PLoS One: εξατομικευμένη θεραπεία σε μη μικροκυτταρικό καρκίνο του πνεύμονα Βασισμένο σε EGFR μεταλλάξεις BRCA1 και mRNA Expression


Αφηρημένο

Ιστορικό

Η μέση επιβίωση είναι 10 μήνες και 2-ετής επιβίωση είναι 20 % σε μεταστατικό καρκίνο του πνεύμονα μη-μικρού κυττάρου (NSCLC) που έλαβαν θεραπεία με βάση την πλατίνα χημειοθεραπεία. Ένα μικρό κλάσμα των μη πλακώδους καρκίνους του πνεύμονα λιμάνι μεταλλάξεις του EGFR, με βελτιωμένη έκβαση gefitinib και erlotinib. Πειραματικά στοιχεία δείχνουν ότι η υπερέκφραση BRCA1 ενισχύει την ευαισθησία να docetaxel και αντοχή στη σισπλατίνη. RAP80 και Αμπραξάς αλληλεπιδρούν πρωτεΐνες που σχηματίζουν σύμπλοκα με BRCA1 και θα μπορούσε να ρυθμίζουν τη δράση του BRCA1. Προκειμένου να εξετάσει περαιτέρω την επίδραση των μεταλλάξεων του EGFR και τα επίπεδα BRCA1 mRNA σε αποτέλεσμα σε προχωρημένο NSCLC, πραγματοποιήσαμε μια προοπτική κλινική μελέτη μη τυχαιοποιημένη μελέτη φάσης ΙΙ, τον έλεγχο της υπόθεσης ότι προσαρμοσμένη θεραπεία θα παρέχει βελτιωμένη έκβαση έναντι των μη-προσαρμοσμένη θεραπεία. Σε μια διερευνητική ανάλυση, εξετάσαμε επίσης την επίδραση των επιπέδων RAP80 και Abraxas mRNA.

Μεθοδολογία /Κύρια Ευρήματα

Εμείς αντιμετωπίζεται 123 μεταστατικό ασθενείς με καρκίνωμα πνεύμονα μη-πλακώδη χρησιμοποιώντας μια προσαρμοσμένη προσέγγιση. RNA και DNA απομονώθηκαν από μικροτομή δείγματα από καρκινικό ιστό εγκλεισμένα σε παραφίνη. Οι ασθενείς με μεταλλάξεις του EGFR έλαβαν erlotinib, και εκείνων που δεν έχουν μεταλλάξεις του EGFR έλαβαν χημειοθεραπεία με ή χωρίς σισπλατίνη με βάση τα επίπεδα BRCA1 mRNA τους: χαμηλά, σισπλατίνη συν γεμσιταβίνη? ενδιάμεσο, σισπλατίνη συν docetaxel? υψηλή, η docetaxel μόνη της. Μία διερευνητική ανάλυση εξετάζεται η έκφραση RAP80 και Abraxas. Διάμεση επιβίωση ξεπέρασαν τους 28 μήνες για τους 12 ασθενείς με μεταλλάξεις του EGFR, και ήταν 11 μήνες για τους 38 ασθενείς με χαμηλή BRCA1, 9 μήνες για τους 40 ασθενείς με ενδιάμεση BRCA 1, και 11 μήνες για τους 33 ασθενείς με υψηλή BRCA1. Διετούς επιβίωσης ήταν 73,3%, 41,2%, 15,6% και 0% αντίστοιχα. Η διάμεση επιβίωση επηρεάστηκε από την έκφραση RAP80 στις τρεις ομάδες BRCA1. Για παράδειγμα, για ασθενείς με τόσο χαμηλό BRCA1 και χαμηλή RAP80, διάμεση επιβίωση ξεπέρασε τους 26 μήνες. RAP80 ήταν ένας σημαντικός παράγοντας για την επιβίωση σε ασθενείς που έλαβαν θεραπεία ανάλογα με τα επίπεδα BRCA1 (αναλογία κινδύνου, 1.3 [95% CI, 1-1,7]? P = 0,05).

Συμπεράσματα /Σημασία

Η χημειοθεραπεία προσαρμοστεί ανάλογα με τα επίπεδα έκφρασης γονιδίων BRCA1 συνδέεται με εξαιρετική μεσαία και 2-ετής επιβίωση για ορισμένες υποομάδες των ασθενών με NSCLC και RAP80 θα μπορούσε να παίξει καίριο επίδραση διαμόρφωσης σε αυτό το μοντέλο εξατομικευμένων χημειοθεραπείας.

Δίκη ΕΓΓΡΑΦΕΣ

ClinicalTrials.gov NCT00883480

Παράθεση: Rosell R, Perez-Roca L, Sanchez JJ, Cobo Μ, Moran Τ, Chaïb I, et al. (2009) εξατομικευμένη θεραπεία σε μη μικροκυτταρικό καρκίνο του πνεύμονα Βασισμένο σε EGFR μεταλλάξεις και της έκφρασης γονιδίων BRCA1 mRNA. PLoS ONE 4 (5): e5133. doi: 10.1371 /journal.pone.0005133

Επιμέλεια: Μιχαήλ Β Blagosklonny, Ordway Research Institute, Ηνωμένες Πολιτείες της Αμερικής

Ελήφθη: 1 Δεκ 2008? Αποδεκτές: τρίτης Μάρτη του 2009? Δημοσιεύθηκε: 5, Μάη του 2009

Copyright: © 2009 Rosell et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Αυτή η μελέτη έλαβε μερική υποστήριξη από Redes de Καρκίνο, Ισπανία (RD06 επιχορήγηση /0020/0056). Η πηγή χρηματοδότησης δεν συμμετείχε στη συλλογή, την ανάλυση και την ερμηνεία των δεδομένων, τη συγγραφή της έκθεσης, ή την απόφαση να υποβάλει προς δημοσίευση

Αντικρουόμενα συμφέροντα:. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα.

Εισαγωγή

Η μέση επιβίωση των ασθενών με προχωρημένο ή μεταστατικό καρκίνο του πνεύμονα μη μικροκυτταρικό-κυττάρων (NSCLC) είναι μόνο 10-11 μήνες είτε με πρότυπο σισπλατίνη χημειοθεραπεία με βάση [1], [ ,,,0],2] ή προσαρμοσμένη σισπλατίνη χημειοθεραπεία με βάση την βάση για την επισκευή εκτομή cross-συμπλήρωση 1 (ERCC1) mRNA έκφραση, [3] και το ποσοστό επιβίωσης των δύο ετών είναι μόνο 14-21%. [1], [2], [3]

Οι δύο πρωτο-ογκογονίδια σήμερα είναι γνωστό ότι μεταλλάσσεται συνηθέστερα σε αδενοκαρκίνωμα του πνεύμονα είναι K-RAS και EGFR [4]. Καρκίνους του πνεύμονα που προκαλείται από μεταλλάξεις ενεργοποίησης στον υποδοχέα του επιδερμικού αυξητικού παράγοντα (EGFR) – κυρίως είτε απαλοιφή στο εξώνιο 19 ή μετάλλαξη L858R στο εξόνιο 21 – να ανταποκρίνονται σε αναστολείς κινάσης τυροσίνης μικρό μόριο (gefitinib και erlotinib), [5], [6], [7] με ένα πρόσφατα αναφερθεί μέση επιβίωση στο gefitinib 17,5 μήνες. [8] το ποσοστό ανταπόκρισης ήταν 90% σε αναδρομική μελέτη μεταλλάξεις εξέταση EGFR μας σε ασθενείς που έλαβαν θεραπεία με gefitinib, [9] και συγκεντρωτικά δεδομένα των προοπτικές μελέτες του gefitinib σε ασθενείς με μεταλλάξεις του EGFR παρουσίασαν ποσοστό ανταπόκρισης 80%. [10] Ωστόσο, δεν μεταλλάξεις του EGFR βρέθηκαν σε 454 ασθενείς με πλακώδες καρκίνωμα του πνεύμονα. [11]

ένα αυξανόμενο σώμα της στοιχεία δείχνουν ότι ο καρκίνος του μαστού γονίδιο ευαισθησίας 1 (BRCA1) προσδίδει ευαισθησία στην απόπτωση που επάγεται από φάρμακα μικροσωληναρίων (πακλιταξέλη και βινκριστίνη), αλλά επάγει αντίσταση σε παράγοντες προκαλούν βλάβη στο DNA (σισπλατίνη και ετοποσίδη) και ακτινοθεραπεία. [12], [13], [14], [15] Αυτά τα προ-κλινικά ευρήματα υποστηρίζονται από μία ποικιλία πειραματικά μοντέλα σε καρκίνο του μαστού και κύτταρα ωοθηκών: επαγώγιμη έκφραση του BRCA1 αυξημένη ευαισθησία paclitaxel? [16] μια σύντομης παρεμβολής RNA διαμεσολαβούμενη απενεργοποίηση του ενδογενούς BRCA1 οδήγησε σε paclitaxel και docetaxel αντίσταση? [17 ], [18], [19] και την ανασύσταση του BRCA1 ελλειμματικών κυττάρων με άγριου τύπου BRCA1 αυξημένη ευαισθησία στην πακλιταξέλη και βινορελβίνη. [17] Αυτή η διαφορική ρυθμιστική δράση της έκφρασης BRCA1 mRNA παρατηρήθηκε επίσης σε κύτταρα όγκου που απομονώνονται από κακοήθεις διαχύσεις του NSCLC και ασθενείς με γαστρικό καρκίνο, όπου τα επίπεδα BRCA1 mRNA συσχετίζεται αρνητικά με την ευαισθησία σισπλατίνη και θετικά με την ευαισθησία docetaxel [20] Δύο αναδρομικές μελέτες. – σε NSCLC [21] και τον καρκίνο των ωοθηκών [19] οι ασθενείς – διαπίστωσε ότι τα χαμηλά ή τα ενδιάμεσα επίπεδα BRCA1 mRNA συσχετίζονται με σημαντικά μεγαλύτερη επιβίωση μετά με βάση την πλατίνα χημειοθεραπεία, [19], [21], ενώ η επιβίωση σε ασθενείς με υψηλότερη έκφραση γονιδίων BRCA1 αυξήθηκε μετά ταξάνη χημειοθεραπεία με βάση. [19]

BRCA1 προσλαμβάνεται στους χώρους του DNA διαλείμματα, παίζοντας κεντρικό ρόλο στην επιδιόρθωση του DNA και τον έλεγχο του σημείου ελέγχου του κυτταρικού κύκλου. Η δέσμευση του μεσολαβητή του DNA οδοφράγματος βλάβη 1 πρωτεΐνης (MDC1) προς το φωσφορυλιωμένο ουρά ιστόνης Η2ΑΧ διευκολύνει το σχηματισμό του BRCA1 πυρηνικών εστίες σε δίκλωνα σπασίματα. [22] Ο υποδοχέας που σχετίζεται με πρωτεΐνη 80 (RAP80) δρα ανάντη του BRCA1 και απαιτείται για τη συσσώρευση του BRCA1 σε θέσεις διαλείμματα του DNA. [23], [24], [25] Αμπραξάς στρατολογεί RAP80 να σχηματίσει ένα σύμπλοκο με BRCA1. Τόσο Abraxas και RAP80 απαιτούνται για την επισκευή βλάβης του DNA, και τα κύτταρα εξαντλούνται από Abraxas ή RAP80 εμφανίζουν υπερευαισθησία σε ακτινοβολία. [23]

Για να εξεταστεί κατά πόσον προσαρμογή της θεραπείας θα μπορούσε να βελτιώσει το αποτέλεσμα σε ασθενείς με προχωρημένο NSCLC, έχουμε εκτελούνται μια προοπτική μη τυχαιοποιημένη μελέτη φάσης ΙΙ της εξατομικευμένη θεραπεία βασίζεται στην κατάσταση μετάλλαξης του EGFR και τα επίπεδα έκφρασης BRCA1 mRNA. Έχουμε επιλέξει να περιορίσει την εγγραφή σε καρκίνωμα μη πλακώδους επιθηλίου, προκειμένου να μεγιστοποιηθεί η δυνατότητα να διαχειρίζεται erlotinib σε ασθενείς με μεταλλάξεις του EGFR. Οι ασθενείς είτε με το εξώνιο 19 διαγραφή ή την μετάλλαξη L858R έλαβαν erlotinib, ενώ εκείνοι με άγριου-τύπου EGFR λάβει χημειοθεραπεία με βάση τα επίπεδα BRCA1: άτομα με χαμηλά επίπεδα έλαβαν σισπλατίνη συν γεμσιταβίνη? εκείνοι με ενδιάμεσα επίπεδα, έλαβαν cisplatin συν ντοσεταξέλη? και τα άτομα με υψηλά επίπεδα έλαβαν docetaxel μόνη της. Σε μια διερευνητική ανάλυση, εξετάσαμε επίσης την επίδραση των επιπέδων RAP80 και Abraxas mRNA σε αυτούς τους ασθενείς.

Αποτελέσματα

Ασθενείς

Μεταξύ Μαρτίου 2005 και Ιουλίου του 2007, το σύνολο των 123 ασθενείς από 25 κέντρα εγγράφηκαν στη μελέτη (Σχήμα 1). Τριάντα πέντε ασθενείς αποκλείστηκαν: 3 ασθενείς δεν είχαν καρκινικά κύτταρα στη βιοψία? 5 ασθενείς είχαν λιγότερο από 50 κύτταρα όγκου στην βιοψία, καθιστώντας αδύνατο να εξασφαλιστεί σωστά αποτελέσματα? 19 ασθενείς ήταν άγριου τύπου EGFR αλλά με ανεπαρκή δείγμα όγκου μετά από αξιολόγηση EGFR για ανάλυση της έκφρασης γονιδίων BRCA1? 2 ασθενείς αρνήθηκαν να συμμετάσχουν? και 6 ασθενείς αποσύρθηκαν από το γιατρό τους λόγω κλινικούς παράγοντες που δεν σχετίζονται με τη μελέτη. Για όλους τους 123 ασθενείς, η απομόνωση του RNA και την ενίσχυση PCR ήταν επιτυχείς. Κατά μέσο όρο, τα αποτελέσματα των γενετικών αναλύσεων ήταν διαθέσιμα σε 8 ημέρες (εύρος 6-11 ημέρες). Ο διάμεσος αριθμός των κύκλων χημειοθεραπείας που χορηγείται στις ομάδες BRCA1 ήταν 5 (εύρος, 1.8). Η μέση παρακολούθηση ήταν 8 μηνών (εύρος, 1-28 μήνες). Δώδεκα ασθενείς είχαν μεταλλάξεις του EGFR και είχαν για να λάβουν erlotinib (ομάδα EGFR). Από τους 111 ασθενείς με EGFR φυσικού τύπου, 38 βρίσκονταν στο χαμηλότερο tercile της έκφρασης γονιδίων BRCA1 και είχαν για να λάβουν σισπλατίνη συν γεμσιταβίνη (ομάδα χαμηλού BRCA 1), 40 ήταν στο ενδιάμεσο tercile και αποδόθηκαν έλαβαν σισπλατίνη και ντοσεταξέλη (ενδιάμεσο BRCA1 ομάδα), και 33 ήταν στην υψηλότερη tercile και είχαν για να λάβουν docetaxel (ομάδα υψηλού BRCA1) (Σχήμα 1).

Μεταξύ Μαρτίου 2005 και Ιουλίου του 2007, συνολικά 123 ασθενείς από 25 κέντρα εγγράφηκαν στη μελέτη. Λόγοι για την απόσυρση των ασθενών: 3 ασθενείς δεν είχαν καρκινικά κύτταρα στη βιοψία? 5 ασθενείς είχαν λιγότερο από 50 κύτταρα όγκου στην βιοψία, καθιστώντας αδύνατο να εξασφαλιστεί σωστά αποτελέσματα? 19 ασθενείς ήταν άγριου τύπου EGFR αλλά με ανεπαρκή δείγμα όγκου μετά από αξιολόγηση EGFR για ανάλυση της έκφρασης γονιδίων BRCA1? 2 ασθενείς αρνήθηκαν να συμμετάσχουν? και 6 ασθενείς αποσύρθηκαν από το γιατρό τους λόγω κλινικούς παράγοντες που δεν σχετίζονται με τη μελέτη. Οι δύο ασθενείς στην ομάδα EGFR που δεν είχαν υπό αξιολόγηση για απόκριση πέθαναν μέσα σε ένα μήνα από την ένταξη στη μελέτη? Οι 13 ασθενείς στην BRCA1 που δεν αξιολογήθηκαν ως προς την απάντηση που έλαβε & gt?. 3 κύκλους θεραπείας

Η

Τα κλινικά χαρακτηριστικά των τεσσάρων ομάδων που φαίνονται στον Πίνακα 1 και τον Πίνακα S1. Διάμεση ηλικία για όλους τους ασθενείς ήταν 60 ετών. Αναλογικά περισσότερο τις γυναίκες από τους άνδρες βρίσκονταν στο χαμηλότερο tercile της έκφρασης γονιδίων BRCA1. μεταλλάξεις του EGFR παρατηρήθηκαν πιο συχνά σε μη καπνιστές (Ρ = 0,03) και γυναίκες (P = 0.0001). Πενήντα πέντε τοις εκατό των ασθενών είχαν μια κατάσταση απόδοσης του 1, και 83% είχαν νόσο σταδίου IV. Δεκαεπτά τοις εκατό των ασθενών είχαν εγκεφαλικές μεταστάσεις. Οι ασθενείς με μεταλλάξεις του EGFR είχαν διάμεσο των δύο μεταστατικές θέσεις, σε σύγκριση με μια ιστοσελίδα σε ασθενείς με EGFR φυσικού τύπου (Πίνακας S2).

Η

Το συνολικό ποσοστό ανταπόκρισης ήταν 90% για την ομάδα EGFR, 25 % για την ομάδα χαμηλής BRCA1, 45,7% για την ενδιάμεση ομάδα BRCA1, και 41,9% για την ομάδα υψηλής BRCA1 (Πίνακας 2). Στην ανάλυση πρόθεσης για θεραπεία, το ποσοστό ανταπόκρισης ήταν 75% για την ομάδα του EGFR, 21,1% για την ομάδα χαμηλού BRCA1, το 40% για την ενδιάμεση ομάδα BRCA 1, και 39,4% για την ομάδα υψηλού BRCA1 (Πίνακας 2).

η διάμεση επιβίωση δεν επιτεύχθηκε, αλλά ξεπέρασαν τους 28 μήνες για την ομάδα του EGFR, σε σύγκριση με 10 μήνες (95% CI, 8,5 έως 15-5) για τους ασθενείς σε τρεις ομάδες BRCA1. Δύο χρόνια επιβίωσης για τους ασθενείς στην ομάδα EGFR ήταν 73,3% και για όλους τους ασθενείς στις ομάδες BRCA1 ήταν 26,7%. Για τους ασθενείς στην ομάδα χαμηλού BRCA1, διάμεση επιβίωση ήταν 11 μήνες (95% CI, 1,1 έως 20,9) και 2-ετής επιβίωση ήταν 41,2%. Για εκείνους στην ενδιάμεση ομάδα BRCA1, διάμεση επιβίωση ήταν 9 μήνες (95% CI, 05.04 – 12.06) και 2-ετής επιβίωση ήταν 15,6%. Για τους ασθενείς στην ομάδα του υψηλού BRCA1, διάμεση επιβίωση ήταν 11 μήνες (95% CI, 8,2 έως 13,8) και 2-ετή επιβίωση ήταν 0% (Πίνακας 2, Σχήμα 2).

Η διάμεση επιβίωση δεν επιτεύχθηκε για 12 ασθενείς στην ομάδα EGFR, 11 μήνες για τους 38 ασθενείς στην ομάδα χαμηλού BRCA1, 9 μήνες για τους 40 ασθενείς στην ενδιάμεση ομάδα BRCA1, και 11 μήνες για τους 33 ασθενείς στην ομάδα της υψηλής BRCA1 (Ρ = 0,01) (βλέπε πίνακα 2) .

η

Ο διάμεσος χρόνος έως την εξέλιξη ήταν 13 μήνες (95% CI, 7,7 έως 18,3) στην ομάδα του EGFR, σε σύγκριση με 6 μήνες (95% CI, 04.07 – 07.02) για τους ασθενείς σε όλα τα τρία BRCA1 ομάδες. Για τους ασθενείς με χαμηλές και στις ενδιάμεσες ομάδες BRCA1, ο χρόνος έως την εξέλιξη ήταν 5 μήνες (95% CI, 02.07 – 07.03). Για τους ασθενείς στην ομάδα υψηλής BRCA1, ο χρόνος έως την εξέλιξη ήταν 8 μήνες (95% CI, 05.01 – 10.09) (Πίνακας 2, Σχήμα S1).

μεταγραφές RAP80 και Abraxas mRNA

Με βάση την τα αποτελέσματα των πειραματικών μοντέλων [23], [24], [25], μια διερευνητική ανάλυση της σχέσης μεταξύ BRCA1, RAP 80 και έκφραση Αμπραξάς mRNA διεξήχθη σε 86 από 111 ασθενείς χωρίς μεταλλάξεις του EGFR, για τους οποίους επαρκής ιστός όγκου ήταν διαθέσιμα. Τα χαρακτηριστικά των ασθενών για αυτούς τους 86 ασθενείς ήταν παρόμοια με εκείνα του συνόλου των 111 ασθενείς? σημαντικά περισσότερες γυναίκες από τους άνδρες είχαν χαμηλή έκφραση BRCA1 (P = 0,009). Response ήταν σημαντικά υψηλότερη σε ασθενείς με ενδιάμεσα και τα υψηλά επίπεδα BRCA1 (Ρ = 0,004). (Πίνακας S3). Μια στενή συσχέτιση βρέθηκε μεταξύ BRCA1 και RAP 80 επίπεδα (ρ = 0,27? P = 0.02) και μεταξύ RAP 80 και τα επίπεδα Abraxas (ρ = 0,41? P & lt? 0.001), αλλά όχι μεταξύ BRCA1 και τα επίπεδα Abraxas (ρ = 0,10? P = 0.39).

η διάμεση επιβίωση ήταν επηρεασμένος από RAP 80 επίπεδα. Σε ασθενείς με χαμηλά επίπεδα BRCA1, διάμεση επιβίωση δεν επιτεύχθηκε το ασθενείς με χαμηλά επίπεδα RAP 80, ενώ ήταν 8 μήνες για τους ασθενείς με ενδιάμεσες RAP 80 και 7 μήνες για εκείνους με υψηλή RAP 80 (Πίνακας 3, Σχήμα 3). Σε ασθενείς με ενδιάμεσα επίπεδα BRCA1, διάμεση επιβίωση ήταν 5 μήνες σε ασθενείς με χαμηλά RAP 80 επίπεδα, ενώ ήταν 13 μήνες για τους ασθενείς με ενδιάμεση RAP 80 επίπεδα και 16 μήνες για τα άτομα με υψηλά RAP 80 επίπεδα. Σε ασθενείς με υψηλά επίπεδα BRCA1, διάμεση επιβίωση ήταν 6 μήνες σε ασθενείς με χαμηλά RAP 80 επίπεδα, 12 μήνες σε ασθενείς με ενδιάμεσα επίπεδα RAP80, και 11 μήνες για τα άτομα με υψηλά RAP 80 επίπεδα (Πίνακας 3).

η διάμεση επιβίωση δεν επιτεύχθηκε για 11 ασθενείς με χαμηλά RAP 80 επίπεδα, 8 μήνες για τους 9 ασθενείς με ενδιάμεσο RAP 80 επίπεδα και 7 μήνες για 5 ασθενείς με υψηλά RAP 80 επίπεδα (P = 0,006).

η

σε ασθενείς με χαμηλά επίπεδα BRCA1, ο χρόνος έως την εξέλιξη ήταν 14 μήνες σε ασθενείς με χαμηλά RAP 80 επίπεδα, ενώ ήταν 4 μήνες για τους ασθενείς με ενδιάμεσα επίπεδα RAP80 και 6 μήνες για τα άτομα με υψηλά RAP 80 επίπεδα (Πίνακας 4, Εικόνα S2). Σε ασθενείς με ενδιάμεσα επίπεδα BRCA1, ο χρόνος έως την εξέλιξη ήταν 4 μήνες σε ασθενείς με χαμηλά επίπεδα RAP 80, ενώ ήταν 9 μήνες για τους ασθενείς με ενδιάμεση RAP 80 επίπεδα και 6 μήνες για τα άτομα με υψηλά RAP 80 επίπεδα. Σε ασθενείς με υψηλά επίπεδα BRCA1, ο χρόνος έως την εξέλιξη ήταν 2 μήνες σε ασθενείς με χαμηλά RAP 80 επίπεδα, 10 μήνες σε ασθενείς με ενδιάμεση RAP 80 επίπεδα, και 4 μηνών για τα άτομα με υψηλά RAP 80 επίπεδα (Πίνακας 4).

Παρόμοια αποτελέσματα ελήφθησαν όταν η μέση επιβίωση και ο χρόνος έως την εξέλιξη συγκρίθηκαν ανάλογα με τα επίπεδα έκφρασης του mRNA Αμπραξάς (πίνακες S4 και S5). Μια διερευνητική πολυπαραγοντική ανάλυση στους 86 ασθενείς, με τη χρήση ενός μοντέλου Cox proportional-κίνδυνοι, που προσδιορίζονται κατάσταση απόδοσης ECOG και RAP 80 ως σημαντικές μεταβλητές για την επιβίωση (αναλογίες κινδύνου: το καθεστώς των επιδόσεων 1, 2,72? P = 0,005? RAP 80, 1.3 ? Ρ = 0,05) (Πίνακας S6). Επιβίωση δεν επηρεάστηκε από άλλα κλινικά χαρακτηριστικά, τα είδη των μεταστάσεων, χημειοθεραπεία δεύτερης γραμμής (36 ασθενείς), ή τα επίπεδα Abraxas. Το μοντέλο Cox για το χρόνο έως την εξέλιξη έδειξε επίσης ότι μόνο το καθεστώς των επιδόσεων και RAP 80 ήταν σημαντικές μεταβλητές (Πίνακας S7).

Συζήτηση

Οι μεταλλάξεις στην περιοχή της κινάσης τυροσίνης EGFR να προκαλέσει αδενοκαρκίνωμα του πνεύμονα σε ποντίκια [ ,,,0],26] και ένα ευνοϊκό απάντηση πρώτης και δεύτερης γραμμής gefitinib και erlotinib σε προχωρημένο NSCLC. [7], [8] στην παρούσα μελέτη, η μέση επιβίωση ξεπέρασαν τους 28 μήνες σε 12 ασθενείς με μεταλλάξεις του EGFR που έλαβαν θεραπεία με erlotinib, με διάμεση χρόνος έως την εξέλιξη των 13 μηνών και δύο ετών επιβίωση του 73,3%? Τα αποτελέσματα αυτά είναι παρόμοια με τα ευρήματα μιας μετα-ανάλυση προοπτικών μελετών με gefitinib σε ασθενείς με μεταλλάξεις του EGFR. [10] Η διάμεση επιβίωση ήταν 11 μήνες σε ασθενείς με τη χαμηλότερη έκφραση BRCA1, που έλαβαν θεραπεία με σισπλατίνη συν γεμσιταβίνη, και την επιβίωση των δύο ετών ήταν 41,2%, η οποία συγκρίνεται ευνοϊκά με το μέσο και δύο ετών επιβίωση επιτυγχάνεται με γεμσιταβίνη και σισπλατίνη ή πεμετρεξίδη συν σισπλατίνη (10,3 μήνες και 22%) σε μια πρόσφατη τυχαιοποιημένη μελέτη. [2] σε ασθενείς με την υψηλότερη έκφραση BRCA1, που έλαβαν θεραπεία με docetaxel μόνη της, διάμεση επιβίωση ήταν 11 μήνες, όμοια με αυτή που ελήφθη σε μια μεγάλη δοκιμή φάσης ΙΙΙ σε ασθενείς υπό αγωγή με docetaxel σε συνδυασμό με σισπλατίνη. [1] Ωστόσο, στη μελέτη μας, κανένας ασθενής να ήταν ζωντανός σε δύο χρόνια, ενώ στη μελέτη φάσης ΙΙΙ , διετής επιβίωση ήταν 21% [1] Περιέργως, 11 ασθενείς με το χαμηλότερο έκφραση και των δύο γονιδίων BRCA1 και RAP 80 είχε ένα αποτέλεσμα παρόμοιο με εκείνο που επιτυγχάνεται με τους ασθενείς με μεταλλάξεις του EGFR που έλαβαν θεραπεία με erlotinib:. διάμεση επιβίωση δεν επιτεύχθηκε και χρόνο για να επιδείνωση ήταν 14 μήνες (Πίνακας 3, Σχήμα 3) απόκριση .Chemotherapy είναι σταθερά βασίζεται στο γεγονός ότι τα γονίδια επιδιόρθωσης του DNA απαιτούν μια σειρά βημάτων μοριακής αναγνώρισης που επιτρέπουν πρωτεΐνες απόκριση βλάβης του DNA για τον εντοπισμό σε και κοντά βλάβες του DNA. Η δέσμευση του μεσολαβητή του DNA οδοφράγματος βλάβη 1 πρωτεΐνης (MDC1) προς το φωσφορυλιωμένο ουρά ιστόνης Η2ΑΧ (γH2AX) διευκολύνει το σχηματισμό του BRCA1 πυρηνικών εστίες σε δίκλωνα σπασίματα που επάγεται με ακτινοβολία ή χημειοθεραπεία. Με διμερισμού με BRCA1 που σχετίζονται με τον τομέα RING πρωτεΐνη (BARD1) μέσα από την περιοχή RING, το BRCA1 αποτελεί Ε3 λιγκάσης της ουμπικουϊτίνης. Πρόσφατα, έχει δειχθεί ότι η RAP 80 στόχους το BRCA1-BARD1 Ε3 λιγάση να MDC1-γH2AX εξαρτώμενη λυσίνη 63-συνδεδεμένες πρωτεΐνες ubiquitin στο δίκλωνα σπασίματα (ανασκόπηση στο Wang & amp? Elledge [27]). Τρεις μελέτες έδειξαν ότι η κατάργηση της RAP 80 μείωσε τον σχηματισμό του BRCA1 επαγόμενης εστιών σε 28%, [23] 2% [24] και 0%. [25] Επιπλέον, ο σχηματισμός εστιών Αμπραξάς και RAP 80 είναι BRCA1-ανεξάρτητη. [ ,,,0],23] Ως εκ τούτου υποθέσαμε ότι εάν RAP 80 ανυψώθηκε, θα μπορούσε να προκαλέσει αντίσταση στην σισπλατίνη χημειοθεραπεία με βάση ακόμη και παρουσία χαμηλών επιπέδων BRCA1. Η διερευνητική αξιολόγηση της RAP 80 στην παρούσα μελέτη επιβεβαιώνει διαμόρφωσης επίδρασή της στην BRCA1 προσαρμοσμένο μοντέλο. Για παράδειγμα, η μέση επιβίωση σε ασθενείς με τη χαμηλότερη έκφραση BRCA1 μειώθηκε καθώς αυξήθηκε RAP 80 έκφραση: 8 μήνες με ενδιάμεσα RAP 80 επίπεδα και 7 μηνών υψηλά RAP 80 επίπεδα (Πίνακας 3). Η υπερέκφραση των γονιδίων BRCA1 προσδίδει ευαισθησία σε docetaxel και paclitaxel? [12], [17], [19], [20] οι ασθενείς με τα υψηλότερα επίπεδα BRCA1, που έλαβαν θεραπεία με docetaxel, είχε μια μέση επιβίωση των 11-12 μηνών όταν η έκφραση RAP80 ήταν επίσης υψηλό αλλά μόνο 6 μήνες όταν RAP 80 έκφραση ήταν χαμηλή (Πίνακας 3). Οι ασθενείς με ενδιάμεσα επίπεδα BRCA1, υποβλήθηκε σε επεξεργασία με σισπλατίνη και ντοσεταξέλη, είχε συνολικό διάμεση επιβίωση των 9 μηνών, η οποία αυξήθηκε σε 13-16 μήνες όταν RAP 80 επίπεδα ήταν μέσης ή υψηλής (Πίνακας 3). Αυτά τα αποτελέσματα μπορούν να εξηγηθούν από προ-κλινικά ευρήματα ότι η RAP 80 είναι σε θέση να μετατοπίζονται σε ακτινοβολία που προκαλείται από εστίες σε HCC1937 κύτταρα που εκφράζουν κολοβωμένη BRCA1 που δεν είναι σε θέση να μεταναστεύσουν στην πυρηνική εστιών. [28] Αυτό δείχνει ότι η RAP 80 θα μπορούσε να αντικαταστήσει το BRCA1 λειτουργία επιδιόρθωσης του DNA σε κύτταρα που δεν έχουν BRCA1. Έτσι, αν και διαφορετικά ζεύγη λευκόχρυσου δείχνουν το ίδιο [29] – ή ελαφρώς διαφορετική [2] – επιβίωσης συνολικά, οι διαφορές θα μπορούσαν να βρεθούν κατά την προσαρμογή της χημειοθεραπείας που βασίζεται σε ένα μοντέλο των γονιδίων BRCA1 και RAP 80.

Στην παρούσα μελέτη , δεν βρέθηκε συσχέτιση μεταξύ BRCA1 και της έκφρασης Abraxas mRNA. Ωστόσο, υπήρχε μία ένδειξη ότι τα επίπεδα έκφρασης του Αμπραξάς διαμορφώνουν την επίδραση του BRCA1. Για παράδειγμα, οι ασθενείς με το χαμηλότερο έκφραση BRCA1, υποβλήθηκε σε επεξεργασία με σισπλατίνη συν gemcitabine, επιτυγχάνεται μια μέση επιβίωση 18 μηνών και χρόνος έως την εξέλιξη της 11 μήνες, όταν τα επίπεδα ήταν χαμηλά Αμπραξάς (Πίνακας S4).

Εκτός από το δυναμικό προγνωστική ρόλο του BRCA1, BRCA1 υπερέκφραση προσδίδει επιθετική συμπεριφορά σε διαγονιδιακά μοντέλα των μικρών κυττάρων και καρκινώματα πλακωδών κυττάρων του πνεύμονα, καθώς επίσης και σε ένα υποσύνολο των αδενοκαρκινωμάτων του πνεύμονα που φέρει την εγγενή t /t-αντιγόνου υπογραφή του καρκίνου. [30] η κακή πρόγνωση έχει επίσης έχουν συσχετιστεί με BRCA1 υπερέκφραση στις αρχές του NSCLC. [31] στην παρούσα μελέτη, διετούς επιβίωσης ήταν 41% σε ασθενείς με τα χαμηλότερα επίπεδα BRCA1, 16% σε εκείνους με ενδιάμεσα επίπεδα και 0% σε άτομα με τα υψηλότερα επίπεδα.

Οι μηχανισμοί του BRCA1 υπερέκφραση ή προς τα κάτω ρύθμιση σε NSCLC μένει να διευκρινιστούν. Ωστόσο, έχει πρόσφατα αποδειχθεί ότι το DNA διασπάται ταχέως ενεργοποιούν πρωτεΐνη ετεροχρωματίνη 1-β (ΗΡ1-β), το οποίο προωθεί τη φωσφορυλίωση ιστόνης Η2ΑΧ, την κίνηση της BRCA1 συγκρότημα σηματοδότηση για την επιδιόρθωση του DNA. [32] Είναι ενδιαφέρον, καζεΐνης κινάσης 2 προάγει την κινητοποίηση του ΗΡ1-β και σχετίζεται με κακή πρόγνωση σε NSCLC. [33] Ενώ BRCA1 μεθυλίωση παρατηρείται στον καρκίνο του μαστού πόρου, βρίσκεται μόνο στο 4% των NSCLCs. [34] Χαμηλή έκφραση BRCA1 σε όγκους μπορεί να οφείλεται στην απώλεια της μεθυλτρανσφεράσες ιστονών, η οποία οδηγεί σε μειωμένη χρωματίνη Η3 μεθυλίωση σε λυσίνη 9, με την επακόλουθη ρύθμιση προς τα κάτω του ΗΡ1-β. [35]

σε αυτή τη φάση II, μη τυχαιοποιημένη μελέτη, ο γενετικός παράγοντας και διαφορά θεραπείας είναι εντελώς συνυπάρχουν, και πρέπει να δίνεται προσοχή κατά την ερμηνεία των αποτελεσμάτων. Ωστόσο, η διερευνητική ανάλυση δείχνει ότι υπάρχουν κάποιες ενδείξεις για το ράψιμο χημειοθεραπεία με βάση την BRCA1 και RAP 80 επίπεδα. Επιπλέον, σε μια πρόσφατη μελέτη ασθενών IV NSCLC 96 στάδιο υπό αγωγή με docetaxel συν γεμσιταβίνη, παρατηρήσαμε ότι τα επίπεδα BRCA1 mRNA αυξάνεται, η πιθανότητα ανταπόκρισης αυξήθηκε και ο κίνδυνος εξέλιξης μειώθηκε. Για τους ασθενείς με τα υψηλότερα επίπεδα BRCA1, το ποσοστό ανταπόκρισης ήταν 58,6%, έναντι 13,8% για τα άτομα με ενδιάμεσα επίπεδα και 27,6% για τα άτομα με τα χαμηλότερα επίπεδα. [36] Με βάση αυτά τα ευρήματα και αυτά της παρούσας μελέτης, η ισπανική πνεύμονα Ομάδα Καρκίνου τώρα την τροποποίηση του πρωτοκόλλου για μια προγραμματισμένη δίκη διεθνή φάσης III σε προχωρημένο NSCLC να συμπεριλάβει προσαρμογή με βάση RAP 80, καθώς και την έκφραση BRCA1 mRNA. Οι ασθενείς στο σκέλος ελέγχου θα λάβουν σισπλατίνη συν ντοσεταξέλη και εκείνων στο πειραματικό σκέλος θα λάβουν χημειοθεραπεία με βάση την RAP 80 και τα επίπεδα BRCA1 mRNA: χαμηλή RAP 80 επίπεδα (ανεξάρτητα από τα επίπεδα BRCA1), σισπλατίνη συν γεμσιταβίνη? μέσης ή υψηλής RAP 80 και χαμηλό ή ενδιάμεσο BRCA1, σισπλατίνη συν docetaxel? μέσης ή υψηλής RAP 80 και υψηλής BRCA1, η docetaxel μόνη της

Υλικά και Μέθοδοι

Το πρωτόκολλο για τη δοκιμή αυτή είναι διαθέσιμη ως υποστηρικτικές πληροφορίες.? βλέπε πρωτόκολλο S1 και S2 πρωτόκολλο.

Δήλωση Ηθικής

Το πρωτόκολλο εγκρίθηκε από την επιτροπή δεοντολογίας ηθική του κάθε κέντρου, και όλοι οι ασθενείς παρείχαν ενυπόγραφη ενημερωμένη συγκατάθεση πριν από την εγγραφή.

Ασθενείς

Θα προσληφθεί ασθενείς με αυτή τη φάση ΙΙ προοπτική μελέτη πολυκεντρική βάση για τον έλεγχο των μεταλλάξεων του EGFR που ακολουθείται από ανάλυση της έκφρασης γονιδίων BRCA1 mRNA σε ιστό του όγκου παραφίνη-ενσωματωμένες. Κλινική επιλεξιμότητας περιλαμβάνονται στάδιο IIIB με πλευριτική συλλογή ή σταδίου IV NSCLC, μετρήσιμη νόσο κατά Κριτήρια Αξιολόγησης απόκρισης σε συμπαγείς όγκους (RECIST), την κατάσταση απόδοσης 0-2 από Eastern Cooperative Oncology Group (ECOG) κριτήρια, επαρκή αιματολογική, νεφρική και ηπατική λειτουργία. εγκεφαλικές μεταστάσεις είχαν τη δυνατότητα. Οι ασθενείς με πλακώδες όγκους των κυττάρων, προηγούμενη συστηματική θεραπεία για προχωρημένο NSCLC, ή άλλα κλινικά σημαντική καρκίνους μέσα σε πέντε χρόνια δεν ήταν επιλέξιμες

Οι ασθενείς με μεταλλάξεις του EGFR. – Είτε το εξόνιο 19 διαγραφή ή η μετάλλαξη L858R – έλαβαν 150 mg ημερησίως από του στόματος erlotinib συνεχώς μέχρι εξέλιξη ή μη ανεκτές ανεπιθύμητες ενέργειες. Κάθε κύκλος ήταν 28 ημέρες. Οι ασθενείς με EGFR φυσικού τύπου που έλαβε προσαρμοστεί η χημειοθεραπεία με βάση τα επίπεδα BRCA1 mRNA. Οι ασθενείς στην χαμηλότερη tercile της έκφρασης γονιδίων BRCA1 έλαβαν σισπλατίνη 75 mg /m

2 την ημέρα 1 συν γεμσιταβίνη 1250 mg /m

2 τις ημέρες 1 και 8. Οι ασθενείς στο ενδιάμεσο tercile έλαβαν σισπλατίνη 75 mg /m

2 την ημέρα 1 και ντοσεταξέλη 75 mg /m

2 την ημέρα 1. Οι ασθενείς με την υψηλότερη tercile έλαβαν docetaxel 75 mg /m

2 την ημέρα 1. Όλα χημειοθεραπείας επανελήφθη κάθε τρεις εβδομάδες για ένα μέγιστο των έξι κύκλων εκτός αν υπήρχε νωρίτερα ενδείξεις εξέλιξης της νόσου ή μη ανεκτές ανεπιθύμητες ενέργειες.

Βασική εκτίμηση περιλαμβάνεται ένα ιατρικό ιστορικό, κλινική εξέταση και οι μετρήσεις του όγκου των ψηλαφητών βλαβών, καθώς και βλάβες αξιολογούνται με υπολογιστική τομογραφία σαρώσεις. Η μέθοδος αξιολόγησης της βάσης επαναλαμβάνεται κάθε άλλο κύκλο, και στη συνέχεια κάθε έξι εβδομάδες μέχρι την εξέλιξη της νόσου.

Μοριακής αναλύει

συλλογή του όγκου των ιστών και τη σύλληψη λέιζερ μικροδιατομής.

BRCA1, RAP80 και Αμπραξάς γονιδιακής έκφρασης και EGFR μεταλλάξεις αναλύθηκαν σε RNA και DNA που απομονώθηκε από ιστούς όγκων εγκλεισμένους σε παραφίνη. Για κάθε δείγμα όγκου σε αιματοξυλίνη /ηωσίνη βάφονται φέτα αναλύθηκε με παθολόγο μας για να επιλέξετε την περιοχή του όγκου. Δύο φέτες 5-micron ήταν τοποθετημένα σε ειδικές διαφάνειες (PEM-Membrane διαφάνειες, Palm, Oberlensheim, Γερμανία) για τη δέσμευση λέιζερ μικροδιατομής (CAPmover Microdissector, Carl Zeiss μικροαπεικόνισης, Βαρκελώνη, Ισπανία) για να εξασφαλίσει ένα ελάχιστο 90% των καρκινικών κυττάρων. Ένα slide χρησιμοποιήθηκε για την απομόνωση του RNA και το δεύτερο χρησιμοποιήθηκε για την απομόνωση του DNA. Ανάλυση

γονιδιακής έκφρασης.

Ανάλυση έκφρασης γονιδίων πραγματοποιήθηκε σε RNA που απομονώθηκε από τα δείγματα ιστών όγκου. cDNA συντέθηκε χρησιμοποιώντας M-MLV ένζυμο retrotranscriptase. cDNA πρότυπο προστέθηκε σε Taqman καθολική Master Mix (ΑΒ? Applied Biosystems, Foster City, CA, USA) με ειδικούς εκκινητές και ανιχνευτής για κάθε γονίδιο (Πίνακας S8). Τα σετ εκκινητή και ανιχνευτή σχεδιάστηκαν με χρήση λογισμικού Primer Express 2.0 (ΑΒ) και τις ακολουθίες REFSEQ (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=gene). Ποσοτικοποίηση της έκφρασης γονιδίου διεξήχθη χρησιμοποιώντας το ΑΒΙ Prism 7900HT Σύστημα Ανίχνευσης Αλληλουχίας (ΑΒ).

ανάλυση μετάλλαξης EGFR.

Για την απομόνωση του DNA από μικροδιατομή ιστό, το υλικό επωάσθηκε με πρωτεϊνάση Κ και Το DNA εκχυλίζεται με φαινόλη-χλωροφόρμιο και καταβύθιση με αιθανόλη. Εναρκτήρες για PCR ενίσχυση σε φωλιασμένη αντιδράσεις για εξώνια 19 και 21 του EGFR που εμφανίζεται στην πληροφορία στήριξης. Μεταλλάξεις αναλύθηκαν χρησιμοποιώντας δύο μεθόδους:. Αλληλουχίας του DNA και ανάλυση μήκος επισημανθεί δια φθορισμού PCR προϊόντων για τις διαγραφές EGFR στο εξόνιο 19, και αλληλούχιση και 5 ‘δοκιμασία δραστικότητας νουκλεάσης (TaqMan) για μετάλλαξη EGFR στο εξόνιο 21 (L858R)

(για περισσότερες λεπτομέρειες σχετικά με τις μοριακές αναλύσεις, βλ Κείμενο S1).

Η στατιστική ανάλυση

οι ασθενείς χωρίστηκαν σε ομάδες με βάση terciles της έκφρασης γονιδίων BRCA1 δεδομένου ότι αυτή η διαίρεση είναι λιγότερο επιρρεπείς σε προκατάληψη σε πολλαπλές συγκρίσεις. Cut-off σημεία για τα terciles BRCA1 ελήφθησαν από τη βάση δεδομένων ισπανική Lung Cancer Ομάδα, η οποία περιλαμβάνει κλινικά και γενετικά χαρακτηριστικά του περισσότερους από 600 ασθενείς με καρκίνο του πνεύμονα Ισπανικά. Απαντήσεις καταγράφηκαν σύμφωνα με τα κριτήρια RECIST. Ο διάμεσος χρόνος έως την εξέλιξη και τη συνολική επιβίωση ήταν υπολογίζονται από την έναρξη της θεραπείας με την πρώτη τεκμηριωμένη εξέλιξη της νόσου ή το θάνατο, αντίστοιχα.

Για να συγκρίνετε ποσοτικών μεταβλητών μεταξύ των ασθενών σε κάθε μία από τις ομάδες θεραπείας, να διερευνήσει τις ενώσεις μεταξύ μεταβλητές σε κάθε ομάδα, και να μελετήσει την πιθανή συσχέτιση μεταξύ των χαρακτηριστικών εκκίνησης και απόκρισης, χρησιμοποιήσαμε παραμετρικές δοκιμές (έλεγχος τ ή ANOVA) ή ισοδύναμα μη παραμετρικά τεστ τους (U Mann-Whitney, Kruskall Wallis), όταν ομαλότητας δεν κατείχε . Η κανονικότητα των συνεχών μεταβλητών ελέγχθηκε με τη δοκιμασία Kolmogorov-Smirnov. Για να συγκρίνετε τις κατηγορικές μεταβλητές και τα ποσοστά ανταπόκρισης με 95% ΚΠ τους μεταξύ των ομάδων θεραπείας, θα χρησιμοποιηθεί είτε το ακριβές τεστ δύο όψεων του Fisher ή το Chi-square test.

Η σύνδεση των παραγόντων κινδύνου με το χρόνο, για να -event τελικά σημεία αναλύθηκε με τη δοκιμασία διπλής όψης logrank, και η μέθοδος Kaplan-Meier χρησιμοποιήθηκε για να σχεδιαστεί η αντίστοιχη χρόνου προς πρόοδο και την καμπύλες επιβίωσης. Μία μονοπαραγοντική ανάλυση παλινδρόμησης Cox, με αναλογίες κινδύνου και 95% τους ΠΙ χρησιμοποιήθηκε για να εκτιμηθεί η συσχέτιση μεταξύ των δυνητικών προγνωστικός παράγοντας και επιβίωση και ο χρόνος μέχρι την εξέλιξη. Οι παράγοντες αυτοί στη συνέχεια περιλαμβάνονται σε ένα πολυπαραγοντικό μοντέλο αναλογικού κινδύνου παλινδρόμησης Cox για να αξιολογηθεί η ανεξάρτητη σημασία της κάθε μεταβλητής για επιβίωση και ο χρόνος μέχρι την εξέλιξη της. Η δοκιμή αναλογία πιθανότητας χρησιμοποιήθηκε για την αξιολόγηση της καλής προσαρμογής και δοκιμασίας του Wald χρησιμοποιήθηκε για να εκτιμηθεί η σημασία του συντελεστή. Για τους δυνητικούς πολλαπλές συγκρίσεις, οι τιμές ρ διορθώθηκαν με τη διόρθωση Bonferroni.

Ογδόντα έξι από τους 111 ασθενείς χωρίς μεταλλάξεις του EGFR για τους οποίους η επαρκής ιστός του όγκου διαθέσιμη συμπεριλήφθηκαν σε μια διερευνητική υπο-ανάλυση της σχέσης μεταξύ BRCA1, RAP80 και έκφραση Abraxas. τεστ κατάταξης Spearman χρησιμοποιήθηκε για την αξιολόγηση της συσχέτισης μεταξύ BRCA1, RAP80 και έκφραση ABRAXAS mRNA.

Όλοι οι στατιστικοί υπολογισμοί έγιναν με το στατιστικό πακέτο λογισμικού SPSS, έκδοση 15.0 (SPSS Inc., Chicago, IL, USA) και S-PLUS 6.1. Δύο όψεων p-τιμές μικρότερες από 0,05 θεωρήθηκαν σημαντικές.

Υποστήριξη Πληροφορίες

S1 κειμένου.

Συμπληρωματικό κείμενο

doi: 10.1371 /journal.pone.0005133.s001

(0,04 MB DOC)

Πίνακα S1.

κλινικοπαθολογοανατομικές χαρακτηριστικά, τα επίπεδα της γονιδιακής έκφρασης, η κατάσταση μετάλλαξης του EGFR, και τα αποτελέσματα για όλους τους ασθενείς

doi: 10.1371 /journal.pone.0005133.s002

(0,07 MB XLS)

Πίνακας S2.

Τύποι μεταστάσεων

doi: 10.1371 /journal.pone.0005133.s003

(0,05 MB DOC)

Πίνακα S3.

Χαρακτηριστικά των 86 ασθενών στους οποίους σήμα RAP 80 και Abraxas αναλύθηκαν

doi: 10.1371 /journal.pone.0005133.s004

(0,07 MB DOC)

Πίνακας S4.

διάμεση επιβίωση ανάλογα με τα επίπεδα των γονιδίων BRCA1 και Abraxas

doi: 10.1371 /journal.pone.0005133.s005

(0,03 MB DOC)

Πίνακας S5.

Χρόνος έως την εξέλιξη σύμφωνα με τα επίπεδα των γονιδίων BRCA1 και Abraxas

doi: 10.1371 /journal.pone.0005133.s006

(0,03 MB DOC)

Πίνακας S6. μοντέλο

πολυμεταβλητών COX για την επιβίωση με BRCA1 και RAP 80 ως συνεχείς μεταβλητές

doi: 10.1371 /journal.pone.0005133.s007

(0,03 MB DOC)

Πίνακας S7. μοντέλο

πολυμεταβλητών COX για το χρόνο έως την εξέλιξη με BRCA1 και RAP 80 ως συνεχείς μεταβλητές

doi: 10.1371 /journal.pone.0005133.s008

(0,03 MB DOC)

Πίνακας S8.

Εκκινητές και ανιχνευτές που χρησιμοποιούνται στη γονιδιακή έκφραση αναλύσεις

doi: 10.1371 /journal.pone.0005133.s009

(0,04 MB DOC)

Εικόνα S1.

χρόνος έως την εξέλιξη σύμφωνα με την ομάδα θεραπείας. Χρόνος έως την εξέλιξη ήταν 13 μήνες στην ομάδα EGFR, 5 μήνες σε χαμηλές και στις ενδιάμεσες ομάδες BRCA 1, και 8 μήνες στην ομάδα υψηλού BRCA1 (βλέπε Πίνακα 2)

doi:. 10.1371 /journal.pone.0005133.s010

(8,92 MB ΔΕΘ)

Εικόνα S2.

Χρόνος έως την εξέλιξη για τους ασθενείς στην ομάδα χαμηλού BRCA1 σύμφωνα με RAP 80 επίπεδα έκφρασης. Χρόνος έως την εξέλιξη ήταν 14 μήνες για τους ασθενείς με χαμηλά RAP 80 επίπεδα, 4 μήνες για όσους με ενδιάμεσο RAP 80 επίπεδα και 6 μήνες για τα άτομα με υψηλά RAP 80 επίπεδα (βλέπε πίνακα 4)

doi:. 10.1371 /journal.pone .0005133.s011

(10.31 MB ΔΕΘ)

πρωτόκολλο S1.

Δίκη Πρωτόκολλο

doi: 10.1371 /journal.pone.0005133.s012

(1.12 MB PDF)

πρωτόκολλο S2.

You must be logged into post a comment.