PLoS One: SLCO1B1 και SLC19A1 Gene Παραλλαγές και ιρινοτεκάνη Induced ταχείας επέμβασης και Επιβίωση: μια προοπτική μελέτη Πολύκεντρο φαρμακογενετική του μεταστατικού καρκίνου του παχέος Cancer


Αφηρημένο

Ιστορικό

Ταχεία ανταπόκριση στη χημειοθεραπεία στον μεταστατικό ορθοκολικό καρκίνο (mCRC) ασθενείς (απάντηση εντός 12 εβδομάδων από την χημειοθεραπεία) μπορεί να αυξήσει την πιθανότητα πλήρους εκτομής και βελτιωμένη επιβίωση. Λίγοι μοριακών δεικτών προβλέψει ιρινοτεκάνη που προκαλείται από την ταχεία αντίδραση και την επιβίωση. Οι πολυμορφισμοί Single-νουκλεοτιδίου (SNPs) σε γονίδια φορέα διαλυμένης ουσίας αναφερθεί ότι συσχετίζονται με τις μεταβλητές φαρμακοκινητική της ιρινοτεκάνης και φυλλικό οξύ σε ασθενείς με καρκίνο. Η μελέτη αυτή έχει ως στόχο να αξιολογήσει την προγνωστική ρόλο των 3 SNPs σε ασθενείς mCRC που έλαβαν θεραπεία με ιρινοτεκάνη και περιέχουν φθοριοπυριμιδίνη σχήματα.

Υλικά και Μέθοδοι

επιλέχθηκαν και ο γονότυπος σε 137 ασθενείς με mCRC από μια Τρεις SNPs κινεζική προοπτική μελέτη πολυκεντρική (NCT01282658). Το τεστ chi-τετράγωνο, μονοπαραγοντική και πολυπαραγοντική μοντέλο λογιστικής παλινδρόμησης, και λειτουργικού χαρακτηριστικού δέκτη ανάλυση χρησιμοποιήθηκαν για την αξιολόγηση συσχετίσεις μεταξύ των γονότυπων και ταχείας αντίδρασης. ανάλυση επιβίωσης Kaplan-Meier και Cox αναλογικά μοντέλα κινδύνου χρησιμοποιήθηκαν για να αξιολογηθούν οι συσχετίσεις μεταξύ γονότυπων και τα αποτελέσματα επιβίωσης. Benjamini και Hochberg False Discovery Rate διόρθωση χρησιμοποιήθηκε σε πολλαπλές δοκιμές

Αποτελέσματα

Γονότυπος GA /AA των SNP rs2306283 του γονιδίου

SLCO1B1

και γονότυπο GG της SNP rs1051266 του γονίδιο

SLC19A1

συνδέθηκαν με αναλογία υψηλότερο ποσοστό ταχείας αντίδρασης (αποδόσεις [OR] = 3.583 και 3.521, 95% CI = 1,301 – 9,871 και 1,271 – 9,804,

σ

= 0,011 και p = 0,013, αντίστοιχα). Το ποσοστό ανταπόκρισης ήταν 70% σε ασθενείς με δύο γονότυπους, σε σύγκριση με μόνο 19,7% στους υπόλοιπους ασθενείς (OR = 9.489, 95% CI = 2,191 με 41,093, το ακριβές τεστ του Fisher

σ

= 0,002). σημασίες τους ήταν όλοι διατηρείται ακόμη και μετά από πολλές δοκιμές (όλα

σ

γ

GMH27R201(99.0)0.30 0,4857 (28,4) 93 (46,2) 51 (25,4) 97 (99,0) 0,66 0.4418(18.6)50(51.5)29(29.9)rs2306283

SLCO1B1

A GMN130D200(98.5)0.930.2412(6.0)73(36.5)115(57.5)97(99.0) 0.360.223(3.1)36(37.1)58(59.8)rs4149056

SLCO1B1

T CMV174A203(100.0)0.800.13153(75.4)46(22.7)4(1.9)98(100.0) 0,1374 0,81 (75,5) 22 (22,4) 2 (2.1) Πίνακας 2. SNPs πληροφορίες και γονοτυπική συχνότητες σε 203 γαστρεντερικό καρκίνο και 98 ασθενείς με mCRC

SNPs, πολυμορφισμοί Single-νουκλεοτιδίων.? ΑΑ, αμινοξύ? mCRC, μεταστατικό καρκίνο του παχέος εντέρου? HWE, Hardy-Weinberg ισορροπία? MAF, ελάσσονα συχνότητα αλληλόμορφο? κ.β., άγριου τύπου? var, παραλλαγή? M, παρανοηματική. CSV Λήψη CSV

Το πρωτόκολλο για αυτή τη δοκιμή και την υποστήριξη κατάλογος TREND είναι διαθέσιμο ως υποστηρικτικές πληροφορίες? βλέπε πρωτόκολλο S1 και πίνακας ελέγχου S1.

Η αποτελεσματικότητα και η τοξικότητα αξιολόγηση

Οι ασθενείς που έμεινε στο νοσοκομείο για την 3-ημέρα της χημειοθεραπείας. Η αποτελεσματικότητα αξιολογήθηκε με μια συνεπή τεχνική απεικόνισης (μαγνητική τομογραφία ή υπολογιστική τομογραφία) κάθε 6 εβδομάδες από το RECIST 1.1. Στοιχεία για την τοξικότητα συλλέχθηκε με πρόσωπο-με-πρόσωπο ερωτηματολόγια και βαθμολογήθηκε με βάση τα κριτήρια του National Cancer Institute Common Toxicity των ανεπιθύμητων ενεργειών έκδοση 4.0 σε κάθε κύκλο. Ένα μόνο κύκλο της χημειοθεραπείας θεωρήθηκε αρκετή για να αξιολογήσουν την τοξικότητα? Αλλιώς, θα χρειαστούν τουλάχιστον τρεις κύκλους (6 εβδομάδες) της χημειοθεραπείας στην ανάλυση αξιολόγησης της απόκρισης. Νωρίτερα αξιολόγηση απόκριση επιτρέπεται μόνο όταν οι ασθενείς είχαν σοβαρά συμπτώματα που δείχνει την εξέλιξη. μετρήσεις του αίματος και βιοχημικές εξετάσεις διεξήχθησαν εντός 72 ωρών από την έναρξη του κάθε κύκλου και 7-10 ημέρες μετά από κάθε κύκλο. Οι αξιολογήσεις διεξήχθησαν τυφλωθεί προς τις γενετικές αποτελέσματα και αξιολογήθηκαν ανεξάρτητα από δύο ιατρούς. Ένα τρίτο γιατρό επιλυθεί ασυνέπειες. Τα κλινικά δεδομένα ελέγχθηκαν από τον χορηγό της μελέτης

Θεραπεία

Οι ασθενείς που δέχτηκαν FOLFIRI έλαβε, όπως συνιστάται από τις κατευθυντήριες γραμμές του Εθνικού Comprehensive Cancer Network, ιρινοτεκάνη (Camptosar?. Pfizer, Σίδνεϊ, Αυστραλία) 180 mg /m

2 ενδοφλέβια (IV) έγχυση επί 30-90 λεπτά, την ημέρα 1? leucovorin 400 mg /m

2 ενδοφλέβια έγχυση για να ταιριάζει με τη διάρκεια της ιρινοτεκάνη έγχυσης, ημέρα 1? 5-FU 400 mg /m

2 IV bolus, ημέρα 1? τότε 1200 mg /m

2 /ημέρα × 2 ημέρες (σύνολο 2400 mg /m

2 πάνω από 46-48 ώρες) συνεχή έγχυση? Αυτό επαναλήφθηκε κάθε 14 ημέρες. Οι ασθενείς που αρνήθηκε συνεχή έγχυση αργότερα άλλαξε σε ένα mCapeIRI [23] αγωγή (ιρινοτεκάνη 125 mg /m

2, ημέρες 1 και 8? Καπεσιταβίνη 825 έως 1.000 mg /m

2, δύο φορές την ημέρα κατά τις ημέρες 1-14 ? επαναλαμβάνονται κάθε 21 ημέρες). Τροποποιήσαμε το πρότυπο ιρινοτεκάνη συν καπεσιταβίνη (CapeIRI [24] ή XELIRI [25]) αγωγή λόγω της εμπειρίας μας στον έλεγχο της τοξικότητας. Όλοι οι ασθενείς γίνονται δεκτές 5-υδροξυτρυπταμίνης ανταγωνιστής υποδοχέα (5 mg μία φορά την ημέρα) 30-60 λεπτά πριν από την ιρινοτεκάνη. Τα κριτήρια για τη μείωση της δόσης irinotecan δίνονται στον Πίνακα S2 σε S2 αρχείου. Η χημειοθεραπεία συνεχίστηκε μέχρι ασθένεια προχωρήσει ή μη ανεκτή τοξικότητα βγήκαν ή οι ασθενείς καλούνται να αποσύρθηκε για οποιοδήποτε λόγο.

Γονοτυπικές

Ψάξαμε το National Center for Biotechnology Information (NCBI) βάση δεδομένων SNP (dbSNP? ​​https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/) και συναφή βιβλιογραφία προσδιορίσει λειτουργική SNPs από τις

SLCO1B1

και

SLC19A1

γονίδια. Τα κριτήρια για την επιλογή SNP ήταν ως εξής :. (1) Με μια μικρή συχνότητα αλληλόμορφο πάνω από 0,15 στο ασιατικό πληθυσμό, (2) συντελεστής γονότυπου ≥ 95%, (3) παρερμηνεύσιμη SNP. Τρεις SNPs (

SLCO1B1

rs2306283 και rs4149056? Και

SLC19A1

rs1051266) επελέγησαν για προσδιορισμό του γονότυπου. Γενωμικό DNA εκχυλίστηκε από περιφερικό αίμα χρησιμοποιώντας κιτ DNA του αίματος FUJI σύνολο (Fujifilm Corporation, Tokyo, Japan). Εκκινητές σχεδιάστηκαν από τον Εργαλεία Γονοτυπικές και λογισμικού MassARRAY Δοκιμασία σχεδιασμού (έκδοση 3.0, Sequenom Inc., Σαν Ντιέγκο, Καλιφόρνια). SNPs γονότυπος χρησιμοποιώντας την πλατφόρμα Sequenom MassARRAY Iplex. Τα δεδομένα επεξεργάστηκαν και αναλύθηκαν από Sequenom MassArray Typer 4.0 του λογισμικού. Λεπτομέρειες των αντιδράσεων PCR και αλληλουχίες εκκινητών είναι διαθέσιμα σε File S1 και Πίνακας S3 σε File S2 αντίστοιχα. Πέντε τοις εκατό των δειγμάτων επιλέχθηκαν τυχαία και ο γονότυπος με άμεση αλληλούχιση, με αποτέλεσμα ρυθμό συμφωνία 100%. όριο κλήσεων συντελεστής καθορίστηκε σε ποσοστό τουλάχιστον 95% για κάθε SNP. Hardy-Weinberg ισορροπία (HWE) ελέγχθηκε μέσω χ

2 δοκιμών και

σ

& lt? 0.05 αναφέρεται απόκλιση από την ισορροπία.

Η στατιστική ανάλυση

Κάθε παραλλαγή αξιολογήθηκε για σύνδεση με κάθε παράμετρο. Οι συσχετίσεις μεταξύ RRR και γονότυπων ελέγχθηκαν χρησιμοποιώντας τη δοκιμή chi-τετράγωνο Pearson. Το πολυπαραγοντικό μοντέλο λογιστικής παλινδρόμησης (Enter) χρησιμοποιήθηκε για την προσαρμογή για πιθανούς συμπαράγοντες (το φύλο και την κατάσταση καπνίσματος ως διχοτομικές μεταβλητές? Ηλικία, επιφάνεια, και κατάσταση απόδοσης ως συνεχείς μεταβλητές? Rs1051266, rs2306283 και rs4149056 γονότυπους ως διχοτομικές μεταβλητές). Το κάπνισμα μείωσε σημαντικά την έκθεση σε ιρινοτεκάνη, υποδηλώνοντας δυνητικό κίνδυνο της αποτυχίας της θεραπείας σε μια μελέτη ασθενών-μαρτύρων [26]? Ως εκ τούτου, θα αντιπροσώπευε για το κάπνισμα κατάσταση στην πολυπαραγοντική ανάλυση. αναλογίες πιθανοτήτων (OR) και το διάστημα εμπιστοσύνης 95% τους (CI) υπολογίστηκαν ως εκτιμήσεις των συσχετισμών. λειτουργούν χαρακτηριστικό (ROC) καμπύλη δέκτη δημιουργήθηκαν για να συγκρίνουν τα μοντέλα με και χωρίς θετική προγνωστικούς παράγοντες ανταπόκρισης. ανάλυση και log-rank test Kaplan-Meier έγιναν για να εκτιμηθεί η κατανομή της PFS, IR-TTF, και το λειτουργικό σύστημα και να συγκρίνει τις διαφορές μεταξύ των καμπυλών επιβίωσης. Για να αξιολογηθεί η σχέση μεταξύ των γονότυπων και PFS, IR-TTF, και το λειτουργικό σύστημα, πολυπαραγοντική Cox παλινδρόμησης (Enter) πραγματοποιήθηκε, προσαρμογή για πιθανούς συγχυτικούς συμπαράγοντες. Οι αναλογίες κινδύνου (HR) και 95% CI τους υπολογίστηκαν ως εκτιμήσεις των συσχετισμών. Η τιμή του

σ

& lt? 0,05 θεωρήθηκε στατιστικά σημαντική σε δύο ουρών δοκιμή. Διορθωμένη τιμή Ρ (

σ

γ

) ελήφθη με Benjamini και Hochberg διόρθωση False Discovery Rate σε πολλαπλές δοκιμές. Haploview λογισμικού (έκδοση 4.2) χρησιμοποιήθηκε για τον υπολογισμό της ανισορροπίας σύνδεσης (LD) μεταξύ των πολυμορφισμών και να εκτελέσει την ανάλυση των προκυπτουσών απλοτύπων. Η στατιστική ανάλυση πραγματοποιήθηκε χρησιμοποιώντας SPSS 16.0 στατιστικού λογισμικού (SPSS Inc., Chicago, IL).

Αποτελέσματα

Τα χαρακτηριστικά των ασθενών και την έκβαση της θεραπείας

Τα χαρακτηριστικά των ασθενών παρουσιάζονται στον Πίνακα 1. Από Νοέμβρης 2010 – Ιούνιος 2012, 139 ασθενείς είχαν εγγραφεί. Δύο ασθενείς βρέθηκαν να είναι επιλέξιμες σύμφωνα με την αξιολόγηση της επιτροπής παρακολούθησης, και εξαιρέθηκαν από την τελική ανάλυση.

διάγραμμα

Ροή δείχθηκε στο Σχήμα 1. αξιολόγηση απόκρισης ήταν διαθέσιμη για 120 ασθενείς. Δεκαεπτά ασθενείς δεν μπορούν να αξιολογηθούν για την απάντηση λόγω: πρόωρη διακοπή της χημειοθεραπείας (με λιγότερους από τρεις κύκλους) λόγω αφόρητη τοξικότητα (

n

= 5) ή σε μη ιατρικούς λόγους (

n

= 6)? ακόμη υπό παρακολούθηση για απόκριση (

n

= 4)? ή άλλα αντι-καρκινική θεραπεία παρεμβαίνει με την εκτίμηση της αποτελεσματικότητας (

n

= 2).

Το RRR και τοξικότητες παρουσιάζονται στον Πίνακα S4 και S5 στο S2 αρχείου. Μεταξύ των 120 ασθενών οι οποίοι θεωρήθηκαν κατάλληλοι για την αξιολόγηση απόκριση, 33 ασθενείς (27,5%) πέτυχαν την ταχεία ανταπόκριση, από αυτούς, 13 ασθενείς (39,4%) ανταποκρίθηκαν μέσα στις πρώτες 6 εβδομάδες από τη χημειοθεραπεία, και 20 ασθενείς (60,6%) ανταποκρίθηκαν εντός 12 εβδομάδες από την έναρξη της χημειοθεραπείας (Πίνακας S4 στο αρχείο S2). Ενενήντα οκτώ ασθενείς έδωσαν δείγματα αίματος και ήταν ο γονότυπος, και η απάντηση ήταν εκτιμητέο σε 88,8% (

n

= 87). Καμία διαφορά για RRR βρέθηκε μεταξύ των ασθενών γονότυπος και μη-γονότυπος (26,4% έναντι 30,3%, p = 0,672? Pearson τεστ chi-τετράγωνο)

Τριάντα τρεις ασθενείς (24,1%), δέχθηκε την αγωγή mCapeIRI. . RRR (27,6% έναντι 27,5%,

σ

= 0.990? Pearson chi-τετράγωνο τεστ) και την επιβίωση (Σχήμα S1 στο S3 αρχείου) δεν έδειξε καμία διαφορά μεταξύ των ομάδων mCapeIRI και FOLFIRI. Γι ‘αυτό και δεν προέβη σε ανάλυση της υποομάδας σύμφωνα με διαφορετικά σχήματα χημειοθεραπείας.

Η Ν

Ασθενείς με RRR n (%)

Ή (95%CI)

p

P

c

rs2306283

aGG518(15.7)GA/AA3514(40.0)3.583(1.301-9.871)0.0110.022rs1051266

aGG 2411 (45,8) 3.521 (1,271 – 9,804) GA /AA 6212 (19,4) 0.0130.017rs4149056

BTT 6718 (26,9) CT /CC 205 (25,0) 0,907 (0,288 – 2,858) 0.8680.868rs2306283 (GA /ΑΑ) + rs1051266 (ΦΕΚ) 10 7 (70,0) 9.489 (2,191 έως 41,093) others7615 (19,7) 0.002

※ 0.008Table 3. RRR σε ασθενείς, σύμφωνα με γονότυπους (Pearson test chi-τετράγωνο).

RRR, ποσοστό ταχείας αντίδρασης? Ή, λόγος πιθανοτήτων? CI, διάστημα εμπιστοσύνης?

※ ακριβές τεστ του Fisher? Ν, αρ μεταξύ των φορολογητέων ασθενείς?

σ

γ

, P-value διορθωθεί από Benjamini και Hochberg διόρθωση False Discovery Rate. ένα γενετικό μοντέλο είναι REC.b γενετικό μοντέλο είναι DOM. CSV Λήψη CSV

Πληροφορίες SNPs, γονοτυπική και haplotypic συχνότητες και ανάλυση LD

Εκτός από την πολυκεντρική μας ομάδα, είμαστε ο γονότυπος SNPs σε 203 ασθενείς Κινέζοι γαστρεντερικού καρκίνου (98 ασθενείς mCRC και 105 ασθενείς με καρκίνο του στομάχου) . Οι συχνότητες γονοτύπου αναφέρονται στον Πίνακα 2. Η συχνότητα ανήλικος αλληλόμορφο (MAF) του κάθε SNP ήταν συγκρίσιμη με προηγουμένως αναφερθέντα δεδομένα στη βάση δεδομένων NCBI, εκτός από rs2306283, για την οποία η MAF ήταν χαμηλότερη σε πληθυσμό μας [27,28] από προηγουμένως αναφερθεί. Όλες οι εκδόσεις ήταν σε HWE (

σ

& gt? 0,05).

OCF (άλλοι κλινικοί παράγοντες) περιλαμβάνει το φύλο, επιφάνεια, κατάσταση απόδοσης και το κάπνισμα. Agene συμπεριλαμβάνει την ηλικία, rs2306283 και rs1051266. SE, τυπικό σφάλμα.

Η

Όχι σύνδεση παρατηρήθηκε ανάμεσα σε αυτές τις τρεις παραλλαγές (Εικόνα S2 στο αρχείο S3). Haplotypic συχνότητες

SLCO1B1

* 1Β, * 1A και * 15 φαίνονται στον πίνακα S6 στο S2 αρχείου.

Η Variate

RRR (Ν = 85)

Η Ή

95% CI

P

Η rs2306283GA /AA εναντίον GG4.0701.155-14.3470.029rs1051266GG εναντίον GA /AA4.3951.282-15.0640.019rs4149056CT /CC έναντι TT2.0820.502-8.6430.313sex0.8610.141-5.2430.871age1.0721.013-1.1350.017SA3.5380.027-458.5590.611PS1.0140.945-1.0870.701SS0.5080.119-2.1680.360Table 4. Η πολυπαραγοντική ανάλυση λογιστικής παλινδρόμησης (Enter) του RRR

RRR, ταχεία ποσοστό ανταπόκρισης.? Ν, Αρ εκτιμητέο ασθενείς? Ή, λόγος πιθανοτήτων? CI, διάστημα εμπιστοσύνης? Α.Ε., επιφάνεια? PS, κατάσταση απόδοσης? SS, το κάπνισμα κατάσταση. CSV Λήψη CSV

Συσχέτιση μεταξύ γονότυπων και την ανταπόκριση

Το πλήρες σύνολο των ενώσεων μεταξύ κάθε SNP και το RRR παρουσιάζονται στον Πίνακα 3. Τόσο rs2306283 (GA /ΑΑ) και rs1051266 (GG) ήταν σημαντικά σχετίζονται με υψηλότερη RRR από τεστ chi-τετράγωνο (Πίνακας 3) και μονοπαραγοντική ανάλυση λογιστικής παλινδρόμησης (Πίνακας S7 στο αρχείο S2). Όπως φαίνεται στον πίνακα 3, RRR ήταν 40% (14 από 35 ασθενείς) σε rs2306283 (GA /ΑΑ) ομάδα σε σύγκριση με 15,7% (8 από τους 51 ασθενείς) σε rs2306283 ομάδα (GG),

p = 0,011

. Στην ομάδα rs1051266 (ΦΕΚ), RRR ήταν 45,8% (11 από τους 24 ασθενείς) σε σύγκριση με το 19,4% (12 από 62 ασθενείς) σε rs1051266 (GA /ΑΑ) ομάδα,

σ

= 0.013. Ασθενείς με rs2306283 (GA /ΑΑ) και rs1051266 (GG) έδειξε μια πιο σημαντική διαφορά στην RRR (70% έναντι 19,7%, OR = 9.489,

σ

= 0,002). Οι διαφορές ήταν ακόμη σημαντική, ακόμη και μετά τη διόρθωση από Benjamini και διόρθωση Hochberg False Discovery Rate (

σ

γ

& lt? 0,05) και τη ρύθμιση για την πιθανή κλινική (φύλο, ηλικία, εμβαδόν, κατάστασης απόδοσης, και το κάπνισμα) και γενετική (rs4149056) συμπαράγοντες στην πολυμεταβλητή ανάλυση λογιστικής παλινδρόμησης (Πίνακας 4). Εκτός από τους γενετικούς παράγοντες, ηλικία ήταν ο μόνος παράγοντας που σχετίζεται κλινικά με RRR. Για να εκτιμηθεί η συμβολή των γενετικών παραγόντων για την πρόβλεψη των RRR, ROC ανάλυση πραγματοποιήθηκε με τη χρήση άλλων κλινικών παραγόντων (OCF), ηλικία από μόνη της και την ηλικία + rs2306283 + rs1051266 (AGene) αντίστοιχα. AGene έδωσε την υψηλότερη τιμή AUC (0.776,

σ

& lt? 0.001) και η καλύτερη ευαισθησία (Σχήμα 2), γεγονός που αποδεικνύει ότι οι παράγοντες του γονιδίου θα μπορούσε να βελτιώσει την προγνωστική ακρίβεια των RRR.

Συσχέτιση μεταξύ γονότυπων και την επιβίωση

Κατά τη διάμεση παρακολούθηση 270 ημέρες (εύρος 36-594 ημέρες), 69 ασθενείς είχαν πεθάνει, 3 ασθενείς δεν ήρθε να παρακολουθήσει το διορισμό τους, και 125 ασθενείς είχαν αποσυρθεί από τη μελέτη (53 έμπειρους PD, 15 υπέστησαν αφόρητες βαθμού ≥ 3 τοξικότητες [1 ασθενής αποσύρθηκε λόγω της ταχείας PD και απαράδεκτη τοξικότητα], 41 ασθενείς χωρίς PD επέλεξε να εγκαταλείψει την αντικαρκινική θεραπεία, 15 μη ασθενείς με PD αποδεκτή χειρουργική επέμβαση ή καθετήρα αρτηριακής θεραπεία χημειοεμβολισμό, και 2 ασθενείς ολοκλήρωσαν 12 κύκλους χημειοθεραπείας χωρίς εξέλιξη). Στη μελέτη μας, η διάμεση OS ήταν 343 ημέρες. Για να αποκλειστεί ότι οι διαφορές στο PFS και IR-TTF οφείλονταν σε μη χημειοθεραπεία παράγοντες, η PFS και IR-TTF αξιολόγηση αποκλείεται αυτούς τους ασθενείς χωρίς ιατρική λόγους ανάκλησης και μη-PD ασθενείς που αποδέχθηκε την αντικαρκινική θεραπεία, εκτός από χημειοθεραπεία. Έτσι, 41 και 54 ασθενείς είχαν γονότυπος και να αναλυθούν για την PFS και IR-TTF, αντίστοιχα. Εκ των οποίων, 1 ασθενείς δεν θα πρέπει να θανατωθούν για rs1051266. Στην ανάλυση Kaplan-Meier, οι ασθενείς με rs2306283 (GA /ΑΑ) είχαν σημαντικά μεγαλύτερο PFS (n = 41, μέση 124 έναντι 104 ημερών, log rank

σ

= 0,014) και IR-TTF (n = 54 , η διάμεση 96 έναντι 86 ημέρες, log rank

σ

= 0,046) σε σύγκριση με εκείνους με γονότυπο GG. Παρόμοια αποτελέσματα μονοπαραγοντική ανάλυση Cox παλινδρόμησης της PFS, IR-TTF και OS φαίνονται στον πίνακα S8 στο S2 αρχείου. Στην πολυπαραγοντική ανάλυση Cox παλινδρόμησης, rs2306283 (GA /ΑΑ) και πάλι αποδείχθηκε ότι είναι ένας ανεξάρτητος προγνωστικός παράγοντας της PFS (n = 40, HR = 0,402, 95% CI = 0,171 – 0,945,

σ

= 0,037), αλλά χάσει τη σημασία της σε εμφανίζουν μεγαλύτερη IR-TTF (n = 53,

σ

= 0.076? Πίνακας 5). Καμία σχέση δεν παρατηρήθηκε μεταξύ rs1051266 ή rs4149056 και PFS ή IR-TTF. Κανένα από τα SNPs ήταν ένας σημαντικός παράγοντας πρόβλεψης της OS (n = 96,

σ

& gt? 0,05? Πίνακας 5). Όλες οι καμπύλες επιβίωσης για rs2306283, rs1051266 και rs4149056 φαίνεται στο Σχήμα 3.

Variate

PFS (Ν = 40)

IR-TTF (Ν = 53)

OS (Ν = 96 )

HR(95%CI)

P

HR(95%CI)

p

HR(95%CI)

p

rs2306283GA/AA εναντίον GG0.402 (0.171-0.945) 0.0370.543 (0.277-1.066) 0.0760.966 (0.536-1.741) 0.909rs1051266GG εναντίον GA /AA1.329 (0.542-3.260) 0.5340.714 (0.358-1.423) 0,3391. 321 (0,688 – 2,538) 0.403rs4149056CT /CC έναντι TT1.197(0.527-2.718)0.6671.042(0.531-2.043)0.9050.688(0.341-1.390)0.297sex0.724(0.234-2.238)0.5740.941(0.350-2.534)0.9050.893(0.363-2.201)0.806age0.997(0.964-1.030)0.8521.008(0.981-1.035)0.5880.969(0.946-0.992)0.008SA0.827(0.018-39.075)0.9231.298(0.058-29.145)0.8700.266(0.023-3.113)0.292PS1.007(0.961-1.055)0.7711.006(0.969-1.045)0.7570.971(0.936-1.009)0.130SS0.934(0.339-2.575)0.8951.079(0.475-2.452)0.8562.201(1.053-4.602)0.036Table 5. ανάλυση παλινδρόμησης πολυπαραγοντική Cox (Enter) της PFS, IR-TTF και OS

PFS, η επιβίωση χωρίς εξέλιξη?. IR-TTF, ιρινοτεκάνη σχετίζονται χρόνος έως την αποτυχία της θεραπείας? OS, η συνολική επιβίωση? Ν, Αριθμός εκτιμητέα ασθενείς? HR, αναλογία κινδύνου? CI, διάστημα εμπιστοσύνης? Α.Ε., επιφάνεια? PS, κατάσταση απόδοσης?. SS, το κάπνισμα CSV Λήψη CSV

Συζήτηση

Βρήκαμε ότι ένα κοινό

SLC19A1

SNP, rs1051266 (GG) που ήταν παρούσα στο 29,9% της ομάδα μας, συσχετίστηκε με υψηλότερο ποσοστό ταχείας αντίδρασης FOLFIRI /mCapeIRI. για το καλύτερο της γνώσης μας, αυτή είναι η πρώτη προοπτική μελέτη για την αξιολόγηση της επίδρασης των

SLC19A1

παραλλαγές επί FOLFIRI /mCapeIRI φαρμακοδυναμική σε ασθενείς mCRC. Ο μεταφορέας SLC19A1 εντοπίζεται κυρίως στο κορυφαίο βούρτσα ριακή μεμβράνη της νήστιδας και του παχέος εντέρου και θεωρείται ως η κύρια οδός της πρόσληψης φολικού σε κύτταρα θηλαστικών [19] . λευκοβορίνη (μία ενεργοποιημένη μορφή του φυλλικού οξέος) μπορεί να βοηθήσει 5-FU για την αναστολή της θυμιδυλικής συνθάσης (TS) με σχηματισμό ενός τριμερούς συμπλόκου με TS-FdUMP. Ως εκ τούτου, leucovorin-5-FU συνδυασμοί έχουν καταδείξει ένα καλύτερο θεραπευτικό δείκτη από 5-FU μόνη της σε προχωρημένο καρκίνο του παχέος εντέρου [29-32]. Χαμηλή φολικού επίπεδα μπορεί να αυξήσει την ικανότητα της λευκοβορίνης για να σχηματιστεί το σύμπλοκο [20]. Backus et al (2000) ανέφεραν ότι τέσσερις ανεξάρτητες κυτταρικές σειρές καρκίνου του κόλου καλλιεργήθηκαν σε χαμηλό φολικού μέσο έδειξε μια μεγαλύτερη ευαισθησία σε είτε 5-FU μόνη της ή ο συνδυασμός με λευκοβορίνη [20]. Προηγούμενη δεδομένα έχουν δείξει ότι τα άτομα με γονότυπο rs1051266 (GG) είχαν χαμηλότερα επίπεδα φυλλικού οξέος στο πλάσμα [18]. Η υψηλότερη RRR των ασθενών rs1051266 (GG) στη μελέτη μας μπορεί εν μέρει να εξηγηθεί από κάτω φυλλικού οξέος στο πλάσμα και αυξημένη αναστολή TS, αλλά η εξήγηση αυτή πρέπει να επιβεβαιωθεί με περαιτέρω μελέτες.

SLCO1B1 διαμεσολαβεί την ηπατική εισροή SN38 από το αίμα. Το άλλο σημαντικό εύρημα είναι ότι rs2306283 (GA /ΑΑ) της

SLCO1B1

συνδέεται με υψηλότερα RRR, πλέον PFS και IR-TTF σε ασθενείς mCRC αντιμετωπίζεται με FOLFIRI /mCapeIRI σχήματα, ενώ rs4149056 (CT /CC) απέτυχε να προβλέψει RRR ή την επιβίωση. Ωστόσο, προηγούμενες μελέτες έχουν δείξει ότι η rs2306283 (A & gt? G) μπορεί να έχει μικρή επίδραση στη δραστηριότητα SLCO1B1 [33,34] και χωρίς στατιστική σημαντικότητα αναφέρθηκε μεταξύ rs2306283 και AUC

SN38 ή ανταπόκριση του όγκου σε ασθενείς με καρκίνο του πνεύμονα 81 [35 ], ενώ το αλληλόμορφο C του rs4149056 οδηγεί σε μειωμένη έκφραση της μεμβράνης της SLCO1B1, μειωμένη δραστηριότητα των μεταφορών, μειωμένη κάθαρση του φαρμάκου [36-39] και ένα υψηλότερο πλάσμα AUC

SN38 σε ασθενείς με καρκίνο του πνεύμονα [35]. Μια πρόσφατη μελέτη σύνδεσης του γονιδιώματος σε επίπεδο μεταξύ 699 παιδιά με οξεία λεμφοβλαστική λευχαιμία αποκάλυψε ότι rs2306283 συσχετίστηκε με αυξημένο μεθοτρεξάτη (ΜΤΧ, επίσης υποστρώματα της SLCO1B1) κάθαρση μετά την προσαρμογή για rs4149056 [37]. Είναι ενδιαφέρον, τα ευρήματά μας υποστήριξε ότι rs2306283 (GA /ΑΑ) συσχετίστηκε ανεξάρτητα με υψηλότερη RRR, πλέον PFS και IR-TTF μετά την προσαρμογή για rs4149056. Αυτά τα ευρήματα δείχνουν ότι η in vitro ή μικρές, αναδρομικές μελέτες μονής ίδρυμα έχουν συνήθως πάρα πολλά σύνθετα συμπαράγοντες για να δώσει πειστικά αποτελέσματα. Διαφορετικό εθνοτικό υπόβαθρο, διαφορετικές ασθένειες, διαφορετικά σχήματα και διαφορετικά ιρινοτεκάνη δόσεις μπορεί να οδηγήσει σε αμφιλεγόμενα αποτελέσματα. Ανανεωμένη συσχετίσεις μεταξύ rs2306283 (GA /ΑΑ) και τα αποτελέσματα της θεραπείας μετά την προσαρμογή για rs4149056 σε προοπτικές μελέτες είναι αξίζει να επιδιωχθεί σε πρόσθετες μελέτες.

Βρήκαμε επίσης ότι το 70% των ασθενών με τόσο rs2306283 (GA /ΑΑ) και rs1051266 (GG) πέτυχε την ταχεία αντίδραση, πολύ υψηλότερο από ό, τι άλλοι ασθενείς που είχαν γονότυπου. Μέχρι σήμερα, δεν υπάρχουν λειτουργικά δεδομένα σχετικά με τις επιδράσεις των συνδυασμένων

SLCO1B1

και

γονιδιακές παραλλαγές SLC19A1

στην πρόβλεψη απάντηση FOLFIRI /mCapeIRI. Οι διαφορές στην RRR (70% έναντι 19,7%), εάν επικυρωθεί, θα παρέχει πολύτιμες πληροφορίες για τη λήψη κλινικών αποφάσεων. Η έξυπνη λειτουργία του rs2306283 (GA /ΑΑ) σε συνδυασμό με rs1051266 (ΦΕΚ), μπορεί να βοηθήσει τους γιατρούς να καταλάβω μία υποομάδα των ασθενών που επωφελούνται από τη μετατροπή /εισαγωγική χημειοθεραπεία πριν από τη χειρουργική επέμβαση. Αλλά λόγω του μικρού μεγέθους του δείγματος, τα ευρήματά μας χρειάζονται επικύρωση σε μεγαλύτερες σειρές.

Κανένα από τα 3 SNPs βρέθηκε να σχετίζεται με το λειτουργικό σύστημα στη μελέτη μας, αν και αρκετές SNPs προέβλεψε μια καλύτερη απάντηση. Αυτό μπορεί να οφείλεται σε διαφορετικούς μεταγενέστερες αγωγές οι οποίες μπορεί να προκαλέσουν ύφεση σε ασθενείς ανθεκτικούς σε χημειοθεραπεία πρώτης γραμμής. Στη μελέτη μας, το ποσοστό ανταπόκρισης είναι χαμηλότερη και ο χρόνος επιβίωσης είναι μικρότερη από ό, τι σε προηγούμενες κλινικές δοκιμές [6,24]. Αυτό μπορεί να συμβαίνει επειδή έχουμε χάσει εκείνους τους ασθενείς που θα έχουν απαντήσει το αργότερο εντός 12 εβδομάδων από τη χημειοθεραπεία, επειδή οι ασθενείς με σταθερή νόσο έλαβαν μια χαμηλότερη διάμεση τιμή του αριθμού των κύκλων χημειοθεραπείας (διάμεσος αριθμός, 4? Εύρος, 2-12). Επιπλέον, το ποσοστό εγκατάλειψης του σχολείου, πριν PD ήταν υψηλό (34,2%) οφείλεται σε κοινωνικοοικονομικούς λόγους. Τι περισσότερο, μόνο 5 ασθενείς (4,2%) αποδέχθηκε εκτομή των μεταστάσεων στο ήπαρ. Οι λόγοι αυτοί μπορεί να εξηγήσει γιατί καλή απάντηση δεν σχετιζόταν με μεγαλύτερη OS στη μελέτη μας.

Εν κατακλείδι, τα αποτελέσματα αυτής της πολυκεντρικής προοπτικής μελέτης δείχνουν ότι rs2306283 (GA /ΑΑ) της

SLCO1B1

σε συνδυασμό με rs1051266 (ΦΕΚ) του

SLC19A1

σχετίζονται σημαντικά με την ταχεία ανταπόκριση του όγκου με FOLFIRI /mCapeIRI σε Κινέζους ασθενείς mCRC. Αυτό μπορεί να βοηθήσει τους γιατρούς να βελτιστοποιήσετε χημειοθεραπεία πρώτης γραμμής ασθενών με mCRC. Ανανεωμένη συσχετίσεις μεταξύ rs2306283 (GA /ΑΑ) και τα αποτελέσματα της θεραπείας είναι αξίζει να συνεχίσει και στο μέλλον.

Υποστήριξη Πληροφορίες

αρχείου S1.

Λεπτομέρειες των αντιδράσεων PCR.

doi: 10.1371 /journal.pone.0077223.s001

(DOCX)

αρχείου S2.

Πίνακας S1 έως S8.

doi: 10.1371 /journal.pone.0077223.s002

(DOCX)

αρχείου S3.

Σχήμα S1 στο S2.

doi: 10.1371 /journal.pone.0077223.s003

(DOCX)

Λίστα ελέγχου S1.

TREND Λίστα ελέγχου.

doi: 10.1371 /journal.pone.0077223.s004

(PDF)

πρωτόκολλο S1.

Δίκη πρωτοκόλλου.

doi: 10.1371 /journal.pone.0077223.s005

(DOC)

Ευχαριστίες

Ευχαριστούμε τους ασθενείς για την ευγενική παροχή βιολογικά δείγματα. Σας ευχαριστούμε Michael Heuser και Nathan Susnik από Hannover Medical School, τη Γερμανία για τη βοήθειά τους με χειρόγραφο γράψιμο, και CapitalBio (Πεκίνο, Κίνα) για πειραματικούς και βιοπληροφορική βοήθεια.

You must be logged into post a comment.