Αφηρημένο

Στόχος

Για να γίνει διαλογή και χαρακτηρίζουν παραλλαγές βλαστική για το E-cadherin

(Cdh1)

σε μη-κληρονομικό καρκίνο του στομάχου (GC) ασθενείς και σε άτομα που διατρέχουν κίνδυνο GC.

Μέθοδοι

59 GCs, 59 συγγενείς πρώτου βαθμού (FDRs) του GC, 20 αυτοάνοση μεταπλαστικού ατροφική γαστρίτιδα (AMAGs) και 52 αιμοδότες (BD) αναλύθηκαν για

Cdh1

με άμεση αλληλούχιση, διαρθρωτικές μοντελοποίηση και της βιοπληροφορικής. Λειτουργική αντίκτυπο στην ματίσματος αξιολογήθηκε για ιντρονικές μεταλλάξεις. Διεξήχθησαν E-cadherin /β-κατενίνης ανοσοϊστοχημική χρώση και ποσοτικοποίηση του mRNA E-cadherin χρησιμοποιώντας RT-PCR

Αποτελέσματα

Σε GCs, 4 παραλλαγές των εσφαλμένων διευθύνσεων (p.G274S?. p.A298T? p.T470I? p.A592T), 1 μετάλλαξη στην 5’UTR (-71C & gt? G) και 1 μετάλλαξη στο ιντρονική IVS12 (c.1937-13T & gt? C) περιοχή βρέθηκαν. Πρώτα παθογόνο δράση της μετάλλαξης p.A298T είχε προβλεφθεί από πρωτεΐνη 3D modeling. Η μετάλλαξη μυθιστόρημα p.G274S έδειξε μια σαφή λειτουργική σημασία. Επιπλέον, κατ ‘αρχάς, εσονικές IVS12 (c.1937-13T & gt? C) μετάλλαξη αποδείχθηκε να οδηγήσει σε παρεκκλίνουσα

Cdh1

απομαγνητοφώνηση με το εξόνιο 11 διαγραφή. Αυτή η μετάλλαξη βρέθηκε σε 2 ΔΘ και σε 1 BD. Σε FDRs, εντοπίσαμε 4 παραλλαγές: το πολυμορφικό (p.A592T) και 3 μεταλλάξεις σε αμετάφραστες περιοχές με αγνώστων στοιχείων λειτουργικό ρόλο, εκτός από το 5’UTR (-54G & gt? C) που είχε βρεθεί για να μειώσετε

Cdh1

μεταγραφή. Σε AMAGs, εντοπίσαμε 2 αλλαγές: 1 εσφαλμένου νοήματος (p.A592T) και 1 νέα παραλλαγή (IVS1 (c.48 + 7C & gt? T)) χωρίς επίδραση στο

Cdh1

μάτισμα. Αρκετές σιωπηλός και πολυμορφικά αντικαταστάσεις βρέθηκαν σε όλες τις ομάδες που μελετήθηκαν.

Συμπεράσματα

Συνολικά η μελέτη μας βελτιώνει το σημερινό χαρακτηρισμό του

Cdh1

μεταλλάξεις και λειτουργικό ρόλο τους στην GC και σε άτομα που κινδυνεύουν από GC. Οι μεταλλάξεις που βρέθηκαν σε αμετάφραστες περιοχές και τα δεδομένα σχετικά με τις επιπτώσεις μάτισμα αξίζουν ιδιαίτερη προσοχή, όπως σχετίζεται με μειωμένη ποσότητα E-cadherin. Η χρησιμότητα του

Cdh1

διαλογής, εκτός από την αναγνώριση των άλλων παραγόντων κινδύνου, θα μπορούσε να είναι χρήσιμη για την έγκαιρη ανίχνευση του GC σε άτομα που βρίσκονται σε κίνδυνο (δηλαδή FDRs και AMAGs), και εγγυάται περαιτέρω μελέτη.

Παράθεση: Garziera Μ, Canzonieri V, Cannizzaro R, Geremia S, Caggiari L, De Zorzi M, et al. (2013) Ταυτοποίηση και Χαρακτηρισμός των

Cdh1

βλαστικής σειράς Παραλλαγές σε σποραδικές γαστρική Καρκινοπαθών και σε άτομα που διατρέχουν κίνδυνο του καρκίνου του στομάχου. PLoS ONE 8 (10): e77035. doi: 10.1371 /journal.pone.0077035

Συντάκτης: Amanda Ewart Toland, Πολιτειακό Πανεπιστήμιο του Οχάιο Medical Center, Ηνωμένες Πολιτείες της Αμερικής

Ελήφθη: 29, Απριλίου του 2013? Αποδεκτές: 5 Σεπτεμβρίου του 2013? Δημοσιεύθηκε: 29 Οκτωβρίου 2013

Copyright: © 2013 Garziera et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Associazione Italiana per la Ricerca sul Cancro (AIRC De Ν Re 10266 και AIRC Cannizzaro Ειδικό Πρόγραμμα Μοριακής Κλινικής Ογκολογίας 5×1000 Ν 12214), και Direzione Centrale del Lavoro, Formazione, Università e Ricerca Della Regione Autonoma Friuli Venezia Giulia, Codice Progetto 200502027001. Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα: Δρ. Valli De Re δηλώνει ότι είναι συν-συγγραφέας και μέλος της Συντακτικής Επιτροπής του PLoS ΈΝΑΣ. Αυτό δεν αλλάζει την τήρηση των συγγραφέων σε όλες τις PLoS ONE πολιτικές για την ανταλλαγή δεδομένων και υλικών.

Εισαγωγή

Καρκίνος στομάχου (GC) παραμένει η τέταρτη πιο συχνή κακοήθεια σε όλο τον κόσμο, ακόμα κι αν επίπτωση της και συνδέονται τα ποσοστά θνησιμότητας έχουν μειωθεί κατά τις τελευταίες δεκαετίες. GC πρόγνωση είναι στενά συνδεδεμένη με το στάδιο της νόσου κατά τη διάγνωση [1]. Πρόωρη εμφάνιση γαστρικού καρκίνου (EOGC) ορίζεται ως GC παρουσιάζει στην ηλικία των 45 ετών ή νεότεροι [2] και έχει μια κακή συνολική επιβίωση [3], [4]. Οι περισσότεροι GCs είναι σποραδικές και συχνά αναπτύσσουν μετά από

Helicobacter pylori

(HP) -associated γαστρίτιδα [5], [6]. Ωστόσο, οικογενή μελέτες συσσωμάτωσης τονίζουν επίσης τη σημασία της γενετικής προδιάθεσης στην σποραδική ανάπτυξη του GC. Συχνότητα της οικογενούς γαστρικού συσσωμάτωσης είναι περίπου 10%

Η πιο ευρέως αποδεκτή GC ιστοπαθολογική ταξινόμηση (ταξινόμηση της Lauren) [7] διακρίνει δύο τύπους GC:. Εντερικό τύπο και διάχυτη τύπου. Διάχυτη GC δείχνει μια μεγαλύτερη κληρονομική βάση και γενικά χειρότερη πρόγνωση σε σύγκριση με την εντερική υπότυπο [8].

Cdh1

γονίδιο που κωδικοποιεί για την Ε-καντερίνης έχει ταυτοποιηθεί να έχει ένα αιτιολογικό ρόλο σε περίπου 30% -50% των κληρονομικών διάχυτης GC (HDGC), ένα σύνδρομο αυτοσωματικό κυρίαρχο GC και λοβιακό επιδεκτικότητα καρκίνου του μαστού που αποτελεί το 1-3% της οικογενούς ομαδοποίηση των GCs [9], [10] και σε διάχυτο υπότυπο GC [11] .

Οι Cdh1

μεταλλάξεις βλαστικής σειράς (μια τέτοια μετάλλαξη έχει περάσει σε κάθε κύτταρο στο σώμα απογόνους του) που συνδέονται ειδικά με HDGC (περίπου 30% -40% των περιπτώσεων)? μεγάλες

Cdh1

διαγραφές έχουν βρεθεί σε περίπου 6,5% των περιπτώσεων [12]. Η οικογενής εντερικό καρκίνο του στομάχου (FIGC) με θετικό οικογενειακό ιστορικό έχουν επίσης περιγραφεί, αλλά μέχρι στιγμής, δεν βλαστική

Cdh1

ελαττώματα έχουν συσχετιστεί με FIGC ή εντερική GCs. Αυτή η έλλειψη στοιχείων του

Cdh1

μεταλλάξεις στο εντερικό υπότυπο έχει οδηγήσει στην υπόθεση ότι οικογενή ομαδοποίηση σε αυτές τις περιπτώσεις καθορίζεται από κοινόχρηστο περιβαλλοντικούς παράγοντες, σε αντίθεση με μια κληρονομική γενετική προδιάθεση. Ωστόσο, πρόσφατα δεδομένα δείχνουν ότι το

Cdh1

σωματικά μεταβολές (όπως μεταβολές συσσωρεύονται στα καρκινικά κύτταρα του σώματος κατά τη διάρκεια ζωής ενός ατόμου) είναι τόσο συχνές σε εντερικό όπως στο διάχυτο GC [13], υποδηλώνοντας ένα σημαντικό ρόλο του

Cdh1

στις δύο histotypes. Παρ ‘όλα αυτά, ο ακριβής επικράτηση του

Cdh1

μεταβολές βλαστικής σειράς σε εντερικό GCs είναι ακόμα άγνωστη.

Cdh1

υπερμεθυλίωση υποκινητής είναι η πιο κοινή γενετική δεύτερο χτύπημα στο GC καρκινογόνο διαδικασία [14], [15].

Cdh1

μεταλλάξεις συνδέονται επίσης με αυξημένη ευαισθησία σε επεμβατικές και μεταστατικές [16], [17] του παχέος εντέρου, της κύστης, του προστάτη, του μαστού και γυναικολογικών καρκίνων [18] – [20]. E-cadherin είναι μία διαμεμβρανική γλυκοπρωτεΐνη που παίζει ρόλο στη διατήρηση της αρχιτεκτονικής επιθηλιακού ιστού, με τη συμμετοχή Ca

2+ αλληλεπιδράσεων που εξαρτώνται από κυττάρου-κυττάρου [21], [22]. E-cadherin περιλαμβάνει μία κυτταροπλασματική περιοχή, μία μικρή διαμεμβρανική περιοχή και πέντε εξωκυτταρικές περιοχές καντερίνης-σαν επανάληψη (EC1-5) που εκτείνονται σε εξώνια 4-13 και περιέχουν υψηλά διατηρημένες περιοχές δέσμευσης ασβεστίου [23], [24] και συντηρημένες κυστεΐνες πιθανό για να σχηματίσουν δισουλφιδικές γέφυρες [25]

στην παρούσα μελέτη, αναλύσαμε

Cdh1

μεταλλάξεις βλαστικής σειράς σε μια σειρά διαδοχικών περιπτώσεις τυχαίας GC και τα άτομα που κινδυνεύουν από GC.? κυρίως πρώτου βαθμού GC-Συγγενείς (FDRs) και αυτοάνοσων μεταπλαστικού ατροφική γαστρίτιδα (AMAG) ασθενείς απευθύνονται σε ινστιτούτο μας για γαστρεντερικά συμπτώματα και η ενδοσκοπική εξέταση. Για να διερευνήσουν το ρόλο της έκφρασης Ε-καδερίνης, διαρθρωτικές, λειτουργικές και ανοσοϊστοχημικές αναλύσεις πραγματοποιήθηκαν σε δείγματα με

Cdh1

βλαστική μετάλλαξη. Ο σκοπός της παρούσας μελέτης ήταν η εκτίμηση του επιπολασμού και χαρακτηρίζουν

Cdh1

μεταλλάξεις βλαστικής σειράς σε μια σειρά διαδοχικών ασθενών σποραδικών GC λείπουν τα κριτήρια της ταξινόμησης HDGC, και σε έναν επιλεγμένο πληθυσμό σε κίνδυνο ανάπτυξης GC, να δοκιμάσει χρησιμότητα του ως δείκτης για να βελτιωθεί η έγκαιρη διάγνωση των όγκων. Τα δεδομένα που λαμβάνονται θα μπορούσε να χρησιμοποιηθεί για να αναπτύξει ένα εργαλείο που εντοπίζει γρήγορα και φθηνά

Cdh1

μεταλλάξεις που υπάρχουν κυρίως στον πληθυσμό μας.

Αποτελέσματα

χαρακτηρισμό των ασθενών και

Cdh1

βλαστική γενετικό έλεγχο

οι κλινικές και ιστοπαθολογικές χαρακτηριστικά του GC, FDR και AMAG θέματα συνοψίζονται στους πίνακες 1 και 2. Μεταξύ των ασθενών 59 GC, 2 (3,4%) έχουν οικογενειακό ιστορικό της GC (S15 είναι η αδελφός του S16) χωρίς να πληρούν τα κριτήρια για την κληρονομική διάχυτη GC, όπως ορίζονται από το Διεθνές Καρκίνο γαστρική Linkage Consortium (IGCLC) κατά τη στιγμή της συλλογής δειγμάτων. Στη σειρά GC μας, 5 ασθενείς σποραδικές αρχές του GC (≤45 ετών) ήταν παρόντες, αλλά όχι

Cdh1

αλλοιώσεις βρέθηκαν σε αυτούς τους ασθενείς. Η μέση ηλικία των FDRs ήταν 49 ετών (εύρος, 28 έως 78 ετών) και για AMAGs 56 χρόνια (εύρος, 31-72 ετών). Μεταξύ των ασθενών 59 GC, 16 άτομα είχαν ένα συγγενή πρώτου βαθμού που περιλαμβάνονται στη μελέτη (16/59 FDRs). FDRs και AMAGs ήρθε στο ίδρυμα μας για μια επίσκεψη γαστρεντερολογίας και γαστροσκόπηση εξετάσεις, που εκδηλώνονται διάφορα συμπτώματα, αλλά ούτε καρκίνο ούτε εντερική μεταπλασία /δυσπλασία ήταν παρούσα σε αυτά τα θέματα.

Η

Cdh1

τα αποτελέσματα του γενετικού ελέγχου που αναφέρονται στον πίνακα 3 με

νέα

μεταλλάξεις: 1 εσονικές (ID 5), 1 εσφαλμένου νοήματος (ID 10), και 2 σιωπηλή (ID 13 και ID18). Συνολικά βρήκαμε 4 παραλλαγές, οι οποίες κωδικοποιούν ένα αμινοξύ (ΑΑ) υποκατάσταση (1 νέα (ID10) και 3 έχουν αναφερθεί στο παρελθόν σε άλλους πληθυσμούς (ID 11, ID 12, ID 15), 1 στην περιοχή του γονιδίου 5’near και 2 μεταλλάξεις στο αμετάφραστο (UTR) ρυθμιστικό στοιχείο (ID 1, ID 3, που έχουν ήδη αναφερθεί) και 6 αντικαταστάσεις σε εσονικές περιοχές (τρεις μεταλλάξεις: ID 5, ID 9, ID 17? τρεις εσονικές πολυμορφικές παραλλαγές: ID 4, ID 6, ID 8, πιθανώς με καμία επίδραση στην καρκινογένεσης GC). Δεν διαγραφές ή προσθήκες βρέθηκαν στα όρια εξόνιο.

η

Άλλες αλλαγές είχαν ως αποτέλεσμα κοινών πολυμορφισμών (συχνότητα τουλάχιστον 1% του πληθυσμού) ή σιωπηλές μεταλλάξεις ότι ο κώδικας για το ίδιο αμινοξύ από το αρχικό σκέλος. Καμία στατιστική συσχέτιση παρατηρήθηκε μεταξύ των τεσσάρων ομάδων των ασθενών ελέγχονται για ID 4, ID 6 ή ID 19 παραλλαγές.

RefSNP (rs) αριθμοί για τον εντοπισμό γενετικών παραλλαγών δημοσιευθεί προηγουμένως, καθώς όπως αναφέρθηκε συχνότητες τους (NIEHS Περιβαλλοντικής Γονιδιώματος, Seattle, WA (URL: https://evs.gs.washington.edu/niehsExome/που προσεγγίζεται Αύγουστο του 2013)? ftp://ftp.1000genomes.ebi.ac.uk/vol1/ftp/phase1/analysis_results/paper/Προσεγγισμένος Δεκέμβριος 2012) αναφέρονται στον Πίνακα 3.

Όλα

Cdh1

παραλλαγές ήταν σε ετερόζυγη κατάσταση, εκτός από το ID 4 και ID 19 στην οποία ανιχνεύθηκε επίσης μια ομόζυγη κατάσταση.

η συχνότητα των μεταλλάξεων και παραλλαγών υπολογίστηκαν σε άτομα χωρίς GC ή νόσο AMAG (52BDs + 59FDRs, n = 111). Δεκαέξι FDRs ήταν συγγενείς πρώτου βαθμού της σειράς GC μας? όταν ένα από τα παραλλαγή ήταν παρούσα σε GC και σχετική υπόθεση του FDR, αποκλείσαμε το άτομο FDR από τον υπολογισμό της συχνότητας. ID4 για παράδειγμα, ήταν παρούσα στις 5 FDRs που σχετίζονται με GC μας της σειράς μας? Ως εκ τούτου, η συχνότητα του πληθυσμού ελέγχου αλλάζει από το σύνολο των 111 με 106 άτομα (7FDRs + 8BDs /106? 14,5%). Το Σχήμα 1 απεικονίζει χρωματογραφήματα αλληλούχιση των νέων μεταλλάξεων έχουμε βρει. Έχουμε αναφερθεί στο παρελθόν το αναγνωριστικό 10 χρωματογράφημα σε άλλο χαρτί [26]

(Α) ID 5, νέα ιντρονική μετάλλαξη κοντά στο εξόνιο 1 (IVS1 c.48 + 7C & gt? T). Βρέθηκε σε έναν ασθενή που επηρεάζονται από AMAG (S121). (Β) ID 13, σιωπηλή μετάλλαξη (c.1416C & gt? T) με συντηρημένο κατάλοιπο Ala στη θέση 472 στο

Cdh1

εξόνιο 10 (p.T472T) βρέθηκαν σε ένα GC (S4). (C) ID 18, η σιωπηλή μετάλλαξη (c.2073C & gt? T) με συντηρημένο κατάλοιπο Ala στη θέση 691 στο

Cdh1

εξόνιο 13 (p.A691A) βρέθηκαν σε ένα GC (S48)

Bioinformatic πρόβλεψης ρόλο και τις διαρθρωτικές μοντελοποίηση αποτελέσματα των παραλλαγών της εσφαλμένης διευθύνσεως βρέθηκαν

Οι παρερμηνεύσιμη μεταλλαγμένα υπολείμματα βρήκαμε όλα εντοπισμένη στον εξωκυτταρικό τομέα E-cadherin. Η θέση κωδικονίου στο ανώριμων και ώριμων (μετά τα Ν-τερματικά διάσπασης) πρωτεΐνες και τα δεδομένα από το PolyPhen-2 και SIFT

in silico

αναλύσεων αναφέρονται στον Πίνακα 4. Όλοι οι τέσσερις παραλλαγές εσφαλμένου νοήματος είναι δυνητικά επιζήμιες από PolyPhen -2, αλλά μόνο ο p.A298T (ID 11) και p.A592T (ID 15) υποκαταστάσεις μπορεί να επηρεάσουν την λειτουργία της πρωτεΐνης με ανάλυση SIFT (Πίνακας 4). Οι p.G274S (ID 10) που περιγράφηκε πρόσφατα [26], ωστόσο, δεν διαταράσσει το τοπικό περιβάλλον, αλλά εισάγει ένα δυναμικό καταλοίπων για φωσφορυλίωση και γλυκοσυλίωση που μπορεί να έχουν πιθανές επιπτώσεις στην σταθερότητα και την ακεραιότητα της Ε-καδερίνης όπως εμείς Υποθέσαμε [26]. Ο παθογενετικός επίδραση της ID 11 υποκατάστασης έχει προηγουμένως αποδειχθεί [27], αλλά εδώ αποδεικνύεται για πρώτη φορά από δομική ανάλυση. Όπως απεικονίζεται στο σχήμα 2Α, η αλλαγή ΑΑ στο εξόνιο 7 του p.A298T (ID 11) τοποθετείται κοντά στο διαδραστικό περιοχή μεταξύ πρωτομερή EC1 και EC2. Έτσι, το πολικό υποκατάσταση κατάλοιπο αλανίνης-θρεονίνης μπορεί να οδηγεί τον σχηματισμό Η-δεσμού μέσω oxydrilic ομάδα του και αυτό μπορεί να επηρεάσει την τοπική δομή της πρωτεΐνης σε μια περιοχή που είναι θεμελιώδης για το Ca

2+ αλληλεπιδράσεις. Η θρεονίνη στη θέση 144 είναι στερικά αποδειχθεί ενοχλητικά επειδή αλληλεπιδρά με δύο υπολείμματα ασπαρτικού οξέος (Asp Asp136 και 138) που εμπλέκονται άμεσα σε Ca

2+ δεσμευτική. Επιπλέον, τα μήκη των ομολόγων είναι ιδιαίτερα τόνισε, είναι λιγότερο από 3 Α (Σχήμα 2Β)

Α-Β PyMOL και Αστράγαλο λογισμικών αναπαραστάσεις της ΕΚ 1-EC2 πρωτομερή βασίζεται στην ανθρώπινη ακολουθία. (ΠΠ Κωδικός: 2O72)? σε C-F, EC3 και EC4 πρωτομερή με βάση ποντικού Ε-καδερίνης (κωδικός ΠΣΠ: 3Q2W) από το λογισμικό Coot. (Α) στιγμιότυπα εκπροσώπηση Cartoon A144 (

κίτρινο

) Θέση: A144 είναι κοντά σε περιοχές του ασβεστίου (

μωβ

) και στην εγγύτητα της διεπαφής διμερισμού μεταξύ EC1 (

μπλε

) -EC2 (

πράσινο

) πεδία. (Β) Διαρθρωτικά εκπροσώπηση της υποκατάστασης A144T στον τομέα EC2. Θέση του AT144 είναι αναδείχθηκε σε κίτρινο. Θρεονίνη στη θέση 144 είναι αρκετά δραματική για την τοπική δομή, διότι αλληλεπιδρά με δύο κατάλοιπα ασπαρτικό οξύ (

πράσινο

) που συμμετέχουν άμεσα σε περιοχές του ασβεστίου, και αυτά τα μήκη δεσμού είναι ιδιαίτερα τόνισε ότι είναι λιγότερο από 3 Α. (Γ) Το T316 (

κίτρινο

) είναι

O

-glycosilated (

μπλε

) και υπάρχει στην επιφάνεια της περιοχής EC3. (Δ) Το υδρόφοβο πλευρική αλυσίδα I316 (

κίτρινο

) δεν μπορεί να είναι

O

-glycosilated και προωθεί τις αλληλεπιδράσεις μεταξύ πρωτεϊνών. (Ε) Η Μεθυλενική πλευρική αλυσίδα του A438 (

κίτρινο

) επιτρέπει διαμορφωτική ελευθερία στην επιφάνεια της περιοχής EC4. (F) T438 (

κίτρινο

) η υποκατάσταση δεν είναι δραματική για τους τοπικούς δομή, αλλά θα μπορούσε να αποτελέσει μια πιθανή τοποθεσία για την μετα-μεταφραστικές τροποποιήσεις. Τα ιόντα ασβεστίου επισημανθεί (

πράσινο

).

Η

Όσον αφορά τα υπόλοιπα δύο νοηματικές μεταλλάξεις, έχουν λιγότερο σαφή λειτουργικό αποτέλεσμα, όπως αναφέρθηκε, επίσης, στον Πίνακα 4. p .T470I (ID 12) υποκατάσταση [28] αλλάζει την επιφάνεια AA του extradomain EC3 στην ώριμη πρωτεΐνη (Σχήμα 2C). Τόσο στη ποντικού Ε-καδερίνης και αλληλουχία Ν-καδερίνης (κωδικός ΠΣΠ: 3Q2W) θρεονίνη βρίσκεται συνήθως

O

-glycosylated υποδηλώνοντας ένα σημαντικό ρόλο για αυτό το κατάλοιπο στη δομή της πρωτεΐνης. Ωστόσο, όπως έδειξε στο Σχήμα 2Δ, η αλλαγή σε ισολευκίνη, ένας μη πολικός ΑΑ με μια υδρόφοβη πλευρική αλυσίδα που δεν μπορούν να υποστούν μετα-μεταφραστική τροποποίηση, προτείνει καμία ιδιαίτερη διαμοριακών ένταση. Υποθέτουμε ότι στο εξωκυτταρικό μέσο, ​​η παρουσία ενός υπόλειμμα ισολευκίνης στην ίδια θέση από ό, τι η θρεονίνη μπορεί να ευνοούν τις αλληλεπιδράσεις πρωτεΐνης-πρωτεΐνης, και η μετάλλαξη αυτή θα μπορούσε έτσι να αναλάβει μια προστατευτική σημασία. Η τελευταία μετάλλαξη αναφέρονται, p.A592T (ID 15), βρέθηκε σε όλες τις ομάδες που μελετήθηκαν (βλέπε Πίνακα 3), υποδηλώνοντας ένα αμφίβολο αποτέλεσμα επί παθογένεση GC. Σε αυτή την περίπτωση, αλανίνη στην extradomain EC4 του ώριμου E-cadherin (Σχήμα 2Ε) παρέχει διαμορφωτική ελευθερία, ακόμη και όταν στην εγγύτητα των Ca

sites 2+ δεσμευτική. Μια αντικατάσταση θρεονίνη εδώ έχει περιορισμένη επίδραση στην τοπική δομή και στρεπτική γωνίες της πρωτεΐνης. Ωστόσο, δεν μπορούμε να αποκλείσουμε ότι η oxydrilic πλευρική αλυσίδα θα μπορούσε να είναι η μετα-μεταφραστική τροποποιημένη σε συγκεκριμένη κατάσταση και έτσι να επηρεάσει τη δομή και τη λειτουργία του

Cdh1

(Σχήμα 2F).

Αντίγραφο ανάλυση ιντρονικές μεταλλάξεις βλαστική

για να διερευνήσουν αν ιντρονικές μεταλλάξεις ανιχνεύονται σε σειρά GC μας (Πίνακας 3) θα μπορούσε δυνητικά να προκαλέσει μια επίδραση στο μάτισμα, εκτελέσαμε

Cdh1

ανάλυση της μεταγραφής. Πολυμορφικές και αθόρυβη παραλλαγές εξαιρέθηκαν από την ανάλυση αυτή, δεδομένου ότι κατά πάσα πιθανότητα δεν έχουν παθογόνο ρόλο. cDNA που παράγεται από το περιφερικό αίμα των επιλεγμένων ατόμων GC φιλοξενούν ιντρονικές ID 5, ID 9 ή ID 17 μεταλλάξεις (Πίνακας 3) σε σύγκριση με εκείνη από δύο υγιείς δότες αίματος, το ένα μόνο έχει το ίδιο αναγνωριστικό 17 μετάλλαξη όπως ασθενείς GC (κωδικός BD S190 ), και ένα άλλο (BD κωδικός S189) χωρίς

Cdh1

μετάλλαξη.

για τα ID 5 και ID 7 ιντρονικές μεταλλάξεις, που ενισχύεται η περιοχή που καλύπτει μέρος του εξονίου 1 σε ένα τμήμα του εξόνιο 5, για το αναγνωριστικό 17 μετάλλαξη, εξόνιο 10 έως 13 (Σχήμα 3). Η RT-PCR εξονίου 1 έως 5 θραύσματα δεν έδειξαν διαφορές όταν τρέχουν σε 4% πηκτή αγαρόζης (Σχήμα 3Α) ούτε μετά αμφίδρομη αλληλουχίας (τα δεδομένα δεν έδειξαν)? με αντίστροφο ID 17 ιντρονική παραλλαγή θα μπορούσε να επηρεάσει το μάτισμα οδηγεί σε μια ανώμαλη μικρότερα

Cdh1

μεταγραφής (Σχήμα 3Β). Μετά την απομόνωση και αλληλούχιση, διαπιστώσαμε ότι η μικρότερη ζώνη οδήγησε σε παραλειφθεί μεταγραφής στερείται το εξόνιο 11, με το εξόνιο 10 απευθείας ενωμένο με το εξώνιο 12. Αυτή παρεκκλίνουσα μεταγραφής ανιχνεύθηκε επίσης στο BD S190 που φέρει το ίδιο βλαστικής υποκατάσταση (Σχήμα 3Β).

Σύνολο mRNA εξήχθη από PBMCs κάθε εκπροσωπούνται δείγματος και retrotrascribed σε cDNA μονού κλώνου για να ενισχύσει: (Α) Τα εξόνια 1-5 περίπου 768 bp. Στον ασθενή δεύτερη AMAG λωρίδα (S121) που φέρουν τη μετάλλαξη ID 5 (IVS1 c.48 + 7C & gt? T)? στην τρίτη λωρίδα FDR (S97) που φέρουν τη μετάλλαξη ID 9 (IVS4 c.532-18C & gt? T)? (Β) Τα εξώνια 10-13 περίπου 686 bp. GC (S10), GC (S46) και BD (S190) που φέρουν το αναγνωριστικό 17 μετάλλαξη (IVS12 c.1937-13T & gt? C). Κίτρινα βέλη αποδείξεις μια μικρότερη ζώνη που αντιστοιχεί σε παρεκκλίνουσα μεταγραφές λείπει το εξόνιο 11? (Γ) β-ακτίνη χρησιμοποιήθηκε ως έλεγχος της εσωτερικής ενίσχυσης. MW: 1 Kb DNA σκάλα. Τα προϊόντα PCR έτρεξαν σε ένα αγαρόζης 4% και τζελ βάφονται με SYBR Green dyef

Η

Ανάλυση του

Cdh1

επίπεδο αφθονία πρωτεΐνης και η έκφραση του mRNA σε άτομα που παρουσιάζουν

Cdh1

ιντρονική μεταλλάξεις

Μια σύγκριση του επιπέδου έκφρασης του mRNA Ε-καδερίνης διεξήχθη από EBV αθανατοποιημένα λεμφοκύτταρα που λαμβάνονται από το περιφερικό αίμα S10 και S190 (μετάλλαξη ID 17), S97 (ID 9) και S189 (καμία

Cdh1

μεταλλάξεις) άτομα. Θέμα S10 επλήγη από καρκίνο του στομάχου, με την επιφύλαξη S97 είναι συγγενής πρώτου βαθμού ενός ασθενή με καρκίνο του στομάχου (FDR), ενώ οι S189 και S190 ήταν και οι δύο δωρητές αίματος. Παρατηρήσαμε μεταξύ του δότη αίματος ελέγχου (S189) που δεν έχει

Cdh1

μετάλλαξη και οι ασθενείς, μια σχετικά ισχυρή μείωση της έκφρασης Ε-καδερίνης (περίπου 60%, Εικόνα 4) στο S10 ασθενή που έχει τόσο ID 17 μετάλλαξη και GC, ενώ μείωση μόνο ένα 2% στο αίμα του δότη S190 έχει το ίδιο αναγνωριστικό 17 μετάλλαξη (

σ

& lt? 0,05, σε σχέση με GC S10). Για S97 (μετάλλαξη ID 9, FDR υποκείμενο), παρατηρήσαμε μια παρόμοια έκφραση Ε-καδερίνης με εκείνη στον έλεγχο S189.

Σχετική ποσοτικοποίηση των επιπέδων Ε-καδερίνης mRNA σε EBV αθανατοποιημένα λεμφοκύτταρα (LCL). LCLs παρήχθησαν από τη σπορά του 2,5 × 10

6 PBMCs αθανατοποιηθούν με B.95.8 EBV και καλλιεργήθηκαν σε εναιώρημα. Περίπου 8 εκατομμύρια κύτταρα συλλέχθηκαν για κάθε δείγμα μετά διαιωνοποίηση. Οι ασθενείς που εξετάστηκαν ήταν: GC S10 φέρουν την παραλλαγή ID 17 (IVS12 c.1937-13T & gt? C), FDR S97 μεταφέρουν το αναγνωριστικό 9 (IVS4 c.532-18C & gt? T), BD S190 με ID 17 και BD S189 χωρίς καμία

Cdh1

μετάλλαξη. S189 θεωρήθηκε ως αναφορά (τιμή 1) Τα αποτελέσματα είναι αντιπροσωπευτικά τριών ανεξάρτητων πειραμάτων. το επίπεδο έκφρασης Ε-καδερίνης ήταν κανονικοποιημένες ομαλοποιήθηκε ως προς β-ακτίνη Δεδομένα παρουσιάζονται ως μέσο ± SD. *, Ρ & lt? 0,05, **, ρ & lt?. 0.01

Η

Η ανοσοϊστοχημική ανάλυση επί του όγκου του γαστρικού ιστού εσωνίων ID 17 περίπτωση (κωδικός ασθενούς S10, Σχήμα 5Ε) έδειξαν μειωμένη έκφραση του συνδεδεμένου με μεμβράνη Ε-καδερίνη στα κύτταρα όγκου σφραγιστικό δαχτυλίδι (μαύρα βέλη), ενώ και οι δύο μεμβράνη και κυτταροπλασματική χρώση ήταν παρούσες στο φυσιολογικό επιθήλιο. Η ίδια ασθενής έδειξε μειωμένη χρώση β-κατενίνης στα κύτταρα σφραγιστικό δαχτυλίδι σε σύγκριση με την ισχυρή έκφραση αυτής της πρωτεΐνης στα κανονικά γειτονικά κύτταρα (Σχήμα 5Η). Η απώλεια των δύο χρώση Ε-καδερίνης και β-κατενίνης ήταν επίσης αισθητή για το δεύτερο ασθενείς (S46) που έχει τα ίδια ιντρονική ID 17 μετάλλαξης και επηρεάζονται από GC πολύ (Σχήμα 5F και 5Θ, αντίστοιχα, για Ε-καδερίνη και β-κατενίνης) .

(Α) αιματοξυλίνη και χρώση ηωσίνης σε κανονικό γαστρικό ιστό. (Β) χρώση με αιματοξυλίνη και ηωσίνη στον ιστό του όγκου των GC S10 με καρκίνωμα σφραγιδοκυττάρων: Τα σφραγίδα κύτταρα δαχτυλίδι τονίζεται από μαύρα βέλη. (C) αιματοξυλίνη και ηωσίνη αποδείξεις η διάχυτη histotype του GC S46. (D) χρώση Ε-καδερίνης σε φυσιολογικό γαστρικό ιστό. (Ε) Μείωση της χρώσης Ε-καδερίνης στα κύτταρα σφραγιστικό δαχτυλίδι του GC S10 σχέση με γειτονικά φυσιολογικά κύτταρα? Τα κύτταρα σφραγιστικό δαχτυλίδι τονίζεται από μαύρα βέλη. (F) Απώλεια της έκφρασης Ε-καδερίνης στα διάχυτη καρκινικά κύτταρα του GC S46 συγκριτικά με φυσιολογικό ιστό (στη δεξιά πλευρά της φωτομικρογραφίας). (G) χρώση β-κατενίνης σε φυσιολογικό γαστρικό ιστό. (H) Αδύναμα χρώση β-κατενίνης στα κύτταρα σφραγιστικό δαχτυλίδι (μαύρα βέλη) του GC S10. (Ι) Απώλεια χρώση β-κατενίνης στον ιστό του όγκου του GC S46 συγκριτικά με φυσιολογικό ιστό (στη δεξιά πλευρά της φωτομικρογραφίας). Όλες οι μικροφωτογραφίες ελήφθησαν στα 400 × μεγέθυνση.

Η

Συζήτηση

ασθενών GC συνήθως έχουν κακή πρόγνωση [29]. Ταυτοποίηση των ασθενών με αυξημένο κίνδυνο ανάπτυξης GC και την έγκαιρη ανίχνευση του GC είναι υποσχόμενες προσεγγίσεις για τη μείωση της νοσηρότητας και της θνησιμότητας του GC. FDR των ασθενών GC είναι γνωστό ότι έχουν 2-3 φορές αυξημένο κίνδυνο GC, πιθανώς λόγω της έκθεσής τους στους ίδιους περιβαλλοντικούς παράγοντες κινδύνου ή /και να κληρονομήσει την ευαισθησία στον καρκίνο [30].

Η καταστροφή των κυττάρων βρεγματικό βρέθηκαν σε AMAG σε συνδυασμό με το σημαντικό ρόλο της E-cadherin στα επιθηλιακά πολικότητα και γαστρικό αδενικό αρχιτεκτονική, δείχνει ότι βλαστική μεταβολές του

Cdh1

θα μπορούσε να είναι ένας επιπλέον παράγοντας κινδύνου για την ανάπτυξη GC στην AMAG ασθενή [31].

το 1998, Guilford και συνεργάτες περιέγραψαν για πρώτη φορά μεταλλάξεις βλαστικής σειράς του

Cdh1

γονίδιο [28]. Στη συνέχεια, οι διαφορετικοί τύποι μεταλλάξεων έχουν αναφερθεί σε οικογένειες διαφόρων εθνοτήτων με διάχυτη GC [32], [33]. Η πρώτη

Cdh1

βλαστική μετάλλαξη που περιγράφεται σε μια ιταλική οικογένεια το 2006, σε έναν ασθενή που πληρούσαν τα κριτήρια IGCLC για HDGC [34]. Ωστόσο, πολύ λίγες μελέτες αναφέρουν

Cdh1

βλαστικής σειράς μεταλλάξεων σε σποραδικές περιπτώσεις GC χωρίς οικογενούς συσσωμάτωση ή σε υποκείμενα που κινδυνεύουν να αναπτύξουν GC [35], [36]. Επιπλέον, σε αυτές τις μελέτες οι λειτουργικές επιδράσεις των

Cdh1

παραλλαγών που συχνά δεν έχουν διερευνηθεί.

Η ισχύς της μελέτης μας είναι η συλλογή των 59 Καυκάσιοι ασθενείς με σποραδική GC, 59 FDRs και 20 AMAGs που παρακολούθησαν την υπηρεσία γαστρεντερολογία μας τα τελευταία χρόνια για γαστρικά συμπτώματα και τη διάγνωση ή τον αποκλεισμό ενός GC μετά την ενδοσκοπική και ιστολογική αξιολόγηση του ιστού.

Όπως συνοψίζεται στον πίνακα 3, διάφορα βλαστική

Cdh1

παραλλαγές έχουν έχουν ανιχνευθεί. Στη σειρά 59 GC, εξαιρουμένων των πολυμορφικών και σιωπηλές αλλαγές που έχουν κατά πάσα πιθανότητα δεν παθογόνο ρόλο, βρήκαμε 6 διαφορετικές αντικαταστάσεις σε 9 ασθενείς (9/59 GCs = 15,2%): 4 του τύπου των εσφαλμένων διευθύνσεων (ID 10, ID 11, ID 12, ID 15) σε 4 διακριτές ασθενείς (6,8%) και 2 του τύπου μη παρερμηνεύσιμη (ID 2 και ID 17) σε 5 διακριτές GCs (3,4%).

Το ID 10 (p.G274S) είναι ένα μυθιστόρημα παρερμηνεύσιμη μετάλλαξη που βρήκαμε σε ένα παλιό άνδρας με GC μικτή histotype. Αυτή η παραλλαγή δεν ανιχνεύθηκε σε 187 άτομα χωρίς καρκίνο (108BDs + 59FDRs + 20AMAGs) αποκλείοντας έτσι ένα πολυμορφισμό. Ένα παθογόνο δράση της ID 10 μετάλλαξη δεν υποστηρίζεται από λειτουργικά (συνάθροιση και εισβολής)

in vitro

προσδιορισμούς όπως ανέφερε πρόσφατα [26], ωστόσο, τα δεδομένα από το

in silico

χαρακτηρισμός της μετάλλαξης και μια μείωση στην έκφραση β-κατενίνης βρέθηκαν σε ιστό του όγκου δεν μπορεί να αποκλείσει εντελώς την σημασία αυτής της μετάλλαξης σε εξέλιξη GC. Έτσι, στη σημερινή ID 10 παραμένει ένα μυθιστόρημα

Cdh1

μετάλλαξη με την παθογένεια ενός απροσδιόριστης σημασίας.

Το ID 11 (p.A298T) η υποκατάσταση στο εξώνιο 7 του

Cdh1

έχει ήδη περιγραφεί σε ένα 36-year-old νεαρών αρσενικών Καυκάσου σε μια οικογένεια HDGC [27]. Στη σειρά μας, αυτή η παραλλαγή ανιχνεύθηκε μόνο σε 1 αρσενικό (S47) του 74-year-old με μια μικτή histotype. Η πιθανή παθογόνο δράση της συγκεκριμένης μετάλλαξης έχει επιβεβαιωθεί μέσω

in vitro

λειτουργικές μελέτες σε διάφορα εργαστήρια [27], [37], [38]. Εδώ πρώτα αποτελέσματα προσομοίωσης (Σχήμα 2Α-Β) με ανάλυση 3D αλληλεπιδράσεις δέσμευσης πρωτεΐνης-συνδετήρα, υποστηρίζουν σθεναρά την πιθανότητα για αλλαγμένη πρωτεϊνική λειτουργία και να οδηγήσει στην πιθανή μοριακό μηχανισμό που στηρίζουν αυτή τη διαδικασία. Το δυναμικό μεταβληθεί λειτουργία πρωτεΐνη υποστηρίχθηκε επίσης από την ανάλυση SIFT (Πίνακας 4) με ένα καλό αποτέλεσμα. Επιπλέον, μια πρόσφατη μελέτη, χρησιμοποιώντας το

in silico

σχεδιασμό πρωτεΐνη FoldX αλγοριθμική προσέγγιση [39], επαναβεβαιώνει το παθογόνο ρόλο της ID 11 (p.A298T) η υποκατάσταση, βάσει υπολογισμού των αλλαγών σταθερότητας φυσική κατάσταση (ΔΔΟ & gt? 0,08 kcal /mol) [40]. Συγγραφείς χαρακτηρίζεται ασθενείς που φέρουν αυτό το παρερμηνεύσιμη μετάλλαξη όπως έχοντας μια νεαρότερη ηλικία κατά τη διάγνωση και μια διάχυτη histotype. περίπτωσή μας τόνισε ότι ID 11 μπορεί επίσης να ανιχνευθεί σε ένα παλιό ασθενή με μικτή GC.

Το ID 12 (p.T470I) βρέθηκε σε ένα 57-year-old άνδρες (S39) με τη διάγνωση της GC . Η αλλαγή αυτή περιγράφηκε για πρώτη φορά σε μια οικογένεια των Μαορί εθνικότητα με EOGC, αλλά δεν επηρεάστηκε το θέμα που δείχνει αυτή τη μετάλλαξη με GC κατά το χρόνο της μελέτης [28]. Εδώ, βρήκαμε ότι η μεταβολή p.T470I ΑΑ είναι ανεκτό από SIFT και επίσης με ανάλυση μοντελοποίησης. Δυστυχώς, τα καρκινικά bioptic δείγμα ιστού ήταν ανεπαρκής για να εκτελέσει E-cadherin χρώση IHC.

Η υποκατάσταση ID 15 (p.A592T) ανιχνεύθηκε σε κάθε κλινική ομάδα δοκιμάζεται, γεγονός που υποδηλώνει μια πιθανή πολυμορφικό διάχυσης. Παρ ‘όλα αυτά, αυτή η παραλλαγή έχει προηγουμένως αναφερθεί σχετίζεται με όγκους του θυρεοειδούς και λοβιακό καρκίνων του μαστού [41] – [43]. δομική ανάλυση μας και

in vitro

[35] και

in silico

μελέτες [38], [40] δεν υποστηρίζουν έναν παθογόνο ρόλο για αυτή την παραλλαγή στο GC.

όπως συνιστάται από τις πρόσφατες κατευθυντήριες γραμμές για την κλινική διαχείριση [44], η επιτήρηση ενδοσκόπηση πρέπει να πραγματοποιείται κάθε χρόνο σε εκείνα τα άτομα με μεταλλάξεις απροσδιόριστης σημασίας (π.χ., εσφαλμένου νοήματος). Κατά τη γνώμη μας, τα θέματα που φιλοξενούν ID 15 και επίσης ID 10, πρέπει να ακολουθούνται για έως και 10 χρόνια πριν από τον αποκλεισμό κάποιο ρόλο, αν και αδύναμη για αυτή την αλλαγή στην παθογένεια της GC.

Στο ID 2 εντοπίσαμε ένα C -να-G αλλαγή πριν από το κωδικόνιο έναρξης (-71C & gt? G,

Cdh1

5’UTR περιοχή), που αντιπροσώπευε την πιο κοινή παραλλαγή που σχετίζεται με GC σε σειρά μας, συμβαίνουν σε τρεις από τους 59 ασθενείς GC ( 5,1%). Αυτή η παραλλαγή αναφέρθηκε επίσης σε μια φινλανδική μελέτη [45] σε 1 από 13 ασθενείς GC (7,7%) και σε 2 από 51 ελέγχους (3,9%), καθώς επίσης και σε δύο EOGC ασθενείς της Βόρειας Αμερικής προέλευσης (3,4%) [46] . Συνολικά δεδομένα από αυτές τις μελέτες δείχνουν ότι ID 2 είναι μια αρκετά συχνή μετάλλαξη, αλλά οι συγγραφείς δεν αναφέρουν στοιχεία σχετικά με την παραλλαγή ID 2 σε σχέση με την κατάσταση της έκφρασης Ε-καδερίνης. ID 2 βρέθηκε σε σειρά μας σε μία εντερική, μία μικτή, και μια διάχυτη histotypes GC. Ολοι αυτοί οι ασθενείς είχαν πάνω από 50 χρόνια στη διάγνωση και ήταν αρνητικά για λοίμωξη HP. Κανένα από άτομα ελέγχου (n = 111) δοκιμάστηκαν χωρίς GC έδειξε αυτή τη μετάλλαξη (Πίνακας 3). Ένα

in situ

αξιολόγηση ή από μία συσχέτιση μεταξύ ID 2 και της έκφρασης Ε-καδερίνης ήταν σε θέση να πραγματοποιηθεί, λόγω της έλλειψης του υλικού του όγκου. Η πιθανή παθογόνο δράση αυτής της παραλλαγής υποκινητή σε επίπεδο έκφρασης Ε-καδερίνης αξίζει περαιτέρω μελέτες

Ιντρονική ID 17 παραλλαγή (IVS12 c.1937-13T & gt? C). Βρέθηκε σε 2 θηλυκά με GC (2/59 GCs = 3,4%) και θετικά για μόλυνση HP, και βρέθηκε επίσης σε 1 BD (1/52 = 1,9%, Πίνακας 3). Η ίδια τροποποίηση προηγουμένως αναφερθεί σε λοβιακά καρκίνο του μαστού με υψηλή συχνότητα (12/53 = 23%) [47], σε οικογένειες HDGC (2/27 = 7,4%) [48] και σε ασθενείς EOGC (7/79 = 8,9% ) [46], αλλά επίσης και σε μία σχετική πληθυσμό ελέγχου [46]. Αξίζει να σημειωθεί ότι, δείχνουμε για πρώτη φορά ότι αυτή η υποκατάσταση οδηγεί σε μία ανώμαλη

Cdh1

μεταγραφή που φιλοξενούν ένα διαγραφή του

Cdh1

εξόνιο 11. Το εξόνιο 11, μαζί με μερικές ακολουθίες των συνοδευτικών εξόνια , κωδικοποιεί για τον τομέα EC4 της ώριμης πρωτεΐνης [25]? ID 17 είναι μία διαγραφή out-of-πλαισίου και οδηγεί στο σχηματισμό ενός πρόωρου κωδικονίου τερματισμού στη θέση 384 του υποκινητή EC4. Κατά συνέπεια, η μεταφρασμένη πρωτεΐνη από

Cdh1

ID 17 κλώνου θα μπορούσε να λείπει η διαμεμβρανική περιοχή και την κυτταροπλασματική ουρά που εμπλέκεται στην β-κατενίνης δεσμευτική. Αμφότεροι οι ασθενείς GC S10 και S46, που έχει την ταυτότητα 17 μετάλλαξη, έδειξε μια μείωση στην έκφραση της Ε-καδερίνης και β-κατενίνης με IHC αναλύσεις (Σχήμα 5)? ο ασθενής GC S10, με ένα καρκίνωμα σφραγιδόλιθος, διαγνώστηκε σε ηλικία 61 ετών, και ο ασθενής GC S46, με μια διάχυτη αδενοκαρκίνωμα, διαγνώστηκε στην ηλικία των 58 ετών. Επιπλέον, η αξιολόγηση της έκφρασης Ε-καδερίνης από τον EBV αθανατοποιημένα Β-λεμφοκύτταρα έδειξαν ισχυρή μείωση (60%) σε GC S10 φιλοξενούν ID 17 μετάλλαξη σε σύγκριση με τον έλεγχο BD (S189) χωρίς

Cdh1

αλλοιώσεις, αλλά επίσης, σε σύγκριση με έναν μόνο δότη αίματος (S190) που φέρει το ίδιο αναγνωριστικό 17 παραλλαγής. Δεδομένου ότι όλα τα θέματα που φέρει την ταυτότητα 17 μετάλλαξης είναι ετερόζυγα για το

Cdh1

γονίδιο, τα δεδομένα μας έδειξαν ότι το άτομο S190, αλλά όχι κύτταρα όγκου του S10 και S46 ασθενείς, μπορεί να εκμεταλλευτεί κάποιο αντισταθμιστικό μηχανισμό που εξουδετερώνει την E-cadherin ρύθμιση προς τα κάτω. Σε όγκους, Ε-καδερίνης υπο-έκφραση συνδέεται με αυξημένη β-κατενίνης μεταγραφική δραστικότητα, ένα κύριο δράστη μονοπάτι Wnt [49]. Η έκφραση ενός μεγάλου αριθμού γονιδίων που σχετίζονται με την εξέλιξη του όγκου, συμπεριλαμβανομένων εκείνων για κυκλίνη D1, C-

myc

, αγγειακού ενδοθηλιακού αυξητικού παράγοντα, και survivin ελέγχεται μέσω μονοπάτι Wnt /β-κατενίνης [50]. δέσμευση με β-κατενίνης αποτρέπει τη μετατόπιση του προς τον πυρήνα της Ε-καδερίνης? Κατά συνέπεια, μία μείωση της έκφρασης Ε-καδερίνης μπορεί να ευνοήσει GC παθογένεση μέσω της αυξημένης συσσώρευσης των πυρηνικών β-κατενίνης. Από τους ασθενείς S10 και S46 με την παραλλαγή ID17 και οι δύο γυναίκες δείχνουν μια Ελικοβακτηρίδιο του Πυλωρού (HP) λοίμωξη, υποθέτουμε ότι ID 17 μπορεί να συνδέεται με ένα προγνωστικό παράγοντα φύλο (είναι γνωστό ότι η συχνότητα εμφάνισης της GC είναι υψηλότερο για τους άνδρες από ό, τι για τις γυναίκες) και /ή μια μόλυνση HP. Η διαγραφή του εξωνίου 11 στο

Cdh1

γονίδιο περιγράφεται επίσης σε έναν ασθενή HDGC, αλλά σε αυτή την τελευταία περίπτωση ανώμαλης ματίσεως συνδέθηκε με ένα διαφορετικό εσωνίου μετάλλαξη (IVS11 c.1711 + 5G & gt? Α) [27] .