PLoS One: Οι Σύλλογοι μεταξύ μάτισμα RNA Complex Gene SF3A1 πολυμορφισμοί και του παχέος εντέρου κινδύνου σε ένα κινεζικό πληθυσμό


Αφηρημένο

Ιστορικό

Η ανώμαλη εναλλακτικό μάτισμα περιλαμβάνονται μεταβολές στα συστατικά του μηχανισμού ματίσματος του mRNA εμφανίστηκαν συχνά σε καρκίνο του παχέος εντέρου. Ωστόσο, ο ρόλος του

SF3A1

, ένα βασικό συστατικό του μηχανισμού ματίσματος του mRNA, για καρκίνο του παχέος εντέρου (CRC) κίνδυνος δεν είχε ακόμα διαλευκανθεί.

Τρόπος και Ευρήματα

πραγματοποιήθηκε μια μελέτη ασθενών-μαρτύρων νοσοκομείο με βάση περιέχει 801 ασθενείς CRC και 817 του καρκίνου χωρίς ελέγχους για να εξετάσει τη σχέση μεταξύ

SF3A1

πολυμορφισμούς και τον κίνδυνο CRC σε ένα κινεζικό πληθυσμό. επιλεγμένα τεσσάρων υποψήφιων SNPs (rs10376, rs5753073, rs2839998 και rs2074733) βασίστηκαν σε ανάλυση της βιοπληροφορικής και τα προηγούμενα ευρήματα. Τα αποτελέσματα δεν έδειξαν σημαντικές συσχετίσεις μεταξύ αυτών των SNPs και τον κίνδυνο CRC (

P

& gt? 0,05). Εκτός αυτού, η στρωματοποιημένη ανάλυση με βάση την κατάσταση καπνίσματος και χρήσης αλκοόλ ληφθεί κανένα στατιστικώς σημαντικά αποτελέσματα.

Συμπέρασμα

Η μελέτη μας ήταν ο πρώτος για να διερευνήσει τη σχέση μεταξύ

SF3A1

πολυμορφισμούς και τον κίνδυνο CRC. Τα αποτελέσματα έδειξαν αυτά τα τέσσερα SNPs στο

SF3A1

δεν συσχετίστηκαν με CRC κινδύνου σε ένα κινεζικό πληθυσμό, ωστόσο, περαιτέρω περισσότερες μελέτες απαιτούνται για να επιβεβαιώσουν τα ευρήματά μας

Παράθεση:. Chen X, Du Η , Liu Β, Ζου L, Chen W, Yang Y, et al. (2015) Οι ενώσεις μεταξύ μάτισμα RNA Complex Gene

SF3A1

πολυμορφισμοί και του παχέος εντέρου κινδύνου σε ένα κινεζικό πληθυσμό. PLoS ONE 10 (6): e0130377. doi: 10.1371 /journal.pone.0130377

Ακαδημαϊκό Συντάκτης: Μινγκ Γιανγκ, Πανεπιστήμιο του Πεκίνου Χημικής Τεχνολογίας, ΚΙΝΑ

Ελήφθη: 13, Φεβρουαρίου του 2015? Αποδεκτές: 19 Μαΐου του 2015? Δημοσιεύθηκε: 16 του Ιουνίου 2015

Copyright: © 2015 Chen et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Δεδομένα Διαθεσιμότητα: Όλα τα σχετικά δεδομένα είναι εντός του χαρτιού

Χρηματοδότηση:. το ερευνητικό έργο χρηματοδοτήθηκε από το Εθνικό Ίδρυμα Φυσικών Επιστημών της Κίνας (Grant Νο 31172395), τις βασικές τεχνολογίες έρευνα και ανάπτυξη πρόγραμμα της Κίνας (Grant Νο 2013BAI12B01-3) και η Επιτροπή Υγείας και Οικογενειακού Προγραμματισμού του Hubei επαρχία της Κίνας (Grant Νο WJ-2015MB039). Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

Καρκίνος του παχέος εντέρου (CRC) παραμένει ένα σημαντικό πρόβλημα υγείας και είναι μια κύρια αιτία νοσηρότητας και θνησιμότητας σε παγκόσμιο επίπεδο, που αντιπροσωπεύει την τρίτη πιο κοινή αιτία θανάτου από καρκίνο σχετίζονται [1]. Εκτιμήθηκε ότι προκαλεί 142.820 νέα κρούσματα και 50.830 θάνατοι του παχέος εντέρου και του ορθού καρκίνου στις Ηνωμένες Πολιτείες για τους άνδρες και τις γυναίκες το 2013 [2]. Αν και έχουν πολλούς παράγοντες κινδύνου για το περιβάλλον [3,4] έχουν ανιχνευθεί ότι σχετίζεται με τον κίνδυνο του CRC, γενετική ευαισθησία βρέθηκε να εμπλέκεται στην ανάπτυξη αυτής της νόσου. μελέτες συσχέτισης Genome κλίμακα (GWAS) έχουν επιτυχή εφαρμοστεί για τον προσδιορισμό θέσεων ευαισθησίας για τον καρκίνο και άλλες ασθένειες [5,6]. Σε καρκίνο του παχέος εντέρου, πρόσφατες μελέτες GWAS έχουν αποκαλύψει περισσότερα από 20 ευπάθεια πολυμορφισμούς μονών νουκλεοτιδίων (SNPs) σε πολλές διαφορετικές θέσεις στην ευρωπαϊκή και ασιατική πληθυσμούς [7-20]. Ωστόσο, τα περισσότερα από αυτά βρίσκονται σε μη κωδικοποιητικές περιοχές και μπορούν να εξηγήσουν λιγότερο από το 10% του οικογενούς σχετικό κίνδυνο CRC σε ευρωπαϊκούς πληθυσμούς [13,14] .Οι έδειξαν ότι μπορεί να υπάρχει ένα σημαντικό κλάσμα των γενετικά συστατικά άγνωστα και η οι βιολογικοί μηχανισμοί που απαιτούνται για να διερευνηθούν.

μάτισμα RNA μπορεί να αφαιρέσει εσώνια από RNAs προ-αγγελιοφόρο και είναι απαραίτητη σε όλους τους ευκαρυωτικούς οργανισμούς για να δημιουργήσει σημαντικό αριθμό εναλλακτικών ισομορφών με αλλοιωμένη δυναμικό κωδικοποίησης ή ρυθμιστικών περιοχών, προκειμένου να διασφαλιστεί η λειτουργική ποικιλομορφία της πρωτεΐνης τους στο πρόσωπο ενός περιορισμένου αριθμού γονιδίων [21,22]. Ωστόσο, παρεκκλίνουσα εναλλακτικό μάτισμα προέκυψε από μεταλλάξεις εντός στοιχεία ματίσματος στα γονίδια ή προϊόντα μεταγραφής του καρκίνου από μη μεταλλαγμένα γονίδια συνέβη σε πολλούς καρκίνους [23]. Για παράδειγμα, μερικές μελέτες έχουν διερευνήσει την ανώμαλη εναλλακτικό μάτισμα σε καρκίνο του παχέος εντέρου και ανιχνεύονται πολλά καρκίνου του παχέος εντέρου ειδική εναλλακτική συμβάντα ματίσματος που επηρεάζουν αρκετές πρωτεΐνες ή πορείες [24-28]. Αυτά τα άνω και κάτω τελεία σχετίζονται με τον καρκίνο γεγονότα ματίσματος συχνά εμπλέκονται μεταβολές σε συστατικά του μηχανισμού ματίσματος mRNA, που δίδεται παραδειγματικά με το πρόσφατο εύρημα ότι η ενίσχυση ή η υπερέκφραση του

PRPF6

θα μπορούσε να είναι ένας οδηγός της ογκογένεσης του παχέος εντέρου [29].

RNA μάτισμα είναι ένα καλά οργανωμένο διαδικασία που στρατολογεί, αναδιατάσσει και απεμπλέκεται από ένα σύνολο μικρών πυρηνικών ριβονουκλεοπρωτεΐνης (snRNP) συμπλοκών, καθώς επίσης και πολλά άλλα πρωτεϊνικά συστατικά πάνω στο προ-mRNA. Κατά τη διάρκεια του ματίσματος, SF3A1, μαζί με το U2 snRNP και άλλες πρωτεΐνες, προσλαμβάνονται στο 3 ‘θέση ματίσματος για να δημιουργηθεί το σύμπλεγμα μάτισμα Α μετά την αναγνώριση του 3’ θέση ματίσματος [30] .Ως εκ τούτου,

SF3A1

είναι κρίσιμη για τη συναρμολόγηση σωμάτια συναρμογής και φυσιολογικά γεγονότα μάτισμα.

SF3A1

βρίσκεται στο 22q12.2, όπου έχει αναφερθεί ότι σχετίζεται με την ευαισθησία του καρκίνου του πνεύμονα [31], του καρκίνου του μαστού [32] και της νόσου φλεγμονώδους εντέρου [33] με μελέτες συσχέτισης γονιδιώματος κλίμακα. Αρκετές μελέτες έχουν αναφέρει τις συσχετίσεις μεταξύ μεταλλάξεις του

SF3A1

και άλλες ασθένειες. Yoshida et al [30] ανακάλυψαν πρόσφατα χαμηλότερα μεταλλάξεων τιμές για

SF3A1

στην πλειονότητα των ασθενών με μυελοδυσπλαστικά σύνδρομα (MDS). Επιπλέον, σε επιμέλεια πληροφορίες από τον Κατάλογο Σωματικών Μεταλλάξεων Καρκίνου (COSMIC) βάση δεδομένων αποκάλυψε ότι οι μεταλλάξεις στην κωδικοποιητική-περιοχή του

SF3A1

σχετίστηκαν με αρκετές μορφές καρκίνου, συμπεριλαμβανομένου οισοφαγικού αδενοκαρκινώματος, μυξοειδές λιποσαρκώματα, αρθρικό σάρκωμα, οστεοσαρκώματα, ενδομητρίου όγκους, καρκίνο του πνεύμονα, καρκίνο μαστού, ωοθηκών, καρκίνο του στομάχου και γλοιοβλαστώματος. Συλλογικά, αυτά τα ευρήματα υποδεικνύουν τη σχέση μεταξύ

SF3A1

και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου, και τόνισε την ανάγκη πρόσθετων ερευνών για τη σύνδεση των

SF3A1

πολυμορφισμούς και τον κίνδυνο CRC.

Λαμβάνοντας υπόψη το κοινή εμφάνιση της ανώμαλης εναλλακτικό μάτισμα στο CRC και το ρόλο του

SF3A1

στο εναλλακτικό μάτισμα, υποθέσαμε τους πολυμορφισμούς του

SF3A1

θα μπορούσε επίσης να συμβάλει στην ευαισθησία της CRC. Στην παρούσα μελέτη, πραγματοποιήσαμε μια μελέτη ασθενών-μαρτύρων νοσοκομείο με βάση σε ένα κινεζικό πληθυσμό να διερευνήσει τη σχέση μεταξύ πολυμορφισμών του

SF3A1

και CRC κίνδυνο.

Υλικά και Μέθοδοι

Ηθική Δήλωση

Κατά την πρόσληψη, γραπτή συγκατάθεση λήφθηκε από κάθε θέμα. Οι προσωπικές πληροφορίες για το σεξ, έτος γέννησης, το κάπνισμα και τις συνήθειες κατανάλωσης οινοπνεύματος από όλους τους συμμετέχοντες επίσης συλλέχθηκαν από τις συνεντεύξεις. Εν τω μεταξύ, 5ml δείγμα περιφερικού αίματος από κάθε υποκείμενο συλλέχθηκε και αποθηκεύονται στο -80 ° C ψυγείο πριν από την εκχύλιση του DNA. Η μελέτη αυτή εγκρίθηκε από την επιτροπή δεοντολογίας της Tongji Νοσοκομείο Huazhong Πανεπιστήμιο Επιστήμης και Τεχνολογίας.

Οι συμμετέχοντες στη μελέτη

Ένα σύνολο από 801 περιπτώσεις CRC και 817 του καρκίνου χωρίς ελέγχους διερευνήθηκαν σε αυτή τη μελέτη, όλα εκ των οποίων ήταν άσχετα εθνοτικών Κινέζων Χαν που ζουν στην περιοχή Γουχάν. Οι ασθενείς που είχαν ιστοπαθολογικά επιβεβαιώθηκε με πρωτοπαθή καρκίνο του παχέος εντέρου είχαν εγγραφεί από Tongji Νοσοκομείο μεταξύ του 2009 και του 2013, και δεν είχαν λάβει ακτινοθεραπεία ή χημειοθεραπεία πριν από τη συλλογή δειγμάτων αίματος, μέρος των οποίων έχουν περιγραφεί σε προηγούμενες μελέτες μας [34-36]. Καρκίνος-free έλεγχοι επιλέχθηκαν από τη φυσική τους συμμετέχοντες εξέταση στο ίδιο νοσοκομείο και κατά τη διάρκεια της ίδιας περιόδου, χωρίς ιστορικό καρκίνου ή σοβαρά χρόνια πάθηση. Τα άτομα της ομάδας ελέγχου ήταν η συχνότητα ταιριάζει με ασθενείς CRC κατά ηλικία (± 5 ετών) και των δύο φύλων.

Αναγνώριση των υποψήφιων SNPs

Οι υποψήφιες SNPs προσδιορίστηκαν με βάση την ανάλυση βιοπληροφορικής και των σχετικών πορισμάτων. Η διαδικασία διαλογής περιγράφεται ως εξής. Πρώτον, εισάγετε το γονίδιο «

SF3A1

» σε ένα web-based εργαλείο βιοπληροφορικής «SNPinfo-SNP Λειτουργία Πρόβλεψη» (https://snpinfo.niehs.nih.gov/snpinfo/snpfunc.htm) με αλληλόμορφο συχνότητα περιορίζεται σε «CHB» και «ασιατική» πληθυσμών. Το εργαλείο ενσωματώνει GWAS και πληροφορίες υποψήφιο γονίδιο για να προβλέψει τα λειτουργικά χαρακτηριστικά και των δύο μη-κωδικοποίησης και κωδικοποίησης SNPs, όπως μεταγραφής παράγοντα-θέση πρόσδεσης (TFBS), microRNA-θέση δέσμευσης, θέση ματίσματος, ρυθμιστικά δυναμικό σκορ, Polyphen και ούτω καθεξής. Ως αποτέλεσμα, 32 SNPs με MAF της CHB ή της Ασίας & gt? 5% ανακτήθηκαν, μεταξύ των οποίων μόνο rs10376 και rs5753073 είχαν προβλεφθεί για να εντοπίσετε τις θέσεις δέσμευσης των microRNA με τις βαθμολογίες Miranda για δύο αλληλόμορφα διέφεραν από ≥ 16. Στη συνέχεια, ένα άλλο βιοπληροφορική εργαλείο «miRNA SNP v2.0» (http: //bioinfo.life.hust.edu.cn/miRNASNP2/) εγκρίθηκε για την πρόβλεψη της λειτουργίας του rs2839998 εξαιτίας του διφορούμενου αποτελέσματος της από «SNPinfo-SNP λειτουργία πρόβλεψη». Όπως ήταν αναμενόμενο, ο SNP επίσης προβλέπεται να είναι μία θέση microRNA-δεσμευτική. Εκτός αυτού, το SNP του rs2074733 αποκαλύφθηκε ότι σχετίζεται με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου του παγκρέατος σε προηγούμενη μελέτη μας. Ως εκ τούτου, τέσσερα SNPs (rs10376, rs5753073, rs2839998 και rs2074733) επελέγησαν τελικά στη μελέτη μας.

απομόνωση του DNA και του γονότυπου

5 ml δείγματος περιφερικού αίματος από κάθε υπόθεση και ελέγχου υπόκειται χρησιμοποιήθηκε για την απομόνωση γονιδιακό DNA χρησιμοποιώντας RelaxGene αίματος Σύστημα DP319-02 (Tiangen, Πεκίνο, Κίνα) σύμφωνα με τις οδηγίες του κατασκευαστή. Οι 7900HT Fast Real-Time PCR System (Applied Biosystems, πόλη Foster, CA) εφαρμόστηκε για τον προσδιορισμό των γονότυπων του rs2074733, rs10376, rs2839998 και rs5753073, χρησιμοποιώντας την Δοκιμασία TaqMan SNP γονότυπου. (Applied Biosystems, Foster City, CA). Η ενίσχυση έγινε υπό τις ακόλουθες συνθήκες: 95 ° C ° για 10 λεπτά που ακολουθείται από 45 κύκλων των 94 ° C για 30 s και 62 ° C για 1 λεπτό. Τα δεδομένα αναλύθηκαν χρησιμοποιώντας αλληλόμορφη Διάκριση Program (Applied Biosystems). Επιπλέον, θα επιλέγονται τυχαία% δειγμάτων 5 και ο γονότυπος δύο φορές τον έλεγχο της ποιότητας, με ποσοστό συμφωνία του 100%.

Η στατιστική ανάλυση

Για να αξιολογήσει τις διαφορές στην κατανομή του φύλου, της ηλικίας, του καπνίσματος, πίνοντας το καθεστώς και τους γονότυπους μεταξύ υπόθεση και τον έλεγχο των ομάδων, Pearson χ

2 δοκιμών και

t

τεστ χρησιμοποιήθηκαν όπου ενδείκνυται. Hardy-Weinberg ισορροπία για γονότυπων ελέγχθηκε σε ελέγχους από μια χ

2-test καλοσύνη-of-fit. Οι συσχετίσεις μεταξύ rs2074733, rs10376, rs2839998 και rs5753073 και τον κίνδυνο CRC αξιολογήθηκαν από την OR και 95% διάστημα εμπιστοσύνης της (95% CI) χρησιμοποιώντας άνευ όρων ανάλυση λογιστικής παλινδρόμησης ρυθμίζεται ανάλογα με την ηλικία, το φύλο, τη συνήθεια του καπνίσματος και της χρήσης αλκοόλ. SPSS 12.0 λογισμικό που χρησιμοποιείται για την εκτέλεση των δύο όψεων στατιστικές αναλύσεις και

P

& lt? 0,05 θεωρήθηκε στατιστικά σημαντική.

Αποτελέσματα

Χαρακτηριστικά του πληθυσμού της μελέτης

Στην παρούσα μελέτη, έχουμε προσληφθεί 801 ασθενείς CRC και 817 του καρκίνου χωρίς υγιή άτομα, των οποίων η τα χαρακτηριστικά που φαίνονται στον πίνακα 1. Η μέση ηλικία των ασθενών και ελέγχων ήταν 58,18 έτη (± 11,68) και 57,51 έτη (± 11,44), αντίστοιχα. Μεταξύ των περιπτώσεων 58,4% ήταν άνδρες σε σύγκριση με 58,0% στους ελέγχους. Επιπλέον, 35,3% των περιπτώσεων ήταν καπνιστές και 31,6% των περιπτώσεων με τις συνήθειες κατανάλωσης οινοπνεύματος. Δεν υπήρχαν σημαντικές διαφορές στην κατανομή της ηλικίας (

P

= 0,244), το φύλο (

P

= 0.867), η συνήθεια του καπνίσματος (

P

= 0,122) και το αλκοόλ χρησιμοποιείτε (

P

= 0,453) μεταξύ της υπόθεσης και τον έλεγχο των ομάδων.

η

Σύλλογος ανάλυση

διανομές γονότυπος του

SF3A1

πολυμορφισμούς στο CRC Οι ασθενείς και τα άτομα ελέγχου φαίνονται στον πίνακα 2. Οι γονότυποι των rs5753073, rs2839998, rs2074733 και rs10376 στους ελέγχους ήταν σύμφωνα με Hardy-Weinberg ισορροπία (HWE) με

P

τιμές των 0.802, 0.734, 0.668 και 0.208, αντίστοιχα. Η ανάλυση λογιστικής παλινδρόμησης δεν έδειξε σημαντικές συσχετίσεις μεταξύ των ετεροζυγωτών και ομοζυγώτες παραλλαγές όλων αυτών των 4 SNPs και τον κίνδυνο CRC μετά προσαρμόζεται ανάλογα με την ηλικία, το φύλο, τη συνήθεια του καπνίσματος και της χρήσης αλκοόλ. Για παράδειγμα, τα άτομα με rs5753073 GG ή GA γονότυπο έδειξε παρόμοια CRC κίνδυνο σε σύγκριση με εκείνους με το γονότυπο ΑΑ (OR = 0,73, 95% CI: 0,37 – 1,44 και OR = 0.86, 95% CI: 0,68 – 1,08). Ομοίως, δεν υπήρχαν διαφορές στις κατανομές γονότυπου του rs2839998, rs2074733 rs10376 και μεταξύ των περιπτώσεων και των ελέγχων.

επόμενο στρωματοποιημένη θέματα μελέτης για τη διερεύνηση της σχέσης του

SF3A1

πολυμορφισμών με το κάπνισμα και ιδιότητα χρήση αλκοόλ. Ωστόσο, εξακολουθούν να παρατηρούνται σημαντικές συσχετίσεις μεταξύ αυτών των SNPs και του κινδύνου CRC του καπνίσματος και της χρήσης αλκοόλ υποομάδες (

P

& gt? 0.05) (Πίνακες 3 και 4)

Η

Συζήτηση

στην παρούσα μελέτη, υποθέσαμε ότι οι πολυμορφισμοί του

SF3A1

θα μπορούσε να συμβάλει στη γενετική ευαισθησία της CRC. Δεδομένου ότι το σύστημα μάτισμα RNA είναι απαραίτητη για τη λειτουργική ποικιλομορφία των πρωτεϊνών και γονιδίων ελέγχου σε ευκαρυωτικούς οργανισμούς, απορύθμιση των εν λόγω μηχανημάτων, συμπεριλαμβανομένων των μεταλλάξεων των βασικών γονιδίων, μπορεί να προκαλέσει διάφορες ασθένειες και καρκίνους [37,38]. Ως μέλος του συμπλόκου συναρμογής,

SF3A1

έχει ενοχοποιηθεί σε διάφορους καρκίνους. έτσι προτείναμε ότι πολυμορφισμοί μπορεί να επηρεάσουν την

SF3A1

έκφραση, στη συνέχεια, με αποτέλεσμα παρεκκλίνουσα εναλλακτικών γεγονότων ματίσματος στο CRC.

Οι τέσσερις υποψήφιες πολυμορφισμοί που επιλέγονται με βάση την ανάλυση βιοπληροφορικής και τα προηγούμενα ευρήματα που βρίσκονται εντός μη κωδικές περιοχές των

SF3A1

. Περισσότεροι από 1.200 GWAS μελέτες έχουν ανιχνευθεί σχεδόν 6.500 ευαισθησία τόπους [39] και είναι αξιοσημείωτο ότι το 93% των οποίων βρίσκονται σε περιοχές μη-κωδικοποίησης [5]. Μερικά από SNPs βρίσκονται εντός ρυθμιστικές περιοχές μη-κωδικοποίησης μπορεί να επηρεάσει την έκφραση γονιδίων και είναι σημαντικά συστατικά σε συγκρότημα προδιάθεση ασθένειας [40]. Μεταξύ των τεσσάρων πολυμορφισμών, rs10736, rs5753073 και rs2839998 βρίσκονται στην 3 ‘μη μεταφραζόμενη περιοχή (UTR), όπου microRNA δεσμεύει και ρυθμίζει την έκφραση mRNA. Αυτές οι δέστρες μπορεί να επηρεαστεί από SNPs που κατοικούν στην περιοχή-στόχο microRNA, το οποίο μπορεί είτε να καταργήσει τις υπάρχουσες θέσεις πρόσδεσης ή να δημιουργήσετε παράνομες θέσεις πρόσδεσης, έχει διαφορετική επίδραση στη γονιδιακή έκφραση και αντιπροσωπεύουν έναν άλλο τύπο της γενετικής ποικιλότητας που μπορεί να επηρεάσει τον κίνδυνο ορισμένων ανθρώπινων ασθένειες [41]. Συσσωρευτική αποδείξεις έχουν αποκαλύψει ότι οι πολυμορφισμοί εντός μικρο-RNA-θέσεις δέσμευσης που σχετίζονται με τον καρκίνο του μαστού [42], καρκίνος της ουροδόχου κύστης [43] και του παχέος εντέρου [44]. Εκτός από θέσεις στόχους microRNA, η συντριπτική πλειοψηφία των CRC SNPs αποκαλύπτεται από GWAS επικαλύπτονται με τουλάχιστον ένα ενισχυτή στην κρύπτη του παχέος εντέρου, ορισμένες από τις οποίες σχετίζονταν σημαντικά με χαμηλής συχνότητας χάσει παραλλαγή ενισχυτή loci (Vels) [45] και συνδέονται με μεταβάλλονται επιπέδου έκφρασης των γονιδίων στόχων τους. Ως εκ τούτου, οι παραπάνω έρευνες πρότειναν τις υποτιθέμενες ρόλους των μη-κωδικοποίησης μας SNPs στο CRC καρκινογένεση.

Για να διερευνήσουν το ρόλο του

SF3A1

πολυμορφισμούς να συμβάλλουν στην ευπάθεια του CRC, πραγματοποιήσαμε μια ένωση ανάλυση του rs5753073, rs2839998, rs2074733 rs10376 και σε 801 περιπτώσεις και 817 του καρκίνου χωρίς ελέγχους σε ένα κινεζικό πληθυσμό. Ωστόσο, όλες αυτές οι SNPs έχουν αποτύχει να συνδέονται με CRC κίνδυνο. Όταν στρωματοποιημένη αναλύσεις πραγματοποιήθηκαν από το κάπνισμα και το αλκοόλ χρήσης, έχουμε ακόμη ληφθεί καμία στατιστικώς σημαντικά αποτελέσματα. Προτείναμε ότι το περιορισμένο μέγεθος του δείγματος ενδέχεται να είναι ανεπαρκής για τη μελέτη αυτή ένωση, ως εκ τούτου, οι περισσότερες περιπτώσεις και οι έλεγχοι που απαιτούνται στο μέλλον.

Μερικοί περιορισμοί υπήρχαν και στην παρούσα μελέτη μας. Κατ ‘αρχάς, ως μελέτη ασθενών-μαρτύρων νοσοκομείο με βάση, μεροληψία της επιλογής μπορεί να μην αποφύγει. Ως εκ τούτου, οι μεγαλύτερες προοπτικές μελέτες συμμετείχαν για να επιβεβαιώσει τα αποτελέσματά μας. Δεύτερον, CRC είναι μια ετερογενής νόσος όπου οι περιβαλλοντικοί παράγοντες παίζουν σημαντικό ρόλο. Ως εκ τούτου, περισσότερα άλλους παράγοντες κινδύνου θα πρέπει να θεωρηθεί ότι περαιτέρω διαλεύκανση της αιτιολογίας της CRC.

Εν ολίγοις, έχουμε κατ ‘αρχάς διερευνήθηκαν οι συσχετίσεις μεταξύ των πολυμορφισμών του

SF3A1

και CRC κίνδυνο. Η μελέτη μας έδειξε ότι rs5753073, rs2839998, rs2074733 rs10376 και δεν προσδίδουν τον κίνδυνο CRC με βάση την τρέχουσα μελέτη νοσοκομείο. Βεβαίως, οι μεγαλύτερες πληθυσμιακές μελέτες με ολοκληρωμένο σχεδιασμό που απαιτείται για την περαιτέρω αποσαφήνιση του ρόλου των πολυμορφισμών των

SF3A1

στην αιτιολογία της CRC.

Ευχαριστίες

Είμαστε ευγνώμονες για την όλοι οι ασθενείς και οι υγιείς εθελοντές για τη συμφωνία να συμμετάσχει στη μελέτη, καθώς και όλους τους ανθρώπους που μας βοήθησαν να ολοκληρώσει με επιτυχία την έρευνα.

You must be logged into post a comment.