Αφηρημένο

Ένα σημαντικό ποσοστό της οικογενούς καρκίνου του παχέος εντέρου (CRC) δεν είναι συνέπεια των γνωστών θέσεων ευαισθησίας, όπως τα γονίδια αναντιστοιχία επισκευή (MMR), υποστηρίζοντας την ύπαρξη πρόσθετων τόπων. Για την ταυτοποίηση νέων τόπων CRC, πραγματοποιήσαμε μια γονιδιώματος-ευρεία σάρωση σύνδεσης σε 356 λευκά οικογένειες χωρίς ενδείξεις ελαττωματικών MMR (δηλαδή, δεν υπάρχει απώλεια της έκφρασης του όγκου του MMR πρωτεϊνών, δεν αστάθεια μικροδορυφορικού (MSI) -Υψηλή όγκους, ή καμία απόδειξη της σύνδεση με γονίδια MMR). Οικογένειες διαπιστώθηκαν μέσω του καρκίνου του παχέος εντέρου Οικογενειακό Μητρώο multi-site NCI-υποστηρίζεται κοινοπραξία (Colon CFR), το City of Hope Περιεκτική Κέντρο Καρκίνου και το Πανεπιστήμιο Memorial της Νέας Γης. Συνολικά 1.612 άτομα (μέσος όρος 5,0 ανά οικογένεια, συμπεριλαμβανομένων 2,2 πληγείσα) γονότυπος χρησιμοποιώντας συστοιχίες πολυμορφισμού ενός νουκλεοτιδίου σύνδεση γονιδιώματος σε επίπεδο? παραμετρικές και ανάλυση μη-παραμετρικής διασύνδεσης χρησιμοποιούνται MERLIN στο

a priori

-defined οικογένεια. Πέντε LOD βαθμολογία μεγαλύτερη από 3,0 παρατηρήθηκαν υποθέτοντας ετερογένεια. Η μεγαλύτερη ήταν μεταξύ των οικογενειών με μέση ηλικία διάγνωσης λιγότερο από 50 χρόνια στο 4q21.1 (κυρίαρχη HLOD = 4.51, α = 0.84, 145,40 cm, rs10518142) και μεταξύ όλων των οικογενειών σε 12q24.32 (κυρίαρχη HLOD = 3.60, α = 0.48 , 285,15 cm, rs952093). Ανάμεσα στις οικογένειες με τέσσερα ή περισσότερα προσβεβλημένα άτομα και μεταξύ των οικογενειών κλινική βάση, η κοινή κορυφή παρατηρήθηκε σε 15q22.31 (101,40 cm, rs1477798? Κυρίαρχη HLOD = 3.07, α = 0,29? Κυρίαρχη HLOD = 3.03, α = 0,32, αντίστοιχα) . Ανάλυση των οικογενειών με μόνο δύο προσβεβλημένων ατόμων έδωσε κορυφή στα 8q13.2 (υπολειπόμενο HLOD = 3.02, α = 0.51, 132,52 cm, rs1319036). Αυτά τα προηγούμενα λαθραία κορυφές σύνδεση καταδεικνύουν τη συνεχιζόμενη χρησιμότητα των δεδομένων που βασίζονται στην οικογένεια σε σύνθετα χαρακτηριστικά και δείχνουν ότι η νέα αλληλόμορφα κινδύνου CRC απομένει να διευκρινιστεί

Παράθεση:. Τσιτσέκ MS, Cunningham JM, Fridley BL, Serie DJ, Bamlet WR, Diergaarde Β, et al. (2012) καρκίνο του παχέος εντέρου συνδέσεως των χρωμοσωμάτων 4q21, 8q13, 12q24 και 15q22. PLoS ONE 7 (5): e38175. doi: 10.1371 /journal.pone.0038175

Επιμέλεια: Αντώνης W. I. Lo, το Κινεζικό Πανεπιστήμιο του Χονγκ Κονγκ, Χονγκ Κονγκ

Ελήφθη: 14 του Μάρτη, 2012? Αποδεκτές: 1η Μάη 2012? Δημοσιεύθηκε: May 31, 2012