PLoS One: Αξιολογώντας την κλινική επίδραση ενός Γονιδιωματική ταξινομητή στον καρκίνο του προστάτη Χρησιμοποιώντας Εξατομικευμένη απόφαση Analysis


Αφηρημένο

Ιστορικό

Αυτή τη στιγμή δεν υπάρχει διαμάχη γύρω από το βέλτιστο τρόπο για τη θεραπεία ασθενών με καρκίνο του προστάτη σε η μετά από προστατεκτομή ρύθμιση. Επικουρική θεραπεία μεταφέρουν τα πιθανά οφέλη των βελτιωμένων θεραπευτικών αποτελεσμάτων, αλλά υπάρχει αβεβαιότητα στην οποία οι ασθενείς θα πρέπει να λαμβάνουν επικουρική θεραπεία. Υπάρχουν ανησυχίες σχετικά με την τοξικότητα δίνοντας στο σύνολο του πληθυσμού προς όφελος μόνο ένα υποσύνολο. Υποθέσαμε ότι οι αποφάσεις μετά από προστατεκτομή θεραπεία με τη χρήση εκτιμήσεων πρόβλεψης κινδύνου γονιδιωματική-based θα βελτιώσει τον καρκίνο και την ποιότητα των αποτελεσμάτων της ζωής.

Μέθοδοι

Έχουμε αναπτύξει μια κατάσταση μετάβασης μοντέλο για την προσομοίωση των αποτελεσμάτων πάνω από ένα 10 χρόνια ορίζοντα για μία ομάδα από ασθενείς μετά από προστατεκτομή. Τα αποτελέσματα περιλαμβάνονται τα ποσοστά καρκίνου εξέλιξη στα 5 και 10 χρόνια, η συνολική επιβίωση και την ποιότητα προσαρμοσμένο επιβίωσης με μειώσεις για τη θεραπεία, οι παρενέργειες, και το στάδιο του καρκίνου. Συγκρίναμε τα αποτελέσματα με τη χρήση σε επίπεδο πληθυσμού έναντι των κινδύνων σε ατομικό επίπεδο της εξέλιξης του καρκίνου, καθώς και για τη φροντίδα της γονιδιωματικής που βασίζονται σε σχέση με συνήθεις συστάσεις θεραπείας φροντίδα.

Αποτελέσματα

έκβαση της εξέλιξης του καρκίνου, αναμένεται ετών ζωής ( Lys), και αναμενόμενη ποιότητα ζωής σταθμισμένων χρόνια (QALYs) ήταν σημαντικά διαφορετικό όταν μεμονωμένες εκτιμήσεις κινδύνου εξέλιξης του καρκίνου γονιδιωματικής με βάση χρησιμοποιήθηκαν στη θέση των εκτιμήσεων κινδύνου σε επίπεδο πληθυσμού. Η χρήση της γονιδιωματικής ταξινομητή για να καθοδηγήσει τις αποφάσεις μεταχείριση που προβλέπεται μικρή, αλλά στατιστικά σημαντική, βελτίωση των αποτελεσμάτων του μοντέλου. Παρατηρήσαμε ένα επιπλέον 0,03 Lys και 0,07 QALYs, μια σχετική αύξηση 12% στην πιθανότητα επιβίωσης χωρίς υποτροπή 5 ετών, και μια σχετική μείωση 4% στην πιθανότητα 5ετούς της μεταστατικής νόσου ή θανάτου.

συμπεράσματα

Η χρήση της πρόβλεψης κινδύνου γονιδιωματικής που βασίζονται σε καθοδηγήσουν αποφάσεις για τη θεραπεία μπορεί να βελτιώσει τα αποτελέσματα για τους ασθενείς με καρκίνο του προστάτη. Η μελέτη αυτή παρέχει ένα πλαίσιο για την εξατομικευμένη ανάλυσης αποφάσεων, και μπορεί να επεκταθεί για να συμπεριλάβει ένα ευρύ φάσμα προσωπικά χαρακτηριστικά για να επιτρέψει την παράδοση των εργαλείων με επίκεντρο τον ασθενή για την τεκμηριωμένη λήψη αποφάσεων

Παράθεση:. Lobo JM, Dicker AP, Buerki C, Daviconi Ε, Karnes RJ, Jenkins RB, et al. (2015) Αξιολόγηση της Κλινικής επιπτώσεων μιας Γονιδιωματική ταξινομητή στον καρκίνο του προστάτη Χρησιμοποιώντας Εξατομικευμένη Ανάλυση της απόφασης. PLoS ONE 10 (4): e0116866. doi: 10.1371 /journal.pone.0116866

Ακαδημαϊκό Επιμέλεια: Νατάσα Κυπριανού, Πανεπιστήμιο του Κεντάκι College of Medicine, Ηνωμένες Πολιτείες |

Ελήφθη: 4 Σεπτεμβρίου, 2014? Αποδεκτές: 15 του Δεκέμβρη του 2014? Δημοσιεύθηκε: 2η Απριλίου, 2015

Copyright: © 2015 Lobo et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Δεδομένα Διαθεσιμότητα: Όλα τα σχετικά δεδομένα είναι εντός του Υποστηρίζοντας αρχεία πληροφοριών του χαρτιού και

Χρηματοδότηση:. η εργασία αυτή υποστηρίζεται από μια ερευνητική επιχορήγηση από GenomeDx Βιοεπιστημών (genomedx.com/), καθώς και από τον καρκίνο του προστάτη Ίδρυμα Βραβείο Νέου ερευνητή 2011 (TNS ? www.pcf.org/) και μια αμερικανική Εταιρεία Ακτινοθεραπευτικής Ογκολογίας βραβείο Συγκριτική αποτελεσματικότητα Ερευνών (TNS? www.astro.org). GenomeDx Βιοεπιστημών παρέχεται στήριξη με τη μορφή των μισθών για τους δημιουργούς CB και ΕΔ, αλλά δεν έχουν κανένα πρόσθετο ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου. Οι συγκεκριμένοι ρόλοι αυτών των συγγραφέων αρθρωτά στο τμήμα «συγγραφέας εισφορές»

Αντικρουόμενα συμφέροντα:. Christine Buerki και Elai Daviconi απασχολούνται από GenomeDx Βιοεπιστημών, ένας από τους χρηματοδότες της μελέτης αυτής. Timothy Ν Showalter έχει λάβει αμοιβές συμβούλων από GenomeDx Biosciences, Inc. για ένα ξεχωριστό έργο. Δεν υπάρχουν διπλώματα ευρεσιτεχνίας, τα προϊόντα στην ανάπτυξη, ή διατίθενται στην αγορά προϊόντα να δηλώσει. Αυτό δεν αλλάζει την τήρηση των συγγραφέων σε όλες τις PLoS ONE πολιτικές για την ανταλλαγή δεδομένων και υλικών, όπως περιγράφεται λεπτομερώς σε απευθείας σύνδεση στον οδηγό για τους συγγραφείς.

ΕΙΣΑΓΩΓΗ

Γονιδιωματική με γνώμονα την ιατρική καρκίνου του προσφέρει τη δυνατότητα για τη θεραπεία του καρκίνου ακρίβεια με την παροχή εξατομικευμένων πληροφοριών ότι οι ασθενείς και οι πάροχοι μπορούν να χρησιμοποιούν για να κάνουν εξατομικευμένες ιατρικές αποφάσεις [1,2]. Οι πρόσφατες εξελίξεις στον τομέα της γονιδιωματικής καρκίνου δημιούργησαν μια μυριάδα του γονιδιακού τεστ διαθέσιμο για κλινική χρήση, αλλά υπήρξε μικρή έρευνα που γίνεται σχετικά με το πώς αυτές οι γονιδιωματικές δοκιμασίες επηρεάσει τα αποτελέσματα σε ασθενείς με καρκίνο [3]. Η κλινική χρησιμότητα των δοκιμών αυτών πρέπει επίσης να καταδειχθεί [3]. Ένας τρόπος που γονιδιωματικής τεχνολογίας μπορεί να επηρεάζει την κλινική αποφάσεις για εντοπισμένο καρκίνο του είναι με την παροχή επιμέρους εκτιμήσεις του κινδύνου της εξέλιξης του καρκίνου ή επανάληψης [4]. Αυτές οι μεμονωμένες εκτιμήσεις μπορούν στη συνέχεια να ενημερώσει τις αποφάσεις σχετικά με τις επιλογές για περισσότερο ή λιγότερο επιθετικές θεραπείες [4].

Αν και τυχαιοποιημένες ελεγχόμενες μελέτες που αποδεικνύουν ότι οι ασθενείς με δυσμενείς παθολογικά χαρακτηριστικά δημοσιεύσετε ριζική προστατεκτομή (RP) που λαμβάνουν επικουρική ακτινοθεραπεία (ART) πάνω παρατήρησης έχουν βελτιωθεί τα αποτελέσματα [5-9], τα ποσοστά χρησιμοποίησης ART είναι χαμηλές [10,11] και μετά από προστατεκτομή ακτινοθεραπεία παραμένει αμφιλεγόμενη [12,13]. Γονιδιωματική με βάση τη διαστρωμάτωση του κινδύνου μπορεί να αντιμετωπίσει τα ζητήματα της χρήσης ART παρακάτω RP με τη δημιουργία επιλογές των θεραπειών μετα-RP που να βασίζεται στις ατομικές προβλέψει τον κίνδυνο ενός ασθενούς της μετάστασης. Η ικανότητα να κινδύνων διαστρωμάτωση επιτρέπει στον κλινικό γιατρό και τον ασθενή να επιλέξει μια θεραπεία μετα-RP που είναι πιο αποτελεσματικό για το συγκεκριμένο άτομο. Υπάρχουν πλέον αρκετές εμπορικά διαθέσιμες γονιδιωματικής δοκιμασίες που μπορεί να διαστρωμάτωση κινδύνου επιθετικότητα του καρκίνου του προστάτη [14]. Μια μελέτη των κλινικών αποφάσεων για την επικουρική και διάσωσης θεραπείες μετά RP έχει βρεθεί αποτελέσματα γονιδιωματικής δοκιμών οδήγησε ουρολόγοι να αλλάξει τις συστάσεις θεραπεία τους σε περισσότερες από 40% των περιπτωσιολογικών μελετών αξιολογήθηκαν [15]. Παρά το γεγονός ότι ο αντίκτυπος αυτών των δοκιμών για τη λήψη αποφάσεων είναι σημαντική, οι μεταγενέστεροι μακροπρόθεσμες επιπτώσεις της γονιδιωματικής ταξινομητή (GC) με βάση τον κίνδυνο ιατρική ακρίβεια δεν έχουν ακόμη αξιολογηθεί. Η παρούσα μελέτη έχει ως στόχο να αντιμετωπίσει αυτό το κενό.

έρευνας Συγκριτική αποτελεσματικότητα (CER) προσφέρει την υπόσχεση για την αξιολόγηση νέα διαγνωστικά τεστ για χρήση στη γονιδιωματική και την ακρίβεια της ιατρικής [3,4] με τη δημιουργία απόδειξη της αποτελεσματικότητας των υποψήφιων γονιδιωματικής δοκιμασίες με ταχύ και αποτελεσματικό τρόπο. Η εξατομικευμένη μεθοδολογία ανάλυσης απόφαση επιτρέπει τα μοντέλα να εκπροσωπεί την επίδραση των εξατομικευμένων εκτιμήσεων της εξέλιξης του καρκίνου μετά από τα αποτελέσματα σε επίπεδο πληθυσμού. Η μεθοδολογία αυτή υπογραμμίζει την ιδιαίτερη σημασία των ατομικών χαρακτηριστικών σχετικά με την προβλεπόμενη αποτελέσματα. Το πλαίσιο μπορεί να επεκταθεί περαιτέρω ώστε να συμπεριλάβει μια σειρά από προσωπικά χαρακτηριστικά όπως συννοσηρές ασθένειες, γονότυπο του όγκου, και ατομικές εκτιμήσεις χρησιμότητα [16].

Σε αυτή τη μελέτη, έχουμε αναπτύξει μια απόφαση αναλυτική προσέγγιση για να συγκρίνετε πρότυπο σε αποτελέσματα συμπεριλαμβανομένων αναμενόμενο χρόνο και την ποιότητα προσαρμοσμένο χρόνο πάνω από ένα ορίζοντα δέκα ετών, και 5 και 10 ετών εξέλιξης του καρκίνου τιμές-μεταξύ των σεναρίων με και χωρίς τον κίνδυνο της γονιδιωματικής που βασίζονται. Ο στόχος αυτής της προσέγγισης ήταν να εκτιμηθεί η πιθανή κλινική χρησιμότητα μιας γονιδιωματικής τεστ για την ενημέρωση των κλινικών αποφάσεων. Χρησιμοποιούμε το τεστ αποκρυπτογραφήσουν GC (GenomeDx Biosciences, San Diego, CA), μια επικυρωμένη γονιδιωματική ανάλυση που προσφέρει ατομικές εκτιμήσεις του κινδύνου μετάστασης (ΚΟΑ) μετά από RP σε ασθενείς υψηλού κινδύνου [17,18]. υποθέσεις μας είναι ότι: (1) εξατομικεύεται ΚΟΑ πιθανότητες να αλλάξει προβλέψει τα αποτελέσματα, σε σύγκριση με το μέσο όρο, σε επίπεδο πληθυσμού MET πιθανότητες, για ένα σημαντικό ποσοστό των ασθενών με καρκίνο του προστάτη που είναι επιλέξιμες για ART, και (2) το παράδειγμα της γονιδιωματικής με γνώμονα την ιατρική καρκίνου βελτιώνει προβλέψει τα αποτελέσματα μετά από RP σε σύγκριση με αποφάσεις που λαμβάνονται σε περίπτωση απουσίας της αξιολόγησης των κινδύνων GC-βάση.

ΥΛΙΚΑ ΚΑΙ ΜΕΘΟΔΟΙ

Σχεδιάσαμε ένα μοντέλο μεταβατικής κατάστασης [19] για την εκτίμηση της ποιότητας προσαρμοσμένο ζωής Το προσδόκιμο για μία ομάδα των ανδρών με καρκίνο του προστάτη οι οποίοι έχουν λάβει RP (Εικ. 1). Στο μοντέλο, οι άνδρες που υποβλήθηκαν σε θεραπεία είτε με πρόωρη επικουρική θεραπεία ή στενή παρακολούθηση με τη θεραπεία διάσωσης για επιλεγμένους ασθενείς μετά από βιοχημική υποτροπή (BCR). Οι θεραπευτικές επιλογές που χρησιμοποιούνται στο μοντέλο είναι η θεραπεία ακτινοβολίας, ορμονοθεραπεία, ή και τα δύο. Κατά τη μετάβαση στην BCR ή MET καταστάσεις, οι ασθενείς που έχουν λάβει προηγουμένως θεραπεία λαμβάνουν δύο χρόνια θεραπεία με αυξητική ορμόνη. Μεμονωμένα άτομα εισάγετε το μοντέλο κατά το χρόνο της προστατεκτομή, και την έξοδο στο θάνατο ή το τέλος ενός ορίζοντα 10 ετών. Η δομή του δέντρου απόφασης απεικονίζεται στο S1 Εικ. Χρησιμοποιήθηκαν ενός μηνός μήκη κύκλου. Οι Markov μοντέλο μεταβάσεις που εκπροσωπούνται στο Σχ. 1. Το μοντέλο γραμμένος σε C /C ++. Η επικύρωση μοντέλο περιγράφεται στα αρχεία Υποστήριξη Πληροφορίες Online (βλέπε S1 κειμένου).

NED αντιπροσωπεύει ασθενείς χωρίς ενδείξεις της νόσου.

Η

εφαρμόστηκε μια προσέγγιση προσομοίωσης ομάδα, με δύο ομάδες ασθενών RP χρησιμοποιούνται ως τους πληθυσμούς δειγματοληψίας. Για κάθε σύγκριση στα πειράματα, χρησιμοποιήσαμε τον κώδικα εκκίνησης μέθοδος δειγματοληψίας με αντικατάσταση να επιλέξουν κάθε ασθενή για να περάσει μέσα από το μοντέλο. Υλοποιήσαμε σε συνδυασμό τρέχει δείγμα για την εκτίμηση της μέσης διαφορά στην ποιότητα ζωής σταθμισμένων χρόνια (QALYs) για κάθε σύγκριση. Εμείς επιλέξαμε ένα μέγεθος δείγματος 10.000 για να εξασφαλιστεί εκτίμηση του αναμενόμενου QALYs εντός 0,1 QALYs.

Κοόρτεις

Ο Πίνακας 1 παρουσιάζει τις δύο ξεχωριστές ομάδες που χρησιμοποιήθηκαν για τα πειράματα. Η Mayo Clinic Cohort, που είχε αναφερθεί αρχικά για την επικύρωση GC, αποτελείται από ασθενείς που έλαβαν θεραπεία με RP μεταξύ 2000 και 2006, στη Mayo Clinic, που είχαν ένα ή περισσότερα ανεπιθύμητα χαρακτηριστικά παθολογίας [17]. Οι έλεγχοι από τη μελέτη ασθενών-ομάδα ήταν επανασταθμίστηκε [20] (με βάρος 5) να αντιπροσωπεύουν με μεγαλύτερη ακρίβεια το μίγμα σοβαρότητα του πληθυσμού των ασθενών μετά από RP ΗΠΑ, αποδίδοντας μια ομάδα προσομοίωση των 808 ασθενών με πιθανότητες κινδύνου GC που εκπροσωπούν το κίνδυνο ΚΟΑ σε πέντε χρόνια. Αυτό επανασταθμίστηκε ομάδα αντικατοπτρίζει την μελέτη επικύρωσης Cohort Mayo Clinic [17] που εκτελούνται για τη GC και αντιπροσωπεύει με μεγαλύτερη ακρίβεια τις αναλογίες των περιπτώσεων παρατηρείται στο γενικό πληθυσμό. Το Πανεπιστήμιο Τόμας Τζέφερσον (TJU) Cohort αποτελείται από 139 ασθενείς με πιθανότητες κινδύνου GC αγωγή με RP και μετεγχειρητική ακτινοβολία μεταξύ του 1990 και του 2009 σε TJU νοσοκομείο [21]. Για κάθε ασθενή σε κάθε ομάδα, το μοντέλο χρησιμοποιεί: η ηλικία κατά τη στιγμή της RP να καθορίσει την ηλικία ειδικά πιθανότητα θνησιμότητας μη καρκίνο, διάστημα εμπιστοσύνης 95% για 5-ετή κίνδυνο μετάστασης, και την κατάσταση του κινδύνου που ορίζονται με GC είτε ως κατώτερη ή μεγαλύτερη από έξι τοις εκατό του μέσου όρου κίνδυνο μετάστασης, το όριο για διαφορετικές αποφάσεις για τη θεραπεία βασίζεται στη μελέτη των επιλογών [15]. Αυτά τα δεδομένα σε ατομικό επίπεδο είναι διαθέσιμα (S1 Data).

Η

Είσοδοι Μοντέλο

Πηγές για τις εισροές προσδιορίστηκαν με βάση μια λεπτομερή ανασκόπηση της μια πρόσφατα δημοσιευμένη ανάλυση απόφαση της ART έναντι ακτινοβολίας διάσωσης θεραπεία (SRT) [22] και ένα PubMed αναζήτηση χρησιμοποιώντας τον όροι «καρκίνος του προστάτη», «θεραπεία ακτινοβολίας», «ορμονοθεραπεία», και «διάσωσης» ή «επίκουρο»? και την ένταξη των δημοσιευμένων αποτελεσμάτων από τρεις τυχαιοποιημένες ελεγχόμενες δοκιμές του ART έναντι παρατήρησης [5-8]. Πιθανότητες της BCR και ΚΟΑ εξήχθησαν από τη βιβλιογραφία. Στοιχεία σχετικά με τα χαρακτηριστικά απόδοσης δοκιμασία GC ελήφθη από τη δημοσιευμένη βιβλιογραφία [15,17,18] (S1 πίνακα). Το μοντέλο σχεδιάστηκε με την παραδοχή ότι η πρόβλεψη κινδύνου GC ήταν απόλυτα ακριβείς για λόγους απλότητας. Ωστόσο, θα πρέπει να σημειωθεί ότι η περιοχή κάτω από την χαρακτηριστική λειτουργική καμπύλη (AUC) για τη δοκιμή GC είναι 0,79 [17], υποδηλώνοντας κάποια εγγενή αβεβαιότητα. Είναι επίσης δεδομένο ότι οι θεραπευτικές παρεμβάσεις είχαν την ίδια αναλογική επίδραση στα αποτελέσματα, ανεξάρτητα από το μέγεθος του κινδύνου, λαμβάνοντας υπόψη την έλλειψη μετά τη θεραπεία κλινικές εκβάσεις αποδείξεις στρωματοποιημένη με κίνδυνο GC-καθορισμένων της μετάστασης. Πιθανότητες για ετήσιο κίνδυνο θανάτου οφείλεται σε αιτίες εκτός από τον καρκίνο του προστάτη με βάση τις πιο πρόσφατες Κέντρα για πίνακες Ελέγχου και Πρόληψης Νοσημάτων ζωής [23], με την προσαρμογή των επιμέρους θέματα ανάλογα με την ηλικία κατά τη στιγμή της προστατεκτομή και ο χρόνος κατά τη διάρκεια του 10-year χρονικό ορίζοντα (S1 πίνακα). Δεδομένου ότι η ανάλυση GC είναι νέα και τα δεδομένα σχετικά με το πώς GC αποτελεσμάτων επηρεάζουν πραγματικό κόσμο κλινική πράξη δεν είναι ακόμη διαθέσιμα, οι πιθανότητες απόφαση για τη θεραπεία των κινδύνων που εξαρτώνται GC βασίστηκαν στη μελέτη των επιλογών [15] (S2 Πίνακας). Στη μελέτη αποφασίζει, GC-ορίζεται κίνδυνο μετάστασης μεγαλύτερη από 6% συσχετίστηκε με υψηλότερα ποσοστά ουρολόγους συνιστώντας ART ή SRT [15], δηλαδή 6% ήταν να χρησιμοποιηθεί ως κατώτατο όριο για τη λήψη αποφάσεων θεραπεία GC-βασισμένη στο σημερινό μοντέλο.

επιπλοκές και ανεπιθύμητες ενέργειες

η θεραπεία που εξαρτώνται πιθανότητες της BCR, ΚΟΑ, και ο θάνατος από καρκίνο του προστάτη, καθώς και οι πιθανότητες των επιπλοκών που οφείλονται σε ορμονική θεραπεία και ακτινοθεραπεία παρουσιάζονται στον πίνακα S1. Αυτές οι πιθανότητες αντιπροσωπεύουν τις πιθανότητες αυτών των εκδηλώσεων οφείλεται μόνο σε αυτές τις θεραπείες και όχι σε άλλες θεραπείες, ο ασθενής μπορεί να λάβει, συμπεριλαμβανομένων RP.

Utilities

Ένα βοηθητικό πρόγραμμα είναι μια τιμή που έχει εκχωρηθεί με βάση την προτίμησης σε κάθε ασθενή για μια συγκεκριμένη κατάσταση υγείας, και τις πιθανές τιμές κυμαίνονται από μηδέν (θάνατος) σε ένα (τέλεια υγεία). τιμές χρησιμότητα που λαμβάνεται από τη δημοσιευμένη βιβλιογραφία αντιπροσωπεύουν τις μέσες προτιμήσεις του υγιείς άνδρες ασθενείς που ολοκλήρωσαν πειράματα trade-off χρόνο για να προσδιορίσει πόσο χρόνο θα θυσιάσει για να αποφευχθεί μια δεδομένη κατάσταση της υγείας [24]. Οι επιχειρήσεις κοινής ωφέλειας που σχετίζονται με κάθε επιπλοκή και τις κρατικές επιχειρήσεις κοινής ωφέλειας για την υγεία και τη θεραπεία παρουσιάζονται στον Πίνακα S1. Για τους ασθενείς σε μια συγκεκριμένη κατάσταση υγείας, τα οποία επίσης υποβάλλονται σε θεραπεία και /ή έχει αναλάβει μια επιπλοκή, η χρησιμότητα του ασθενούς υπολογίζεται πολλαπλασιάζοντας τις επιχειρήσεις κοινής ωφελείας. Τα QALYs υπολογίζεται από το χρόνο (σε έτη) από το βοηθητικό πρόγραμμα πολλαπλασιασμό? ένα QALY είναι ισοδύναμο με ένα έτος σε τέλεια υγεία ή δύο ετών ζούσε με μια χρηστική αξία 0,5. Επιλέξαμε να χρησιμοποιήσουμε μη προεξοφλημένες QALYs δεδομένου ότι η ανάλυσή μας δεν περιλαμβάνουν το κόστος [25].

Αναλύσεις ευαισθησίας

Η μονόδρομη ανάλυση ευαισθησίας πραγματοποιήθηκε για να προσδιοριστεί πόσο ευαίσθητη αποτελέσματα ήταν στις μεταβολές των βασικών παραμέτρων. Εμείς ατομικά ποικίλλει πιθανότητες μετάβασης, οι πιθανότητες εκδήλωσης, και οι εκτιμήσεις χρησιμότητα κατά ± 10% για να προσδιοριστεί η επίδραση στις αναμενόμενες QALYs. Πιθανολογική ανάλυση ευαισθησίας πραγματοποιήθηκε επίσης σε αυτές τις παραμέτρους. Θεραπεία πιθανότητες απόφαση, σύμφωνα με τη συνήθη φροντίδα και εκείνων που βασίζονται σε πιθανότητες κινδύνου GC μεταβάλλονταν για να προσδιοριστεί η επίδραση στην αναμενόμενη διάρκεια ζωής-έτη (Lys), QALYs, και τα κλινικά αποτελέσματα. Όταν μεταβολή των πιθανοτήτων θεραπεία, οι σχετικές πιθανότητες κάθε τύπο θεραπείας παρέμεινε η ίδια, αλλά το ποσοστό των ασθενών στην παρατήρηση άλλαξε για να είναι 20% πάνω ή κάτω από τις τιμές βάσης σε απόλυτους όρους με το μέγιστο ποσοστό επί παρατήρηση είναι 100% και η ελάχιστη είναι 0%.

στατιστικές συγκρίσεις

Αξιόπιστες προσομοιώσεις δείγματος παράγεται για κάθε σύγκριση με την ελαχιστοποίηση παραλλαγή. Paired t-tests χρησιμοποιήθηκαν για να προσδιοριστεί εάν οι διαφορές στην αναμενόμενη Lys και QALYs ήταν σημαντικές. Εμείς παράγεται διωνυμική διαστήματα εμπιστοσύνης ανάλογα με συγκρίνουν κλινικές εκβάσεις για κάθε σύγκριση. δοκιμή McNemar χρησιμοποιήθηκε για να προσδιοριστεί εάν οι διαφορές σε αυτά τα αποτελέσματα ήταν σημαντικά. Kaplan-Meier εκτιμήσεις για τις συνολικές πιθανότητες BCR και ΚΟΑ στις χρησιμοποιήθηκαν 5 έτη για σκοπούς επικύρωσης.

ΑΠΟΤΕΛΕΣΜΑΤΑ

Έχουμε αναπτύξει ένα μοντέλο με δύο πιθανότητες σε επίπεδο πληθυσμού από τη βιβλιογραφία και, άτομο πιθανότητες επίπεδο με βάση την 5-ετή κίνδυνο του κινδύνου GC πιθανότητας του ασθενούς της μετάστασης. Για τις πιθανότητες σε ατομικό επίπεδο, μηνιαία πιθανότητες BCR και ΚΟΑ άλλαξαν από τις μηνιαίες πιθανότητες πληθυσμού σε επίπεδο ώστε να αντικατοπτρίζει την εξατομικευμένη κινδύνου 5 ετών του ασθενούς της μετάστασης. Οι αλλαγές έγιναν με βάση την υπόθεση ότι οι μηνιαίες πιθανότητες του ατόμου και ο κίνδυνος 5 ετών μετάσταση είναι ανάλογη με τις μηνιαίες πιθανότητες σε επίπεδο πληθυσμού και το μοντέλο-προέβλεψε 5-ετή κίνδυνο μετάστασης.

αξία της ενσωμάτωσης ετερογένεια

Βρήκαμε ότι τα αποτελέσματα διαφέρουν για τα αποτελέσματα των ασθενών όταν τα εξατομικευμένα πιθανότητες χρησιμοποιούνται στη θέση των πιθανοτήτων σε επίπεδο πληθυσμού. Για την Κλινική Μάγιο Cohort, οι Lys σε επίπεδο πληθυσμού, υπολογίζεται ότι είναι 8,88 (95% CI: (8.84, 8.93)) και QALYs εκτιμήθηκαν ως 8.00 (95% CI: (7.95, 8.05)) σε σύγκριση με 8,82 Lys (95 % CI: (8.77, 8.87)) και 8,03 QALYs (95% CI: (7.98, 8.08)) για την εξατομικευμένη μοντέλο. Ο πίνακας 2 δείχνει σημαντικές διαφορές παρατηρήθηκαν για το σύνολο των 5 και 10 ετών BCR-free πιθανότητες και την ΚΟΑ ή πιθανότητες θανάτου.

Η

Για την TJU Cohort, οι Lys σε επίπεδο πληθυσμού εκτιμάται ότι να είναι 9,10 (95% CI: (9.05, 9.14)) και QALYs εκτιμήθηκαν ως 8,18 (95% CI: (8.13, 8.22)) σε σύγκριση με 9,04 Lys (95% CI: (8.99, 9.08)) και 8,19 QALYs (95 % CI: (8.15, 8.24)) για την εξατομικευμένη μοντέλο. Όπως φαίνεται στον Πίνακα 2, βρέθηκαν σημαντικές διαφορές για τις 5 και 10 ετών BCR-free πιθανότητες και την ΚΟΑ ή πιθανότητες θανάτου.

Η έκδοση σε επίπεδο πληθυσμού του υπόδειγμα εκτιμά το μεγαλύτερο προσδόκιμο Lys και ελαφρώς χαμηλότερη QALYs σε σύγκριση με όταν χρησιμοποιούνται εξατομικευμένα πιθανότητες. Αυτές οι διαφορές και οι διαφορές στο BCR και ΚΟΑ αποτελέσματα συμβαίνουν, παρά το γεγονός ότι και οι δύο εκδόσεις του μοντέλου ενσωματώνουν τις εκτιμήσεις ηλικία ειδικά της πιθανότητας θανάτου από άλλες αιτίες.

Επίδραση του Γονιδιωματική-Based αποφάσεις

Χρησιμοποιήσαμε την ετερογενή έκδοση του μοντέλου για να συγκρίνουν τη χρήση των αποφάσεων θεραπείας γονιδιωματικής που βασίζονται στη συνήθη αποφάσεις για τη θεραπεία φροντίδας. Για την Κλινική Μάγιο Cohort, θεραπεία GC-based οδήγησε σε μεγαλύτερη αναμένεται Lys-8,85 έναντι 8,82 (p & lt? 0.001) -και μεγαλύτερη αναμένεται QALYs-8,10 έναντι 8,03 (p & lt? 0.001). Για την TJU Cohort, θεραπεία GC-based οδήγησε σε μεγαλύτερη αναμένεται Lys-9,07 έναντι 9,04 (p & lt? 0.001) -και μεγαλύτερη αναμένεται QALYs-8,25 έναντι 8,19 (p & lt? 0.001). Επιπλέον, από τον Πίνακα 3 βλέπουμε ότι οι 5 και 10 ετών αποτελέσματα για BCR και ΚΟΑ είναι σημαντικά καλύτερη σε θεραπεία GC-based, με εξαίρεση της πιθανότητας 5 ετών ΚΟΑ ή θανάτου για την Mayo Clinic Cohort.

επίσης, παρατηρούμε από το σχήμα. 2 ότι ενώ η θεραπεία εμφανίζεται νωρίτερα κατά μέσο όρο (που οφείλεται σε ένα μεγαλύτερο ποσοστό των ασθενών που λάμβαναν επικουρική θεραπεία) BCR συμβεί αργότερα υπό θεραπεία GC-based από το συνηθισμένο θεραπεία φροντίδας κατά την εξέταση Lys και QALYs. Το ίδιο ισχύει και για τα αποτελέσματα που κοόρτης TJU φαίνεται στο S2 Σχ. Ως αποτέλεσμα, οι ασθενείς υπό θεραπεία GC-based αφιέρωναν περισσότερο χρόνο στο χωρίς ενδείξεις της νόσου (NED) κλινική κατάσταση. Για την Κλινική Μάγιο Cohort, ο μέσος χρόνος που δαπανάται στο NED κάτω γονιδιωματικής που βασίζονται φροντίδα είναι 7.74 Lys σε σύγκριση με 7,59 Lys σύμφωνα με τη συνήθη φροντίδα (p & lt? 0.001)? για την TJU Cohort ο μέσος χρόνος που δαπανάται στο NED κάτω γονιδιωματικής που βασίζονται φροντίδα είναι 7.84 Lys σε σύγκριση με 7,70 Lys σύμφωνα με τη συνήθη φροντίδα (p & lt? 0.001). Τα αποτελέσματα της ανάλυσης ευαισθησίας παρουσιάζονται στο S3 Εικ. και S3 Πίνακας

BCR = βιοχημική υποτροπή.? NED = καμία ένδειξη της νόσου? GC = γενωμική ταξινομητή.

Η

ΣΥΖΗΤΗΣΗ

Έχουμε αναπτύξει ένα μοντέλο αναλυτική απόφαση σχεδιάστηκε για να αξιολογήσει την επίδραση της εξατομικευμένης πιθανότητες μετάστασης μετά την RP σχετικά με τα αποτελέσματα. Παρατηρήσαμε ότι η ενσωμάτωση ατομικός κίνδυνος GC ως εισροές για τον κίνδυνο ανάπτυξης ΚΟΑ, σε σύγκριση με τις τιμές σε επίπεδο πληθυσμού, οδήγησαν σε διαφορετικά αποτελέσματα. Αυτό υποδηλώνει ότι από την εξέταση των εξατομικευμένων εισόδους για την εξέλιξη της νόσου μπορεί να βελτιώσει τις εκτιμήσεις αναπτυχθεί χρησιμοποιώντας μεθοδολογίες απόφαση αναλυτική. Η χρήση του κινδύνου GC για να καθοδηγήσει τις αποφάσεις της θεραπείας συσχετίστηκε με μικρές, αλλά σημαντικές, αυξήσεις Lys, QALYs, και ο χρόνος που δαπανάται στα ΔΝΕ πριν και μετά τη θεραπεία καταστάσεων, καθώς και η βελτίωση των αποτελεσμάτων 5 και 10 ετών. Για τις γνώσεις μας, αυτή είναι η πρώτη έκθεση που δημοσιεύθηκε στη χρήση εξατομικευμένων μεθοδολογία ανάλυσης αποφάσεων για την αξιολόγηση της κλινικής χρησιμότητας της δοκιμασίας διαστρωμάτωση κινδύνου γονιδιωματικής που βασίζονται στον καρκίνο του προστάτη. Αυτή η προσέγγιση CER παρέχει ένα δυναμικό μοντέλο για την εκτίμηση της κλινικής χρησιμότητας της κάθε γονιδιωματικής ανάλυσης όταν υποψήφιους δεδομένων κλινικά αποτελέσματα δεν είναι ακόμα διαθέσιμα.

Τα ευρήματα αυτά υποδηλώνουν ότι η εξέταση μεμονωμένων πιθανότητες κινδύνου GC μετά από προστατεκτομή μπορεί να βελτιώσει την κλινική έκβαση για τον καρκίνο του προστάτη ασθενείς. Κλινική σημασία φαίνεται κυρίως από τα στατιστικά σημαντικές βελτιώσεις σε 5 και 10 ετών, οι πιθανότητες της BCR, ΚΟΑ, και το θάνατο. Επιπλέον, το μέγεθος των παροχών QALYs που παρατηρήθηκε στην παρούσα μελέτη είναι παρόμοια με εκείνα που αναφέρθηκαν για γονιδιωματική προγνωστικές δοκιμασίες έχουν σχεδιαστεί για να τεκμηριωθούν αποφάσεις επικουρική χημειοθεραπεία για καρκίνο του μαστού και καρκίνο του παχέος εντέρου, περιλαμβανομένης της Breast Cancer OncotypeDX Test (Genomic Health Inc., Redwood City, CA) που είναι σήμερα σε κλινική χρήση [26-28]. ανάλυση ευαισθησίας δείχνει ότι περισσότερο επιθετική χρήση της διάσωσης και επικουρική θεραπεία για την υψηλή βαθμολογία GC θα μπορούσε να επεκτείνει τις παρατηρούμενες αυξήσεις σε QALYs έως 0,08 QALYs. Αυτό παρέχει περαιτέρω απόδειξη ότι η χρήση της γονιδιωματικής δοκιμασίες διαστρωμάτωση του κινδύνου να καθοδηγήσουν αποφάσεις για τη θεραπεία μπορεί να βελτιώσει τα αποτελέσματα.

Η μελέτη αυτή συμβάλλει στη βάση αποδεικτικών στοιχείων για τη γονιδιωματική γνώμονα προστάτη φροντίδα του καρκίνου με την εκτίμηση του δυναμικού κατάντη κλινική χρησιμότητα μιας γονιδιωματικής δοκιμασίας σχεδιασμένη για να παρέχει εξατομικευμένη προβλέψεις του κινδύνου μετάστασης. Πριν εκθέσεις κατέδειξε τη σημασία της εξέτασης ατομικών προτιμήσεων των ασθενών για τα αποτελέσματα της θεραπείας κατά τη σύγκριση του προστάτη θεραπείες για τον καρκίνο, χρησιμοποιώντας μεθοδολογία απόφαση αναλυτική [16,29,30]. Στην παρούσα μελέτη, επεκτείναμε την εξατομικευμένη πλαίσιο ανάλυσης απόφαση να συμπεριληφθούν εξατομικευμένα αποτελέσματα κίνδυνο GC όπως εξατομικευμένες εισόδους σε μια ανάλυση απόφαση του επικουρικού και διάσωσης θεραπείες για τον καρκίνο του προστάτη. Η μεθοδολογία αυτή μπορεί να είναι μια χρήσιμη προσέγγιση για την εκπροσώπηση ετερογένεια μεταξύ των ασθενών με τη μορφή της γονιδιωματικής καθορισμένες πιθανότητες των αποτελεσμάτων της θεραπείας, και η ευρετική μοντέλο μπορεί να επεκταθεί για να συμπεριλάβει ένα ευρύ φάσμα προσωπικά χαρακτηριστικά εκτός από την γονιδιωματική όγκου.

τα μοντέλα ανάλυσης απόφαση περιορίζεται από την ποιότητα και την ακρίβεια των εισροών μοντέλο. Οι είσοδοι χρησιμότητα που χρησιμοποιούνται στο τρέχον μοντέλο ελήφθησαν από τη δημοσιευμένη βιβλιογραφία και ενσωματώθηκαν στο μοντέλο ως οι μέσοι όροι σε επίπεδο πληθυσμού. Προηγουμένως έχει δειχθεί στον καρκίνο του προστάτη που οι εκτιμήσεις χρησιμότητα του πληθυσμού σε επίπεδο οδηγήσει σε συστάσεις ανάλυσης αποφάσεων που διαφέρουν από αυτούς που χρησιμοποιούν εξατομικευμένες τιμές χρησιμότητας [16,29,30]. Αυτό ήταν πέρα ​​από το πεδίο εφαρμογής της παρούσας μελέτης, και την ένταξη των εξατομικευμένων εκτιμήσεων χρησιμότητας θα παρουσίαζε μια ξεχωριστή λίστα των μεθοδολογικές προκλήσεις [31]. Επιπλέον, οι βελτιώσεις στην παρατηρούμενη αποτελέσματα στην παρούσα μελέτη πρέπει να σταθμίζονται έναντι του πρόσθετου κόστους παροχής γονιδιωματικής με γνώμονα την φροντίδα για τον καρκίνο. Μια λεπτομερής ανάλυση κόστους-αποτελεσματικότητας της ανάλυσης GC είναι πέρα ​​από το πεδίο εφαρμογής της παρούσας έκθεσης, αλλά αποτελεί το αντικείμενο της εν εξελίξει έρευνας από την ομάδα μας.

Επί του παρόντος, το επίπεδο μου στοιχεία δεν είναι διαθέσιμα στοιχεία σχετικά με τη σχετική αποτελεσματικότητα του επικουρικού και σώσει τη θεραπεία του καρκίνου του προστάτη σε ασθενείς με υψηλά έναντι πιθανότητες χαμηλού κινδύνου GC, αλλά αυτά τα δεδομένα θα μπορούσε να βελτιώσει τις εκτιμήσεις της επιτυχίας της θεραπείας και την περαιτέρω επιρροή προβλέψει τα αποτελέσματα. Στην ουσία, ο προσδιορισμός GC επανακατατάσσει μεμονωμένους ασθενείς βασίζονται κίνδυνο μεταστατικής νόσου, που παρέχουν εξατομικευμένες πληροφορίες που μπορούν να καθοδηγήσουν θεραπευτικές αποφάσεις. Με τον τρόπο αυτό, η ανάλυση GC μπορεί να παρέχει μια βάση για τον εξορθολογισμό και βελτίωση της λήψης αποφάσεων για την τέχνη και SRT για ασθενείς με καρκίνο του προστάτη, μια περιοχή σημαντικής διαμάχης και της αβεβαιότητας στη σύγχρονη κλινική πράξη [32-34]. Είτε αυτό θα οδηγήσει σε μεταγενέστερους βελτίωση στα ποσοστά θανάτου από καρκίνο του προστάτη θα σχετίζονται εν μέρει με τη διαθεσιμότητα αποτελεσματικών θεραπειών για την πρόληψη της μετάστασης. Ωστόσο, η ανάλυση GC μπορεί τουλάχιστον να παρέχει μια ποσοτική εργαλείο για τον εντοπισμό των ασθενών με χαμηλό κίνδυνο μετάστασης που μπορεί να γλιτώσει την τοξικότητα του ART. Ένας περιορισμός του σημερινού μοντέλου είναι η υπόθεση ότι το πρόσθετο και διάσωσης θεραπείες έχουν παρόμοια ανάλογη αποτελεσματικότητα, ανεξαρτήτως του κινδύνου GC. Η σχετική αποτελεσματικότητα του επικουρικού και διάσωσης θεραπείες για τους ασθενείς υψηλότερο και χαμηλότερο κίνδυνο αναμένεται να επηρεάσει επίσης τα αποτελέσματα του μοντέλου. Εμείς απευθύνεται αυτόν τον περιορισμό με την υποβολή της αποτελεσματικότητας της επικουρικής θεραπείας και διάσωσης (δηλαδή, η πιθανότητα της αναδιανομής προς το κράτος NED) και της πιθανότητας να λαμβάνουν θεραπεία με βάση την βαθμολογία GC με αναλύσεις ευαισθησίας. Το μοντέλο μας ανέλαβε επίσης τέλεια απόδοση της δοκιμής GC, παρά κάποια εγγενή αβεβαιότητα στην πρόβλεψη του προσδιορισμού της πιθανότητας μετάστασης σε 5 χρόνια μετά RP [17]. Είναι απίθανο ότι αυτό επηρέασε τα αποτελέσματα του μοντέλου, που ήταν ανθεκτικό σε μια σειρά από μονόδρομη ανάλυση ευαισθησίας καθώς και πιθανολογική ανάλυση ευαισθησίας.

Τα ευρήματά μας υποδηλώνουν ότι η γονιδιωματική πιθανότητες κινδύνου προσφέρουν στατιστικά σημαντικό κλινικό όφελος για τον καρκίνο του προστάτη ασθενείς που αντιμετωπίζουν με τις αποφάσεις για τη θεραπεία δεύτερης γραμμής μετά την προστατεκτομή. Αυτό φαίνεται μέσα από τις βελτιώσεις που παρατηρήθηκαν σε Lys, QALYs, και τις πιθανότητες της BCR, ΚΟΑ, και το θάνατο, όταν οι αποφάσεις της θεραπείας έγιναν με βάση τον κίνδυνο GC αντί για τη συνήθη φροντίδα. Η εφαρμογή μας εξατομικευμένης ανάλυσης απόφαση αποδεικνύει τη χρησιμότητα των CER για την εκτίμηση κλινική χρησιμότητα των δοκιμασιών πρόβλεψης κινδύνου γονιδιωματική-based. Μελλοντικές εφαρμογές των εξατομικευμένων μεθόδων απόφαση αναλυτική για τη διάγνωση της ιατρικής ακρίβεια θα πρέπει να περιλαμβάνει τα εξής: αξιολόγηση της σχέσης κόστους-αποτελεσματικότητας? ενσωμάτωση πρόσθετα χαρακτηριστικά που υπόκεινται σε επίπεδο συμπεριλαμβανομένων και άλλων κλινικών και παθολογικών παραγόντων, ιατρικές συνοδά νοσήματα, καθώς και προγνωστικούς παράγοντες της κανονικής τραυματισμό ιστού ή ανταπόκριση στη θεραπεία γονιδιωματική-based? και τις προτιμήσεις του ασθενούς για τις επιλογές θεραπείας. Αυτές οι πρόσθετες εκτιμήσεις μπορούν να δημιουργήσουν ένα πλαίσιο ανάλυσης των αποφάσεων που αντιπροσωπεύει μια ολοκληρωμένη πλατφόρμα για την εξατομικευμένη ιατρική.

Υποστήριξη Πληροφορίες

S1 κειμένου. . Επικύρωση και Ανάλυση Ευαισθησίας

Αυτή η ενότητα περιλαμβάνει τα πλήρη στοιχεία σχετικά με την ανάλυση ευαισθησίας

doi:. 10.1371 /journal.pone.0116866.s001

(DOCX)

S1 δεδομένων. . Δεδομένων σε ατομικό επίπεδο για την ηλικία του ασθενούς και για την γονιδιωματική ταξινομητή-προέβλεψε 5-ετή πιθανότητα μετάστασης για ομάδες αξιολογούνται σε αυτό το μοντέλο

Τα στοιχεία αυτά περιλαμβάνουν τις εξατομικευμένες εισόδους για το μοντέλο απόφασης αναλυτική

doi:. 10.1371 /περιοδικό. pone.0116866.s002

(XLS)

S1 Εικ. δομή δέντρου απόφασης για τη διαδικασία λήψης αποφάσεων prosatectomy μετά ριζική.

Οι βραχίονες διάσωσης και ακτινοθεραπεία (χαρακτηρισμένα ως διάσωσης Tx και Επικουρική Tx) το καθένα εκπροσωπεί την θεραπεία θεραπεία θεραπείες ακτινοβολίας, ορμονοθεραπεία, και η ακτινοβολία και ορμόνες.

doi : 10.1371 /journal.pone.0116866.s003

(TIFF)

S2 Εικ. . Το χρόνο σε έτη ζωής (Lys) σε κράτη (Subfigure Α), και την ποιότητα προσαρμοσμένο χρόνια ζωής (QALYs) σε κράτη (Subfigure Β) για την TJU Cohort

BCR = βιοχημική υποτροπή? NED = καμία ένδειξη της νόσου? TJU = Πανεπιστήμιο Τόμας Τζέφερσον? . GC = γενωμική ταξινομητή

doi: 10.1371 /journal.pone.0116866.s004

(TIFF)

S3 Εικ. Επιδράσεις στην QALYs από μεταβολές στις τιμές πιθανότητας κατά +/- 10% για τη Mayo Clinic Cohort.

Θεραπεία GC-based αναφέρεται σε αποφάσεις για τη θεραπεία γίνεται με βάση την ανάλυση γονιδιωματικής ταξινομητή κίνδυνο. BCR = βιοχημική υποτροπή? . GC = γενωμική ταξινομητή

doi: 10.1371 /journal.pone.0116866.s005

(TIFF)

S1 πίνακα. πιθανότητα μετάβασης και τις εισροές που χρησιμοποιούνται ως εισροές σε επίπεδο ομάδας για το υπόδειγμα χρησιμότητας.

Όταν οι ασθενείς βρίσκονται σε θεραπεία, η χρησιμότητα κατάσταση υγείας πολλαπλασιάζεται με το βοηθητικό κατάσταση επεξεργασίας. Οι αναφορές που περιλαμβάνονται [5, 8, 22-24, 37-42], καθώς και σημειώσεις για να εξηγήσει, όταν οι πιθανότητες και τα βοηθητικά προγράμματα που εφαρμόζονται στο πλαίσιο του μοντέλου. Εκτός αν άλλως αναφέρει, η περιοχή που χρησιμοποιείται στην ανάλυση ευαισθησίας ήταν 10% υψηλότερη και η χαμηλότερη από την τιμή εισόδου

doi:. 10.1371 /journal.pone.0116866.s006

(DOCX)

S2 πίνακα. Οι πιθανότητες απόφαση θεραπεία για την επικουρική και διάσωσης θεραπείες.

Το πρότυπο των πιθανοτήτων φροντίδας που προέρχονται από τη δημοσιευμένη βιβλιογραφία [10,11,35-37], και αντικατοπτρίζουν πιθανότητα που λαμβάνουν θεραπεία υπό τις συνήθεις ρυθμίσεις φροντίδας. Οι εναλλακτικές, γονιδιωματική-ταξινομητής βαθμολογίας με βάση τις πιθανότητες θεραπείας προήλθαν από μια δημοσιευμένη έκθεση για την αξιολόγηση των συστάσεων γιατρό για θεραπεία με βάση τη δοκιμή γονιδιωματικής ταξινομητή. Για τις αποφάσεις της θεραπείας, οι βαθμολογίες του κινδύνου γονιδιωματική ταξινομητή θεωρήθηκαν είτε χαμηλού κινδύνου ή υψηλού κινδύνου με βάση ένα κατώτατο όριο που υπολογίζεται κίνδυνο μακρινή μετάσταση του 6% στα 5 χρόνια, σύμφωνα με την παρατηρούμενη επίδραση των βαθμολογιών γονιδιωματικής κινδύνου ταξινομητή στις συστάσεις ουρολόγους »στο ΑΠΟΦΑΣΙΖΟΥΝ μελέτη [15]. Για τις αναλύσεις ευαισθησίας, μια σειρά από +/- 20% χρησιμοποιήθηκε για το πρότυπο των αποφάσεων παρατήρησης φροντίδα για την αξιολόγηση ανακρίβειες στην βασική εκτιμήσεις? μια σειρά από +/- 20% χρησιμοποιήθηκε για τις πιθανότητες θεραπείας παρατήρηση βαθμολογίας με βάση γονιδιωματικής κίνδυνο ταξινομητή για τη μοντελοποίηση των επιπτώσεων των περισσότερο ή λιγότερο επιθετική ενσωμάτωση των δεδομένων γονιδιωματικής κινδύνου στην κλινική πρακτική. * Επιλέχθηκαν πρότυπο των ποσοστών χρησιμοποίησης της θεραπείας φροντίδα εμπειρικά με βάση ένα συνδυασμό της γνώμης των εμπειρογνωμόνων και δημοσιεύονται εκθέσεις της αξιοποίησης ακτινοθεραπεία μετά από ριζική προστατεκτομή [10,11, 35-37]. . GC = γενωμική ταξινομητή

doi: 10.1371 /journal.pone.0116866.s007

(DOCX)

S3 πίνακα. αποτελέσματα της ανάλυσης ευαισθησίας για την Cohort Mayo Clinic, όταν ποικίλες σύσταση θεραπεία επιθετικότητα

GC = γενωμική ταξινομητή

doi:.. 10.1371 /journal.pone.0116866.s008

(DOCX)

Αναφορές

1. Garraway LA, Verweij J, Ballman KV (2013) ογκολογία Ακρίβεια: μια επισκόπηση. J Clin Oncol 31: 1803-1805. doi: 10.1200 /JCO.2013.49.4799. PMID: 23589545

Δείτε το άρθρο

PubMed /NCBI

Google Scholar

Η

2. Garraway LA (2013) Genomics με γνώμονα την ογκολογία: πλαίσιο για μια αναδυόμενη παράδειγμα. J Clin Oncol 31: 1806-1814. doi: 10.1200 /JCO.2012.46.8934. PMID: 23589557

Δείτε το άρθρο

PubMed /NCBI

Google Scholar

Η

3. Simonds NI, Khoury MJ, Schully SD, Armstrong Κ, Cohn WF, et al. (2013) Συγκριτική έρευνα της αποτελεσματικότητας στον τομέα της γονιδιωματικής καρκίνο και την ιατρική ακρίβεια: ρεύματα τοπίο και τις μελλοντικές προοπτικές J Natl Cancer Inst 105: 929-936. doi: 10.1093 /JNCI /djt108. PMID: 23661804

Δείτε το άρθρο

PubMed /NCBI

Google Scholar

Η

4. Goddard ΚΑΒ, Knaus WA, Whitlock Ε, Lyman GH, Feigelson ΕΣ, et al.

You must be logged into post a comment.