PLoS ONE: Ο πολυμορφισμός rs2233678 στο PIN1 Ανάδοχος Περιφέρεια Μειωμένο κίνδυνο καρκίνου: Μια μετα-Analysis


Αφηρημένο

Ιστορικό

Δημοσίευση στοιχεία δείχνουν ότι ο rs2233678 (-842 G & gt? C) πολυμορφισμός στην ο PIN1 (πεπτιδυλο-προλυλο cis /trans somerase NIMA-αλληλεπιδρούν 1) περιοχή υποκινητή μπορεί να σχετίζεται με τον κίνδυνο καρκίνου? Ωστόσο, το συμπέρασμα είναι ακόμα ασαφή

Μέθοδοι

Είμαστε σε μια μετα-ανάλυση για να διαπιστωθεί αν -842 G & gt?. C πολυμορφισμού συσχετίστηκε με τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου. αναλογία πιθανοτήτων (OR) και 95% διαστήματα εμπιστοσύνης (95% CI) χρησιμοποιήθηκαν για την αξιολόγηση της αντοχής του συνεταιρίζεσθαι. δεδομένα κατανομής γονότυπου και προσαρμοσμένο ΕΑΠ συλλέχθηκαν για τον υπολογισμό των συγκεντρωμένων ΕΑΠ. Μετα-παλινδρόμησης έγινε για τον εντοπισμό της πηγής της ετερογένειας. προκατάληψη δημοσίευση αξιολογήθηκε με δοκιμή Egger και δοκιμασία Begg του.

Αποτελέσματα

Ένα σύνολο των 11 επιλέξιμων μελετών, συμπεριλαμβανομένων των 9280 συμμετεχόντων, εντοπίστηκαν και αναλύθηκαν. Συνολικά, βρήκαμε ότι οι μεταφορείς της C αλληλόμορφο -842 συσχετίστηκαν με σημαντικά μειωμένο κίνδυνο καρκίνου (C έναντι G, OR = 0.750, 95% CI: 0,639 – 0,880, P

ετερογένεια = 0,014, εκτιμάται ότι από τα στοιχεία της διανομής γονότυπο ? CC + GC εναντίον GG, OR = 0.668, 95% CI: 0,594 – 0,751, P

ετερογένεια = 0,638, εκτιμάται από προσαρμοστεί ΕΑΠ). Δεν παρατηρήθηκαν ενδείξεις για μεροληψία δημοσίευσης. Μετα-παλινδρόμησης αποκάλυψε ότι εθνότητες (p = 0,021) και το μέγεθος του δείγματος (p = 0.02), αλλά όχι πηγές ελέγχου (p = 0.069) ήταν η πηγή της ετερογένειας.

Συμπέρασμα

Αυτά τα αποτελέσματα δείχνουν ότι οι rs2233678 PIN1 (-842 G & gt? C) πολυμορφισμός μειώνει σημαντικά τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου

Παράθεση:. Li Q, Dong Ζ, Λιν Υ, Jia Χ, Li Q, Jiang H, et al. (2013) του πολυμορφισμού rs2233678 στο PIN1 Ανάδοχος Περιφέρεια Μειωμένο κίνδυνο καρκίνου: Μια μετα-ανάλυση. PLoS ONE 8 (7): e68148. doi: 10.1371 /journal.pone.0068148

Επιμέλεια: Α Ρ Μ Ruhul Amin, Winship Cancer Institute του Πανεπιστημίου Emory, Ηνωμένες Πολιτείες της Αμερικής

Ελήφθη: 14 Απριλίου 2013? Αποδεκτές: 26η Μαΐου 2013? Δημοσιεύθηκε: 9 Ιουλίου 2013

Copyright: © 2013 Li et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Αυτό το έργο υποστηρίζεται από το Ίδρυμα Φυσικών Επιστημών της Κίνας (81071664 και 81272714) και Pudong Νέο Χώρο Ταμείο Υγείας Bureau (PWRd2010-07). Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

φωσφορυλίωση Pro-κατευθυνόμενη είναι ένας σημαντικός μηχανισμός σηματοδότησης, η οποία ρυθμίζει διάφορες κυτταρικές διαδικασίες, όπως πολλαπλασιασμό κυττάρων, στην εξέλιξη του κυτταρικού κύκλου, μεταγραφική ρύθμιση, επεξεργασία RNA και της διαφοροποίησης των κυττάρων [1], [2]. Πεπτιδυλο-προλυλο cis /trans somerase NIMA-αλληλεπιδρώντας 1, PIN1, είναι ένας βασικός ρυθμιστής του ρυθμιστικού μηχανισμού postphosphorylation, η οποία ελέγχει τη διαμόρφωση των προ-κατευθυνόμενης θέσεις φωσφορυλίωσης [3], [4]. Συνεπής με ρυθμιστική λειτουργία του, PIN1 εμπλέκεται στη διαδικασία της καρκινογένεσης. Έχει αναφερθεί ότι PIN1 είναι παρεκκλίνοντα υπερεκφράζεται σε ορισμένους κοινούς καρκίνους, όπως του πνεύμονα, του μαστού, του παχέος εντέρου και του προστάτη [5] – [8]

πολυμορφισμών ενός νουκλεοτιδίου (SNPs) του PIN1 και του καρκίνου. κίνδυνος έχουν ερευνηθεί από αρκετές μελέτες [9] – [16]. Μέχρι σήμερα, ένας αριθμός 3 Κοινή SNPs του PIN1 έχουν ευρέως διερευνηθεί, δηλαδή δύο παραλλαγές στην περιοχή του PIN1 υποκινητή: rs2233678 (G & gt? C στο νουκλεοτίδιο -842) και rs2233679 (Τ & gt? C στο νουκλεοτίδιο -667) και μία SNP σε η περιοχή κωδικοποίησης (rs2233682, G & gt? Α? Gln33Gln). Στοιχεία έδειχναν ότι ο πολυμορφισμός rs2233682, η συνώνυμη αλλαγή PIN1, δεν μετέβαλε τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου [10], [11]. Ωστόσο, ο συσχετισμός μεταξύ rs2233678 (-842 G & gt? C) πολυμορφισμό και την ευαισθησία στον καρκίνο ήταν ακόμα ασαφή. Χαν και οι συνεργάτες του [10] διαπίστωσαν ότι το αλληλόμορφο C του -842 G & gt? C πολυμορφισμού συσχετίστηκε με μειωμένο κίνδυνο καρκίνου του μαστού, ενώ Σεγκάτ και Naidu έδειξε το -842 G & gt? C πολυμορφισμός δεν επηρεάζει την ευαισθησία σε ηπατοκυτταρικό καρκίνωμα [15] ή του καρκίνου του μαστού [14]. Έτσι, είναι απαραίτητο να εξακριβωθεί αν το rs2233678 (-842 G & gt? C) πολυμορφισμός σχετίζεται με αλλαγμένη κίνδυνο καρκίνου ή όχι. Για να απαντήσουμε στο ερώτημα αυτό, πραγματοποιήσαμε αυτή την μετα-ανάλυση για να παρέχει μια πιο ακριβή εκτίμηση του συνεταιρίζεσθαι και την καλύτερη κατανόηση της σχέσης μεταξύ rs2233678 (-842 G & gt? C). Πολυμορφισμό και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου

Αποτελέσματα

Υπήρχαν 87 άρθρα σχετικά με την αναζήτηση στρατηγικής (PubMed: 12? EMBASE: 31? CNKI: 44). Το διάγραμμα ροής που φαίνεται στο σχήμα 1 συνοψίζει τη διαδικασία επιλογής μελέτη. Στη μελέτη των Naidu και οι συνεργάτες του [14], τα δεδομένα γονότυπο παρουσιάστηκαν ξεχωριστά ανάλογα με τις διαφορετικές πληθυσμού (Μαλαισιανοί, Κινέζοι και Ινδοί)? στη μελέτη των Lu et al [12], τα δεδομένα γονότυπο επίσης παρουσιάζονται χωριστά, σύμφωνα με διαφορετικό σύνολο της μελέτης (σύνολο δοκιμής και σύνολο επικύρωσης). Ως εκ τούτου, μπορούμε να αντιμετωπίζονται ως ξεχωριστές μελέτες. Έτσι, συνολικά 11 ανεξάρτητες μελέτες [9] – [16], συμπεριλαμβανομένων 4.619 περιπτώσεις και 4.661 έλεγχοι χρησιμοποιήθηκαν σε αυτή την μετα-ανάλυση. PIN1 πολυμορφισμών και καρκίνος του κινδύνου διερευνήθηκε σε 7 είδη καρκίνου (καρκίνωμα του οισοφάγου, του λάρυγγα καρκίνωμα πλακωδών κυττάρων, πλακώδες καρκίνωμα της κεφαλής και του τραχήλου, ηπατοκυτταρικό καρκίνωμα, τον καρκίνο του μαστού, καρκίνο του πνεύμονα και ρινοφαρυγγικό καρκίνωμα). Οι επιλέξιμες μελέτες αταξινόμητους και κύρια χαρακτηριστικά που παρατίθενται στον Πίνακα 1, καθώς και τα δεδομένα της κατανομής γονότυπου. Υπήρχαν 8 μελέτες της ασιατικής καταγωγής και 3 μελέτες του Καυκάσου καταγωγή. Δοκιμή για Hardy-Weinberg ισορροπία (HWE) στον πληθυσμό ελέγχου έγινε για κάθε μελέτη, και η κατανομή γονότυπων δεν ήταν σε συμφωνία με HWE σε μία μελέτη [15].

Στα άρθρα από Naidu και Lu, ανέφεραν 3 μελέτες και μελέτες 2 χωριστά, αντίστοιχα, και το καθένα από αυτά υποβλήθηκε σε επεξεργασία ως ανεξάρτητη μελέτη. Έτσι, συνολικά 11 μελέτες που περιλαμβάνονται στην ποσοτική σύνθεση

Η

Κυριότερα αποτελέσματα

-842 G & gt?.. Γ πολυμορφισμό και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου εκτιμάται από τα δεδομένα κατανομής γονότυπου

Ο Πίνακας 2 παρουσιάζει αναλυτικά αποτελέσματα σύγκρισης και ετερογένεια μεταξύ των μελετών. Με απευθείας τη συγκέντρωση δεδομένων κατανομή γονότυπων, σε συνολική σύγκριση, βρήκαμε ότι ο -842 G & gt? C πολυμορφισμού συσχετίστηκε με μειωμένο κίνδυνο καρκίνου, και συγκεκριμένα η PIN1 -842 C αλληλόμορφο σημαντικά μειωμένο κίνδυνο καρκίνου, σε σύγκριση με το -842 G αλληλόμορφο (C vs. G, OR = 0.750, 95% CI: 0,639 έως 0,880, Ρ

ετερογένεια = 0,014, Σχήμα 2). Σημαντική συσχέτιση παρατηρήθηκε επίσης στις συγκρίσεις του GC εναντίον GG και CC + GC εναντίον GG. αναλύσεις υποομάδων πραγματοποιήθηκαν σύμφωνα με τις εθνικότητες, τις πηγές του ελέγχου και το μέγεθος του δείγματος. Δεν παρατηρήθηκε σημαντική συσχέτιση του -842 G & gt? C πολυμορφισμού με τον κίνδυνο καρκίνου παρατηρήθηκε μεταξύ του Καυκάσου, ενώ φορείς του αλληλόμορφου C παρουσίασαν χαμηλότερο κίνδυνο στις ασιατικές. Οι πηγές του ελέγχου δεν επηρέασε συγκεντρωτικά αποτελέσματα σε ότι τόσο τα αποτελέσματα από μελέτες βασισμένες στον πληθυσμό ή το νοσοκομείο που βασίζονται ήταν περίπου συνεπής. Με διαστρωμάτωση μελέτες από το μέγεθος του δείγματος (μελέτες 500 ή περισσότερους συμμετέχοντες είχαν ταξινομηθεί ως μεγάλο, διαφορετικά ταξινομήθηκαν ως μικρά), βρήκαμε ότι οι μεγάλες μελέτες που προβλέπονται σημαντική συσχέτιση, ενώ οι μικρές μελέτες δεν βρέθηκε καμία αξιοσημείωτες διαφορές.

σύγκριση αλληλόμορφο υπολογίζεται με τυχαία εφέ μοντέλο. αναλογία πιθανοτήτων = 0,750, 95% διαστήματα εμπιστοσύνης: 0,639 – 0,880

Η

-842 G & gt? C πολυμορφισμός και τον κίνδυνο καρκίνου εκτιμάται από προσαρμοστεί ΕΑΠ

Ο Πίνακας 3 δείχνει το.. αποτελέσματα μετα-ανάλυση υπολογίζονται προσαρμοστεί ΕΑΠ. Συνεπής με τα αποτελέσματα από τα στοιχεία γονότυπο, το C αλληλόμορφο PIN1 -842 σχετίστηκε με μειωμένη ευαισθησία στον καρκίνο και στις τρεις συγκρίσεις (comparison ομοζυγώτες, ετεροζυγώτες σύγκριση και κυρίαρχο μοντέλο), ειδικά σε σύγκριση ομοζυγώτες (CC εναντίον GG, OR = 0,589, 95% CI: 0,394 έως 0,880, Ρ

ανομοιογένεια = 0.885? Σχήμα 3), στην οποία δεν παρατηρήθηκε σημαντική συσχέτιση όταν εκτιμάται από δεδομένα κατανομής γονότυπο. Επιπλέον, μείωσαν τον κίνδυνο καρκίνου παρατηρήθηκαν σε κάθε υποομάδα, συμπεριλαμβανομένων Καυκάσιο πληθυσμό.

σύγκριση ομοζυγώτες υπολογίζονται με σταθερές ενέργειες μοντέλο. αναλογία πιθανοτήτων = 0,589, 95% διαστήματα εμπιστοσύνης:. 0,394 έως 0,880

Η

Αξιολόγηση των Δημοσίευση Bias, ετερογένεια και Ευαισθησία

τεστ Egger και δοκιμασία Begg που πραγματοποιήθηκαν για την αξιολόγηση της δημοσίευση προκατάληψη των επιλέξιμων μελετών. Αυτές οι δοκιμές αποκάλυψαν καμία ένδειξη για μεροληψία δημοσίευσης (C εναντίον G υπολογίζεται από δεδομένα κατανομής γονότυπο, P

Begg = 1.000, P

Egger = 0,604, Εικόνα 4? CC εναντίον GG εκτιμάται από προσαρμοστεί ΕΑΠ, P

Begg = 0,175, Ρ

Egger = 0.234, Εικόνα 5). Όπως φαίνεται στον Πίνακα 2, ήταν σημαντική ετερογένεια σε αλληλόμορφο και σύγκριση ετεροζυγώτη, έτσι μετα-παλινδρόμησης διεξήχθη για την ανίχνευση της πηγής της ετερογένειας. Βρήκαμε ότι οι εθνότητες (p = 0,021) και το μέγεθος του δείγματος (p = 0.02), αλλά όχι πηγές ελέγχου (p = 0,069), συνέβαλαν στην ετερογένεια. ανάλυση ευαισθησίας πραγματοποιήθηκε επίσης με την παράλειψη μια μελέτη κάθε χρόνο για να αξιολογήσει την επίδραση της ατομικής μελέτης. Κανένα άτομο μελέτη επηρεάζονται συγκεντρωτικά αποτελέσματα σημαντικά (τα δεδομένα δεν παρουσιάζονται).

Οι κύκλοι αντιπροσωπεύουν το βάρος της ατομικής μελέτης. δοκιμή Egger, το p = 0.604? δοκιμασία Begg, το p = 1.000.

Η

Οι κύκλοι αντιπροσωπεύουν το βάρος της ατομικής μελέτης. δοκιμή p Egger είναι = 0,124? δοκιμασία Begg, το p = 0,175

Η

Συζήτηση

Σε αυτό το μετα-ανάλυση, 11 μελέτες [9] – [16]., συμπεριλαμβανομένων των 9280 συμμετεχόντων, εντοπίστηκαν και αναλύθηκαν. Δείξαμε ότι ο rs2233678 (-842 G & gt? C) πολυμορφισμός στην περιοχή υποκινητή PIN1 συνδέθηκε με μια σημαντικά μειωμένη ευαισθησία στον καρκίνο. Αυτή η συσχέτιση παρατηρήθηκε σε χώρες της Ασίας και του Καυκάσου πληθυσμού τόσο.

Το ανθρώπινο γονίδιο PIN1 βρίσκεται στο χρωμόσωμα θέση 19p13, με μια περιοχή του υποκινητή περίπου 1,5 kb. PIN1 ανήκει στην οικογένεια εξελικτικά συντηρημένη πεπτιδυλο-προλυλο ισομεράσης (ΡΡΙάσης) των πρωτεϊνών [17] που διαμορφώνει την ισομερισμού των ομολόγων προλίνη αμιδίου μεταξύ του

cis

και

trans

διαμόρφωσης, αλλάζοντας έτσι την επιβεβαίωση του υποστρώματος του [2], [18]. PIN1 περιέχει μια καρβοξυ-τερματική καταλυτική περιοχή και μια διατηρημένη WW (Trp-Trp) περιοχή η οποία μπορεί να αλλάξει διαμόρφωση φωσφοπρωτεϊνών από αναγνώρισης και σύνδεσης σε ειδικές φωσφόρου-Ser /Thr-Pro μοτίβα [19]. Προηγούμενες μελέτες έχουν δείξει ότι PIN1 ρυθμίζει πολλές ογκογόνες και όγκου πρωτεΐνες καταστολέα, όπως κυκλίνη D1 [20], Cdc27 [21], c-Jun [5], β-κατενίνης [8], Bcl-2 [22], Mytl [ ,,,0],23], NFAT [24], CK-2 [25], ρ53 και ρ73 [26]. Όλες αυτές οι πρωτεΐνες περιέχουν φωσφορυλιώνεται Ser /Thr-Pro μοτίβα και είναι βασικοί ρυθμιστές του κυτταρικού κύκλου ή ογκογόνο και του όγκου των πρωτεϊνών καταστολέα. Επιπλέον, παρεκκλίνουσα έκφραση του PIN1 έχει αναφερθεί σε διάφορους καρκίνους [5] – [8]. Έτσι, ε τα στοιχεία δείχνουν ότι PIN1 παίζει σημαντικό ρόλο στη διαδικασία της καρκινογένεσης

Οι δύο SNPs (rs2233678, -842 G & gt? C? Rs2233679, -667 Τ & gt? C). Απαντούν στην περιφέρεια PIN1 προαγωγού έχουν έχει αποδειχθεί ότι επηρεάζει το επίπεδο έκφρασης της PIN1. Σεγκάτ και οι συνεργάτες του διαπίστωσαν ότι η -842 CC γονότυπο ήταν σημαντικά σχετίζεται με χαμηλότερα επίπεδα PIN1 πρωτεΐνης σε σύγκριση με το γονότυπο CC -667 στα περιφερικά μονοπύρηνα κύτταρα των υγιών συμμετεχόντων [27]. Lu και οι συνεργάτες έδειξαν επίσης ότι ο -842 G αλληλόμορφο αυξημένη έκφραση PIN1 σε σύγκριση με το C αλλήλιο -842 σε καρκίνο κεφαλής και τραχήλου κυτταρικές γραμμές [11], υποδεικνύοντας ότι η C αλληλόμορφο παραλλαγή -842 μείωσε την δραστηριότητα προαγωγέα. Λαμβάνοντας υπόψη την ογκογένεση ρόλο της PIN1 και τη δραστηριότητα αλλαγμένη υποκινητή που προκαλείται από -842 G & gt? Παραλλαγή C, είναι λογικό να συμπεράνουμε ότι το -842 G & gt?. C πολυμορφισμός στην περιοχή PIN1 υποκινητή μπορεί να μεταβάλει τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου

η παρούσα μετα-ανάλυση, βρήκαμε ότι σημαντική ετερογένεια ήταν παρούσα σε ετεροζυγώτη και σύγκριση αλληλόμορφο. Εκτελώντας ανάλυση των υποομάδων και μετα-παλινδρόμησης, βρήκαμε ότι οι εθνότητες και το μέγεθος του δείγματος ήταν υπεύθυνοι για την ετερογένεια. Αυτό θα μπορούσε να εξηγηθεί από το γενετικό υπόβαθρο, παράγοντες κινδύνου τρόπο ζωής, καθώς και οι περιβαλλοντικοί παράγοντες που εκτίθενται είναι διαφορετικά μεταξύ Ασίας και του Καυκάσου πληθυσμού. Επιπλέον, η ανάλυση ευαισθησίας πραγματοποιήθηκε για να αξιολογηθεί η επίδραση της κάθε μελέτης, και τα αποτελέσματα έδειξαν ότι μας μετα-ανάλυση δεν επηρεάστηκε από την ατομική μελέτη. Επιπλέον, υπάρχουν ενδείξεις για μεροληψία δημοσίευσης ανιχνεύθηκε, η οποία έδειξε ότι τα αποτελέσματά μας ήταν αξιόπιστη.

Ωστόσο, τα αποτελέσματά μας θα πρέπει να ερμηνεύονται με προσοχή, δεδομένου ότι αυτό μετα-ανάλυση είχε κάποιους περιορισμούς. Πρώτον, περιορίζεται από τον αριθμό των μελετών γενετικής συσχέτισης, δεν είχαμε εκτιμήσει την -842 G & gt? C πολυμορφισμός και ο κίνδυνος ενός ορισμένου τύπου καρκίνου. Δεδομένου ότι οι παράγοντες κινδύνου ενός καρκίνου του διαφέρουν από άλλα, τα αποτελέσματά μας δεν θα μπορούσε απλά να εφαρμοστεί σε όλα τα είδη καρκίνου. Δεύτερον, το μέγεθος του δείγματος της κάθε περιλαμβάνονται μελέτες ήταν σχετικά μικρή, η οποία μπορεί ενδεχομένως να οδηγήσει σε προκατάληψη όμως ανάλυση ευαισθησίας, δοκιμή Begger και δοκιμή Egger αποκάλυψε σημαντικές διαπιστώσεις. Τρίτον, η κατανομή γονότυπο στους ελέγχους δεν συμφωνούν με Hardy-Weinberg ισορροπία σε μία μελέτη, η οποία μπορεί να διαταράσσουν συγκεντρωτικά αποτελέσματα. . Ωστόσο, όταν είχε αποκλειστεί αυτή η μελέτη, θα εξακολουθεί να παρατηρείται μια σημαντική συσχέτιση

Για την περίληψη, μας μετα-ανάλυση δείχνει ότι η -842 G & gt? C πολυμορφισμός σχετίζεται με μειωμένο κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου. Να συμμορφώνονται αυτή τη συσχέτιση, μεγάλο δείγμα μεγέθους και καλά σχεδιασμένες μελέτες ασθενών-μαρτύρων δικαιολογημένη.

Υλικά και Μέθοδοι

Αναγνώριση των Επιλέξιμων Σπουδών

Αυτή η μελέτη διεξήχθη και αναφέρονται σε συμφωνία με τις κατευθυντήριες γραμμές PRISMA για συστηματικές ανασκοπήσεις και μετα-αναλύσεις (συμπληρωματικές πληροφορίες:. πίνακα S1 κατάλογος PRISMA). μελέτες ασθενών-μαρτύρων επιλέξιμες εξήχθησαν από την αναζήτηση βάσεων δεδομένων και χειροκίνητη αναζήτηση των στοιχείων των σχετικών άρθρων και σχολίων. Προκειμένου να εντοπιστούν και πολλά σχετικά άρθρα του δυνατού, PubMed, EMBASE και Υποδομών China National Γνώσης (CNKI) αναζητήθηκαν χρησιμοποιώντας λέξεις-κλειδιά «PIN1», «πολυμορφισμός», και «καρκίνος». Εξετάστηκαν επίσης εναλλακτικές ορθογραφίες από αυτές τις λέξεις-κλειδιά. Δεν υπήρχε κανένας περιορισμός της έρευνας και η τελευταία έρευνα πραγματοποιήθηκε τον Μάιο του 2013. Οι παραπομπές των σχετικών μελετών και αξιολογήσεις έγιναν με το χέρι έψαξε για πρόσθετες μελέτες.

ένταξης και αποκλεισμού Κριτήρια

Οι μελέτες επιλέχθηκαν σύμφωνα με τα ακόλουθα κριτήρια συμμετοχής: (1) μελέτες ασθενών-μαρτύρων? (2) διερευνά τη σχέση μεταξύ PIN1 -842 G & gt? C πολυμορφισμού και του καρκίνου του κινδύνου? (3) με τα στοιχεία διανομής γονότυπο για τον υπολογισμό των συνδυασμένων ΕΑΠ και 95% ΠΙ ή διατίθενται προσαρμοσμένη ΕΑΠ και 95% ΠΙ. Μελέτες χωρίς δεδομένα κατανομής λεπτομέρεια γονότυπο αποκλείστηκαν. Τίτλοι και περιλήψεις από την αναζήτηση εγγραφών ήταν κατά κύριο λόγο προβληθεί και πλήρεις εργασίες κειμένου περαιτέρω ανακτώνται για επιβεβαίωση επιλεξιμότητας. Δύο κριτές (Qi Li και Zhao Dong) εξάγεται επιλέξιμες μελέτες ανεξάρτητα σύμφωνα με τα κριτήρια ένταξης. Διαφωνία μεταξύ των δύο κριτές συζητήθηκε με άλλο κριτικός (Yong Gao) μέχρι επιτεύχθηκε συναίνεση.

Εξόρυξη Δεδομένων

Τα στοιχεία των επιλέξιμων μελετών εξήχθη από δύο κριτές (Qi Li και Zhao Dong) ανεξάρτητα με μια προ-σχεδιασμένη μορφή συλλογής δεδομένων. Τα ακόλουθα δεδομένα συλλέχθηκαν: όνομα του πρώτου συγγραφέα, το έτος δημοσίευσης, τη χώρα όπου διεξήχθη η μελέτη, την εθνικότητα, τύπους καρκίνου, την πηγή του ελέγχου, Hardy-Winberg ισορροπία, τον αριθμό των περιπτώσεων και των ελέγχων, η συχνότητα του γονότυπου στις περιπτώσεις και τους ελέγχους, προσαρμόζεται αναλογίες πιθανοτήτων (OR) και 95% διαστήματα εμπιστοσύνης (ΠΙ). Διαφορετικές καταβάσεις εθνικότητα είχαν χαρακτηριστεί ως Ασίας και του Καυκάσου. Επιλέξιμες μελέτες ορίστηκαν ως νοσοκομείο με βάση (ΗΒ) και με βάση τον πληθυσμό (PB), σύμφωνα με την πηγή ελέγχου. Όταν Hardy-Winberg ισορροπίας (HWE) στους ελέγχους ελέγχθηκε από chi-square test για την αγαθότητα του ταιριάζει. Δύο σχολιαστές επιτευχθεί συναίνεση σχετικά με κάθε στοιχείο

Στατιστική Ανάλυση

Η δύναμη σύνδεσης μεταξύ PIN1 rs3746444 (-842 G & gt? C). Πολυμορφισμό και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου μετρήθηκε με Ή με 95% CI. Οι εκτιμήσεις των συγκεντρωμένων ΕΑΠ επιτεύχθηκαν με τον υπολογισμό ενός δεδομένα κατανομής datagenotype διανομής γονότυπο ή προσαρμόζεται ΕΑΠ και 95% πιστωτικών ιδρυμάτων κάθε μελέτη. Ένα 95% CI χρησιμοποιήθηκε για τη δοκιμή στατιστικής σημαντικότητας και 95% CI χωρίς 1 για Ή δείχνει μια σημαντική αυξηθεί ή να μειωθεί κίνδυνο καρκίνου. Τα συγκεντρωτικά ΕΑΠ υπολογίστηκαν για σύγκριση αλληλόμορφο (C έναντι G), η σύγκριση ομοζυγώτες (ΦΕΚ έναντι CC), η σύγκριση ετεροζυγώτες (GC έναντι GG), κυρίαρχη (CC + GC έναντι GG) και υπολειπόμενη (CC έναντι GC + GG) τρόπους, υποθέτοντας κυρίαρχο και υποτελούς επιδράσεις του αλληλόμορφου παραλλαγής C, αντίστοιχα. αναλύσεις υποομάδων διεξήχθησαν επίσης να διερευνήσει τις επιπτώσεις της συγχυτικούς παράγοντες: τις εθνότητες, τις πηγές του ελέγχου και το μέγεθος του δείγματος. Αναλύσεις ευαισθησίας έγιναν να εντοπίζεται μεμονωμένα μελέτη »επίδραση στα συγκεντρωτικά αποτελέσματα και να εξετάσει την αξιοπιστία των αποτελεσμάτων.

Chi-square test Q βάση χρησιμοποιήθηκε για να ελεγχθεί η στατιστική ετερογένεια μεταξύ των μελετών, και η ετερογένεια θεωρήθηκε σημαντική όταν ρ & lt ? 0.10 [28]. Το μοντέλο σταθερών επιδράσεων (με βάση τη μέθοδο Mantel-Haenszel) και το μοντέλο τυχαίων δράσεων (με βάση τη μέθοδο Dersimonian-Laird) χρησιμοποιήθηκαν για να συγκεντρώσουν τα στοιχεία από διάφορες μελέτες. Το μοντέλο σταθερών επιδράσεων χρησιμοποιήθηκε όταν δεν υπήρχε σημαντική ετερογένεια? Αλλιώς, εφαρμόστηκε το μοντέλο τυχαίων δράσεων [29]. Μετα-παλινδρόμησης έγινε για τον εντοπισμό της πηγής της ετερογένειας και p & lt? 0,05 θεωρήθηκε σημαντική [30]

προκατάληψη Δημοσίευση ανιχνεύθηκε με οικόπεδο Begg του χωνιού και δοκιμή γραμμικής παλινδρόμησης του Egger », και σ & lt?. 0.05 θεωρήθηκε σημαντική [31]. Όλες οι στατιστικές αναλύσεις υπολογίστηκαν με το λογισμικό STATA (έκδοση 10.0? StataCorp, College Station, Texas USA). Και όλες οι τιμές P ήταν δύο-side.

Υποστήριξη Πληροφορίες

Πίνακα S1.

PRISMA λίστα ελέγχου

doi:. 10.1371 /journal.pone.0068148.s001

(DOC)

You must be logged into post a comment.