημαντική συσχέτιση στατιστικά με εγκεφαλική τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου: με ΕΑΠ 1,42 (95% CI = 1,19 – 1,70), 1,22 (95% CI = 1,09 – 1,37), 1,32 (95% CI = 1,11 – 1,56 ) για SS έναντι LL γονότυπο, κυρίαρχα και υπολειπόμενο μοντέλο (

P

για ετερογένεια & gt? 0,1). Για τον καρκίνο του μαστού, οι ασθενείς μεταφέρονται με LS γονότυπο είχαν υψηλότερο κίνδυνο από SS γονότυπο, η οποία ΕΑΠ και 95% CI ήταν 1,52 (1,19 – 1,94) και 1,46 (1,16 έως 1,84) για την LS έναντι LL γονότυπο και κυρίαρχα μοντέλα. Ωστόσο, καμία στατιστικά σημαντικές συσχετίσεις παρατηρήθηκαν σε ασθενείς με καρκίνο του πνεύμονα (Σχήμα 3).

Η

Αθροιστική μετα-ανάλυση

Αθροιστική μετα-αναλύσεις των MNS16A διεξήχθησαν με μια κατάταξη των μελετών σε χρονολογική σειρά. Το Σχήμα 4 δείχνει τα αποτελέσματα από τις σωρευτικές μετα-αναλύσεις σε σταθερών επιδράσεων μοντέλο. Η επίδραση της MNS16A έτειναν να δείχνουν μια σημαντική συσχέτιση με τον χρόνο σε όλα τα γενετικά μοντέλα. Επιπλέον, οι 95% ΠΙ έγινε όλο και πιο στενά με την αύξηση των δεδομένων, γεγονός που υποδηλώνει ότι η ακρίβεια των εκτιμήσεων σταδιακά ενισχύθηκε με τη συνεχή προσθήκη περισσότερων μελετών.

Η

Ανάλυση ευαισθησίας

Από μέτρια ετερογένεια παρατηρήθηκαν υπό την γονοτυπική μοντέλο LS έναντι LL και κυρίαρχα μοντέλα, πραγματοποιήσαμε μια ευαισθησία μετα-ανάλυση για την αξιολόγηση των αποτελεσμάτων της κάθε μελέτης σχετικά με τις συνδυασμένες ΕΑΠ και 95% ΠΙ. Ένα μοντέλο τυχαίας επίδρασης που απασχολούνται από την ετερογένεια υποδείχθηκε. ανάλυση ευαισθησίας έδειξε την ανεξάρτητη μελέτη που συμβάλλουν στην πιο ετερογένεια διεξήχθη από Zhang et al. Η ανομοιογένεια ήταν εντελώς μειωθεί από τον αποκλεισμό της εν λόγω μελέτης: υπό την γονοτυπική μοντέλο LS έναντι LL, ΕΑΠ = 1.15 (95% CI = 01.03 έως 01.28,

P

για ετερογένεια = 0,102,

2

= 35,0%) και ΕΑΠ = 1.20 (95% CI = 01.10 – 01.31,

P

για ετερογένεια = 0,656,

2

= 0.00%), πριν και μετά την αφαίρεση, αντίστοιχα. Παράλειψη των μελετών από Andersson et al. άλλαξε τα συγκεντρωμένα ΕΑΠ κλασματικά (Πίνακας 4).

Η

προκατάληψη Δημοσίευση

Όπως φαίνεται και από τις δύο οπτικοποίηση του οικοπέδου χοάνη ή Egger και δοκιμασία Begg του, δεν υπήρχε καμία ένδειξη για μεροληψία δημοσίευσης στην γονοτυπική μοντέλα LS έναντι LL, SS έναντι LL, κυρίαρχη, και υπολειπόμενο μοντέλο (

P

= 0.482,

P

= 0.537,

P

= 0.551 και

P

= 0,745, αντίστοιχα), παρουσιάζοντας τα αποτελέσματα ήταν στατιστικά ισχυρή.

η ταξινόμηση των συλλόγων

Με βάση τα προηγούμενα προτεινόμενες κατευθυντήριες γραμμές και την εφαρμογή των κριτηρίων της Βενετίας, το ποσό των αποδεικτικών στοιχείων κατηγοριοποιούνται ως Α, δεδομένου ότι n του

ανήλικος είναι άνω των 1.000 (n

ανήλικος = 2558)? αντιγραφής ανατέθηκε στην κατηγορία Β, επειδή το ποσό των μεταξύ μελετών ετερογένεια (

2

= 40,5%)? και την προστασία από προκαταλήψεις βαθμολογήθηκε ως κατηγορία Β, λόγω της παρουσίας της περίληψης ΕΑΠ μικρότερη από 1,15, το οποίο μπορεί εύκολα να διαχέεται ακόμη και από σχετικά μικρές αποκλίσεις σε μια μετα-ανάλυση των δημοσιευμένων στοιχείων. Η συνολική αξιολόγηση της σύνδεσης μεταξύ MNS16A και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου ήταν μέτρια αθροιστική απόδειξη (ABB). Μετά από στρωματοποίηση κατά εθνικότητα, η μετα-ανάλυση έδειξε με συνέπεια σημαντικό κίνδυνο καρκίνου του συνεταιρίζεσθαι σε Καυκάσιο πληθυσμό και ανατέθηκαν μια συνολική ισχυρή επιδημιολογική αξιοπιστίας (ΑΑΑ). Ασιατικό πληθυσμό δεν είχαν στατιστικά σημαντικά ευρήματα και τοποθετήθηκε σε αδύναμα στοιχεία. Επιπλέον, η ισχυρή επιδημιολογική αξιοπιστίας (ΑΑΑ) παρατηρήθηκε επίσης για συσχέτιση μεταξύ MNS16A με εγκεφαλική καρκίνο και τον καρκίνο του μαστού (Πίνακας 5).

Η

Σύγκριση με προηγούμενα δημοσιευμένες μετα-αναλύσεις

μια μετα-ανάλυση που αφορά όλους τους πολυμορφισμούς τόπου hTERT με την ευαισθησία του καρκίνου, Simone et al. διερευνώνται ότι MNS16A S αλληλόμορφο ήταν στατιστικά σχετίζεται με αυξημένο κίνδυνο των όγκων του κεντρικού νευρικού συστήματος (ΚΝΣ). Σε σύγκριση, μας μετα-ανάλυση προστεθούν περισσότερες δημοσιεύσεις για να εξετάσει ένωση MNS16A με όλα τα διαθέσιμα τύπος καρκίνου? ανέλυσε τα δεδομένα σε διαφορετικό σύστημα ταξινόμησης MNS16A (LS και LMS σύστημα ταξινόμησης)? στρωματοποιημένη τύποι εθνικότητα και τον καρκίνο για περαιτέρω έρευνα.

Συζήτηση

Μια σειρά από καλά σχεδιασμένες μελέτες σύνδεσης γονιδιώματος μεγάλη (GWAS) είχε εμπλακεί παραλλαγές σε θέση hTERT να σχετίζεται σημαντικά με όλες σχεδόν τις κακοήθεις όγκους [ ,,,0],33]. MNS16A, ένα 23 bp (ή 26 bp) αλληλουχία διαδοχική επανάληψη (TCCTCTTAT (cat) CTCCCAGTCTC) σε υποθετική περιοχή προαγωγού της μεταγραφής αντιπληροφοριακού RNA, αναφέρθηκε αρχικά να αυξηθεί η έκφραση των hTERT mRNA σε ιστούς καρκίνου του πνεύμονα. Στην παρούσα μελέτη, προχωρήσαμε σε μια μετα-ανάλυση 10 προηγουμένως δημοσιευμένα άρθρα που περιλαμβάνουν 6101 περιπτώσεις και 10521 ελέγχων σχετικά με τη σύνδεση της MNS16A με τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου. Αν και όλα τα γενετικά μοντέλα MNS16A έδειξε μια μέτρια συσχέτιση με τον κίνδυνο καρκίνου, η επίδραση θα μπορούσε πολύ καλά να κινείται από την επίδραση στην εγκεφαλική καρκίνο. Στη συνέχεια, μπορούμε στρωματοποιημένη τύπους καρκίνου και διαπίστωσε ασθενείς με καρκίνο και τον καρκίνο του μαστού εγκεφαλική έδειξαν ισχυρή αθροιστική απόδειξη για τις ενώσεις, αλλά ο καρκίνος του πνεύμονα δεν ήταν. Εκτός από αυτό, η εθνικότητα επίσης στρωματοποιημένη σε αυτό το έργο. Καυκάσιος πληθυσμός παρουσίασε σημαντικά αυξημένο σχέση με τον κίνδυνο καρκίνου, ενώ οι Ασιάτες όχι. Η διακύμανση του αποτελέσματος μεταξύ Καυκάσιων και οι Ασιάτες θα μπορούσε να συμβάλει σε αυτό κατά προσέγγιση το 70% Καυκάσιων ήταν εγκεφαλική καρκίνου, ενώ ομοίως η απουσία αποτελέσματος Ασιάτες θα μπορούσε κάλλιστα να οφείλεται στο γεγονός ότι μόνο ο καρκίνος μη-εγκεφαλική διεξήχθησαν σε αυτόν τον πληθυσμό. Επιπλέον, δεν υπήρχε σχεδόν καμία προφανώς ετερογένεια από στρωματοποιημένη για τον τύπο του καρκίνου, η οποία πρότεινε διαφορικά αποτελέσματα του MNS16A σε διάφορα είδη καρκίνου. Ωστόσο, η λειτουργική σημασία της δραστηριότητας μεταγραφής χωρίς νόημα και ακριβείς μοριακούς μηχανισμούς της MNS16A με διάφορους τύπους καρκίνου ήταν ακόμα ασαφής

Στην εργασία αυτή, αναλύσαμε τα δεδομένα σε διαφορετικό σύστημα ταξινόμησης:. LS και LMS (περιγράφεται από Hofer et al . [21]) σύστημα ταξινόμησης για την περαιτέρω ανασκαφή. Τα αποτελέσματα κατάλαβα ότι η S αλληλόμορφο είχαν υψηλότερη σχέση από το Μ αλληλόμορφο με MNS16A. Η αιτία μπορεί να οφείλεται στο μέγεθός της MNS16A: αλληλόμορφο Μ περιέχει τρία 26 επαναλήψεις bp? λαμβάνοντας υπόψη ότι η S αλληλόμορφα περιέχουν δύο επαναλήψεις 26 bp. Ως εκ τούτου, θα μπορούσαμε να δούμε ότι, 26 bp που μπορεί να επηρεάσει ως καταστολέας για υποστηρικτής της αντίθετης φοράς TERT mRNA [18]. Είναι πιο λογικό να αλληλόμορφο S ανάλυση MNS16A και Μ αλληλόμορφο ξεχωριστά σε μελλοντική έρευνα για να βρείτε ακριβή γονότυπο με τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου.

Μέσω της ανάλυσης ευαισθησίας, παράλειψη ένα άρθρο από τον Zhang et al. εξαλειφθεί η ανομοιογένεια των LS έναντι LL γονότυπο και κυρίαρχα μοντέλα (P για την ετερογένεια & gt? 0,1). Ο λόγος μπορεί να οφείλεται στις χαμηλότερες συχνότητες της S αλληλόμορφου σε Ασιάτες. Επιπλέον, το άρθρο παράλειψη Carpentier, οι ΕΑΠ εξακολουθούν να παρουσιάζονται αυξημένο κίνδυνο, και 95% CI ήταν σε κοντινή απόσταση στατιστικά σημαντική (OR = 1,15, 95% CI = 01.03 έως 01.28? OR = 1.14, 95% CI = 01.01 – 01.29, πριν και μετά την αφαίρεση), το οποίο δεν άλλαξε ουσιαστικά τα συγκεντρωμένα ΕΑΠ, καθώς και το άρθρο του Andersson.

Ορισμένοι από τους περιορισμούς που απαιτούνται σοβαρά υπόψη. Κατ ‘αρχάς, αποτέλεσμα μας βασίστηκε σε αδιόρθωτη εκτιμήσεις. Ατομικά στοιχεία δεν ήταν διαθέσιμα για μια προσαρμοσμένη εκτίμηση κατά ηλικία και φύλο, η οποία θα μπορούσε ενδεχομένως να οδηγήσει σε ψευδώς θετικά αποτελέσματα. Ένας άλλος περιορισμός έλειπε αρχικά δεδομένα να περιορίσει περαιτέρω αξιολόγησή μας της αλληλεπίδρασης γονιδίων-περιβάλλοντος, όπως το κάπνισμα, η χρήση αλκοόλ και άλλα κλινικά χαρακτηριστικά. Τέλος, έλλειψη επαρκούς πρωτότυπων μελετών περιορίζεται περαιτέρω αξιολόγηση μας καρκίνου του παχέος εντέρου, ο καρκίνος του μαστού και τον κίνδυνο καρκίνωμα του ρινοφάρυγγα με MNS16A.

Συμπέρασμα

Το έργο αυτό επαληθεύεται το σημαντικό ρόλο της MNS16A μίνι-δορυφόρους σε εγκεφαλική και του μαστού προδιάθεση καρκίνου. Πρόσθετες μεγαλύτερες μελέτες ήταν επιβεβλημένη προκειμένου να επικυρωθούν τα συμπεράσματά μας.

Υποστήριξη Πληροφορίες

Λίστα ελέγχου S1.

doi: 10.1371 /journal.pone.0073367.s001

(DOC)

Ευχαριστίες

Το έργο αυτό διορθωμένο από την Ελένη Neumann από κινητό Στρες & amp? Συνοδοί Editorial Office και κυττάρων άγχος Κοινωνία Διεθνή Τμήμα Μοριακής & amp? Βιολογίας Κυττάρου, Πανεπιστήμιο του Κονέκτικατ.

You must be logged into post a comment.