PLoS One: ενός νουκλεοτιδίου πολυμορφισμοί του PIN1 Διοργανωτή Περιφέρειας και του καρκίνου του κινδύνου: Στοιχεία από μια μετα-Analysis


Αφηρημένο

Ιστορικό

πεπτιδυλπρολύλ cis /trans ισομεράσης NIMA-αλληλεπιδρώντας 1 (PIN1) είναι που εμπλέκονται στη διαδικασία της ογκογένεσης. Οι δύο πολυμορφισμούς μονών νουκλεοτιδίων (-677T & gt? C, -842G & gt? C) έχουν στην περιοχή PIN1 υποκινητή έχουν υπόνοιες ότι συνδέονται με τον κίνδυνο καρκίνου για χρόνια, αλλά το συμπέρασμα είναι ακόμη ασαφή

Μέθοδοι

.

μελέτες ασθενών-μαρτύρων Επιλέξιμες ανακτήθηκαν από την αναζήτηση των βάσεων δεδομένων και των στοιχείων των σχετικών κριτικές και μελέτες. δεδομένα κατανομής γονότυπο, προσαρμοσμένο αναλογίες πιθανοτήτων (OR) και 95% εμπιστοσύνης (ΠΙ) διαστήματα εξήχθησαν να υπολογίσει συγκεντρωτικά ΕΑΠ.

Αποτελέσματα

Ένα σύνολο των 4619 περιπτώσεων καρκίνου και 4661 έλεγχοι που περιλαμβάνονται στο Αυτή η μετα-ανάλυση. Συνολικά, το PIN1 -667T & gt? C πολυμορφισμός δεν συσχετίστηκε με τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου, ενώ το αλληλόμορφο -842C συσχετίστηκε σημαντικά με τον κίνδυνο μειωμένης καρκίνο (CC + GC εναντίον GG, OR = 0,725, 95% CI: 0,607 – 0,865? P

ετερογένεια = 0,012 και GC εναντίον GG: OR = 0.721, 95% CI: 0,591 – 0,880? P

ετερογένεια = 0,003). Τα αποτελέσματα από τα στοιχεία διανομής γονότυπο ήταν σε συμφωνία με αυτά που υπολογίστηκαν με προσαρμοσμένο ΕΑΠ και 95% ΠΙ. Δεν προκατάληψη δημοσίευση ανιχνεύθηκε

Συμπεράσματα

Τα αποτελέσματα αυτής της μετα-ανάλυσης δείχνουν ότι η PIN1 -842G & gt?. C πολυμορφισμός σχετίζεται με μειωμένο κίνδυνο καρκίνου, αλλά ότι η -667T & gt? C πολυμορφισμός είναι δεν

Παράθεση:. Peng JJ, Wei D, Li D, Fu ZQ, Tan Υ, Xu T, et al. (2013) ενός νουκλεοτιδίου πολυμορφισμοί του PIN1 Διοργανωτή Περιφέρειας και του καρκίνου του κινδύνου: Στοιχεία από μια μετα-ανάλυση. PLoS ONE 8 (8): e70990. doi: 10.1371 /journal.pone.0070990

Επιμέλεια: Oliver Schildgen, Kliniken der Stadt Köln gGmbH, Γερμανία

Ελήφθη: 7 Ιούνη, 2013? Δεκτές: 1 Ιουλίου του 2013? Δημοσιεύθηκε: 16 Αυγ, 2013

Copyright: © 2013 Peng et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Οι συγγραφείς δεν έχουν καμία υποστήριξη ή χρηματοδότηση για να αναφέρετε

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

πεπτιδυλπρολύλ cis /trans ισομεράσης NIMA-αλληλεπιδρούν 1 ( PIN1) ανήκει στην πεπτιδυλ-προλυλ ισομεράσης οικογένεια parvulin. Με έναν τομέα διατηρημένη WW (Trp-Trp), η οποία είναι υπεύθυνη για πρόσδεση σε ειδικές αλληλουχίες των πρωτεϊνών στόχων και την πρόσληψη αυτών των πρωτεϊνών σε σύμπλοκα σηματοδότησης [1], [2]. PIN1 έχει υψηλή συγγένεια με τις πρωτεΐνες με Ser /Thr-Pro (προλίνη) μοτίβα και ρυθμίζει την διαμόρφωση των προ-κατευθυνόμενης θέσεις φωσφορυλίωσης [2], [3]. Pro-κατευθυνόμενη φωσφορυλίωσης είναι ένα κρίσιμο μηχανισμός σηματοδότησης που ρυθμίζει διάφορες βιολογικές διαδικασίες, όπως ο πολλαπλασιασμός των κυττάρων, τη διαφοροποίηση, μεταγραφική ρύθμιση και ογκογένεση [4]. Έτσι, PIN1 μπορεί να ρυθμίσει πολλά μονοπάτια σηματοδότησης, συμπεριλαμβανομένων των υπευθύνων για την ογκογένεση [5] διαμορφώνοντας φωσφορυλίωση pro-σκηνοθεσία. Έχει καλά καταδειχθεί ότι πολλές πρωτεΐνες ογκογόνο και ογκοκατασταλτικό ρυθμίζονται από PIN1, όπως κυκλίνη D1 [6], c-Jun [7], Bcl-2 [8], β-κατενίνης [9] και p53 [10] . Ως εκ τούτου, PIN1 λειτουργεί ως κρίσιμο ρυθμιστή κατά τη διαδικασία της ογκογένεσης.

Σύμφωνα με την κρίσιμη ρυθμιστικό ρόλο της PIN1 στην ανάπτυξη καρκίνου, έχει αναφερθεί ότι παρεκκλίνουσα έκφραση PIN1 συνδέεται με καρκίνους, όπως ο καρκίνος του μαστού [7], [11] και του καρκίνου του προστάτη [12]. Επιπλέον, μελέτες δείχνουν ότι πολυμορφισμών μονού νουκλεοτιδίου (SNPs) του PIN1 συνδέονται με τη νόσο του Alzheimer [13], [14] και του καρκίνου [15] – [22]. Οι δύο SNPs (-667T & gt? C rs2233679, -842G & gt? C rs2233678) στην περιοχή του υποκινητή της PIN1 έχουν ως επί το πλείστον διερευνηθεί. Το 2007, Σεγκάτ και οι συνεργάτες του [21] βρήκαν το -667T & gt? Πολυμορφισμός C συσχετίστηκε με ηπατοκυτταρικό καρκίνωμα (HCC), που ήταν συν-μολυνθεί με τον ιό της ηπατίτιδας Β και ο ιός της ηπατίτιδας Β? Ωστόσο, άλλοι ερευνητές δεν βρέθηκε καμία σημαντική σύνδεση των -667T & gt? C πολυμορφισμού με άλλες μορφές καρκίνου [16], [17]. Από την άλλη πλευρά, Han et al [16] έδειξε ότι το αλληλόμορφο C του -842G & gt? C πολυμορφισμού μπορούσε μείωσε τον κίνδυνο καρκίνου του μαστού, ενώ Naidu πρότεινε ότι η -842G & gt? C πολυμορφισμός δεν επηρέασε την ευαισθησία στον καρκίνο του μαστού [20 ]. Εν συντομία, η σύνδεση των δύο SNPs του PIN1 (-667T & gt? C, -842G & gt? C) με τους κινδύνους του καρκίνου είναι άπιαστο, σύμφωνα με την τρέχουσα βιβλιογραφία

Η παρούσα μετα-ανάλυση σχεδιάστηκε για να εξακριβωθεί αν τα δύο κοινά. SNPs (-667T & gt? C, -842G & gt? C) PIN1 σχετίζονται με τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου και να αξιολογεί τον αντίκτυπο των εθνοτήτων

Μέθοδοι

Αναζήτηση στρατηγικής

Βάσεις δεδομένων PubMed. , EMBASE και Υποδομών China National Γνώσης (CNKI) ερευνήθηκαν για να ανακτήσετε επιλέξιμες μελέτες ασθενών-μαρτύρων. Λέξεις-κλειδιά της «πεπτιδυλπρολύλ cis /trans ισομεράση, NIMA-αλληλεπιδρώντας 1», «μόνο νουκλεοτιδίου πολυμορφισμός», και «καρκίνος» χρησιμοποιήθηκαν και εξετάστηκαν επίσης οι εναλλακτικές ορθογραφίες από αυτές τις λέξεις κλειδιά. Δεν υπήρχε κανένας περιορισμός της αναζήτησης και η τελευταία έρευνα πραγματοποιήθηκε τον Μάρτιο του 2013. λίστες αναφοράς των σχετικών μελετών και αξιολογήσεις έγιναν με το χέρι έψαξε για πρόσθετες μελέτες.

κριτήρια

Ένταξη και αποκλεισμού

Επιλέξιμες μελέτες ήταν προσδιορίζονται σύμφωνα με τα ακόλουθα κριτήρια ένταξης: (1) μελέτες ασθενών-μαρτύρων? (2) τη διερεύνηση της συσχέτισης μεταξύ της -842G & gt? C ή -667T & gt? C πολυμορφισμού και του καρκίνου του κινδύνου? (3) την παροχή συχνότητες γονοτύπου λεπτομέρεια. Μελέτες χωρίς συχνότητες γονοτύπου λεπτομέρεια αποκλείστηκαν. Ψάχνοντας τα αρχεία αναζητήθηκαν κυρίως από τίτλους και περιλήψεις και στη συνέχεια πλήρη άρθρα κειμένων ανακτήθηκαν για περαιτέρω αξιολόγηση της επιλεξιμότητας. Δύο κριτές (PJJ και WD) εξάγεται επιλέξιμες μελέτες ανεξάρτητα σύμφωνα με τα κριτήρια ένταξης. Διαφωνία μεταξύ των δύο συγγραφέων συζητήθηκε με άλλο συγγραφέα (ZT) μέχρι επιτεύχθηκε συναίνεση.

Συλλογή δεδομένων

Τα στοιχεία των επιλέξιμων μελετών εξήχθη από δύο συγγραφείς (PJJ και WD) ανεξάρτητα εις διπλούν, με ένα προσχεδιασμένα μορφή συλλογής δεδομένων. Τα ακόλουθα δεδομένα συλλέχθηκαν: όνομα του πρώτου συγγραφέα, το έτος δημοσίευσης, τη χώρα όπου διεξήχθη η μελέτη, οι μέθοδοι προσδιορισμού του γονότυπου, την εθνικότητα, τον τύπο του καρκίνου, την πηγή του ελέγχου, τον αριθμό των περιπτώσεων και των ελέγχων, η συχνότητα του γονότυπου στις περιπτώσεις και οι έλεγχοι, προσαρμοσμένοι λόγοι πιθανοτήτων (ΕΑΠ) και τα διαστήματα εμπιστοσύνης 95% (ΠΙ). Σε αυτή την μετα-ανάλυση, την εθνότητα απλώς κατηγοριοποιούνται ως Ασίας και του Καυκάσου. Πηγή του ελέγχου ορίστηκε ως το νοσοκομείο με βάση (ΗΒ) και με βάση τον πληθυσμό (ΡΒ) ανάλογα με την πηγή ελέγχου. Μέγεθος δείγματος των μελετών ορίζεται ως μεγάλες (& gt? 500 συμμετέχοντες) ή μικρά (≤500 συμμετέχοντες). Στη μελέτη των Σεγκάτ et al [21], δεν υπάρχουν πληροφορίες σχετικά με την πηγή του ελέγχου ήταν διαθέσιμο, έτσι θα κατατάσσονται αυτή τη μελέτη ως ΗΒ. Δύο σχολιαστές επιτευχθεί συναίνεση για κάθε θέμα.

Η στατιστική ανάλυση

Για να δοκιμαστεί η κατανομή των Hardy-Winberg ισορροπίας (HWE) σε ελέγχους, chi-square test για την αγαθότητα του ταιριάζει διεξήχθη και ένα p & lt ? 0,05 αναγράφεται ανισορροπία της HWE. Εκτιμήσαμε την ισχύ καταστατικού της PIN1 -667T & gt? C και -842G & gt? C πολυμορφισμών με τον κίνδυνο καρκίνου κατά OR και 95% ΠΙ. Το 95% ΠΙ χρησιμοποιήθηκε για τη δοκιμή στατιστικής σημαντικότητας και ένα CI 95% χωρίς 1 δείχνει ένα σημαντικά αυξημένο ή μειωμένο κίνδυνο καρκίνου. Υπολογίσαμε συγκεντρώνονται ΕΑΠ για σύγκριση ομοζυγώτες (CC έναντι ΤΤ ή GG), η σύγκριση ετεροζυγώτες (TC έναντι ΤΤ και GC εναντίον GG), κυρίαρχο μοντέλο (TC + ​​CC εναντίον TT ή GC + CC εναντίον GG) και υποτελούς ( CC εναντίον GC + GG ή TC + ΤΤ) μοντέλο, υποθέτοντας ότι το κυρίαρχο και υποτελούς επίδραση του αλληλόμορφου παραλλαγής C, αντίστοιχα. Πραγματοποιήσαμε αναλύσεις υποομάδων για να διερευνήσει τις επιπτώσεις της συγχυτικούς παράγοντες, όπως εθνοτήτων, την πηγή του ελέγχου και το μέγεθος του δείγματος. Παραλείποντας μία μελέτη κάθε φορά, αναλύσεις ευαισθησίας πραγματοποιήθηκαν για τη διερεύνηση επιμέρους μελέτη »επίδραση στα συγκεντρωτικά αποτελέσματα και να εξετάσει την αξιοπιστία των αποτελεσμάτων μετα-ανάλυση.

Chi-square test Q βάση χρησιμοποιήθηκε για να εκτιμηθεί η στατιστική ετερογένεια μεταξύ μελέτες, και η ετερογένεια ήταν σημαντική όταν ρ & lt? 0.10. Το μοντέλο σταθερών επιδράσεων (με βάση τη μέθοδο Mantel-Haenszel) και το μοντέλο τυχαίων δράσεων (με βάση τη μέθοδο Dersimonian-Laird) χρησιμοποιήθηκαν για να υπολογιστεί συγκεντρωμένων ΕΑΠ. Το μοντέλο σταθερών επιδράσεων χρησιμοποιήθηκε όταν δεν υπήρχε σημαντική ετερογένεια? Αλλιώς, εφαρμόστηκε το μοντέλο τυχαίων δράσεων [23]. Μετα-παλινδρόμησης έγινε για τον εντοπισμό της πηγής της ετερογένειας, και ένα ρ & lt?. 0.05 θεωρήθηκε σημαντική

οικόπεδο χοάνη Begg και δοκιμασία γραμμικής παλινδρόμησης του Egger »διεξήχθησαν για την ανίχνευση προκατάληψη δημοσίευση, και ένα ρ & lt? 0,05 θεωρούνται σημαντικές [24]. Όλες οι στατιστικές αναλύσεις πραγματοποιήθηκαν με το λογισμικό STATA (έκδοση 10.0? StataCorp, College Station, Texas USA). Και όλες οι τιμές p είναι δύο πλευρά.

Αποτελέσματα

Αναγνώριση των επιλέξιμων μελετών

Μετά την αφαίρεση των διπλών αρχείων, μια σειρά από 91 ψάχνοντας τα αρχεία ελέγχθηκαν και 8 πλήρους άρθρα κείμενο [15] – [22] ανακτήθηκαν μετά από έλεγχο. Στη μελέτη των Naidu et al [20], ερεύνησαν τριών πληθυσμών και η κατανομή γονότυπο έχουν αναφερθεί ξεχωριστά, ως εκ τούτου, οι τρεις πληθυσμοί είχαν θεωρηθεί ως 3 μελέτες? Lu ανέφερε επίσης τα στοιχεία του συνόλου δοκιμής και επικύρωσης που ανεξάρτητα [18], και οι δύο ομάδες αντιμετωπίστηκαν ως 2 μελέτες. Έτσι, 11 μελέτες που περιλαμβάνονται στην ποσοτική σύνθεση. Η λεπτομερής διαδικασία διαλογής δείχθηκε στο Σχήμα 1.

* Δεδομένα από Lu [18] αντιμετωπίστηκαν ως 2 μελέτες, και τα δεδομένα από Naidu [20] υποβλήθηκαν σε επεξεργασία ως 3 μελέτες.

Η

Χαρακτηριστικά που περιλαμβάνονται μελέτες

Ένα σύνολο από 11 μελέτες που περιλαμβάνονται σε αυτό το μετα-ανάλυση, συμπεριλαμβανομένων των 4619 ασθενών με καρκίνο και 4.661 ελέγχους. PIN1 πολυμορφισμών και καρκίνος του κινδύνου ερευνήθηκε σε 7 είδη καρκίνου (ηπατοκυτταρικό καρκίνωμα, λαρυγγικό καρκίνωμα πλακωδών κυττάρων, πλακώδες καρκίνωμα της κεφαλής και του τραχήλου, ο καρκίνος του μαστού, ο καρκίνος του πνεύμονα, καρκίνωμα του οισοφάγου και ρινοφαρυγγικό καρκίνωμα). Αλύσου πολυμεράσης μήκους θραύσματος αντίδραση περιορισμού πολυμορφισμό (PCR-RFLP) χρησιμοποιήθηκε για προσδιορισμό του γονότυπου στις περισσότερες μελέτες. Τα λεπτομερή χαρακτηριστικά των επιλέξιμων μελετών φαίνονται στον Πίνακα 1. διανομές γονότυπος του -667T & gt? C και -842G & gt? C πολυμορφισμός σε μάρτυρες ήταν σε συμφωνία με HWE, εκτός από το -842G & gt? C πολυμορφισμός στη μελέτη αναφέρθηκε από Σεγκάτ και συνεργάτες [21]

η

-677T & gt?. C πολυμορφισμού και του καρκίνου

κινδύνου

με τη συγκέντρωση των δεδομένων της κατανομής γονότυπου, σε συνολική σύγκριση, δεν υπάρχει σημαντική συσχέτιση της -667T & gt? C πολυμορφισμού με τον καρκίνο κίνδυνος βρέθηκε σε οποιοδήποτε μοντέλο σύγκριση (Σχήμα 2Α? Πίνακας 2). αναλύσεις υποομάδων διεξήχθησαν για να εκτιμηθεί περαιτέρω ο αντίκτυπος των εθνοτήτων, πηγές του ελέγχου και το μέγεθος του δείγματος. Τα αποτελέσματα πρότειναν ότι δεν υπήρχε σημαντική συσχέτιση της -667T & gt? C πολυμορφισμού με τον κίνδυνο καρκίνου σε οποιαδήποτε από τις υποομάδες (Πίνακας 2). Αξιοσημείωτα, δεν υπάρχει σημαντική ετερογένεια μεταξύ των μελετών ανιχνεύθηκε (Πίνακας 2). ανάλυση ευαισθησίας έδειξε ότι καμία μεμονωμένη μελέτη επηρέασε σημαντικά τα συγκεντρωτικά αποτελέσματα (τα δεδομένα δεν παρουσιάζονται)

Α:. σύγκριση ετεροζυγώτες (TC έναντι ΤΤ) υπολογίζεται με τα στοιχεία διανομής γονότυπο? Β ετερόζυγο σύγκριση (TC έναντι ΤΤ) υπολογίζεται με προσαρμοσμένη ΕΑΠ και 95% ΠΙ? Lu Ι α: σύνολο ελέγχου [18]? Lu J Β: Ρύθμιση της επικύρωσης [18]

Η

Για να εκτιμήσει καλύτερα την επίδραση των πολυμορφισμών PIN1, υπολογίζουμε συγκεντρωτικά ή με προσαρμοσμένη ΕΑΠ και 95% ΠΙ.. Ομοίως, βρήκαμε το PIN1 -667T & gt? C πολυμορφισμός δεν συμβάλλουν στον κίνδυνο του καρκίνου σε συνολική σύγκριση (Σχήμα 2Β? Πίνακας 3). Ωστόσο, ασιατική φορείς του -667TC γονότυπο μπορεί να έχουν μειωμένο κίνδυνο καρκίνου (ετεροζυγώτες σύγκριση TC εναντίον CC: OR = 0.880, 95% CI: 0,779 – 0,993? P

ετερογένεια, 0.414? Πίνακας 3), ενώ αυτό δεν παρατηρήθηκε σε Καυκάσιο πληθυσμό. Ετερογένεια δεν ήταν σημαντική μεταξύ των μελετών και καμία μεμονωμένη μελέτη επηρέασε σημαντικά τα συγκεντρωτικά αποτελέσματα

Η

PIN1 -842G & gt?. C πολυμορφισμού και του καρκίνου

κινδύνου

Η μετα-ανάλυση αποτελεσμάτων από τα δεδομένα της διανομής γονότυπο έδειξε ότι το αλληλόμορφο -842C θα μπορούσε να μειωθεί σημαντικά τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου (Κυρίαρχο μοντέλο CC + GC εναντίον GG: OR = 0,725, 95% CI: 0,607 – 0,865? P

ετερογένεια = 0.012 Σχήμα 3Α? και ετεροζυγώτες σύγκριση: GC εναντίον GG: OR = 0.721, 95% CI: 0,591 – 0,880, P

ετερογένεια = 0,003? Πίνακας 2). Το μειωμένο κίνδυνο καρκίνου επιβεβαιώθηκε επίσης αναλύσεις υποομάδων (Πίνακας 2). Ανάλυση ευαισθησίας πρότεινε καμία ατομική μελέτη επηρεάζονται συγκεντρώνονται αποτέλεσμα σημαντικά, ενώ παρατηρήθηκε ετερογένεια μεταξύ των μελετών

Α:. κυρίαρχο μοντέλο (GC + CC εναντίον GG) υπολογίζεται με δεδομένα κατανομής γονότυπο? Β κυρίαρχο μοντέλο (GC + CC εναντίον GG) υπολογίζεται με προσαρμοσμένη ΕΑΠ και 95% ΠΙ? Lu Ι α: σύνολο ελέγχου [18]? Lu J Β: Ρύθμιση της επικύρωσης [18]

Η

Κατά την αξιολόγηση της -842G & gt? C πολυμορφισμού και του καρκίνου του κινδύνου με τη χρήση προσαρμοστεί ΕΑΠ και 95% ΚΠ, βρήκαμε το αλληλόμορφο -842C σχετίζεται με μειωμένο κίνδυνο. σε όλα τα 3 μοντέλα σύγκρισης και πιο υποομάδες (Σχήμα 3Β? Πίνακας 3). Επιπλέον, δεν υπάρχει σημαντική ετερογένεια παρατηρήθηκε και καμία μεμονωμένη μελέτη επηρέασαν τα ενοποιημένα αποτελέσματα.

μεροληψία δημοσίευσης και μετα-παλινδρόμησης

προκατάληψη Δημοσίευση αξιολογήθηκαν με δοκιμή Egger και δοκιμασία Begg του, και εμείς δεν βρέθηκε οποιαδήποτε ένδειξη για μεροληψία δημοσίευσης (Σχήμα 4, σύγκριση ετεροζυγώτες της -667T & gt? C και κυρίαρχο μοντέλο της -842G & gt? C δόθηκαν για παράδειγμα). Για να αναζητήσετε την πηγή της ετερογένειας, μετα-παλινδρόμησης έγινε. τύπους καρκίνου (p = 0,003), εθνοτήτων (p = 0,001), πηγές του ελέγχου (p = 0,006) και το μέγεθος του δείγματος (p = 0,001) ήταν οι πηγές της ετερογένειας. Επιπλέον, μελέτη από Σεγκάτ [21] συνέβαλε επίσης στην ετερογένεια (p = 0.015), και δεν υπάρχει σημαντική ετερογένεια (σύγκριση ετεροζυγώτες, P

ετερογένεια = 0,418? Κυρίαρχο μοντέλο, P

ετερογένεια = 0.455) παρατηρήθηκε μετά την απομάκρυνση του Αυτή η μελέτη

Α:. σύγκριση ετεροζυγώτες (TC έναντι ΤΤ) της -667T & gt? C πολυμορφισμού υπολογίζεται με προσαρμοσμένη ΕΑΠ και 95% ΚΠ, P

Begg = 0,917, P

Egger = 0,89? Β: κυρίαρχο μοντέλο (GC + CC εναντίον GG) της -842G & gt? C πολυμορφισμού υπολογίζεται με αναπροσαρμοσμένη ΕΑΠ, P

Begg = 0,536, P

Egger = 0,366

Η

Συζητήσεις

Ανθρώπινα PIN1 γονίδιο, που βρίσκεται στο χρωμόσωμα θέση 19p13, περιέχει 4 εξόνια και έχει μία περιοχή υποκινητή περίπου 1,5 kb. Η -667T & gt? C και -842G & gt? Πολυμορφισμοί C συμβαίνουν στην περιοχή PIN1 υποκινητή, και έχουν υποψίες ως παράγοντες κινδύνου του καρκίνου [16], [17], [21] και η νόσος Alzihamer [13], [14]. Πρόσφατα, τα δεδομένα από μια μετα-ανάλυση έδειξε ότι ούτε ο -667T & gt? C ούτε -842G & gt? C πολυμορφισμού συσχετίστηκε με ευαισθησία σε ασθένειες Alzihamer του [25]? . Ωστόσο, η συσχέτιση μεταξύ των πολυμορφισμών PIN1 και τον κίνδυνο του καρκίνου είναι ακόμα ελλιπής

Σε αυτό το μετα-ανάλυση, βρήκαμε την -667T & gt? C πολυμορφισμός δεν συμβάλλουν στην ευπάθεια στον καρκίνο, ενώ το αλληλόμορφο -842C σχετίζεται σημαντικά με μειωμένο κίνδυνο καρκίνου. Να αξιολογηθεί καλύτερα η επίδραση των πολυμορφισμών PIN1, προσαρμοσμένη ΕΑΠ και πιστωτικών ιδρυμάτων από τις επιλέξιμες μελέτες συλλέχθηκαν και αναλύθηκαν. Τα ευρήματα αυτά υποστηρίζονται επίσης από τα αποτελέσματα προσαρμοστεί ΕΑΠ. Επιπλέον, τα αποτελέσματα από προσαρμοστεί ΕΑΠ επίσης προταθεί ότι οι μεταφορείς της -667TC γονότυπο μπορεί να έχουν μειωμένο κίνδυνο καρκίνου σε χώρες της Ασίας.

Λου και οι συνεργάτες του [17] έχουν αποδείξει ότι το αλληλόμορφο -842C των PIN1 σχετίζεται με μειωμένη μεταγραφική δραστηριότητα. Σε συνδυασμό με την ογκογένεση ρόλο της PIN1 [18], αυτό μπορεί να εξηγήσει γιατί το αλληλόμορφο -842C μειωμένο κίνδυνο καρκίνου. Σεγκάτ αναφέρθηκε για πρώτη φορά ότι το αλληλόμορφο -667T συσχετίστηκε με αυξημένο κίνδυνο HCC συνυπάρχουσα λοίμωξη με HBV και HCV [21], ενώ οι επόμενες μελέτες δεν βρέθηκε καμία διαφορά μεταξύ του αλληλόμορφου -667T και -667C [3], [13], [ ,,,0],24]. Στη μελέτη με Σεγκάτ [21], συμπεριλήφθηκαν μια σειρά από εξαιρετικά επιλεγμένους ασθενείς, και δεν θα μπορούσε να αντιπροσωπεύει όλες τις HCC. Επιπλέον, η κατανομή γονότυπος -842G & gt? C ήταν σε διαφωνία με HWE, η οποία μπορεί να είναι ο λόγος για τον οποίο διαπιστώθηκε αυξημένος κίνδυνος

Η ετερογένεια παρατηρήθηκε στη σύγκριση ετεροζυγώτες και κυρίαρχο μοντέλο -842G & gt?. C πολυμορφισμό. Η ετερογένεια μεταξύ των μελετών προκλήθηκε από τύπους καρκίνου, πηγές του ελέγχου, εθνοτήτων και το μέγεθος του δείγματος. Επιπλέον, όσον αφορά την ατομική μελέτη, μελέτη Σεγκάτ του [21] συνέβαλαν στην ετερογένεια, αλλά η ανάλυση ευαισθησίας έδειξε ότι η μελέτη αυτή δεν επηρέασε σημαντικά τα συγκεντρωτικά αποτελέσματα. Έτσι, τα αποτελέσματα από μετα-αναλύσεις μας ήταν ισχυρή και αξιόπιστη.

Έχει καλά τεκμηριωμένο ότι η μετα-ανάλυση αυξήσεις στα στατιστική ισχύ [26] και διάφορες μελέτες έχουν επικυρώσει την αποτελεσματικότητα της μετα-ανάλυσης [27], [28]. Σε αυτή την μετα-ανάλυση, συμπεριλάβαμε 4619 περιπτώσεις καρκίνου και 4661 ελέγχους, η οποία μπορεί να παρέχει αρκετή στατιστική δύναμη. Έχουμε, επίσης, υπολογίζεται συγκεντρωτικά ΕΑΠ με ​​προσαρμοσμένο ΕΑΠ και πιστωτικών ιδρυμάτων, τα οποία θα μπορούσαν να αντικατοπτρίζουν με μεγαλύτερη ακρίβεια γονίδιο αποτέλεσμα. Επίσης, πρέπει να σημειωθεί περιορισμοί αυτής της μελέτης. Αυτή η μετα-ανάλυση βασίστηκε σε μελέτες διαφόρων ειδών καρκίνου, έτσι θα πρέπει να είναι προσεκτικοί για να ερμηνεύσει τα αποτελέσματά μας. Λόγω της ποικίλη αιτιολογία του καρκίνου, αυτά τα 2 SNPs της PIN1 μπορεί να έχουν διαφορετικές λειτουργίες ανάλογα με το είδος του καρκίνου. Επιπλέον, λόγω του περιορισμένου αριθμού μελετών, δεν εκτελούνται αναλύσεις υποομάδων σύμφωνα με τους τύπους καρκίνου

Για την περίληψη, έχουμε αποδείξει ότι η -667T & gt?. C πολυμορφισμός του PIN1 δεν συμβάλλουν στον κίνδυνο του καρκίνου, ενώ η -842C αλληλόμορφο σχετίζεται με μειωμένο κίνδυνο καρκίνου.

Υποστήριξη Πληροφορίες

Λίστα ελέγχου S1.

PRISMA λίστα ελέγχου

doi:. 10.1371 /journal.pone.0070990.s001

(DOC)

You must be logged into post a comment.