PLoS One: Γονιδιώματος-Wide γονιδιακής έκφρασης Αναλύσεις Προφίλ Προσδιορίστε CTTN ως πιθανό προγνωστικό δείκτη για τον καρκίνο του οισοφάγου


Αφηρημένο

Σκοπός

οισοφαγικό καρκίνωμα πλακωδών κυττάρων (ESCC) είναι ένα από τα πιο κοινά θανατηφόρα malignances της πεπτικής οδού. πρόγνωση του είναι κακή, κυρίως λόγω της έλλειψης αξιόπιστων δεικτών για την έγκαιρη ανίχνευση και προγνωστική πρόβλεψη. Εδώ έχουμε ως στόχο να προσδιορίσει τα μόρια που εμπλέκονται στην καρκινογένεση ESCC και εκείνων που ως πιθανοί δείκτες για την πρόγνωση και ως νέων μοριακών θεραπευτικών στόχων.

Μέθοδοι

πραγματοποιήσαμε αναλύσεις προφίλ γονιδιακής έκφρασης του γονιδιώματος-πάνω από 10 πρωτοβάθμια ESCCs και των παρακείμενων φυσιολογικών ιστών τους με μικροσυστοιχίες cDNA που εκπροσωπούν 47.000 αντίγραφα και παραλλαγές. Υποψήφια γονίδια στη συνέχεια επικυρώθηκαν από ημι ποσοτική αντίστροφη μεταγραφή-PCR (RT-PCR), μικροσυστοιχίες ιστού (TMAs) και ανοσοϊστοχημεία χρώση (IHC).

Αποτελέσματα

Χρησιμοποιώντας μια αυθαίρετη γραμμή αποκοπής του σήματος αναλογία ≥1.5 ή ≤-1,5 log, παρατηρήσαμε 549 έως ρυθμιζόμενων γονιδίων και 766 κάτω-ρυθμιζόμενα γονίδια σε ESCCs σε σύγκριση με το φυσιολογικό οισοφαγικό ιστούς. Οι λειτουργίες του 302 διαφορικά εκφραζόμενων γονιδίων συνδέθηκαν με το μεταβολισμό των κυττάρων, προσκόλληση κυττάρου και ανοσοαπόκριση. Αρκετά υποψήφια γονίδια είχαν διαφορετική έκφραση μεταξύ των οποίων τέσσερις υπερεκφράζεται (CTTN, DMRT2, MCM10 και SCYA26) και δύο υποεκφράζονται (HMGCS2 και SORBS2) στη συνέχεια επαληθεύτηκαν, το οποίο μπορεί να σερβιριστεί ως βιοδείκτες για ESCC. Επιπλέον, η υπερέκφραση του cortactin (CTTN) παρατηρήθηκε σε 126/198 (63,6%) των περιπτώσεων ESCC και συσχετίστηκε σημαντικά με λεμφαδένα μετάσταση (Ρ = 0,000), την παθολογική στάδιο (Ρ = 0,000) και την κακή επιβίωση (Ρ DMRT-Fr:5′-GCGTGGTGTCCTGCCTGAAG-3′,DMRT-Rr:5′-GCCCCTTCTTGTCCTCGGTG-3′;MCM10-Fr:5′-GCAAAAATCCCCTGTAGAGA-3′, MCM10-Rr:5′-CCCCACAATTTGACCTCTAG-3′;SCYA26-Fr:5′-CACCTTGGAACTGCCACACG-3′,SCYA26-Rr:5′-TGGGTACAGACTTTCTTGCC-3′;HMGCS2-Fr:5′-CTGGGATGGTCGTTATGCCA-3′,HMGCS2-Rr:5′-TCGTCAAGGGTGAAGGGTCG-3′;SORBS2-Fr:5′-ACGTAGAGAAACTCACACCT-3′,SORBS2-Rr:5′-TCCTATCACTAGAATAGCTG-3′;GAPDH-Fr:5′-CATGAGAAGTATGACAACAGCCT-3′,GAPDH-Rr:5′-AGTCCTTCCACGATACCAAAGT-3′.

Tissue Μικροσυστοιχίες (TMAs) και ανοσοϊστοχημεία (IHC)

μικροσυστοιχίες ιστών (TMAs) κατασκευάστηκαν με 231 ζεύγη δειγμάτων πρωτογενούς όγκου ESCC και συμφωνημένα φυσιολογικό οισοφαγικό επιθήλιο όπως περιγράφηκε προηγουμένως [15], [16]. Τα δείγματα ESCC ποικίλλει από τον βαθμό στάδιο Ι παθολογικές στον βαθμό III από ασθενείς στην ηλικιακή ομάδα των 40-80 ετών. Πρότυπη μέθοδος σύμπλοκο στρεπταβιδίνης-βιοτίνης-υπεροξειδάσης χρησιμοποιήθηκε για χρώση IHC. Εν συντομία, τομές TMA αποπαραφινοποιήθηκαν, επανυδατώθηκαν και μπλοκαριστεί από 10% φυσιολογικό ορό κατσίκας σε θερμοκρασία δωματίου για 30 λεπτά. Οι τομές στη συνέχεια επωάστηκαν με αντι-cortactin (CTTN) αντίσωμα (Abcam, Cambridge, UK) σε αραίωση 1:300 όλη τη νύκτα στους 4 ° C. Μετά πλύση με TBS, τα πλακίδια επωάστηκαν στη συνέχεια με βιοτινυλιωμένο κατσίκα ανοσοσφαιρίνη αντι-κουνελιού σε μια συγκέντρωση 1:100 για 30 λεπτά στους 37 ° C. Τρεις ανεξάρτητοι ερευνητές ημιποσοτικά αξιολογούνται CTTN θετικότητα, χωρίς προηγούμενη γνώση των κλινικοπαθολογική δεδομένων. Θετική έκφραση CTTN σε φυσιολογικούς και κακοήθεις ιστούς ESCC ήταν κυρίως μοτίβο κυτταρόπλασμα. Επειδή η ένταση της χρώσης CTTN εντός κάθε πυρήνα ιστός ήταν ως επί το πλείστον ομογενή, η ένταση της χρώσης CTTN ήταν ημιποσοτικά αξιολογηθούν χρησιμοποιώντας τα ακόλουθα κριτήρια: ισχυρό θετικό (βαθμολογήθηκε ως 2+), σκούρο καφέ χρώση σε & gt? 50% της κανονικής ή κακοηθών οισοφάγου πλακώδους κύτταρα αποκρύπτοντας εντελώς κυτταρόπλασμα? ασθενές θετικό (1+), οποιοδήποτε μικρότερο βαθμό καφέ χρώση αισθητή στο κυτταρόπλασμα του κυττάρου? απών (βαθμολογήθηκαν ως 0), καμία αισθητή χρώσης σε φυσιολογικά ή κακοήθη οισοφάγου πλακώδη κύτταρα. Εμείς κατατάσσονται ισχυρή θετική έκφραση ως CTTN υπερέκφραση (+), ασθενές θετικό και απουσιάζει η έκφραση ως CTTN δεν υπερέκφραση (-). Περιπτώσεις έγιναν δεκτές ως έντονα θετική μόνο αν οι αναθεωρητές τους ορίζονται ανεξάρτητα ως τέτοια.

Στατιστική Ανάλυση

Η στατιστική ανάλυση έγινε με το SPSS βασική έκδοση 13.0 (SPSS Inc). Η συσχέτιση μεταξύ της έκφρασης CTTN σε ιστούς όγκων και κλινικοπαθολογική χαρακτηριστικά όπως η ηλικία, το φύλο, τη διαφοροποίηση των κυττάρων του όγκου, τους λεμφαδένες μετάσταση και παθολογικές στάδιο αναλύθηκε χρησιμοποιώντας το τεστ chi-square. επιβίωση (DSS) καμπύλες συγκεκριμένες ασθένειες υπολογίστηκαν από την ημερομηνία της διάγνωσης μέχρι την ημερομηνία του θανάτου που σχετίζονται με ESCC ή την τελευταία ημέρα της συνέχειας. Οι καμπύλες επιβίωσης εκτιμήθηκαν με τη μέθοδο Kaplan-Meier και οι διαφορές στους χρόνους επιβίωσης συγκρίθηκαν με τη δοκιμασία log-rank. Σχετική κινδύνους θανάτου από καρκίνο που συνδέονται με την κατάσταση έκφρασης CTTN και κλινικοπαθολογική μεταβλητές όπως η ηλικία, το φύλο, τη διαφοροποίηση των κυττάρων του όγκου και μετάσταση λεμφαδένων εκτιμήθηκαν με μονοπαραγοντική αναλύσεις. πολυπαραγοντική ανάλυση Cox έγινε σε όλες τις μεταβλητές που εντοπίστηκαν να είναι σημαντική σε μονοδιάστατες επίπεδο. Οι διαφορές θεωρήθηκαν σημαντικές όταν η τιμή Ρ ήταν μικρότερη από 0,05.

Αποτελέσματα

Αναγνώριση των διαφορικά εκφραζόμενων γονιδίων μεταξύ ESCC ιστοί και Δίπλα φυσιολογικό οισοφαγικό Επιθήλια

προφίλ γονιδιακής έκφρασης των συγκεντρωμένων όγκων (από 10 ESCCs) και συγκεντρώθηκαν κανονική τους ομολόγους τους ελήφθησαν με ανάλυση μικροσυστοιχιών χρησιμοποιώντας Affymetrix ανθρώπινο γονιδίωμα U133 συν 2,0 συστοιχίες που καλύπτουν 47.000 αντίγραφα και παραλλαγές. Συνολικά 25.206 σετ καθετήρα (μεταγραφές) ήταν παρούσα σε ESCC ιστούς σε σχέση με την κανονική τους ελέγχους τους. Βρήκαμε ότι το 1315 τα γονίδια έδειξαν διαφορετικά επίπεδα έκφρασης. Μεταξύ αυτών των γονιδίων, 549 up-ρυθμιζόμενα γονίδια (41,7%, Πίνακας S1) και 766 ρυθμισμένα προς τα κάτω γονίδια (58,3%, Πίνακας S2) ανιχνεύθηκαν σε ιστούς όγκων σε σχέση με το προφίλ έκφρασης των κανονικών οισοφάγου επιθηλίων, χρησιμοποιώντας μια αυθαίρετη γραμμή αποκοπής αναλογία καταγραφής του σήματος των ≥1.5 ή ≤-1.5. Οι λειτουργικές ρόλοι 715 από αυτά τα γονίδια (340 επάνω ρυθμισμένη και 375 ρυθμισμένα προς τα κάτω) είναι γνωστές. Η λειτουργία του 302 διαφορικά εκφρασμένων γονιδίων (715, 42,24%) σε ιστούς όγκων που σχετίζονται με το μεταβολισμό των κυττάρων (148 γονίδια, Πίνακας S3), προσκόλληση κυττάρου (90 γονίδια, Πίνακας S4), και η ανοσολογική απάντηση (64 γονιδίων, Πίνακας S5 ).

Επικύρωση των επιλεγμένων γονιδίων, με την ημιποσοτική PCR (RT-PCR)

Για να επαληθεύσετε τα δεδομένα μικροσυστοιχιών, τα επίπεδα έκφρασης των 6 τυχαία επιλεγμένων γονιδίων (4 έως ρυθμιζόμενα γονίδια και 2 κατάντη ρυθμιζόμενη γονίδια) εξετάστηκαν με RT-PCR χρησιμοποιώντας τα ίδια δείγματα RNA που χρησιμοποιήθηκαν για ανάλυση μικροσυστοιχίας. Τα πρότυπα έκφρασης των 6 τυχαία επιλεγμένων γονιδίων σε ιστούς όγκων ανιχνεύθηκε με RT-PCR, εκτός SORBS2, ήταν συνεπή με εκείνα από τα αποτελέσματα cDNA μικροσυστοιχίας (Σχήμα 1Α).

(Α) ποσοτικαί αντίστροφη μεταγραφή-ΡΟΚ ( RT-PCR) εφαρμόστηκε για να συγκρίνετε την κατάσταση έκφρασης του CTTN, DMRT2, MCM10, SCYA26, HMGCS2 και SORBS2 μεταξύ 8 ζεύγη δειγμάτων πρωτογενούς όγκου ESCC και συμφωνημένα φυσιολογικό οισοφαγικό επιθήλιο. GAPDH χρησιμοποιήθηκε ως εσωτερικός έλεγχος. (Β) Αντιπρόσωπος της έκφρασης CTNN σε ένα ζεύγος ESCC (δεξιά) και παρακείμενο φυσιολογικό ιστό (αριστερά) ανιχνεύεται με ανοσοχρώση με αντι-αντίσωμα CTNN (καφέ). Το slide με αιματοξυλίνη (Αρχική μεγέθυνση: πάνω × 100, κάτω × 200).

Η

Αξιολόγηση των CTTN ως προγνωστικός δείκτης για ESCC

Για να αξιολογήσει τη δυνατότητα των υποψηφίων υπερεκφράζεται γονίδια ως βιοδείκτες για ESCC, θα πραγματοποιηθεί χρώση IHC με αντίσωμα για CTTN στις μικροσυστοιχίες ιστού που περιέχει 231 ζεύγη των καρκινικών ιστών ESCC και γειτονικό φυσιολογικό οισοφαγικό επιθήλιο τους. Ενημερωτική αποτελέσματα IHC ελήφθησαν από 198 περιπτώσεις ESCC. Μη ενημερωτικό δείγματα περιλαμβάνονται τα χαμένα δείγματα, ανάρμοστα λεκιασμένα δείγματα και δείγματα με πολύ λίγα κύτταρα? όπως δεν χρησιμοποιήθηκαν ως έγκυρα δεδομένα. Παρατηρήσαμε την έκφραση απόκλιση κυτταρόπλασμα των CTTN μεταξύ των πρωτογενών όγκων ESCC και συμφωνημένα φυσιολογικούς ιστούς τους (Σχήμα 1Β). Το ποσοστό των CTTN υπερέκφραση στο ενημερωτικό ιστούς όγκων ESCC ήταν μέχρι 63,6% (126/198), η οποία ήταν σημαντικά υψηλότερη από ότι σε φυσιολογικό οισοφαγικό επιθήλιο (26,8%, 53/198,

P

& lt? 0.001, Wilcoxon rank test υπογραφεί, Σχήμα 1Β και Πίνακας 1). Από τα 198 ενημερωτική περιπτώσεις που εξετάστηκαν, ανιχνεύθηκε ο συσχετισμός μεταξύ της κατάστασης έκφρασης CTTN και κλινικοπαθολογική χαρακτηριστικά ESCCs. Τα αποτελέσματα έδειξαν ότι η υπερέκφραση CTTN συσχετίστηκε σημαντικά με λεμφαδένα μετάσταση (Ρ = 0,000) και παθολογικές στάδιο (Ρ = 0,000). Δεν παρατηρήθηκε σημαντική διαφορά ανιχνεύθηκε σε ηλικία (Ρ = 1,000), το φύλο (Ρ = 0,883) και τη διαφοροποίηση των κυττάρων του όγκου (Ρ = 0,619, Πίνακας 2). Kaplan-Meier ανάλυση επιβίωσης έδειξε ότι οι ασθενείς με CTTN (+) όγκους (n = 126) έχουν σημαντικά χειρότερο ποσοστό επιβίωσης από ό, τι τα άτομα με CTTN (-) όγκους (n = 72) (Ρ & lt? 0.001, log-rank: 19.517, Σχήμα 2Α ). Εν τω μεταξύ, ανάλυση επιβίωσης Kaplan-Meier έδειξε επίσης ότι οι ασθενείς με προχωρημένο παθολογικό στάδιο (ΙΙΒ + ΙΙΙ? N = 85) είχαν σημαντικά χειρότερο ποσοστό επιβίωσης από εκείνους με πρώιμη παθολογική φάση (Ι + ΙΙ Α? N = 113) (P = 0.000, ημερολόγιο -rank: 19.390, Σχήμα 2Β). Επιπλέον, εξετάσαμε την προγνωστική αξία της έκφρασης CTTN σε ασθενείς ESCC με διαφορετικές παθολογικές στάδια. Ασθενείς με CTTN υπερέκφραση είχαν σημαντικά μικρότερο ποσοστό επιβίωσης της νόσου ειδικά από εκείνους που δεν CTTN υπερέκφραση τόσο I + II Α υποομάδα (n = 113, p = 0.001, Εικόνα 3Α) και ΙΙΒ + υποομάδα III (n = 85, p = 0,027, Εικόνα 3Β), δείχνοντας ότι η CTTN θα μπορούσε να είναι ένα πολύτιμο προγνωστικό δείκτη για ESCC. Επιπλέον, μονοπαραγοντική ανάλυση χρησιμοποιήθηκε για να αξιολογήσει τις ενώσεις μεταξύ πρόγνωση και διάφορους παράγοντες συμπεριλαμβανομένης της ηλικίας, του φύλου, της διαφοροποίησης των κυττάρων του όγκου, μετάσταση στους λεμφαδένες και CTTN κατάσταση των όγκων ESCC. Το αποτέλεσμα έδειξε ότι λεμφαδένες μετάσταση (Ρ = 0,000), της διαφοροποίησης των κυττάρων του όγκου (Ρ = 0,001) και την υπερέκφραση του CTTN σε όγκους (Ρ = 0.000) ήταν σημαντική αρνητική προγνωστικούς παράγοντες για τους ασθενείς ESCC (Πίνακας 3). Μεταξύ αυτών των παραμέτρων, πολυπαραγοντικές αναλύσεις χρησιμοποιώντας το μοντέλο αναλογικών κινδύνων Cox αποκάλυψε ότι η υπερέκφραση της CTTN σε ESCC όγκους (P = 0,001), LN μετάσταση (P = 0,003) και τη διαφοροποίηση των κυττάρων του όγκου (P = 0.000) ήταν ανεξάρτητοι προγνωστικοί παράγοντες για ESCC, αντίστοιχα (Πίνακας 3). Συλλογικά, τα ευρήματά μας δείχνουν ότι η υπερέκφραση της CTTN σε όγκους ESCC προβλέπει ανεξάρτητα κακή πρόγνωση για τους ασθενείς με ESCC.

(Α) κατά Kaplan-Meier για το ποσοστό της νόσου ειδικά για την επιβίωση (Σ.Α.Τ.) των ασθενών ESCC με ( n = 126, πράσινη γραμμή) ή χωρίς (n = 72, μπλε γραμμή) CTNN υπερέκφραση. (Β) κατά Kaplan-Meier για το ποσοστό ΣΑΤ των ασθενών ESCC με παθολογικό στάδιο I + II Α (n = 113, μπλε γραμμή) ή ΙΙΒ + ΙΙΙ (n = 85, πράσινη γραμμή).

Η

η

Συζήτηση

οισοφαγικό καρκίνωμα πλακωδών κυττάρων (ESCC) είναι μια ιδιαίτερα επιθετική μορφή καρκίνου, που είναι η τέταρτη κύρια αιτία θανάτου από καρκίνο στην Κίνα [17]. Λόγω της έλλειψης αξιόπιστων διαγνωστικών τεχνικών και συγκεκριμένα συμπτώματα για την ανίχνευση πρώιμο στάδιο, οι περισσότεροι ασθενείς έχουν προχωρήσει σε τοπικό επίπεδο των διαδίδονται καρκίνου κατά τη διάγνωση, όταν καταπίνουν με δυσκολία ή αισθάνονται άβολα. Αρκετοί δείκτες όγκου, όπως το καρκινοεμβρυϊκό αντιγόνο (CEA), το αντιγόνο πλακώδες καρκίνωμα (SCC) και κυτοκερατίνη 19-θραύσμα (Cyfra 21-1), χρησιμοποιούνται στην κλινική διάγνωση όσο και στην παρακολούθηση του ασθενούς. EGFR εκφράζεται σε 33,3% του οισοφάγου πλακωδών κυττάρων καρκινώματα (ESCCs), λαπατινίμπη μπορεί να έχει σημαντική θεραπευτική δράση έναντι EGFR εκφράζουν ESCC αναστέλλοντας την ανάπτυξη των κυττάρων και αυξάνοντας ESCC Herceptin- και Cetuximab διαμεσολαβούμενη ADCC [18]. Στην πραγματικότητα, δεν έχουμε ανακαλύψει κανένα χρήσιμο δείκτη όγκου για την ανίχνευση των ESCC σε πρώιμο στάδιο και αποτελεσματικές θεραπείες μοριακή στόχευση. Η καλύτερη κατανόηση του μοριακού μηχανισμού που εμπλέκονται στην εμφάνιση και ανάπτυξη της ESCC μπορεί να οδηγήσει σε μια πιο αποτελεσματική θεραπεία για τους ασθενείς ESCC και να βρούμε αποτελεσματικές δείκτες για την έγκαιρη διάγνωση και την καλύτερη επιλογή του επικουρικού τρόπους θεραπείας για την κατάλληλη ασθενείς ESCC. . Οποίος καθορίζει σε διαφορές στη γονιδιακή έκφραση μεταξύ ESCC όγκων και φυσιολογικών ιστών είναι απαραίτητο να κατανοήσουμε καλύτερα αυτό το μοριακό μηχανισμό

Ανάλυση του προφίλ έκφρασης μέσω cDNA μικροσυστοιχιών είναι σήμερα χρησιμοποιείται ευρέως σε διάφορα καρκινικά κύτταρα [19] – [21] . Ένα νέο χαρακτηριστικό της παρούσας μελέτης είναι ότι χρησιμοποιήσαμε μια μικροσυστοιχία περιέχει έναν πολύ μεγάλο αριθμό ανιχνευτών για τον προσδιορισμό διαφορική έκφραση γονιδίων μεταξύ ιστών ESCC και συμφωνημένα φυσιολογικό οισοφαγικό επιθήλιο με συστοιχία έκφρασης. Το αποτέλεσμα έδειξε ότι 1.315 γονίδια διαφορικά εκφραζόμενα σε ESCC. Μεταξύ αυτών των γονιδίων, 549 ρυθμίστηκαν προς τα πάνω και 766 είχαν ρυθμισμένα προς τα κάτω. 715 διαφορικά εκφραζόμενα γονίδια με γνωστή λειτουργία, 42,24% σχετίστηκαν με το μεταβολισμό των κυττάρων, κυτταρική προσκόλληση και την ανοσολογική απόκριση. Σε συμφωνία με προηγούμενες εκθέσεις, εντοπίσαμε τα γονίδια, όπως FASCIN (SNL), EGFR και ECRG4, ήταν γνωστό ότι είναι διαφορική έκφραση σε ιστούς ESCC και συμφωνημένα φυσιολογικό οισοφαγικό επιθήλιο [18], [22] – [24]. Επιπλέον, ανακαλύψαμε επίσης αρκετές ESCC σχετίζονται γονίδια τα οποία δεν έχουν προηγουμένως αναφερθεί. Μερικά από διαφορικά εκφραζόμενων γονιδίων μπορεί να είναι χρήσιμα ως διαγνωστικοί δείκτες, προγνωστικοί δείκτες ή νέων θεραπευτικών στόχων. Σε αυτή τη μελέτη, έχουμε επιλέξει ένα up-ρυθμιζόμενο γονίδιο CTTN και εξετάστηκαν κωδικοποιεί πρωτεΐνη (cortactin) κατάσταση έκφρασης του με ανάλυση μικροσυστοιχιών ιστό. Cortactin έχει περιγραφεί ως ακτίνης πρωτεΐνη που συνδέεται με τα ικριώματα, η οποία δεσμεύει και ενεργοποιεί τον σχετίζονται με ακτίνη πρωτεΐνη 2/3 πολύπλοκο, και έχει αναδειχθεί ως κεντρικό στοιχείο που συνδέει τα μονοπάτια σηματοδότησης με κυτταροσκελετού αναδιάρθρωσης [25], [26]. Αναδιαμόρφωση του κυτταροσκελετού της ακτίνης έχει επιπτώσεις στην κυτταρική μετανάστευση, κινητικότητα και πρόσφυση, καθώς και στην εισβολή και μετάσταση όγκου [27]. Η υπερέκφραση του cortactin σχετίζεται με αυξημένη ικανότητα εισβολής των κυττάρων του ηπατοκυτταρικού καρκινώματος [28].

Cortactin υπερεκφράζεται σε πολλούς τύπους ανθρώπινων καρκίνων, συμπεριλαμβανομένων κεφαλής και λαιμού πλακωδών καρκινωμάτων και του παχέος, γαστρικό, ηπατοκυτταρικό, του μαστού και των ωοθηκών [ ,,,0],26], [29]. Προηγούμενες εκθέσεις έδειξαν ότι μια σημαντική συσχέτιση μεταξύ CTTN υπερέκφραση και κακή πρόγνωση σε οστεοσάρκωμα [30]. Στην παρούσα μελέτη, αξιολογήσαμε την κατάσταση έκφρασης του cortactin με τη χρήση υψηλής απόδοσης ανάλυση ΤΜΑ. Η μελέτη μας έχει εκθέσει την πιθανή αξία των CTTN στην πρόβλεψη της επιβίωσης ασθενών σε υποομάδες με πρώιμο ή προχωρημένο παθολογικό στάδιο, γεγονός που υποδηλώνει ότι η υπερέκφραση της CTTN μπορεί να χρησιμοποιηθεί ως ανεξάρτητο παράγοντα για προγνωστικούς πρόβλεψη της ESCC. Ωστόσο, περισσότερη εργασία πρέπει να εκτελείται για να αξιολογήσει περαιτέρω το γονίδιο CTTN για κλινικές εφαρμογές για ESCC ασθενείς.

Εν κατακλείδι, η ανάλυση cDNA μικροσυστοιχιών μας ανιχνευθεί προφίλ γονιδιακής έκφρασης διαφορά μεταξύ των ιστών ESCC και φυσιολογικό οισοφαγικό επιθήλιο και με αυτόν τον τρόπο παρέχονται πολύτιμες πληροφορίες για την περαιτέρω μελέτη η μοριακή βάση στην οποία στηρίζεται η ογκογένεση του καρκίνου του οισοφάγου. Καλύτερη κατανόηση των προφίλ γονιδιακής έκφρασης των ESCC μπορεί να οδηγήσει σε πιο αποτελεσματική διαχείριση των ESCC από ακριβείς προγνωστικούς δείκτες και αποτελεσματική εξατομικευμένη θεραπεία.

Υποστήριξη Πληροφορίες

Εικόνα S1.

doi: 10.1371 /journal.pone.0088918.s001

(ΔΕΘ)

Πίνακα S1.

Up-regualted γονίδια (≥1.5 φορές) σε δέκα περιπτώσεις οισοφαγικού πλακώδους καρκινώματος

doi:. 10.1371 /journal.pone.0088918.s002

(DOC)

Πίνακας S2.

Down-ρυθμιζόμενα γονίδια (≥1.5 φορές) σε δέκα περιπτώσεις οισοφαγικού πλακώδους καρκινώματος

doi:. 10.1371 /journal.pone.0088918.s003

(DOC)

Πίνακα S3.

Λίστα των 148 γονιδίων που σχετίζονται με το μεταβολισμό των κυττάρων

doi:. 10.1371 /journal.pone.0088918.s004

(DOC)

Πίνακας S4.

Λίστα των 90 γονιδίων που σχετίζονται με την κυτταρική προσκόλληση

doi:. 10.1371 /journal.pone.0088918.s005

(DOC)

Πίνακας S5.

Λίστα των 64 γονιδίων που σχετίζονται με την ανοσολογική απάντηση

doi:. 10.1371 /journal.pone.0088918.s006

(DOC)

You must be logged into post a comment.