PLoS One: συστηματική ανάλυση της γονιδιακής έκφρασης Τροποποιήσεις και τα κλινικά αποτελέσματα για μακράς αλυσίδας ακυλο-συνένζυμο Α συνθετάση Οικογένεια στον Καρκίνο


Αφηρημένο

Η κακή ρύθμιση του μεταβολισμού των λιπιδίων συμβάλλει στην εξέλιξη του καρκίνου. προηγούμενη μελέτη μας δείχνει ότι μακράς αλυσίδας λιπαρά ακυλο-Co Α συνθετάση (ACSL) 3 είναι απαραίτητη για λιπιδίων προς τα πάνω ρύθμιση που προκαλείται από το στρες ενδοπλασματικό δίκτυο. Στην έκθεση αυτή, έχουμε ως στόχο να προσδιορίσει το ρόλο της οικογένειας ACSL στον καρκίνο με συστηματική ανάλυση και

in vitro

πείραμα. Ερευνήσαμε την έκφραση ACSL χρησιμοποιώντας τη βάση δεδομένων Oncomine να προσδιοριστεί το γονίδιο αλλοίωση κατά τη διάρκεια της καρκινογένεσης και προσδιόρισε τη σχέση μεταξύ της έκφρασης ACSL και την επιβίωση του ασθενή με καρκίνο, χρησιμοποιώντας τη βάση δεδομένων PrognoScan. ACSL1 μπορεί να παίζει ένα δυνητικό ογκογόνο ρόλο σε ορθοκολικό καρκίνο και του μαστού και να παίξουν ένα δυνητικό ογκοκατασταλτικό ρόλο στον καρκίνο του πνεύμονα. Ανάλυση συν-έκφραση αποκάλυψε ότι ACSL1 συνεκφράστηκε με MYBPH, PTPRE, PFKFB3, SOCS3 στον καρκίνο του παχέος εντέρου και με LRRFIP1, TSC22D1 στον καρκίνο του πνεύμονα. Σύμφωνα με την ανάλυση PrognoScan, ρύθμιση προς τα κάτω του ACSL1 στο παχύ έντερο και τον καρκίνο του μαστού κυτταρική γραμμή ανέστειλε πολλαπλασιασμό, μετανάστευση, και ανεξάρτητο από αγκύρωση ανάπτυξη. Σε αντίθεση, παρατηρήθηκε αύξηση του ογκογόνου ιδιοκτησίας στην κυτταρική σειρά καρκίνου του πνεύμονα με εξασθένηση ACSL1. Υψηλή έκφραση ACSL3 προβλέψει καλύτερη πρόγνωση στον καρκίνο των ωοθηκών? Αντίθετα, υψηλή ACSL3 προβλέψει μια χειρότερη πρόγνωση σε μελάνωμα. ACSL3 συνεκφράστηκε με SNUPN, TRIP13, και SEMA5A σε μελάνωμα. Υψηλή έκφραση του ACSL4 προβλέψει μια χειρότερη πρόγνωση σε καρκίνο του παχέος εντέρου, αλλά προέβλεψε καλύτερη πρόγνωση σε μαστού, του εγκεφάλου και καρκίνο του πνεύμονα. ACSL4 συνεκφράστηκε με SERPIN2, HNRNPCL1, ITIH2, PROCR, LRRFIP1. Υψηλή έκφραση του ACSL5 προβλεπόμενη καλή πρόγνωση σε καρκίνους του μαστού, των ωοθηκών, και του πνεύμονα. ACSL5 συνεκφράστηκε με TMEM140, TAPBPL, BIRC3, PTPRE και SERPINB1. Χαμηλή ACSL6 προβλέψει μια χειρότερη πρόγνωση σε οξεία μυελογενή λευχαιμία. ACSL6 συνεκφράστηκε με SOX6 και DARC. Συνολικά, τα διάφορα μέλη της ACSLS εμπλακεί σε διάφορες μορφές της ανάπτυξης του καρκίνου. ACSL-συν-εκφράζονται μόρια μπορούν να χρησιμοποιηθούν για την περαιτέρω διερεύνηση του ρόλου της οικογένειας ACSL σε επιμέρους είδος των καρκίνων

Παράθεση:. Chen WC, Wang CY, Hung YH, Weng ΤΥ, γεν MC, Lai MD (2016) Συστηματική Ανάλυση της γονιδιακής έκφρασης Τροποποιήσεις και τα κλινικά αποτελέσματα για μακράς αλυσίδας ακυλο-συνένζυμο Α συνθετάση Οικογένεια στον καρκίνο. PLoS ONE 11 (5): e0155660. doi: 10.1371 /journal.pone.0155660

Επιμέλεια: Viji Shridhar, Mayo Clinic College of Medicine, Ηνωμένες Πολιτείες

You must be logged into post a comment.