PLoS One: Σχέση μεταξύ Rad51 G135C και G172T Παραλλαγές και την ευαισθησία στον καρκίνο: Μια μετα-ανάλυση συμμετοχή 54 μελέτες ασθενών-μαρτύρων


Αφηρημένο

Ιστορικό

Οι συσχετίσεις μεταξύ των πολυμορφισμών Rad51 γονίδιο (G135C και G172T) και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου έχουν ερευνηθεί, αλλά τα αποτελέσματα ήταν ασαφή. Για να πάρετε μια ολοκληρωμένη αξιολόγηση του σωματείου παραπάνω, πραγματοποιήσαμε μια μετα-ανάλυση των δημοσιευμένων μελετών.

Μέθοδοι

Ένα μηχανογραφημένο αναζήτηση PubMed, Embase και Web βάσεων δεδομένων γνώσης για όλες τις σχετικές μελέτες εκτελούνται και τα δεδομένα αναλύθηκαν σε μια μετα-ανάλυση. Η συνολική αναλογία πιθανοτήτων (OR), με διάστημα εμπιστοσύνης 95% (95% CI) υπολογίστηκε για να εκτιμήσει τη δύναμη της σχέσης μεταξύ πολυμορφισμών Rad51 και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου. Τα δεδομένα αναλύθηκαν με τη χρήση σταθερού ή τυχαίων δράσεων μοντέλο, όταν κρίνεται σκόπιμο. ανάλυση ευαισθησίας και δοκιμή προκατάληψη δημοσίευση επίσης εκτιμάται.

Αποτελέσματα

Σε γενικές γραμμές, συνολικά 54 μελέτες ασθενών-μαρτύρων συμπεριλήφθηκαν στο σημερινό μετα-ανάλυση, μεταξύ των οποίων 42 μελέτες με 19.142 περιπτώσεις και 20.363 έλεγχοι για RAD51 G135C πολυμορφισμό και 12 μελέτες με 6.646 περιπτώσεις και 6.783 έλεγχοι για G172T πολυμορφισμό. Για G135C πολυμορφισμό, τα συγκεντρωτικά αποτελέσματα έδειξαν ότι σημαντικά αυξημένο κίνδυνο βρέθηκε στη συνολική καρκίνους (μοντέλο ομοζυγώτες: OR = 1.776, 95% CI = 1,288 – 2,449? Αλληλομόρφων γενετικό μοντέλο: OR = 1.169, 95% CI = 1,016 – 1,345? Υπολειπόμενο μοντέλο: OR = 1.946, 95% CI = 1,336 – 2,835), κυρίως στον καρκίνο του μαστού (μοντέλο ομοζυγώτες: OR = 1.498, 95% CI = 1,026 – 2,189? υπολειπόμενο μοντέλο: OR = 1.732, 95% CI = 1,170 – 2,562) . Για G172T πολυμορφισμός, μειωμένο κίνδυνο καρκίνου παρατηρήθηκε σε καρκίνο κεφαλής και τραχήλου (μοντέλο ομοζυγώτες: OR = 0,621, 95% CI = 0,460 – 0,837? Αλληλομόρφων γενετικό μοντέλο: OR = 0.824, 95% CI = 0,716 – 0,948? Υπολειπόμενο μοντέλο: OR = 0.639, 95% CI = 0,488 – 0,837).

Συμπεράσματα

τα αποτελέσματα μας πρότεινε ότι η G135C πολυμορφισμός Rad51 είναι υποψήφια για ευαισθησία σε συνολική καρκίνους, ιδιαίτερα με τον καρκίνο του μαστού, και ότι η Rad51 G172T θα μπορούσε να διαδραματίσει ένα προστατευτικό ρόλο στην ανάπτυξη του καρκίνου κεφαλής και τραχήλου

Παράθεση:. Zhao Μ, Chen P, Dong Υ, Zhu Χ, Zhang X (2014) Σχέση μεταξύ Rad51 G135C και G172T Παραλλαγές και η ευαισθησία για τον Καρκίνο: Μια μετα-ανάλυση συμμετοχή 54 μελέτες ασθενών-μαρτύρων. PLoS ONE 9 (1): e87259. doi: 10.1371 /journal.pone.0087259

Επιμέλεια: Bin He, Baylor College of Medicine, Ηνωμένες Πολιτείες της Αμερικής

Ελήφθη: 29 Αυγ του 2013? Αποδεκτές: 24η Δεκεμβρίου 2013? Δημοσιεύθηκε: 27, Ιαν, 2014

Copyright: © 2014 Zhao et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Αυτή η έρευνα υποστηρίχθηκε από την Προτεραιότητα Ακαδημαϊκό Πρόγραμμα Ανάπτυξης των Jiangsu Ιδρυμάτων Ανώτατης Εκπαίδευσης (PAPD). Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

καρκίνος του Ανθρώπου εξακολουθεί να είναι μία από τις κύριες αιτίες θανάτου παγκοσμίως, με αποτέλεσμα ένα από τα πιο δύσκολα θέματα παγκόσμιας υγείας αντιμετωπίζει σήμερα η ανθρωπότητα. Σύμφωνα με αιτιολογικός μελέτες, καρκινογένεση του καρκίνου είναι μια σύνθετη, πολυσταδιακή και πολυπαραγοντική διαδικασία, στην οποία εμπλέκονται πολλοί γενετικοί και περιβαλλοντικοί παράγοντες. Τα τελευταία χρόνια, έχει γίνει σαφές ότι η ατομική διακύμανση σε γενετικό υπόβαθρο μπορεί να οδηγήσει σε διάφορες συνέπειες μετά την έκθεση στο περιβάλλον και μπορεί τελικά να συμβάλλουν στην παθογένεση του καρκίνου και την εξέλιξη [1] – [3].

μονοπάτια επιδιόρθωσης του DNA είναι υπεύθυνοι για τη διατήρηση της γονιδιωματικής σταθερότητας και ακεραιότητας και διαδραματίζουν καίριο ρόλο στην προστασία από γενετικές μεταλλάξεις [4]. Γονίδια επιδιόρθωσης του DNA έχουν προταθεί ως σημαντικός παράγοντες στην πρόληψη της γονιδιωματική βλάβη και συνεχώς παρακολουθεί χρωμοσώματα να διορθώσει τραυματισμούς που προκαλούνται από εξωγενείς παράγοντες, όπως το υπεριώδες φως ή ο καπνός του τσιγάρου, και ενδογενών μεταλλαξιογόνες [5], [6]. Πρόσφατες αναφορές έχουν δείξει ότι η γενετική παραλλαγή στα γονίδια επιδιόρθωσης του DNA θα μπορούσε να προκαλέσει αλλαγμένη ικανότητα επιδιόρθωσης του DNA, οδηγώντας σε συσσώρευση της βλάβης του DNA, που ακολουθείται από προγραμματισμένο κυτταρικό θάνατο ή ανεξέλεγκτη κυτταρική αύξηση και μπορεί να ευθύνεται, εν μέρει, για την ανάπτυξη του καρκίνου του [7].

Ανθρώπινα RAD51, μία από τις πρωτεΐνες κλειδιά για ομόλογο ανασυνδυασμό, είναι απαραίτητο να μειωτικό και μιτωτική ανασυνδυασμού και παίζει κρίσιμο ρόλο στην επιδιόρθωση ομόλογου ανασυνδυασμού του DNA δίκλωνα σπασίματα [8]. Λειτουργεί με τη διαμόρφωση νουκλεοπρωτεΐνη νήματα σε μονόκλωνο DNA, προκαλώντας ομόλογο ζευγάρωμα και μεσολάβηση αντιδράσεις ανταλλαγής σκέλος μεταξύ έλικας του DNA μονόκλινα και δίκλινα κατά τη διάρκεια της επισκευής [9]. Το γονίδιο RAD51 βρίσκεται στο χρωμόσωμα 15q15.1 σε ανθρώπους και πιστεύεται ότι συμμετέχουν σε ένα κοινό διπλό σκέλος οδού επιδιόρθωσης διάλειμμα. Τα τελευταία χρόνια, οι πολυμορφισμοί του γονιδίου RAD51 έχουν προσελκύσει μεγάλη εξάπλωση προσοχή. Δύο κοινά μελέτησαν τους πολυμορφισμούς του γονιδίου RAD51 είναι G135C (rs1801320), μία Ο προς C στη θέση 135, και G172T (rs1801321), ένα G προς Τ μεταστροφής στην θέση 172. Και οι δύο από αυτούς που βρίσκονται στην 5 ‘αμετάφραστη περιοχή και φαίνεται να είναι λειτουργική συνάφεια. Αυτές οι δύο πολυμορφισμοί έδειξαν να επηρεάζουν mRNA σταθερότητα ή μεταφραστική αποτελεσματικότητα, οδηγώντας σε τροποποιημένα επίπεδα πολυπεπτιδίου προϊόν και αλλάζοντας τη λειτουργία της πρωτεΐνης που κωδικοποιεί RAD51, και επηρέασε την ικανότητα επιδιόρθωσης του DNA σε κάποιο βαθμό [10], [11].

Κατά την τελευταία δεκαετία, ένα αριθμός μοριακών επιδημιολογικές μελέτες έχουν γίνει για να αξιολογηθεί η σχέση μεταξύ πολυμορφισμών RAD51 γονίδιο (G135C και G172T) και του κινδύνου καρκίνου σε διαφορετικούς πληθυσμούς, αλλά τα αποτελέσματα παρέμειναν αμφιλεγόμενη. Ως εκ τούτου, να αποκομίσουν μια ακριβέστερη εκτίμηση της σχέσης μεταξύ RAD51 G135C και πολυμορφισμούς G172T και τον κίνδυνο του καρκίνου, πραγματοποιήθηκε μια μετα-ανάλυση. Για το καλύτερο της γνώσης μας, αυτή είναι η πιο περιεκτική μετα-ανάλυση σχετικά με τους πολυμορφισμούς RAD51 και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου.

Υλικά και Μέθοδοι

στρατηγική αναζήτησης και τα δεδομένα εξόρυξη

Όλα μελέτες που διερευνούν τη σχέση μεταξύ των πολυμορφισμών του γονιδίου RAD51 (G135C και G172T) και τον κίνδυνο του καρκίνου εντοπίστηκαν από ολοκληρωμένη υπολογιστή που βασίζεται σε έρευνες του PubMed, Embase και Web βάσεων δεδομένων γνώσης (την τελευταία ενημέρωση αναζήτησης στις 25 Αυγούστου, 2013). Η αναζήτηση εκτελέστηκε χρησιμοποιώντας διάφορους συνδυασμούς λέξεις-κλειδιά όπως ( «γονίδιο RAD51″ Ή «γονίδιο της ρεκομπινάσης RAD51») και ( «πολυμορφισμός» OR «παραλλαγή» ή «παραλλαγές»). Η ακριβής αναζήτηση είναι διαθέσιμη κατόπιν αιτήματος από τους συγγραφείς. Πρόσθετες μελέτες έχουν επίσης εντοπιστεί από μια αναζήτηση στο χέρι όλων των αναφορών των ανακτημένων άρθρων. αναζήτηση μας περιορίστηκε σε μελέτες που δημοσιεύονται στην αγγλική γλώσσα

Τα κριτήρια ένταξης και αποκλεισμού

Οι μελέτες που περιλαμβάνονται στο σημερινό μετα-ανάλυση έπρεπε να πληρούν όλα τα ακόλουθα κριτήρια:. (1) μελέτες για τη διερεύνηση οι συσχετίσεις μεταξύ των πολυμορφισμών του G135C ή G172T στο RAD51gene και τον κίνδυνο του καρκίνου? (2) μια άσχετη υπόθεση ελέγχου ή σχεδιασμού ομάδα (3) επαρκή στοιχεία (κατανομές γονότυπου για τις περιπτώσεις και τους ελέγχους) για τον υπολογισμό του λόγου πιθανοτήτων (OR) με 95% CI της? (4) μελέτες που δημοσιεύθηκαν στα αγγλικά? (5) κατανομή γονότυπο του πληθυσμού ελέγχου σύμφωνη με Hardy-Weinberg Ισορροπία (HWE). Εμείς δεν θεώρησε περιλήψεις ή αδημοσίευτες εκθέσεις. αναφορές περιστατικών, editorials, άρθρα ανασκόπησης, και επιστολές αποκλείστηκαν. Τα άρθρα εξαιρέθηκαν επίσης εάν δεν περιλαμβάνουν έναν πληθυσμό ελέγχου και δεν καθορίζουν τη συχνότητα του γονότυπου. Αν οι μελέτες με τα ίδια ή επικαλυπτόμενες δεδομένα δημοσιεύθηκαν από τους ίδιους συγγραφείς, επιλέχθηκε η μελέτη με το μεγαλύτερο μέγεθος δείγματος. Η υποστήριξη κατάλογος PRISMA είναι διαθέσιμο ως υποστηρικτικές πληροφορίες? βλέπε Λίστα ελέγχου S1.

Δεδομένα εξόρυξη

Δύο συγγραφείς πληροφορίες που προκύπτουν από όλες τις επιλέξιμες δημοσιεύσεις ανεξάρτητα σύμφωνα με τα κριτήρια ένταξης που αναφέρονται παραπάνω. Διαφωνία επιλύθηκε από την αξιολόγηση της τρίτης κριτικός και συζήτηση μέχρι να επιτευχθεί συναίνεση. Τα ακόλουθα χαρακτηριστικά συλλέχθηκαν από κάθε μελέτη: το πρώτο συγγραφέα, το έτος δημοσίευσης, τη χώρα, την εθνικότητα του ασθενούς, τον τύπο του καρκίνου, την πηγή των ομάδων ελέγχου (πληθυσμό, ή το νοσοκομείο που βασίζονται σε ελέγχους ή μικτά (που αποτελείται από δύο πληθυσμό, και το νοσοκομείο με βάση τους ελέγχους )), και οι συχνότητες γονοτύπου στην υπόθεση και τον έλεγχο των ομάδων. Εν τω μεταξύ, εμείς δεν ορίζουν ελάχιστο αριθμό υποθέσεων ή τους ελέγχους που πρέπει να περιλαμβάνονται σε μας μετα-ανάλυση.

Η στατιστική ανάλυση

Αναλύσαμε πρώτα HWE στους ελέγχους για κάθε μελέτη χρησιμοποιώντας καλοσύνη, της -ταιριάζει δοκιμής (chi-square ή την ακριβή δοκιμασία του Fisher) και παραβίαση της HWE προσδιορίστηκε από την P & lt? 0,05. Αργού πιθανότητες αναλογίες (ΕΑΠ) με 95% διαστήματα εμπιστοσύνης (ΠΙ) χρησιμοποιήθηκαν για την αξιολόγηση του βαθμού συσχέτισης μεταξύ των πολυμορφισμών του γονιδίου RAD51 και την ευαισθησία του καρκίνου. Τα συγκεντρωτικά ΕΑΠ για RAD51 G135C πολυμορφισμού διεξήχθησαν υπό κυρίαρχο μοντέλο (CC + GC εναντίον GG), υπολειπόμενο μοντέλο (CC έναντι GG + GC), το μοντέλο ομοζυγώτες (CC εναντίον GG) και αλληλομόρφων γενετικό μοντέλο (C έναντι G) . C και G αντιπροσωπεύουν τον ανήλικο και το μείζον αλληλόμορφο αντίστοιχα. Οι ίδιες μέθοδοι εφαρμόζονται στην ανάλυση του πολυμορφισμού RAD51 G172T. Στρωματοποιημένη αναλύσεις διεξήχθησαν σε σχέση με την εθνικότητα, τον τύπο του καρκίνου και την πηγή των ελέγχων.

Μια χ

2-based Q-test έγινε για να ελεγχθεί η ετερογένεια μεταξύ των επιλέξιμων συγκρίσεις, η οποία θεωρείται σημαντική αν P & lt? 0,05. Η μεταβολή που προκαλείται από την ετερογένεια εκτιμήθηκε από τον υπολογισμό του δείκτη ασυνέπεια I

2, με I

2 & lt? 25%, 25-75% και & gt? 75% που αντιπροσωπεύουν χαμηλό, μέτριο ή υψηλό βαθμό ασυνέπειας, αντίστοιχα [12 ]. Η συγκεντρωτική Ή υπολογίστηκε από ένα μοντέλο σταθερών επιδράσεων (η μέθοδος Mantel-Haenszel) εάν το αποτέλεσμα της δοκιμής Q ήταν P & gt? 0,05, η οποία έδειξε ότι η ετερογένεια μεταξύ των μελετών δεν ήταν σημαντική [13]. Σε αντίθετη περίπτωση, ένα μοντέλο τυχαίων δράσεων (η μέθοδος Der-Simonian και Laird) χρησιμοποιήθηκε [14]. ανάλυση ευαισθησίας πραγματοποιήθηκε από την αφαίρεση κάθε μελέτη σε μια στιγμή για να αξιολογηθεί η σταθερότητα των αποτελεσμάτων στο πλαίσιο είτε γονοτυπική μοντέλα ή το μοντέλο αλληλομόρφων. Επιπλέον, δοκιμασία Begg και δοκιμασία γραμμικής παλινδρόμησης Egger κατά την οπτική επιθεώρηση του οικοπέδου χοάνης πραγματοποιήθηκαν για την αντιμετώπιση της πιθανής μεροληψίας δημοσίευση και P & lt?. 0,05 θεωρήθηκε ως ένδειξη της σημαντικής προκατάληψη δημοσίευση [15]

Όλες οι στατιστικές αναλύσεις πραγματοποιήθηκαν με τη χρήση του λογισμικού STATA (έκδοση 11? Stata Corporation, College Station, Texas). Δύο όψεων τιμές Ρ μικρότερη από 0,05 θεωρήθηκαν σημαντικές.

Αποτελέσματα

Μελέτες που περιλαμβάνονται στη μετα-ανάλυση

Η αρχική αναζήτηση βιβλιογραφίας μέσω του PubMed, Embase και Web of Knowledge βάσεις δεδομένων απέδωσε 203 δημοσιευμένα άρθρα μετά αφαιρέθηκαν τα διπλότυπα. Όταν εξετάστηκε από τους τίτλους ή περιλήψεις, 115 αρχεία δεν πληρούσε τα κριτήρια ένταξης, αφήνοντας 88 δυνητικά σχετικές μελέτες που εξετάστηκαν στο πλήρες κείμενο. Ανάμεσα στα υπόλοιπα 88 άρθρα, 10 δεν αφορούσαν G135C ή G172T πολυμορφισμούς σε RAD51gene, 7 δεν ήταν ανθρώπινες μελέτες, 4 δεν δημοσιεύθηκε στα αγγλικά, 6 δεν ήταν μελέτες ασθενών-μαρτύρων, 5 δεν ήταν χρησιμοποιήσιμα αναφερόμενα στοιχεία, 2 είχαν περιλήψεις συναντήσεων , 4 ήταν μετα-ανάλυση, και 11 δεν ήταν σε HWE? Επίσης εξαιρούνται αυτές οι εκδόσεις. Τέλος, συνολικά 54 μελέτες ασθενών-μαρτύρων σε 37 άρθρα εντοπίστηκαν στο σημερινό μετα-ανάλυση [16] – [54], μεταξύ των οποίων 42 με 19.142 περιπτώσεις και 20.363 έλεγχοι για RAD51 G135C πολυμορφισμό και 12 με 6646 περιπτώσεις και 6783 ελέγχους για G172T πολυμορφισμό. κατανομές γονότυπου των ελέγχων όλων των επιλεγμένων μελετών είναι σε συμφωνία με HWE. Η ροή της επιλογής σπουδών φαίνεται στο Σχήμα 1, και τα κύρια χαρακτηριστικά των επιλέξιμων μελετών παρουσιάζονται στον Πίνακα 1 και τον Πίνακα 2.

Η

Η

Μετα-ανάλυση των αποτελεσμάτων

Τα συγκεντρωτικά αποτελέσματα της μετα-ανάλυσης για τη συσχέτιση μεταξύ πολυμορφισμών RAD51 (G135C και G172T) και την ευαισθησία του καρκίνου παρουσιάζονται στους πίνακες 3 και πίνακες 4.

η

Όσον αφορά G135C πολυμορφισμό, ένα εντοπίστηκαν συνολικά 42 μελέτες ασθενών-μαρτύρων σε 37 εκδόσεις με 19.142 περιπτώσεις και 20.363 ελέγχους. Συνολικά, σημαντικά αυξημένο κίνδυνο καρκίνου βρέθηκε σε όλες τις γενετικές μοντέλα (μοντέλο ομοζυγώτες: OR = 1.776, 95% CI = 1,288 – 2,449, Εικόνα 2? Αλληλομόρφων γενετικό μοντέλο: OR = 1.169, 95% CI = 1,016 – 1,345? Υπολειπόμενο μοντέλο: OR = 1.946, 95% CI = 1,336 – 2,835), εκτός από το κυρίαρχο μοντέλο (OR = 1.039, 95% CI = 0,942 – 1,146). Η ετερογένεια ήταν σημαντική σε όλα τα γενετικά μοντέλα και τα λεπτομερή δεδομένα παρουσιάζονται στον Πίνακα 3. Αυτά τα επιλέξιμα μελέτες αναλύθηκαν με στρωματοποιημένη ανάλυση. Στο στρωματοποιημένη ανάλυση της επίδρασης των τύπων καρκίνου, μια σημαντική συσχέτιση βρέθηκε για τον καρκίνο του μαστού (μοντέλο ομοζυγώτες: OR = 1.498, 95% CI = 1.026 -2.189? Υπολειπόμενο μοντέλο: OR = 1.732, 95% CI = 1,170 – 2,562) . Ωστόσο, καμία σημαντική συσχέτιση με τον κίνδυνο καρκίνου επιδείχθηκε σε συνολικό πληθυσμό με καρκίνο των ωοθηκών, ορθοκολικό καρκίνο, οξεία μυελοκυτταρική λευχαιμία, καθώς και καρκίνους της κεφαλής και του λαιμού. Όσο για την εθνικότητα, τα αποτελέσματά μας έδειξαν G135C πολυμορφισμού συσχετίστηκε με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου μεταξύ όλων των πληθυσμών σύμφωνα με το μοντέλο ομοζυγώτες και υποτελούς μοντέλο. Όταν κατηγοριοποιημένα με βάση την πηγή των ελέγχων, σημαντικά αυξημένο κίνδυνο παρατηρήθηκαν επίσης σε δύο υποομάδες έλεγχο με βάση τον πληθυσμό και τις υποομάδες του ελέγχου των νοσοκομειακών βάση (Πίνακας 3).

Η

Όσον αφορά την G172T πολυμορφισμός, συνολικά επιλέχθηκαν 12 μελέτες ασθενών-μαρτύρων σε 9 δημοσιεύσεις με 6.646 περιπτώσεις και 6.783 ελέγχους. Όπως φαίνεται στον Πίνακα 4, τα συγκεντρωτικά αποτελέσματα έδειξαν ότι δεν υπάρχουν σημαντικές συσχετίσεις μεταξύ G172T πολυμορφισμό και την ευαισθησία του καρκίνου σε όλα τα γενετικά μοντέλα (μοντέλο ομοζυγώτες: OR = 1.014, 95% CI = 0,872 – 1,173? Κυρίαρχο μοντέλο: OR = 0.980, 95% CI = 0,906 έως 1,061, Εικόνα 3? υπολειπόμενο μοντέλο: OR = 1.011, 95% CI = 1,241 έως 14,879? αλληλομόρφων γενετικό μοντέλο: OR = 0.993, 95% CI = 0,941 – 1,048). Η ανομοιογένεια ήταν σημαντική σε όλες τις γενετικές μοντέλα εκτός από το κυρίαρχο μοντέλο (P = 0,414). Αναλύσαμε επίσης αυτά τα επιλέξιμα μελέτες από στρωματοποιημένη ανάλυση. Όπως έχουμε διαιρέσει τις μελέτες από τον τύπο του καρκίνου, το αποτέλεσμα έδειχνε ότι ο μειωμένος κίνδυνος καρκίνου βρέθηκε σε καρκίνους της κεφαλής και του τραχήλου (μοντέλο ομοζυγώτες: OR = 0,621, 95% CI = 0,460 – 0,837? Αλληλομόρφων γενετικό μοντέλο: OR = 0.824, 95% CI = 0,716 – 0,948? υπολειπόμενο γενετικό μοντέλο: OR = 0.639, 95% CI = 0,488 – 0,837) Παρ ‘όλα αυτά, δεν βρήκαμε στατιστικά σημαντική συσχέτιση μεταξύ G172T πολυμορφισμού και του καρκίνου του μαστού και των ωοθηκών. Όταν κατανεμημένες ανάλογα με την εθνικότητα, το αποτέλεσμα δεν έδειξε καμία απόδειξη ότι ο πολυμορφισμός G172T ήταν σημαντικά σχετίζεται με αυξημένο κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου σε Καυκάσιους πληθυσμούς. Στην ανάλυση υποομάδων ανά πηγή των ελέγχων, δεν υπάρχει σημαντική συσχέτιση με τον κίνδυνο καρκίνου παρατηρήθηκε και στις δύο υποομάδες έλεγχο με βάση τον πληθυσμό και το νοσοκομείο με βάση (Πίνακας 4).

Η

Ευαίσθητα ανάλυση

Δεδομένου ότι η σημαντική μεταξύ μελετών ετερογένεια για RAD51 G135C και G172T πολυμορφισμούς, το μοντέλο τυχαίας επίδρασης χρησιμοποιήθηκε για τον υπολογισμό των συγκεντρωτικά αποτελέσματα, εάν η ετερογένεια ήταν σημαντική. Εν τω μεταξύ, πραγματοποιήσαμε επίσης μια ανάλυση ευαισθησίας για την εκτίμηση των επιπτώσεων της κάθε μελέτης σχετικά με τις συγκεντρωμένων ΕΑΠ από παράλειψη των επιμέρους μελετών. Η ανάλυση ευαισθησίας έδειξε ότι, για κάθε πολυμορφισμό, καμία μεμονωμένη μελέτη αλλάξει ποιοτικά τα συγκεντρωτικά ΕΑΠ, γεγονός που υποδηλώνει ότι τα αποτελέσματα αυτής της μετα-ανάλυσης ήταν στατιστικά σταθερό και αξιόπιστο (Figure_S1 και Εικόνα _S2).

Διάγνωση προκατάληψη Δημοσίευση

Θα προσδιορίσει περαιτέρω τις πιθανές προκαταλήψεις δημοσίευση των λογοτεχνιών με δοκιμή και χοάνη οικόπεδο Egger του. Σε όλες τις μελέτες, δεν υπάρχει ασυμμετρία οικόπεδο χωνί βρέθηκε. Τα αποτελέσματα των δοκιμών του Egger για G135C και G172T πολυμορφισμούς RAD51 δεν έδειξαν οποιαδήποτε ένδειξη σφάλματος εκ της δημοσίευσης (t = -1.11, P = 0,275 για G135C κάτω ομοζυγώτες σύγκριση μοντέλο, Εικόνα 4? T = -0.09, P = 0.929 για G172T κάτω ομοζυγώτες σύγκριση μοντέλο, Εικόνα 5).

η

Συζήτηση

είναι καλά αναφερθεί ότι η διπλό σκέλος ζημιά διάλειμμα είναι η πιο επικίνδυνη βλάβη που παρατηρείται σε ευκαρυωτικά κύτταρα, επειδή μπορεί να προκαλέσει κυτταρικό θάνατο ή συνιστούν σοβαρή απειλή για τη βιωσιμότητα των κυττάρων και τη σταθερότητα του γονιδιώματος. Έχει τη δυνατότητα να συλλάβει μόνιμα την εξέλιξη του κυτταρικού κύκλου και να θέσει σε κίνδυνο την επιβίωση των κυττάρων [55]. Δεδομένου ότι οι μηχανισμοί επιδιόρθωσης του DNA είναι απαραίτητα για τη διατήρηση της σταθερότητας γονιδιωματική και τη λειτουργικότητα, ελαττώματα στην επιδιόρθωση του DNA μπορεί να οδηγήσει στην ανάπτυξη των χρωμοσωμικών ανωμαλιών που μπορεί να οδηγήσει σε αυξημένη ευπάθεια σε καρκίνο [4], [56], [57]. Ο ομόλογος ανασυνδυασμός και μη ομόλογου άκρου ενώνει έχουν μελετηθεί εκτενώς ως δύο διακριτών οδών στην επισκευή του δίκλωνα σπασίματα σε κύτταρα θηλαστικών. Ο ομόλογος ανασυνδυασμός είναι μια διαδικασία υψηλής πιστότητας που χρησιμοποιεί αλληλουχία DNA, μια αδελφή χρωματίδων ή ομόλογο χρωμόσωμα σε άμεση γειτνίαση με το διάλειμμα ως πρότυπο [58] – [60]. Σε αυτή τη διαδικασία επισκευής, ένα πρώιμο διαδικασία είναι η εκτομή των 3 ‘άκρα των DSBs να σχηματίσουν έλικος ουρές single που εισβάλλουν στο ανέπαφο ομόλογο DNA διπλής έλικας σχηματίζοντας μια διασταύρωση Holliday [61], [62]. RAD51, ένα είδος πανταχού παρούσα πρωτεΐνη ανταλλαγή κλώνου, είναι γνωστό ότι είναι ένας κεντρικός ένζυμο που εμπλέκεται στο DNA διπλής έλικος επισκευή διάλειμμα με ομόλογο ανασυνδυασμό. Θα μπορούσε να πολυμεριστεί σε μονόκλωνο DNA και αναζητήσεις για ομολογία σε ένα διπλό μόριο DNA δότη, συνήθως το αδελφών χρωματίδων [63]. Πρόσφατες έρευνες έχουν δείξει δύο κοινών πολυμορφισμών (G135C και G172T) βρίσκεται στη μη μεταφραζόμενη περιοχή 5 ‘φαίνεται να είναι λειτουργική σημασία. Επιπλέον, πολλές λειτουργικές μελέτες αποκάλυψαν ότι αυτοί οι πολυμορφισμοί μπορούν να επηρεάσουν mRNA σταθερότητα ή μεταφραστική αποτελεσματικότητα, οδηγώντας σε αλλαγές σε δύο επίπεδα προϊόντος πολυπεπτιδίου και τη λειτουργία του που κωδικοποιεί πρωτεΐνη RAD51, και έτσι επηρέασε την ικανότητα επιδιόρθωσης του DNA σε κάποιο βαθμό [10], [11] . Επιπλέον, η ένωση της Rad51 παραλλαγές (G135C και G172T) και τον κίνδυνο του καρκίνου έχει ερευνηθεί εκτενώς σε διαφορετικούς πληθυσμούς. Ωστόσο, τα αποτελέσματα αυτών των μελετών ήταν ασυνεπής. Ως εκ τούτου, πραγματοποιήσαμε μια μετα-ανάλυση για να συνοψίσει τα αποτελέσματα της μεταβολής Rad51 σχετικά με τον κίνδυνο καρκίνου.

Σε αυτό το μετα-ανάλυση, 54 μελέτες ασθενών-μαρτύρων (42 για G135C πολυμορφισμό, 12 για G172T πολυμορφισμός) πραγματοποιήθηκαν για να παρέχει την πιο ολοκληρωμένη αξιολόγηση της σχέσης μεταξύ των πολυμορφισμών RAD51 και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου. Για Rad51 G135C πολυμορφισμό, το αλληλόμορφο C του G135C πολυμορφισμού είχε σημαντική συσχέτιση με την ευαισθησία του καρκίνου για το μοντέλο ομοζυγώτες, αλληλομόρφων γενετικό μοντέλο, και υπολειπόμενο γενετικό μοντέλο στο σύνολο του πληθυσμού. Παρ ‘όλα αυτά, τα αποτελέσματα έδειξαν ότι Rad51 G172T πολυμορφισμός δεν συσχετίστηκε με συνολικό κίνδυνο του καρκίνου, όταν όλες οι μελέτες είχαν συσσωρευθεί μαζί. Λαμβάνοντας υπόψη τον πιθανό ρόλο των εθνοτικών διαφορών στο γενετικό υπόβαθρο, πραγματοποιήσαμε ανάλυση υποομάδας με βάση την εθνικότητα. Κατά συνέπεια, σημαντική συσχέτιση βρέθηκε σε τόσο Καυκάσιους και Ασιάτες για Rad51 G135C πολυμορφισμό, αλλά όχι για G172T πολυμορφισμό. Όταν στρωματοποιημένη από την πηγή των ελέγχων, τα αποτελέσματά μας βρήκε αποδείξεις ότι υπάρχει συσχετισμός μεταξύ του κινδύνου του καρκίνου και G135C πολυμορφισμός στα δύο με βάση τον πληθυσμό και το νοσοκομείο με βάση τους ελέγχους, ενώ δεν παρατηρήθηκε σημαντική συσχέτιση αναφέρεται είτε σε ελέγχους με βάση τον πληθυσμό ή το νοσοκομείο με βάση για G172T πολυμορφισμό. Στο στρωματοποιημένη ανάλυση ανά τύπο καρκίνου, τα αποτελέσματά μας έδειξε έντονα ότι Rad51 G135C πολυμορφισμού συσχετίστηκε με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου του μαστού, ενώ G172T πολυμορφισμού με μειωμένο το κεφάλι και τον κίνδυνο του καρκίνου του τραχήλου.

Προηγούμενη μετα-αναλύσεις πραγματοποιήθηκαν για την αξιολόγηση της επίδραση της Rad51 G135C πολυμορφισμού είτε τον κίνδυνο του καρκίνου του μαστού ή οξεία λευχαιμία [64], [65]. Συγκρίνοντας με αυτά, η μελέτη μας έχει κάποιες βελτιώσεις. Πρώτον, αυτή είναι η πρώτη έκθεση όχι μόνο για να αναλύσει δύο πολυμορφισμών στο γονίδιο Rad51 (G135C και G172T) και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου σε διάφορες μορφές καρκίνου, αλλά επίσης για την ταυτοποίηση του πολυμορφισμού G172T ως παράγοντας κινδύνου για καρκίνο κεφαλής και τραχήλου. Δεύτερον, παρέχεται μια πιο ολοκληρωμένη ανάλυση των δεδομένων από τον υπολογισμό των τεσσάρων διαφορετικών γενετικών μοντέλων και την εκτέλεση ανάλυση υποομάδας με βάση την εθνότητα, τους τύπους καρκίνου και την πηγή των ελέγχων. Τρίτον, αποκλείσαμε αυτές τις μελέτες, στις οποίες κατανομές γονότυπου στους ελέγχους δεν ήταν σε συμφωνία με HWE επειδή θα μπορούσαν να επηρεάσουν τα αποτελέσματα.

Η ετερογένεια μεταξύ των μελετών θα πρέπει να σημειωθεί, διότι μπορεί να επηρεάσουν τις δυνάμεις της μετα-ανάλυσης. Στην τρέχουσα μετα-ανάλυση, σημασία ετερογένεια παρατηρήθηκε τόσο για Rad51 G135C και πολυμορφισμούς G172T. Έτσι, χρησιμοποιήθηκαν τα μοντέλα τυχαίας αποτέλεσμα εάν εντοπίστηκε σημαντική ετερογένεια. Εν τω μεταξύ, για να μειώσει την ετερογένεια, θα πραγματοποιηθεί ανάλυση υποομάδας με βάση την εθνότητα, τους τύπους καρκίνου και την πηγή των ελέγχων. Τα αποτελέσματα έδειξαν ότι η ετερογένεια μειωθεί ή εξαφανιστεί σε υποομάδες. Πραγματοποιήσαμε επίσης ανάλυση ευαισθησίας για να εξακριβώσει την κύρια προέλευση της ετερογένειας. Η ανάλυση έδειξε ότι καμία μελέτη μεταβληθεί ουσιωδώς τα συγκεντρωτικά ΕΑΠ, γεγονός που υποδηλώνει ότι τα αποτελέσματα αυτής της μετα-ανάλυσης ήταν στατιστικά σταθερή και αξιόπιστη. Δεν παρατηρήθηκε η προκατάληψη δημοσίευση για τη σύνδεση μεταξύ αυτών των δύο πολυμορφισμό και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου.

Θα πρέπει να ληφθούν υπόψη ορισμένοι περιορισμοί όσον αφορά την παρούσα μετα-ανάλυση κατά την ερμηνεία των αποτελεσμάτων. Πρώτα απ ‘όλα, μόνο δημοσιευμένες μελέτες και έγγραφα γραμμένα στην αγγλική γλώσσα αναζητήθηκαν σε αυτή την μετα-ανάλυση, μερικές αδημοσίευτες μελέτες ή μελέτες γραμμένα σε άλλη γλώσσα που θα μπορούσε επίσης να πληρούν τα κριτήρια ένταξης είχαν αγνοηθεί. Δεύτερον, σε ορισμένες μελέτες, λεπτομερείς πληροφορίες όπως η ηλικία και το φύλο σε περίπτωση και τον έλεγχο των διαφόρων γονότυπων δεν ήταν διαθέσιμα, τα οποία περιορίζονται περαιτέρω εκτιμήσεις σε κάποιο βαθμό. Τρίτον, η σημερινή μετα-ανάλυση δεν εξέτασε τις αλληλεπιδράσεις γονιδίου-γονιδίου και γονιδίων-περιβάλλοντος λόγω της έλλειψης επαρκών στοιχείων. Απαιτούνται περαιτέρω μελέτες για να αξιολογήσουν τις πιθανές αλληλεπιδράσεις γονίδιο-γονιδίων και γονιδίων-περιβάλλοντος στην σχέση μεταξύ πολυμορφισμό του γονιδίου Rad51 και την ευαισθησία στον καρκίνο. Τέταρτον, οι περισσότεροι από τους ασθενείς στη μελέτη μας ήταν Καυκάσιους, που μπορεί να περιορίσουν τη γενική εφαρμογή των αποτελεσμάτων μας. Παρά αυτά, το παρόν μας μετα-ανάλυση είχε επίσης κάποια πλεονεκτήματα. Πρώτον, αναλύοντας δύο πολυμορφισμών του γονιδίου Rad51 με συνολικά 54 μελέτες ασθενών-μαρτύρων έχει πολύ μεγαλύτερη στατιστική δύναμη σε σχέση με οποιαδήποτε μεμονωμένη μελέτη. Δεύτερον, αποκλείσαμε τις μελέτες στις οποίες οι συχνότητες γονοτύπου των ελέγχων δεν ήταν σύμφωνα με HWE, παρέχοντας επαρκή αποδεικτικά στοιχεία για την κατάρτιση ασφαλών συμπερασμάτων σχετικά με τη σχέση μεταξύ των πολυμορφισμών Rad51 και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου. Τρίτον, η σταθερότητα και η αξιοπιστία της παρούσας μετα-ανάλυση αυτή επιβεβαιώθηκε από το αναλύσεων ευαισθησίας και αναλύσεων προκαταλήψεις δημοσίευση. Τέλος, τα ευρήματα υπογραμμίζουν τη σχέση μεταξύ πολυμορφισμών του γονιδίου Rad51 και την ανάπτυξη του καρκίνου και θα παρέχει κατευθύνσεις για μελλοντική έρευνα σε μοριακό μηχανισμό του καρκίνου.

Συμπεράσματα

Οι έρευνές μας πρότεινε ότι η G135C πολυμορφισμός Rad51 είναι ένα υποψήφιος για ευαισθησία σε συνολική καρκίνους, ιδιαίτερα τον καρκίνο του μαστού, και ότι ο πολυμορφισμός G172T συνδέεται σημαντικά με μειωμένο κίνδυνο καρκίνου κεφαλής και τραχήλου. απαιτούνται περαιτέρω μελέτες με μεγάλο μέγεθος δείγματος και βαθύτερη αξιολόγηση σχετικά με την επίδραση των γονιδίων-γονιδίου και αλληλεπιδράσεων γονιδίων-περιβάλλοντος στην πολυμορφισμούς και τον καρκίνο του κινδύνου Rad51.

Υποστήριξη Πληροφορίες

Εικόνα S1.

Ανάλυση ευαισθησίας της περιληπτική ή της σύνδεσης μεταξύ Rad51 G135C πολυμορφισμό και την ευαισθησία του καρκίνου στο μοντέλο ομοζυγώτες

doi:. 10.1371 /journal.pone.0087259.s001

(ΔΕΘ)

Εικόνα S2.

Ανάλυση ευαισθησίας της περιληπτική ή της σύνδεσης μεταξύ Rad51 G172T πολυμορφισμό και την ευαισθησία του καρκίνου στο μοντέλο ομοζυγώτες

doi:. 10.1371 /journal.pone.0087259.s002

(ΔΕΘ)

Λίστα ελέγχου S1.

PRISMA Λίστα ελέγχου

doi:. 10.1371 /journal.pone.0087259.s003

(DOCX)

You must be logged into post a comment.