PLoS One: η γενετική ποικιλομορφία σε γονίδια-κλειδιά σε προσταγλανδίνη Ε2 Pathway (COX-2, HPGD, ABCC4 και SLCO2A1) και τη συμμετοχή τους σε καρκίνο του παχέος εντέρου Development


Αφηρημένο

Οι προ-καρκινογόνα αποτελέσματα της προσταγλανδίνης Ε2 (PGE

2) στο βλεννογόνο του παχέος εντέρου δεν είναι μόνο ρυθμίζονται από τις τιμές μεταξύ της κυκλοοξυγενάσης-2 (COX-2), βιοσύνθεση και 15 Hydroxyprostaglandin αφυδρογονάση (15-PGDH) εξαρτώμενη από την υποβάθμιση, αλλά και τα επίπεδα σταθερής κατάστασης της PGE

2 στο εξωκυτταρικό μικροπεριβάλλον, συντηρείται από ειδικό κλειδί μεταφορείς προσταγλανδίνης, η πρωτεΐνη Πολλαπλά Αντίσταση (MRP4) (μεταφορέας εκροής) και προσταγλανδίνη Transporter (PGT) (φορέας εισροή). Για να κατανοήσουμε τη συμβολή της γενετικής ποικιλότητας στα γονίδια που κωδικοποιούν για την COX-2/15 PGDH /MRP4 /πρωτεΐνες PGT στην ανάπτυξη CRC, πραγματοποιήσαμε μια μελέτη ασθενών-μαρτύρων νοσοκομείο με βάση τη συμμετοχή 246 ασθενών CRC και 480 του καρκίνου χωρίς ελέγχους. Ένα σύνολο 51 tagSNPs χαρακτηρίστηκαν χρησιμοποιώντας την πλατφόρμα Sequenom μέσω πολυπλεξίας που ακολουθείται από ενίσχυση με φασματομετρία μάζας διαχωρισμού προϊόντος ή αλληλόμορφων διάκριση χρησιμοποιώντας PCR πραγματικού χρόνου. Επτά tagSNPs είχαν εμπλακεί στην ανάπτυξη CRC: η rs689466 στο

COX-2

γονίδιο, ο rs1346271 και rs1426945 στο 15-PGDH, το rs6439448 και rs7616492 στο PGT και rs1751051 και rs1751031 στο MRP4 κωδικοποίησης γονιδίων. Κατόπιν στρωματοποιημένη ανάλυση μετρήσιμη αλληλεπίδραση γονιδίων-περιβάλλοντος παρατηρήθηκε μεταξύ rs689466 και το κάπνισμα συνήθειες, με τα άτομα ποτέ καπνιστές φορείς rs689466 GG ομόζυγο γονότυπο που έχει μια σχεδόν 6 φορές αυξημένη ευαισθησία για CRC έναρξης (95% CI: 1,49 – 22,42,

P

= 0,011). Επιπλέον, η ανάλυση μείωση πολυπαραγοντική διάσταση (MDR) προσδιόρισε μια συνολική τέσσερις-παράγοντα καλύτερο γονίδιο γονίδιο διαδραστικό μοντέλο, συμπεριλαμβανομένων των πολυμορφισμών rs1426945, rs6439448, rs1751051 και rs1751031. Αυτό το μοντέλο είχε το υψηλότερο συνέπειας διασταυρωμένης επικύρωσης (10/10,

P

& lt? 0.0001) και ακρίβεια 0,6957 και περαιτέρω σχετίζεται με μια 5-φορές αυξημένο κίνδυνο για ανάπτυξη CRC (95% CI: 3,89 -7.02,

P

& lt? 0,0001). Συμπερασματικά, ειδικά γονίδια χαμηλή διεισδυτικότητα στην προ-καρκινογόνων PGE

2 οδός φαίνεται να ρυθμίζουν την γενετική ευαισθησία για ανάπτυξη CRC. Μια σαφέστερη κατανόηση για CRC αιτιολογία μέσω του εντοπισμού των βιοδεικτών παχέος καρκινογένεσης θα μπορούσε να επιτρέψει έναν καλύτερο ορισμό των μοντέλων κινδύνου που είναι πιο πιθανό να επωφεληθούν από στοχευμένες στρατηγικές πρόληψης για τη μείωση της CRC επιβάρυνση

Παράθεση:. Pereira C, Queirós S , Galaghar Α, Sousa Η Pimentel-Nunes P, Brandão C, et al. (2014) η γενετική ποικιλομορφία σε γονίδια-κλειδιά σε προσταγλανδίνη Ε

2 Pathway (

COX-2, HPGD, ABCC4

και

SLCO2A1

) και τη συμμετοχή τους στη παχέος την ανάπτυξη του καρκίνου. PLoS ONE 9 (4): e92000. doi: 10.1371 /journal.pone.0092000

Επιμέλεια: Kjetil Tasken, Πανεπιστήμιο του Όσλο, Νορβηγία

Ελήφθη: 25 του Νοεμβρίου, 2013? Αποδεκτές: 15 Φεβρουαρίου 2014? Δημοσιεύθηκε: δεύτερης Απριλίου 2014

Copyright: © 2014 Pereira et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Αυτή η μελέτη υποστηρίχθηκε από μια ερευνητική επιχορήγηση από το πορτογαλικό Ινστιτούτο Ογκολογίας του Πόρτο. Επιπλέον, CP είναι ο αποδέκτης της επιχορήγησης PhD (SFRH /BD /64805/2009) από FCT-Fundação para a Επιστημών e Tecnologia, που συγχρηματοδοτείται από το Ευρωπαϊκό Κοινωνικό Ταμείο (ΕΚΤ) στο πλαίσιο Ανθρώπινου Δυναμικού Επιχειρησιακού Προγράμματος (POPH) από το Εθνικό Στρατηγικό πλαισίου αναφοράς (ΕΣΠΑ). Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:. Οι συγγραφείς έχουν διαβάσει την πολιτική του περιοδικού και έχουν τα ακόλουθα συγκρούσεις: RM είναι ένα PLoS ΕΝΑ Συντακτική μέλος του Διοικητικού συμβουλίου. Αυτό δεν αλλάζει την τήρηση των συγγραφέων να PLoS ONE Editorial πολιτικές και κριτήρια.

Εισαγωγή

Καρκίνος του παχέος εντέρου (CRC) είναι η πιο διαδεδομένη κακοήθεια στις ανεπτυγμένες περιφέρειες, αντιπροσωπεύοντας πάνω από το 13% του συνόλου διαγνωσμένων κρουσμάτων (728.550 περιπτώσεις) και 11% όλων των θανάτων από καρκίνο που σχετίζονται με το 2008 (320.279 θάνατοι) [1]. Το βάρος της CRC αυξάνεται ως αντανάκλαση της αύξησης του πληθυσμού και της γήρανσης, επίσης, όπως, αυξημένη υιοθέτηση του καρκίνου που σχετίζονται με «δυτικότροπες» τρόπου ζωής [2]. Έτσι, η εφαρμογή των κατευθυντήριων γραμμών ελέγχου CRC με βάση τον πληθυσμό με έμφαση στον εντοπισμό και την αφαίρεση των προκαρκινικών αλλοιώσεων συνιστάται ιδιαίτερα για μια επιτυχημένη μείωση στα ποσοστά εμφάνισης CRC [3]. Δυστυχώς, τα ποσοστά συμμόρφωσης απέχουν πολύ από το επιθυμητό και σημαντικά χαμηλότερα από αυτά που αναφέρθηκαν για άλλες προτεινόμενες στρατηγικές πρόληψης [4], η οποία θέτει σε κίνδυνο την αποτελεσματικότητα αυτών των προσεγγίσεων για την πρόληψη CRC. Αυτό θα μπορούσε να παράσχει το σκεπτικό, όχι μόνο για στοχευμένη προβολή αλλά και η επιδίωξη για εναλλακτικές ή /και συμπληρωματικές στρατηγικές, δηλαδή τη χρήση χημειοπροφύλαξης να μειώσει σημαντικά αυτό το άχθος του καρκίνου.

Μία ομάδα ενώσεων με εκτενή δεδομένα που υποστηρίζουν προληπτικό ρόλο τους σε εκδήλωση καρκίνου περιλαμβάνουν τα μη στεροειδή αντιφλεγμονώδη φάρμακα (ΜΣΑΦ), που φαίνεται να μειωθεί ο σχετικός κίνδυνος ανάπτυξης CRC κατά 40-50%, κυρίως με τη στόχευση του ενζύμου της κυκλοοξυγενάσης-2 (COX-2) [5] – [7].

COX-2 είναι ένα άμεσο πρώιμο γονίδιο ανταπόκρισης, δείχθηκε προηγουμένως να είναι προς τα πάνω ρυθμισμένα σε 40-50% των ορθοκολικού αδενώματος και 85% των CRC, που οδηγεί στην εξωκυτταρική συσσώρευση μικροπεριβάλλον των προσταγλανδινών (PGs) [ ,,,0],8]. COX-2 που προέρχονται PGE

2, η κύρια PG παράγονται σε όγκους παχέος εντέρου, διαδραματίζει καίριο συνεισφορά στα χαρακτηριστικά του καρκίνου, διεγείροντας τον πολλαπλασιασμό των κυττάρων, τη διεισδυτικότητα και τη μετανάστευση, την ενίσχυση της αγγειογένεσης, αποφεύγοντας την απόπτωση και ρυθμίζοντας την αντικαρκινική ανοσολογική απόκριση [ ,,,0],9]. COX-2 έχει ένα φυσιολογικό ανταγωνιστή σε 15-hydroxyprostaglandin αφυδρογονάση (15-PGDH) που καταβολίζει PGE

2, σε έναν ανενεργό κετο ένωσης [10]. 15-PGDH εκφράζεται έντονα σε φυσιολογικό βλεννογόνο και μία από τις πιο κάτω ρυθμιζόμενα γονίδια σε όγκους παχέος εντέρου, που είναι ένας ισχυρός

in vivo

καταστολέα νεοπλασίας κόλον με μείωση τον καταβολισμό της PGE

2 [11] , [12]. Επιπλέον, τα επίπεδα χαμηλής 15-PGDH σχετίζονται με την αντίσταση στην COX-2 εκλεκτικός αναστολέας Celecoxib χημειοπροληπτική δράση σε ορθοκολικό ανάπτυξη όγκων, ενισχύοντας την επίδραση της απώλειας της έκφρασης 15 PGDH σε ορθοκολικό καρκινογένεση [13]. Παρόλα αυτά, οι βιολογικές επιδράσεις της COX-2 /PGE

2 μονοπατιού δεν είναι μόνο ρυθμίζονται από τις τιμές των COX-2 βιοσύνθεση και 15-PGDH εξαρτώμενη από την υποβάθμιση, αλλά και τα επίπεδα σταθερής κατάστασης της PGE

2 εξωκυτταρικό μικροπεριβάλλον, ρυθμίζονται με ειδικό κλειδί μεταφορείς προσταγλανδίνης [14], [15]. Η πολυφαρμακευτική αντίσταση που σχετίζεται με πρωτεΐνη 4 (MRP4) είναι υπεύθυνη για την εξαγωγή PGE

2 στο εξωκυτταρικό περιβάλλον, όπου μια πληθώρα των οδών θα ενεργοποιηθεί μέσω της σύνδεσης με ειδικούς υποδοχείς ζευγάρι G-πρωτεΐνη [14]. Από την άλλη πλευρά, η ενεργός πρόσληψη πίσω στο κυτταρόπλασμα, όπου PGE

2 θα απενεργοποιείται με 15-HPGD, είναι διεξάγεται από προσταγλανδίνη μεταφορέα (PGT) [15]. Στην πραγματικότητα, Holla και οι συνεργάτες του [16] ανέφεραν ότι τα επίπεδα PGT και MRP4 mRNA είναι αντιστρόφως ρυθμίζονται σε ανθρώπινο CRC, με την έκφραση PGT να ρυθμίζεται προς τα κάτω και MRP4 υπερεκφράζεται σε ιστούς CRC και κυτταρικές σειρές που οδηγεί σε υψηλότερα επίπεδα PGE

2 εξωκυττάρια προς τα πάνω ρύθμιση έτσι τα αποτελέσματα της COX-2 /PGE

2 μονοπατιού.

μια δεκαετία πριν την κυκλοφορία του πρώτου σχεδίου ανθρώπινου γονιδιώματος επέτρεψε μια βαθύτερη γνώση για την αρχιτεκτονική και τη λειτουργία του ανθρώπινου γονιδιώματος, τονίζοντας τη σημασία της κοινής γενετικές παραλλαγές σε γένεση της νόσου. Σε CRC, το οικογενειακό ιστορικό είναι μια καλά εδραιωμένη αιτιολογικός παράγοντας, ρίχνοντας μερικές ενδείξεις για την εμπλοκή της χαμηλής γονιδίων διεισδυτικότητα στην ογκογένεση του [17].

Το

COX-2

γονίδιο είναι γενετικά πολυμορφική και ήταν ο στόχος της αρκετές μελέτες γενετικής σύνδεσης, εμπλέκοντας τη συμμετοχή των τριών πολυμορφισμού στο

COX-2

γονίδιο για την ανάπτυξη όγκων παχέος εντέρου (rs20417, rs699466 και rs5275, επίσης γνωστή ως -765G & gt? C, -1195A & gt? G και 8473T & gt? C, αντίστοιχα), αν και όχι πάντα με συνέπεια [18]. Σε μια προκαταρκτική μελέτη, ανέφεραν αυξημένη ευαισθησία για ανάπτυξη CRC στο G φορείς αλληλόμορφο του rs689466A & gt?. G πολυμορφισμό στο

COX-2

υποστηρικτής του [19]

Hoeft και οι συνεργάτες του [20] πρώτον εντόπισε δύο ετικέτες πολυμορφισμούς μονών νουκλεοτιδίων (tagSNPs), οι rs8752 και rs2612656 στο

HPGD

γονίδιο, που κωδικοποιεί για την πρωτεΐνη 15-PGDH, όπως αυξημένη δείκτες ευαισθησίας για την ανάπτυξη CRC. Πιο πρόσφατα, Thompson και συνεργάτες [21] παρατήρησαν μια αύξηση του κινδύνου κατά 40% συνδέεται με την SNP rs2555639 βρίσκεται στο 17,74 kb ανοδικά του 5’UTR του

HPGD

γονίδιο που περαιτέρω επικυρωθεί στο σύνολο αντιγραφής.

με εξαίρεση μια μελέτη ασθενών-μαρτύρων δύο φάσεων σε ένα ισπανικό πληθυσμό [22] καμία προηγούμενη μελέτη ερεύνησε το ρόλο των κοινών γενετικών παραλλαγών στην MRP4 και γονίδια που κωδικοποιούν PGT (

ATP-Binding Cassette Υπο-Οικογένεια C κράτη 4

(

ABCC4

) και

φορέα διαλυμένης ουσίας οργανικού ανιόντος οικογενειακό όχημα, μέλος 2Α1

(

SLCO2A1

), αντίστοιχα) στο CRC γένεση. Ούτε ασχολήθηκε με το συνδυασμένο αποτέλεσμα των SNPs σε αυτά τα τέσσερα γονίδια με κεντρικούς ρόλους στη ρύθμιση των επιπέδων της PGE

2 εξωκυτταρικά. Έτσι, σε αυτή τη μελέτη ασθενών-μαρτύρων που διερεύνησε τις ενώσεις των 51 κοινές γενετικές παραλλαγές στο

COX-2 /HPGD /ABCC4 /SLCO2A1

PGE

2 γονίδια οδού με CRC εμφάνιση.

υλικά και Μέθοδοι

μέγεθος δείγματος Εκτίμηση

Είμαστε εκτιμάται ότι το μέγεθος του δείγματος που απαιτείται για να ανιχνεύσει μια αναλογία πιθανοτήτων (OR) είναι ίση ή ανώτερη από 1,70 είναι 200 ​​ασθενείς και 400 μάρτυρες (2:01 αναλογία) για να επιτευχθεί μια στατιστική ισχύ 80%, με επίπεδο σημαντικότητας 5%, για πολυμορφισμοί με μια συχνότητα ανώτερη του 15%. (Epi Info έκδοση 6, Κέντρα Ελέγχου και Πρόληψης Νοσημάτων, Ατλάντα, Γεωργία). Λαμβάνοντας υπόψη ότι r

2, χρησιμοποιείται για την επιλογή των tagSNPs, είναι αντιστρόφως ανάλογη με το μέγεθος κατά το οποίο το μέγεθος του δείγματος πρέπει να αυξηθεί σε ένα σχέδιο μελέτης, για ar

2 0.8 χρειαζόμασταν για να αυξηθεί το μέγεθος του δείγματος μας κατά 25 .%

Πληθυσμός μελέτης

Αυτή η μη συμφωνημένα μελέτη ασθενών-μαρτύρων νοσοκομείο με βάση περιλαμβάνονται 726 συμμετέχοντες: 246 επιβεβαιώθηκε ιστολογικά ασθενείς CRC και 480 του καρκίνου χωρίς ελέγχους, από την βόρεια περιοχή της Πορτογαλίας και προσλαμβάνονται στο

Instituto Português de Oncologia do Porto

(IPO-Πόρτο).

Γραπτή ενημερωμένη συγκατάθεση λήφθηκε από όλους τους στρατολόγησε τους συμμετέχοντες πριν από την ένταξή τους στη μελέτη, σύμφωνα με την Διακήρυξη του Ελσίνκι. Το ερευνητικό αυτό σχέδιο εγκρίθηκε από την Επιτροπή Δεοντολογίας της IPO-Πόρτο (ref. 0084/08) και

Comissão Nacional de Protecção de Dados

(ref. 6619/2011), που είναι η Αρχή Προστασίας Δεδομένων της Πορτογαλίας.

ομάδα ελέγχου.

σε αυτή την ομάδα, τα άτομα μεταξύ 50 και 75 ετών, χωρίς κλινικές ενδείξεις CRC ή άλλων ογκολογική κακοήθειας ήταν τυχαία προσληφθεί από την υπηρεσία του δότη αίματος στο IPO-Πόρτο μεταξύ Ιουλίου 2005 και Φεβρουαρίου 2008.

CRC ομάδα ασθενών.

οι ασθενείς με ιστολογικά επιβεβαιωμένο CRC διαγνωστεί πρόσφατα μεταξύ του Ιανουαρίου 2002 και Σεπτεμβρίου 2007 συμμετείχαν σε αυτή τη μελέτη. Αυτοί οι ασθενείς επιλέχθηκαν από μια κολονοσκόπηση βάση δεδομένων από το Τμήμα Γαστρεντερολογίας, ηλικίας 50 έως 75 ετών, χωρίς προηγούμενο ιστορικό της φλεγμονώδους νόσου του εντέρου ή κληρονομικά σύνδρομα και οι οποίοι είχαν προγραμματιστεί για παρακολούθηση συμβουλευτείτε σε

Serviço de Gastrenterologia

ή

Unidade de Digestivos

στο IPO Πόρτο μεταξύ Μαρτίου και Μαΐου 2008.

διακόσια σαράντα επτά CRC ασθενείς συμπεριλήφθηκαν από το 387 αναμένεται να προσληφθούν. Κατά τη διάρκεια της πρόσληψης ή μετά από ασθενείς τηλεφωνική συνέντευξη κλήθηκαν να ανακαλέσουν τις συνήθειες του τρόπου ζωής τους (καπνιστική συμπεριφορά, ΔΜΣ, κ.λπ.) κατά το προηγούμενο έτος CRC διάγνωση. Ιατρικά αρχεία αναθεωρήθηκαν για να εξαγάγετε τα κλινικοπαθολογοανατομικές μεταβλητών (στάδιο, βαθμός του όγκου, η παρουσία της σύγχρονης και metachronous βλάβες) και να αποκλείσει προκατάληψη εσφαλμένης ταξινόμησης.

Συλλογή δειγμάτων και Βιολογική Επεξεργασία

Τα δείγματα αίματος συλλέχθηκαν χρησιμοποιώντας τυπική τεχνική φλεβοκέντησης με σωλήνες που περιέχουν EDTA. DNA εκχυλίστηκε από λευκοκύτταρα περιφερικού αίματος χρησιμοποιώντας το QIAamp Blood DNA Mini Kit (Qiagen, Hilden, Γερμανία), ακολουθώντας τις οδηγίες του κατασκευαστή.

Για ασθενείς που δεν μπορούν να δώσουν ένα δείγμα αίματος, το DNA εξάγεται από φορμαλίνη παραφίνη ενσωματωμένα (FFPE) τετράγωνα από το Τμήμα Παθολογίας στο Ινστιτούτο μας. Δύο έως τέσσερα 10 μm τομή πάχους χρησιμοποιήθηκαν σε κάθε εκχύλιση, ανάλογα με το μέγεθος της περιοχής του ιστού (1.5-3 cm

2). Εν συντομία, τα δείγματα ιστών CRC από κάθε γυάλινο πλακίδιο αποξέστηκαν, χρησιμοποιώντας ένα καθαρό ξυράφι, σε ένα σωλήνα μικροφυγοκέντρου 1,5-ml. Τα δείγματα αποπαραφινώθηκαν σε ξυλόλιο για 10 λεπτά, σε θερμοκρασία δωματίου, που ακολουθείται από φυγοκέντρηση στα 14.000 g-16.000 g για 3 λεπτά. Οι σβώλοι ιστού κατόπιν επανυδατώθηκαν με 1 ml απόλυτης αιθανόλης, που ακολουθείται από φυγοκέντρηση στα 14.000 g-16.000 g για 3 λεπτά και το υπερκείμενο απορρίφθηκε. Αυτό το στάδιο επαναλήφθηκε δύο φορές. Στη συνέχεια, ο σωλήνας διατηρήθηκε ανοικτή για 15 λεπτά για να εξατμιστεί οποιοδήποτε υπόλοιπο αιθανόλης. Περαιτέρω βήματα της απομόνωσης του DNA πραγματοποιήθηκαν με τη χρήση του GRS Το γονιδιακό DNA Kit – ιστών, σύμφωνα με το πρωτόκολλο του κατασκευαστή (GRiSP, Πόρτο, Πορτογαλία)

DNA προσδιορίστηκε ποσοτικά χρησιμοποιώντας το NanoDrop 1000 Φασματοφωτόμετρο (Thermo Fisher Scientific, Wilmington. , DE, USA) και αποθηκεύτηκαν στους -20 ° C μέχρι την εξέταση γονότυπου. Η ποιότητα του DNA προσδιορίστηκε με μέτρηση της οπτικής πυκνότητας (OD) 260/280 αναλογία.

Επικύρωση του DNA Γονοτυπικές εξάγεται από FFPE Δείγματα

Για να εκτιμηθεί κατά πόσον DNA που απομονώθηκε από τομές FFPE είναι αξιόπιστη για την αναδρομική γονοτυπική συγκρίναμε τα γονότυπους του 20 σωματικών DNAs εξάγονται από FFPE δείγματα προς βλαστικής σειράς DNA που απομονώθηκε από φρέσκο ​​περιφερικό αίμα από τους ίδιους ασθενείς. Οι γονότυποι ήταν πολύ συγκλίνουσες (100%).

πολυμορφισμοί Επιλογή

Χρησιμοποιώντας μια προσέγγιση tagSNP, οι γενετικές παραλλαγές που ανακτώνται από ένα σύνολο κοινών SNPs στον Καυκάσιο πληθυσμό HapMap έργο (CEU) . Το γονιδίωμα Παραλλαγή διακομιστή (έκδοση 7.00) χρησιμοποιήθηκε για να ανακτήσει tagSNPs σύλληψη παραλλαγές (1) με μια μικρή συχνότητα αλληλόμορφο ίση ή ανώτερη από 15%? (2) εντός της κωδικοποιητικής περιοχής των γονιδίων συν 2 Kb ανάντη και κατάντη και (3) με ένα r

2 superior έως 0,8. Ένα σύνολο 140 tagSNPs συνελήφθησαν: 6, 15, 31 και 88 tagSNPs στο

COX-2

,

HPGD

,

SLCO2A1

και

ABCC4

γονίδια, αντίστοιχα. Έχουμε επιλέξει περαιτέρω SNPs με υψηλή πιθανότητα επιτυχίας γονοτύπησης χρησιμοποιώντας την πλατφόρμα Sequenom, (Sequenom, San Diego, CA). Εν συντομία, tagSNPs έχουν προτεραιότητα ως εξής: πρώτον, όλα τα μη-μονήρεις tagSNPs ή μονήρεις κυήσεις με την αναμενόμενη λειτουργική επίπτωση (FuncPred λογισμικό) ελέγχθηκαν. TagSNPs με χαμηλές βαθμολογίες του γονότυπου αντικαταστάθηκαν με τις αντιπροσωπευτικές παραλλαγές? και τέλος οι μη σημαντικές μονήρεις περιελήφθησαν στον σχεδιασμό συστοιχία. Ένα σύνολο 55 SNPs μετατράπηκαν επιτυχώς στην πλατφόρμα Sequenom.

Επιπλέον, περιλαμβάνονται επίσης πολυμορφισμοί που προηγουμένως σχετίζονται με την ανάπτυξη ορθοκολικών όγκων και είχε μια ελάσσονα συχνότητα αλληλίου ανώτερη ή ίση προς 15% που απέτυχε να μετατραπεί σε η πλατφόρμα Sequenom: rs20417, rs689466 και rs5275 στο

COX-2

και rs2612656 και rs2555639 στο

HPGD

γονίδια

γονότυπου Χαρακτηρισμός

TagSNP του γονότυπου ήταν. πραγματοποιείται με τη χρήση MassARRAY iPlex Gold τεχνολογία (Sequenom, San Diego, CA) με βάση πολυπλεκτικό ενίσχυση που ακολουθείται από διαχωρισμό του προϊόντος με φασματομετρία μάζας. Η τεχνική αυτή διεξάγεται από το

Unidade de Genómica /Serviço de Genotipagem κάνει Instituto Gulbenkian de Επιστημών.

Η

Όλες οι πολυμορφισμοί δεν περιλαμβάνονται στην ανάλυση tagSNPs χαρακτηρίστηκαν μέσω διακρίσεις αλληλομόρφων (Real-Time αντίδραση πολυμεράσης Chain) χρησιμοποιώντας έγκυρες δοκιμασίες προσδιορισμού του γονότυπου TaqMan® SNP (C___2517145_20, C___7550203_10, C___15909858_20, C___16038735_10 για την rs689466, rs5275, rs2612656 και rs2555639, αντίστοιχα), με την εξαίρεση του πολυμορφισμού -765G & gt? C (rs20417) η οποία έθιμο σχεδιαστεί (Applied Biosystems, Foster City, California USA). Αλληλόμορφες διάκριση έγινε με μέτρηση τελικού σημείου φθορισμού χρησιμοποιώντας ΑΒΙ PRISM Sequence Detection System (Applied Biosystems, Foster City, California USA).

Έλεγχος Ποιότητας

Γονότυπους εξαιρέθηκαν από την ανάλυση εάν κάποιο από εφαρμόστηκε τα ακόλουθα κριτήρια: ποσοστό κατώτερο καλέστε στο 0,90? ποσοστό αντιστοιχίας κατώτερη από 0,95 και Hardy-Weinberg ισορροπία (HWE) με

P

& lt? 0,05. Blank πρότυπα συμπεριλήφθηκαν σε κάθε 96 και 384 φρεατίων για την εξασφάλιση μόλυνση χωρίς αποτέλεσμα. Δύο ερευνητές πραγματοποίησαν την ερμηνεία γονότυπο ανεξάρτητα πέντε έως δέκα τοις εκατό του συνόλου των δειγμάτων επιλέχθηκαν τυχαία και υπέβαλε εκ νέου σε ένα νέο γενετικό χαρακτηρισμό για να επιβεβαιώσετε τις γονότυπους

Στατιστική Ανάλυση

Για την ανάλυση γενετικού διανομής. , η ισορροπία Hardy-Weinberg ελέγχθηκε από την καλοσύνη-of-fit test του Pearson για να συγκρίνει την παρατηρούμενη σε σχέση με την αναμενόμενη κατανομή γονότυπο μεταξύ του πληθυσμού ελέγχου.

η ανάλυση των δεδομένων έγινε με τη χρήση του λογισμικού ηλεκτρονικών υπολογιστών της IBM στατιστικό πακέτο για την Κοινωνική Επιστήμες-SPSS (IBM Corp., Armonk, New York, USA) για Macintosh (έκδοση 19.0). Chi-square ανάλυση χρησιμοποιήθηκε για να συγκρίνετε κατηγορικές μεταβλητές, χρησιμοποιώντας ένα επίπεδο σημαντικότητας 5%. Μη παραμετρικές δοκιμασίες χρησιμοποιήθηκαν για τη σύγκριση των μέσων τιμών. αναλογία πιθανοτήτων (OR) και το διάστημα εμπιστοσύνης 95% της (CI) υπολογίστηκαν ως μέτρο της σύνδεσης μεταξύ των γενετικών παραλλαγών και τον κίνδυνο για την ανάπτυξη της CRC. Συμεταβλητές αποδειχθεί ότι διαφέρουν μεταξύ των πληθυσμών της ομάδας συμπεριλήφθηκαν στην ανάλυση λογιστικής παλινδρόμησης. ανάλυση της αλληλεπίδρασης γονιδίων-περιβάλλοντος ήταν διεξάγεται από στρωματοποίηση των δεδομένων λαμβάνοντας υπόψη το φύλο, το κάπνισμα συνήθειες και δείκτη μάζας σώματος (ΔΜΣ). Επιπλέον, ένα bootstrap αναδειγματοληψία χρησιμοποιήθηκε για τη διερεύνηση της σταθερότητας των εκτιμήσεων κινδύνου (1000 επαναλήψεις). Επιπλέον, η ψευδής θετική πιθανότητα έκθεσης (FPRP) χρησιμοποιήθηκε για να επιβεβαιώσει την noteworthiness σημαντικών ευρημάτων, σύμφωνα με τη μελέτη της Wacholder και οι συνεργάτες του [23]. Το όριο FPRP ορίστηκε σε 0,5 υπό ανατεθεί εκ των προτέρων πιθανότητα κυμαίνονται 0,01 – 0,25 για τον εντοπισμό ενός ή 1,5

Η ανάλυση του απλότυπου διεξήχθη σε επίπεδο γονιδίου χρησιμοποιώντας το λογισμικό SNPStats (www http:.. //Bioinfo .iconcologia.net /SNPstats). Οι συχνότητες απλότυπου υπολογίστηκαν χρησιμοποιώντας την εφαρμογή του αλγορίθμου EM κωδικοποιούνται μέσα στο

haplo.stats

πακέτο. Η πιο συχνή απλότυπος επιλέχθηκε αυτόματα ως κατηγορία αναφοράς. Για το

HPGD

,

SLCO2A1

και

ABCC4

γονίδια τα μπλοκ απλότυπος κατασκευάστηκαν λαμβάνοντας υπόψη τις πλέον σημαντικές πολυμορφισμούς.

Το open-source μείωση πολυπαραγοντική διάστασης (MDR) λογισμικού (έκδοση 3.0.2) (www.epistasis.org) χρησιμοποιήθηκε για να αξιολογήσει πιθανές αλληλεπιδράσεις γονίδιο-γονιδίων μεταξύ SNPs με στατιστικά σημαντική επίδραση στην γενετική προδιάθεση CRC. Η καταλληλότητα ενός μοντέλου MDR εκτιμήθηκε με προσδιορισμό της ακρίβειας δοκιμών και διασταυρωμένης επικύρωσης συνοχή του (CVC). Χρησιμοποιώντας ένα 10-πλάσια μέθοδος διασταυρωμένης επικύρωσης τα δεδομένα διαιρούνται σε 10 ομάδες, στις οποίες 9 υποομάδες ήταν η κατάρτιση συνόλων και ένα υποσύνολο ήταν ένα σύνολο δοκιμής. Ως εκ τούτου, η CVC είναι ένα μέτρο του αριθμού των φορών των 10 τμημάτων του συνόλου δεδομένων το καλύτερο μοντέλο εξήχθη. Η ενιαία καλύτερο μοντέλο έχει κανονικά τη μέγιστη ακρίβεια τις δοκιμές και CVC. Η στατιστική σημαντικότητα αξιολογήθηκε χρησιμοποιώντας ένα 1000-φορές τεστ μετάθεση να συγκρίνετε παρατηρούμενη ακρίβεια δοκιμή με αυτά αναμένονται με τη μηδενική υπόθεση της μηδενικής σύνδεσης. δοκιμή μετάθεση διορθώθηκαν για πολλαπλές δοκιμές επαναλαμβάνοντας το σύνολο ανάλυση σχετικά με 1000 σύνολα δεδομένων που ήταν σύμφωνες με την μηδενική υπόθεση.

Αποτελέσματα

Περιγραφή της Μελέτης Πληθυσμός

Τα χαρακτηριστικά της μελέτης πληθυσμού συνοψίζονται στον πίνακα 1. οι περιπτώσεις ήταν σημαντικά μεγαλύτερα από ελέγχους με μέση ηλικία 63 έτη (50-75) (έναντι 58 χρόνια στην ελέγχων (50-69),

P

& lt? 0.001). Τα αρσενικά είχαν υπερεκπροσωπούνται στις δύο ομάδες (60,1% έναντι 65,4% στις περιπτώσεις και τους ελέγχους, αντίστοιχα,

P

= 0,159) και σχεδόν το 77% των συμμετεχόντων ήταν υπέρβαροι (

P

= 0.955). Η πλειοψηφία των συμμετεχόντων είχε καπνίσει ποτέ είτε σε κατηγορία (37,4% των περιπτώσεων και 39,7% σε ελέγχους,

P

= 0.636).

Η

Γονότυπος Συχνότητες και εκτιμήσεις κινδύνου

Τρεις SNPs και τέσσερα δείγματα εξαιρέθηκαν από την ανάλυση λόγω της αποτυχίας του γονότυπου και τέσσερα SNPs έπεσαν, επειδή οι συχνότητες τους απέκλιναν από HWE (

P

& lt? 0,05). Ένα σύνολο 51 SNPs συμπεριλήφθηκαν στην ανάλυση εκτίμηση κινδύνου. Οι μέσες τιμές κλήσεων γονότυπο και ο συσχετισμός ήταν 99.02% και 99,3%, αντίστοιχα. Η περιγραφή των επιλεγμένων SNPs εμφανίζεται στον Πίνακα S1.

Συνολικά επτά γενετικούς πολυμορφισμούς στους τέσσερις γονίδια εμπλέκονται στην καρκινογένεση του παχέος, όπως μπορεί να παρατηρηθεί στον Πίνακα 2. Η AG και GG γονότυπους του πολυμορφισμού rs689466 σε

COX-2

γονίδιο υπερεκπροσωπούνται στην ομάδα των υποθέσεων που οδηγεί σε αυξημένο κίνδυνο για CRC πιο αισθητή για ομόζυγη GG αν και αυτό δεν ήταν στατιστικά σημαντική στην πολυπαραγοντική ανάλυση (OR = 2,01? 95% CI: 0,93 – 4,35 ,

P

= 0,076). Οι rs1346271 και rs1426945 SNPs στο

HPGD

γονιδίου σχετίζεται με μειωμένο κίνδυνο κατά 32% και 44% για CRC έναρξης (95% CI: 0,47 – 0,96,

P

= 0,029 και 95% CI : 0,34 – 0,93,

P

= 0.026, για τη GC και ΑΑ ομόζυγη φορείς των πολυμορφισμών rs1346271 και rs1426945, αντίστοιχα). Από τα δεκαπέντε γενετικές παραλλαγές αναλύονται στις

SLCO2A1

γονίδιο μόνο τους πολυμορφισμούς rs6439448 και rs7616492 επηρέασε την ευαισθησία για CRC. Τα άτομα φορείς του rs6439448 ετερόζυγο γονότυπο AG παρουσίασε Ή 0,68 (95% CI: 0,47 – 0,99,

P

= 0,047). Από την άλλη πλευρά, δύο φορές αυξημένη προδιάθεση παρατηρήθηκε για τα άτομα που φέρουν δύο αντίγραφα του Α αλληλόμορφου του rs7616492 πολυμορφισμού (95% CI: 1,27 – 3,32,

P

= 0,003). Εστιάζοντας στο

ABCC4

γονίδιο, ένα 1,76 ενισχυμένη ευαισθησία παρατηρήθηκε με την ΑΑ γονότυπο του rs1751051 SNP και προστασία ήταν εμφανής για AG φορείς γονότυπο του rs1751031 πολυμορφισμού (OR = 0,68? 95% CI: 0,47 – 0,97,

P

= 0,032). Η bootstrap ανάλυση υποστηρίζεται αποτελέσματά μας (Πίνακας 2). Η κατανομή γονότυπων όλων περιλαμβάνονται SNPs αναφέρεται στον Πίνακα S2.

Η

Η ανάλυση FPRP αποκάλυψε ότι οι μη προσαρμοσμένες σημαντικές συσχετίσεις που παρατηρήθηκαν στον Πίνακα 2, διατήρησε τη σημασία τους (FPRP≤0.5) όταν μια εκ των προτέρων πιθανότητα ίση ή ανώτερη από 0,10 θεωρήθηκε, με την εξαίρεση του πολυμορφισμού rs689466 (ΦΕΚ vs AA) που παρουσίασε FPRP των 0.690, γεγονός που υποδηλώνει πιθανή προκατάληψη σε αυτό το θετικό αποτέλεσμα (τα δεδομένα δεν παρουσιάζονται).

γονιδίων-περιβάλλοντος αλληλεπίδρασης Ανάλυση

Κατόπιν στρωματοποιημένη ανάλυση παρατηρήσαμε, ότι με την εξαίρεση των rs6439448 και rs1751051 πολυμορφισμοί στο

SLCO2A1

και

ABCC4

γονίδιο, αντίστοιχα όλες οι άλλες παραλλαγές εμφανίζονται να έχουν μια εξαρτώμενη από το φύλο συμπεριφορά ιδιαίτερα σημαντικό σε αρσενικούς φορείς GG γονότυπο του

COX-2

rs689466 SNP (OR = 3,3? 95% CI: 1.23 – 9.9,

P

= 0,018) και ΑΑ ομόζυγο για το rs1426945 πολυμορφισμός στο

HPGD

γονιδίου (OR = 0,38? 95% CI: 0,20 – 0,74,

P

= 0,004), όπως αναφέρονται στον πίνακα 3.

η

Επιπλέον , ένα σχεδόν 6-φορές παρατηρήθηκε αυξημένος κίνδυνος σε ολοένα καπνιστές που φέρουν το γονότυπο GG για το

COX-2

rs689466 πολυμορφισμό (95% CI: 1,49 – 22,42,

P

= 0,011 vs OR = 0,63? 95% CI: 0,13 – 3,08,

P

= 0,56 σε μη καπνιστές). Σε αντίθεση, η

ABCC4

rs1751051 ΑΑ γονότυπο φάνηκε να οδηγήσει σε μεγαλύτερη ευπάθεια σε άτομα που δεν είχαν καπνίσει ποτέ (OR = 2,32? 95% CI: 01.05 – 05.13,

P

= 0.037). Η rs7616492 ομόζυγο ΑΑ γονότυπο του

SLCO2A1

γονίδιο έπαιξε αντίθετους ρόλους κατά την εξέταση της αλληλεπίδρασης με το ΔΜΣ (OR = 0,06? 95% CI: 0,01 – 0,69,

P

= 0,023 και OR = 2,18? 95% CI:. 1,00 – 4,77,

P

= 0,051 για τα άτομα με ΔΜΣ & lt? 25 και το υπερβολικό βάρος (BMI≥25 kg /m

2), αντίστοιχα)

απλότυπου Ανάλυση

Τέσσερις κοινές απλότυποι περιγράφηκαν για

COX-2

γονίδιο, όπως μπορεί να παρατηρηθεί στον πίνακα 4. η πιο συχνή απλότυπος, ο AGT, ήταν παρούσα στο 52% των ελέγχων και χρησιμοποιείται ως ο αναφοράς ένα. Το μπλοκ που περιέχει το αλληλόμορφο rs689466 G, GGT, συσχετίστηκε με 51% αυξημένη ευαισθησία συνεπής με την ατομική SNP ανάλυση (95% CI: 01.10 – 02.06,

P

= 0,010). Παρά το γεγονός ότι δεν είχαμε παρατηρήσει καμία επίδραση του αλληλόμορφου rs5275 C σε CRC κίνδυνο ανεξάρτητα, φορείς της AGC απλότυπος είχαν 1,53 φορές υψηλότερη προδιάθεση για CRC (95% CI: 1.13 – 2.19,

P

= 0,008). Ο απλότυπος AGAC του

HPGD

γονιδίου ήταν η πιο συχνή (30%) από τα πέντε τετράγωνα. παρατηρήθηκε αυξημένο κίνδυνο για άτομα που μεταφέρουν τα μπλοκ, AGGC και ACGC, που περιέχει το rs1426945 G (OR = 1,70? 95% CI: 1,22 – 2,37,

P

= 0,002 και OR = 1,60? 95% CI: 1,04 – 2,44,

P

= 0,031, αντίστοιχα). Συνεκτικά, η αντίπαλη rs1426945 ΑΑ γονότυπο που ανατίθενται σε μείωση του κινδύνου κατά 40% στην ανάλυση SNP. Ο απλότυπος TAGAAC του

SLCO2A1

γονίδιο που περιέχει το μειωμένο rs6439448 σχετικού κινδύνου Α αλληλόμορφο αλληλόμορφο και rs7616492 G οδήγησε σε προστασία σχεδόν 50% για την ανάπτυξη CRC σε σύγκριση με τα άτομα που μεταφέρουν το μπλοκ αναφοράς TCAAAC. Το μόνο κοινό απλότυπος που περιλαμβάνει το rs1751051 αλληλόμορφο του

ABCC4

γονίδιο (AATTA) αύξησε την ευαισθησία για CRC εμφάνιση πάνω από δύο πτυχές, σε αντίθεση με την Τάττα πιο συχνή απλότυπος. Δεν μπλοκ περιείχε το αλληλόμορφο rs1751031 G.

Η

Gene-γονιδίου Αλληλεπίδραση Ανάλυση

Μια εξαντλητική ανάλυση MDR πραγματοποιήθηκε-out για να αξιολογήσει όλους τους πιθανούς συνδυασμούς των rs689466, rs1346271, rs1426945, rs6439448, rs7616492, rs1751051 και rs1751031 πολυμορφισμούς αποδειχθεί ότι σχετίζονται με CRC εμφάνιση στο άτομο SNP ανάλυση. Όπως φαίνεται στον Πίνακα 5, παρατηρήσαμε την υψηλότερη CVC (10/10) και την ακρίβεια (0.6957) στο μοντέλο αλληλεπίδραση τεσσάρων-παράγοντα, το οποίο δείχνει την αλληλεπίδραση μεταξύ rs1426945

HPGD

πολυμορφισμό, rs6439448

SLCO2A1

SNP rs1751051 και rs1751031 και πολυμορφισμών στο

ABCC4

γονίδιο. Αυτή η αλληλεπίδραση γονιδίων γονίδιο που συνδέεται με ένα 5-φορές αυξημένο κίνδυνο για ανάπτυξη CRC (95% CI: 3,89 – 7,02,

P

& lt? 0.0001).

Η

Συζήτηση

η έγκαιρη εξέταση και παρακολούθηση των ατόμων προηγουμένως διαγνωστεί με αδενώματα του παχέος εντέρου είναι ο ακρογωνιαίος λίθος της CRC πρόληψης [3]. Παρ ‘όλα αυτά, τα ποσοστά συμμόρφωσης σε χώρες με εφαρμόσει κατευθυντήριες γραμμές ελέγχου CRC με βάση τον πληθυσμό απέχουν πολύ από το επιθυμητό για μια επιτυχημένη αντίκτυπο στην CRC συχνότητα [4]. Αν και η τακτική χρήση των NSAIDs έχει σταθερά αποτελεσματική στην πρωτογενή πρόληψη των όγκων παχέος εντέρου η χρήση του επί του παρόντος σε κίνδυνο από την εμφάνιση σοβαρών γαστρεντερικών παρενεργειών σε πληθυσμό μέσος κινδύνου [24]. Έτσι, η πρόκληση πέφτει στον προσδιορισμό των βιολογικών δεικτών που θα μπορούσαν να στοχεύουν τους πληθυσμούς υψηλού κινδύνου για την παχέος εντέρου ή /και chemopreventive στρατηγικές.

Σε αυτή τη μελέτη ασθενών-μαρτύρων που αξιολόγησε τη συμμετοχή των 51 tagSNPs σε τέσσερα γονίδια (

COX-2 /HPGD /SLCO2A1 /ABCC4

) με τους βασικούς ρόλους στην PGE

2 μονοπατιού στην ανάπτυξη CRC. Τα αποτελέσματά μας δείχνουν ότι οι επτά γενετικών πολυμορφισμών που εμπλέκονται στην παχέος καρκινογένεσης: η rs689466A & gt? G στο

COX-2

, η rs1346271G & gt? C και rs1426945G & gt? Α στο

HPGD

, η rs6439448C & gt? Α και rs7616492G & gt? Α στο

SLCO2A1

και η rs1751051T & gt? Α και rs1751031A & gt? G στο

ABCC4

γονίδιο

η rs689466A & gt?. G στο

COX-2

γονίδιο είχε συνεργικό αποτέλεσμα σε CRC ογκογένεση που αυξάνεται με δοσολογία αλληλόμορφο, ενισχύοντας περαιτέρω αιτιολογικός ρόλος του στην ανάπτυξη του καρκίνου. Η ομόζυγο γονότυπο GG ενίσχυσε την ευαισθησία για CRC έναρξη κατά 2-φορές και φάνηκε να έχουν σεξ και το κάπνισμα συνήθειες εξαρτώνται από τη συμπεριφορά, με ολοένα καπνιστές έχουν ένα σχεδόν 6 φορές αυξημένη γενετική προδιάθεση για CRC. Αυτά τα δεδομένα ακολουθούν τις προηγούμενες παρατηρήσεις μας από μια προκαταρκτική μελέτη [19]. Επιπλέον, δύο απλοτύπων που περιέχουν είτε το rs689466G (GGT) ή τα αλληλόμορφα rs5275C (AGC) οδήγησε σε αύξηση κατά 50% σε σχέση με τον κίνδυνο για CRC. Η έλλειψη συνέπειας που παρατηρείται μεταξύ επιδημιολογικές μελέτες σχετικά με την rs689466A & gt? G SNP σε διαφορετικές εθνικές καταγωγές ή μοντέλα καρκίνου φαίνεται να δείχνουν ότι όχι μόνο τον πληθυσμό διαστρωμάτωση και τις συνήθειες του τρόπου ζωής μπορεί να διαμορφώνει αυτήν τη συμπεριφορά πολυμορφισμού, αλλά και την επιρροή της μπορεί να είναι κύτταρο, ιστό και παθολογική κατάσταση- εξαρτώμενη [19], [25] – [29]. Στην πραγματικότητα, σε μία πρόσφατα δημοσιευμένη μελέτη ανέφερε ότι αυτός ο πολυμορφισμός -1195 βρίσκεται στα νουκλεοτίδια ανοδικά εξωνίου 1 αυξάνει

COX-2

μεταγραφική δραστηριότητα σε δύο καρκίνου του παχέος εντέρου κυτταρικές γραμμές [30]. Αυτό ήταν επίσης αισθητή σε ηπατώματος ανθρώπινες κυτταρικές σειρές [31], αλλά ανταγωνίζεται την αυξημένη δραστηριότητα προαγωγέα που παρατηρείται για το rs689466 Ένα αλληλόμορφο σε κυτταρικές γραμμές γαστρικού καρκίνου [25]. COX-2 υπερέκφραση προτείνεται ως ένα από τα μονοπάτια του καπνού προκαλούμενη εμπλέκονται στην καρκινογένεση [32], [33]. Τσιγάρου περιέχει περισσότερες από 60 καρκινογόνες προσδιορίζονται ακόμη και αν ορισμένες, όπως, νικοτίνη και βενζο [a] πυρένιο, δείχθηκε να ενεργοποιεί την έκφραση της COX-2 έως

b

-αδρενοϋποδοχείς και ERK1 /2 μονοπάτια, αντίστοιχα, το παθογένεση της που σχετίζονται με το κάπνισμα CRC εξακολουθεί μελετημένη [34]. Περαιτέρω λειτουργικές μελέτες που απαιτούνται για να αποσαφηνιστεί η φύση αυτής της αλληλεπίδρασης γονιδίων-περιβάλλοντος

Η rs5275T & gt?. πολυμορφισμός C, ορίζεται σε 8473 ζεύγη βάσεων από το εξώνιο 1, στο παρελθόν ήταν που σχετίζονται με αυξημένο κίνδυνο για ορθοκολικού αδενώματος και εδώ με ένα υψηλότερη ευαισθησία για CRC στο πλαίσιο του απλοτύπου AGC (vs AGT) [18]. Αυτή η υποκατάσταση Τ-to-C στο 3’UTR αποδείχθηκε να συμβάλει στην COX-2 υπερέκφραση με την διατάραξη της miR-542-3p:. Αλληλεπίδραση mRNA και έτσι μειώνοντας COX-2 mRNA αποσύνθεση [35]

Όπως ήδη αναφέρθηκε, η COX-2 έχει ένα κυρίαρχο ρόλο στη σύνθεση της προ-καρκινογόνων PGE

2 βιοδραστικών λιπιδίων και τον κεντρικό μοριακό στόχο των ΜΣΑΦ. Στην πραγματικότητα Τσαν και οι συνεργάτες του [36] παρατήρησαν ότι προληπτικό ρόλο της ασπιρίνης ήταν αποκλειστικά αποτελεσματικό στην υποομάδα των καρκίνων του παχέος εντέρου που υπερεκφράζουν COX-2 ένζυμο. Έτσι, η γενετική μεταβλητότητα

COX-2

γονιδίου μπορεί να βοηθήσει στην πρόβλεψη άτομα σε μεγαλύτερο κίνδυνο και αναμένεται να εκτεθούν σε υψηλότερα επίπεδα της COX-2.

Η έκφραση και η δραστηριότητα των 15-PGDH καταστέλλεται σε καρκίνο του παχέος εντέρου και APC

αδενώματα min ποντίκι, που οδηγεί σε μείωση της PGE

2 καταβολισμό, τοπική συσσώρευση στους ιστούς του PGE

2 και αντίσταση στην Celecoxib χημειοπρόληψη σε όγκους του παχέος εντέρου [11], [13] .

δεν ήταν σε θέση να αναπαράγουν του πληθυσμού μας, τις ενώσεις που αναφέρθηκαν σε προηγούμενες μελέτες [20], [21], [37].

You must be logged into post a comment.