Αφηρημένο

Σκοπός

Για την αξιολόγηση κλινικοπαθολογική και μοριακά χαρακτηριστικά των ασθενών με μεταστατικό καρκίνο του παχέος εντέρου (mCRC) και των αποτελεσμάτων τους σε δοκιμές πρώιμης φάσης χρησιμοποιώντας παράγοντες οδού στόχευση.

ασθενείς και Μέθοδοι

Αναλύσαμε τα χαρακτηριστικά των 238 ασθενών με mCRC που αναφέρεται στις δοκιμές φάσης 1 μονάδα στο MD Anderson Cancer Κέντρο.

KRAS

,

PIK3CA

και

BRAF

κατάσταση ελέγχθηκαν με τη χρήση της αλληλουχίας του DNA που βασίζεται στην PCR.

Αποτελέσματα

Πενήντα ένα τοις εκατό των ασθενών που έτρεφε

KRAS

μεταλλάξεις? 15% είχαν

PIK3CA

μεταλλάξεις. Στο μοντέλο πολυμεταβλητή παλινδρόμηση για κλινικά χαρακτηριστικά

KRAS

μεταλλάξεις συνδέονται με μια αυξημένη συχνότητα εμφάνισης του πνεύμονα και οστικές μεταστάσεις και μειωμένη συχνότητα εμφάνισης των επινεφριδίων μεταστάσεων?

PIK3CA

μεταλλάξεις οριακά συσχετίζονται με βλεννώδες όγκους (ρ = 0,05). Στην μονοπαραγοντική ανάλυση,

KRAS

και

PIK3CA

μεταλλάξεις συνδέονται στενά. στάδιο Σύνθετη Δούκα (p & lt? 0.0001) και

KRAS

μεταλλάξεις (p = 0.01) ήταν οι μόνες σημαντικές ανεξάρτητοι προγνωστικοί παράγοντες κακής επιβίωσης (αναλογικών κινδύνων κατά Cox μοντέλο). Οι ασθενείς με

PIK3CA

μεταλλάξεις είχε μια τάση προς μικρότερη επιβίωση χωρίς εξέλιξη όταν έλαβαν θεραπεία με αντι-EGFR θεραπείες (p = 0.07). Δεκαοκτώ από 78 εκτιμητέο ασθενείς (23%) που έλαβαν θεραπεία με αναστολείς άξονα PI3K /Akt /mTOR επιτευχθεί σταθερή νόσο [SD] ≥6 μήνες ή πλήρη ανταπόκριση /μερική ανταπόκριση (CR /PR), μόνο ένας εκ των οποίων ήταν στην υποομάδα (Ν = 15) με

PIK3CA

μεταλλάξεις, ίσως γιατί 10 από αυτούς τους 15 ασθενείς (67%) είχαν συνυπάρχουσες

KRAS

μεταλλάξεις. Δεν SD ≥6 μήνες /CR /PR παρατηρήθηκε σε 10 ασθενείς που έλαβαν θεραπεία με μιτογόνο ενεργοποίηση της πρωτεϊνικής κινάσης (ΜΑΡΚ) με στόχο οδός ναρκωτικών.

Συμπεράσματα

KRAS

και

PIK3CA

μεταλλάξεις συχνά συνυπάρχουν σε ασθενείς με καρκίνο του παχέος εντέρου, και συνδέονται με τα κλινικά χαρακτηριστικά και την έκβαση. αντίσταση Ξεπερνώντας μπορεί να απαιτήσει τη στόχευση και τις δύο οδούς

Παράθεση:. Garrido-Laguna I, το Χονγκ DS, Γιάνκου F, Nguyen LM, Falchook GS, Fu S, et al. (2012) KRASness και PIK3CAness σε ασθενείς με προχωρημένο καρκίνο του παχέος εντέρου: Αποτέλεσμα μετά από θεραπεία με Δοκιμές πρώιμης φάσης με αναστολείς Στοχευμένες Pathway. PLoS ONE 7 (5): e38033. doi: 10.1371 /journal.pone.0038033

Επιμέλεια: Rui Manuel Reis, Πανεπιστήμιο de Minho, Πορτογαλία

Ελήφθη: 30 Δεκεμβρίου, 2011? Αποδεκτές: 30 Απριλίου 2012? Δημοσιεύθηκε: May 31, 2012 |

Copyright: © 2012 Garrido-Laguna et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Αυτό το έργο υποστηρίχθηκε από Grant Αριθμός RR024148 από το Εθνικό Κέντρο Έρευνας Πόρων, ένα συστατικό του ΝΙΗ χάρτη πορείας για την Ιατρική Έρευνα. Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

υπάρχει αυξανόμενη υποστήριξη για την ιδέα ότι οι συγκεκριμένες μεταλλάξεις προβλέψει τις κλινικές εκδηλώσεις και την ανταπόκριση στη θεραπεία των ασθενών με καρκίνο. Σε καρκίνο του παχέος εντέρου,

RAS

μεταλλάξεις έχουν λάβει τοποθέτησης έλεγχο. Ειδικότερα, η ενεργοποίηση μεταλλάξεων στο

KRAS

οδήγησης αντίσταση σε αντι-EGFR θεραπείες σε ασθενείς με μεταστατική νόσο. [1], [2] Ωστόσο, ένα υποσύνολο των ατόμων με

KRAS

μεταλλάξεις (p.G13D) θα μπορούσε να αντλήσει όφελος από την αντι-EGFR θεραπείες. [3] Ο ρόλος του

PIK3CA

μεταλλάξεις στην πρόβλεψη αντίσταση σε αντι-EGFR θεραπείες έχει συζητηθεί, με αρχικές μελέτες οι οποίες καταλήγουν σε αντίθετα συμπεράσματα. [4], [5] Πρόσφατα, μια πολυκεντρική αναδρομική μελέτη έδειξε ότι

PIK3CA

μεταλλάξεις στο εξόνιο 20 συμμετείχαν σε αντίσταση σε αντι-EGFR θεραπείες, ενώ οι μεταλλάξεις στο εξόνιο 9 δεν ήταν. [6] Τέλος, η ομάδα μας απέδειξε ότι η ενεργοποίηση μεταλλάξεων στο

PIK3CA

μπορεί να προβλέψουν την ανταπόκριση στην αναστολείς /Akt /mTOR PI3K. [7]

Εδώ, θα επανεξετάσει τις κλινικές και τα μοριακά χαρακτηριστικά των ασθενών με μεταστατικό καρκίνο του παχέος εντέρου (mCRC), οι οποίοι παραπέμφθηκαν μας μονάδα κλινικές δοκιμές. Ο σκοπός της μελέτης ήταν να προσδιοριστούν τα κλινικά χαρακτηριστικά που σχετίζονται με το

KRAS

και

PIK3CA

μεταλλάξεις, και τα αποτελέσματα σε πρώιμες κλινικές δοκιμές του PI3K /Akt /mTOR και αναστολείς ΜΑΡΚ.

Αποτελέσματα

τα χαρακτηριστικά των ασθενών

ασθενών και του όγκου κλινικοπαθολογική χαρακτηριστικά για τους ασθενείς 238 της μελέτης παρατίθενται στον πίνακα 1. Πενήντα-τέσσερα τοις εκατό των ασθενών ήταν άνδρες. Εβδομήντα τοις εκατό των ασθενών ήταν ηλικίας άνω των πενήντα. Οι περισσότεροι ασθενείς (69%) ήταν Καυκάσιους. Οι πιο κοινές θέσεις μεταστάσεων ήταν ήπαρ, λεμφαδένες και στον πνεύμονα, που βρέθηκαν σε 83%, 75% και 72% των ασθενών, αντιστοίχως. Όλα τα 238 ασθενείς ελέγχθηκαν για

KRAS

κατάσταση. Εκατόν-και-είκοσι δύο ασθενείς (51%) είχαν

KRAS

μεταλλάξεις. Από τους 168 ασθενείς που εξετάστηκαν για

PIK3CA

μεταλλάξεις, 25 (15%) είχαν μια μετάλλαξη. Από τους 173 ασθενείς που εξετάστηκαν για

BRAF

μεταλλάξεις, 11 (6%) είχαν μια μετάλλαξη.

Η

Συχνότητα

KRAS

Μετάλλαξη υπότυποι

Στη συνέχεια, υπολογίζεται η επίπτωση των διαφόρων τύπων

KRAS

μεταλλάξεις. Η τοποθεσία του

KRAS

μεταλλάξεις ήταν διαθέσιμα σε 108 από 122 ασθενείς. Η πιο συχνή

KRAS

μετάλλαξη ήταν p.G12D (31 ασθενείς [29%]), ακολουθούμενη από p.G12V (23 ασθενείς [21%]), p.G12A (14 ασθενείς [13%]) και p.G13D (13 ασθενείς [12%]). Άλλες μεταλλάξεις συνέβησαν στα ακόλουθα χαμηλές συχνότητες: p.G12C (11 ασθενείς [10%]), p.G12S (8 ασθενείς [7%]), p.Q61H (5 ασθενείς [5%]) και p.G12R, σ .G13C και p.G12F, ένας ασθενής κάθε (1%).

Αξιολόγηση των «KRASness»

κλινικά χαρακτηριστικά.

Οι ασθενείς με

KRAS

μεταλλάξεις (Ν = 122) είχαν υψηλότερη συχνότητα εμφάνισης των πνευμόνων (79% [96/122] έναντι 66% [76/116], p = 0.03) και οστικές μεταστάσεις (20% [24/122] έναντι 9% [ ,,,0],11/116], p = 0,03) σε σύγκριση με εκείνους με άγριου τύπου

KRAS

(Ν = 116).

για να εκτιμηθεί περαιτέρω η σχέση μεταξύ

KRAS

μεταλλάξεις και διαφορετικά κλινικά χαρακτηριστικά σε ασθενείς με καρκίνο του παχέος εντέρου, έχουμε τοποθετηθεί μονοπαραγοντική και πολυπαραγοντική λογιστική μοντέλα παλινδρόμησης. Οι μονομεταβλητά μοντέλα υποδηλώνουν ότι ασθενείς με

KRAS

μεταλλάξεις είχαν μεγαλύτερη πιθανότητα να έχουν πνεύμονα (ρ = 0,02) και οστικές μεταστάσεις (ρ = 0,03) (Πίνακας 2). Έχουμε τοποθετηθεί ένα πολυπαραγοντικό μοντέλο, συμπεριλαμβανομένων αυτών των μεταβλητών με μονοπαραγοντική τιμές p & lt? 0.5 στο πλήρες μοντέλο. Μετά από πίσω επιλογή μοντέλου, το πολυπαραγοντικό μοντέλο έδειξε ότι η αυξημένη πνεύμονα και οστικές μεταστάσεις και μειώθηκαν οι επινεφριδίων μεταστάσεις συνδέονται σημαντικά με

KRAS

μεταλλάξεις (Πίνακας 2)

Η

μοριακά χαρακτηριστικά.

εκατόν-και-εξήντα οκτώ ασθενείς είχαν τον έλεγχο τόσο για

KRAS

και

PIK3CA

μεταλλάξεις. Το ήμισυ των ασθενών που ελέγχθηκαν (Ν = 84) είχαν μια

KRAS

μετάλλαξη και το ένα ήμισυ (Ν = 84) δεν το έκαναν. Σε σύγκριση με το

KRAS

ασθενείς άγριου τύπου, οι ασθενείς που φέρουν

KRAS

μεταλλάξεις είχαν συχνότερα

PIK3CA

μεταλλάξεις (21% [18/84] έναντι 8% [7 /84], ρ = 0.03). Όπως έχει ήδη αναφερθεί,

BRAF

και

KRAS

μεταλλάξεις ήταν αμοιβαία αποκλειόμενα (173 ασθενείς ελέγχονται και για τα δύο) (Πίνακας 1). [6]

PIK3CA

μεταλλάξεων συσχετίστηκε σημαντικά με τον

KRAS

μεταλλάξεις σε μονοδιάστατες μοντέλα (p = 0.03). Ενδιαφέροντος, όταν εισήχθη μοριακά χαρακτηριστικά στο μοντέλο κλινική πολυμεταβλητή (δηλαδή,

PIK3CA

κατάστασης), η μόνη μεταβλητή που σχετίζεται με το

KRAS

μεταλλάξεις ήταν

PIK3CA

(όχι δεδομένα φαίνεται).

KRAS

μεταλλάξεις που συνδέονται με μια μικρότερη OS

Θα διεξαχθεί μια μονοπαραγοντική ανάλυση επιβίωσης για τα διάφορα χαρακτηριστικά του ασθενούς, όπως η ηλικία, το φύλο, τη φυλή, τον τύπο του όγκου (βλεννώδες έναντι όχι), το στάδιο Δούκα κατά τη διάγνωση, το site του πρωτοπαθούς όγκου,

KRAS

,

BRAF

και

PIK3CA

μεταλλάξεις. Στην πολυπαραγοντική ανάλυση, το στάδιο Δούκα κατά τη διάγνωση και

KRAS

κατάστασης ήταν σημαντική πρόβλεψης της επιβίωσης (

KRAS

HR 1.71, 95% CI 1,11 – 2,62) (Πίνακας 3). Η διάμεση OS από το χρόνο της διάγνωσης σε ασθενείς με

KRAS

μεταλλάξεις ήταν 57,5 ​​μήνες (95% CI: 50,0 έως 64,8 μήνες), ενώ για

KRAS

ασθενείς άγριου τύπου, η διάμεση OS ήταν 89,5 μήνες (95% CI 63,5 έως 120,1 μήνες) (log-rank p = 0,007) (Εικόνα 1).

Οι ασθενείς με

KRAS

άγριου τύπου mCRC είχε πλέον OS σε σύγκριση με το

KRAS

μεταλλαγμένο ασθενείς (τσεκάρωντας σήματα αντιπροσωπεύουν ασθενείς ακόμα ζωντανός κατά τη στιγμή της τελευταίας παρακολούθησης).

Η

επίσης, αξιολογείται κατά πόσον διαφορετικοί τύποι

KRAS

μεταλλάξεις ήταν σχετίζονται με την επιβίωση. Εμείς δεν βρήκε διαφορές στο OS σε διαφορετικούς τύπους

KRAS

μεταλλάξεις. Για παράδειγμα, η διάμεση OS για τους ασθενείς με ένα κωδικόνιο 12 μετάλλαξη ήταν 57,5 ​​μήνες (95% CI 50 – 62,2 μήνες) και η διάμεση OS για τους ασθενείς με ένα κωδικόνιο 13 μετάλλαξη 56,8 μήνες (95% CI 28.8- δεν μπορεί να εκτιμηθεί) (log -rank p-value = 0,52). Εκτιμήσαμε περαιτέρω OS, όπως ορίζεται από τον ειδικό τύπο του αμινο εμπλέκονται στις διαφορετικές μεταλλάξεις οξύ. Για την ανάλυση αυτή κρατήσαμε μόνο υποομάδες με τουλάχιστον 10 παρατηρήσεις (Πίνακας S1). Δεν υπήρχε διαφορά στο λειτουργικό σύστημα. Ωστόσο, ο αριθμός των ασθενών σε κάθε ομάδα υπότυπο ήταν μικρό, που κυμαίνονται από 11 έως 31, αποκλείοντας οριστικά συμπεράσματα.

Αξιολόγηση των «PIK3CAness»

Κλινικά χαρακτηριστικά.

Για να αξιολογηθεί η συσχέτιση μεταξύ

PIK3CA

μεταλλάξεις και διαφορετικά κλινικά χαρακτηριστικά σε ασθενείς με καρκίνο του παχέος εντέρου, προσπαθήσαμε να χωρέσει μονομεταβλητών και πολλαπλά μοντέλα λογιστικής παλινδρόμησης. Η μονοπαραγοντική μοντέλο πρότεινε ότι οι ασθενείς με

PIK3CA

μεταλλάξεις είχαν πιο συχνά βλεννώδεις όγκοι (p = 0.04). Είχαν επίσης μια τάση να έχουν λιγότερο συχνή ηπατικές μεταστάσεις συγκριτικά με τους ασθενείς με

PIK3CA

όγκους φυσικού τύπου (OR 0.40, ρ = 0.07) (Πίνακας 4). Στην πολυπαραγοντική ανάλυση, βλεννώδες όγκοι ήταν οριακά σημαντική (p-value = 0,05), με τους ασθενείς που έχουν βλεννώδεις όγκοι πιο συχνά να έχουν

PIK3CA

μεταλλάξεις (OR 2,61? 95% CI 0,99 – 6,87). Επιπλέον, η ηλικία έδειξε μια τάση εβδομάδα (p-value = 0,15), με ηλικιωμένους ασθενείς με μικρότερη συχνότητα που έχει

PIK3CA

μεταλλάξεις (OR 0,52? 95% CI 0,22 – 1,26). Όπως αναφέρθηκε προηγουμένως,

PIK3CA

κατάσταση δεν ήταν μια ανεξάρτητη μεταβλητή επιβίωση πρόβλεψη στην πολυπαραγοντική ανάλυση.

Η

μοριακά χαρακτηριστικά.

168 (71%) των ασθενών που ελέγχθηκαν για

PIK3CA

μεταλλάξεις. Από τους 143 ασθενείς με άγριου τύπου

PIK3CA

, 66 (46%) είχαν

KRAS

μεταλλάξεις. Από τους 25 (15%) ασθενείς με

PIK3CA

μεταλλάξεις, 18 (72%) είχαν

KRAS

μεταλλάξεις (p = 0.03) (Πίνακας 1). Από τους 147 ασθενείς που εξετάστηκαν τόσο για

PIK3CA

και

BRAF

, ένας ασθενής (0,7%) είχαν και τις δύο μεταλλάξεις. Μια πρόσφατη έκθεση έδειξε ότι

PIK3CA

μεταλλάξεις στο εξόνιο 20 συμμετείχαν στην αντίσταση σε αντι-EGFR θεραπείες, ενώ οι μεταλλάξεις στο εξόνιο 9 δεν ήταν. [6] Περαιτέρω, αν και

KRAS

μεταλλάξεις πιστεύεται να προβλέψει την αντίσταση στη θεραπεία με αναστολείς του EGFR, ένα υποσύνολο των φυσικών προσώπων

KRAS

μεταλλάξεις p.G13D μπορεί ακόμα να επωφεληθούν από αντι-EGFR θεραπείες. [3] Εμείς, ως εκ τούτου, να αναλυθούν συνυπάρχουσα

PIK3CA

μεταλλάξεις (εξόνιο 9 και 20), σε ασθενείς με

KRAS

μεταλλάξεις. Βρήκαμε ότι οι ασθενείς με

KRAS

μεταλλάξεις p.G13D είχαν τη χαμηλότερη συχνότητα εμφάνισης

PIK3CA

μεταλλάξεις (10%) σε σύγκριση με τους ασθενείς με

KRAS

p.G12A (36% είχε

PI3KCA

μεταλλάξεις), p.G12C (33%), p.G12D (22%) και p.G12V (12%). Επιπλέον, κανένας από τους εννέα ασθενείς με

KRAS

μεταλλάξεις p.G13D είχε μια

PIK3CA

μετάλλαξη στο εξόνιο 20, ενώ

PIK3CA

μεταλλάξεις στο εξόνιο 20 βρέθηκαν σε όλα τα άλλα τύπους

KRAS

μεταλλάξεις (Πίνακας S2). Ωστόσο, ο μικρός αριθμός των ασθενών που αποκλείει την κατάρτιση κάθε στατιστικώς σημαντικά συμπεράσματα.

PFS για αντι-EGFR θεραπείας.

Αναλύσαμε PFS σε ασθενείς που έλαβαν θεραπεία με αντι-EGFR θεραπείες (cetuximab ή panitumumab). Οι ασθενείς με

KRAS

μεταλλαγμένο mCRC που έλαβαν θεραπεία με αντι-EGFR θεραπείες (Ν = 24) είχαν μικρότερη PFS σε σύγκριση με τους ασθενείς με άγριου τύπου

KRAS

(Ν = 98) (15 έναντι 22 εβδομάδων , ρ = 0,01). Μέσα στην ομάδα των ασθενών που εξετάζονται για

PIK3CA

μεταλλάξεις που έλαβαν αντι-EGFR θεραπείες, οι ασθενείς με

PIK3CA

μεταλλάξεις (Ν = 9) είχε μια τάση προς μια μικρότερη PFS από

PIK3CA

ασθενών άγριου τύπου (Ν = 82) (17 έναντι 22 εβδομάδων, p = 0,07) (Σχήμα S1)

Ανταπόκριση σε αναστολείς PI3K /Akt /mTOR ή Αναστολείς MAP κινάσης:. αντίκτυπος της συνύπαρξης του

PIK3CA

και

KRAS

μεταλλάξεις

Ογδόντα ασθενείς υποβλήθηκαν σε θεραπεία για 1 πρωτόκολλα φάσης που περιέχει αναστολείς /mTOR PI3K /Akt (NCT00454090, NCT00554268, NCT00610493, NCT00687622, ​​NCT00726583, NCT00731263 , NCT00756847, NCT00761644, NCT00770731, NCT00880321, NCT00920257, NCT00940381, NCT00972686, NCT01054313, NCT01072175, NCT01087554, NCT01087983, NCT01138085, NCT01155453, NCT01263145) (www.clinicaltrials.gov). Εβδομήντα οκτώ ασθενείς ήταν αξιολογηθούν ως προς την ανταπόκριση κατά RECIST (Σχήμα 2). Από αυτούς τους 78 ασθενείς, οι 43 είχαν μια

KRAS

μετάλλαξη σε όγκους τους και 35 ήταν

KRAS

άγριου τύπου. Από τους 43 ασθενείς με

KRAS

μεταλλαγμένου νόσο, 9 (21%) επιτυγχάνεται SD ≥6 μήνες /CR /PR? από τους 33 ασθενείς με

KRAS

άγριου τύπου, 9 (27%) είχαν SD ≥6 μήνες /CR /PR (ακριβής δοκιμασία Fisher ρ = 0,59).

Η

Δεκαπέντε ασθενείς με

PIK3CA

μεταλλάξεις υποβλήθηκαν σε θεραπεία με /αναστολείς Akt /mTOR PI3K, και ένα (7%) είχαν SD ≥6 μήνες /CR /PR? 10 από αυτούς τους ασθενείς (67%) είχαν μια ταυτόχρονη

KRAS

μετάλλαξη και κανένας δεν είχε μια

BRAF

μετάλλαξη. Εξήντα τρεις ασθενείς με άγριου τύπου ή άγνωστη

PIK3CA

κατάσταση υποβλήθηκαν σε θεραπεία με αναστολείς PI3K /Akt /mTOR, και 17 (27%) είχαν SD ≥6 μήνες /CR /PR (ακριβής δοκιμασία του Fisher για SD ≥ 6 μήνες /CR /PR σε

PIK3CA

μεταλλαγμένο εναντίον άγριου τύπου p = 0,17)? 33 από αυτούς τους ασθενείς (52%) είχαν μια

KRAS

μετάλλαξη.

Ένα σύνολο των 10 ασθενών που υποβλήθηκαν σε θεραπεία με αναστολείς της ΜΑΡΚ μονοπάτι (γενικά αναστολείς BRAF ή ΜΕΚ). Από αυτούς τους ασθενείς, τέσσερις είχαν

BRAF

και πέντε είχαν

KRAS

μεταλλάξεις. Κανένας δεν είχε

PIK3CA

μεταλλάξεις. Κανένας από αυτούς τους ασθενείς είχαν SD ≥6 μήνες /CR /PR (εικόνα 2).

Συζήτηση

Σε 238 ασθενείς με καρκίνο του παχέος εντέρου που αναφέρεται στην κλινική μονάδα δοκιμών μας, διαπιστώσαμε ότι 122 (51 %) είχαν

KRAS

μεταλλάξεις. Η πιο συχνή

KRAS

υποτύπους μετάλλαξη ήταν p.G12D (31 ασθενείς [25%]), ακολουθούμενη από p.G12V (23 ασθενείς [19%]), p.G12A (14 ασθενείς [11%]) και p.G13D (13 ασθενείς [11%]). Αυτή η συχνότητα εμφάνισης

KRAS

υποτύπων ήταν σύμφωνο με αυτό που αναφέρεται στον κατάλογο των σωματικών μεταλλάξεων στον Καρκίνο (COSMIC) βάση δεδομένων (www.sanger.ac.uk/genetics/CGP/cosmic/accessed στις 17 Ιουνίου

th, 2011). Στην πολυπαραγοντική ανάλυση των κλινικών χαρακτηριστικών,

KRAS

μεταλλάξεις που σχετίζονται με αυξημένη συχνότητα εμφάνισης του πνεύμονα και οστικές μεταστάσεις (p = 0,05 για κάθε μεταβλητή) και μειωμένη συχνότητα εμφάνισης των επινεφριδίων μεταστάσεων (p = 0,04) σε σύγκριση με το

KRAS

ασθενείς άγριου τύπου. Προηγούμενες μελέτες βρήκαν μια μεγαλύτερη πιθανότητα μεταστάσεων πνεύμονα σε ασθενείς με mCRC με

KRAS

μεταλλάξεις. [8], [9] Στο μοριακό επίπεδο, οι ασθενείς που φέρουν

KRAS

μεταλλάξεις είχαν πιο συχνά ταυτόχρονη

PIK3CA

μεταλλάξεις σε σύγκριση με άτομα με άγριου τύπου

KRAS

(21 % έναντι 8%, [p = 0,03]). Επιπλέον, 72% των ασθενών με

PIK3CA

μεταλλάξεις είχε επίσης ένα

KRAS

μετάλλαξη, ενώ μόνο το 46% των ασθενών με άγριου τύπου

PIK3CA

είχε ένα

KRAS

μετάλλαξη (p = 0.03).

PIK3CA

μεταλλάξεων συσχετίστηκε σημαντικά με τον

KRAS

μεταλλάξεις σε δύο μονοπαραγοντική και πολυπαραγοντική μοντέλα.

Η διάμεση OS από το χρόνο της διάγνωσης σε ασθενείς με

KRAS

μεταλλάξεις ήταν μικρότερη από ό, τι για εκείνους με άγριου τύπου

KRAS

(57,5 έναντι 89,5 μήνες? p = 0,007) (Εικόνα 1). Επιπλέον, στην πολυπαραγοντική ανάλυση, το στάδιο Δούκα κατά τη διάγνωση και

KRAS

κατάστασης ήταν σημαντική ανεξάρτητοι προγνωστικοί παράγοντες της επιβίωσης.

BRAF

μεταλλάξεις έχουν πρόσφατα βρεθεί να είναι προγνωστική για μικρότερες OS σε ασθενείς με mCRC. [10], [11] Ωστόσο, ο ρόλος του

KRAS

κατάσταση ως προγνωστικός δείκτης του OS είναι αμφιλεγόμενη. Μια προηγούμενη αναδρομική μελέτη, συμπεριλαμβανομένων 3.439 ασθενών σε πολυπαραγοντική ανάλυση επιβίωσης έδειξε ότι μόνο μεταλλάξεις p.G12V ήταν προγνωστική της κακής επιβίωσης. Είναι ενδιαφέρον ότι, η συχνότητα εμφάνισης μεταλλάξεων p.G12V σε αυτή τη μελέτη ήταν σημαντικά χαμηλότερη από αυτή που αναφέρεται στην κοσμική βάση δεδομένων (8% έναντι 23%). Μια πρόσφατη μελέτη έδειξε αυξημένη OS σε ασθενείς με

KRAS

άγριου τύπου mCRC που έλαβαν θεραπεία με την καλύτερη υποστηρικτική φροντίδα σε σύγκριση με τους ασθενείς με

KRAS

μεταλλαγμένου mCRC. [1] Ωστόσο, μετά προχωρά σε υποστηρικτική φροντίδα, οι ασθενείς με

KRAS

άγριου τύπου είχαν τη δυνατότητα να περάσουν σε panitumumab? Ως εκ τούτου, το αποτέλεσμα της θεραπείας δεν μπορεί να αποκλειστεί εντελώς. Δεν είναι σαφές γιατί οι διαφορετικές μελέτες δείχνουν αντικρουόμενα στοιχεία σχετικά με την προγνωστική επίδραση του

KRAS

, αν και είναι κατανοητό ότι αυτό σχετίζεται με τη θεραπεία δίνεται και /ή άλλους παράγοντες επιλογής.

Στην μονοπαραγοντική ανάλυση, ασθενείς με

PIK3CA

μεταλλάξεις είχαν συχνότερα βλεννώδεις όγκους (ρ = 0,04), και έτειναν να έχουν λιγότερο συχνά ηπατικών μεταστάσεων σε σύγκριση με ασθενείς με

PIK3CA

όγκους άγριου τύπου. Μόνο η συνεργασία με βλεννώδες όγκου ήταν (οριακά) σημαντικές στην πολυμεταβλητή ανάλυση (p = 0.05).

PIK3CA

κατάσταση δεν ήταν μια ανεξάρτητη μεταβλητή επιβίωση πρόβλεψη στην πολυπαραγοντική ανάλυση. Σε μοριακό επίπεδο, το 72% των ασθενών με

PIK3CA

μεταλλάξεις είχαν συνυπάρχουσες

KRAS

μεταλλάξεις. Πιθανού ενδιαφέροντος, οι ασθενείς με μεταλλαγμένο

PIK3CA

είχε μια τάση προς μια μικρότερη PFS όταν έλαβαν θεραπεία με αντι-EGFR θεραπείες από αυτούς με άγριου τύπου

PIK3CA

(διάμεσος = 22 εβδομάδες έναντι 17 εβδομάδων , ρ = 0.07). Άλλες εκθέσεις δείχνουν επίσης ότι οι ασθενείς με

PIK3CA

μεταλλάξεις είναι λιγότερο ευαίσθητες σε αντι-EGFR θεραπείες. [4] Ωστόσο, μια μεγαλύτερη πολυκεντρική ανάλυση πρόσφατα διαπίστωσε ότι μόνο το

PIK3CA

μεταλλάξεις στο εξόνιο 20 συσχετίστηκαν με χειρότερη έκβαση μετά από τη θεραπεία με cetuximab. [6] Παρά το γεγονός ότι πολλές γραμμές των στοιχείων δείχνουν ότι οι ασθενείς με καρκίνο του παχέος εντέρου και

KRAS

μεταλλάξεις κάνουν καλά με αναστολείς του EGFR, τα τελευταία στοιχεία δείχνουν ότι τα άτομα με

KRAS

p.G13D μετάλλαξη μπορεί να επωφεληθεί από EGFR αναστολείς. [3] Εμείς, ως εκ τούτου, να αναλυθούν οι ασθενείς με p.G13D

KRAS

μεταλλάξεις για το εξόνιο 20

PIK3CA

μεταλλάξεις και βρήκε κανένα, ενώ αυτές οι μεταλλάξεις βρέθηκαν σε άλλα

KRAS

μεταλλαγμένο υποτύπους. Ωστόσο, ο μικρός αριθμός των ασθενών που αξιολογήθηκαν αποκλείει οριστικά συμπεράσματα. Μπορεί να απαιτείται για την αξιολόγηση, σε προοπτικές μελέτες, έστω και συνύπαρξη των εξόνιο 20 μεταλλαγμένων

PIK3CA

σε ορισμένους υποτύπους του

KRAS

μεταλλαγμένο ασθένεια θα μπορούσε να συμβάλει στην αντίσταση αναστολέας του EGFR.

Ογδόντα ασθενείς που υποβλήθηκαν σε θεραπεία σε συνδυασμό με πρωτόκολλα που περιέχουν αναστολείς PI3K /AKT /mTOR από τους οποίους 78 (98%) ήταν εκτιμητέο. 23% επιτυγχάνεται SD ≥6 μήνες /CR /PR. Δεν υπήρχε σημαντική διαφορά στο ποσοστό της SD ≥6 μήνες /CR /PR και μεταξύ αυτών με άγριου τύπου ή μεταλλαγμένο

KRAS

. Ενδιαφέροντος, μόνο 1 ασθενής με

PIK3CA

μετάλλαξη επιτευχθεί SD ≥6 μήνες /CR /PR όταν έλαβαν θεραπεία με μία PI3K /Akt αναστολέα /mTOR. Οι περισσότεροι από αυτούς τους ασθενείς (67%) είχαν συνυπάρχουσα

KRAS

μεταλλάξεις, οι οποίες μπορεί να εξηγήσει την αντοχή τους. Πράγματι, η ενεργοποίηση της οδού ΜΑΡΚ έχει πρόσφατα προταθεί ως μηχανισμός αντίστασης στους αναστολείς ΡΙ3Κ. [12] Ακόμη και έτσι, μπορεί να είναι ενδιαφέρον το γεγονός ότι μεταξύ των 13 ασθενών που είχαν κάποιο είδος της μείωσης του όγκου, 7 είχαν

KRAS

μετάλλαξη. Το τελευταίο δείχνει ότι αν και οι ρυθμοί της SD ≥6 μήνες /CR /PR ήταν χαμηλά, και οι ασθενείς με συνυπάρχουσα

KRAS

και

PIK3CA

μεταλλάξεις δεν απάντησε, η παρουσία ενός

KRAS

μετάλλαξη από μόνη της δεν αποτελεί απόλυτη ένδειξη πλήρους αντίστασης στην //mTOR θεραπείας με αναστολέα που βασίζεται PI3K Akt. Έχουμε αναφερθεί πρόσφατα ότι η συνύπαρξη των

PIK3CA

και

KRAS

μεταλλάξεις δεν ήταν προγνωστική της αντίστασης στην PI3K /Akt /mTOR σε ασθενείς με καρκίνο των ωοθηκών. [13] Βέβαια, το πλαίσιο νόσος τύπου παίζει ένα ρόλο και πρόσθετες μεταλλάξεις που δεν περιλαμβάνονται στην παρούσα ανάλυση μπορεί να επηρεάσουν την απόκριση σε αυτές τις θεραπείες. Μια πρόσφατη εργασία έχει δείξει ότι η ενεργοποίηση ενός πολύπλοκου δικτύου ανάδρασης βρόχους μπορεί για παράδειγμα να εξηγήσει αντίσταση σε αναστολείς BRAF σε ασθενείς με καρκίνο του παχέος εντέρου με

BRAF

μεταλλάξεις. [14]

Απροσδόκητα, το 27% των ασθενών με άγριου τύπου ή άγνωστη

PIK3CA

κατάσταση αντιμετωπίζεται με PI3K /Akt αναστολέα /mTOR επιτευχθεί SD ≥6 μήνες /CR /PR (p = 0,09). Είναι πιθανό ότι μια μοριακή ανωμαλία στον /μονοπατιού PI3K /Akt mTOR υπήρχαν σε αυτούς τους ασθενείς, αλλά δεν αναγνωρίστηκε, και ότι μια τέτοια εκτροπή δεν μπορεί να έχει την ίδια τάση να συνυπάρχει με

KRAS

ή

BRAF

μεταλλάξεις. Πράγματι, η απώλεια της έκφρασης ΡΤΕΝ, τα οποία συχνά υποδεικνύει μία

ΡΤΕΝ

μετάλλαξη, έχει αναφερθεί στο 40% των ασθενών με μεταστατικό ορθοκολικό καρκίνο. [15]

Ένα σύνολο 10 ασθενών (εννέα από τους οποίους είχαν

KRAS

ή

BRAF

μεταλλάξεις και κανένας από τους οποίους είχαν

PIK3CA

μεταλλάξεις) ήταν αγωγή με αναστολείς της ΜΑΡΚ μονοπάτι (γενικά αναστολείς BRAF ή ΜΕΚ). Παρά το γεγονός ότι ο αριθμός των ασθενών είναι μικρό, κανένας επιτευχθεί SD ≥6 μήνες /CR /PR.

Η δουλειά μας έχει αρκετούς περιορισμούς. Κατ ‘αρχάς, αυτό είναι μια αναδρομική μελέτη σε ένα ενιαίο φορέα με ένα σχετικά μικρό αριθμό ασθενών. Δεύτερον, δεν θα μπορούσαμε να επικυρώσει ποσοστό απόκρισης σε αντι-EGFR θεραπείες, όπως αυτές οι πληροφορίες δεν ήταν διαθέσιμες για πολλούς από τους ασθενείς που υποβλήθηκαν σε θεραπεία σε ιδρύματα, εκτός από MD Anderson πριν να αναφέρεται στην μονάδα μας? ως εκ τούτου, η μόνη διαθέσιμη κλινική έκβαση για αυτούς τους ασθενείς ήταν PFS. Τρίτον, όλες οι αναλύσεις μεταλλάξεων δεν θα μπορούσε να ολοκληρωθεί για όλους τους ασθενείς που συμπεριλήφθηκαν στη μελέτη, λόγω των περιορισμένων ποσοτήτων των διαθέσιμων ιστών.

Εν κατακλείδι, θα δείξουμε ότι

KRAS

και

PIK3CA

μεταλλάξεις συνδέονται συχνά σε ασθενείς με καρκίνο του παχέος εντέρου. Στο πλαίσιο της πρώιμες κλινικές δοκιμές, τα φάρμακα που στοχεύουν στην ΡΙ3Κ /Akt /mTOR μονοπάτι είχε περιορισμένη δραστικότητα σε αυτούς τους ασθενείς, ακόμη και με την παρουσία του

PIK3CA

μεταλλάξεις, πιθανώς λόγω της συχνής συνύπαρξης ενεργοποίηση μεταλλάξεων στο ΜΑΡΚ μονοπάτι.

Μέθοδοι

ασθενείς

αναδρομικά τα κλινικοπαθολογική χαρακτηριστικά και κλινικές εκβάσεις των 238 διαδοχικών ασθενών με mCRC που παρατηρήθηκαν στη Φάση 1 Clinic (κλινική Κέντρο Στοχευμένες θεραπεία) στο Πανεπιστήμιο του Τέξας MD Anderson Κέντρο Καρκίνου αρχίζει τον Οκτώβριο του 2008, και για τους οποίους

KRAS

κατάσταση ήταν γνωστή. Τα δεδομένα συλλέχθηκαν από μεταγραφεί σημειώσεις και αναφορές ακτινολογίας στην ηλεκτρονική βάση δεδομένων των ασθενών αυτών. Οι θέσεις της μεταστατικής νόσου συλλέχθηκαν από την τελευταία διαθέσιμη έκθεση ακτινολογίας για κάθε ασθενή. Παθολογία εξετάστηκε από παθολόγο MD Anderson σε όλες τις περιπτώσεις. Το Κέντρο Καρκίνου Διοικητικό κριτική MD Anderson Θεσμικών έχει εγκρίνει τη μελέτη. Γραπτή συγκατάθεση δόθηκε από τους ασθενείς για τις πληροφορίες τους να αποθηκεύονται στη βάση δεδομένων του νοσοκομείου και να χρησιμοποιηθούν για την έρευνα.

KRAS, BRAF, PIK3CA

Μετάλλαξη Δοκιμές

δοκιμή μετάλλαξης γίνει στο Κλινικό Εργαστήριο βελτίωσης Τροποποίηση-πιστοποιημένα Διαγνωστικό Εργαστήριο Μοριακής του Τομέα Παθολογίας και Εργαστηριακής Ιατρικής στο MD Anderson. DNA εκχυλίστηκε από μικρο-ανατομή εμπεδωθεί με παραφίνη όγκου και αναλύεται με μια αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης (PCR) μέθοδο έδρα της αλληλουχίας του DNA για να εξετάσει κωδικόνια 12, 13 και 61 του

KRAS

πρωτο-ογκογονίδιο. Η ευαισθησία της ανίχνευσης του προσδιορισμού αυτού είναι περίπου 1 στα 10 κύτταρα που φέρει τη μετάλλαξη στην μικροδιατομή περιοχή. Όποτε είναι δυνατόν, η ανάλυση έγινε για

PIK3CA

μεταλλάξεις στα κωδικόνια [c] 532 έως 554 της εξόνιο 9 (έλικας) και c1011-1062 της εξώνιο 20 (περιοχή κινάσης) και

BRAF

C595 -600 μεταλλάξεις του εξονίου 15 με Pyrosequencing όπως περιγράφηκε προηγουμένως. [16]

Στατιστικές Μέθοδοι

Η στατιστική ανάλυση έγινε και επικυρώνεται από στατιστικολόγο μας (XW). Τα χαρακτηριστικά των ασθενών συνοψίζονται χρησιμοποιώντας περιγραφική στατιστική. Η συσχέτιση μεταξύ

KRAS

ή

PIK3CA

κατάσταση μετάλλαξης και των χαρακτηριστικών των ασθενών αξιολογήθηκε χρησιμοποιώντας το ακριβές τεστ του Fisher. Συνολική επιβίωση (OS) ορίζεται ως το χρονικό διάστημα μεταξύ της ημερομηνίας της διάγνωσης και θανάτου. Οι ασθενείς που ήταν ζωντανοί περικόπηκαν την τελευταία ημερομηνία παρακολούθησης. Επιβίωση χωρίς εξέλιξη (PFS) ορίστηκε ως ο χρόνος από την έναρξη της θεραπείας με ανίχνευση της εξελισσόμενης νόσου ή θανάτου. Οι ασθενείς που δεν προχωρούν τη διάρκεια της θεραπείας είχαν λογοκριθεί κατά την τελευταία ημερομηνία της παρακολούθησης. Οι πιθανότητες του OS και PFS εκτιμήθηκαν χρησιμοποιώντας τη μέθοδο των Kaplan και Meier και συγκρίθηκαν μεταξύ των υποομάδων των ασθενών που χρησιμοποιούν τη δοκιμασία log-rank. [17], [18] αναλογικών κινδύνων κατά Cox μοντέλων παλινδρόμησης ήταν σκόπιμο να αξιολογηθεί η σχέση μεταξύ του λειτουργικού συστήματος και τα χαρακτηριστικά του ασθενούς και

KRAS

κατάσταση μετάλλαξης. [19] μονοπαραγοντική και πολλαπλής λογιστικής παλινδρόμησης μοντέλα ήταν σκόπιμο να αξιολογηθεί η σχέση μεταξύ

KRAS

και

PIK3CA

μετάλλαξη και τον ασθενή κλινικά χαρακτηριστικά. Αρχικά, μονομεταβλητών μοντέλα λογιστικής παλινδρόμησης ήταν σε φόρμα και μεταβλητές με p-τιμές μικρότερες από 0.5 περιλήφθηκαν στο μοντέλο πολλαπλής λογιστικής παλινδρόμησης. Στη συνέχεια εκτελούνται προς τα πίσω επιλογή μοντέλου και διατηρούνται μόνο αυτές τις μεταβλητές με ρ-τιμές μικρότερες από 0.05. Όλες οι στατιστικές αναλύσεις πραγματοποιήθηκαν με τη χρήση του λογισμικού SAS (version9.2) και Splus (έκδοση 8.0).

Υποστήριξη Πληροφορίες

Εικόνα S1.

Kaplan-Meier οικόπεδο επιβίωσης χωρίς εξέλιξη (PFS) και

PIK3CA

κατάστασης σε ασθενείς με mCRC που έλαβαν σχήματα συμπεριλαμβανομένων των αντι-EGFR θεραπείες. Οι ασθενείς με mCRC /

PIK3CA

μεταλλαγμένο είχε μια τάση προς μια μικρότερη PFS σε σύγκριση με το

PIK3CA

ασθενείς άγριου τύπου

doi:. 10.1371 /journal.pone.0038033.s001

(ΔΕΘ)

πίνακα S1.

διάμεση συνολική επιβίωση (OS) για κάθε ομάδα των

KRAS

μεταλλάξεις.

doi: 10.1371 /journal.pone.0038033.s002

(DOCX)

Πίνακας S2.

Τύπος

PIK3CA

μεταλλάξεις βρέθηκαν σε ασθενείς με

KRAS

μεταλλάξεις *.

doi: 10.1371 /journal.pone.0038033.s003

(DOCX)

Ευχαριστίες

Joann Ααρών, ΜΑ, για την επιστημονική επιμέλεια

.