Αφηρημένο

Στόχοι

Μια συγχρονική επιδημιολογική μελέτη διερεύνησε τη γενετική προδιάθεση να στόματος και τα προκαρκινικά στάδια του καρκίνου στο Πουέρτο Ρίκο (PR).

Υλικά και Μέθοδοι

Τριακόσια τρία άτομα με καλοήθη στοματική κατάσταση, από του στόματος προκαρκινικά (από του στόματος επιθηλιακή υπερπλασία /υπερκεράτωση, στοματική επιθηλιακή δυσπλασία), ή στοματικό καρκίνωμα πλακωδών κυττάρων (SCCA) ταυτοποιήθηκαν μέσω εργαστηρίων PR παθολογία. Ένα τυποποιημένο, δομημένο ερωτηματολόγιο που λαμβάνονται πληροφορίες σχετικά με την επιδημιολογική μεταβλητές? παρειάς κύτταρα συλλέχθηκαν για γενετική ανάλυση. Γονοτυπική έγινε χρησιμοποιώντας δοκιμασίες TaqMan®. Τα αλληλόμορφα συχνότητες πολυμορφισμών απλού νουκλεοτιδίου (SNPs) αξιολογήθηκαν σε γονίδια κυτοκίνης και γονιδίων που επηρεάζουν μετάσταση όγκων. εκτιμήσεις κινδύνου για τη διάγνωση του στόματος προκαρκινικών ή SCCA ενώ έχουν ένα αλληλόμορφο παραλλαγή δημιουργήθηκαν με τη χρήση της λογιστικής παλινδρόμησης. Προσαρμοσμένη μοντέλα ελέγχονται για κατανάλωση ηλικία, το φύλο, την καταγωγή, την εκπαίδευση, το κάπνισμα και το αλκοόλ.

Αποτελέσματα

Σε σχέση με τα άτομα με καλοήθη προφορική βλάβη, άτομα με ομόζυγο υπολειπόμενο αλληλικές παραλλαγές του παράγοντα νέκρωσης των όγκων ( TNF-α) -238 A /G SNP είχε μειωμένο πιθανότητες να έχουν μια προφορική προκαρκινικά στάδια (ή

προσαρμοστεί = 0,15? 95% CI 0,03 – 0,70). Ο μετασχηματισμός του αυξητικού παράγοντα βήτα-1 (TGFβ-1 -509 C /T) πολυμορφισμού συσχετίστηκε αντίστροφα με την κατοχή προφορική SCCA μεταξύ προσώπων ομόζυγο για το υπολειπόμενο παραλλαγή (ή

αργού = 0,27? 95% CI 0,09 – 0,79). Το γονίδιο μεταλλοπρωτεϊνάσης μήτρας (ΜΜΡ-1) παραλλαγή, rs5854, συνδέθηκε με από του στόματος SCCA? συμμετέχοντες με ακόμη μία παραλλαγή αλληλόμορφου είχαν περισσότερες πιθανότητες να έχουν προφορική SCCA (ή

προσαρμοστεί = 2.62, 95% CI 1,05 – 6,53) σε σύγκριση με τα άτομα με προγονική αλληλόμορφα.

Συμπέρασμα

μας διερευνητικές αναλύσεις δείχνουν ότι οι γενετικές αλλαγές στα γονίδια και τα γονίδια με μεταστατικό δυναμικό του ανοσοποιητικού συστήματος που σχετίζονται με από του στόματος και τα προκαρκινικά στάδια SCCA κινδύνου PR

Παράθεση:. Erdei E, Luo L, Sheng η Maestas Ε, Λευκό KAM, Mackey Α, et al. (2013) Οι κυτταροκίνες και μετάσταση όγκου Gene Παραλλαγές σε καρκίνο του στόματος και τα προκαρκινικά στάδια στο Πουέρτο Ρίκο. PLoS ONE 8 (11): e79187. doi: 10.1371 /journal.pone.0079187

Επιμέλεια: Λουκία Gabriele, Istituto Superiore di Sanità, Ιταλία

Ελήφθη: 28 του Ιανουαρίου του 2013? Αποδεκτές: 24 του Σεπτεμβρίου, 2013? Δημοσιεύθηκε: 20 του Νοέμβρη του 2013

Copyright: © 2013 Erdei et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Η μελέτη έλαβε την υποστήριξη επιχορήγηση από το Εθνικό Ινστιτούτο Υγείας υπό τον αριθμό επιχορήγησης 5U54DE014257-06. Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:. Amanda Mackey είχε προσληφθεί προσωρινά από OsoBio αποστειρωμένη φαρμακευτική Manufacturing Company κατά τη στιγμή της γραφής και την πρώτη κατάθεση αυτού του χειρογράφου. Δεν υπάρχουν διπλώματα ευρεσιτεχνίας, τα προϊόντα για την ανάπτυξη ή την εμπορία προϊόντων που να δηλώνουν. Αυτό δεν αλλάζει την τήρηση των συγγραφέων σε όλες τις PLoS ONE πολιτικές για την ανταλλαγή δεδομένων και υλικών, όπως περιγράφεται λεπτομερώς σε απευθείας σύνδεση στον οδηγό για τους συγγραφείς. Όλοι οι άλλοι συγγραφείς δηλώνουν ότι δεν έχουν καμία σύγκρουση συμφερόντων με τη δημοσίευση των αποτελεσμάτων της μελέτης αυτής.

Εισαγωγή

ποσοστά επίπτωσης από το στόμα και του φάρυγγα καρκίνο (OPC) στο Πουέρτο Ρίκο είναι από τα υψηλότερο στο δυτικό ημισφαίριο [1]. Κατά τη διάρκεια της διεξαγωγής επιδημιολογική μελέτη του καρκίνου του στόματος και τα προκαρκινικά στάδια στο Πουέρτο Ρίκο, εντοπίσαμε ένα έλλειμμα στην ανίχνευση του στόματος προκαρκινικές αλλοιώσεις και

in situ

καρκίνους του νησιού σε σχέση με αυτή που παρατηρήθηκε στην ηπειρωτική χώρα Ηνωμένες Πολιτείες [2], [3]. Εκτός από την κοινωνικο-οικονομική και διαλογή θέματα ανισότητα που είναι πιθανόν υπεύθυνο για την παρατηρούμενη έλλειμμα, γενετικές παραλλαγές στο ανοσοποιητικό σύστημα και τα γονίδια που συμβάλλουν στην μεταστατικό δυναμικό των στοματικών καρκίνων μπορεί να παίζει ένα ρόλο στην υπέρβαση του καρκίνο του στόματος στο νησί.

οι κυτοκίνες είναι μικρές μοριακού βάρους ρυθμιστικές πρωτεΐνες του ανοσοποιητικού συστήματος που εκκρίνονται από ενεργό ανοσοκύτταρα (κυρίως Τ κύτταρα, ειδικά βοηθητικά Τ κύτταρα και τα κύτταρα που παρουσιάζουν αντιγόνο) και άλλους τύπους κυττάρων (επιθηλιακά και ενδοθηλιακά κύτταρα, ινοβλάστες, κερατινοκύτταρα, κ.λπ.), τα οποία αποτελούν μέρος του ανοσοποιητικού συστήματος παρακολούθησης του σώματος [4] – [6]. Μεταβλητότητα των κωδικοποίησης και μη-κωδικοποίησης των γονιδίων κυτταροκινών μπορεί να επηρεάσει σε μεγάλο βαθμό το ανοσοποιητικό δραστηριότητα του συστήματος και της ικανότητάς του να παρακολουθεί και σαφή τα καρκινικά κύτταρα.

Τα ζωικά μοντέλα παρέχουν στοιχεία ενδεικτικά της συμμετοχής των κυτοκινών στη διαδικασία ενεργοποίησης του ανοσοποιητικού συστήματος κατά τη διάρκεια της προφορικής καρκινογένεση [7]. Επιπλέον, μελέτες που διεξήχθησαν στην ινδική υποήπειρο [8], [9], την Ταϊβάν [10], την Ευρώπη [11], και στη νότια Ταϊλάνδη [12] ανέφεραν συσχετίσεις μεταξύ πολυμορφισμών των γονιδίων των κυτταροκινών και τον καρκίνο του στόματος. Μέχρι σήμερα, όμως, οι ενώσεις μεταξύ των παραλλαγών γονιδίων ανοσολογικής απόκρισης του συστήματος δεν έχουν μελετηθεί σε σχέση με το στόμα προ-καρκινικό στάδιο ή καρκίνους μεταξύ Πορτορικανοί.

Επειδή το στόμα ακανθοκυτταρικό καρκίνωμα έχουν μια τάση για μικρομεταστάσεις στο κεφάλι, το λαιμό, και πάνω μέρος του σώματος [13], [14], και υπό το φως της παρατηρούμενης ελλείμματος σε πρώιμο στάδιο της στοματικής των καρκίνων που διαγιγνώσκονται στο Πουέρτο Ρίκο, εκλέξαμε να συμπεριλάβει στην μας αναλύει γενετικές παραλλαγές που έχουν τη δυνατότητα να επηρεάσουν τον καρκίνο του στόματος μετάσταση.

Η τρέχουσα χαρτί αναφέρει τα αποτελέσματα της διερευνητικής ανάλυσης των πολυμορφισμών απλού νουκλεοτιδίου (SNPs) που υπάρχει σε Τ βοηθητικά Th 1 και Th2 κυτοκίνης και μετάσταση όγκου γονιδίων σε σχέση με τον κίνδυνο να διαγνωστεί με ένα στοματικό προκαρκινικά ή καρκίνωμα πλακωδών κυττάρων (SCCA) στο Πουέρτο Ρίκο.

Υλικά και Μέθοδοι

οι συμμετέχοντες στη μελέτη

Λεπτομέρειες σχετικά με τη μελέτη και την εφαρμογή του έχουν αναφερθεί στο παρελθόν [15], [16]. Εν συντομία, κατά τη διάρκεια της περιόδου από τον Φεβρουάριο του 2003 έως τον Οκτώβριο του 2007, όλα τα άτομα που έχουν διαγνωστεί με είτε καλοήθεις στοματική κατάσταση, προφορική προκαρκινικά στάδια, ή από του στόματος SCCA εντοπίστηκαν μέσω ενός από τα έξι εργαστήρια παθολογίας που βρίσκονται γύρω από το Πουέρτο Ρίκο. Αρχικά, από το στόμα των περιπτώσεων καρκίνου δεν είχαν συμπεριληφθεί στην εγγραφή? πρόσληψή τους άρχισε τον Ιούλιο του 2004. Η καλοήθης προφορική συνθήκες (η ομάδα σύγκρισης), ορίστηκαν ως ιστοπαθολογική διάγνωση μιας καλοήθους αδενώματος, αμάλγαμα τατουάζ, κύστη, ίνωμα, ινώδη ιστοκυττόματος, κοκκίωμα, αιμαγγείωμα, incontinentia pigmenti, φλεγμονή, καλοήθους έλκους, λίπωμα, βλεννοκήλη , βλεννογονίτιδα, θηλώματος, σύνδρομο Sjoegren, sialandenitis, ή αντιδραστική, μη-επιθηλιακή υπερπλασία. Προφορική προκαρκινικά στάδια ορίστηκε ως η ιστοπαθολογική διάγνωση του στόματος υπερκεράτωση (HK), από του στόματος επιθηλιακή υπερπλασία (EH), ή από του στόματος επιθηλιακή δυσπλασία (Αγγλικό Λεξικό της Οξφόρδης).

Επιλέξιμες ανατομικές περιοχές περιλαμβάνονται το χείλος (βλεννογόνο), γλώσσα, ούλα, όροφο του στόματος, τον ουρανίσκο, και άλλων και μη καθορισμένων τμημάτων του στόματος (ICD-O-3 C00.3-C00.6, C02-C06).

Μετά την παραλαβή χειρουργός-of-ρεκόρ άδεια να επικοινωνήσετε με ένα προσδιορίζονται με την επιφύλαξη, ήρθαμε σε επαφή με το άτομο, πρώτα μέσω ταχυδρομείου, και στη συνέχεια, μέσω τηλεφώνου για να απαντήσει σε τυχόν ερωτήσεις σχετικά με τη μελέτη και να προγραμματίσετε μια συνέντευξη πρόσωπο με πρόσωπο. Κατά την προγραμματισμένη συνέντευξη πρόσωπο με πρόσωπο και αφού λάβει ενημερωμένη συγκατάθεση, ένας από τους δύο εκπαιδευμένους, τυφλωμένοι ερευνητές χορηγηθεί ένα τυποποιημένο, δομημένο ερωτηματολόγιο. Η συνέντευξη περιελάμβανε ερωτήσεις σχετικά με τους κοινωνικο-δημογραφικούς (π.χ., φυλή /εθνικότητα, ημερομηνία γέννησης), τον τρόπο ζωής (π.χ., η κατανάλωση αλκοόλ, η χρήση καπνού), και διαιτητικά /θρεπτική (π.χ., η κατανάλωση φρούτων και λαχανικών) παράγοντες. Επιπλέον, στοματική κύτταρα ελήφθησαν από την οποία το γενετικό υλικό εκχυλίζεται και αποθηκεύεται. Για να διασφαλιστεί η ακεραιότητα του δείγματος και επαρκή ποσότητα DNA για την εκτενή του γονότυπου, η διαδικασία ενίσχυσης ολόκληρο το γονιδίωμα (WGA) διεξήχθη επίσης.

Τα γονίδια που έχουν επιλεγεί για προσδιορισμό του γονότυπου

Για να επιλέξετε γονίδια για προσδιορισμό του γονότυπου, εξετάσαμε σχετική βιβλιογραφία και ακολούθησε μια προσέγγιση υποψηφίου γονιδίου, λαμβάνοντας παράλληλα υπόψη τα θεμελιώδη γονίδια που μπορούν να διαμορφώσουν την ισορροπία μεταξύ Τ βοηθητικών 1 και 2 (Th1 /Th2) απόκρισης της ενεργοποίησης των Τ κυττάρων, ανοσοκαταστολή [π.χ., αυξητικός παράγοντας μετασχηματισμού βήτα-1 (ΤGFβ-1 )], και το ανοσοποιητικό σύστημα κυψελοειδούς επιτήρησης εναντίον των καρκινικών κυττάρων [ιντερλευκίνες (IL)].

Επιπλέον, συμπεριλάβαμε προηγουμένως δημοσιευθεί γενετικές παραλλαγές εμπλέκονται στην μετάσταση όγκου, π.χ., ενεργοποιητή πλασμινογόνου, ή ουροκινάση, είναι γνωστό ότι παίζουν ένα ρόλο στην αποδόμηση εξωκυτταρικής μήτρας, προάγοντας έτσι τη μετανάστευση των καρκινικών κυττάρων και τον πολλαπλασιασμό [17] – [20], και αρκετές μεταλλοπρωτεϊνασών μήτρας (MMPs), συμπεριλαμβανομένης της ΜΜΡ-1 SNP [21] – [23]. Περαιτέρω, κατά το ότι γενετικές παραλλαγές του υποδοχέα αυξητικού παράγοντα που μοιάζει με ινσουλίνη είχαν προηγουμένως αναφερθεί ότι συνδέεται με την εξέλιξη του στόματος καρκίνωμα επιθηλιακών [24], το οποίο επίσης είχε συμπεριληφθεί στα γονίδια μας ενδιαφέρει.

Επειδή δεν υπάρχει καμία κεντρική , επικυρωμένη πόρων γονιδιωματική πληροφορίες για το Πουέρτο Ρίκο-ειδική κυτοκίνη ή γονίδιο πληροφορίες παραλλαγή του SNP μετάσταση-προώθηση, χρησιμοποιήσαμε συγκρίσεις συχνότητα του Διεθνούς HapMap ευρωπαϊκή καταγωγή και HapMap αφρικανικές γενετικές σύνολα δεδομένων που συγκρίνουν εκείνες στις συχνότητες που λαμβάνονται στο Πουέρτο Ρίκο δείγμα μετά του γονότυπου. Επιπλέον, αξιολογήσαμε τη δυνητική συμβολή του πληθυσμού υποδομή για το διαχωρισμό της επιρροής της εθνικότητας, το οποίο προηγουμένως δημοσιευθεί ως περίπου το 70% του Ευρωπαϊκού, 24,5% της Αφρικής, και 5,7% ανιχνεύσιμη Native American γενετική καταγωγή [15].

η γονοτύπηση εκτελέστηκε χρησιμοποιώντας δοκιμασίες Taqman (Applied Biosystem Inc., τώρα μέρος της LifeTechnologies, Grand Island, Νέα Υόρκη), οι οποίες επιτρέπουν τη χρήση των ανιχνευτών όσο το 13 βάσεις. Ένα μη φθορίζον αποσβέστης εφαρμόστηκε για τον περιορισμό φθορισμό υποβάθρου, και ένα θερμοκυκλωτή ΑΒΙ 7900HT και το σχετικό λογισμικό χρησιμοποιήθηκε για να καθοριστεί το καθεστώς αλληλόμορφο.

Η στατιστική ανάλυση

Οι περιγραφικές πληροφορίες συχνότητας για κάθε αλληλόμορφο παραλλαγή που περιλαμβάνονται στην έρευνά μας προσδιορίστηκε με βάση HapMap δεδομένα καθώς και δεδομένα από τους συμμετέχοντες Πουέρτο Ρίκο. Hardy-Weinberg ισορροπία δοκιμές (HWE) διεξήχθη για την ανίχνευση ασυνήθιστα κατανομές συχνότητας στον πληθυσμό της μελέτης και τις αποκλίσεις από HWE σημείωσε. Εμείς δεν περιλαμβάνουν παραλλαγές που παρεκκλίνει από τις δοκιμές HWE στη γενετική μοντελοποίηση μας.

αλληλόμορφων συχνοτήτων των γενετικών παραλλαγών αξιολογήθηκαν και συγκεντρώνονται από διαγνωστική κατάσταση. Επειδή πολλαπλές SNPs IL-1 και IL-10 κυτοκίνης γονότυπος, εξετάσαμε περαιτέρω αν δομές απλότυπος του ορισμένες παραλλαγές κληρονομούνται σε ανισορροπία σύνδεσης θα μπορούσε να συμβάλλει με διαφορετικό τρόπο από το στόμα προκαρκινικά στάδια ή τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου. HaploView λογισμικού 4.2 έκδοση (MIT Ινστιτούτο Broad, Cambridge, ΜΑ) χρησιμοποιήθηκε για τον προσδιορισμό γενωμική και χρωμοσωμική θέση των απλοτύπων [25]. Ψάξαμε και σε σύγκριση με τη διεθνή HapMap 3 έκδοση των δεδομένων του πληθυσμού να εξακριβώσει δομές μπλοκ εθνικότητα ειδικά. Εμείς ανακτηθεί πληροφορίες μπλοκ για τους λευκούς και τους πληθυσμούς της Αφρικής, η οποία ήταν παρόμοια δομή. Τα ευρωπαϊκά δεδομένα φαίνεται να προσφέρει την πιο κατάλληλη δομή για τους συμμετέχοντες Πουέρτο Ρίκο, περαιτέρω επιβεβαιώνοντας την προηγούμενη εκτίμηση τους προγόνους μας αναλύει στο οποίο βρήκαμε πληθυσμό της μελέτης μας είχαν περίπου το 70 τοις εκατό ευρωπαϊκή καταγωγή [15].

IL-1 και IL -10 απλότυποι ανακατασκευάστηκαν από τα δεδομένα γονότυπο SNP χρησιμοποιώντας το λογισμικό ΦΑΣΗ [26] που χρησιμοποιεί μία Bayesian μέθοδο με την οποία η προηγούμενη αλληλομόρφων διανομής, καταγράφονται σε μια κεντρική πηγή γενετικών πληροφοριών, έργο HapMap, επιλέχθηκε για την προσέγγιση της κατανομής που περιγράφονται στο δείγμα μας [ ,,,0],27], [28].

Σύλλογοι μεταξύ κάθε απλότυπος και τη διάγνωση του στόματος προκαρκινικά στάδια ή καρκίνο εξετάστηκαν από την εκτέλεση παλινδρόμησης τάση απλότυπος. Οι πιθανότητες της ύπαρξης διαφορετικών απλοτύπων για κάθε άτομο ενσωματώθηκαν ως μεταβλητές πρόβλεψης που αντιπροσωπεύουν για την αβεβαιότητα φάσης απλότυπος.

Έχουμε πραγματοποιήσει δοκιμές HWE για το σύνολο του πληθυσμού του δείγματος. Για αυτές τις γενετικές παραλλαγές που συνάντησε HWE (P

HWE & gt? 0.05), που χρησιμοποιείται κυρίαρχα και υπολειπόμενο μοντέλα της νόσου για την εκτίμηση αναλογίες πιθανοτήτων (OR) και τα διαστήματα τους εμπιστοσύνης 95% (95% CI) για να διαγνωστεί με καρκίνο του στόματος ή προκαρκίνου σε σχέση με έχει μια δεδομένη γενετική παραλλαγή. Εφαρμόσαμε επίσης πρόσθετο μοντέλα για τον προσδιορισμό των σχέσεων μεταξύ των επιλεγμένων παραλλαγών γονιδίων σημαντικών στην ανοσολογική δραστικότητα σύστημα, καθώς και γονίδια που επηρεάζουν OPC μεταστατικό δυναμικό, σε κάθε περίπτωση σε σχέση με τον κίνδυνο ασθένειας που σχετίζεται με κάθε έχοντας επιπλέον αντίγραφο του αλληλόμορφου παραλλαγής. ΕΑΠ προσαρμόστηκαν για γνωστούς παράγοντες κινδύνου (ηλικία, φύλο, αυτο-αναφερόμενη καταγωγή, την εκπαίδευση, το κάπνισμα και η κατανάλωση αλκοόλ).

Εμείς δεν εφαρμόζουν πολλαπλές διαδικασίες σύγκρισης για να ρυθμίσετε τα επίπεδα της σημασία για παρατηρούμενη μέτρα του συλλόγου, γιατί μας πρωταρχική αναλυτική στόχος ήταν να διερευνήσει πιθανές συσχετίσεις μεταξύ κάθε παραλλαγή του γονιδίου και των διαφόρων αποτελεσμάτων της νόσου υπό μελέτη. Επιπλέον, εξέφρασαν την ανησυχία ότι η διόρθωση για πολλαπλές συγκρίσεις θα οδηγούσε σε ένα απαράδεκτο επίπεδο των σφαλμάτων τύπου 2.

Για επιλεγμένα SNPs που έδειξε συσχέτιση με το στόμα προκαρκινικά στάδια ή καρκίνο στις στατιστικές και της γενετικής μοντελοποίησης μας, ερευνήσαμε η λειτουργία του ισχύοντος παραλλαγή του γονιδίου χρησιμοποιώντας SNPInfo και FuncPred λογισμικού (https://snpinfo.niehs.nih.gov/snpinfo/guide.htm).

Ηθική Δήλωση

το πρωτόκολλο της έρευνας και της συναινούντων διαδικασίες εξετάστηκαν και εγκρίθηκαν από τις θεσμικές συμβούλια επανεξέταση στο Πανεπιστήμιο της Νέας Υόρκης και το Πανεπιστήμιο του Πουέρτο Ρίκο, Ιατρικών Επιστημών Πανεπιστημιούπολη, Σαν Χουάν, Πουέρτο Ρίκο. Επιπλέον, όπως αποχαρακτηριστούν βιολογικά δείγματα εστάλησαν και το DNA εξάγεται στο Πανεπιστήμιο του Νέου Μεξικού Κέντρο Επιστημών Υγείας, Τμήμα Ιατρικής, το UNM HSC Διοικητικό Institutional Review κριτική για το μοριακό συστατικό του ερευνητικού πρωτοκόλλου και διαπίστωσε ότι δεν συνεπάγονται άνθρωπο και ως εκ τούτου κατατάσσονται ως απαλλάσσονται από την εξέταση.

Γραπτή ενημερωμένη συγκατάθεση λήφθηκε, και το έντυπο συγκατάθεσης όριζε ότι όλοι οι συμμετέχοντες συμφώνησαν να παρέχουν πληροφορίες ερωτηματολογίου για την υγεία και βιολογικών δειγμάτων για ερευνητικούς σκοπούς.

αποτελέσματα

ένα σύνολο ταυτοποιήθηκαν ως έχουν διαγνωστεί με μια μελέτη επιλέξιμες στοματική κατάσταση τριακόσια τρία άτομα, συναίνεσε να συμμετάσχουν στη μελέτη, και εφόσον μπορούν να χρησιμοποιηθούν τα δεδομένα στο ερωτηματολόγιο και η στοματική κύτταρα από τα οποία προέρχονται μπορούν να χρησιμοποιηθούν DNA.

Ο Πίνακας 1 παρουσιάζει συνοπτικά τα χαρακτηριστικά των συμμετεχόντων στην μελέτη από διαγνωστική ομάδα. Ενώ η φυλετική κατανομή ήταν παρόμοια σε όλες τις διαγνωστικές κατηγορίες, πρόσωπα στη στοματική ομάδα SCCA ήταν πιο πιθανό να είναι μεγαλύτερης ηλικίας, άνδρες και λιγότερο μορφωμένοι από ό, τι τα άτομα στα καλοήθη και τα προκαρκινικά στάδια ομάδες. Ο Πίνακας 2 συνοψίζει τα SNPs αξιολογούνται, κατανομή συχνοτήτων τους με βάση HapMap δεδομένων, κατανομή συχνοτήτων τους στη μελέτη μας, και τα αποτελέσματα δοκιμών HWE. Πίνακας 3 εκθέσεις όλες τις συχνότητες αλληλόμορφο από τον διαγνωστικό ομάδα για κάθε αλληλόμορφο παραλλαγή στη μελέτη.

Η

Η

Ο Πίνακας 4 παρουσιάζει τα αποτελέσματα από την υλικοτεχνική μοντέλων παλινδρόμησης μας κυτοκίνης και τις παραλλαγές του γονιδίου μετάσταση-προώθηση, καθώς και απλοτύπων γονίδιο IL-1β, τα οποία πέρασαν HWE. Τα αποτελέσματα παρουσιάζονται στον πίνακα και περιγράφονται παρακάτω σε όρους της πρόβλεψης λειτουργικότητας περιορίζονται σε επιλεγμένες παραλλαγές γονιδίων για τα οποία τουλάχιστον ένα ακατέργαστο ή προσαρμογή OR ήταν 2.0+ ή αντιστρόφως, ≤0.5, δηλαδή βιολογικά νόημα ενώσεις, ή όταν η παρατηρούμενη συσχέτιση ήταν στατιστικώς σημαντική στο επίπεδο 0.05. Τα ευρήματα από όλες τις πρόσθετες αναλύσεις που παρουσιάζονται στον Πίνακα S1, S2, S3.

Η

Βρήκαμε αποδείξεις ότι υπάρχει συσχετισμός μεταξύ rs361525, μια παραλλαγή του TNF-α, και έχοντας μια προφορική προκαρκινικών αλλοιώσεων σε σχέση με έχουν διαγνωστεί με καλοήθη στόματος ανωμαλία. Χρησιμοποιώντας προσθετικό γενετικό μοντέλο, τα άτομα με ομόζυγο υπολειπόμενο αλληλικές παραλλαγές του TNF-α -238 Α /G SNP είχαν σημαντικά μειωμένες πιθανότητες να έχουν μια προφορική προκαρκινικά στάδια (αργό OR = 0.22, 95% CI 0,05 – 0,93) σε σύγκριση με τα άτομα που είχαν ετερόζυγο για την αλληλόμορφη παραλλαγή. Το OR ήταν 0,15 (95% CI 0,03 – 0,70) μετά την προσαρμογή για την ηλικία, το φύλο, το κάπνισμα, η κατανάλωση αλκοόλ, την εκπαίδευση, και αυτο-αναφερόμενη καταγωγή. Όταν συγκεντρώνονται οι δύο περιπτώσεις και τα προκαρκινικά στάδια ακανθοκυτταρικό καρκίνωμα, το ακάθαρτο και προσαρμοσμένοι λόγοι πιθανοτήτων ήταν 0,50 (95% CI 0,22 – 1,13) και 0,30 (95% CI 0,11 – 0,80), αντίστοιχα. Τα ευρήματά μας σχετικά με rs361525 ήταν παρόμοια όταν εργαζόταν κυρίαρχη γενετική μοντελοποίηση.

αξιολόγηση Λειτουργικότητα του TNF-α -238 αλληλουχία του υποκινητή /G A, rs361525 SNP αποκάλυψε ότι αυτή η παραλλαγή αλληλομόρφων, που βρίσκεται σε μια θέση μεταγραφικής παράγοντα δέσμευσης της περιοχής προαγωγέα του γονιδίου TNF-α, μπορεί να διαταράξει άμεσα το επίπεδο, τη θέση ή το χρονοδιάγραμμα της έκφρασης του TNF-α. https://snpinfo.niehs.nih.gov/snpinfo/snpfunc.htm

Πρόσθετες αναλύσεις των γονιδίων κυτταροκινών παραλλαγές δείχνουν επίσης μια σχέση με τον καρκίνο του στόματος ή προκαρκινικά στάδια. Χρησιμοποιώντας ένα μοντέλο πρόσθετο, η ιντερλευκίνη-4 (IL-4) -524 C /T SNP, παραλλαγή rs2243250 αλληλικός συνδέεται σταθερά με ένα σχετικά αδύναμο μείωση των πιθανοτήτων να διαγνωστεί με μια προφορική προκαρκινικά στάδια ή προφορική SCCA? οι ΕΑΠ ήταν στατιστικά σημαντική μόνο όταν το στόμα προκαρκινικές αλλοιώσεις και προφορικές SCCA συνδυάστηκαν και σε σύγκριση με τους συμμετέχοντες με καλοήθεις στόματος ανωμαλίες (αργό OR = 0,70? 95% CI 0,50 – 1,00).

Η πρόβλεψη λειτουργικότητα του αλληλομόρφων rs2243250 παραλλαγή SNP είναι παρόμοια με εκείνη του rs361525 ΤΝΡ-α στην εν λόγω παραλλαγή του γονιδίου θεωρείται δυνητική θέση δέσμευσης παράγοντα μεταγραφής στο οποίο οι αλλαγές μπορούν να επηρεάσουν βαθιά παραγωγή του τύπου Th2 κυτοκίνης.

ο SNP rs1800469, ένα μετασχηματισμό αυξητικού παράγοντα βήτα-1 (TGFβ-1 -509 C /T) πολυμορφισμός, ήταν αρνητικά που συνδέονται με την κατοχή προφορική SCCA μεταξύ προσώπων ομόζυγο για το υπολειπόμενο παραλλαγή (αργό OR = 0,27? 95% CI 0,09 – 0,79). Μετά από προσαρμογή για συμπαράγοντες, η ένωση παρέμεινε ισχυρή, αλλά ήταν μόνο οριακά σημαντική (προσαρμογή OR = 0,26, 0,60 – 1,10).

Όταν χρησιμοποιείται το λογισμικό FuncPred την αξιολόγηση των δυνατοτήτων λειτουργικότητα του TGFβ-1 -509 C /T SNP, είχε προβλεφθεί να είναι μια ισχυρή θέση δέσμευσης για περίπου 50 διαφορετικούς παράγοντες μεταγραφής.

Haploblock ανάλυση των τεσσάρων γονότυπου IL-10 SNPs οδήγησε σε ετικέτες rs1800896 SNP ως σημαντική συμβολή στη δομή απλότυπος. Όταν εξετάσαμε τις τέσσερις πολυμορφισμοί ανεξάρτητα χρησιμοποιώντας ένα υπολειπόμενο γενετικό μοντέλο, ο rs1800896 SNP αρνητικά που συνδέονται με από του στόματος SCCA (Εικόνα 1, Πίνακας 4), ενώ δύο SNPs, rs1800871 και rs1800872, συσχετίστηκαν θετικά με τον κίνδυνο που έχει μια διάγνωση του στόματος προκαρκινικά στάδια ή καρκίνο. ΕΑΠ για την τέταρτη SNP, rs1800890, ήταν ιδιαίτερα ασταθής

Υποσημείωση:. Το γράφημα δείχνει τη φυσική θέση των αλληλόμορφων παραλλαγών στο χρωμόσωμα και εντός του εξεταζόμενου γονιδίου. Μπεϋζιανή ανάλυση χρησιμοποιήθηκε για να εκτιμηθεί η συχνότητα και η δομή των παραλλαγών μεταξύ δείγμα μας σε σύγκριση με τις συχνότητες υγιή δότη HapMap Καυκάσου (βλέπε Μέθοδοι τμήμα για περισσότερες λεπτομέρειες και αναφορές).

Η

Μετά την εκτέλεση πρόβλεψη λειτουργικότητα για την rs1800896, rs1800871 και rs1800872 SNPs, αυτοί αποκαλύφθηκαν ως παράγοντα μεταγραφής τοποθεσίες που επηρεάζουν άμεσα την παραγωγή της IL-10, ένα ουσιώδες τύπου Th2 κυτοκίνης δέσμευσης.

Προσδιορίσαμε επίσης δύο τετράγωνα IL-1 συνεπής με IL-1α και τοποθεσίες IL-1β. Αυτά τα μπλοκ ήταν παρόμοια με καταγράφηκε εθνοτική δομές ομάδα με βάση τα αποτελέσματα επικαιροποιημένης Διεθνές HapMap 3 του έργου (Σχήμα 2). Όταν δημιουργήθηκαν αργού ΕΑΠ, 2 μέλη της IL-1β μπλοκ (rs1143627, rs16944) ως CG απλότυπος συνδέθηκαν με από του στόματος κίνδυνο SCCA (Πίνακας 4)

Υποσημείωση: Το γράφημα παρουσιάζει την πραγματική φυσική θέση του αλληλομόρφων παραλλαγές στο χρωμόσωμα και εντός του γονιδίου της IL-1. Μπεϋζιανή ανάλυση χρησιμοποιήθηκε για να εκτιμηθεί η συχνότητα και η δομή των παραλλαγών μεταξύ δείγμα μας σε σύγκριση με τις συχνότητες υγιή δότη HapMap Καυκάσου (βλέπε ενότητα Μέθοδοι για περισσότερες λεπτομέρειες και αναφορές).

Η

Εκτός από κυτοκίνης πολυμορφισμούς, βρήκαμε ότι μεταξύ του συνόλου των γονιδίων μετάστασης, ένα κρίσιμο γενετική παραλλαγή, rs5854, που βρίσκεται στο γονίδιο μεταλλοπρωτεϊνάσης μήτρας (ΜΜΡ-1), συνδέθηκε με από του στόματος κίνδυνο SCCA. Οι συμμετέχοντες που είχαν έστω και ένα αλληλόμορφο παραλλαγής ήταν πιο πιθανό να έχουν διαγνωστεί με από του στόματος SCCA (προσαρμογή OR = 2.62, 95% CI 1,05 – 6,53) σε σύγκριση με τα άτομα με προγονική αλληλόμορφα (Πίνακας 4).

Το rs5854 SNP είχε προβλεφθεί από το λογισμικό FuncPred να είναι μια θέση πρόσδεσης microRNA. Περαιτέρω, βάσει των πληροφοριών που λαμβάνονται μέσω της βάσης δεδομένων miRBase. (https://www.mirbase.org/index.shtml? University of Manchester, UK), η παρουσία της παραλλαγής Τ επιτρέπει σύνδεση της έξι διαφορετικές miRNAs

συζήτηση

ανοσοποιητικό παραλλαγές του συστήματος θα μπορούσε να αντικατοπτρίζει μια συνολική ανοσοποιητικό σύστημα γενετική προδιάθεση προς την ανάπτυξη του καρκίνου. Η παρούσα μελέτη βασίστηκε σε ένα

a priori

ενδιαφέρον για την αξιολόγηση προ-φλεγμονώδη και αντι-φλεγμονώδεις κυτοκίνες όπως επίσης και γονίδια μετάσταση-προώθηση σε σχέση με την από του στόματος και τα προκαρκινικά στάδια του καρκίνου.

Εμείς αξιολογούνται ενώσεις μεταξύ πολλαπλών SNPs σε σχέση με τις διάφορες εκβάσεις ασθένεια που μας ενδιαφέρει. Με δεδομένη την υπόθεση δημιουργίας φύση της μελέτης, έχουμε εκλεγεί για να αναφέρετε ή ειδικά ευρήματα από καθένα από τα γονίδια και μας απλότυπος ειδικές αναλύσεις κατά πόσον ή όχι μια ένωση εντοπίστηκε και κατά πόσον ή όχι μια παρατηρούμενη συσχέτιση ήταν στατιστικά σημαντική (Πίνακας 4 και Πίνακας S1 μέσω πίνακα S3). Με τον τρόπο αυτό, παρέχουμε άλλους την ευκαιρία να συγκρίνουν τα ευρήματά τους με τη δική μας. Λαμβάνοντας υπόψη τις πολλαπλές αναλύσεις που διεξάγονται, είναι πιθανό ότι ένα ή τον άλλο από τα ευρήματά μας μπορεί να έχει ως αποτέλεσμα και μόνο κατά τύχη. Με αυτή την προειδοποίηση στο μυαλό, η ανάλυσή μας εντόπισε αρκετά SNPs που μπορεί να σχετίζεται με το στόμα προκαρκινικά στάδια ή καρκίνο στο Πουέρτο Ρίκο πληθυσμό της μελέτης.

ισπανόφωνοι υποεκπροσωπούνται στον καρκίνο του στόματος γενετική έρευνα, παρά το γεγονός ότι ορισμένες ομάδες του πληθυσμού, συμπεριλαμβανομένων Πορτορικανοί, έχουν υψηλή στοματική ποσοστά εμφάνισης καρκίνου [1], [29] – [31]. Στην παρούσα εργασία, παρουσιάζουμε τα αποτελέσματα καταδεικνύουν ότι το ανοσοποιητικό σύστημα παραλλαγή μπορεί να επηρεάσει την επιτήρηση των όγκων και ανοσολογική απόκριση μέσω της παραγωγής κυτοκινών. Επιπλέον, βρήκαμε ότι η μήτρα μεταλλοπρωτεϊνάσης-1 γενετική παραλλαγή, ακόμη και η παρουσία μόνο μία παραλλαγή αλληλόμορφου, αύξησε τον κίνδυνο να έχουν καρκίνο του στόματος μεταξύ Πορτορικανοί.

Είναι σημαντικό να σημειωθεί ότι αν και η Διεθνής HapMap εκθέσεις βάση δεδομένων των πληροφοριών «, Ισπανόφωνος εθνότητα» γονότυπος και η συχνότητα αλληλόμορφο για τα περισσότερα από τα SNPs που χρησιμοποιείται στη μελέτη μας, HapMap δεδομένα συγκεντρώθηκαν με τη χρήση γενετικού υλικού από Μεξικού δωρητών, η οποία δεν είναι απαραίτητα ανακλαστικά του Πορτορικανοί ή γενετική καταγωγή τους. Για την ενίσχυση της προσβασιμότητας του Πουέρτο Ρίκο συγκεκριμένες γενετικές πληροφορίες, παρέχουμε δεδομένα συχνότητας, στρωματοποιημένη κατά διαγνωστικά ομάδα, για κάθε μία από τις παραλλαγές υπό μελέτη.

Ο παράγοντας νέκρωσης όγκων άλφα (TNF-α) πολυμορφισμοί σημειώνονται συχνά στον καρκίνο του στόματος έρευνα [10], [32] – [34]. ΤΝΡ-α προάγει την καρκινική κυτταρική απόπτωση και σχετίζονται με όγκους θανάτωση μέσω του συνδέτη παράγοντα νέκρωσης όγκων που σχετίζονται με την απόπτωση που επάγει (TRAIL) οδού σηματοδότησης. Nuotomi et al. και Sharma στο Ελ. τόσο διαπίστωσε ότι η rs361525 υποκινητή -238 παραλλαγή αυξημένη έκφραση του TNF-α και είχε ως αποτέλεσμα αυξημένη παραγωγή της κυτοκίνης [35] στον ορό, [36]. Μπορούν τεκμηριώνεται επίσης αυξημένη έλξη των κοκκιοκυττάρων ουδετερόφιλων στον πνεύμονα από την παραγωγή TNF-α. Με βάση τα ευρήματά τους, μπορεί κανείς να υποθέσει ότι μία αυξημένη φαινότυπο παραγωγός θα μπορούσε να είναι επωφελής κατά τη διάρκεια του στόματος καρκινογένεση.

Το ίδιο ΤΝΡ-α SNP, rs361525, -238 ιντρονικές Μια αλληλόμορφη παραλλαγή προηγουμένως περιγράφεται ως λιγότερο συχνές από του στόματος περιπτώσεων καρκίνου στην Ταϊβάν σε σχέση με τους υγιείς μάρτυρες [10], ένα εύρημα σύμφωνο με την προστατευτική συσχέτιση που παρατηρήθηκε μεταξύ Πουέρτο Ρίκο περιπτώσεις. Συγκεκριμένα, η πιθανή προστατευτική δράση που παρατηρήθηκε στη μελέτη μας ήταν ισχυρή, ειδικά όσον αφορά προκαρκινικές αλλοιώσεις. Η ομοιότητα των αποτελεσμάτων σε όλη ανόμοιων πληθυσμούς εντάλματα περαιτέρω, πιο λεπτομερή καρκίνο του στόματος έρευνας για τη γενετική προδιάθεση.

Haploblock ανάλυση των τεσσάρων γονότυπου ιντερλευκίνη 10 (IL-10) SNPs αποκάλυψε ότι ένας SNP (rs1800896) ήταν αρνητικά που συνδέονται με από του στόματος SCCA, ενώ δύο άλλες SNPs, rs1800871 και rs1800872, συσχετίστηκαν θετικά με τον κίνδυνο που έχει μια διάγνωση του στόματος προκαρκινικά στάδια ή καρκίνο. Αυτά τα αποτελέσματα δείχνουν ότι σε μελλοντικές μελέτες θα είναι φρόνιμο να διερευνήσει αυτές τις αλληλόμορφες μεταβολές ανεξάρτητα, παρά τη χρησιμοποίηση ενός SNP tagging που κρύβει ενδεχομένως άγνωστες επιπτώσεις των συνδεδεμένων παραλλαγών και μειώνει ψευδώς τις επιδράσεις της IL-10 γενετικές παραλλαγές σε προφορική καρκινογένεση.

Interleukin1 (IL-1) είναι ένα από τα ισχυρότερα κυτοκινών ενεργοποιητής Τ κυττάρων. Υψηλή παραγωγή β IL-1 έχει αναφερθεί ότι είναι ανοσοκατασταλτικό σε

in vitro

καλλιέργειες του στόματος πλακώδες καρκίνωμα, αλλά ο ρόλος των διαφόρων αλληλικών παραλλαγών επί του στόματος κίνδυνο καρκίνου δεν έχει διερευνηθεί μέχρι σήμερα. Με βάση την ανάλυση μας, η παραλλαγή απλότυπος CG του rs1143627 και rs16944 SNPs της IL-1β γονίδιο ήταν σημαντικά σχετίζεται με αυξημένο κίνδυνο να έχουν από του στόματος SCCA χρησιμοποιώντας ένα μοντέλο πρόσθετης ασθένεια.

ιντερλευκίνη 4 (IL-4) είναι που εμπλέκονται στη ρύθμιση της απόπτωσης και της μετανάστευσης των μακροφάγων σε πολλές μορφές καρκίνου. Η δράση του IL-4 κατά τη διάρκεια καρκινογένεσης που πιθανά σχετίζονται με την παρουσία και την επαγόμενη κυτταρική δραστηριότητα του σχετιζόμενου με τον όγκο μακροφάγων (ΤΑΜ), οι οποίες εμφανίζουν λεγόμενες φαινοτύπους Μ2 που προωθούν την εξέλιξη και τη μετάσταση του καρκίνου [37] – [39]. Επιπλέον, αυτά τα μακροφάγα ενισχύσει την αναδιαμόρφωση μήτρας η οποία συνδέει το ανοσοποιητικό σύστημα κυτταρικής δραστηριότητας με μεταστατικό δυναμικό, ιδίως μέσω ΜΜΡ-1 ενεργοποίησης [40].

Σύμφωνα με τα αποτελέσματά μας που δείχνουν μια πιθανή προστατευτική επίδραση της παραλλαγής rs2243250 έναντι όγκου ανάπτυξη, έχει αναφερθεί ότι στον καρκίνο του προστάτη, η IL-4 5 ‘παραλλαγή της αλληλουχίας υποκινητή, rs2243250 μειώνει IL-4 δραστικότητα [41].

αυξητικού παράγοντα μεταμόρφωσης βήτα υπεροικογένειας των κυτοκινών θεωρείται ότι έχει πολύπλοκες και αντιφατικές επιδράσεις στην ανάπτυξη σε διάφορες μορφές καρκίνου. Βρήκαμε ότι το SNP rs1800469, ένας πολυμορφισμός υποκινητή αυξητικό παράγοντα μετασχηματισμού βήτα-1 (ΤGFβ-1 -509 C /T), έδειξε προστατευτικά αποτελέσματα σε σχέση με τον καρκίνο του στόματος. Επιπλέον, το SNP είχε προβλεφθεί από το λογισμικό και τη λογική FuncPred ελαχιστοποίησης να είναι μια ισχυρή θέση σύνδεσης για περίπου 50 διαφορετικούς παράγοντες μεταγραφής. Τα ευρήματά μας υπογραμμίζουν την ανάγκη για περισσότερο καρκίνο του στόματος προσανατολισμό, βασικές ανοσολογικές μελέτες? ίσως

in vitro

πειράματα στα οποία αυτή η θεμελιώδης κυτοκίνη μπορεί να χρησιμοποιηθεί για κλινικό όφελος σε προφορική πρόληψη του καρκίνου.

Μετά την προσαρμογή για συμπαράγοντες, βρήκαμε ότι τα άτομα με ένα ή περισσότερα παραλλαγή αλληλόμορφου για την MMP -1 SNP, rs5854, είχε πάνω από μια αύξηση κατά 2,5 φορές στις αποδόσεις της προφορικής SCCA. Παρόμοια με τα ευρήματά μας, μια προηγούμενη μελέτη στην οποία συμμετείχαν 96 ασθενείς ανέφεραν κινέζικα ότι η παρουσία του ΜΜΡ-1 ομόζυγη αλληλικές παραλλαγές στην περιοχή του υποκινητή του γονιδίου συνέβαλαν σε αυξημένο κίνδυνο στοματικό καρκίνωμα πλακωδών κυττάρων [42].

πρωτεΐνες ΜΜΡ-1, που ονομάζεται επίσης διάμεση κολλαγενάσες, σπάσει την εξωκυτταρική μήτρα υπό κανονικές αναπτυξιακές και ασθένειας διεργασίες. MMPs συχνά σημειώνονται ως παράγοντες που συμβάλλουν σε μετάσταση καρκίνου, επιτρέποντας αναδόμηση του συνδετικού ιστού που περιβάλλει τον όγκο. Το ένζυμο ΜΜΡ-1 διασπά τους τύπους Ι, II, και III διάμεση κολλαγόνα.

Πρέπει επίσης να παρέχουν νέες πληροφορίες βασίζονται Πουέρτο Ρίκο στόματος περιπτώσεων καρκίνου μας δείχνει ότι το αλληλόμορφο Τ του γονιδίου ΜΜΡ-1 προάγει δυνητικά αρκετές θέσεις πρόσδεσης microRNA. Έχει προταθεί ότι miRNA ακολουθίες μπορούν να επηρεάσουν όχι μόνο γονίδιο έκφρασης, αλλά επίσης να συμβάλουν στην προτύπων μεθυλίωσης και μεταβολές δραστηριότητα σε μερικούς επιθηλιακούς όγκους [43], [44].

ΜΜΡ-1 έχει χρησιμοποιηθεί ως στόχος της πρώτης γενιάς αναστολέα μεταλλοπρωτεϊνάσης μήτρας, πρώτα ως συμπλήρωμα στη συνήθη χημειοθεραπεία σε ασθενείς μη μικροκυτταρικός καρκίνος του πνεύμονα και στη συνέχεια στη θεραπεία των καρκίνων του προστάτη και σαρκώματος σχετίζονται με τον HIV Kaposi. Τα αποτελέσματά μας υποδεικνύουν γενετική προδιάθεση στην ΜΜΡ-1 γονίδιο που θα μπορούσε να έχει δυνατότητα εφαρμογής σε στοματική καρκινώματα πλακωδών κυττάρων? Ωστόσο, με βάση την βάση δεδομένων πληροφοριών Κλινικών Δοκιμών National Cancer Institute, ΜΜΡ-1 αναστολής δεν έχει ποτέ χρησιμοποιηθεί σε από του στόματος θεραπεία του καρκίνου (https://www.cancer.gov/clinicaltrials/search/results?protocolsearchid=8196085).

στο σύνολό τους, τους πιθανούς βιολογικούς δεσμούς καταδείχθηκαν στην ανάλυσή μας? βρήκαμε ότι η IL-4 παραλλαγές ήταν παρόντες στο Πουέρτο Ρίκο συμμετέχοντες, και οι ανιχνεύονται παραλλαγές μπορούν να επηρεάσουν διηθούν όγκο δραστηριότητας των μακροφάγων και η παρουσία τους μέσα και γύρω από τις βλάβες. Οι διηθούν όγκο Μ2 μακροφάγα προώθηση της διαδικασίας αναδιαμόρφωσης μήτρα μέσω αυξημένης ενεργοποίησης ΜΜΡ-1. Εντοπίσαμε ότι ακόμη και μια παραλλαγή αλληλόμορφο του γονιδίου ΜΜΡ-1 αυξάνει τον κίνδυνο να έχουν καρκίνο του στόματος διάγνωση στο Πουέρτο Ρίκο. MMP-1 ενεργοποίηση ενισχύει την εξάπλωση των καρκινικών κυττάρων, συμβάλλοντας έτσι στην αύξηση μεταστατικό δυναμικό του στόματος όγκους και προχωρημένο στάδιο κατά τη διάγνωση.

Τα αποτελέσματά μας δεν είναι μόνο να επιβεβαιώσει προηγούμενες εκθέσεις, αλλά θα μπορούσε να υποδηλώνει μοριακών και κυτταρικών αλληλεπιδράσεων που συνδέουν τη γενετική μεταβλητότητα στην ενεργοποίηση των κυττάρων του ανοσοποιητικού και αυξημένη μεταστατικό δυναμικό μεταξύ του στόματος περιπτώσεις καρκίνου που διαμένουν στο Πουέρτο Ρίκο. Δυστυχώς, όμως, περιορισμένο μέγεθος του δείγματος μας δεν επιτρέπει μια ουσιαστική επίσημη αξιολόγηση των γονιδίων-γονιδίου ή αλληλεπιδράσεων γονιδίων-περιβάλλοντος.

Σημειώνουμε ότι πολλά δυνητικά ενδιαφέρουσες SNPs δεν ανιχνεύθηκαν ως επηρεάζουν τον καρκίνο του στόματος ή κίνδυνο προκαρκινικών στην πιλοτική μελέτη μας δείγμα. Για παράδειγμα, η IL-2 κυτοκίνη είναι επίσης ένας ισχυρός ενεργοποιητής Τ κυττάρων [6] και χρησιμοποιείται σε διάφορα επιθηλιακούς καρκίνους ως ανοσοενισχυτικό σε χημειοθεραπεία ή ακτινοθεραπεία. Ωστόσο, εμείς δεν ανιχνεύουν τυχόν παραλλαγές που θα δείξει πιθανή ανοσολογική δυναμικό σε αυτή τη μελέτη.

Πορτορικανοί είναι μελετημένη και υποεκπροσωπούνται στην προφορική προσπάθειες έρευνας και την πρόληψη του καρκίνου. Ενώ προς το παρόν διαθέσιμες στρατηγικές είναι πιθανό επαρκούν για την επίτευξη των στόχων πρόσφατο Παγκόσμιο Οργανισμό Υγείας για τη μείωση του καρκίνου του στόματος [45], τα μελλοντικά μέτρα πρόληψης μπορεί τελικά να ενσωματώσουν γενετικές πτυχές της ευαισθησίας της νόσου. Βρήκαμε αποδείξεις μεταξύ των συμμετεχόντων μας υποστηρίζει την πιθανότητα ότι οι γενετικές αλλοιώσεις σε διάφορα αναγκαία γονίδια του ανοσοποιητικού συστήματος που επηρεάζουν τους παράγοντες του ξενιστή και μειωμένη ανοσολογική παρακολούθηση μπορεί να συμβάλλει στην αύξηση του κινδύνου καρκίνου του στόματος και τα προκαρκινικά στάδια στο Πουέρτο Ρίκο.

Καλούμε ενδιαφέρει τους συναδέλφους και τα ενδιαφερόμενα μέρη να ξεκινήσουν μεγάλες καρκίνο του στόματος και τα προκαρκινικά στάδια της έρευνας προσπάθειες που υπηρετούν Ισπανικός κοινότητες που πλήττονται δυσανάλογα από του στόματος και του φάρυγγα καρκίνων. Τα αποτελέσματα αυτών των μελλοντικών προσπαθειών θα ωφελήσει πιθανό άλλες εθνοτικές ομάδες, όπως καλά.

Υποστήριξη Πληροφορίες

Πίνακα S1.