Αφηρημένο

Η επικύρωση των υποψηφίων βιοδεικτών συχνά παρεμποδίζεται από την έλλειψη ενός αξιόπιστου μέσο αξιολόγησης και τη σύγκριση των επιδόσεων. Παρουσιάζουμε εδώ ένα σύνολο αναφοράς δειγμάτων ορού και πλάσματος για να διευκολύνει την επικύρωση των βιοδεικτών για χειρουργήσιμο καρκίνο του παγκρέατος. Το σύνολο αναφοράς περιλαμβάνει μια μεγάλη ομάδα των ασθενών με καρκίνο του παγκρέατος σταδίου Ι-ΙΙ, που έχουν προσληφθεί από 5 διαφορετικά θεσμικά όργανα και τις σχετικές ομάδες ελέγχου. Έχουμε χαρακτήρισε την απόδοση της τρέχουσας καλύτερη ορολογική βιοδείκτη για τον καρκίνο του παγκρέατος, CA 19-9, χρησιμοποιώντας δείγματα πλάσματος από την αναφορά που να παρέχει ένα σημείο αναφοράς για μελλοντικές μελέτες βιοδεικτών και να διευρύνουν τις γνώσεις μας για CA 19-9 για τον καρκίνο του παγκρέατος σε πρώιμο στάδιο και οι ομάδες ελέγχου. CA 19-9 διακρίνονται καρκίνων του παγκρέατος από τα υγιή και χρόνιας παγκρεατίτιδας ομάδες με μέσο όρο ευαισθησία και ειδικότητα 70-74%, παρόμοια με προηγούμενες μελέτες που χρησιμοποιούν όλα τα στάδια του καρκίνου του παγκρέατος. Ασθενείς με χρόνια παγκρεατίτιδα δεν δείχνουν CA 19-9 υψόμετρα, αλλά οι ασθενείς με καλοήθη απόφραξη των χοληφόρων είχαν αυξήσεις σχεδόν τόσο υψηλές όσο οι ασθενείς με καρκίνο. Έχουμε αποκτήσει πρόσθετες πληροφορίες σχετικά με την βιοδεικτών συγκρίνοντας δύο διαφορετικές δοκιμασίες. Οι δύο δοκιμασίες CA 9-9 συμφώνησαν επίσης στη συνολική απόδοση, αλλά αποκλίνει σε μετρήσεις των μεμονωμένων δειγμάτων, πιθανώς λόγω λεπτές διαφορές στην εξειδίκευση αντισώματος όπως αποκαλύπτεται από γλυκάνης ανάλυση της σειράς. Επομένως, το σύνολο αναφοράς υπόσχεται να είναι μια πολύτιμη πηγή για την επικύρωση βιοδεικτών και τη σύγκριση, καθώς και τα δεδομένα CA 19-9 που παρουσιάζονται εδώ θα είναι χρήσιμα για τη συγκριτική αξιολόγηση και για τη διερεύνηση των σχέσεων με την CA 19-9

Παράθεση:. Χάαμπ BB , Huang Υ, Balasenthil S, Partyka Κ, Tang Η Anderson Μ, et al. (2015) Οριστικός Χαρακτηρισμός του CA 19-9 σε χειρουργήσιμο καρκίνο του παγκρέατος χρησιμοποιώντας ένα σύνολο αναφοράς του ορού και δείγματα πλάσματος. PLoS ONE 10 (10): e0139049. doi: 10.1371 /journal.pone.0139049

Επιμέλεια: Zoltán Rakonczay Jr., Πανεπιστήμιο του Szeged, Ουγγαρία

Ελήφθη: 18, Ιουνίου 2015? Αποδεκτές: έβδομης Σεπτεμβρίου 2015? Δημοσιεύθηκε: δεύτερης Οκτωβρίου 2015

Αυτό είναι ένα ανοικτό άρθρο πρόσβασης, χωρίς όλα τα πνευματικά δικαιώματα, και δεν μπορεί να αναπαραχθεί ελεύθερα, διανεμηθεί, να μεταδοθεί, τροποποιηθεί, χτισμένο πάνω, ή ειδάλλως να χρησιμοποιηθεί από οποιονδήποτε για οποιονδήποτε νόμιμο λόγο. Το έργο γίνεται διαθέσιμα υπό την Creative Commons CC0 δημόσιο τομέα αφοσίωση

Δεδομένα Διαθεσιμότητα:. Είναι διαθέσιμα στην Υποστήριξη πληροφορίες Τα δεδομένα CA19-9

Χρηματοδότηση: Το έργο αυτό χρηματοδοτήθηκε με την έγκαιρη διάγνωση Ερευνητικό Δίκτυο του Εθνικού Ινστιτούτου για τον Καρκίνο (U01CA152653 να BB Χάαμπ, RE Brand, και P. Allen? και U01CA111302 με την τροπολογία Killary, ML Frazier, και S. Sen). Οι συγγραφείς θα ήθελα επίσης να ευχαριστήσω τον έγκαιρο εντοπισμό Δίκτυο Έρευνας για την παροχή των παγκρεατικών δείγματα που χρησιμοποιήθηκαν για αυτή τη μελέτη

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

Η πρόοδος των γνώσεων σχετικά με τον καρκίνο του παγκρέατος έχουν προκαλέσει ενθουσιασμό για τις προοπτικές σημαντικής προόδου σε σχέση με αυτήν την θανάσιμη ασθένεια [1, 2]. Μεταξύ άλλων περιοχών, το πεδίο έχει γνωρίσει προόδους στην κατανόηση της γενετικής έναρξη και την πρόοδο της ασθένειας [3], ο ρόλος του στρώματος στην προώθηση του καρκίνου και σε παρεμπόδιση συστηματικές θεραπείες [4-7], και ο ρόλος του πλαστικότητα στον καρκίνο κυττάρου [8]. Ενώ αυτές οι πληροφορίες θα είναι θεμελιώδεις για την ανάπτυξη αποτελεσματικών θεραπειών, οι βελτιώσεις στην επιβίωση, επίσης, θα εξαρτηθεί από την καλύτερη ανίχνευση, διάγνωση και αποφάσεις για τη θεραπεία βασίζεται στα ατομικά χαρακτηριστικά του ασθενούς. Πρέπει να προωθήσουν την ικανότητά μας να ανιχνεύσει ένα καρκίνο του παγκρέατος σε πρώιμο στάδιο, όταν είναι δυνητικά ιάσιμη με χειρουργική εκτομή, και χρειαζόμαστε καλύτερους τρόπους για να καθορίσουν τη διαδρομή της περίθαλψης που θα είναι πιο αποτελεσματική για κάθε ασθενή.

Μοριακοί βιοδείκτες υπόσχονται να παρέχουν τέτοιες ακριβή, πληροφορίες για τον ασθενή συγκεκριμένες [9], αλλά η ανάπτυξη και η εφαρμογή τους είναι δύσκολη και αργή. Σε παγκρέατος έρευνα για τον καρκίνο, ένα σημαντικό εμπόδιο για την ανάπτυξη των μοριακών βιοδεικτών είναι οι περιορισμένοι πόροι για την αξιολόγηση και τη σύγκριση των υποψήφιων βιοδεικτών χρησιμοποιώντας δείγματα που συλλέχθηκαν στα πρώτα στάδια της ανάπτυξης του καρκίνου, όταν είναι δυνατόν εκτομή για τη θεραπεία. Μια σημαντική ποσότητα του χρόνου που συνήθως απαιτείται για να είναι δυνατή μια ακριβής εκτίμηση του βιοδείκτη και πριν να ληφθούν αποφάσεις για περαιτέρω επενδύσεις. Πιο συχνά από ό, τι δεν, είναι ελπιδοφόρα αποτελέσματα στις πρώτες μελέτες που δεν τεκμηριώνονται στην παρακολούθηση σπουδών, ή η απόδοση ενός βιοδείκτη δεν είναι συνεπής μεταξύ των μελετών [10, 11]. Απαιτείται μια συνεπής και συστηματική προσέγγιση για την αξιολόγηση των υποψηφίων βιοδεικτών.

Για να αντιμετωπιστεί η ανάγκη για την αξιολόγηση του παγκρέατος βιοδείκτες του καρκίνου, μια συνεργατική ομάδα, κατά την Πρώιμη Ανίχνευση Δίκτυο Έρευνας (EDRN) ανέπτυξε πρόσφατα μια αναφορά που ανθρώπινων δειγμάτων . Το κίνητρο για την ανάπτυξη της σειράς αναφοράς ήταν να επιτρέψει την οριστική αξιολόγηση των υποψηφίων βιοδεικτών για καρκίνο του παγκρέατος, να παρέχουν ακριβείς συγκρίσεις μεταξύ των υποψήφιων βιοδεικτών, και για να δοκιμαστεί η συνδυασμένη χρήση διαφορετικών βιοδεικτών. Ένα κοινό σύνολο των δειγμάτων, τα οποία συλλέγονται σύμφωνα με αυστηρά πρότυπα σε πολλαπλά όργανα και περιλαμβάνει τους πληθυσμούς ασθενών πιο σχετικές με τις κλινικές απαιτήσεις, είναι απαραίτητη για την επίτευξη των στόχων αυτών [12]. Αρκετές αρχές καθοδήγησε την δημιουργία του σετ. Το σετ ήταν να περιλαμβάνουν δείγματα από πολλούς οργανισμούς, έτσι ώστε να μην είναι αντιπροσωπευτική μόνο μια γεωγραφική περιοχή? συλλογής δειγμάτων ήταν να ακολουθήσει ένα ενιαίο, λεπτομερές τυποποιημένη διαδικασία λειτουργίας, την πρόληψη της εισαγωγής της προκατάληψης στο σύνολο? οι ασθενείς ήταν να συμπεριλάβει πολλά με χειρουργήσιμο καρκίνο, το οποίο είναι το πιο δύσκολο να εντοπιστεί ακόμα το πιο σημαντικό για πιθανές θετικές επιπτώσεις? και τα θέματα ελέγχου ήταν να συμπεριλάβει τόσο υγιείς ανθρώπους και ασθενείς με καλοήθεις παθήσεις του παγκρέατος, επειδή ορισμένες ευνοϊκές συνθήκες μπορεί να είναι δύσκολο να διακριθεί από καρκίνο του παγκρέατος και μπορεί να προκαλέσει αυξήσεις στις βιοδείκτες του καρκίνου.

Όσον αφορά τον πληθυσμό ασθενών, επιλέξαμε να συγκεντρώσει τα δείγματα από ασθενείς με σταδίου Ι ή καρκίνο II όπως επιβεβαιώθηκε από χειρουργική παθολογία. Αυτοί οι ασθενείς είναι επιλέξιμοι για χειρουργική θεραπεία και κατά μέσο όρο έχουν σημαντικά καλύτερα αποτελέσματα από ό, τι το υπόλοιπο των ασθενών με καρκίνο του παγκρέατος. Ανίχνευση του καρκίνου, ακόμη και νωρίτερα, δηλαδή σε καρκίνωμα in-situ ή PanIN-3, θα ήταν προτιμότερο να ανίχνευση στο στάδιο Ι, επειδή οι ασθενείς με σταδίου Ι συνήθως να συνεχίσουν να αναπτύσσουν υποτροπή μετά από χειρουργική επέμβαση. Προς το παρόν δεν έχουμε έναν τρόπο να επιβεβαιώσει συνήθως την παρουσία PanIN-3, έτσι συναρμολόγηση δείγματα από μια ομάδα αυτών των ασθενών δεν είναι ακόμη δυνατή. Μια εναλλακτική προσέγγιση που χρησιμοποιήθηκε στο παρελθόν ήταν να συγκεντρωθούν τα δείγματα που είχαν συλλεχθεί πριν από τη διάγνωση του καρκίνου του παγκρέατος, τα οποία προσδιορίζονται μέσα από την εξέταση των πληροφοριών παρακολούθησης από μαζικές μελέτες για τη δημόσια υγεία να βρείτε άτομα που τελικά ανέπτυξαν καρκίνο του παγκρέατος [13, 14]. Τέτοια δείγματα είναι πολύτιμα για τη διερεύνηση της σκοπιμότητας του προσυμπτωματικού ελέγχου για τον καρκίνο, αλλά δεν έχουν σχεδιαστεί για τη δοκιμή για την ανίχνευση πριν από το στάδιο Ι ή ΙΙ, διότι το στάδιο της νόσου δεν είναι γνωστή. Επιπλέον, λόγω της δυσκολίας στη λήψη αυτών των δειγμάτων, το οποίο συνήθως είναι επέμενε για ένα μικρό μόνο αριθμό μελετών. Ως εκ τούτου, επιδιώξαμε την συναρμολόγηση ενός συνόλου του δείγματος που θα μπορούσε να χρησιμοποιηθεί για πολλές μελέτες και ότι θα ήταν χρήσιμα σε ένα σημαντικό στόχο στην παγκρέατος θεραπεία του καρκίνου, την ανίχνευση των περισσότερων καρκίνων σε ένα στάδιο που είναι επιλέξιμες για τη χειρουργική επέμβαση.

το 19-9 δοκιμασία CA είναι η τρέχουσα καλύτερη ορολογική βιοδείκτη για τον καρκίνο του παγκρέατος. Το μονοκλωνικό αντίσωμα CA 19-9 εγέρθηκε έναντι ενός ορθοκολικού καρκίνου κυτταρική γραμμή [15], και το αντιγόνο δεσμεύει είναι μια δομή υδατάνθρακα που συνδέονται με μία ποικιλία πρωτεϊνών και των λιπιδίων [16]. Παρά το γεγονός ότι τα επίπεδα στο αίμα του συνδέονται στενά με καρκίνο του παγκρέατος-it είναι αυξημένα σε 70-80% των ασθενών με καρκίνο του παγκρέατος και σε περίπου 20% των ασθενών με καλοήθεις συνθήκες του παγκρέατος [17] Απόδοση -η δεν είναι επαρκής για τη διάγνωση του καρκίνου, όπως ο κίνδυνος των δύο ψευδώς αρνητικά και ψευδώς θετικά διαγνώσεις είναι απαράδεκτα υψηλό. Περίπου 5% των ασθενών με καρκίνο του παγκρέατος δεν αυξάνουν CA 19-9 λόγω βλαστικής σειράς μεταλλάξεων ως αποτέλεσμα ανικανότητα να παράγουν το γλυκάνης [18], και μια άλλη ομάδα των ασθενών δεν ανυψώνουν CA 19-9 για άγνωστους λόγους. Οι μη-ειδικές αυξήσεις της CA 19-9 αποτέλεσμα κυρίως από βλάβη στο χοληδόχο πόρο ή τμήματα των παγκρεατικών αγωγών που είναι επικαλυμμένα με το αντιγόνο 19-9 CA. Νέα βιοδεικτών για τη διάγνωση του καρκίνου του χειρουργήσιμη πρέπει να έχουν καλύτερες επιδόσεις από CA 19-9, τόσο ως προς την ευαισθησία και την ειδικότητα, είτε ως ένα ενιαίο βιοδείκτη ή πιο πιθανό σε συνδυασμό.

Οι στόχοι της παρούσας μελέτης ήταν να 1) προσδιορίζουν τις επιδόσεις του CA 19-9 στο σύνολο αναφοράς? 2) να καθορίσει σαφέστερα την απόδοση του CA 19-9 για τη νόσο σταδίου Ι-ΙΙ και σε σχέση με τις δυνητικά συγχυτικούς όρους της καλοήθους απόφραξη των χοληφόρων και χρόνια παγκρεατίτιδα? και 3) να συγκρίνουν τις επιδόσεις και να καθορίσει την προέλευση των διαφορών μεταξύ των διακριτών αναλύσεις CA 19-9. Ο πρώτος στόχος ήταν αναγκαία προκειμένου να δώσει ένα σημείο αναφοράς με το οποίο μπορούμε να συγκρίνουν και να αξιολογήσουν τις υποψήφιες βιοδείκτες. Ο δεύτερος στόχος ήταν αναγκαία, διότι πολλές από τις προηγούμενες μελέτες του CA 19-9 ήταν σε μεγάλο βαθμό σταθμισμένο προς τον καρκίνο προχωρημένου σταδίου, κυρίως επειδή τα δείγματα από ασθενείς με καρκίνο τελικού σταδίου είναι πιο εύκολα διαθέσιμα. Οι ασθενείς με νόσο σταδίου Ι-ΙΙ έχουν τη δυνατότητα για βελτιωμένα αποτελέσματα μέσω της χειρουργικής επέμβασης, έτσι ώστε η ακριβής και έγκαιρη ανίχνευση αυτού του επιπέδου της νόσου είναι εξαιρετικά σημαντική. Ο τρίτος στόχος ήταν αναγκαία, διότι οι προηγούμενες μελέτες του CA 19-9 για τον καρκίνο του παγκρέατος έχουν διαφορετικά αποτελέσματα, πιθανώς λόγω διαφορών ως προς τις ιδιαιτερότητες των αντισωμάτων [19] ή οι διαφορές στις πλατφόρμες δοκιμασία. Είναι σημαντικό να κατανοήσουμε τις επιπτώσεις αυτών των διαφορών για τις αποφάσεις για μεμονωμένους ασθενείς. Επιπλέον, περισσότερες πληροφορίες σχετικά με τις γλυκάνες δεσμεύεται από κάθε αντίσωμα CA 19-9 ενδεχομένως θα βοηθήσει να χαρακτηριστούν οι γλυκάνες που παράγονται από τους ασθενείς με καρκίνο και να διατυπώσει τις στρατηγικές για την ανίχνευση μεγαλύτερο ποσοστό ασθενών από ό, τι είναι δυνατόν τώρα.

Υλικά και μέθοδοι

Τα κριτήρια επιλεξιμότητας

Κάθε ιστοσελίδα που διεξάγονται συλλογή δειγμάτων χρησιμοποιώντας ένα πρωτόκολλο και σε γραπτή μορφή συγκατάθεσης που ήταν η έγκριση από το Διοικητικό συμβούλιο κριτική τους Θεσμική. Τα υποκείμενα ήταν υποχρεωμένα να παρέχουν γραπτή, ενημερωμένη συγκατάθεση. Οι περιοχές που συμμετέχουν στη συλλογή του δείγματος ήταν το Πανεπιστήμιο του Πίτσμπουργκ Medical Center, Memorial Sloan Kettering,, το Πανεπιστήμιο του Michigan, το Πανεπιστήμιο της Νεμπράσκα, και Northshore Πανεπιστήμιο Healthsystem (παλαιότερα γνωστό ως Evanston Northwestern Healthcare). Τα ακόλουθα κριτήρια ένταξης ήταν απαραίτητα για παγκρεατική περιπτώσεις και τους ελέγχους του καρκίνου. Οι ομάδες ελέγχου περιλαμβάνονται ασθενείς με χρόνια παγκρεατίτιδα, ασθενείς οξεία καλοήθη απόφραξη των χοληφόρων, και υγιή άτομα.

περιπτώσεων καρκίνου του παγκρέατος.

Θέματα υποβλήθηκαν σε θεραπευτική εκτομή του παγκρέατος για αδενοκαρκίνωμα συμπεριλαμβανομένων των αρνητικών περιθωρίων και κατά προτίμηση Στάδιο 1 ή 2Α (απουσία μεταστάσεων λεμφαδένων).

Δεν απαιτείται προηγούμενη ιστορία οποιασδήποτε άλλης κακοήθειας εκτός nonmelanoma καρκίνων του δέρματος για δέκα χρόνια.

Η

χρόνιες περιπτώσεις παγκρεατίτιδας.

Όλα θέματα πρέπει να είχε τουλάχιστον δύο από τις ακτινολογικές κριτήρια που αναφέρονται κατωτέρω, εκτός αν ένα άτομο δεν είχε ιστορικό εξωκρινής παγκρεατική ανεπάρκεια, οπότε ήταν απαραίτητη μόνο ένα κριτήριο από ακτινοβολίες.

κοιλιακός υπέρηχος που είναι συνεπής με χρόνια παγκρεατίτιδα με πρότυπες ραδιολογικές κριτήρια

Κοιλιακή αξονική τομογραφία συνεπής με χρόνια παγκρεατίτιδα με πρότυπες ραδιολογικές κριτήρια (δηλαδή, αποτιτανώσεις, διεσταλμένες παγκρεατικού πόρου, ακανόνιστο περίγραμμα του αδένα, κυστικές βλάβες).

Ενδοσκοπική παλίνδρομη χολαγγειοπαγκρεατογραφία (ERCP) εξετάσεις συνεπής με χρόνια παγκρεατίτιδα με πρότυπες ραδιολογικές κριτήρια (διεσταλμένες βασανιστική κύρια παγκρεατικού πόρου με ακανόνιστες δευτερογενών κλάδων, ενδοπορικού λίθων).

Ενδοσκοπική υπερηχογράφημα συνεπής με χρόνια παγκρεατίτιδα με πρότυπες υπερηχογραφικά κριτήρια.

παγκρέατος αποτιτανώσεις εντοπίζονται σε απλό φιλμ της κοιλιάς.

η

Όλα τα άτομα είχαν μια μελέτη απεικόνισης του παγκρέατος εντός 3 μηνών από την εγγραφή της μελέτης που δεν προτείνουν μια παγκρεατική μάζα.

Όλα τα υποκείμενα είχαν ένα σταθερό κλινικό ιστορικό κατά το παρελθόν έτος, χωρίς υποψία για καρκίνο (απώλεια βάρους, ίκτερο, ή αλλαγή στην κοιλιακή συμπτώματα).

Όλα τα θέματα που δεν είχαν προηγούμενο ιστορικό οποιασδήποτε άλλης κακοήθειας εκτός από μη-μελάνωμα καρκίνος του δέρματος για το παρελθόν δέκα χρόνια

Όλα τα θέματα που δεν είχαν οικογενειακό ιστορικό καρκίνου του παγκρέατος

Η

Οξεία καλοήθης χολική περιπτώσεις απόφραξης

Όλα τα θέματα πληρούνται όλα τα παρακάτω κλινικά κριτήρια…:

Αύξηση του επιπέδου χολερυθρίνης ορού μεγαλύτερη από 2,0 mg /dL

διατατική εξωηπατικών χοληφόρων συστήματα αποδειχθεί σε μελέτη απεικόνισης

Το δείγμα αίματος που λαμβάνεται πριν από οποιαδήποτε διορθωτική επέμβαση.

Η

Όλα τα υποκείμενα είχαν απόφραξη των χοληφόρων που ήταν καλοήθη αιτιολογία, όπως κοινή πέτρα χοληφόρου πόρου ή καλοήθης χολική στένωση.

οι ασθενείς με πρωτοπαθή σκληρυντική χολαγγειίτιδα (PSC) αποκλείστηκαν.

Όλα άτομα είχαν μια πλήρη μελέτη απεικόνισης που εκτελούνται στο πάγκρεας που δεν προτείνουν μια καρκίνο του παγκρέατος, όπως μια διακριτή μάζα βλάβη.

Όλα τα θέματα που δεν είχαν προηγούμενο ιστορικό οποιασδήποτε άλλης κακοήθειας εκτός από μη καρκίνους του δέρματος μελανώματος για τα τελευταία δέκα χρόνια.

Όλα τα θέματα που δεν είχαν οικογενειακό ιστορικό καρκίνου του παγκρέατος.

Η

υγιείς μάρτυρες.

Όλα τα θέματα που πληρούσαν τα ακόλουθα κριτήρια.

Ηλικία , τη φυλή και το φύλο ταιριάζουν με ειδική περιπτώσεων καρκίνου του παγκρέατος.

Δεν οικογενειακό ιστορικό καρκίνου του παγκρέατος.

Δεν προσωπική ιστορία της οξείας παγκρεατίτιδας ή απόφραξη των χοληφόρων, όπως ορίζεται παραπάνω.

Όχι ταυτόχρονη κοιλιακό άλγος.

Δεν ταυτόχρονη ανεξήγητη απώλεια βάρους.

Δεν απαιτείται προηγούμενη ιστορία οποιασδήποτε άλλης κακοήθειας εκτός από μη-μελάνωμα καρκίνος του δέρματος για τα τελευταία δέκα χρόνια.

Η

δεν υπήρχε εκτεταμένη παρακολούθηση πέραν του χρόνου ότι τα δείγματα στάλθηκαν στο τέλος της περιόδου συλλογής. Ενώ υπάρχει η πιθανότητα ότι ένα ή περισσότερα από τα χειριστήρια είχε καρκίνο αρχόμενη κατά το χρόνο της συλλογής δείγματος, η επίδραση επί της μελέτης πιθανότατα θα ήταν αμελητέα. Λόγω πόσο σπάνιο η ασθένεια είναι στο γενικό πληθυσμό με μια διάρκεια ζωής στάθμισης 1 σε 71 ασθενείς, θα πρέπει να αναμένεται μόνο ότι το πολύ ένα από αυτούς τους ασθενείς σε ένα γενικό κίνδυνο πληθυσμό για το PC θα αναπτύξει ποτέ καρκίνο στη ζωή τους -Ώρα.

ορού και συλλογής πλάσματος

Όλες οι συλλογές πραγματοποιήθηκε μετά από ενημερωμένη συγκατάθεση των συμμετεχόντων και πριν από κάθε χειρουργικές επεμβάσεις ή διαδικασίες. Τα δείγματα συλλέχθηκαν από τις 21 Φεβρουαρίου, 2005 – 20 Απριλίου 2011 και τα πειράματα πραγματοποιήθηκαν το 2013 και το 2014. Όλα τα δείγματα αίματος συλλέχθηκαν σύμφωνα με την τυποποιημένη διαδικασία λειτουργίας EDRN. Όλα τα δείγματα καταψύχθηκαν στους -70 ° C ή ψυχρότερο εντός 4 ωρών από το χρόνο της συλλογής. Τέσσερις mL ορού και 2 ml του πλάσματος (χρησιμοποιώντας EDTA ως αντιπηκτικό) απεστάλησαν από τη συμμετοχή sites για να NCI Biorepository στο Frederick, Maryland. Τα δείγματα μεταφέρθηκαν στο αποθετήριο με τρόπο που απέτρεψε την απόψυξη χρησιμοποιώντας εγκεκριμένες τεχνικές μεταφορέα. Κλάσματα στάλθηκαν σε ξηρό πάγο στους χώρους που εκτελεί το CA 19-9 αναλύσεις, και δεν κλάσματα αποψύχθηκαν περισσότερο από τρεις φορές το συνολικό πριν από τη χρήση.

Οι υγιείς μάρτυρες συλλέχθηκαν από τις 4 από τις 5 περιοχές με συνεισφορές των ελέγχων που ταιριάζουν τις συνολικές συνεισφορές από κάθε περιοχή (Πίνακας 1). Παρακολουθήσαμε την πρόσληψη ελέγχου για τη διασφάλιση υπήρχε λογική αντιστοίχιση των ελέγχων στις περιπτώσεις που στην ηλικία, τη φυλή και το φύλο, αλλά είμαστε χαλαροί τον αλγόριθμο κάπως με τους ασθενείς με χρόνια παγκρεατίτιδα λόγω της μικρότερη ηλικία έναρξης της νόσου σε σχέση με τον καρκίνο του παγκρέατος.

Οι ορισμοί των σταδίων του όγκου

τα παγκρεατικά αδενοκαρκινώματα οργανώθηκαν σύμφωνα με τα κριτήρια στο πλαίσιο της μεικτής επιτροπής της Αμερικής για τον Καρκίνο (AJCC) Εγχειρίδιο σταδιοποίηση 7

ου έκδοση. Χρησιμοποιήθηκαν οι ακόλουθοι ορισμοί της έκτασης του όγκου και κομβικών κατάσταση: T1 = Tumor περιορίζεται στο πάγκρεας ≤2 cm στη μεγαλύτερη διάσταση? Τ2 = Tumor περιορίζεται στο πάγκρεας & gt? 2 cm σε μεγαλύτερη διάσταση? Τ3 = όγκου εκτείνεται πέρα ​​από το πάγκρεας, αλλά χωρίς τη συμμετοχή του άξονα κοιλιοκάκη ή η ανώτερη μεσεντέρια αρτηρία? N0 = Χωρίς περιφερειακή μετάσταση στους λεμφαδένες? και Ν1 = Περιφερειακής μετάσταση στους λεμφαδένες. Τα στάδια αυτά ορίζονται ως εξής: Στάδιο 1α = T1N0M0? Στάδιο 1b = T2N0M0? Στάδιο 2α = T3N0M0? και Στάδιο 2β = T1-3N1M0.

CA 19-9 δοκιμασίες

Δύο εργαστήρια έτρεξε CA 19-9 αναλύσεις σε δείγματα από τα δείγματα πλάσματος που ελήφθησαν χωρίς καμία πληροφορία. Μία δοκιμασία, η EIA-1474 kit [Παρτίδα # RN-45868] από DRG International (Springfield, NJ), διεξήχθη στο εργαστήριο του Δρ Killary σύμφωνα με προηγουμένως δημοσιευμένες μεθόδους [20]. Η άλλη δοκιμασία αναπτύχθηκε και εκτελούνται στο εργαστήριο του Δρ Χάαμπ χρησιμοποιώντας ένα προηγουμένως δημοσιευμένο πρωτόκολλο [19, 21, 22]. Στο επόμενο κείμενο, αναφερόμαστε στην πρώην ως «Δοκιμασία 1″ και το τελευταίο ως «Δοκιμασία 2.« Το κιτ DRG ονομαστικά έχει εγκριθεί μόνο για ορό, αλλά προηγουμένως είχε χρησιμοποιηθεί για το πλάσμα για να επιτευχθούν αποτελέσματα παρόμοια με αυτά που επιτυγχάνονται χρησιμοποιώντας ορό [20]. Σε αυτή τη μελέτη, θα επικυρωθεί η περαιτέρω χρήση της με πλάσμα, επιβεβαιώνοντας στατιστική ισοδυναμία με Δοκιμασία 1 και με την πλατφόρμα Αρχιτέκτονας Abbott (δείτε αποτελέσματα). Ένα υποσύνολο των δειγμάτων (n = 82) αναλύθηκε χρησιμοποιώντας τη δοκιμασία CA 19-9 στην πλατφόρμα αρχιτέκτονα Immunoassay Abbott στο Δίκτυο Υγείας του Πανεπιστημίου του Τορόντο, Καναδά. Δείτε το αρχείο S1 για πρόσθετες πληροφορίες σχετικά με τα πρωτόκολλα και τα χαρακτηριστικά δοκιμασία.

Η στατιστική ανάλυση

Για κάθε ομάδα, συγκρίναμε τις κατανομές CA19-9 μεταξύ των δύο CA19-9 δοκιμασίες χρησιμοποιώντας το paired t -test (σε log-μετασχηματιστεί CA19-9) και το Wilcoxon Signed Rank τεστ. Η ο συντελεστής Spearman μεταξύ των δύο δοκιμασιών ήταν υπολογίζονται επίσης. Για περιγραφικές αναλύσεις, δημιουργήσαμε ένα boxplot για κάθε δοκιμασία CA19-9 και κάθε ομάδα? Οι γεωμετρικοί μέσοι των μεμονωμένων προσδιορισμών και 95% διαστήματα εμπιστοσύνης αυτών Wald επίσης υπολογίστηκαν.

Για ζεύγη συγκρίσεις μεταξύ των υγιών, καλοήθης απόφραξη των χοληφόρων, χρόνια παγκρεατίτιδα, και ομάδες του καρκίνου, πραγματοποιήσαμε δύο δειγμάτων t-tests ( στα log-μετασχηματιστεί τιμές CA19-9) και τις δοκιμές Wilcoxon Rank Sum. Επιπλέον, για κάθε συνδεδεμένο ελέγχου και ομάδα την περίπτωση, δημιουργείται μια μη παραμετρική εκτίμηση των χαρακτηριστικών λειτουργίας λήψεως (ROC) καμπύλη [23] και την περιοχή κάτω από την καμπύλη (AUC) για τις μεμονωμένες αναλύσεις CA19-9 και για μια γραμμικός συνδυασμός των log-μετασχηματιστεί τιμές από τις δύο δοκιμασίες που προέρχονται από μοντέλα λογιστικής παλινδρόμησης. Η διαδικασία εκκίνησης με 500-πλάσια αναδειγματοληψία χρησιμοποιήθηκε για την κατασκευή των διαστημάτων εμπιστοσύνης των AUC μεμονωμένων προσδιορισμών, τις διαφορές στην AUC μεταξύ των δύο CA19-9 προσδιορισμούς, και της διαφοράς στην AUC μεταξύ των μεμονωμένων CA19-9 δοκιμασίες και οι συνδυασμένες δοκιμασίες.

Για τις μεμονωμένες ανιχνεύσεις CA19-9, εξετάσαμε τις ευαισθησίες και εξειδικεύσεις με τη χρήση της κλινικής αποκοπής 37 U /mL, καθώς και ένα προερχόμενο αποκοπής που μεγιστοποιεί το άθροισμα της ευαισθησίας και ειδικότητας. Έχουμε, επίσης, εκτιμάται ευαισθησία και ειδικότητα με βάση τους συνδυασμούς των δύο CA19-9 δοκιμασίες χρήση ή /και κανόνες. Η διαδικασία εκκίνησης με 500 φορές αναδειγματοληψία χρησιμοποιήθηκε για την κατασκευή των διαστημάτων εμπιστοσύνης για την ευαισθησία, την ειδικότητα και το άθροισμα της ευαισθησίας και της ειδικότητας.

γλυκάνης πειράματα σειρά και ανάλυση

Το κεντρικό εργαστήριο για γλυκάνης array Σύνθεση (μέρος της κοινοπραξίας για Λειτουργική Glycomics, CFG) στο Πανεπιστήμιο Emory εκτελούνται τα γλυκάνης πειράματα σειρά και πρωτογενείς αναλύσεις. Η έκδοση συστοιχία χρησιμοποιείται εδώ ήταν 5,1, που περιέχει 610 μοναδικά γλυκάνες. Τα πειράματα που ακολουθείται δημοσιευμένα πρωτόκολλα [24]. Χρησιμοποιήσαμε το πρόγραμμα GlycoSearch [25] για την ανάλυση των δεδομένων γλυκάνη σειρά.

Αποτελέσματα

CA 19-9 στην αναφορά που

Το σύνολο αναφοράς που περιλαμβάνονται δείγματα ορού και πλάσματος συλλέγονται σε πέντε διαφορετικά ιδρύματα κάτω από μια κοινή τυποποιημένη διαδικασία λειτουργίας. Τα δείγματα είναι από 98 ασθενείς με καρκίνο του παγκρέατος σταδίου Ι-ΙΙ, 62 ασθενείς με χρόνια παγκρεατίτιδα, 31 ασθενείς με καλοήθη απόφραξη των χοληφόρων, και 61 υγιείς μάρτυρες (Πίνακας 1).

προσδιορίζεται η ΑΠ 19-9 τιμές στα δείγματα πλάσματος χρησιμοποιώντας δύο διαφορετικές δοκιμασίες, ένας εμπορικώς-διαθέσιμο κιτ (που αναφέρεται ως Δοκιμασία 1), και η άλλη ένα σύστημα in-house (που αναφέρονται ως Δοκιμασία 2). Χρησιμοποιήσαμε δύο διαφορετικές δοκιμασίες, προκειμένου να λογοδοτήσει για τις πιθανές διαφορές μεταξύ των δοκιμασιών, δεδομένης της προηγούμενης παρατηρήσεις του αυτές τις διαφορές [26, 27]. Δοκιμάσαμε την αξιοπιστία των αναλύσεων που χρησιμοποιούνται εδώ από συγκρίσεις με μια αυτοματοποιημένη πλατφόρμα (Abbott αρχιτέκτονας CA 19-9 Immunoassay) για 82 από τα δείγματα που διανέμονται σε όλες τις ομάδες ασθενών. Οι τιμές σε κάθε μία από τις ομάδες των ασθενών ήταν στατιστικώς ισοδύναμες μεταξύ όλων των τριών προσδιορισμών, εκτός από ελαφρά υψηλότερα επίπεδα μεταξύ των υγιών μαρτύρων για Δοκιμασία 2 σε σχέση με την δοκιμασία Abbott (πίνακας Α1 S3 File), και η διάκριση του καρκίνου από τις ομάδες ελέγχου ήταν στατιστικά ισοδύναμες μεταξύ όλων των δοκιμασιών (Πίνακας Β S3 αρχείων και S1 αρχείου). Αυτό το αποτέλεσμα επιβεβαιώνει την αξιοπιστία των αποτελεσμάτων που λαμβάνονται χρησιμοποιώντας δοκιμασίες 1 και 2 και η γενική ισοδυναμία τους με αυτοματοποιημένο πλατφόρμες.

Εξετάσαμε πρώτα τις κατανομές των τιμών για κάθε μία από τις δοκιμασίες στις διάφορες ομάδες ασθενών (Σχ 1Α) . Τα υγιή άτομα και σε ασθενείς με χρόνια παγκρεατίτιδα είχαν τα χαμηλότερα επίπεδα? ασθενείς καλοήθης χολική απόφραξη είχαν σημαντικά υψηλότερα επίπεδα (p-τιμή είναι μικρότερη από 0,0001 και ίση με 0.006 με το τεστ Wilcoxon Rank Sum, σε σχέση με υγιή άτομα για Δοκιμασία 1 και 2 αντίστοιχα)? και ασθενείς με καρκίνο είχαν τα υψηλότερα επίπεδα (p & lt? 0,0001 σε σχέση με υγιή άτομα που βασίζονται στις δύο t-test ή Wilcoxon Rank Sum για κάθε ανάλυση). Οι δύο αναλύσεις έδειξαν ισοδύναμες τάσεις. Τα αναλυτικά αποτελέσματα για τα γεωμετρικά μέσα από τις επιμέρους δοκιμασίες και τα χρονικά διαστήματα τους εμπιστοσύνης 95% παρουσιάζονται στον Πίνακα Γ S3 αρχείου, και οι p-τιμές για τις συγκρίσεις μεταξύ των ομάδων των ασθενών παρουσιάζονται στον Πίνακα Α S3 αρχείου.

Α) CA 19-9 επίπεδα σε κάθε ομάδα. Σας παρουσιάζουμε τις τιμές log-μετασχηματιστεί για να απεικονίσει καλύτερα όλες τις σειρές των τιμών. Τα κουτιά δείχνουν τα τεταρτημόρια των κατανομών, οι οριζόντιες γραμμές στα πλαίσια δείχνουν τις διαμέσους, και οι διακεκομμένες γραμμές δίνουν τις σειρές, με μεμονωμένες ακραίες τιμές που υποδεικνύεται από τους κύκλους. Α1, Δοκιμασία 1? Α2, Δοκιμασία 2. B-D) Δέκτης-χειριστή-χαρακτηριστικό (ROC) καμπύλη συγκρίνοντας τους ασθενείς με καρκίνο του παγκρέατος με τις υποδεικνυόμενες ομάδες ελέγχου. Οι θρύλοι καθορίσετε την περιοχή κάτω από τις καμπύλες (AUCs) για κάθε δοκιμασία, με τις σειρές των διαστημάτων εμπιστοσύνης 95%.

Η

Ρωτήσαμε αν τα επίπεδα CA 19-9 ήταν διαφορετική μεταξύ των προηγούμενες φάσεις (στάδια Ια, Ιβ, και ΙΙα) και το μεταγενέστερο στάδιο (στάδιο IIb) ασθενείς. Τα επίπεδα CA19-9 δεν ήταν σημαντικά διαφορετική μεταξύ των δύο ομάδων (p-τιμές βασίζονται σε t-δοκιμή και δοκιμή Wilcoxon Rank Sum)? και η περιοχή-under-the-καμπύλη (AUC) στην ανάλυση του δέκτη-λειτουργίας-χαρακτηριστικό (ROC) δεν ήταν επίσης στατιστικά σημαντικά διαφορετική μεταξύ των ομάδων για τη διαφοροποίηση του καρκίνου από υγιή άτομα (S2 αρχείου). Ως εκ τούτου, στις επόμενες αναλύσεις που ομαδοποιούνται σε όλους τους ασθενείς του καρκίνου μαζί.

Χρησιμοποιήσαμε το AUC για να προσδιοριστεί η ικανότητα του CA 19-9 για τη διάκριση των ομάδων. Οι δοκιμασίες CA19-9 ήταν καλύτερος σε διαχωρισμό του καρκίνου από υγιείς ομάδες ελέγχου (AUCs ίση με 0,78 με 95% CI (0.70,0.84) για Δοκιμασία 1, και 0,76 (0,68, 0,83) για Δοκιμασία 2) (Σχήμα 1Β). Οι δοκιμασίες είχαν επίσης καλή απόδοση στο διαχωρισμό του καρκίνου από χρόνιο ομάδες παγκρεατίτιδα (AUCs ίση με 0,73 με 95% CI (0,65, 0,80) για Δοκιμασία 1, και 0,77 (0,69, 0,83) για Δοκιμασία 2) (Εικ 1C), αλλά δεν ήταν αποτελεσματικές στο διαχωρισμό του καρκίνου από τις καλοήθεις χοληφόρων ομάδες παρεμπόδισης (AUCs ίση με 0,56 με 95% CI (0,47, 0,67) για Δοκιμασία 1, και 0,62 (0,45, 0,71) για Δοκιμασία 2) (Εικ 1D). Δεν υπήρχαν στατιστικά σημαντικές διαφορές σε AUCs μεταξύ Δοκιμασίες 1 και 2 σε κάθε μία από αυτές τις συγκρίσεις.

Για να σχετίζονται πιο άμεσα αυτά τα αποτελέσματα στην κλινική πρακτική, εξετάσαμε τις ευαισθησίες και εξειδικεύσεις των προσδιορισμών CA19-9 στο τυπικό αποκοπής που χρησιμοποιείται στην πράξη, 37 U /mL, και κατά αποκοπές που έδωσε μέγιστη ποσά ευαισθησίας και εξειδίκευσης (Πίνακας 2). Στο 37 U /mL αποκοπής, ο μέσος όρος της ευαισθησίας συν ειδικότητα κυμαινόταν από 70 να 74 για τη διάκριση του καρκίνου από τα υγιή και χρόνιας παγκρεατίτιδας ομάδες ελέγχου. Για αμφότερους τους προσδιορισμούς, ένα κατώτερο όριο ευαισθησίας αυξηθεί σε μεγάλο βαθμό με μικρότερο μείωση στην εξειδίκευση, με αποτέλεσμα μια στατιστικά σημαντική βελτίωση κατά μέσο όρο ευαισθησία και ειδικότητα (Πίνακας 2).

Η

Patient-by-ασθενής σύγκριση της CA 19-9 δοκιμασίες

Η παραπάνω ανάλυση δείχνει ότι η CA 19-9 απόδοση είναι παρόμοια μεταξύ Δοκιμασία 1 και Δοκιμασία 2 όταν αξιολογείται σε όλους τους ασθενείς, αλλά θέλαμε επίσης να γνωρίζουν πώς οι δύο δοκιμασίες σύγκριση για μεμονωμένους ασθενείς. Μια άμεση σύγκριση των τιμών που λαμβάνονται για κάθε ασθενή έδειξε σημαντικές διαφορές για ορισμένους ασθενείς (Σχήμα 2). Οι διαφορές μεταξύ των δοκιμασιών ήταν ομοιόμορφα κατανεμημένα? σε ορισμένες περιπτώσεις Δοκιμασία 1 ήταν υψηλότερη, και σε άλλες περιπτώσεις Δοκιμασία 2 ήταν υψηλότερη.

Το ημερολόγιο μετασχηματισμένο CA 19-9 τιμές όλων των θεμάτων από Δοκιμασία 1 και Δοκιμασία 2 απεικονίσθηκαν σε σχέση με το άλλο. Κάθε κύκλος δείχνει ένα μεμονωμένο δείγμα ασθενούς. Η γραμμή τάσης είναι η γραμμική-ελαχίστων τετραγώνων ταιριάζει καλύτερα, και ο συντελεστής συσχέτισης της κλίμακας Spearman είναι 0,74.

Η

Σε πρακτικό επίπεδο, οι διαφορές μεταξύ των δοκιμασιών μόνο θέμα σε σχέση με τις αποκοπές που χρησιμοποιούνται στην κλινική πρακτική. Ως εκ τούτου, εμείς ερωτηθούν πόσο συχνά η κατάσταση ενός δείγματος ήταν διαφορετική μεταξύ Δοκιμασία 1 και Δοκιμασία 2 σε σχέση με το cutoff (Πίνακας 3). Χρησιμοποιώντας 37 U /mL ως αποκοπής, 8 από τους ασθενείς 53 καρκίνο (15%) είναι αυξημένα σε Δοκιμασία 1 ήταν χαμηλά σε Δοκιμασία 2, και 7 από τους ασθενείς 52 καρκίνο (14%) είναι αυξημένα σε Δοκιμασία 2 ήταν χαμηλά σε Δοκιμασία 1. Επτά από τα 128 άτομα ελέγχου (5%) δεν είναι αυξημένα σε Δοκιμασία 1 ήταν αυξημένα σε Δοκιμασία 2, και 9 από τις 130 ελέγχων (7%) δεν είναι αυξημένα σε Δοκιμασία 2 ήταν αυξημένα σε Δοκιμασία 1. Διαφορές ήταν επίσης παρόντες χρησιμοποιώντας 100 U /mL αποκοπής. Έτσι, αν και οι δύο δοκιμασίες δίνουν γενικά την ίδια συνολική απόδοση, οι διαφορές ήταν εμφανείς για μεμονωμένους ασθενείς. Κάθε δοκιμασία κατά καιρούς έδωσε ψευδώς αρνητικά ή ψευδώς θετικά αποτελέσματα σε σύγκριση με την άλλη.

Η

Έλεγχος των δοκιμασιών CA 19-9 σε συνδυασμό

αξιολογηθεί κατά πόσον ένας συνδυασμός των δύο μεθόδων έδωσε καλύτερα αποτελέσματα από είτε δοκιμασίας μόνο. Αυτή η ιδέα βασίζεται στην υπόθεση ότι εάν τα αντισώματα σε κάθε δοκιμασία ανιχνεύει βέλτιστα διακριτές υποομάδες ασθενών, ένα μεγαλύτερο ποσοστό ασθενών θα ανιχνευθεί εάν οι δοκιμασίες συνδυάστηκαν. Χρησιμοποιήσαμε λογιστική παλινδρόμηση για να αντλήσει γραμμικοί συνδυασμοί των log-μετασχηματιστεί τιμές των δύο προσδιορισμών, και να αξιολογηθούν οι AUCs για το διαχωρισμό του καρκίνου από κάθε μία από τις ομάδες ελέγχου με βάση τη συνδυασμένη βαθμολογία. Ο συνδυασμός των δύο δοκιμασίες δεν δείχνουν σημαντική βελτίωση για τη διάκριση καρκίνου από τον υγιή ή χρόνιων ομάδες παγκρεατίτιδα (Εικόνα 1 και Πίνακας 2). Επιπλέον, με τη χρήση απλών κανόνων συνδυασμού με βάση AND ή OR φορείς, είτε σε βελτιστοποιημένη αποκοπές ή το πρότυπο 37 U /mL αποκοπής, υπήρξε ελάχιστη βελτίωση στην μέση ευαισθησία και ειδικότητα σε σχέση με τις μεμονωμένες αναλύσεις (Πίνακας 2). Ως εκ τούτου, αν και οι δύο δοκιμασίες δυνητικά τον εντοπισμό μη-επικαλυπτόμενα σύνολα των ασθενών (όπως προτείνεται από την έλλειψη τέλεια συσχέτιση στο Σχήμα 2), δεν συμβάλλουν συμπληρωματικά, καρκίνο-συγκεκριμένες πληροφορίες.

διαφορές Εξειδίκευση μεταξύ της CA 19-9 αντισώματα

Περισσότερες πληροφορίες σχετικά με την προέλευση των διαφορών μεταξύ των δοκιμασιών θα μπορούσε να είναι χρήσιμη για τη βελτιστοποίηση της ανίχνευσης των ασθενών με καρκίνο, ελαχιστοποιώντας ταυτόχρονα τον εντοπισμό των ατόμων της ομάδας ελέγχου. Το αντιγόνο ονομαστικά αναγνωρίζεται από την CA 19-9 αντισωμάτων είναι μια γλυκάνη που ονομάζεται σιαλυλ Lewis A [16], με την ακολουθία Siaα2,3Galβ1,3 (Fucα1,4) ΟΙοΝΑο, όπου Σία είναι σιαλικό οξύ, Gal είναι γαλακτόζη, Fuc είναι φουκόζη, και ΟΙοΝΑο είναι Ν-ακετυλγλυκοζαμίνη. Sialyl Lewis Α είναι ένα μέλος του συστήματος ομάδα Lewis αίματος γλυκανών επί ερυθρών αιμοσφαιρίων και μια ποικιλία από γλυκοπρωτεϊνών και γλυκολιπιδίων [22, 28]. Αν και σιαλυλ Lewis Α είναι ο κύριος γλυκάνη δεσμεύεται από CA 19-9 αντισώματα, άλλες γλυκάνες μπορεί να δεσμευτεί [19, 29]. Ένα ισχυρό εργαλείο για να πάρει περισσότερες πληροφορίες σχετικά με το τι άλλες γλυκάνες ένα αντίσωμα συνδέεται είναι η γλυκάνη array [24, 30], η οποία επιτρέπει μετρήσεις της πρόσδεσης μιας πρωτεΐνης σε πολλές διαφορετικές γλυκάνες παράλληλα. Ως εκ τούτου, λαμβάνεται γλυκάνης δεδομένα συστοιχία για τα αντισώματα που χρησιμοποιούνται σε δοκιμασίες 1 και 2.

Και τα δύο αντισώματα δεσμεύονται η κανονική CA 19-9 αντιγόνο σιαλυλ Lewis A-αλλά με διαφορές (Σχήμα 3 και Σχήμα 4). Το αντίσωμα από Δοκιμασία 2 (9L426) δεσμεύεται περισσότερο ισχυρά από ό, τι το αντίσωμα Δοκιμασία 1 έως διμερή Slea-Lea, όπως αποδεικνύεται από το καλύτερο σήμα στην χαμηλή συγκέντρωση 0.2 μg /mL, αλλά αυτό δεν εμφάνιζε καμμιά σύνδεση με την παραλλαγή σιαλικού οξέος Neu5Gc. Είναι επίσης συνδέεται με σιαλυλο Lewis C (μη-φουκοζυλιωμένη σιαλυλο Lewis Α) σε σχετικά υψηλή συγκέντρωση των 20 μg /mL. Αντιθέτως, το αντίσωμα Δοκιμασία 1 (μόνο το αντίσωμα ανίχνευσης ήταν διαθέσιμο από το εμπορικό κιτ) έδειξε μεγαλύτερο πρόσδεση σε Neu5Gc αλλά καμία επιπλέον δέσμευση σε SLEC. Ένα τρίτο αντίσωμα (κλώνος M081221, Fitzgerald, Acton, ΜΑ), που δεν χρησιμοποιούνται στην Δοκιμασία 1 ή 2, αλλά περιλαμβάνονται για σύγκριση, δεσμεύονται άλλες γλυκάνες, επιπλέον εκείνων που εμφανίζουν την κανονική αντιγόνο CA 19-9. Αυτό το αντίσωμα αντέδρασε σταυρωτά με γλυκάνες που περιέχουν σιαλυλ Lewis Χ, ένα ισομερές του σιαλυλ Lewis Α, στο οποίο ενεργοποιείται η στερέωση της φουκόζης και γαλακτόζη στον πυρήνα δομή. Ετσι τα αντισώματα CA 19-9 έχουν επικαλυπτόμενες αλλά διακριτές ιδιαιτερότητες, συμπεριλαμβανομένης και της δέσμευσης σε ορισμένες δομές πέρα ​​από το κανονικό αντιγόνο CA 19-9.

Κάθε αντίσωμα επωάστηκε σε 2 μg /mL σε ένα πίνακα που περιέχει γλυκάνη 610 διακριτές γλυκανών (γλυκάνης έκδοση πίνακας 5.1 από την Κοινοπραξία για Λειτουργική Glycomics). Το γράφημα περιλαμβάνει τις γλυκάνες που δείχνει τα υψηλότερα επίπεδα σύνδεσης με οποιοδήποτε από τα αντισώματα. Για κάθε αντίσωμα, εμείς ομαλοποιηθούν οι πρώτες τιμές φθορισμού για να ρυθμίσετε την υψηλότερη τιμή σε 1. Ο κατάλογος προσδιορίζει τα γλυκάνες που περιλαμβάνονται στο οικόπεδο, και οι ετικέτες πάνω από τις στήλες δείχνουν τον πρωτογενή μορφή σε κάθε γλυκάνης. DRG είναι το αντίσωμα Δοκιμασία 1, 9L426 είναι το αντίσωμα Δοκιμασία 2, και M081221 είναι ένα άλλο αντι-σιαλυλ Lewis Α αντίσωμα συμπεριλαμβάνεται για σύγκριση.

Η

Για κάθε αντίσωμα, το δεσμευτικό ένταση στις υποδεικνυόμενες γλυκάνες, σε